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Id: lil-779425
Autor: Hernández A, Paula C; Chaparro Olaya, Jacqueline; Velandia, Myriam L; Álvarez M, William Andrés; Pérez N, Paola Andrea.
Título: Muerte celular programada en protozoarios: el caso de Giardia intestinalis / Programmed cell death in protozoa: Giardia intestinalis's case
Fonte: Rev. salud bosque;2(1):25-33, 2012. ilus.
Idioma: es.
Resumo: Giardia intestinalis es considerado uno de los eucariotas más antiguos y su poca complejidad representa una valiosa oportunidad para desentrañar los misterios de procesos vitales de eucariotas más complejos. Esta característica única de G. intestinalis y el hecho de que su genoma esté completamente secuenciado y disponible, y que todo su ciclo de vida puede ser reproducido in vitro, hacen de este parásito un modelo ideal para estudiar mecanismos celulares, entre ellos, la muerte celular programada. Desde el punto de vista morfológico y molecular, la apoptosis es uno de los tipos más complejos de muerte celular programada, la cual es un proceso normal durante el desarrollo celular, y tiene un papel esencial en el control de la proliferación celular y en la respuesta a retos inmunológicos o a daños celulares. Recientemente, se ha reportado que en protozoos, entre ellos Giardia, podría ocurrir un tipo de muerte celular programada similar a la apoptosis y los resultados de nuestros laboratorios apoyan esta hipótesis; sin embargo, no se han identificado hasta el momento las moléculas relacionadas con los procesos de apoptosis en estos parásitos. La presente revisión abarca una descripción de la morfología y estructura de las formas de vida de G. intestinalis, de su ciclo biológico, de la parasitosis que causa y de las estrategias quimioterapéuticas para su tratamiento. Asimismo, se hace un repaso de lo que hasta ahora se conoce sobre apoptosis en protozoarios, y específicamente en G. intestinalis, y se describen algunos resultados de nuestro grupo que apoyan la existencia de muerte celular programada en este parásito.

Giardia intestinalis is an early-branching eukaryote and its low complexity represents a valuable opportunity to unravel the mysteries of essential processes in more complex eukaryotes. In addition, the genome of G. intestinalis is completely sequenced and its entire life cycle can be reproduced in vitro. All these characteristics make of Giardia an ideal model for studying cellular mechanisms, such as programmed cell death. Apoptosis is one of the most complex types of programmed cell death and plays an essential role during cell development, cell proliferation and immune response. Recently it has been reported that in Giardia can take place events that resemble apoptosis and although our results support this hypothesis, molecules involved in this process have not yet been identified. This review includes a description of the morphology and structure of G. intestinalis, its life cycle, the disease that causes and the strategies for its treatment. In addition, we review what is known about apoptosis in protozoa, and specifically in G. intestinalis, and describe some results from our group supporting the existence of apoptosis-like programmed cell death in this parasite.
Descritores: Apoptose
Giardia lamblia/parasitologia
Giardíase/parasitologia
-Células Eucarióticas/citologia
Morte Celular/fisiologia
Trofozoítos/parasitologia
Tipo de Publ: Revisão
Responsável: CO176.1 - Biblioteca Jorge Bejarano


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Id: lil-657614
Autor: Di Conza, José A; Mollerach, Marta E; Gutkind, Gabriel O; Ayala, Juan A.
Título: Dos aislamientos de Salmonella Infantis multirresistentes se comportan como hipoinvasivos pero con elevada proliferación intracelular
Fonte: Rev. argent. microbiol;44(2):69-74, jun. 2012. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: En este trabajo se investigó la presencia de determinantes característicos de plásmidos de virulencia en dos aislamientos clínicos de Salmonella Infantis portadores de plásmidos de multirresistencia. Además, se estudió la capacidad de invasión y proliferación en células eucariotas no fagocíticas. Ninguno de los aislamientos de S. Infantis mostró los determinantes genéticos que caracterizan a los plásmidos de virulencia para este género (operón spv). Los ensayos de invasión sobre líneas celulares eucariotas mostraron que los aislamientos de S. Infantis presentan una capacidad de invasión disminuida pero persisten y proliferan en el citoplasma, independientemente de utilizar una línea celular permisiva (HeLa) o no permisiva (NRK) para tal fin. Finalmente, no se observaron indicios microscópicos que podrían hacer sospechar un efecto bactericida de estas líneas celulares sobre los aislamientos estudiados.

Two multidrug-resistant Salmonella Infantis isolates behave like hypo-invasive strains but have high intracellular proliferation. In this work, plasmid-encoded virulence factors in two Salmonella Infantis isolates carrying multiresistance plasmids were investigated. In addition, their invasion and proliferative ability in non-phagocytic cells was studied. None of them showed the typical determinants of virulence plasmids (spv operon). The invasion assays of S. Infantis isolates on eukaryotic cells showed a decreased ability to Invade but they remained and proliferated In the cytoplasm regardless of having used a permissive (HeLa) or non-permissive (NRK) cell line. Finally, there was no microscopic evidence suggesting a bactericidal effect of these eukaryotic cell lines on the Isolates tested.
Descritores: Farmacorresistência Bacteriana Múltipla/genética
Células Eucarióticas/microbiologia
Fatores R/fisiologia
Salmonella/patogenicidade
-Sangue/microbiologia
Divisão Celular
Linhagem Celular/microbiologia
Infecção Hospitalar/microbiologia
Fezes/microbiologia
Genes Bacterianos
Marcadores Genéticos
Células HeLa/microbiologia
Rim/citologia
Fatores R/genética
Fatores R/isolamento & purificação
Infecções por Salmonella/microbiologia
Salmonella/efeitos dos fármacos
Salmonella/genética
Salmonella/isolamento & purificação
Virulência/genética
Limites: Animais
Seres Humanos
Ratos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: AR1.2 - Instituto de Investigaciónes Epidemiológicas


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Id: lil-644466
Autor: Santos, H. F; Carmo, F. L; Leite, D. C. A; Jesus, H. E; De Carvalho Maalouf, P; Almeida, C; Soriano, A. U; Altomari, D; Suhett, L; Vólaro, V; Valoni, E; Francisco, M; Vieira, J; Rocha, R; Sardinha, B. L; Mendes, L. B; João, R. R; Jesus, R. F; Sebastian, G. V; Pessoa, A; van Elsas, J. D; Rezende, R. P; Pires, D. O; Duarte, G; Castro, C. B; Rosado, A. S; Peixoto, R. S.
Título: Comparison of different protocols for the extraction of microbial DNA from reef corals
Fonte: Braz. j. microbiol;43(2):517-527, Apr.-June 2012. graf, tab.
Idioma: en.
Projeto: CAPES; . CNPq; . FAPERJ.
Resumo: This study aimed to test different protocols for the extraction of microbial DNA from the coral Mussismilia harttii. Four different commercial kits were tested, three of them based on methods for DNA extraction from soil (FastDNA SPIN Kit for soil, MP Bio, PowerSoil DNA Isolation Kit, MoBio, and ZR Soil Microbe DNA Kit, Zymo Research) and one kit for DNA extraction from plants (UltraClean Plant DNA Isolation Kit, MoBio). Five polyps of the same colony of M. harttii were macerated and aliquots were submitted to DNA extraction by the different kits. After extraction, the DNA was quantified and PCR-DGGE was used to study the molecular fingerprint of Bacteria and Eukarya. Among the four kits tested, the ZR Soil Microbe DNA Kit was the most efficient with respect to the amount of DNA extracted, yielding about three times more DNA than the other kits. Also, we observed a higher number and intensities of DGGE bands for both Bacteria and Eukarya with the same kit. Considering these results, we suggested that the ZR Soil Microbe DNA Kit is the best adapted for the study of the microbial communities of corals.
Descritores: Biodiversidade
Células Eucarióticas/citologia
DNA Bacteriano
Microbiologia Ambiental
Elapidae/microbiologia
Técnicas In Vitro
Reação em Cadeia da Polimerase/métodos
Microbiologia do Solo
-Métodos
Protocolos
Solo
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Responsável: BR32.1 - SBIB - Serviço de Biblioteca e Informação Biomédica


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Id: lil-618034
Autor: Pérez-Sayáns, M; Suárez-Peñaranda, JM; Barros-Angueira, F; Diz, PG; Gándara-Rey, JM; García-García, A.
Título: An update in the structure, function, and regulation of V-ATPases: the role of the C subunit / Uma atualização na estrutura, função e regulação das V-ATPases: o papel das subunidades C
Fonte: Braz. j. biol;72(1):189-198, Feb. 2012. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: Vacuolar ATPases (V-ATPases) are present in specialized proton secretory cells in which they pump protons across the membranes of various intracellular organelles and across the plasma membrane. The proton transport mechanism is electrogenic and establishes an acidic pH and a positive transmembrane potential in these intracellular and extracellular compartments. V-ATPases have been found to be practically identical in terms of the composition of their subunits in all eukaryotic cells. They have two distinct structures: a peripheral catalytic sector (V1) and a hydrophobic membrane sector (V0) responsible for driving protons. V-ATPase activity is regulated by three different mechanisms, which control pump density, association/dissociation of the V1 and V0 domains, and secretory activity. The C subunit is a 40-kDa protein located in the V1 domain of V-ATPase. The protein is encoded by the ATP6V1C gene and is located at position 22 of the long arm of chromosome 8 (8q22.3). The C subunit has very important functions in terms of controlling the regulation of the reversible dissociation of V-ATPases.

As Vacuolar ATPases (V-ATPases) estão presentes nas células especializadas em secreção de protões, nas quais eles são bombeados através das membranas de vários organelos intracelulares e da membrana plasmática. O mecanismo de transporte de protões é eletrogênico e estabelece um pH ácido e um potencial transmembrana positivo nestes compartimentos intracelulares e extracelulares. As V-ATPases foram encontradas em todas as células eucarióticas, praticamente idênticas em termos de composição das suas subunidades. Elas têm duas estruturas distintas: um setor periférico catalítico (V1) e uma membrana hidrofóbica (V0), responsável pela condução de protões. A atividade das V-ATPases é regulada por três mecanismos diferentes, os quais controlam a densidade de bomba, associação/dissociação de domínios V1 e V0, e a atividade secretora. A subunidade C é uma proteína de 40-kDa, localizada no domínio V1 da V-ATPase. Essa proteína é codificada pelo gene ATP6V1C e está localizada na posição 22 do braço longo do cromossomo 8 (8q22.3). A subunidade C tem funções muito importantes em termos de controle do regulamento da dissociação reversível da V-ATPase.
Descritores: Subunidades Proteicas/fisiologia
ATPases Vacuolares Próton-Translocadoras/fisiologia
-Membrana Celular/fisiologia
Células Eucarióticas/fisiologia
Relação Estrutura-Atividade
ATPases Vacuolares Próton-Translocadoras/química
Limites: Seres Humanos
Tipo de Publ: Revisão
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-614568
Autor: Zheng, Lu; Liang, Ping; Zhou, JianBo; Huang, XiaoBing; Wen, Yu; Wang, Zheng; Li, Jing.
Título: BC047440 antisense eukaryotic expression vectors inhibited HepG2 cell proliferation and suppressed xenograft tumorigenicity
Fonte: Braz. j. med. biol. res = Rev. bras. pesqui. méd. biol;45(2):97-103, Feb. 2012. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: The biological functions of the BC047440 gene highly expressed by hepatocellular carcinoma (HCC) are unknown. The objective of this study was to reconstruct antisense eukaryotic expression vectors of the gene for inhibiting HepG2 cell proliferation and suppressing their xenograft tumorigenicity. The full-length BC047440 cDNA was cloned from human primary HCC by RT-PCR. BC047440 gene fragments were ligated with pMD18-T simple vectors and subsequent pcDNA3.1(+) plasmids to construct the recombinant antisense eukaryotic vector pcDNA3.1(+)BC047440AS. The endogenous BC047440 mRNA abundance in target gene-transfected, vector-transfected and naive HepG2 cells was semiquantitatively analyzed by RT-PCR and cell proliferation was measured by the MTT assay. Cell cycle distribution and apoptosis were profiled by flow cytometry. The in vivo xenograft experiment was performed on nude mice to examine the effects of antisense vector on tumorigenicity. BC047440 cDNA fragments were reversely inserted into pcDNA3.1(+) plasmids. The antisense vector significantly reduced the endogenous BC047440 mRNA abundance by 41 percent in HepG2 cells and inhibited their proliferation in vitro (P < 0.01). More cells were arrested by the antisense vector at the G1 phase in an apoptosis-independent manner (P = 0.014). Additionally, transfection with pcDNA3.1(+)BC047440AS significantly reduced the xenograft tumorigenicity in nude mice. As a novel cell cycle regulator associated with HCC, the BC047440 gene was involved in cell proliferation in vitro and xenograft tumorigenicity in vivo through apoptosis-independent mechanisms.
Descritores: Carcinoma Hepatocelular/metabolismo
DNA Antissenso/genética
Expressão Gênica
Vetores Genéticos/genética
-Proliferação Celular
DNA Antissenso/metabolismo
Células Eucarióticas/metabolismo
Citometria de Fluxo
Vetores Genéticos/metabolismo
/metabolismo
HEP GTEMEFOS CELLS/metabolismo
Camundongos Nus
Transplante de Neoplasias
Plasmídeos/genética
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
RNA Mensageiro/análise
Transfecção
Ensaios Antitumorais Modelo de Xenoenxerto
Limites: Animais
Seres Humanos
Camundongos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-601527
Autor: Santander González, Sandra Paola; Urueña Pinzon, Claudia Patricia; Castañeda Rendón, Diana; Cifuentes López, Claudia Emilce; Aristizábal Gutiérrez, Fabio Ancízar; Cordero Camacho, Claudia Patricia; Fiorentino Gómez, Susana.
Título: Influencia del tratamiento de Petiveria alliacea en la expresión diferencial de genes en células tumorales / Differential gene expression in tumor cells induced by Petiveria alliacea treatment
Fonte: Univ. med;50(3):284-296, jul.-dic. 2009. tab, ilus.
Idioma: es.
Resumo: El estudio del perfil de expresión génica en las células eucariotas se constituye como una herramienta importante en el entendimiento de las huellas moleculares generadas en respuesta a un estímulo farmacológico. A partir de Petiveria alliacea, una de las plantas colombianas con actividad antitumoral, se ha obtenido la fracción FAST 8 7:3, en la cual se han encontrado diferentes compuestos, como el trisulfuro de dibencilo, uno de los componentes antitumorales más potentes reportados para la planta. Esta fracción también posee actividad citotóxica sobre la línea de células tumorales K562 e induce cambios en el perfil de expresión de genes, que podrían estar relacionados de alguna forma con la actividad antitumoral tradicional reportada para esta planta. Esta actividad puede ser ejercida, en parte, por la presencia del trisulfuro de dibencilo y por la actividad de los otros componentes de la fracción. En este contexto, proponemos el uso del ADNc-AFLP como herramienta útil en la tamización del perfil de genes transcritos en las células tumorales y, también, como herramienta útil para el descubrimiento de nuevos fármacos antitumorales...

Abstract Gene expression profile in eukaryotic cells is a very useful tool to understand the molecular footprint responsible for the pharmacological response to a stimulus. In the present study a fraction named FAST 8 (7:3), obtained from Petiveria alliacea, was used as stimulus to track out the gene expression profile on K562 cell line. P. alliacea is a plant that grows in Colombia, and in traditional medicine is used for its anti-tumoral activity. Of the different compounds present in the fraction, dibenzyl trisulfide (DTS), is a compound described by previous reports to have anti-tumoral properties. The fraction exhibits cytotoxic activity over tumor cell line K562 inducing changes in gene expression profile. DTS might be in part responsible for the fraction activity, but the other compounds may also contribute to the biological response. Herein, we propose the use of cDNAAFLP as a useful tool for gene expression profile screening of tumoral cells and in the discovery of new anti-tumoral drugs...
Descritores: Células Eucarióticas
Preparações Farmacêuticas
Responsável: CO185.1 - Biblioteca Alfonso Borrero Cabal, S. J.


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Id: lil-589921
Autor: Peak, Emily; Hoffmann, Karl F.
Título: Cross-disciplinary approaches for measuring parasitic helminth viability and phenotype
Fonte: An. acad. bras. ciênc;83(2):649-662, June 2011. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: Parasitic worms (helminths) within the Phyla Nematoda and Platyhelminthes are responsible for some of the most debilitating and chronic infectious diseases of human and animal populations across the globe. As no subunit vaccine for any parasitic helminth is close to being developed, the frontline strategy for intervention is administration of therapeutic, anthelmintic drugs. Worryingly, and unsurprising due to co-evolutionary mechanisms, many of these worms are developing resistance to the limited compound classes currently being used. This unfortunate reality has led to a renaissance in next generation anthelmintic discovery within both academic and industrial sectors. However, a major bottleneck in this process is the lack of quantitative methods for screening large numbers of small molecules for their effects on the whole organism. Development of methodologies that can objectively and rapidly distinguish helminth viability or phenotype would be an invaluable tool in the anthelmintic discovery pipeline. Towards this end, we describe how several basic techniques currently used to assess single cell eukaryote viability have been successfully applied to parasitic helminths. We additionally demonstrate how some of these methodologies have been adopted for high-throughput use and further modified for assessing worm phenotype. Continued development in this area is aimed at increasing the rate by which novel anthelmintics are identified and subsequently translated into everyday, practical applications.

Vermes parasíticos (helmintos) dos filos Nematoda e Platelmintos são responsáveis por algumas das doenças infecciosas crônicas e mais debilitantes das populações humana e animal em todo o globo. Já que nenhuma vacina está prestes a ser desenvolvida para nenhum parasita helmíntico, a frente estratégica de intervenção é a administração de drogas terapêuticas anti-helmínticas. De maneira preocupante, e não surpreendente devido a mecanismos coevolutivos, muitos destes vermes estão desenvolvendo resistência às limitadas classes de compostos que têm sido usados no momento. Esta infeliz realidade levou a um renascimento na descoberta de uma nova geração de anti-helmínticos tanto no setor acadêmico quanto no industrial. Contudo, um importante gargalo neste processo é a falta de métodos quantitativos para testar um grande número de pequenas moléculas em relação aos efeitos sobre o organismo inteiro. O desenvolvimento de metodologias que possam distinguir objetiva e rapidamente a viabilidade dos helmintos ou o fenótipo seria uma ferramenta valiosa para canalizar a descoberta de anti-helmínticos. Para este fim, descrevemos aqui como muitas técnicas básicas, correntemente usadas para avaliar a viabilidade de células únicas de eucariotos, têm sido aplicadas com sucesso para helmintos parasíticos. Adicionalmente demonstramos como algumas destas metodologias foram adotadas para uso em larga escala e além disso modificadas para avaliar o fenótipo de vermes. O desenvolvimento contínuo nesta área está voltado para aumentar a taxa com que novos anti-helmínticos são identificados e subsequentemente traduzidos em aplicações práticas cotidianas.
Descritores: Células Eucarióticas
Helmintos/genética
Fenótipo
-Anti-Helmínticos
Descoberta de Drogas/métodos
Helmintos/citologia
Helmintos/efeitos dos fármacos
Limites: Animais
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Silva, Maeli Dal Pai
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Id: lil-484617
Autor: Poletto, Andréia B; Wasko, Adriane P; Oliveira, Claudio; Azevedo, Alexandre; Carvalho, Robson F; Silva, Maeli Dal Pai; Foresti, Fausto; Martins, Cesar.
Título: Identities among actin-encoding cDNAs of the Nile tilapia (Oreochromis niloticus) and other eukaryote species revealed by nucleotide and amino acid sequence analyses
Fonte: Genet. mol. biol;31(1,suppl):325-356, 2008. ilus, tab.
Idioma: en.
Projeto: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; . Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.
Resumo: Actin-encoding cDNAs of Nile tilapia (Oreochromis niloticus) were isolated by RT-PCR using total RNA samples of different tissues and further characterized by nucleotide sequencing and in silico amino acid (aa) sequence analysis. Comparisons among the actin gene sequences of O. niloticus and those of other species evidenced that the isolated genes present a high similarity to other fish and other vertebrate actin genes. The highest nucleotide resemblance was observed between O. niloticus and O. mossambicus a-actin and b-actin genes. Analysis of the predicted aa sequences revealed two distinct types of cytoplasmic actins, one cardiac muscle actin type and one skeletal muscle actin type that were expressed in different tissues of Nile tilapia. The evolutionary relationships between the Nile tilapia actin genes and diverse other organisms is discussed.
Descritores: Actinas
DNA Complementar
Peixes/genética
-Sequência de Aminoácidos
Células Eucarióticas
Nucleotídeos
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
Limites: Animais
Responsável: BR26.1 - Biblioteca Central


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Texto completo SciELO Brasil
Ambar, Guilherme
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Id: lil-440445
Autor: Bacci Junior, Maurício; Soares, Rafael B. S; Tajara, Eloíza; Ambar, Guilherme; Fischer, Carlos N; Guilherme, Ivan R; Costa, Eduardo P; Miranda, Vitor F. O.
Título: Identification and frequency of transposable elements in Eucalyptus
Fonte: Genet. mol. biol;28(3,suppl):634-639, Nov. 2005. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Transposable elements (TE) are major components of eukaryotic genomes and involved in cell regulation and organism evolution. We have analyzed 123,889 expressed sequence tags of the Eucalyptus Genome Project database and found 124 sequences representing 76 TE in 9 groups, of which copia, MuDR and FAR1 groups were the most abundant. The low amount of sequences of TE may reflect the high efficiency of repression of these elements, a process that is called TE silencing. Frequency of groups of TE in Eucalyptus libraries which were prepared with different tissues or physiologic conditions from seedlings or adult plants indicated that developing plants experience the expression of a much wider spectrum of TE groups than that seen in adult plants. These are preliminary results that identify the most relevant TE groups involved with Eucalyptus development, which is important for industrial wood production
Descritores: Elementos de DNA Transponíveis
Eucalyptus/genética
Genoma de Planta
-Células Eucarióticas
Etiquetas de Sequências Expressas
Responsável: BR26.1 - Biblioteca Central


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Texto completo SciELO Chile
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Id: lil-424717
Autor: López-Lastra, Marcelo; Rivas, Andrea; Barría, María Inés.
Título: Protein synthesis in eukaryotes: The growing biological relevance of cap-independent translation initiation
Fonte: Biol. Res;38(2/3):121-146, 2005. ilus.
Idioma: en.
Projeto: Pontificia Universidad Católica de Chile; . FONDECYT.
Resumo: Ribosome recruitment to eukaryotic mRNAs is generally thought to occur by a scanning mechanism, whereby the 40S ribosomal subunit binds in the vicinity of the 5'cap structure of the mRNA and scans until an AUG codon is encountered in an appropriate sequence context. Study of the picornaviruses allowed the characterization of an alternative mechanism of translation initiation. Picornaviruses can initiate translation via an internal ribosome entry segment (IRES), an RNA structure that directly recruits the 40S ribosomal subunits in a cap and 5' end independent fashion. Since its discovery, the notion of IRESs has extended to a number of different virus families and cellular RNAs. This review summarizes features of both cap-dependent and IRES-dependent mechanisms of translation initiation and discusses the role of cis-acting elements, which include the 5'cap, the 5'-untranslated region (UTR) and the poly(A) tail as well as the possible roles of IRESs as part of a cellular stress response mechanism and in the virus replication cycle.
Descritores: RNA Mensageiro/análise
RNA Mensageiro/biossíntese
RNA Mensageiro/genética
Células Eucarióticas/citologia
Células Eucarióticas/fisiologia
Células Eucarióticas/virologia
Fatores de Iniciação em Eucariotos/análise
Fatores de Iniciação em Eucariotos/biossíntese
Fatores de Iniciação em Eucariotos/genética
Proteínas
-RNA Ribossômico/análise
RNA Ribossômico/biossíntese
RNA Ribossômico/síntese química
Limites: Seres Humanos
Animais
Tipo de Publ: Revisão
Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central



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