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Id: lil-660379
Autor: Vecchia, AD.; Fleck, JD.; Kluge, M.; Comerlato, J.; Bergamaschi, B.; Luz, RB.; Arantes, TS.; Silva, JVS.; Thewes, MR.; Spilki, FR..
Título: Assessment of enteric viruses in a sewage treatment plant located in Porto Alegre, southern Brazil / Avaliação de vírus entéricos em uma estação de tratamento de esgoto localizada em Porto Alegre, sul do Brasil
Fonte: Braz. j. biol;72(4):839-846, Nov. 2012. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: In order to verify the microbial quality of the influents and effluents of one STP from southern Brazil, an eight-month survey was conducted to examine the presence of total and fecal coliforms and of adenovirus (HAdV), enterovirus (EV), genogroup A rotaviruses (GARV) and Torque teno virus (TTV), in treated effluent samples from São João/Navegantes STP, Porto Alegre (Brazil). A total of 16 samples were collected, eight of influent (raw sewage, prior to treatment), and the other eight of the effluent (post-treatment sewage). Total and fecal coliform levels ranging from 3.6 × 10(4) to 4.4 × 10(7) MPN/100 mL and 2.9 × 10³ to 1.7 × 10(7) MPN/100 mL, were detected in all samples. In raw sewage, HAdV (25%) and GARV (28.6%) viral genomes were detected. The analysis of effluent samples revealed the presence of HAdV (50%), EV (37.5%), and TTV (12.5%) genomic fragments. All samples, regardless of the month analysed, presented detection of a least one virus genus, except for in April. Higher virus detection rates were observed in treated sewage samples (62.5%), and in 80% of them (effluent positive samples) HAdV was detected. Results showed that improvements in sewage monitoring and treatment processes are necessary to reduce the viral and bacterial load on the environment in southern Brazil. To the knowledge of the authors, this is the first study showing the monitoring of viral genomes in influent and effluent samples from a STP located in Porto Alegre (Rio Grande do Sul, Brazil), southern Brazil.

Com o intuito de verificar a qualidade microbiológica de afluentes e efluentes de uma estação de tratamento de esgoto (ETE), um monitoramento de oito meses foi realizado para examinar a presença de coliformes totais e fecais, e de adenovírus (HAdV), enterovírus (EV), rotavírus do genogrupo A (GARV) e torque teno vírus (TTV), em amostras de esgoto tratado da ETE São João/Navegantes, em Porto Alegre-RS, Brasil. Um total de 16 amostras foi coletado, sendo oito de afluente (esgoto bruto, anterior ao tratamento) e oito de efluente (esgoto tratado). Os níveis de coliformes totais e fecais variaram entre 3,6 × 10(4) e 4,4 × 10(7) MPN/100 mL e 2,9 × 10³ e 1,7 × 10(7) MPN/100 mL, respectivamente, tendo sido estes detectados em todas as amostras. No esgoto bruto, foram detectados os genomas virais de HAdV (25%) e GARV (28,6%). A análise das amostras de efluente revelou a presença de fragmentos genômicos de HAdV (50%), EV (37,5%) e TTV (12,5%). Todas as amostras, independentemente do mês analisado, possibilitaram a detecção de pelo menos um gênero viral, exceto no mês de abril. Altas taxas de detecção viral foram observadas em amostras de esgoto tratado (62,5%), sendo que o HAdV foi detectado em 80% dessas amostras de efluente positivas. Os resultados mostram que aprimoramentos no processo de tratamento e monitoramento do esgoto são necessários para reduzir a carga viral e bacteriológica no ambiente do Sul do Brasil. Ao conhecimento dos autores, este é o primeiro estudo de monitoramento de genomas virais em amostras de afluente e efluente de uma ETE localizada em Porto Alegre-Rio Grande do Sul, Brasil.
Descritores: Vírus de DNA/classificação
Vírus de RNA/classificação
Esgotos/virologia
Microbiologia da Água
-Adenoviridae/isolamento & purificação
Brasil
Vírus de DNA/isolamento & purificação
DNA Viral
Enterovirus/isolamento & purificação
Reação em Cadeia da Polimerase
Vírus de RNA/isolamento & purificação
Rotavirus/isolamento & purificação
Torque teno virus/isolamento & purificação
Eliminação de Resíduos Líquidos
Purificação da Água
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-648559
Autor: Albuquerque, Maria Carolina M.; Varella, Rafael B.; Santos, Norma.
Título: Acute respiratory viral infections in children in Rio de Janeiro and Teresópolis, Brazil / Infecções respiratórias agudas causadas por vírus em crianças do Rio de Janeiro e de Teresópolis, Brasil
Fonte: Rev. Inst. Med. Trop. Säo Paulo;54(5):249-255, Sept.-Oct. 2012. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: The frequency of viral pathogens causing respiratory infections in children in the cities of Rio de Janeiro and Teresópolis was investigated. Nasal swabs from children with acute respiratory illnesses were collected between March 2006 and October 2007. Specimens were tested for viral detection by conventional (RT)-PCR and/or real time PCR. Of the 205 nasal swabs tested, 64 (31.2%) were positive for at least one of the viral pathogens. Single infections were detected in 56 samples, 50 of those were caused by RNA viruses: 33 samples tested positive for rhinovirus, five for influenza A, five for metapneumovirus, four for coronavirus and, three for respiratory syncytial virus. For the DNA viruses, five samples were positive for bocavirus and one for adenovirus. Co-infections with these viruses were detected in eight samples. Our data demonstrate a high frequency of viral respiratory infections, emphasizing the need for a more accurate diagnosis particularly for the emerging respiratory viruses. The fact that the emerging respiratory viruses were present in 9.2% of the tested samples suggests that these viruses could be important respiratory pathogens in the country.

Neste estudo foi investigada a frequência de patógenos virais causando infecção em crianças nas cidades do Rio de Janeiro e Teresópolis. Foram coletados 205 swabs nasais de crianças com infecção aguda do trato respiratório no período de março de 2006 a outubro de 2007. Os espécimes foram testados para detecção de vírus através de (RT)-PCR e/ou PCR em tempo real. Dentre as 205 amostras testadas, 64 (31,2%) foram positivas para pelo menos um vírus. Infecções causadas por um único agente viral foram detectadas em 56 amostras, 50 das quais eram causadas por vírus de RNA: 33 amostras foram positivas para rinovírus, cinco amostras foram positivas para influenza A, cinco amostras foram positivas para metapneumovírus, quatro amostras foram positivas para coronavírus e três amostras foram positivas para vírus respiratório sincicial. Para os vírus de DNA foram detectadas cinco amostras positivas para bocavírus humano e uma amostra positiva para adenovírus. Foram identificados oito casos de co-infecção. Nossos dados demonstram frequência elevada de infecções respiratórias virais, enfatizando a necessidade de um diagnóstico mais acurado destes patógenos, principalmente os vírus considerados emergentes. O fato de alguns vírus respiratórios emergentes terem sido detectados em 9,2% das amostras testadas sugere que estes vírus podem ser patógenos respiratórios importantes no país.
Descritores: Coinfecção/virologia
Infecções por Vírus de DNA/virologia
Cavidade Nasal/virologia
Infecções por Vírus de RNA/virologia
Infecções Respiratórias/virologia
-Doença Aguda
Distribuição por Idade
Brasil/epidemiologia
Coinfecção/epidemiologia
Infecções por Vírus de DNA/epidemiologia
Vírus de DNA/genética
Vírus de DNA/isolamento & purificação
Infecções por Vírus de RNA/epidemiologia
Vírus de RNA/genética
Vírus de RNA/isolamento & purificação
Infecções Respiratórias/epidemiologia
Estações do Ano
Limites: Adolescente
Criança
Pré-Escolar
Seres Humanos
Lactente
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-638561
Autor: Ferreira, Carla Elizabeth de Oliveira; Raboni, Sonia Mara; Pereira, Luciane Aparecida; Nogueira, Meri Bordignon; Vidal, Luine Rosele Renaud; Almeida, Sérgio Monteiro.
Título: Viral acute gastroenteritis: clinical and epidemiological features of co-infected patients
Fonte: Braz. j. infect. dis;16(3):267-272, May-June 2012. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: BACKGROUND: Acute gastroenteritis (AGE) is a common disorder that affects children worldwide. It is usually caused by viral agents, including rotavirus, enteric adenovirus, norovirus, and astrovirus groups. Currently, there are few reports about co-infection among these viruses, mainly in Brazil. METHODS: This is a retrospective study in which 84 rotavirus-positive samples from hospitalized patients at a teaching hospital in Southern Brazil, collected in the 2001-2010 period, were analyzed by polymerase chain reaction (PCR) and reverse transcription - polymerase chain reaction (RT-PCR), for the investigation of enteric adenovirus, astrovirus, and norovirus. RESULTS: In total, 12 of the 84 (14%) samples were positive to enteric adenovirus or norovirus. Clinical, laboratory, and demographic data showed statistically significant differences between mono and co-infected patients, including age and depletion rate. CONCLUSIONS: These findings highlight the need for implementation of other enteric virus detection assays in clinical diagnosis for a complete laboratory investigation of hospitalized pediatric patients with AGE, in order to understand the impact of these pathogens on disease severity, spread within hospital, and consequently, prevent the dissemination of nosocomial infections.
Descritores: Coinfecção/virologia
Vírus de DNA/classificação
Diarreia/virologia
Gastroenterite/virologia
Vírus de RNA/classificação
-Doença Aguda
Brasil/epidemiologia
Coinfecção/epidemiologia
Vírus de DNA/isolamento & purificação
Diarreia/epidemiologia
Gastroenterite/epidemiologia
Prevalência
Estudos Retrospectivos
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
Vírus de RNA/isolamento & purificação
Limites: Pré-Escolar
Feminino
Seres Humanos
Lactente
Masculino
Responsável: BR1.1 - BIREME


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ALVES, Sydney Hartz
Weiblen, Rudi
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Id: lil-614628
Autor: Pilau, Marciele Ribas; Alves, Sydney Hartz; Weiblen, Rudi; Arenhart, Sandra; Cueto, Ana Paula; Lovato, Luciane Teresinha.
Título: Antiviral activity of the Lippia graveolens (Mexican oregano) essential oil and its main compound carvacrol against human and animal viruses
Fonte: Braz. j. microbiol;42(4):1616-1624, Oct.-Dec. 2011. tab.
Idioma: en.
Projeto: CNPq.
Resumo: Mexican oregano (Lippia graveolens) is a plant found in Mexico and Central America that is traditionally used as a medicinal herb. In the present study, we investigated the antiviral activity of the essential oil of Mexican oregano and its major component, carvacrol, against different human and animal viruses. The MTT test (3-4,5-dimethythiazol-2yl)-2,5-diphenyl tetrazolium bromide) was conducted to determine the selectivity index (SI) of the essential oil, which was equal to 13.1, 7.4, 10.8, 9.7, and 7.2 for acyclovir-resistant herpes simplex virus type 1 (ACVR-HHV-1), acyclovir-sensitive HHV-1, human respiratory syncytial virus (HRSV), bovine herpesvirus type 2 (BoHV-2), and bovine viral diarrhoea virus (BVDV), respectively. The human rotavirus (RV) and BoHV-1 and 5 were not inhibited by the essential oil. Carvacrol alone exhibited high antiviral activity against RV with a SI of 33, but it was less efficient than the oil for the other viruses. Thus, Mexican oregano oil and its main component, carvacrol, are able to inhibit different human and animal viruses in vitro. Specifically, the antiviral effects of Mexican oregano oil on ACVR-HHV-1 and HRSV and of carvacrol on RV justify more detailed studies.
Descritores: Antivirais
Vírus de DNA
Técnicas In Vitro
Lippia mexicana/análise
Óleos Voláteis
Plantas Medicinais
RNA Viral
Verbenaceae/genética
-Métodos
Técnicas
Limites: Seres Humanos
Animais
Responsável: BR32.1 - Serviço de Biblioteca e Informação Biomédica


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Mancini, Dalva Assunçäo Portari
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Id: lil-525779
Autor: Mancini, Dalva Assunção Portari; Torres, Rosângela Pavan; Pinto, José Ricardo; Mancini-Filho, Jorge.
Título: Inhibition of DNA virus: herpes-1 (HSV-1) in cellular culture replication, through an antioxidant treatment extracted from rosemary spice / A inibição do vírus DNA: herpes-1 (HSV-1) na replicação de cultura celular, através de um tratamento antioxidante extraídos de especiarias alecrim
Fonte: Braz. j. pharm. sci;45(1):127-133, jan.-mar. 2009. ilus, graf, tab.
Idioma: en.
Projeto: CNPq.
Resumo: This work aimed to evaluate antiviral properties in antioxidants from spices. Phenolic compounds extracted from rosemary (Rosmarinus officinallis, L) by hot water, had their antioxidant activity determined by spectrophotometry using β carotene/linoleic acid system. The rosemary extract was evaluated by antiviral assay of Herpes Virus type-1 (HSV-1) replication in VERO cells, in the presence or absence of the spice. 10,000 TCID50/mL of the HSV-1 was kept for 3 h at 4º C, with 300 ppm of rosemary extract, and 100 ppm of butyl hydroxyl toluene (BHT). Then, these viruses were inoculated in VERO cells incubated at 37º C in CO2-5 percent, for seven days. Daily, they were examined and the end point was based on 100 percent of CPE in virus control (without antioxidants). The HSV-1 replication inhibition percentage (IP) measured the antiviral action from antioxidants, showing viral reductions of the 82.0, 82.5 percent, in the presence of rosemary and rosemary + BHT, respectively. As an extension, cell test corresponded to the similar viral decrease (IP = 85.0 and 86.3 percent) in both aforementioned situations. Results lead to conclude that phenolic compounds from rosemary revealed an antiviral action on herpesvirus-1.

Neste estudo foi avaliada a ação antiviral de antioxidantes de especiaria. Extrato aquoso de alecrim (Rosmarinus officinalis, L), que apresentou atividade antioxidante através de espectrofotometria usando o sistema β caroteno/ácido linoléico, foi avaliado em ensaios com vírus herpes-1 na replicação em células VERO. Nestes ensaios foram utilizados 10.000 TCID50 por cento/mL do vírus HSV-1, mantidos em contato com 300 ppm do extrato de alecrim e com 100 ppm de butil hidroxi tolueno (BHT), durante 3h a 4ºC. Esses vírus, em seguida, foram inoculados em células VERO incubadas a 37 ºC/5 por cento de CO2 por sete dias. Pelo efeito citopático (ECP) e o "end point" de ECP do controle de vírus (sem antioxidante), foi possível observar que houve reduções na replicação viral de 82 e 82,5 por cento na presença do alecrim e do alecrim + BHT, respectivamente. Nessa situação,avaliou-se ainda a redução da adsorção viral às células, que apresentou índices similares de 85,0 e 86,3 por cento de redução na capacidade da adsorção. Estas reduções no desempenho do HSV foram medidas pela fórmula de porcentagem de inibição da replicação viral (PI). Os resultados levam a concluir que os compostos fenólicos do alecrim apresentam ação antiviral sobre o HSV-1.
Descritores: Extratos Vegetais/análise
Herpes Simples
Herpesvirus Humano 1
Rosmarinus/imunologia
Vírus de DNA/química
-Antioxidantes/farmacocinética
Antivirais/uso terapêutico
Compostos Fenólicos/análise
Espectrofotometria
Células Vero
Tipo de Publ: Estudos de Avaliação
Responsável: BR40.1 - DBD - Divisão de Biblioteca e Documentacão do Conjunto das Químicas


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Id: lil-484485
Autor: Ordóñez Díaz, Karen Melissa; Cortés, Jorge Alberto; Cuervo Maldonado, Sonia Isabel.
Título: Virus ADN y su relación con el cáncer / DNA virus and their relation to cancer
Fonte: Rev. colomb. cancerol;10(3):197-206, sept. 2006. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: La génesis del cáncer se ha relacionado con alteraciones en la regulación del ciclo celular, secundaria, en una importante proporción, al efecto de agentes químicos, físicos o biológicos. Entre estos últimos, los virus han sido identificados como agentes causales de neoplasias en animales y humanos. A continuación, se presenta una revisión sobre los principales mecanismos moleculares por los cuales virus ADN, como el virus del papiloma humano (VPH), virus de Ebstein-Barr (VEB), herpes virus humano 8 (HHV-8) y virus de la hepatitis B (VHB), pueden alterar el ciclo celular y favorecer el desarrollo de cáncer, al hacer mención a los factores que pueden contribuir a este proceso en la población expuesta, así como de los adelantos realizados en la investigación en pro de su prevención.

Cancer origin has been related to alterations in the cell cycle. Some of these alterations are due to chemical, physical or biological agents. Among the last ones, viruses have been identified as causal factors of neoplasms in animals and humans. This article reviews the main molecular mechanisms through which DNA viruses such as Human Papilloma Virus, Ebstein Barr Virus, Human Herpes Virus-8, and Hepatitis B virus, might alter and favor cancer development.
Descritores: Ciclo Celular
Vírus de DNA
Neoplasias
Tipo de Publ: Revisão
Responsável: CO40.1 - Biblioteca Médica


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Id: lil-453154
Autor: Marangon, Fabiana Bogossian; Miller, Darlene; Alfonso, Eduardo.
Título: Laboratory results in ocular viral diseases: implications in clinical-laboratory correlation
Fonte: Arq. bras. oftalmol;70(2):189-194, mar.-abr. 2007. graf, tab.
Idioma: en.
Resumo: PURPOSE: To document etiology and predictive value of clinical diagnosis in laboratory confirmed viral diseases. METHODS: Reports of culture-positive cases of samples collected from patients presenting from January 1987 - December 2001 were evaluated. RESULTS: One thousand nine hundred and sixty-four (1964) cultures were submitted during 1987-2001. Twenty-six percent were positive (514). Human herpesvirus 1 was the most frequent agent isolated from all positive culture (56 percent). Adenovirus was the most common virus isolated from conjunctiva (66 percent), human herpesvirus 1 from lid and cornea (76 percent, 88 percent) and cytomegalovirus from vitreous (27 percent). Some unusual pathogens were recovered from conjunctiva as cytomegalovirus and from cornea as adenovirus, enterovirus and cytomegalovirus. Recognition of common viral syndromes was human herpesvirus 1 (88 percent), epidemic keratoconjunctivitis (88 percent), acute hemorrhagic conjunctivitis (70 percent) and varicella zoster virus (100 percent). However, some misdiagnosed cases were observed. Thirteen percent of conjunctivitis thought to be caused by herpes were due to adenovirus, 3.2 percent to Enterovirus, 3.2 percent to varicella zoster virus and 3.2 percent to human cytomegalovirus. Also, 5 percent of cases with a clinical diagnosis of herpes keratitis were caused by adenovirus and 2.7 percent by enterovirus. Finally, 4.8 percent of cases thought to be adenovirus conjunctivitis were herpes conjunctivitis. CONCLUSIONS: Human herpesvirus 1 remains the most frequently isolated virus from ocular sites in general (56 percent). Nonherpetic corneal isolates were in decreasing order: adenovirus, enterovirus and cytomegalovirus. Clinical and laboratory correlation was less than 90 percent. The most misdiagnosed cases were herpes conjunctivitis and keratitis, some cases of adenovirus conjunctivitis some cases of acute hemorrhagic conjunctivitis. It is essential that a rapid and...

OBJETIVOS: Documentar a etiologia e prever a importância do diagnóstico clínico em doenças virais oculares confirmadas em laboratório. MÉTODOS: Todos os relatórios de pacientes com cultura viral positiva durante o período de janeiro 1987 - dezembro 2001 foram analisados. RESULTADOS: Quinhentos e quatorze (514) casos foram encontrados. Em geral, herpesvírus 1 humano foi o agente mais freqüentemente isolado. Adenovírus foi o vírus mais comumente isolado da conjuntiva (66 por cento), herpesvírus 1 humano das pálpebras e córnea (76 por cento, 88 por cento respectivamente) e citomegalovírus do vítreo (27 por cento). Alguns agentes não usuais foram isolados da conjuntiva como citomegalovírus e da córnea como adenovírus, enterovírus e citomegalovírus. Reconhecimento das síndromes virais comuns foi: herpervírus 1 humano (88 por cento), ceratoconjuntivite epidêmica (88 por cento), conjuntivite aguda hemorrágica (70 por cento). Porém, alguns casos com diagnóstico incorreto foram observados. Treze por cento das conjuntivites com diagnóstico de herpes foram causadas por adenovírus, 3,2 por cento por enterovírus, 3,2 por cento por varicella zoster vírus e 3,2 por cento por citomegalovírus. Também, 5 por cento dos casos com diagnóstico clínico de ceratite herpética eram adenovírus e 2,7 por cento enterovírus. Além disso, 4,8 por cento dos casos em que se pensaram em conjuntivite por adenovírus, eram conjuntivite por herpes. Finalmente, 30 por cento dos casos em que se diagnosticaram conjuntive hemorrágica aguda, o agente etiológico era adenovírus. CONCLUSÃO: Em geral herpesvírus humano 1 continua a ser o vírus mais comum encontrado nas infecções oculares (56 por cento). Agentes não herpéticos isolados da córnea foram em ordem decrescente: adenovírus, enterovírus e citomegalovírus. A correlação entre o diagnóstico clínico e laboratorial foi menor do que 90 por cento. Um diagnóstico rápido e específico é essencial em casos de apresentações virais atípicas...
Descritores: Infecções Oculares Virais/diagnóstico
Infecções Oculares Virais/etiologia
Ceratoconjuntivite/diagnóstico
Ceratoconjuntivite/etiologia
-Brasil/epidemiologia
Técnicas de Laboratório Clínico
Conjuntivite Hemorrágica Aguda/diagnóstico
Conjuntivite Hemorrágica Aguda/epidemiologia
Conjuntivite Hemorrágica Aguda/etiologia
Córnea/virologia
Vírus de DNA/isolamento & purificação
Erros de Diagnóstico/prevenção & controle
Enterovirus/isolamento & purificação
Infecções Oculares Virais/epidemiologia
Reações Falso-Positivas
Herpes Zoster/virologia
Ceratoconjuntivite/epidemiologia
Valor Preditivo dos Testes
Estações do Ano
Fatores de Tempo
Cultura de Vírus
Limites: Seres Humanos
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-384258
Autor: Vigliocco, A; Bonamico, B; Alemano, S; Miersch, O; Abdala, G.
Título: Stimulation of jasmonic acid production in Zea mays L. infected by the maize rough dwarf virus-Río Cuarto: reversion of symptoms by salicylic acid
Fonte: Biocell;26(3):369-374, Dec. 2002.
Idioma: en.
Resumo: In the present paper we study the possible biological relevance of endogenous jasmonic acid (JA) and exogenous salicylic acid (SA) in a plant-microbial system maize-virus. The virus disease "Mal de Río Cuarto" is caused by the maize rough dwarf virus-Río Cuarto. The characteristic symptoms are the appearance of galls or enations in leaves, shortening of the stem internodes, poor radical system and general stunting. Changes in JA and protein pattern in maize control and infected plants of a virus-tolerant cultivar were investigated. Healthy and infected-leaf discs were collected for JA measurement at different post-infection times (20, 40, 60 and 68 days). JA was also measured in roots on day 60 after infection. For SDS-PAGE protein analysis, leaf discs were also harvested on day 60 after infection. Infected leaves showed higher levels of JA than healthy leaves, and the rise in endogenous JA coincided with the enation formation. The soluble protein amount did not show differences between infected and healthy leaves; moreover, no difference in the expression of soluble protein was revealed by SDS-PAGE. Our results show that the octadecanoid pathway was stimulated in leaves and roots of the tolerant maize cultivar when infected by this virus. This finding, together with fewer plants with the disease symptoms, suggest that higher foliar and roots JA content may be related to disease tolerance. SA exogenous treatment caused the reversion of the dwarfism symptom.
Descritores: Ácido Salicílico/farmacologia
Ciclopentanos/metabolismo
Doenças das Plantas/virologia
Vírus de Plantas/fisiologia
Zea mays/metabolismo
Zea mays/virologia
-Infecções por Vírus de DNA
Vírus de DNA/fisiologia
Folhas de Planta/efeitos dos fármacos
Folhas de Planta/metabolismo
Folhas de Planta/virologia
Zea mays/efeitos dos fármacos
Zea mays/crescimento & desenvolvimento
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-361999
Autor: Diniz-Mendes, Leonardo; Devalle, Sylvie; Niel, Christian.
Título: Genomic characterization of a Brazilian TT Virus isolate closely related to SEN virus-F
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;99(3):301-306, May 2004. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: SEN virus (SENV) is a circular, single stranded DNA virus that has been first characterized in the serum of a human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1)-infected patient. Eight genotypes of SENV (A-H) have been identified and further recognized as variants of TT virus (TTV) in the family Circoviridae. Here we describe the first genomic characterization of a SENV isolate (5-A) from South America. Using 'universal' primers, able to amplify most, if not all, TTV/SENV genotypes, a segment of > 3 kb was amplified by polymerase chain reaction from the serum of an HIV-1 infected patient. The amplicon was cloned and a 3087-nucleotide sequence was determined, that showed a high (85 percent) homology with the sequence of the Italian isolate SENV-F. Proteins encoded by open reading frames (ORFs) 1 to 4 consisted of 758, 129, 276, and 267 amino acids, respectively. By phylogenetic analysis, isolate 5-A was classified into TTV genotype 19 (phylogenetic group 3), together with SENV-F and TTV isolate SAa-38.
Descritores: Infecções por Vírus de DNA
DNA Viral
Variação Genética
Infecções por HIV
-Brasil
Vírus de DNA
Genótipo
Fases de Leitura Aberta
Filogenia
Reação em Cadeia da Polimerase
Análise de Sequência de DNA
Limites: Seres Humanos
Adulto
Masculino
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-317682
Autor: Diament, Aron J.
Título: Neurovises / Central nervous system viral diseases
Fonte: In: Veronesi, Ricardo; Focaccia, Roberto. Tratado de infectologia: v.1. Säo Paulo, Atheneu, 2002. p.451-470, tab. (BR)
Idioma: pt.
Símbolo: BR.
Descritores: Viroses do Sistema Nervoso Central
-Vírus de DNA
Morbillivirus
Doenças Neurodegenerativas
Respirovirus
Vírus de RNA
Responsável: BR31.1 - SIDC - Serviço de Informação e Documentação Científica
BR31.1; WC100, V599t, 2.ed., v.1



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