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Id: lil-623934
Autor: Illg, Rolf Dieter.
Título: Plant tissue culture techniques
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;86(supl.2):21-24, 1991.
Idioma: en.
Conferência: Apresentado em: Brazilian-Sino Symposium on Chemistry and Pharmacology of Natural Products, Rio de Janeiro, Dec. 10-14, 1989.
Resumo: Plant cell and tissue culture in a simple fashion refers to techniques which utilize either single plant cells, groups of unorganized cells (callus) or organized tissues or organs put in culture, under controlled sterile conditions.
Descritores: Plantas/anatomia & histologia
Técnicas de Cultura/métodos
-Células Clonais/citologia
Células-Tronco Totipotentes/citologia
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: biblio-965114
Autor: Rodrigues, Wagner Nunes; Tomaz, Marcelo Antomio; Ferrão, Maria Amélia Gava; Ferrão, Romário Gava; Fonseca, Aymbiré Francisco Almeida da.
Título: Diversity among genotypes of conilon coffee selected in Espírito Santo state / Diversidade entre genótipos de café conilon selecionados no estado do Espírito Santo
Fonte: Biosci. j. (Online);31(6):1643-1650, nov./dec. 2015.
Idioma: en.
Resumo: The use of multivariate techniques for factor analysis is an efficient alternative for coffee breeding programs. This study aimed to evaluate the genetic diversity of 60 genotypes of conilon coffee based on agronomic performance in the northern state of Espírito Santo and to estimate the relative contribution of different agronomic characteristics towards the diversity of the species. The data were collected in an experiment conducted on the Experimental Farm of Bananal do Norte (Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extenção Rural ­ INCAPER) in the southern state of Espírito Santo, and 12 agronomic characteristics were evaluated over four sequential harvests (4 years). Significant differences between the genotypes were observed for all of the characteristics, indicating the possibility of exploiting the high genetic variability to classify the genotypes into different groups based on their similarities. Of the agronomic characteristics, the duration of the ripening cycle was the variable that contributed the most to the variability among the 60 genotypes, with a relative contribution of 70.02%.

A utilização de técnicas multivariadas de análise de fatores é uma alternativa eficiente utilizada no melhoramento genético do cafeeiro. O presente trabalho objetivou avaliar a divergência genética de 60 clones de café conilon, selecionados pelo seu desempenho no norte do Estado do Espírito Santo, e estimar a contribuição relativa de diferentes características agronômicas para a diversidade da espécie. Os dados foram coletados em experimento conduzido na Fazenda Experimental Bananal do Norte (INCAPER), considerando 12 características agronômicas, avaliadas através de médias de quatro safras. Diferenças significativas entre os genótipos foram observadas para todas as características avaliadas, indicando a possibilidade de exploração da alta variabilidade genética para a classificação dos genótipos em diferentes grupos homogêneos, baseado em suas similaridades. Dentre as características agronômicas, a duração do ciclo de maturação foi a variável que mais contribuiu para a variabilidade entre os 60 genótipos, com contribuição relativa de 70,02%.
Descritores: Cruzamento
Células Clonais
Café
Melhoramento Genético
Coffea
Genótipo
Responsável: BR396.1 - Biblioteca Central


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Id: biblio-933789
Autor: Brown, Gilda Alves.
Título: Estudos de sintenia em ateles paniscus chamek atelinae, platirrhini.
Fonte: Rio de Janeiro; s.n; 1988. 123 p. ilus, graf.
Idioma: pt; pt.
Tese: Apresentada a Universidade Federal do Rio de Janeiro. Intituto de biologia. Departamento de genética para obtenção do grau de Mestre em ciências (genética).
Resumo: No intuito de montar um painel híbrido para mapeamento genético de uma das espécies de macaco-aranha, Ateles paniscus chamek, foram feitas 4 hibridizações de fibroblastos normais desta espécies com células de uma linhagem receptora de roedor, RAG, que é deficiente para HGPRT. Os experimentos de hibridização geraram 82 clones híbridos HGPRT (selecionados em meio com HAT) que foram analisados para a presença de 24 isozimas marcadoras do macaco-aranha. Além disso, um total de 5 clones híbridos foram cariotipados. Os clones híbridos que não segregavam isozimas marcadoras do macaco-aranha foram eliminados da análise estatística ou subclonados em meio com 6- mercapto- purina. A estimativa das freqüências de discordância das isozimas marcadoras permitiu que se determinasse várias associação sintênicas prováveis no macaco-aranha. Essas associações sintênicas foram comparadas com aquelas encontradas nos outros mamíferos, principalmente nos primatas. As implicações genéticas e evolutivas da análise comparativa dos grupos sintêncos entre os mamíferos foram discutidas

Four hybridization experiments have been carried out for the construction of a hybrid panel using normal fibroblasts of the spider monkey species Ateles paniscus chamek and a recipient rodent cell line (RAG) that is deficient for HGPRT. The hybridizations generated 82 hybrid clones that were selected in medium supplemented with HAT. The hybrid clones were screened for the expression of 24 spider monkey isozyme markers. In addition, six hybrid clones were karyotyped. Clones expressing all spider monkey isozymes markers were excluded from statistical analyses or were subcloned in medium supplemented with 6- mercapto-Purine. Frequencies of discordancy were used for the identification of probable syntenic associations of the spider monkey isozyme markers. These syntenic associations were compared to those found within primates and other mammals. The genetic and evolutionary implications of comparative mapping analysis among mammals have been discussed
Descritores: Atelinae/genética
Células Clonais
Genética
Hibridização Genética
Limites: Animais
Responsável: BR440.1 - Biblioteca Geraldo Matos de Sá . Hospital do Câncer I
BR440.1; 574.273223, B877e D HCI


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Id: biblio-906092
Autor: Custodio, Débora Fernandes.
Título: Caracterização de L-Asparaginase de Erwinia chrysanthemi melhorada por evolução sintética de proteí­nas e otimização das condições de produção / Characterization of Erwinia chrysanthemi L-Asparaginase improved by synthetic protein evolution and optimization of production conditions.
Fonte: São Paulo; s.n; 2018. 108 p. tab, graf, ilus.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Faculdade de Ciências Farmacêuticas para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: A L-Asparaginase (L-ASNase) é uma enzima tetramérica bacteriana, utilizada em sessões de quimioterapia. Essa enzima depleta os aminoácidos asparagina (Asn) e glutamina (Gln), transformando-os em aspartato (Asp) ou glutamato (Glu), respectivamente, e em amônia. Contudo, a L-ASNase pode induzir resposta imune, levando à produção de anticorpos antiasparaginase, uma causa importante de resistência ao medicamento. Uma L-ASNase ideal seria aquela com alta atividade e estabilidade e baixo potencial imunogênico, porém, as L-ASNases utilizadas na terapêutica não reúnem essas características simultaneamente. Por essa razão, o presente trabalho utilizou técnicas de mutagênese randômica, a fim de criar uma nova proteoforma de L-ASNase de E. chrysanthemi com uma melhor atividade e estabilidade. Além disso, foram estudadas condições de cultivo em agitador metabólico, visando à otimização de condições de produção. Foi criada uma biblioteca com 1.056 clones, e desses, 19 foram selecionados por apresentarem atividade superior ou igual à enzima selvagem quando dosada em extrato bruto. Dentre eles, dois mutantes se destacaram por apresentarem a atividade específica glutaminásica diferente da enzima selvagem. Análises in silico indicam que o mutante 9-6D apresentou diminuição de desordem estrutural e epítopos imunogênicos. O mutante 9-5F demonstrou uma diminuição da porcentagem da atividade glutaminásica quando comparada a enzima selvagem. O estudo de produção do mutante 9-5F indicou que a temperatura de indução, seguida da concentração do indutor, são os parâmetros mais relevantes para a otimização da produção de L-ASNase de E. chrysanthemi mutante

L-Asparaginase (L-ASNase) is a bacterial tetrameric enzyme used in chemotherapy sessions that deplete asparagine (Asn) and glutamine (Gln), transforming them into Aspartate (Asp) or glutamate (Glu), respectively, and ammonia. However, L-ASNase can induce immune response leading to the production of anti-asparaginase antibody, an important cause of drug resistance. Ideally, L-ASNase would be one with high activity, high stability and low immunogenic potential, but the L-ASNases commercially available today do not present these characteristics simultaneously. For this reason, this study used techniques of random and site-directed mutagenesis in order to create a new proteoform of E. chrysanthemi L-ASNase with improved activity and stability. In addition, culture conditions were studied in a metabolic shaker, aiming at the optimization of production conditions. A library with 1,056 clones was created, and of these clones, 19 were selected because they had activity superior or equal to the wild-type enzyme in crude protein extract. Among them, 2 mutants stood out for having different glutaminase specific activity in relation to wild-type enzyme. The 9-6D mutant also showed decreased structural disorder and immunogenic epitopes. The 9-5F mutant demonstrated a decrease in percentage of glutaminase activity when compared to the wild-type enzyme. The production study of 9-5F mutant indicated that the induction temperature followed by the inductor concentration are the most relevant parameters for the production optimization of E. chrysanthemi mutant L-ASNase
Descritores: Asparaginase/análise
Pectobacterium chrysanthemi/classificação
-Células Clonais
Mutação
Leucemia-Linfoma Linfoblástico de Células Precursoras/tratamento farmacológico
Tipo de Publ: Técnicas In Vitro
Responsável: BR40.1 - DBD - Divisão de Biblioteca e Documentacão do Conjunto das Químicas
BR40.1; T615.1, C987c. 30100022449-F


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: biblio-841989
Autor: Girardini, Lilian K; Paim, Daniel S; Ausani, Thais C; Lopes, Graciela V; Pellegrini, Debora C. P; Brito, Maria Aparecida V. P; Cardoso, Marisa.
Título: Antimicrobial resistance profiles of Staphylococcus aureus clusters on small dairy farms in southern Brazil / Perfil de resistência a antimicrobianos de grupos clonais de Staphylococcus aureus isolados de pequenas propriedades leiteiras do sul do Brasil
Fonte: Pesqui. vet. bras = Braz. j. vet. res;36(10):951-956, out. 2016. tab, ilus.
Idioma: en.
Projeto: CNPq.
Resumo: In intensive dairy farming, persistent intramammary infection has been associated with specific Staphylococcus (S.) aureus strains, and these strains may be resistant to antimicrobials. The objective of this study was to evaluate the antimicrobial resistance phenotypes of S. aureus isolates and to assess the distribution and the persistence of clonal groups in small dairy herds of southern Brazil. Milk samples were collected from all lactating cows from 21 dairy farms over a two-year period, totaling 1,060 samples. S. aureus isolates were tested for susceptibility to thirteen antimicrobials using the disk diffusion method. The total DNA of the isolates was subjected to SmaI digestion followed by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). Banding patterns differing by ≤4 bands were considered members of a single PFGE cluster. The frequency of S. aureus isolation ranged from 3.45% to 70.59% among the 17 S. aureus-positive herds. Most S. aureus isolates (87.1%) were susceptible to all antimicrobials; resistance to penicillin (18.2%) was the most frequently observed. The 122 isolates subjected to macrorestriction analysis were classified into 30 PFGE-clusters. Among them, only 10 clusters were intermittent or persistent over the two-year period. The majority (93.6%) of isolates belonging to persistent and intermittent clusters were susceptible to all tested antimicrobials. S. aureus intramammary colonization in small dairy farms of southern Brazil is most frequently caused by sporadic PFGE clusters, although some persistent clusters can arise over time. Both sporadic and persistent isolates were highly susceptible to antimicrobials.(AU)

A infecção intramamária persistente em bovinos leiteiros tem sido associada com estirpes de Staphylococcus (S.) aureus específicos, os quais podem ser resistentes a antimicrobianos. Os objetivos deste estudo foram avaliar os fenótipos de resistência aos antimicrobianos de isolados de S. aureus e a distribuição e persistência de grupos clonais em pequenos rebanhos leiteiros do sul do Brasil. As amostras de leite foram coletadas de todas as vacas em lactação de 21 propriedades leiteiras, ao longo de um período de dois anos, perfazendo um total de 1.060 amostras. Isolados de S. aureus foram testados quanto à resistência frente a treze antimicrobianos, pelo método de disco-difusão. O DNA total dos isolados foi clivado com a enzima Smal e submetido a eletroforese em gel de campo pulsado (PFGE). Padrões de bandas diferentes por ≤4 bandas foram considerados como pertencentes ao mesmo grupo clonal. A freqüência de S. aureus variou de 3,45% até 70,59%, entre os 17 rebanhos com isolamento positivo de S. aureus. A maioria dos isolados de S. aureus (87,1%) foi suscetível a todos os antimicrobianos; resistência à penicilina (18,2%) foi a mais freqüentemente observada. Os 122 isolados submetidos à análise de macrorestrição foram classificados em 30 grupos clonais de PFGE. Entre eles, apenas dez grupos clonais foram intermitentes ou persistentes ao longo do período de dois anos. A maioria (93,6%) dos isolados pertencentes a grupos clonais persistentes e intermitentes foram suscetíveis a todos os antimicrobianos testados. Concluiu-se que a colonização intramamária em bovinos de pequenas propriedades leiteiras do Sul do Brasil é mais frequentemente causada por grupos clonais esporádicos de S. aureus, embora alguns grupos clonais persistentes possam ocorrer ao longo do tempo. Em ambos os grupos clonais os isolados foram majoritariamente suscetíveis a antimicrobianos.(AU)
Descritores: Células Clonais
Mastite Bovina
Staphylococcus aureus Resistente à Meticilina
Staphylococcus aureus/genética
Staphylococcus aureus/isolamento & purificação
-Eletroforese em Gel de Campo Pulsado/veterinária
Reação em Cadeia da Polimerase/veterinária
Limites: Animais
Bovinos
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-774281
Autor: Silveira, Melise Chaves.
Título: Caracterização do ambiente genético dos genes de resistência a beta-lactâmicos e aminoglicosídeos, blaSPM-1 e rmtD, em amostras de Pseudomonas aeruginosa pertencentes ao clone ST277, epidêmico no Brasil / Characterization of the genetic environment of the beta-lactam and aminoglycoside resistance genes, blaSPM-1 and RMTD on samples of Pseudomonas aeruginosa belonging to clone ST277, epidemic in Brazil.
Fonte: Rio de Janeiro; s.n; 2014. v,99 p. ilus, tab.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Instituto Oswaldo Cruz para obtenção do grau de Mestre.
Resumo: O surgimento de bactérias Gram-negativas resistentes à drogas tem sido progressivo ealarmante. Entre os patógenos de particular importância está Pseudomonas aeruginosamultirresistentes à drogas (MDR). Um clone epidêmico de P. aeruginosa MDR produtor dametalo-beta-lactamase SPM-1, chamado clone SP (ST277), tem sido encontrado em diferentesestados brasileiros. O gene blaSPM-1 foi descrito em uma estrutura genética chamada ISCR4,responsável pela sua mobilização e expressão. Além do gene blaSPM-1, tem sido descrito, nesteclone, a presença de um integron de classe I carreando genes de resistência (In163) e umelemento genético ISCR14 carreando uma metilase de RNAr 16S (rmtD), que confereresistência a altas concentrações de aminoglicosídeos. Este tipo de associação resulta em umperfil de resistência extremamente preocupante. Assim, este estudo teve como objetivoinvestigar a contexto genético dos genes blaSPM-1 e rmtD, além de caracterizar mutações emgenes cromossomais associados a multirresistência a antimicrobianos em amostras de P.aeruginosa pertencentes ao clone ST277, através de Sourthen blot e sequenciamento de novageração. A partir de 50 amostras de P. aeruginosa MDR isoladas entre 2007 e 2010, foramselecionadas 13 amostras pertencentes ao ST277 (através de MLST) que apresentarampositividade para blaSPM-1 e/ou rmtD e In163 (através de PCR), sendo 12 do clone SP (A) euma de um clone diferente, M, através de PFGE. Através de restrição do DNA com asenzimas de restrição SpeI e XbaI, e posterior hibridação com sondas dos genes alvos (blaSPM-1,rmtD e In163) foi possível observar que os genes alvos encontravam-se em fragmentosdistintos e que a amostra do clone M apresentou um perfil de hibridação diferentes das demaisamostras demonstrando a ocorrência de vários rearranjos na mesma, indicando uma maiordistância evolutiva...
Descritores: Resistência Microbiana a Medicamentos
Genes MDR
Genômica
Pseudomonas aeruginosa/genética
-Células Clonais
Eletroforese em Gel de Ágar
Limites: Animais
Responsável: BR15.1 - Biblioteca de Ciências Biomédicas


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Id: lil-733475
Autor: Rivas, Jomar; Redondo, Carlos; Alonso, Guillermina.
Título: Genotipificación de cepas de enterobacterias procedentes de 4 centros de salud del área de Caracas / Genotyping of enterobacterias strains from 4 healthcare centers in Caracas
Fonte: Acta cient. Soc. Venez. Bioanalistas Esp;9(2):3-7, 2006. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: Las infecciones nosocomiales pueden ser producidas por microorganismos resistentes a la acción de los antimicrobianos que han sido seleccionados por la mal uso ó el uso indiscriminado de los antibióticos en el ámbito hospitalario. En los últimos años se han desarrollado nuevas técnicas moleculares de tipificación basada en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), que han representado un avance importante en el estudio de las enfermedades infecciosas, siendo muy útiles al permitir diferenciar serotipos estrechamente relacionados y grupos de cepas no relacionadas clonalmente, debido a su gran poder discriminatorio. En Venezuela, son pocos los estudios de eepidemiología molecular de las infecciones intrahospitalarias, y por esta razón nos propusimos genotipificar cepas de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae provenientes de aislados nosocomiales de cuatro centros de salud del área metropolitana (Hospital "Dr. José María Vargas", Hospital "Dr. Domingo Luciani", Centro Médico de Caracas y Policlínica Metropolitana) con la finalidad de determinar la relación clonal existente entre estas cepas. El uso de ERIC-PCR permitió relacionar parcialmente las especies de E. coli aisladas en los cuatro centros de salud, sin embargo la técnica de REP-PCR permitió discriminar entre los patrones de bandas similares, mostrando un poder de resolución mayor. El uso de ERIC-PCR y REP-PCR no permitió tipificar la mayoría de las cepas de K. pneumoniae aisladas en los cuatro centros de salud en estudio. En el Centro Médico de Caracas se identificaron dos aislados clonales provenientes de diferentes áreas del hospital, Unidad de Terapia de Adultos y Hospitalización. En la Policlínica Metropolitana se identificaron tres aislados clonales, dos en la unidad de Terapia y uno en Hospitalización. En el Hospital "Dr. Domingo Luciani" y en el Hospital "Dr. José María Vargas" no se identificaron clones. Estos resultados proporcionan un aporte a los programas de vigilancia...

Nosocomial infections can be produced by microorganisms resistand to antimicrobial agents, and they have been selected by the bad use or abuse of antibiotics in the hospital environment. Recently, new molecular typing techniques have been developed, based on polymerase chain reaction (PCR). These techniques represent an important advantage the study of infectious diseases; they are able to discriminate relate closed serovars and groups of nonrelated isolates due to its great power discriminatory. In Venezuela, there is a small number of molecular epidemiology researches. The goal of the present study is genotyping Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolated of nosocomial infected patients from four healthcare centers in the metropolitan area (Hospital "Dr. José María Vargas", Hospital "Dr. Domingo Luciani", Centro Médico de Caracas, Policlínica Metropolitana) in order to investigate the clonal relationship between the isolates. ERIC-PCR allowed us to correlate E. coli isolates however REP-PCR shows greater greater resolution. The use of both ERIC-PCR and REP-PCR, did not permit us typing K. pneumoniae isolates. Two clonally related isolates from Centro Médico de Caracas were identified. Three clonally related isolates from the Policlínica Metropolitana ere identified. No clones were identified in samples from Hospital "Dr. Domingo Luciani" and the Hospital "José María Vargas". These results contribute to monitoring programs, to improve the control of the bacterial infections, helping to establish efficient procedures and reduce nosocomials infections.
Descritores: Células Clonais/citologia
Células Clonais/microbiologia
Enterobacteriaceae/citologia
Enterobacteriaceae/patogenicidade
Infecção Hospitalar/microbiologia
Infecção Hospitalar/sangue
-Análise Química do Sangue
Limites: Seres Humanos
Masculino
Feminino
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Estudos de Avaliação
Responsável: VE1.1 - Biblioteca Humberto Garcia Arocha


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Id: lil-733444
Autor: Ugueto León, Denisse; Pomenta Rojas, Anny; Carrasco, Hernán J.
Título: Análisis de la composición poblacional de aislados venezolanos de Trypanosoma cruzi I, provenientes de un hospedador humano, un insecto triatomineo y un reservorio natural / Analysis of the population composition of venezuelans isolates of Trypanosoma cruzi I fron a human host, a triatomine insect and a nature reservoir
Fonte: Acta cient. Soc. Venez. Bioanalistas Esp;11(1):3-11, 2008. tab, graf.
Idioma: es.
Resumo: Se analizó la composición poblacional de aislados venezolanos pertenecientes al grupo Tel, provenientes de distintos hospedadores. El análisis fue realizado mediante la clonación de los aislados utilizando la técnica de plaqueo, de la cual se originaron clones de cada uno que posteriormente fueron comparados mediante la técnica de Amplificación Aleatoria de ADN Polimórfico (RAPD). La observación de los perfiles de bandas obtenidos mediante electroforesis en gel de agarosa, mostró diferencias en cuanto al número y la posición de bandas en los clones obtenidos de los aislados provenientes de humano y del reservorio natural (Dildelphis marsupiales), mientras que para el aislado proveniente del vector (Triatoma ningromaculata), todos los clones generaron perfiles de bandas similares. Estos resultados evidencian una heterogeneidad poblacional para el caso de los dos primeros aislados. El índice de variabilidad genética fue diferente para cada uno de los aislados, siendo mayor para dos aislados provenientes de dos pacientes chagásicos, mostrando un valor de 0.1652 y 0.0853 respectivamente, mientras que para el aislado proveniente del reservorio natural, se obtuvo un valor de 0.0312. Estos resultados indican polimorfismo existente entre clones provenientes de un mismo aislado, siendo indicativo de la existencia de heterogeneidad intrapoblacional, lo cual pudiese tener implicaciones en la diversidad de manifestaciones clínicas reportadas para infecciones con T. cruzi I.

It was analyzed the population composition of Venezuelan isolates belonging to the genotype Tel from different hosts. The analysis was carried out through the cloning of the isolates using the plating technique, obtaining clones of each one of them, which were afterward compared using the random amplified plymorphic DNA technique (RAPD). The observation of bands'profiles obtained by agarose gel electrophoresis, showed differences regarding to the number and position of the bands between the isolates from both humans and natural reservoir (Dildelphis marsupialis), except for the clones obtained from the vector isolate (triatoma nigromaculata), where all of them gave the same pattern of bands. This result reveals the presence of population heterogeneity for the isolates from human and natural host. The genetic variability index was different in each one of the isolates, being higher for the isolates fron two chagasic patientes, showing values of 0.1652 and 0.0853 respectivivly; and for the isolate fron the natural reservoir the index value was 0.0312. These results reveals the presence of polymorphism between the clones obtained from the same isolate, showing the existence of intra popultaion heterogenicity, wich might have implications on the diversity of clinical manifestations previously reported with T. cruzi I infections.
Descritores: Células Clonais
Estudos Ecológicos
Doença de Chagas/diagnóstico
Doença de Chagas/sangue
Trypanosoma cruzi/genética
Trypanosoma cruzi/microbiologia
Trypanosoma cruzi/parasitologia
-Análise Química do Sangue
Genética
Hematologia
Responsável: VE1.1 - Biblioteca Humberto Garcia Arocha


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Id: lil-712429
Autor: Escobar-Pérez, Javier Antonio; Castro, Betsy Esperanza; Márquez-Ortiz, Ricaurte Alejandro; Gaines, Sebastián; Chavarro, Bibiana; Moreno, Jaime; Leal, Aura Lucía; Vanegas, Natasha.
Título: Aislamientos de Staphylococcus aureus sensibles a meticilina relacionados genéticamente con el clon USA300, ¿origen de los aislamientos SARM de genotipo comunitario en Colombia? / Methicillin-sensitive Staphylococcus aureus isolates related to USA300 clone: Origin of community-genotype MRSA in Colombia?
Fonte: Biomédica (Bogotá);34(supl.1):124-136, abr. 2014. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: Introducción. USA300 es un linaje genético que se encuentra en aislamientos de Staphylococcus aureus sensibles (SASM) y resistentes a meticilina (SARM). Actualmente, en Colombia las infecciones por SARM en hospitales y en la comunidad son causadas principalmente por un clon con genotipo comunitario (SARM-GC) relacionado genéticamente con el clon USA300. El origen de esta variante es aún desconocido. Objetivo. Identificar y caracterizar aislamientos de S. aureus resistentes y sensibles a meticilina con el fin de aportar información para establecer un posible origen de los aislamientos SARM-GC en Colombia. Materiales y métodos. Se realizó una caracterización de aislamientos SASM relacionados con el clon USA300 detectados a partir de un análisis de 184 aislamientos de S. aureus (90 SARM y 94 SASM) causantes de infecciones. La relación genética de los aislamientos se determinó por electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE), tipificación de secuencias multilocus (MLST) y tipificación del gen de la proteína A ( spa ). Resultados. De los 184 aislamientos, 27 (14,7 %) presentaron características moleculares y relación genética con el clon USA300, y de ellos, 18 fueron SARM y nueve fueron SASM. Todos los aislamientos SARM relacionados con este clon albergaban un casete estafilocócico cromosómico mec (SCC mec ) IVc (3.1.2). En ningún aislamiento SASM se detectaron secuencias remanentes de SCC mec o una duplicación del sitio att B que evidenciaran la pérdida del casete. Conclusión. El origen de los aislamientos SARM-GC en Colombia probablemente se encuentre en la diseminación de clones SASM relacionados con el clon USA300 que adquirieron el SCC mec IVc posteriormente.

Introduction: USA300 is a genetic lineage found both in methicillin-resistant (MRSA) and methicillin-sensitive Staphylococcus aureus (MSSA) isolates. In Colombia, hospital and community MRSA infections are caused by a USA300-related community genotype MRSA (CG-MRSA) clone. The genetic origin of this clone is unknown yet. Objective: To identify and characterize methicillin-resistant (MRSA) and methicillin-sensitive S. aureus (MSSA) isolates in order to improve the information about the origin of the CG-MRSA isolates in Colombia. Materials and methods: USA300-related MSSA isolates were detected and characterized from a study of 184 S. aureus isolates (90 MRSA and 94 MSSA) recovered from infections. The genetic relatedness of the isolates was established by means of pulsed field gel electrophoresis (PFGE), multilocus sequence typing (MLST) and protein A gene typification ( spa typing). Results: Among 184 isolates, 27 (14.7%) showed molecular characteristics and genetic relationship with the USA300 clone, of which 18 were MRSA and nine were MSSA. All USA300-related MRSA harbored Staphylococcal cassette chromosome mec (SCC mec ) IVc (3.1.2). In the MSSA isolates, SCC mec remnants or att B duplicate sites were not detected. Conclusions: In Colombia, the CG-MRSA isolates probably originated in the dissemination of an USA300-related MSSA clone which later acquired SCC mec IVc.
Descritores: Infecções Comunitárias Adquiridas/microbiologia
Resistência a Meticilina/genética
Staphylococcus aureus Resistente à Meticilina/genética
Infecções Estafilocócicas/microbiologia
-Técnicas de Tipagem Bacteriana
Proteínas de Bactérias/genética
Chile
Células Clonais
Colômbia/epidemiologia
Infecções Comunitárias Adquiridas/epidemiologia
Infecções Comunitárias Adquiridas/transmissão
Farmacorresistência Bacteriana Múltipla/genética
Eletroforese em Gel de Campo Pulsado
Genes Bacterianos
Genótipo
Staphylococcus aureus Resistente à Meticilina/classificação
Staphylococcus aureus Resistente à Meticilina/isolamento & purificação
Staphylococcus aureus Resistente à Meticilina/patogenicidade
Filogenia
Estudos Prospectivos
Infecções Estafilocócicas/epidemiologia
Infecções Estafilocócicas/transmissão
Estados Unidos
Virulência/genética
Limites: Adolescente
Adulto
Idoso
Seres Humanos
Meia-Idade
Adulto Jovem
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: CO332 - Facultad de Medicina


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Id: lil-712427
Autor: Lemus, Dihadenys; Echemendía, Miguel; Díaz, Raúl; Llop, Alina; Llanes, María Josefa.
Título: Vigilancia de la resistencia a los medicamentos antituberculosos en Cuba, 2010-2011 / Surveillance of antituberculosis-drug resistance in Cuba, 2010-2011
Fonte: Biomédica (Bogotá);34(supl.1):108-113, abr. 2014. tab.
Idioma: es.
Resumo: Introducción. La vigilancia de la resistencia a medicamentos antituberculosos permite alertar sobre el hallazgo de aislamientos de Mycobacterium tuberculosis multirresistentes y extremadamente resistentes . Objetivo. Determinar los patrones de resistencia de los aislamientos de M. tuberculosis recuperados en Cuba entre los años 2010 y 2011 y demostrar el desempeño del Laboratorio Nacional de Referencia en la ejecución de las pruebas de sensibilidad. Materiales y métodos. Se realizó un estudio prospectivo longitudinal en el que se incluyeron 657 aislamientos de M. tuberculosis recibidos de todo el país. Se empleó el método de la nitrato reductasa para detectar resistencia a isoniacida y rifampicina, y el método de las proporciones para corroborar la resistencia a dichos medicamentos e investigar la sensibilidad a estreptomicina, etambutol, ofloxacina, kanamicina y capreomicina en aislamientos multirresistentes. Como parte del control de calidad externo de las pruebas de sensibilidad, se evaluaron dos paneles de cepas de M. tuberculosis . Resultados. En 95,69 % de los aislamientos recuperados de casos nuevos de tuberculosis y en 72,64 % de los recuperados de casos previamente tratados, se encontró sensibilidad a isoniacida y rifampicina, siendo la multirresistencia de 1,03 y 10,38 %, respectivamente. Se encontraron dos aislamientos extremadamente resistentes. Con la excepción del etambutol y la capreomicina, para todos los medicamentos la eficiencia fue de 100% en el control de calidad externo. Conclusiones. Se confirmó la baja prevalencia de aislamientos de M. tuberculosis multirresistentes en Cuba, resultado avalado por el excelente desempeño demostrado en el control de calidad externo de las pruebas de sensibilidad.

Introduction: Antituberculosis-drug resistance surveillance is very important to identify multidrug-resistant and extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates. Objective: To determine the prevalence of resistance in M. tuberculosis strains isolated between 2010 and 2011, and to demonstrate the laboratory performance in the external quality control of drug susceptibility testing. Materials and methods: A prospective longitudinal study was carried out to determine antituberculosis-drug resistance in 657 M. tuberculosis isolates obtained throughout the country. The nitrate reductase assay was used to detect resistance to isoniazid and rifampin. The proportion method was performed to confirm resistance to these drugs and to further investigate in multidrug-resistant isolates their susceptibility to streptomycin, ethambutol, ofloxacin, kanamycin and capreomycin. Additionally, as part of external quality control, susceptibility was evaluated in two M. tuberculosis strain panels. Results: In 95.69% of the isolates recovered from new tuberculosis cases, and in 72.64 % of isolates from previously treated patients we found susceptibility to isoniazid and rifampicin; multidrug resistance was 1,03 and 10.38%, respectively. We found two extensively resistant isolates. Except for ethambutol and capreomycin, the efficiency of all other drugs was 100% in the external quality control. Conclusion: The study confirmed the low prevalence of M. tuberculosis multidrug-resistant isolates in Cuba. This result was confirmed by the external quality control of drug susceptibility testing.
Descritores: Antituberculosos/farmacologia
Farmacorresistência Bacteriana
Mycobacterium tuberculosis/efeitos dos fármacos
Tuberculose/microbiologia
-Células Clonais/efeitos dos fármacos
Cuba/epidemiologia
Farmacorresistência Bacteriana Múltipla
Isoniazida/farmacologia
Laboratórios/estatística & dados numéricos
Testes de Sensibilidade Microbiana/métodos
Mycobacterium tuberculosis/isolamento & purificação
Vigilância da População
Prevalência
Estudos Prospectivos
Rifampina/farmacologia
Tuberculose Resistente a Múltiplos Medicamentos/epidemiologia
Tuberculose Resistente a Múltiplos Medicamentos/microbiologia
Tuberculose/epidemiologia
Limites: Seres Humanos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: CO332 - Facultad de Medicina



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