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| Id: |
lil-140741
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| Autor: |
Nagy, P. I; Hopfinger, A. J. |
| Título: |
Analise conformacional de modelos de peptidios para a proteina aderente do mexilhao, Mytilus edulis L / Conformational analyses of model peptides for the adhesive protein of the mussel, Mytilus edulis L
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| Fonte: |
Rev. farm. bioquim. Univ. Säo Paulo;30(2):41-7, jul.-dez. 1994. ilus, tab.
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| Idioma: |
en.
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| Resumo: |
Efetuaram-se simulacoes de dinamica molecular a 298 K, usando o programa MOLSIM, para o tridecamero peptidico modelo da proteina aderente do mexilhao Mytilus edulis L. Os resultados estruturais sao comparados aos obtidos com o uso de tecnicas de mecanica molecular e de minimizacao de energia. O tridecamero adota estrutura de dupla volta reversa para as sequencias Lys-Pro-Ser-Tyr e Hyp-Hyp-Thr-Dopa. Na primeira volta, encontrou-se estrutura beta em mais que 50 porcento das simulacoes. Para as trajetorias remanescentes, adotou-se geralmente uma volta gama, composta de residuos de Lys-Pro-Ser. A segunda volta e uma volta beta, que e conservada atraves de simulacoes utilizando modelos e temperaturas diferentes. As duas voltas adjacentes garantem estrutura globular para o modelo da proteina, que e mantida em faixas de constantes dieletricas moleculares entre 1 e 15. Encontrou-se uma conformacao estendida como sendo uma conformacao secundaria, de energia maior em 40-90 kcal tridecamero. Identificaram-se diversas ligacoes de hidrogenio, que mantem a volta dupla estavel. A maioria dessas ligacoes de hidrogenio compreende um grupo OH, que pode explicar a porcentagem extraordinariamente alta de residuos contendo OH, especialmente Hyp e Dopa. A conformacao do modelo de proteina incorpora cadeias laterais de Lys, Dopa e Tyr, que apresentam as funcoes polares proximas umas das outras. Esse arranjo favorece uma geometria de ligacao cruzada na proteina, proposta a partir dos resultados experimentais com a placa aderente
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| Descritores: |
Modelos Moleculares
Estrutura Molecular
Mytilus edulis
Peptídeos/biossíntese
Proteínas/biossíntese
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-Conformação Proteica
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| Tipo de Publ: |
Estudo Comparativo
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| Responsável: |
BR40.1 - DBD - Divisão de Biblioteca e Documentacão do Conjunto das Químicas
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