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Id: lil-729495
Autor: Camacho Kurmen, Judith Elena; González, Gloria; Klotz, Bernadette.
Título: Producción de Astaxantina en Haematococcus pluvialis bajo diferentes condiciones de estrés / Astaxanthin Production in Haematococcus pluvialis under different stress conditions
Fonte: NOVA publ. cient;11(19):94-104, Jan.-June 2013. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: Las microalgas son fuente de un gran número de compuestos bioactivos de interés industrial, como los carotenoides que se utilizan como colorantes naturales en alimentación animal y humana, así como en la industria farmacéutica, cosmética y en la acuicultura. Además se han propuesto como agentes efectivos en la prevención de una variedad de enfermedades, debido a su capacidad antioxidante, inmunoregulaora, anti-inflamatoria y anti-cancerígena. El ketocarotenoide astaxantina es el más importante desde el punto de vista biotecnológico. Hoy la mayor cantidad de astaxantina es producida por síntesis química y es vendida a un precio de US $2500/kg. El alto precio y el incremento en la demanda para este compuesto, especialmente de origen natural, en las diferentes industrias, hace que sea de interés la producción astaxantina a partir de microalgas como el Haematococcus pluvialis, que acumula cantidades importantes (más del 4%/g de peso seco) y de mejor calidad que las obtenidas por otras fuentes como levaduras y plantas. La acumulación del pigmento en H. pluvialis ocurre durante la transformación de la microalga desde el estado vegetativo (fase verde) a aplanospora (fase roja) cuando cesa su crecimiento en la fase estacionaria. Los tipos de estrés que inducen a la acumulación de astaxantina son temperatura, intensidad lumínica, ciclos de luz/oscuridad, concentración de nutrientes, pH, especies reactivas de oxígeno, sales y presencia de inhibidores de procesos metabólicos a diferente nivel. Es importante resaltar que esta microalga es de difícil cultivo; así como en la obtención del pigmento en cantidades de interés, debido a su ciclo celular complejo. De igual forma, un mayor entendimiento de las bases moleculares de la relación -condiciones de estrés-inducción- acumulación de astaxantina en H. pluvialis, podría ser útil para aumentar la productividad de astaxantina.

Microalgae are a source of a large number of bioactive compounds of industrial importance, such as carotenoids used as natural colorants in food and feed, as well as in pharmaceuticals, cosmetics and aquaculture. They also have been studied as effective compounds for the prevention of different diseases due to their antioxidant, immunoregulatory, anti-inflammatory and anticarcinogenic properties. In biotechnology applications astaxanthin is the most important ketocarotenoide. Currently most astaxanthin is produced by chemical synthesis and sold at U.S. $ 2500/kg. The high price and increasing demand of this compound in different industries, especially of natural origin creates an interest in the astaxanthin production from microalgae as Haematococcus pluvialis that accumulate significant amounts (more than 4%/g dry weight) and better quality what is obtained from sources such as yeast and plants. The pigment accumulation in H. pluvialis occurs during the transformation of microalgae from the vegetative state (green phase) to aplanospora (red phase) when growth ends in the stationary phase. The types of stress that induce astaxanthin accumulation are temperature, light intensity, cycles of light / dark, nutrient concentration, pH, reactive oxygen species, salts and presence of metabolic processes inhibitors at different levels. Is important to take in account that this microalgae is hard to grow and obtain the pigment in amounts of interest could be complicated due to complex cell cycle. Similarly, a better understanding of the molecular basis of the relationship, stress-inducing conditions, astaxanthin accumulation in H. pluvialis, might be helpful for increasing productivity of astaxanthin.
Descritores: Estresse Psicológico
-Plantas
Carotenoides
Genética
Limites: Humanos
Responsável: CO332 - Facultad de Medicina


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Id: biblio-998796
Autor: Bueno, Natalia Fernanda.
Título: Caracterização de dois pares efetor/inibidor associados ao sistema de secreção tipo IV de Xanthomonas citri / Characterization of the two effector/inhibitor pair associated with the type IV secretion system of Xanthomonas citri.
Fonte: São Paulo; s.n; 2018. 159 p. graf, tab.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Instituto de Química para obtenção do grau de Mestre.
Resumo: O sistema de secreção tipo IV (T4SS) da família de bactérias Xanthomonadaceae transfere efetores (X-Tfes) com a capacidade de matar outras bactérias, conferindo uma vantagem em comunidades bacterianas mistas para colonizar diferentes nichos como o solo ou as superfícies das plantas. Os X-Tfes possuem diferentes domínios putativos com atividades hidrolíticas contra componentes do envelope celular bacteriano do tipo: glicohidrolases, transglicosilases, amidases e lipases. Os X-Tfes por sua atividade biológica inata podem ocasionar dano intracelular para a bactéria que os produz. Para se proteger contra estas atividades, também são produzidas lipoproteínas com função inibitoria (X-Tfis) localizadas no periplasma. Os genes que codificam os X-Tfes e os X-Tfis estão organizados em operons, o que permite gerar os pares efetor/inibidor simultaneamente. Entre os potenciais X-Tfes do fitopatógeno Xanthomonas citri estão Xac1918 e Xac0574. Xac1918 é uma proteína com um domínio da superfamília da lisozima e um domínio conhecido como RTX (Repeats in Toxin) de ligação ao cálcio, enquanto Xac0574 tem um domínio da superfamília da lipase 3. Os seus possíveis inibidores, Xac1917 e Xac0573 respectivamente, apresentam um peptídeo sinal no N-terminal contendo o lipobox representativo das lipoproteínas. As proteínas Xac0574 e Xac0573 são monômeros em solução que formam um complexo estável 1:1, favorecido termodinamicamente (ΔG°= -12 Kcal/mol) com uma constante de dissociação de 2,45 nM, garantindo que a bactéria fique protegida contra os efeitos nocivos de Xac0574 quando é produzida intracelularmente. Xac0574 é uma fosfolipase A1, sem atividade lisofosfolipase, com a capacidade de hidrolisar os três fosfolipídios majoritários que compõem a membrana celular bacteriana, fosfatidilglicerol (PG), cardiolipina e fosfatidiletanolamina (PE), mostrando uma aparente preferência pelo último. A atividade enzimática de Xac0574 explica a forte inibição do crescimento celular em E. coli após da sua indução heteróloga, já que gera uma diminuição de quase 10 vezes da população celular comparada com a cultura não induzida com a mesma construção. Poroutro lado, Xac0573 inibe efetivamente a atividade enzimática de Xac0574 ao formar o complexo, além de não ter atividade fosfolipase nem lisofosfolipase. Foram produzidos cristais da Xac1918 e Xac0573 que difrataram com uma resolução de 3,0 e 2,5 Å, respectivamente. Porém, só foi gerado um modelo de Xac0573. Xac0573 está composta por duas folhas ß antiparalelas com uma topologia característica de ß sanduíche Com uma pequena hélice e duas voltas. Um alinhamento de homólogos de Xac0573 identificou nas extremidades da proteína as regiões conservadas, constituindo duas possíveis interfaces de interação que podem ser as responsáveis por bloquear o acesso dos fosfolipídios ao sítio catalítico ou impedir os rearranjos estruturais de Xac0574 que são necessários para a sua atividade enzimática. Adicionalmente, a topologia da Xac0573 é semelhante do domínio C2, conhecido em eucariotos como domínio de ligação ao lipídio e ao cálcio, e está envolvido em processos de sinalização de segundos mensageiros lipídicos, proteínas de trafego de membranas e mecanismos de fusão de membranas. Nossos resultados apontam para uma nova função biológica do domínio C2 como um inibidor enzimático intracelular em bactérias

The type IV secretion system (T4SS) of the bacteria family Xanthomonadaceae transfers effectors (X-Tfes) with that can kill other bacterial cells, conferring an advantage to the bacterial community during colonization of different niches in the soil or on the plant surface. The X-Tfes possess different putative domains with hydrolytic activity against components of the bacterial cellular envelope, including glycohydrolase, transglycolase, amidase and lipase domain. The innate biological activity of X-Tfes can cause intracellular damage. Therefore, the bacteria that produce them also produce lipoproteins with inhibitor function (X-Tfis) located in the periplasm for their protection. The genes that code for X-Tfes and X-Tfis are organized in operons that allow for their simultaneous expression. Among the X-Tfes of the phytopathogen Xanthomonas citri are Xac1918 and Xac0574. Xac1918 is carries a lysozyme superfamily domain, as well as a domain known as RTX (Repeats in Toxic) predict to bind calcium, while, Xac0574 has a domain belonging to the lipase 3 superfamily. Their possible inhibitors, Xac1917 e Xac0573 respectively, carry an N-terminal signal peptide containing a lipobox found in bacterial lipoproteins. The Xac0574 and Xac0573 proteins are both monomers in solution, They can form a stable 1:1 complex, that is thermodynamically favored (ΔG°= -12 Kcal/mol) with a dissociation constant of 2,45 nM. This affinity ensure that the bacterium is protected against the harmful effects of Xac0574 when it is produced intracellularly. We show that Xac0574 is a phospholipase A1, without lisophospholipase activity, and is able to hydrolyze the three most common phospholipids found in the membranes of Gram negative bacteria, namely phosphatidylglycerol (PG), cardiolipin and phosphatidylethanolamine (PE), presenting an apparent preference for PE. The enzymatic activity of Xac0574 explains the strong inhibition of growth of E. coli cells after its heterologous induction: a nearly 10-fold decrease in the cell population is observed when compared to the non-induced culture with the same construct. On the other hand, Xac0573 effectively inhibits the enzymatic activity of Xac0574. Furthermore, Xac0573 does not possess when forming the complex, besides not having phospholipase nor lysophospholipase activity.Crystals of Xac1918 and Xac0573 were produced which diffracted with to resolution of 3.0 and 2.5 Å, respectively. However, we were able to resolve the structure of only Xac0573. Xac0573 is composed of two anti-parallel sheet that form a ß-sandwich with three small helices. An alignment to Xac0573 homologs identified conserved regions at the ends of the protein that constitute two possible interfaces of interaction that may be responsible for blocking the access of the phospholipids to the catalytic site or impede the structural rearrangements of Xac0574 that are necessary for its enzymatic activity. Additionally, the topology of Xac0573 is similar to that to C2 domains, known in eukaryotes to bind lipids and calcium and to be involved in signaling processes mediated by lipid second messengers, membrane trafficking and membrane fusion mechanisms. Our results point to a new biological function of the C2 domain as an intracellular enzyme inhibitor in bacteria
Descritores: Plantas
Solo
Xanthomonas/classificação
Sistemas de Secreção Tipo IV/análise
-Reação em Cadeia da Polimerase/tendências
Biologia Molecular/classificação
Responsável: BR40.1 - DBD - Divisão de Biblioteca e Documentacão do Conjunto das Químicas
BR40.1; T574.88, B928c. 30100026134-Q


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Id: biblio-1361621
Autor: Albuquerque, Marcela Albuquerque Cavalcanti de.
Título: Effect of vegetable by-products on folate production by starter and probiotic microorganisms to develop a bio-enriched fermented soy product / Efeito de subprodutos vegetais na produção de folatos por microrganismos starter e probióticos para o desenvolvimento de um produto de soja fermentado bioenriquecido.
Fonte: São Paulo; s.n; 2018. 177 p. tab, ilus, graf.
Idioma: en.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Faculdade de Ciências Farmacêuticas para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: However, folate production was strain-dependent and also dependent on the environmental conditions and on the vegetable substrate used. Passion fruit by-product presented the lowest folate concentration and was selected for the following experiments. Thus, the impact of the supplementation of soymilk with passion fruit by-product and/or commercial prebiotic fructooligosaccharides FOS P95 on the folate production by three St. thermophilus strains, as well as four probiotic Lactobacillus strains (LA-5, LGG, PCC, and RC-14) were evaluated. St. thermophilus ST-M6 and TH-4 produced the highest amounts of folate in all fermented soymilks. The concentration of the vitamin was also high when these strains grew in co-culture with LA-5 and LGG. Soymilk supplemented with both passion fruit by-product and FOS together presented the highest concentration of folate when fermented by the co-culture TH-4+LGG. This co-culture was selected to produce four fermented soy products (FSP). All FSP were bio-enriched with folate produced by the co-culture and the probiotic strain LGG remained always above 8 log CFU/mL until the end of the storage period (28 days at 4ºC). In contrast, the concentration of the vitamin was stable until day 14 then a slight decrease was observed at the end of the storage period. The FSP supplemented with both passion fruit by-product and FOS together may contribute with around 14% of the recommended daily intake for folate if consumed until day 14 of storage. During the in vitro simulated gastrointestinal conditions, the folate content of the digested FSP increased from 1.3 to 3.6-fold, especially at the small and large intestinal in vitro phases and the strain LGG was recovered. In contrast, St. thermophilus TH-4 was not recovered during the assay. Finally, the prebiotic potential of the bioactive compounds present in the fruit by-products was characterized. Fruit by-product water extracts (FWE) containing soluble fibres from fruit by-products were obtained through a hot-water extraction and were associated to phenolic compounds and showed antioxidant activity. The FWE (especially, orange and mango water extracts) presented an anti-inflammatory potential by decreasing the nitric oxide concentration produced in vitro by macrophages stimulated with lipopolisaccharides (LPS) from Salmonella Thyphymurium. The FWE (especially from mango) were able to stimulate the growth of the strains TH-4 and LGG, as well the folate production by these microorganisms when tested individually and in co-culture. The FWE also increased the adhesion of TH-4 and LGG to Caco-2 cells in an in vitro model. These results suggest a prebiotic potential of the fruit by-products evaluated and their potential towards increased folate production by the selected microorganisms. Therefore, the bio-enrichment of fermented soy products with folate produced by beneficial microorganisms is an alternative for the development of functional foods with high folate content. Additionally, fermentable bioactive compounds with functional and/or biological activity, such as soluble fibres associated to phenolic compounds with antioxidant activity, present in the fruit by-products, may act as potential prebiotic ingredients. These bioactive molecules may represent a potential natural alternative to synthetic drugs for the treatment of inflammatory processes

O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de subprodutos vegetais, incluindo subprodutos do processamento de fruta (maracujá, laranja, acerola e manga) e de soja (okara) na produção de folatos de novo por microrganismos strater e probióticos para bioenriquecer um produto de soja fermentado. Na primeira etapa deste trabalho, o impacto da farinha de amaranto na produção de folatos pelos microrganismos também foi avaliado. Neste sentido, primeiramente, verificou-se o efeito desses subprodutos vegetais e da farinha de amaranto na capacidade de três cepas starter - Streptococcus thermophilus (ST-M6, TH-4 e TA-40) e 10 cepas probióticas (Lactobacillus (Lb.) acidophilus LA-5, Lb. fermentum PCC, Lb. reuteri RC-14, Lb. paracasei subsp. paracasei Lb. casei 431, Lb. paracasei subsp. paracasei F19, Lb. rhamnosus GR-1, and Lb. rhamnosus LGG, Bifidobacterium (B.) animalis subsp. lactis BB-12, B. longum subsp. longum BB-46, e B. longum subsp. infantis BB-02) em produzir folato utilizando um caldo MRS modificado. A maior parte dos microrganismos testados foi capaz de produzir folato. Entretanto, a produção foi considerada cepa-dependente e, também, dependente das condições ambientais e do tipo de subproduto vegetal empregado. O subproduto de maracujá apresentou a menor concentração de folato e, por isso, foi selecionado para os testes seguintes. Neste sentido, o impacto da suplementação do leite de soja com subproduto de maracujá e/ou com o prebiótico comercial fruto-oligosacarídeo FOS P95 na produção de folato pelas três cepas de St. thermophilus, bem como quarto cepas probióticas do gênero Lactobacillus (LA-5, LGG, PCC e RC-14), também foi avaliado. Em cultura pura, as cepas de St. thermophilus ST-M6 e TH-4 produziram grande quantidade de folato nas formulações de extrato de soja fermentados. A concentração da vitamina foi maior quando tais cepas se desenvolveram em co-cultura com LA-5 e LGG. Observou-se que o extrato de soja suplementado concomitantemente com subproduto de maracujá e FOS apresentou a maior quantidade de folato quando fermentado pela co-cultura TH-4+LGG. Esta co-cultura, portanto, foi selecionada para desenvolver os produtos fermentados de soja (PFS). Todas as formulações foram bioenriquecidas e a cepa LGG manteve-se viável por todo o período de armazenamento (28 dias a 4ºC). Entretanto, a concentração da vitamina manteve-se estável apenas até o dia 14, observando-se uma diminuição da quantidade de folato ao final do período de armazenamento. Constatou-se que o produto fermentado de soja suplementado concomitantemente com subproduto de maracujá e FOS pode contribuir com cerca de 14% da ingestão diária recomendada para folato se consumido até o dia 14 do armazenamento. Além disso, durante a simulação gastrointestinal in vitro, observou-se que a digestão aumentou de 1,3 a 3,6 vezes a concentração da vitamina incrementando, consideravelmente, a bioacessibilidade do folato, principalmente nas porções simuladas do intestino delgado e grosso do intestino e a cepa LGG foi recuperada. Entretanto, a cepa St. thermophilus TH-4 não foi recuperada durante o ensaio. Por fim, o potencial prebiótico de componentes bioativos presentes nos subprodutos de fruta foi caracterizado. Uma extração Hot Water foi conduzida, a fim de obter extratos aquosos de subprodutos de fruta ricos em fibras solúveis associadas a compostos fenólicos com atividade antioxidante. Observou-se, ainda, que tais extratos aquosos de subprodutos de fruta (laranja e manga) apresentaram potencial anti-inflamatório constatado pela diminuição da concentração de óxido nítrico produzido por macrófagos estimulados com lipopolissacarideo (LPS) de Salmonella Typhymurium in vitro. Além disso, os extratos aquosos de subprodutos de fruta (principalmente o extrato aquoso de subproduto de manga) foram capazes de estimular a multiplicação das cepas TH-4 e LGG, bem como a produção de folatos por estes microrganismos quando avaliados individualmente e em co-cultura. Adicionalmente, esses extratos aquosos de subprodutos de fruta aumentaram a adesao do TH-4 e do LGG a células Caco-2 em modelo in vitro. Neste sentido, os resultados sugerem um potencial prebiótico dos subprodutos de fruta testados, de modo a estimular, não somente o desenvolvimento dos microrganismos avaliados mas, principalmente, o potencial destes em produzir folatos na presença dos substratos vegetais testados. O bioenriquecimento dos produtos fermentados de soja com folatos produzidos por microrganismos benéficos emerge como alternativa de alimento potencialmente funcional com alto teor de folato. Adicionalmente, compostos bioativos fermentescíveis e com atividade biológica como, por exemplo, as fibras solúveis associadas a compostos fenólicos com atividade antioxidante, presentes nos subprodutos de fruta testados podem constituir potenciais ingredientes prebióticos, além de representarem uma possível alternativa natural para o tratamento de processos inflamatórios
Descritores: Plantas/efeitos adversos
Soja/efeitos adversos
Probióticos/análise
Leite de Soja/farmacologia
Prebióticos/análise
Frutas/efeitos adversos
-Técnicas In Vitro/métodos
Ácidos Pteroilpoliglutâmicos/antagonistas & inibidores
Técnicas de Cocultura/métodos
Alimento Funcional/análise
Anti-Inflamatórios/farmacologia
Responsável: BR40.1 - DBD - Divisão de Biblioteca e Documentacão do Conjunto das Químicas
BR40.1; T664, A345e. 30100022470-F


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Id: biblio-1361862
Autor: Souza, Ana Paula Silva de.
Título: Caracterização bioquímica e funcional da proteína XadA3 de Xylella fastidiosa / Biochemistry and functional characterization of Xylella fastidiosa XadA3 adhesin.
Fonte: São Paulo; s.n; 2018. 135 p. tab, graf, ilus.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Instituto de Química para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: Gram-negativas e é utilizado por diversos patógenos para colonizar seus hospedeiros, sendo o primeiro passo do processo de desenvolvimento do biolfilme. Uma variedade de apêndices celulares e proteínas está envolvida na adesão bacteriana, tais como pili, fimbrias, adesinas fimbriais e afimbriais. O fitopatógeno Xylella fastidiosa, agente causal de importantes doenças como a doença de Pierce de videiras, a clorose variegada dos citros e a síndrome do rápido declínio de oliveiras, possui em sua superfície várias dessas estruturas que são potencialmente responsáveis pela colonização eficiente de insetos-vetores e plantas hospedeiras. Entre as adesinas afimbriais codificadas no genoma dessa bactéria, três XadA (XadA1, Hsf/XadA2 e XadA3) são classificadas como autotransportadores triméricos. Dados da literatura sugerem que XadA1 e XadA2 são importantes para a formação do biofilme, porém a função de XadA3 ainda não havia sido investigada. Nesse trabalho, tivemos como objetivo caracterizar bioquímica e funcionalmente a proteína XadA3 e obter informações adicionais sobre o papel desempenhado por XadA1 e XadA2 na adesão e virulência de X. fastidiosa. Utilizando imunodetecção com um anticorpo policlonal anti-XadA3 por nós obtido, demonstramos que essa proteína localiza-se na superfície bacteriana e medeia a adesão intercelular. A caracterização dos fenótipos de mutantes de deleção de cada um dos genes das adesinas XadA revelou que o mutante ΔxadA3 tem reduzida capacidade de agregação celular e formação de biofilme quando comparado tanto aos mutantes ΔxadA1 e ΔxadA2 como à cepa selvagem Temecula. A deleção dos genes xadA afeta marginalmente o perfil de expressão gênica global avaliado através de RNAseq das cepas mutantes comparativamente à cepa selvagem, porém destaca-se, nas cepas mutantes, o aumento nos níveis dos transcritos de lipases/esterases. Já foi descrito que essas enzimas parecem atuar na degradação do tecido vegetal associada aos sintomas da doença de Pierce de videiras. A deleção de xadA3 resulta em um fenótipo de hipervirulência em videiras, mas também de deficiência de transmissão pelo inseto-vetor. O conjunto dos resultados obtidos nesse trabalho evidenciam o importante papel desempenhado pelas adesinas XadAs, particularmente XadA3, na adesão intercelular, no desenvolvimento do biofilme e na virulência de X. fastidiosa

Adhesion is a widely conserved mechanism of virulence among Gram-negative bacteria that is used by several pathogens to colonize their hosts, being the first step in biolfilm development. A variety of appendages and proteins are involved in bacterial adhesion, such as pili, fimbriae, fimbrial and afimbrials adhesins. The phytopathogen Xylella fastidiosa, causal agent of important diseases such as Pierce's disease of grapevines, citrus variegated chlorosis and olive quick decline syndrome, harbours on its surface several of these structures that are potentially responsible for efficient colonization of insect vectors and plant hosts. Among the afimbrial adhesins encoded in the genome of this bacterium, three XadAs (XadA1, Hsf/XadA2 and XadA3) are classified as trimeric autotransporters. Data from the literature suggest that XadA1 and XadA2 are important for biofilm formation, but XadA3 function has not been yet investigated. In this work, we aimed to biochemically and functionally characterize the XadA3 protein and gather additional information about the role played by XadA1 and XadA2 in X. fastidiosa adhesion and virulence. Using immunodetection with a polyclonal anti-XadA3 antibody, we have demonstrated that this protein localizes to the bacterial surface and mediates intercellular adhesion. Phenotypic characterization of the deletion mutants of XadA adhesins encoded genes revealed that the ΔxadA3 mutant has reduced cell aggregation capacity and biofilm formation when compared to both ΔxadA1 and ΔxadA2 mutants as well as to Temecula wild type strain. Deletion of the xadA genes marginally affects the global gene expression profile assessed by RNA-seq of the mutant strains compared to the wild-type strain, eventhough an increase in lipase/esterase transcripts levels was observed in the mutant strains. It has been reported that these enzymes appear to participate in the degradation of plant tissue that is associated with symptoms of Pierce's disease of grapevines. The deletion of xadA3 results in a phenotype of hypervirulence in grapevines but also of deficiency in insect-vector transmission. The results obtained in this work evidenced the important role played by XadAs adhesins, particularly XadA3, in X. fastidiosa intercellular adhesion, biofilm development and virulence
Descritores: Plantas/metabolismo
Bactérias/classificação
Biofilmes/classificação
Xylella/metabolismo
Sistemas de Secreção Tipo V
Bactérias Gram-Negativas
-Papel (figurativo)
Bioquímica
Doença/classificação
Adesinas Bacterianas
Enzimas
RNA-Seq/instrumentação
Insetos Vetores/química
Anticorpos/farmacologia
Responsável: BR40.1 - DBD - Divisão de Biblioteca e Documentacão do Conjunto das Químicas
BR40.1; T574.88, S729c. 30100026172-Q


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Id: biblio-1378572
Autor: Jesus, Felipe Marcelo Almeida de.
Título: Interações entre o relógio biológico e a sinalização do estado energético em plantas do complexo Saccharum / Biological clock and energy sensors in plants from Saccharum complex.
Fonte: São Paulo; s.n; 2022. 112 p. tab, graf.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Instituto de Química para obtenção do grau de Mestre.
Resumo: A cana-de-açúcar e a cana energia são plantas intercruzáveis que compõe o complexo Saccharum. Estas plantas são fonte de biomassa para produção de açúcar, biocombustíveis, eletricidade, entre outros, e utilizam a energia assimilada pela fotossíntese de forma contrastante, ainda que ambas resultem em alta produtividade. O relógio biológico é um mecanismo molecular que gera informações sobre a hora do dia em conjunto com estímulos ambientais, adaptando respostas fisiológicas em prol de otimizar o desenvolvimento dos organismos em um ambiente cíclico, processo que regula cerca de 64% dos genes de cana-deaçúcar no campo. Em organismos sésseis como as plantas, o recorrente processo de produção de energia apenas durante o período luminoso, gera ritmos de metabólitos que influenciam na atividade de enzimas quinases que assim funcionam como sensores do estado energético, em vias conservadas nos eucariotos. Porém, pouco se sabe a respeito de como estes sinais são percebidos a nível transcricional, principalmente em plantas cultiváveis. Para elucidar como estas vias atuam em conjunto em plantas do complexo Saccharum, medimos o nível de transcrição de componentes do relógio biológico, de subunidades que compõe o complexo TOR, e da subunidade catalítica de SnRK1, KIN10. Medimos o desempenho do relógio biológico das variedades através da quantificação de amido em quatro pontos temporais, para obter uma dinâmica de produção e consumo, processo que é regulado pelo relógio biológico e tem genes com perfil de expressão rítmicos em cana de-açúcar. Curiosamente, uma das quatro variedades onde identificamos provável perfil rítmico de consumo de amido é a S.officinarum SP80-3280, cana-de-açúcar utilizada anteriormente para estudos de relógio biológico. Os nove acessos foram divididos em dois grupos com base em sua partição de carbono contrastante. HF (high fiber) com mais fibras e perfilho e grupo HS (high sucrose), com maior armazenamento de açúcares e amido que HF, em todos os horários de coleta, e com baixa produção de fibras. Estes grupos não diferem em expressão dos componentes de relógio biológico, no entanto, HS tem maior transcrição de uma subunidade do complexo TOR, em apenas um dos horários analisados (ZT12). Em conjunto, a expressão dos componentes do relógio biológico divide os acessos entre os que possuem altos níveis de transcrição de ScLHY, no ZT03, e os que possuem maior transcrição dos genes PRR59, 73 e 95, no ZT12, grupos com contrastante partição de carbono. A transcrição dos sensores energéticos se correlaciona no começo da noite em acessos de HS e Krakatau e, no começo da manhã, em acessos de HF e IN84-105, sem agrupar as variedades por espécie ou destino de carbono. Este trabalho sugere que há diferentes níveis de correlação entre a transcrição dos genes mensurados e as contrastantes partições de carbono das plantas do complexo Saccharu

Sugarcane and Energycane are intercrossable plants that make up the Saccharum complex. These plants are a source of biomass, sugar, biofuels, electricity among others, and even though they use the energy assimilated by photosynthesis in a contrasting way, both results in high productivity. The biological clock is a molecular mechanism that generates information about the time of day in conjunction with environmental stimuli, adapting physiological responses to optimize the development of organisms in a cyclic environment, a process that regulates about 64% of sugarcane genes in field-grown plants. In organisms such as plants, the recurrent process of energy production that happens only during the luminous period generates rhythmicity that may influence the activity of kinase enzymes, thus giving an energy sensor property for then. However, little is known about how these signs are perceived at the transcriptional level, especially in crops and monocots. To elucidate how these pathways act together in plants of the Saccharum complex, we measured the transcription level of the daytime loop of the biological clock, subunits that make up the TOR complex, and the catalytic subunit of SnRK1, KIN10. We measured starch content in four time points, to obtain a dynamic of production and consumption, a process that is regulated by the biological clock and has genes with a rhythmic expression profile in sugarcane. Interestingly, one of the four varieties where we could identify a probable rhythmic profile of starch consumption is a sugarcane SP80-3280 (S. officinarum), that have been used for biological clock studies. The nine genotypes were divided into two groups based on their contrasting carbon partition. HF (high fiber) with more fiber and tiller and group HS (high sucrose), with higher sugar and starch storage than HF, but with lower fiber production. These groups do not differ in expression of biological clock components; however, HS has a higher transcription of a subunit of the TOR complex, in only one of the analyzed times (ZT12). Together, the expression of components of the biological clock divides the genotypes between those with higher levels of ScLHY in ZT03 and those with more transcripts of PRR59, 73 and 95 genes in ZT12, groups that also have contrasting carbon partition. The transcription of TOR complex correlates in the early evening in HS and KRAKATAU, but in the morning, in HF and IN84-105, with no clear correlation with the C destination preferences. This work suggests that there are different levels of correlation between the transcription of biological clock and energy sensors component genes and the contrasting carbon partitions of plants from the Saccharum complex
Descritores: Plantas/efeitos adversos
Relógios Biológicos
Saccharum/efeitos adversos
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BR40.1


  6 / 1066 LILACS  
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Id: lil-637923
Autor: Nishida, Kenji; Nakamura, Ichiro; Morales, Carlos O.
Título: Plants and butterflies of a small urban preserve in the Central Valley of Costa Rica / Plantas y mariposas de una pequeña reserva urbana en el Valle Central de Costa Rica
Fonte: Rev. biol. trop;57(supl.1):31-67, nov. 2009. ilus, graf, mapas, tab.
Idioma: en.
Resumo: Costa Rica's most populated area, the Central valley, has lost much of its natural habitat, and the little that remains has been altered to varying degrees. Yet few studies have been conducted to assess the need for conservation in this area. We present preliminary inventories of plants, butterflies, and day-flying moths of the Reserva Ecológica Leonelo Oviedo (RELO), a small Premontane Moist Forest preserve within the University of Costa Rica campus, located in the urbanized part of the valley. Butterflies are one of the best bio-indicators of a habitat's health, because they are highly sensitive to environmental changes and are tightly linked to the local flora. A description of the RELO's physical features and its history is also presented with illustrations. Approximately 432 species of ca. 334 genera in 113 families of plants were identified. However, only 57 % of them represent species native to the Premontane Moist Forest of the region; the rest are either exotic or species introduced mostly from lowland. More than 200 species of butterflies in six families, including Hesperiidae, have been recorded. Rev. Biol. Trop. 57 (Suppl. 1): 31-67. Epub 2009 November 30.

Por ser el área más poblada del país, el valle Central de Costa Rica perdió su hábitat natural; lo poco que queda ha sido alterado en grados variados. Sin embargo, se han realizado algunos estudios para evaluar la necesidad de conservación en esta área. Se presentan inventarios preliminares de plantas, mariposas y polillas diurnas de la Reserva Ecológica Leonelo Oviedo (RELO); una pequeña reserva de bosque húmedo premontano en del campus de la Universidad de Costa Rica, ubicado en la parte urbanizada del valle. Las mariposas diurnas son uno de los mejores bio-indicadores de la salud del hábitat, porque son muy sensibles a los cambios del ambiente y están estrechamente ligadas a la flora local. Se presenta también una descripción de los caracteres físicos y la historia de la RELO, con ilustraciones. Se identificaron aproximadamente 432 especies de ca. 334 géneros en 113 familias de plantas. Sin embargo, solamente 57% de ellas son especies nativas del bosque húmedo premontano de la región; el resto son especies exóticas o introducidas en su mayoría desde tierras bajas. Se han registrado más de 200 especies de mariposas diurnas en seis familias, incluyendo Hesperiidae.
Descritores: Plantas/classificação
Borboletas/classificação
Lepidópteros/classificação
Mariposas/classificação
-Universidades
Costa Rica
Biodiversidade
Floresta Úmida
59971
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Estudo Observacional
Responsável: CR1.1 - BINASSS - Biblioteca Nacional de Salud y Seguridad Social


  7 / 1066 LILACS  
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Texto completo SciELO Costa Rica
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Id: lil-637924
Autor: Morales, Carlos O.
Título: Caracterización florística y estructural de tres fragmentos boscosos secundarios en Cartago, Costa Rica / Floristic and structural characterization of three secondary forest fragments in Costa Rica
Fonte: Rev. biol. trop;57(supl.1):69-82, nov. 2009. tab.
Idioma: es.
Resumo: Floristic and structural characterization of three secondary forest fragments in Costa Rica. Observations on successional development and floristic composition were made in 25 plots (10x2 m) established in three contiguous secondary forest fragments of the Lankester Botanical Garden, Costa Rica. Human activities favored forest regeneration there by 1) protecting an abandoned farm and pasture area since 1970, and 2) planting and propagating plant species. Planting successfully growing native and introduced species can accelerate the succession process, avoid dominance of pioneer or invasive species, and increase species diversity faster than in common successional processes. Natural diversification slowed down as natural vegetation surrounding the secondary fragments was disappearing, with a consequent reduction or lost of seed input and other reproductive sources, such as spores and stalks. introduced plant species became naturalized in these forests, their reproduction is successful, and some of them are invasive. This study proposes general paths to help Neotropical forest restoration processes by combining natural succession and planting of native species. Rev. Biol. Trop. 57 (Suppl. 1): 69-82. Epub 2009 November 30.

Se realizaron observaciones sobre sucesión y composición florística en 25 parcelas de 10 m x 2 m en tres fragmentos boscosos secundarios, contiguos, del Jardín Botánico Lankester, Costa Rica. La intervención humana fue positiva en la regeneración de estos fragmentos por 1) protección de una antigua área de cultivo y pastoreo desde 1970, y 2) siembra y propagación de especies vegetales. Se comprobó que el cultivo de plantas nativas e introducidas de crecimiento exitoso puede acelerar el proceso de regeneración, impedir la dominancia de especies pioneras o invasoras y aumentar la diversidad de especies más rápidamente que en procesos comunes de sucesión. La diversificación natural se redujo a medida que la vegetación natural de los alrededores de los fragmentos fue desapareciendo, con una consecuente disminución o erradicación de semillas y otros propágulos, tales como esporas y tallos. Especies introducidas se naturalizaron en estos bosques, se propagan fácilmente y algunas son invasoras. Este estudio propone pautas generales para facilitar la regeneración de bosques neotropicales al combinar regeneración natural y cultivo de especies nativas.
Descritores: Plantas/classificação
Regeneração
Florestas
-Plantas/anatomia & histologia
Espécies Introduzidas
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Responsável: CR1.1 - BINASSS - Biblioteca Nacional de Salud y Seguridad Social


  8 / 1066 LILACS  
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Id: lil-329732
Autor: Muñoz, V; Bourdy, G; Deharo, E; Callapa, J; Quenevo, C; Sauvain, M.
Título: Actividad antipaludica invitro e in vivo de plantas usadas por el grupo etnico boliviano Tacana / Antimalarial activity in vitro and in vivo of plants used by the ethnical group Tacana Bolivia
Fonte: Cuad. Hosp. Clín = Cuad. - Hosp. clín;47(2):7-26, 2002. tab.
Idioma: es.
Resumo: Pregunta de investigaciòn. ¿Las palntas utilizadas en la Medicina Tradicional porl os Tacanas especialmente como febrifugas y antimalariales, manifiestan acatividad antipàludica en las pruebas biòlogicas in viatro e in vivo recomendadas por la comunidad cientifica?. Objetivos: Determinar la actividad antipàludica in vitro e in vivo de extractos de plantas utilizadas en Medicina Tradicional por los Tacanas. Lugar: IINSAD, IBBA, Poblaciòn Tacana. Mètodos: Cultivo de estadios eritrocitarios de Plasmodium falciparum. Micromètodo radioisotòpico, in vitro. Test supresivo de 4 dìas in vivo. Resultados: 125 especies vegetales estudiadas in vitro e in vivo utilizando cepas cloroquina-sensibles y cloroquina-resistentes de plasmodium falciparum y ratones infectados con Plasmodium berghei NK65. De las 10 especies que se usan como plantas febrifugas, una mostrò actividad in vivo. 7 extractos etanòlicos de las especies vegetales: Bowdichia virgilioides, Caesalpinia pluviosa, Licaria canella, Nectandra aff. hihua, Protium glabrescens, Gymnosporia sp. y Quina Florida, fueron los màs activos in vitro e in vivo. Conlusión: De las 7 esoecies vegetales que mostraron actividad in vitro o in vivo, sòlo una especie Bawdichia virgilioides fue indicada especificamente para el tratameinto de malaria, su uso tradicional está ampliamente respaldado por las diferentes pruebas antipalúdicas realziadas en este trabajo, B. virgilioides es una fuente potencial de drogas antimalariales, es una prioridad futuras investigaciones clínicas a través de diferentes proyectos. Caesalpinia pluviosa, licaria canella, Nectandra aff, hihua, Protium glabrescens, Gymnosporia sp y Quina florida merecen estudios complementarios.
Descritores: Plantas
Plantas Medicinais
Medicina Tradicional
-Bolívia
Responsável: BO6.1 - Biblioteca


  9 / 1066 LILACS  
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Id: lil-395774
Autor: Muñoz, V; Rojas, I; Bourdy, G; Deharo, E; Quenevo, C; Frade, C; Sauvain, M.
Título: Actividad citotoxica de plantas medicinales usadas por el grupo étnico boliviano Tacana / Cytotoxic activity of medicinal plants used by the Takana ethnic group in Bolivia
Fonte: Cuad. Hosp. Clín = Cuad. - Hosp. clín;49(2):133-145, 2004. tab.
Idioma: es.
Resumo: Pregunta de investigación ¿ Las plantas utilizadas en la Medicina Tradicional por los Tacanas manifiestan actividad citotóxica in vitro con el test de la sulforodamina? Objetivos. Determinar la actividad citotóxica in vitro de extractos de plantas utilizadas en la Medicina Tradicional por los Tacanas. Lugar. Población Tacana, IBBA. Métodos. Cultivo de lineas celulares humanas, KB (carcinoma nasofaringeo), HeLa (carcinoma cervical)Ensayo colorimétrico de sulforodamina B, in vitro. Resultados. 118 extractos etanólicos de especies vegetales estudiadas in vitro utilizadando dos lineas tumorales humanas. 14 especies vegetales mostraron actividad citotóxica in vitro. De la 14 especies citotóxicas, 12 especies vegetales presentaron Cl50<- a 10ug/ml. Conclusión. 13 porciento de las plantas estudiadas presentaron actividad citotóxica, pese a no ser seleccionadas por su uso tradicional como anticancerígenos, pues, la actividad anticancer de las plantas estudiadas no consta en la medicina tradicional de los Tacanas. La actividad antitumoral, antioxidante y antimutagénica dae las especies citotóxicas en este trabajo y otras especies diferentes, per, de los mismos géneros estudiados fue reportada por científicos de otras latitudes, lo que nos podría indicar que los principios activos serian comunes en estos géneros, permitiéndonos indentificar nuevas fuentes de medicamentos. Todas las especies activas merecen estudios complementarios.
Descritores: Plantas
Técnicas de Cultura de Células
Medicina Tradicional
Botânica/classificação
Etnobotânica/instrumentação
Etnobotânica/métodos
Etnobotânica/normas
Grupos Étnicos
Técnicas In Vitro
-Bolívia
Responsável: BO6.1 - Biblioteca


  10 / 1066 LILACS  
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Texto completo SciELO Costa Rica
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Id: lil-764972
Autor: Ramos de Andrade, Juliana; Andrade da Silva, Kleber; Fraga dos Santos, Josiene Maria; Melo dos Santos, Danielle; Pereira Guerra, Thiago; de Lima Araújo, Elcida.
Título: Influence of microhabitats on the performance of herbaceous species in areas of mature and secondary forest in the semiarid region of Brazil / Influencia de microhábitats en el desempeño de especies herbáceas en áreas de bosque maduro y secundario en la región semiárida de Brasil
Fonte: Rev. biol. trop;63(2):357-368, Apr.-Jun. 2015. ilus, graf, tab.
Idioma: en.
Resumo: The conditions for plant establishment in mature forest are different from those found in disturbed areas. In dry environments, the herbaceous cover is the most important in the recolonization of deforested areas. It can, therefore, act as an ideal biological group for assessing how changes in habitat heterogeneity affect the resilience of dry forests. The aim of this research was to evaluate whether natural regeneration of the herbaceous stratum differed between areas of mature and secondary forest of Caatinga and to describe this process. The study took place in the Brazilian semiarid region during the rainy season 2011 (January to August), where fifty 1m² plots were set up, 25 allocated to the microhabitat established as “between canopies” and 25 to the microhabitat “under the canopy”. The herbaceous species selected for the study were Delilia biflora (Asteraceae), Gomphrena vaga (Amaranthaceae) and Pseudabutilon spicatum (Malvaceae), abundant species occurring in both areas. All individuals from the selected populations were counted, marked with sequential numbers, and the height of the stem was measured. Differences between areas, and in size and survival between microhabitats, were found only for the first two species. Fruit production was higher in the mature forest for the three species. The study concluded that: 1. The effect of the microhabitats “between canopies” and “under the canopy” in mature and secondary forest areas depends on the species considered; 2. Populations sensitive to light intensity differ in number of individuals, height and fruit production; and 3. The resilience of anthropogenic areas in semiarid environments can be characterized by the presence of spatial heterogeneity with regard to the emergence and survival of herbaceous seedlings, suggesting that the regeneration of disturbed areas may occur in patches. Rev. Biol. Trop. 63 (2): 357-368. Epub 2015 June 01.

Las condiciones para el establecimiento de las plantas (agua, luz, nutrientes, etc.) en los fragmentos preservados se diferencian de las encontradas en áreas perturbadas. En ambientes secos, la cubierta herbácea predomina en la recolonización de áreas despejadas y puede actuar como un buen grupo biológico para evaluar los impactos de los cambios de la heterogeneidad de hábitats en el proceso de resiliencia de los bosques secos. Ante de esto, el objetivo fue evaluar si la regeneración natural de la capa herbácea difería entre áreas preservadas y áreas de Caatinga perturbadas y describir cómo ocurre esto. El estudio se realizó en la región semiárida brasileña durante la temporada de lluvias, donde 50 parcelas de 1m² fueron establecidas, 25 de las cuales se ubicaron en el microhábitat llamado “entre dosel” y 25 en “bajo dosel”. Las especies herbáceas seleccionadas para el estudio fueron: Delilia biflora (Asteraceae), Gomphrena vaga (Amaranthaceae) y Pseudabutilon spicatum (Malvaceae), especies abundantes que se producen en ambas áreas. Todos los individuos de las poblaciones seleccionadas se contaron, marcando con números secuenciales, y se midió la altura del tallo. Las diferencias entre las zonas, y el tamaño y supervivencia entre microhábitats, se encontraron solo para las dos primeras especies. La producción de frutos fue mayor en el bosque maduro para las tres especies. El estudio llega a la conclusión de que: 1. el efecto de la existencia de microhabitates “entre dosel” y “bajo dosel” en áreas preservadas y antropogénicas depende de la especie considerada; 2. las poblaciones sensibles a la variación de la intensidad luminosa presentan diferencias en cuanto al número de individuos, la altura y la producción de frutos de las plantas; 3. la resiliencia de las zonas antropogénicas de ambientes semiáridos se puede caracterizar por la existencia de heterogeneidad espacial en cuanto a la emergencia y supervivencia de plántulas herbáceas, lo que sugiere que la regeneración de áreas perturbadas puede ocurrir en parches.
Descritores: Plantas/anatomia & histologia
Plantas/classificação
Saúde Ambiental
-Brasil
Florestas
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Responsável: CR1.1 - BINASSS - Biblioteca Nacional de Salud y Seguridad Social



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