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Id: biblio-847153
Autor: Nascimento, Ana Paula Barbosa do.
Título: Um novo gene de Pseudomonas aeruginosa envolvido em percepção de quórum / A novel gene involved in Pseudomonas aeruginosa quorum sensing.
Fonte: São Paulo; s.n; 2014. 82 p. tab, graf, ilus.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Instituto de Química para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: Pseudomonas aeruginosa é uma gamaproteobactéria com capacidade de colonizar diversos tipos de ambiente e infectar hospedeiros filogeneticamente distintos. Em humanos, comporta-se como um patógeno oportunista,estando frequentemente relacionada à infecções em indivíduos imunocomprometidos e indivíduos portadores de fibrose cística. Um mecanismo importante para a versatilidade de P. aeruginosa é o sistema de percepção de quórum (QS), onde a bactéria pode vincular expressão gênica à densidade populacional e às características do ambiente. Atualmente, sabe-se que muitos outros reguladores estão interligados com QS, entre eles, a proteína reguladora RsmA e os pequenos RNAs RsmZ e RsmY. Além disso, diversos fatores importantes para a patogenicidade da bactéria são reguladas por QS. Em P. aeruginosa PA14, um fator importante para a patogenicidade em diversos hospedeiros é a proteína KerV, cujo envolvimento com QS foi descrito pela primeira vez neste trabalho. A linhagem D12, que possui uma deleção no gene kerV, mostrou alterações em fenótipos regulados por QS, como a maior produção de piocianina, composto que contribui para virulência e persistência das infecções causada por P. aeruginosa. Por ser facilmente detectável e pela regulação de sua síntese não ter sido completamente explorada em PA14, a expressão dos genes responsáveis pela produção de piocianina é um interessante repórter na investigação do possível envolvimento de KerV com QS. Além de piocianina, D12 apresenta níveis reduzidos de ramnolipídeos. Esses fenótipos somados se assemelham aos fenótipos da mutação de rsmA, sugerindo o envolvimento de KerV com os sistemas QS e Gac-Rsm direta ou indiretamente. Neste trabalho, mostramos que KerV exerce um efeito negativo na regulação dos operons phz1 e phz2, responsáveis pela síntese de piocianina, alterando a expressão desses genes. KerV exerce também um efeito positivo na expressão da proteína RsmA, responsável pela repressão de diversos genes alvos, onde RsmA se liga ao sítio de ligação ao ribossomo no mRNA, impedindo a tradução. Ensaios de gel shift mostraram que a ligação direta de RsmA na sequência líder de phzA1 e phzA2 ocorre, elucidando a maneira pela qual KerV está envolvido na regulação da expressão dos operons phz em P. aeruginosa PA14. Mostramos também que phz2 é ativo e contribui para a síntese de piocianina, pois na ausência de phz1, os níveis do pigmento são maiores do que aqueles detectados em PA14. Isso sugere uma maior expressão de phz2 e uma regulação diferencial dos operons de acordo com as condições ambientais como possível estratégia para manter os níveis desse composto. Uma evidência dessa regulação diferencial é vista no mutante lasR. Na fase inicial de crescimento, esse mutante não produz piocianina, porém quando exposto a tempos mais longos de cultivo, a produção de piocianina é maior quando comparada a PA14. Isso é reflexo da ativação da expressão de phz1 no mutante lasR em fase estacionária tardia, enquanto phz2 permanece não expresso. Isso indica que phz2 é dependente de LasR, ainda que indiretamente. Já phz1, embora tenha sua expressão influenciada por LasR no estágio inicial de crescimento, na fase estacionária é regulado por outros fatores independentes de las

Pseudomonas aeruginosa is a gammaproteobacterium that colonizes several environments and infects phylogenetically distinct hosts. It behaves as an opportunistic pathogen in humans, often related to infection in immunocompromised individuals and cystic fibrosis patients. An important mechanism for P. aeruginosa versatility is the quorum sensing (QS) network, that allows bacteria to link gene expression to population density and environmental traits. Several additional regulators are interconnected with QS, as the regulatory mRNA binding protein RsmA and the non-coding small RNAs RsmZ and RsmY. Futhermore, key factors for pathogenicity are QS-regulated. In P. aeruginosa PA14, an important pathogenicity-related factor is the KerV protein, described for the first time here as involved in QS. D12 strain, that harbor a deletion in the kerV gene, shows alterations in QS-regulated phenotypes, such as high production of pyocyanin, a compound that contributes to virulence and persistence of P. aeruginosa infections. As the production of pyocyanin is easily detected and all mechanisms involved in its synthesis regulation are not fully described, the expression of genes responsible for production of this pigment is a good reporter to investigate KerV involvement in the QS network. Additionally, D12 also shows lower levels of rhamnolipids, another QS-regulated trait. Taken together, these phenotypes resemble the effects of a rsmA mutation, suggesting KerV involvement with QS and Gac-Rsm systems. In this work, we propose that KerV exerts a negative effect in the regulation of phz1 and phz2 operons, responsible for pyocyanin synthesis, by alterating the expression of these genes. KerV also has a positive effect on rsmA expression, responsible for the repression of several genes by blocking the ribosome binding site preventing the translation. Gel shift assays showed that RsmA binds directly in the leader sequence of phzA1 and phzA2, elucidating the manner in which KerV is involved in the regulation of phz operons expression in P. aeruginosa PA14. We also demonstrate that phz2 is actively expressed and contributes to pyocyanin production in PA14, since in the phz1 mutant the levels of pyocyanin are even higher than in the wild type strain. This suggests a phz2 higher expression and a differential regulation of phz operons according to environmental changes as a mechanism to maintain the levels of pyocyanin synthesis. An evidence for this regulation is the synthesis of pyocyanin by the lasR mutant, which does not make pyocyanin at early growth stages. However, at late stationary phase, pyocyanin production is even higher than in the wild-type strain, reflecting the LasR-independent regulation of phz1 expression, while phz2 operon remains silent
Descritores: Pseudomonas aeruginosa/crescimento & desenvolvimento
Percepção de Quorum
-Infecções Bacterianas
Perfilação da Expressão Gênica/métodos
Regulação da Expressão Gênica/genética
Biologia Molecular/instrumentação
Reação em Cadeia da Polimerase/métodos
Proteobactérias
Pseudomonas/citologia
Piocianina/farmacologia
Responsável: BR40.1 - DBD - Divisão de Biblioteca e Documentacão do Conjunto das Químicas
BR40.1; T574.88, N244n. 30100025361-Q


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Id: lil-741265
Autor: Fernandes, Sheryl Oliveira; Kirchman, David L.; Michotey, Valérie D.; Bonin, Patricia C.; LokaBharathi, P.A..
Título: Bacterial diversity in relatively pristine and anthropogenically-influenced mangrove ecosystems (Goa, India)
Fonte: Braz. j. microbiol;45(4):1161-1171, Oct.-Dec. 2014. graf, tab.
Idioma: en.
Resumo: To appreciate differences in benthic bacterial community composition at the relatively pristine Tuvem and the anthropogenically-influenced Divar mangrove ecosystems in Goa, India, parallel tag sequencing of the V6 region of 16S rDNA was carried out. We hypothesize that availability of extraneously-derived anthropogenic substrates could act as a stimulatant but not a deterrent to promote higher bacterial diversity at Divar. Our observations revealed that the phylum Proteobacteria was dominant at both locations comprising 43-46% of total tags. The Tuvem ecosystem was characterized by an abundance of members belonging to the class Deltaproteobacteria (21%), ~ 2100 phylotypes and 1561 operational taxonomic units (OTUs) sharing > 97% similarity. At Divar, the Gammaproteobacteria were ~ 2x higher (17%) than at Tuvem. A more diverse bacterial community with > 3300 phylotypes and > 2000 OTUs mostly belonging to Gammaproteobacteria and a significantly higher DNT (n = 9, p < 0.001, df = 1) were recorded at Divar. These findings suggest that the quantity and quality of pollutants at Divar are perhaps still at a level to maintain high diversity. Using this technique we could show higher diversity at Divar with the possibility of Gammaproteobacteria contributing to modulating excess nitrate.
Descritores: Ecossistema
Microbiologia Ambiental
Variação Genética
Proteobactérias/classificação
Proteobactérias/genética
-DNA Bacteriano/química
DNA Bacteriano/genética
DNA Ribossômico/química
DNA Ribossômico/genética
Índia
/genética
RNA, RIBOSOMAL, ABNORMALITIES, MULTIPLES/genética
Análise de Sequência de DNA
Zonas Úmidas
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-551366
Autor: Magomere, Titus O; Obukosia, Silas D; Mutitu, Eunice; Ngichabe, Christopher; Olubayo, Florence; Shibairo, Solomon.
Título: Molecular characterization of 'Candidatus Liberibacter' species/strains causing huanglongbing disease of citrus in Kenya
Fonte: Electron. j. biotechnol;12(2):5-6, Apr. 2009. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: This study was undertaken to characterize the alpha subgroup of the proteobacteria causing the huanglongbing (HLB) disease of citrus from three different ecological zones of Kenya namely the Lower highlands (LH2, LH3, 1800-1900 m above sea level); Upper midlands (UM3, UM4, 1390-1475m), Lower midlands (LM5, LM4, LM3 of 1290-1340-1390m), by isolation and sequencing DNA encoding the L10 and L12 ribosomal proteins and the intergenic region. A 7I6-basepair DNA fragment was amplified and sequenced and consisted of 536 basepairs of DNA encoding the L10 protein, 44 basepairs of DNA intergenic region and 136 basepairs of DNA that partially encodes the L12 protein. Sequences of rpL10/L12 protein genes from Kenyan strains were 98 percent and 81 percent similar to the South African 'Candidatus Liberibacter africanus strain Nelspruit' and the Asian 'Candidatus Liberibacter asiaticus' strains, respectively. The intergenic rDNA sequence of Kenyan strain from UM and LM showed 84 percent similarity with 'Candidatus L. africanus strain Nelspruit' and 50 percent similarity with 'Candidatus L. asiaticus' strain. However, the LH strain had an 11- basepairs deletion, while the LM4 had a 5-basepair deletion in the intergenic region compared to 'Candidatus L. africanus strain Nelspruit'. The L10 amino acid sequence was 100 percent homologous among HLB bacteria obtained from the agro-ecological zones in Kenya and the L10 protein sequence was also homologus to 'Candidatus L. africanus strain Nelspruit'. Nevertheless, the L10 amino acid sequence of 'Candidatus L. asiaticus' and the 'Candidatus L. africanus subsp. capensis' differed from the Kenyan strains by 18.36 percent and 11.82 percent, respectively. Phylogenetic analysis of both the L10/L12 rDNA sequences and the L10 amino acid sequences clustered the Kenyan strains of the 'Candidatus Liberibacter' species with members of alpha subdivision of proteobacteria.
Descritores: DNA Ribossômico/agonistas
DNA Ribossômico/genética
Proteobactérias/enzimologia
Proteobactérias/metabolismo
Proteínas Ribossômicas
-Análise de Sequência de DNA/métodos
Análise de Sequência de DNA
Eletroforese em Gel de Ágar
Quênia
Filogenia
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Id: lil-538011
Autor: Hernández García, Marcela; Morgante, Verónica; Ávila Perez, Marcela; Villalobos Biaggini, Patricio; Miralles Noé, Pola; González Vergara, Myriam; Seeger Pfeiffer, Michael.
Título: Novel s-triazine-degrading bacteria isolated from agricultural soils of central Chile for herbicide bioremediation
Fonte: Electron. j. biotechnol;11(5):5-6, Dec. 2008. ilus, tab.
Idioma: en.
Projeto: Millennium Nucleus.
Resumo: s-Triazine-degrading bacterial strains were isolated from long-term simazine-treated agricultural soils of central Chile. The number of culturable heterotrophic bacteria of these agricultural soils (7 x 10(6) CFU/g of dry soil) was not affected by simazine application on field. The simazine-degrading bacterial strains P51, P52 and C53 were isolated by enrichment in minimal medium using simazine as the sole nitrogen source. Resting cells of strains P51 and P52 degraded >80 percent of simazine within 48 hrs, whereas strain C53 was able to remove >60 percent of the herbicide. The atzA and atzD genes of the s-triazine upper and lower catabolic pathways were detected in strains P51 and C53, while only atzD gene was observed in strain P52. To compare the bacterial 16S rRNA gene sequence structure, ARDRA were performed using the restriction enzymes Msp1 and Hha1. ARDRA indicated that strain P52 was a different ribotype than C53 and P51 strains. For further characterization the novel isolates were identified by 16S rRNA gene sequencing. Strains C53 and P51 belong to the genus Stenotrophomonas and the strain P52 belongs to the genus Arthrobacter . s -Triazine-degrading bacterial strains isolated from contaminated soils could be used as biocatalysts for bioremediation of these herbicides.
Descritores: Simazina/administração & dosagem
Simazina/uso terapêutico
Stenotrophomonas/enzimologia
Triazinas/administração & dosagem
Triazinas/uso terapêutico
-Cultivos Agrícolas
Arthrobacter/enzimologia
Biodegradação Ambiental
Chile
Herbicidas/administração & dosagem
Herbicidas/uso terapêutico
Proteobactérias/enzimologia
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: lil-513111
Autor: Singh, Gursharan; Batish, Mona; Sharma, Prince; Capalash, Neena.
Título: Xenobiotics enhance laccase activity in alkali-tolerant gama-proteobacterium JB / Xenobióticos aumentam a atividade de lacase em gama-Proteobacterium JB alcali-tolerante
Fonte: Braz. j. microbiol;40(1):26-30, Jan.-Mar. 2009. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: Various genotoxic textile dyes, xenobiotics, substrates (10 µM) and agrochemicals (100 µg/ml) were tested for enhancement of alkalophilic laccase activity inã-proteobacterium JB. Neutral Red, Indigo Carmine, Naphthol Base Bordears and Sulphast Ruby dyes increased the activity by 3.7, 2.7, 2.6 and 2.3 fold respectively. Xenobiotics/substrates like p-toluidine, 8-hydroxyquinoline and anthracine increased it by 3.4, 2.8 and 2.3 fold respectively. Atrazine and trycyclozole pesticides enhanced the activityby 1.95 and 1.5 fold respectively.

Vários corantes têxteis genotóxicos, xenobióticos, substratos (10 mM) e agroquímicos (100 mM/mL) foram testados quanto ao aumento da atividade de lacase em ã-Proteobacterium JB. Os corantes Neutral Red, Indigo Carmine, Naphtol Base Bordears e Sulphast Ruby aumentaram a atividade em 3,7, 2,7, 2,6 e 2,3 vezes, respectivamente. Xenobióticos/substratos como p-toluidina, 8-hidroxiquinolina e antracina aumentaram a atividade em 3,4, 2,8 e 2,3 vezes, respectivamente. Atrazina e pesticidas triciclozol aumentaram a atividade em 1,95 e 1,5 vezes, respectivamente.
Descritores: Corantes/análise
Lacase/análise
Mutagênicos/análise
Proteobactérias/enzimologia
Xenobióticos/análise
-Ativação Enzimática
Métodos
Técnicas
Tipo de Publ: Relatório Técnico
Responsável: BR32.1 - Serviço de Biblioteca e Informação Biomédica


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Id: lil-463393
Autor: São Paulo(Estado). Secretaria da Saúde. Centro de Vigilância Epidemiológica.
Título: Relatório do seminário sobre febre purpúrica do Brasil / Written report seminary about fever purpura from Brazil.
Fonte: São Paulo; s.n; 1986. 96 p. ilus, tab, graf.
Idioma: pt.
Conferência: Apresentado em: Seminário sobre Febre Purpúrica do Brasil, São Paulo, 4 jun.1986.
Descritores: Brasil
Congressos
EPIDEMIOLOGICAL SURVEILLANCE
Haemophilus
Proteobactérias
Púrpura
Responsável: BR91.2 - Centro de Documentação
BR91.2; W3, S239r


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Texto completo SciELO Chile
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Id: lil-424732
Autor: Rivas, Mariella; Seeger, Michael; Holmes, David S; Jedlicki, Eugenia.
Título: A Lux-like Quorum Sensing System in the Extreme Acidophile Acidithiobacillus ferrooxidans
Fonte: Biol. Res;38(2/3):283-297, 2005. ilus, tab.
Idioma: en.
Projeto: National Fund for Scientific and Technological Development.
Resumo: The genome of the acidophilic, proteobacterium Acidithiobacillus ferrooxidans, contains linked but divergently oriented genes, termed afeI and afeR, whose predicted protein products are significantly similar to the LuxI and LuxR families of proteins. A possible promoter and Lux box are predicted upstream of afeI. A cloned copy of afeI, expressed in E. coli, encodes an enzyme that catalyzes the production of a diffusible compound identified by gas chromatography and mass spectrometry as an unsubstituted N-acyl homoserine lactone (AHL) of chain length C14. This AHL can be detected by a reporter strain of Sinorhizobium meliloti Rm41 suggesting that it is biologically active. The reporter strain also responds to extracts of the supernatant of A. ferrooxidans grown to early stationary phase in sulfur medium indicating that a diffusible AHL is produced by this microorganism. Semi-quantitative RT-PCR experiments indicate that afeI and afeR are expressed maximally in early stationary phase and are more expressed when A. ferrooxidans is grown in sulfur- rather than iron-containing medium. Given the predicted amino acid sequence and functional properties of AfeI and AfeR it is proposed that A. ferrooxidans has a quorum sensing system similar to the LuxI-LuxR paradigm.
Descritores: Acidithiobacillus thiooxidans
Acidithiobacillus thiooxidans/química
Proteobactérias
Proteobactérias/química
-Genoma Bacteriano
/análise
PL SMIDOS DE BACTERIOCINAS/análise
/biossíntese
PL SMIDOS DE BACTERIOCINAS/biossíntese
/química
PL SMIDOS DE BACTERIOCINAS/química
/síntese química
PL SMIDOS DE BACTERIOCINAS/síntese química
Reação em Cadeia da Polimerase/métodos
Reação em Cadeia da Polimerase
Tipo de Publ: Estudos de Validação
Research Support, Non-U.S. Gov't
Estudo Comparativo
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Id: lil-406231
Autor: Baldani, José I; Baldani, Vera L. D.
Título: History on the biological nitrogen fixation research in graminaceous plants: special emphasis on the Brazilian experience
Fonte: An. acad. bras. ciênc;77(3):549-579, Sept. 2005.
Idioma: en.
Resumo: A presente revisão aborda a história da Fixação Biológica de Nitrogênio (FBN) em Gramíneas no Brasil, procurando mostrar a evolução da pesquisa na área iniciada a mais de 40 anos sob a liderança da pesquisadora Johanna Döbereiner. Um aspecto marcante deste período foi a descoberta de diversas bactérias fixadoras de nitrogênio atmosférico tais com as rizosféricas (Beijerinckia fluminensis e Azotobacter paspali), associativas (Azospirillum lipoferum, A. brasilense, A. amazonense) e as endofíticas (Herbaspirillum seropedicae, H. rubrisubalbicans, Gluconacetobacter diazotrophicus, Burkholderia brasilensis e B. tropica). O papel destas bactérias diazotróficas em associação com as gramíneas, especialmente os cereais, tem sido estudado e muito se avançou sobre os aspectos ecológicos, fisiológicos, bioquímicos e genéticos. Os mecanismos de colonização e infecção dos tecidos das plantas foram melhor entendidos e a contribuição da FBN para o sistema solo-planta foi determinado. Estudos de inoculação de cereais com bactérias diazotróficas, têm mostrado que as endofíticas têm um maior potencial de contribuição da FBN e que o genótipo da planta influencia na associação da planta/bactéria. Os avanços alcançados apontam para uma maior exploração e entendimento desta associação endofítica. Os programas de sequenciamento do genoma: RIOGENE (Gluconacetobacter diazotrophicus) e GENOPAR (Herbaspirillum seropedicae) mostram a importância da FBN no Brasil e devem permitir que o país continue na fronteira do conhecimento em relação ao processo de FBN em gramíneas.
Descritores: Fixação de Nitrogênio/fisiologia
Poaceae/fisiologia
Proteobactérias/metabolismo
-Brasil
Genótipo
Fixação de Nitrogênio/genética
Raízes de Plantas/microbiologia
Raízes de Plantas/fisiologia
Poaceae/microbiologia
Proteobactérias/genética
Tipo de Publ: Revisão
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-333064
Autor: Castillo, Isabel; Lodeiros, César; Núñez, Maximiano; Campos, Isabel.
Título: Evaluación in vitro de sustancias antibacterianas producidas por bacterias aisladas de diferentes organismos marinos / In vitro evaluation of antibacterial substances produced by bacteria isolated from different marine organisms
Fonte: Rev. biol. trop;49(3/4):1213-1222, Sep.-Dec. 2001.
Idioma: es.
Resumo: Bacteria from several groups of marine organisms were isolated and, using direct antibiograms, identified those that produce antibacterial substances, using a human pathogenic strain of Staphylococcus aureus ATCC6538 as revealing microorganism. Bacteria which produce substances that inhibited S. aureus growth were identified through morphological, physiological and biochemical tests. Out of 290 bacteria, 54 (18.6) inhibited the growth of S. aureus, but only 27 survived for identification. Bivalves, sponges and corals were the most represented from which 41.2, 33.3 and 29.7, respectively, produced antibacterial substances of the isolated bacteria in each group. The marine species with highest proportions of these bacteria were the hard coral Madracis decactis (62.5), the sponges Cliona sp. (57.1) and the octocoral Plexaura flexuosa (50.0). Out of the 27 strains that produced antibacterial substances, 51.8 were Aeromonas spp. and 14.8 Vibrio spp. Marine bacteria that produce antibacterial substances are abundant, most belong in the Vibrionacea group and were isolated mainly from corals and bivalve mollusks.
Descritores: Água do Mar/microbiologia
Antibacterianos/biossíntese
Bactérias Gram-Negativas/metabolismo
Invertebrados
Staphylococcus aureus
-Antibiose
Antibacterianos/farmacologia
Bivalves
Cnidários
Inibidores do Crescimento
Poríferos/microbiologia
Proteobactérias/metabolismo
Staphylococcus aureus
Microbiologia da Água
Limites: Animais
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME



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