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Id: biblio-1015230
Autor: Lupinacci, Fernanda C S; Ferreira, Elisa N; Roffe, Martin; Bellato, Hermano M; Carraro, Dirce Maria; Hajj, Glaucia N M.
Título: Effects of tumor biobank storage on polysome stability
Fonte: Appl. cancer res;39:1-5, 2019. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: Background: Human biological material has become an important resource for biomedical research. Tumor Biobanks are facilities that collect, store and distribute samples of tumor and normal tissue for further use in basic and translational cancer research. mRNA-translation has been demonstrated to modulate protein levels and is considered a fundamental post-transcriptional mechanism of gene expression regulation. Thus, determining translation efficiencies of individual mRNAs in human tumors may add another layer of information that contributes to the understanding of tumorigenic pathways. To analyze the RNAs actively engaged in translation, RNAs associated with ribosomes (polysomes) are isolated, identified and compared to total RNA. However, the application of this technique in human tumors depends on the stability of the polysomal structure under Biobank storage conditions that usually consists of ultra-low temperature. Since the effect of freezing on the stability of the polysomal structure in stored tumor samples is not known, it is essential to evaluate this factor in the frozen samples, validating the use of biobank samples in studies of translational efficiency. Methods: Xenograft tumors were divided in two parts, half was subject to immediate processing, and half was frozen for posterior analysis. Both parts were subject to polysomal separation, RNA extraction and identification through RNAseq. Results: It was possible to successfully extract and identify total and polysomal RNA from both fresh and frozen tumoral tissue. The quantification of the polysome profile indicated no difference in the translational efficiency estimated in fresh versus frozen tissue. Gene expression data from the fresh versus frozen tissues were compared and the correlation between the polysome associated fresh x frozen (R = 0,89) and total fresh x frozen (0,90) mRNAs was calculated. No difference was identified between the two conditions. Conclusions: We demonstrated that tissue freezing does not affect the polysomal structure, consequently validating the viability of the use of biobank stored tissue for polysome associated RNA analysis (AU)
Descritores: Polirribossomos
RNA
Expressão Gênica
Regulação da Expressão Gênica
Neoplasias
Limites: Humanos
Responsável: BR30.1 - Biblioteca


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Id: lil-505342
Autor: Holetz, Fabíola Barbieri.
Título: Grânulos de processamento de mRNAs em Trypanosoma cruzi / Granules of processing of mRNAs in Trypanosoma cruzi.
Fonte: Curitiba; s.n; 2008. xvii,130 p. ilus, tab, graf.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Instituto Oswaldo Cruz para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: Em tripanossomatídeos a regulação da expressão gênica ocorre principalmente em nível pós-transcricional por mecanismos que envolvem mudanças na estabilidade e no acesso dos mRNAs aos polissomos. Estes mecanismos permitem uma rápida adaptação destes parasitas a diferentes condições as quais são expostos durante o ciclo de vida. Estudos recentes têm demonstrado que grânulos de mRNA, presentes em diversos eucariotos têm papel fundamental na regulação da expressão gênica em nível pós-transcricional. Estes grânulos são divididos em diferentes classes (entre elas os P-bodies e os grânulos de estresse), contém mRNPs não comprometidas com a tradução, compartilham algumas proteínas e podem utilizar mecanismos semelhantes para regular o metabolismo de mRNAs. Os P-bodies são sítios de estocagem e/ou degradação de mRNAs, enquanto os grânulos de estresse estão envolvidos na triagem e estocagem de diversos transcritos. Como existe evidência de que moléculas de mRNA podem ser mantidas estáveis e não associadas à polissomos em T. cruzi, nós conjecturamos a possibilidade de que estas estruturas estejam presentes e sejam funcionais neste parasita. Os genes que codificam alguns componentes de P-bodies estão presentes em T. cruzi e embora algumas proteínas que constituem o cerne destas estruturas pareçam estar ausentes neste parasita, a maioria das funções inerentes aos P-bodies estão representadas. Nós identificamos e clonamos a proteína TcDhh1, uma DEAD box RNA helicase altamente conservada entre os eucariotos e considerada marcadora de P-bodies em mamíferos e leveduras. Esta proteína é constitutivamente expressa durante todo o ciclo de vida do parasita, está presente em complexos independentes de polissomos e está localizada em foci citoplasmáticos que variam em número quando as células são submetidas a condições de estresse ou ao tratamento com as drogas cicloheximida e puromicina. Para determinar a composição destes grânulos, nós realizamos ensaios de...
Descritores: Estruturas Citoplasmáticas
Regulação da Expressão Gênica
Polirribossomos
RNA
Trypanosoma cruzi
Responsável: BR15.1 - Biblioteca de Ciências Biomédicas
BR15.1


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Id: lil-173476
Autor: Blackburn T., Eileen.
Título: Miopatías inflamatorias idiopáticas: revisión bibliográfica / Idiopathic inflammatory myopathies: bibliography review
Fonte: Reumatología (Santiago de Chile);12(1):5-15, 1996. tab.
Idioma: es.
Descritores: Miosite/diagnóstico
-Autoanticorpos/imunologia
Dermatomiosite/fisiopatologia
Doença Mista do Tecido Conjuntivo/complicações
Miosite/classificação
Miosite/complicações
Miosite/tratamento farmacológico
Polimiosite/fisiopatologia
Polirribossomos/imunologia
Prednisona/uso terapêutico
Complicações na Gravidez
Testes Sorológicos
Limites: Humanos
Tipo de Publ: Revisão
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Moussatche, N
Id: lil-77433
Autor: Dâmaso, C. R. A; Moussatché, N.
Título: Vaccinia core transcription prevents in vitro depolymerization of polyribosomes in rabbit reticulocyte lysate
Fonte: Braz. j. med. biol. res = Rev. bras. pesqui. méd. biol;20(6):763-6, 1987. ilus.
Idioma: en.
Conferência: Apresentado em: Annual Meeting of the Federaçäo de Sociedades de Biologia Experimental, 2, Rio de Janeiro, July 8-12, 1987.
Projeto: CNPq; . FINEP.
Resumo: When a rabbit reticulocyte lysate is incubated in the presence of vaccina cores, protein synthesis is umpaired at the level of the initiation step and the polyribosomes are depolymerized. However, when the same system is coupled with virus transcription: a) protein synthesis is restored, b) the initiation step is not inhibited, and c) the polyribosomes are not disaggregated. A viral factor activated in the absence of virus transcription and not activated when RNA synthesis occurs may be involved in the early mechanism of protein synthesis inhibition by vaccinia virus
Descritores: Técnicas In Vitro
Inibidores da Síntese de Proteínas/farmacologia
Polirribossomos/metabolismo
Proteínas/biossíntese
Reticulócitos/metabolismo
Transcrição Genética
Vaccinia/fisiologia
-Proteínas Virais/metabolismo
Vaccinia/genética
Limites: Coelhos
Animais
Responsável: BR26.1 - Biblioteca Central


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Barardi, C. R. M
Villa, L. L
Brentani, R. R
Id: lil-61007
Autor: Barardi, C. R. M; Santos, C. L. S; Villa, L. L; Brentani, R. R.
Título: A direct method for cDNA cloning employing translation released mRNA
Fonte: Braz. j. med. biol. res = Rev. bras. pesqui. méd. biol;20(3/4):313-20, 1987. ilus.
Idioma: en.
Projeto: FAPESP.
Resumo: 1. A new cloning procedure is described for cDNA synthesis from mRNA released by in vitro translation of polysomes in a cell-free amino acid incorporating system. The usefulness of the method lies in the feasibility of employing nanogram amounts of mRNA. 2. Complementary DNA is synthesized derectly in the translation mixture simply by adjusting the concentration of some components and removing ribosomes by boiling and centrifugation. 3. As an example, we report here the construction and characterization of cDNA clone corresponding to chick alfa (1) procollagen starting from a collagen-synthesizing polysome fraction obtained from chick embryos
Descritores: Clonagem Molecular
DNA Recombinante/biossíntese
Técnicas In Vitro
Polirribossomos/metabolismo
RNA Mensageiro/metabolismo
-Colágeno/metabolismo
Limites: Embrião de Galinha
Animais
Responsável: BR26.1 - Biblioteca Central


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Brentani, R. R
Id: lil-10413
Autor: Santos, C. L; Hatada, E. H; D'Abronzo, F; Sonohara, S; Brentani, R. R.
Título: Purification and characterization of procollagen mRNA from a heavy polysomal fraction.
Fonte: Braz. j. med. biol. res = Rev. bras. pesqui. méd. biol;15(6):349-54, 1982.
Idioma: en.
Descritores: Polirribossomos
Pró-Colágeno
Biossíntese de Proteínas
RNA Mensageiro
-Embrião de Galinha
Limites: Animais
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Brentani, R. R
Id: lil-5376
Autor: Santos, C. L; Hatada, E. N; Brentani, R. R.
Título: Traducao "in vitro" e transcricao reversa do mRNA de procolageno. / Translation \"in vitro\" and reverse transcription of procollagen mRNA
Fonte: An. farm. quím. Säo Paulo;21(1):28-40, 1981.
Idioma: pt.
Resumo: Uma fracao de RNA mensageiro (mRNA) foi isolada a partir de RNA total extraido de polissomos de embrioes de galinha e purificada por dois ciclos de cromatografia em oligo (dt) - celulose. A analise deste material por eletroforese em condicoes denaturantes revelou a presenca de um pico homogeneo de moleculas, com um coeficiente de sedimentacao em torno de 28S. A adicao deste mRNA a um sistema de sintese proteica derivado de reticulocitos de coelho induziu a formacao de polipeptideos sensiveis a colagenase bacteriana purificada, com mobilidade eletroforetica igual a das cadeias do procolageno padrao. DNA complementar (cDNA) a mRNA de procolageno foi obtido pelo uso de transcriptase reserva. A analise deste cDNA em gel de agarose alcalino, revelou um tamanho medio correspondente a 565000 daltons. Atraves de experimentos de hibridizacao dos cDNAs de procolageno e globina com seus respectivos mRNAs, em que se assumiu a pureza da preparacao do mRNA de globina como 100%, pode-se estimar, por comparacao, que o mRNA de procolageno apresenta-se 78% puro
Descritores: Pró-Colágeno
RNA Mensageiro
-Globinas
Polirribossomos
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-4949
Autor: Diaz de Leon, L; Breitkreutz, D; Paglia, L; Stern, R.
Título: Aislamiento y caracterizacion parcial de polisomas activos de tejidos calcificados y con matriz extracelular. / Isolation and partial characterization of active polysomes from calcified and matrix-containing tissues
Fonte: Arch. invest. méd;12(3):275-96, 1981.
Idioma: es.
Descritores: Técnicas de Cultura
Polirribossomos
Responsável: BR1.1 - BIREME



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