Base de dados : LILACS
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Linhares, Alexandre da Costa
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Id: biblio-945879
Autor: Aragão, Glicélia Cruz; Oliveira, Darleise de Souza; Santos, Mirleide Cordeiro dos; Mascarenhas, Joana D'Arc Pereira; Oliveira, Consuelo Silva de; Linhares, Alexandre da Costa; Gabbay, Yvone Benchimol.
Título: Molecular characterization of norovirus, sapovirus and astrovirus in children with acute gastroenteritis from Belém, Pará, Brazil / Caracterização molecular de norovírus, sapovírus e astrovírus em crianças com gastroenterite aguda em Belém, Pará, Brasil
Fonte: Rev. Pan-Amazônica Saúde (Online);1(1):149-158, 2010. tab, graf.
Idioma: pt.
Resumo: The importance of norovirus (NoVs), sapovirus (SaVs) and human astrovirus (HAstVs) as causes of gastroenteritis outbreaks are already well-defined, but a few studies have described sporadic cases of acute gastroenteritis caused by these viral entities. The aim of this study was to determine the role of these viruses in the etiology of acute gastroenteritis in children enrolled to participate in hospital – and emergency department – based intensive surveillance carried out in Belém, Brazil, from March to September 2003. A total of 305 stool specimens from patients with severe gastroenteritis were collected and screened by reverse transcription followed by polymerase chain reaction (RT-PCR), using the specific primers Mon 269 and Mon 270 for HAstVs, p289 and p290 for human calicivirus (HuCVs), and Mon 431/433 and Mon 432/434 for NoVs. Sequencing of RT-PCR HAstV, HuCVs and NoVs amplicons was carried out using the same primers. Of the 305 samples tested, 96 (31.5 percent) were positive, with 51 diagnosed as HuCVs, 40 as HAstVs and five as mixed infections. Of the 56 (18.4 percent) HuCVs sequenced, 30 were NoVs (9.8 percent) of genogroups GI-4 and GII-4, and 15 (4.9 percent) were SaVs of types GI-1, GI-2 and GII-1. HAstVs, including genotypes 1, 8 and 2, were detected in 45 (14.7 percent) samples. This study has highlighted the importance of these viruses as causes of acute gastroenteritis and established the circulation of different genotypes during the study period. These results reinforce the need for establishing an intensive surveillance for gastroenteritis caused by these viruses to assess the burden of disease and to monitor the circulation of genotypes.

A importância dos norovírus (NoVs), sapovírus (SaVs) e astrovírus humanos (HAstVs) como causa de surtos de gastroenteritis já está bem definida. Entretanto, poucos estudos têm descrito casos esporádicos de gastroenterites aguda causados por esses agentes. O objetivo deste estudo foi determinar o papel destes vírus na etiologia da gastroenterite aguda em crianças atendidas durante uma vigilância intensiva realizada em hospitais e ambulatórios de Belém, Brasil, de março a setembro de 2003. Um total de 305 espécimes fecais de pacientes com gastrenterite grave foram coletados e testados por reação em cadeia da polimerase precedida de transcrição reversa (RT-PCR), utilizando iniciadores específicos Mon 269 e Mon 270 para os HAstVs; p289 e p290 para os calicivírus humanos (HuCVs); e Mon 431/433 e Mon 432/434 para os NoVs. Sequenciamento dos amplicons de HAstV, HuCVs e NoVs, obtidos por RT-PCR, foi realizado usando os mesmos iniciadores. Das 305 amostras testadas, 96 (31,5 por cento) apresentaram resultados positivos, sendo que 51 diagnosticadas como HuCVs, 40 como HAstVs e cinco infecções mistas. Das 56 (18,4 por cento) amostras de HuCVs sequenciadas, 30 foram NoVs (9,8 por cento) pertencentes aos genogrupos GI-4 e GII-4, e 15 (4,9 por cento) SaVs dos grupos GI-1, GI-2 e GII-1. HAstVs foram detectados em 45 (14,7 por cento) das amostras, incluindo os genótipos 1, 8 e 2. Esta pesquisa ressalta a importância destas viroses como causa de gastrenterite aguda e demonstra a circulação de diferentes genótipos durante o período de estudo. Estes resultados reforçam a necessidade de se estabelecer uma vigilância intensiva das gastrenterite causadas por estes vírus, de forma a poder avaliar o impacto da doença e monitorar os genótipos circulantes.
Descritores: Gastroenterite/etiologia
Mamastrovirus
Norovirus
Sapovirus
-Infecções por Astroviridae
Infecções por Astroviridae/diagnóstico
Dados de Sequência Molecular
Reação em Cadeia da Polimerase/métodos
Limites: Masculino
Feminino
Seres Humanos
Criança
Responsável: BR275.1 - Biblioteca


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Id: biblio-971381
Autor: Giordano, Miguel Oscar.
Título: Monitoreo y confección de mapas que reflejen la contaminación estacional por astrovirus humano en las aguas del río Suquía de la ciudad de Córdoba, Argentina.
Fonte: Córdoba; s.n; 2015. 70 p. ilus, graf.
Idioma: es.
Tese: Apresentada a Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas. Secretaría de Graduados en Ciencias de la Salud. Maestría en Microbiología con Orientación en Investigación en Salud Humana para obtenção do grau de Mestre.
Resumo: El agua es reconocida como el recurso natural más preciado de nuestro planeta, el descuido de las fuentes de agua ligado a las actividades humanas, genera contaminación sostenida en el tiempo y lleva como resultado a la disminución en la calidad y cantidad de este recurso esencial. La presencia de patógenos virales en las fuentes de agua tienen un alto impacto socioeconómico tanto en las naciones en desarrollo como en las desarrolladas. La ocurrencia de virus entéricos como rotavirus, astrovirus, norovirus y adenovirus en el ambiente, en aguas y alimentos, ha sido reportada en los países desarrollados y asociada a gastroenteritis de origen viral relacionada con el consumo de agua contaminada con materia fecal. En Argentina y otros países de Sudamérica no hay regulaciones sobre el monitoreo de virus patógenos en matrices acuosas y existen pocos estudios de monitoreo ambiental de patógenos virales (rotavirus, norovirus, adenovirus, enterovirus) en aguas superficiales de ríos y lagos. Más aún, no se dispone de información sobre el monitoreo ambiental de astrovirus en aguas superficiales en la Argentina. En este trabajo de tesis se abordó el estudio de astrovirus humano en aguas del río Suquia con los objetivos de: 1. Evaluar las aguas del río Suquía como potencial fuente de transmisión de astrovirus humano (HastV). 2. Conocer si el río Suquía está integrado a la historia natural de circulación de astrovirus en nuestro medio. A los fines de cumplir los objetivos planteados se analizaron un total de 28 muestras de agua recolectadas en 7 puntos representativos del río Suquía, cubriendo el muestreo desde el nacimiento (Dique San Roque) hasta que el río abandona la Ciudad de Córdoba (Cantera San José).

Abstract: Water is the most precious natural resource on Earth; neglected water sources associated with anthropogenic activities generate sustained contamination over time and results in a reduction in quantity and quality of this essential resource. The presence of pathogenic virus in water sources has a high socioeconomic impact, both in developing and developed countries. The occurrence of enteric virus, such as rotavirus, astrovirus, norovirus and adenovirus, in the environment, water and food has been reported in developed countries associated with viral gastroenteritis related to consumption of fecal-contaminated water.In Argentina as well as in other South American countries, there are regulations no requiring monitoring of pathogenic viruses in water matrices, and few studies have focused on environmental monitoring of viral pathogens (rotavirus, norovirus, adenovirus, enterovirus) in surface waters of rivers and lakes. Moreover, there is no information available on environmental monitoring of astrovirus in surface waters in Argentina. This thesis work focuses on the study of human astrovirus in the waters of the Suquía river, with the general aims of: 1. evaluating the waters of Suquía river as a potential source of transmission of human astrovirus (HastV), and 2. Knowing if Suquía river is integrated to the natural history of astrovirus circulation in our environment. To meet the aims of this work, a total of 28 water samples were collected from 7 representative points along Suquía river course, with sampling covering from the riverhead (San Roque Dam) to the site where the river leaves the city of Córdoba (San José quarry).
Descritores: Mamastrovirus/imunologia
Infecções por Astroviridae/microbiologia
Monitoramento da Água
Controle da Qualidade da Água
Poluição Costeira/análise
Poluição Costeira/políticas
Políticas Públicas de Saúde
-Argentina/epidemiologia
Limites: Masculino
Feminino
Seres Humanos
Tipo de Publ: Estudos de Validação
Responsável: AR32.1 - Biblioteca Prof. Dr. J. M. Allende
AR32.1; TM, G-58 015


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Id: lil-774266
Autor: Xavier, Maria da Penha Trindade Pinheiro.
Título: Estudo retrospectivo dos astrovirus humanos associados a casos de gastrenterite aguda em crianças residentes em tres regioes do Brasil: nordeste, sudeste e sul no período de 1994 a 2011 / Retrospective study of human astrovirus associated with cases of acute gastroenteritis in children living in three regions of Brazil: northeast, southeast and south in the period 1994-2011.
Fonte: Rio de Janeiro; s.n; 2015. xiii,108 p. ilus, tab.
Idioma: en; pt.
Tese: Apresentada a Instituto Oswaldo Cruz para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: Os astrovírus humanos (HAstVs) pertencem a família Astroviridae e são associados agastrenterite aguda (GA) em crianças menores de cinco anos, tanto nos paísesdesenvolvidos como naqueles em desenvolvimento, o que os tornam de interesse nocampo da Saúde Pública. A família Astroviridae é dividida em dois gêneros:Avastrovirus e Mamastrovirus. No gênero Mamastrovirus, encontram-se os astrovirusassociados à infecção em mamíferos, tanto humanos como animais. Até 2008, osastrovirus associados a doenças em humanos eram restritos a oito genótipos,conhecidos como HAstV 1-8. A partir de então novos HAstVs foram sendo descritos,associados a doenças em humanos, como os HAstVs MLB1-3 e os HAstVs VA1-4.Opresente estudo consiste no estudo epidemiológicos retrospectivos (1994 a 2011) paradetecção e caracterização molecular de HAstV em amostras de fezes provenientes decrianças com menos de cinco anos de idade com GA, em diferentes regiões do Brasil:Nordeste, Sudeste e Sul. Incluem-se neste trabalho três estudos: 1) Estudo dosHAstV em casos esporádicos de GA ocorridos em crianças menores de cinco anos deidade, em três regiões brasileiras (Nordeste, Sudeste e Sul), durante o período de2005 a 2011, incluindo a pesquisa dos novos HAstV; 2) Estudo dos HAstV em criançascom GA, atendidas na creche Bertha Lutz, FIOCRUZ-RJ, durante o período de janeirode 1994 a dezembro de 2008; 3)...

Human astrovirus (HAstVs), belong to Astroviridae family, and are associatedwith acute gastroenteritis (GA) in children under five years-old, both indeveloped and in developing countries, which makes them of interest in thePublic Health field. The Astroviridae family is divided into two genera:Avastrovirus and Mamastrovirus. Mamastrovirus are the astrovirusesassociated to infection in mammals, both humans and animals. By 2008, theastrovirus associated with human disease were restricted to eight genotypes,known as HAstV 1-8. Since then, new HAstVs have been described, associatedwith human disease, such as HAstVs MLB1-3 and HAstVs VA1-4. The presentstudy is the retrospective epidemiological study (1994 to 2011) for the detectionand molecular characterization of HAstV in stool samples from children underfive years old presenting GA, in different regions of Brazil: Northeast, Southeastand South. Three studies are presented: 1) Study of HAstV in sporadic cases ofGA occurred in children under five years old in three Brazilian regions(Northeast, Southeast and South) from 2005 to 2011, including the descriptionof a new HAstV; 2) Study of HAstV in children with GA, attending the day careBertha Lutz, FIOCRUZ-RJ from January 1994 to December 2008 and 3) Studyof HAstV in children under two years old presenting GA and hospitalized inNiteroi, Rio de Janeiro from April to September 2003. The detection of HAstVwas performed using different protocols for detection and molecularcharacterization such as: Reverse–transcriptase polymerase chain reaction,(RT- PCR), Single step RT -PCR (OneStep RT-PCR) and RealTime RT- PCR.The HAstV detected were characterized by partial sequencing of ORF2 regionof the viral genome. The study 1 demonstrated the HAstV detection frequencyin 7.1 % of samples, and described the first ASTV MLB1 in Brazil. Themolecular characterization identified the circulation genotypes HAstV -1, 2, 3, 4,5, 6 and 8...
Descritores: Infecções por Astroviridae
Gastroenterite/diagnóstico
Gastroenterite/epidemiologia
Mamastrovirus/patogenicidade
Limites: Seres Humanos
Criança
Responsável: BR15.1 - Biblioteca de Ciências Biomédicas


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Id: lil-634603
Autor: Gomes, K. A.; Stupka, J. A.; Diana, A.; Parra, G. I..
Título: Caracterización molecular de calicivirus aislados de brotes de gastroenteritis ocurridos en la Argentina durante los años 2005 y 2006 / Molecular characterization of calicivirus strains detected in outbreaks of gastroenteritis occurring in Argentina during 2005 and 2006
Fonte: Rev. argent. microbiol;40(4):222-228, oct.-dic. 2008. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: Con el objetivo de determinar la incidencia de calicivirus, rotavirus y astrovirus en brotes de gastroenteritis ocurridos en diversas regiones de la Argentina durante los años 2005 y 2006, se analizaron muestras de materia fecal provenientes de 7 brotes con resultado de coprocultivo negativo. Para el diagnóstico de rotavirus se utilizó un ELISA comercial, mientras que para el diagnóstico de calicivirus y astrovirus se utilizó el método de RT-PCR. De las 74 muestras analizadas, 20 fueron positivas para calicivirus, 17 para rotavirus y una para astrovirus. No se identificaron infecciones virales mixtas. En 5 muestras positivas para calicivirus se secuenció una región del gen de la polimerasa; 4 de ellas correspondieron al género Norovirus y una al género Sapovirus. El análisis filogenético de las muestras secuenciadas determinó la presencia de norovirus de los genogrupos GI y GII; dentro de este último, se identificaron los genotipos GII-4, GII-b y GII-17. El análisis de la muestra en la cual se identificó sapovirus reveló la presencia del genotipo GI-1. Este estudio representa una continuación del análisis epidemiológico molecular de calicivirus asociados a brotes de gastroenteritis iniciado en 2004 y constituye la primera comunicación de la circulación de norovirus del genotipo GII-17 en la Argentina.

In order to determine the incidence of calicivirus, rotavirus and astrovirus in outbreaks of gastroenteritis occurring in different regions of Argentina during 2005 and 2006, fecal samples from seven nonbacterial outbreaks were analyzed. A commercial ELISA was used for rotavirus detection, while RT-PCRs were used for calicivirus and astrovirus. Of the 74 samples analyzed, 20 were calicivirus positive, 17 were rotavirus positive and one was astrovirus positive. No mixed infections were detected. A partial region of the RdRp gene was sequenced in five calicivirus positive-samples; 4 of them belonged to Norovirus genus and one to Sapovirus genus. The phylogenetic analysis of norovirus-positive-samples revealed the presence of strains from genogroups GI and GII; genotypes GII- 4, GII-b and GII-17 were identified within the latter. Phylogenetic the sapovirus-positive-sample revealed the presence of genotype GI-1. This study represents a follow-up of the of molecular epidemiology analysis of calicivirus associated to gastroenteritis outbreaks that have been carried out by our group since 2004, and constitutes the first report of the circulation of genotype GII-17 in Argentina.
Descritores: Infecções por Caliciviridae/virologia
Caliciviridae/isolamento & purificação
Surtos de Doenças
Gastroenterite/virologia
RNA Viral/genética
-Argentina/epidemiologia
Infecções por Astroviridae/epidemiologia
Infecções por Astroviridae/virologia
Sequência de Bases
Infecções por Caliciviridae/epidemiologia
Caliciviridae/genética
Genótipo
Gastroenterite/epidemiologia
Dados de Sequência Molecular
Mamastrovirus/isolamento & purificação
Norovirus/genética
Norovirus/isolamento & purificação
Filogenia
Infecções por Rotavirus/epidemiologia
Infecções por Rotavirus/virologia
Rotavirus/isolamento & purificação
Alinhamento de Sequência
Sapovirus/genética
Sapovirus/isolamento & purificação
Limites: Adolescente
Adulto
Idoso
Criança
Pré-Escolar
Seres Humanos
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Responsável: AR1.2 - Instituto de Investigaciónes Epidemiológicas


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Texto completo SciELO Brasil
Leite, José Paulo Gagliardi
Cardoso, Divina das Dores de Paula
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Id: lil-523736
Autor: Silva, Paula Andreia; Santos, Rodrigo Alessandro Tôgo; Costa, Paulo Sérgio Sucasas; Teixeira, José Marcus Sócrates; Giugliano, Loreny Gimenes; Andreasi, Márcia Sueli Assis; Leite, José Paulo Gagliardi; Schreier, Ecakart; Cardoso, Divina das Dôres de Paula.
Título: The circulation of human astrovirus genotypes in the Central West Region of Brazil
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;104(4):655-658, July 2009. graf.
Idioma: en.
Projeto: CNPq.
Resumo: Out of 1,588 faecal samples of children taken from three locations of the Central West Region of Brazil, 57 were positive for astroviruses (HAstVs) using reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). They were genotyped by nested RT-PCR and/or genomic sequencing. HAstV-1 (42.8 percent), HAstV-2 (23.2 percent), HAstV-3 (3.6 percent), HAstV-4 (14.3 percent) and HAstVs -5, -6, -7 and -8 (1.8 percent each) were detected. In Goiânia and Campo Grande, HAstV-1 was the most frequently detected genotype while in Brasília (DF) it was HAstV-2. Shifts in the circulation of astrovirus genotypes were observed in DF and Campo Grande. All samples collected by rectal swabs were viral negative. The astrovirus genotypes were detected in all age groups and there was no correlation between genotype and age group.
Descritores: Infecções por Astroviridae/virologia
Diarreia/virologia
Fezes/virologia
Mamastrovirus/genética
-Infecções por Astroviridae/diagnóstico
Genótipo
Mamastrovirus/isolamento & purificação
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
Limites: Pré-Escolar
Seres Humanos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Brasil
Texto completo
Id: lil-520213
Autor: Silva, S. E. L. da; Bonetti, A. M; Petrocelli, A; Ferrari, H. F; Luvizotto, M. C. R; Cardoso, T. C.
Título: Epidemiological aspects of astrovirus and coronavirus in poults in the South Eastern Region of Brazil / Aspectos epidemiológicos associados à prevalência de Astrovirus e Coronavirus em lotes de perus da Região Sudeste do Brasil
Fonte: Braz. j. microbiol;40(2):248-253, Apr.-June 2009. tab.
Idioma: en.
Resumo: A survey of Turkey Coronavirus (TCoV) and Astrovirus (TAstV-2) prevalence was carried out from February to December during 2006 year in semiarid region of Brazil, from a turkey producer area, localized in South Eastern of Brazil. To asses the risk factor related to clinical material, climatic condition and type of RT-PCR applied, cloacal swabs (CS), faeces, sera, bursa of Fabricius (BF), thymus (TH) and spleen (SP) and ileum-caeca region were collected from 30-day-old poults suffering of enteritis episode characterized as poult enteritis mortality syndrome (PEMS). The PEMS clinical features were characterized by watery to foamy faeces, light brown-yellow in colour and low mortality rate. Meteorological data (rainfall and relative humidity) observed during along the study presented monthly average temperature ranging from 39.3 and 31.2ºC, precipitation in rainy season from 40 to 270.3 mm/month, and no rain during dry season. Simplex RT-PCR gave odds ratio (OR) values suggesting that ileum-caeca region is at higher chance (OR=1.9; p=0.9741) to have both viral RNA than faeces (OR=1.5; p=0.7319). However, multiplex RT-PCR showed 3.98 (p=0.89982) more chance to give positive results in faeces than CS at dry season. The major risk factors seem to be low rate of humidity and high temperatures at winter, probably responsible for spread, easily, the TCoV and TAstv-2 among the flocks. The positive results of both virus suggested that they can play an important role in enteric disorders, associated to low humidity and high temperatures frequently found in tropical countries.

O presente estudo foi conduzido para avaliar a prevalência do Coronavirus dos perus (TCoV) e Astrovirus tipo 2 (TAstV-2) entre os meses de Fevereiro a Dezembro de 2006, em uma região produtora localizada no semi-árido a Sudeste do Brasil. Os principais fatores de risco associado a prevalência foram material clínico analisado, condições climáticas e tipo de técnica molecular empregada. Os sinais clínicos foram caracterizados como intenso fluido intestinal e baixo crescimento em aves jovens, sendo o material coletado swabs cloacais, fezes, soros, bursa de Fabrícius, segmentos do intestino delgado, timo e baço. Os dados meteorológicos (índice pluviométrico e umidade relativa) desta região, durante o período de estudo, foram de temperatura média mensal variando de 39.3 a 31.2ºC, precipitação na época chuvosa variando de 40 a 270.3mm/mês e ausência de chuva na estação fria e seca. A técnica de simplex RT-PCR resultou em valores de odds ratio (OR) que sugerem que a região do intestino delgado (junção íleo-cecal) possui alta chance (1.9 vezes) de gerar resultados positivos na amplificação de RNA viral que as fezes (1.5 vezes) analisadas. A técnica de multiplex RT-PCR demonstrou ser 3.98 vezes mais eficiente em promover resultados positivos nas fezes que nos swabs cloacais, durante a época de inverno. Os maiores fatores de risco encontrados foram baixa umidade relativa associada a altas temperaturas, durante a estação seca, o que pode permitir uma maior disseminação aérea do ambos os vírus entre os lotes estudados. A alta prevalência detectada para dois vírus sugerem que, no Brasil, estes representam os maiores responsáveis pelos surtos de enterite viral nas regiões semi-áridas, associado a baixas umidades e altas temperaturas típicas de países tropicais.
Descritores: Infecções por Astroviridae
Avastrovirus/genética
Avastrovirus/isolamento & purificação
Infecções por Coronavirus
Coronavirus do Peru/genética
Coronavirus do Peru/isolamento & purificação
Técnicas In Vitro
Reação em Cadeia da Polimerase
Aves Domésticas
-Epidemiologia
Métodos
Prevalência
Técnicas e Procedimentos Diagnósticos
Limites: Animais
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Estudos de Avaliação
Responsável: BR32.1 - Serviço de Biblioteca e Informação Biomédica


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Texto completo SciELO Brasil
Cardoso, Divina das Dores de Paula
Texto completo
Id: lil-498387
Autor: Andreasi, Marcia Sueli Assis; Cardoso, Divina das Dores de Paula; Fernandes, Sonia Maria; Tozetti, Ines Aparecida; Borges, Ana Maria Tavares; Fiaccadori, Fabíola Souza; Santos, Rodrigo Alessandro Tôgo; Souza, Menira.
Título: Adenovirus, calicivirus and astrovirus detection in fecal samples of hospitalized children with acute gastroenteritis from Campo Grande, MS, Brazil
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;103(7):741-744, Nov. 2008. tab.
Idioma: en.
Resumo: We analyzed fecal samples from hospitalized children up to three years of age with acute gastroenteritis at Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil, from May 2000-January 2004. Astrovirus and calicivirus were detected by Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction and adenovirus was detected using the Rotavirus and Adenovirus combined immunoenzyme assay. Astrovirus, adenovirus and calicivirus were detected at rates of 3.1 percent, 3.6 percent and 7.6 percent, respectively. These results re-emphasize the need for the establishment of regional vigilance systems to evaluate the impact of enteric viruses on viral gastroenteritis.
Descritores: Infecções por Adenovirus Humanos/epidemiologia
Infecções por Astroviridae/epidemiologia
Infecções por Caliciviridae/epidemiologia
Diarreia/virologia
Gastroenterite/virologia
-Doença Aguda
Infecções por Adenovirus Humanos/diagnóstico
Adenovírus Humanos/isolamento & purificação
Infecções por Astroviridae/diagnóstico
Brasil/epidemiologia
Infecções por Caliciviridae/diagnóstico
Caliciviridae/isolamento & purificação
Fezes/virologia
Técnicas Imunoenzimáticas
Mamastrovirus/isolamento & purificação
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
Limites: Pré-Escolar
Seres Humanos
Lactente
Recém-Nascido
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Brasil
Rácz, Maria Lúcia
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Id: lil-471864
Autor: Resque, Hugo Reis; Munford, Veridiana; Castilho, Juliana Galera; Schmich, Herika; Caruzo, Thabata Alessandra Ramos; Rácz, Maria Lucia.
Título: Molecular characterization of astrovirus in stool samples from children in São Paulo, Brazil
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;102(8):969-974, Dec. 2007. graf, tab.
Idioma: en.
Projeto: FAPESP; . CNPq.
Resumo: The purpose of this study was to characterize astrovirus in faecal samples collected from children with and without diarrhea in São Paulo, Brazil, grouped into two sets: EPM and HU. Detection and genotyping were carried out using reverse transcription nested polymerase chain reaction (RT-PCR) with specific primers directed towards the genome open reading frame 2 (ORF2). Results for EPM set showed that 66/234 (28.2 percent) were positive: 28/94 (29.7 percent) from children with acute diarrhea, 14/45 (31.1 percent) with persistent diarrhea, and 9/55 (16.3 percent) from control individuals. No data was available for 15/40 (37.5 percent) of samples. Mixed infections with other viruses were found in 33 samples. In the HU, 18/187 (9.6 percent) were positive: 12/158 (7.6 percent) from individuals with acute diarrhea and 6/29 (20.7 percent) from control children. Four samples were mixed with other viruses. Out of 66 astrovirus positive EPM samples, 18 (27.2 percent) were characterized as human astrovirus type-1 (HAstV-1), two (3.0 percent) as HAstV-2, two (3.0 percent) as HAstV-3, and three (4.5 percent) as HAstV-8. Among 18 astrovirus positive HU samples, one (5.5 percent) was characterized as HAstV-1, six (33.3 percent) as HAstV-2, and one (5.5 percent) as HAstV-8. Two HAstV-8 genotyped samples were further confirmed by nucleotide sequencing. Our results shows that astroviruses are circulating in a constant manner in the population, with multiple serotypes, in higher frequency than it was described for other Brazilian regions. For the first time in Sao Paulo, Brazil, it was shown that astroviruses play an important role in children gastroenteritis, as described for most locations where they were detected.
Descritores: Infecções por Astroviridae/virologia
Gastroenterite/virologia
Mamastrovirus/genética
-Doença Aguda
Infecções por Astroviridae/diagnóstico
Infecções por Astroviridae/epidemiologia
Brasil/epidemiologia
Estudos de Casos e Controles
Fezes/virologia
Genótipo
Gastroenterite/diagnóstico
Gastroenterite/epidemiologia
Mamastrovirus/isolamento & purificação
Fases de Leitura Aberta
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
RNA Viral/genética
Limites: Criança
Seres Humanos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


  9 / 16 LILACS  
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Texto completo SciELO Brasil
Mascarenhas, Joana D'arc P
Macêdo, Olinda
Leite, José Paulo G
Texto completo
Id: lil-454809
Autor: Gabbay, Yvone B; Linhares, Alexandre C; Oliveira, Darleise S; Nakamura, Lilian S; Mascarenhas, Joana D'Arc P; Gusmão, Rosa Helena P; Heinemann, Marcos B; Macêdo, Olinda; Leite, José Paulo G.
Título: First detection of a human astrovirus type 8 in a child with diarrhea in Belém, Brazil: comparison with other strains worldwide and identification of possible three lineages
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;102(4):531-534, June 2007. ilus.
Idioma: en.
Resumo: This study describes the genetic relationships of the first human astrovirus type-8 (HAstV-8) detected in Belém-Brazil, during a public hospital-based study. This strain was compared with other HAstV-8 strains identified elsewhere which have sequences available at GeneBank. The regions ORF1a (primers Mon348/Mon340) and ORF2 (primers Mon269/Mon270) were analyzed by nucleotide sequencing and a high similarity rate was observed among the Belém strain and other HAstV-8 strains. In ORF1a, homology values of 93-100 por cento were detected, and in ORF2 96-99 por cento. Considering the sequence variation (7 por cento) observed in ORF2 region, it was suggested that HAstV-8 strains could be divided in three different lineages.
Descritores: Infecções por Astroviridae/virologia
Diarreia Infantil/virologia
Mamastrovirus/genética
-Infecções por Astroviridae/epidemiologia
Brasil/epidemiologia
Diarreia Infantil/epidemiologia
Fezes/virologia
Mamastrovirus/classificação
Mamastrovirus/isolamento & purificação
Fases de Leitura Aberta
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
Limites: Seres Humanos
Feminino
Lactente
Tipo de Publ: Relatos de Casos
Estudo Comparativo
Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Costa, Paulo Sérgio Sucasas da
Leite, José Paulo Gagliardi
Cardoso, Divina das Dores de Paula
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Id: lil-447560
Autor: Santos, Rodrigo Alessandro Tôgo; Borges, Ana Maria Tavares; Costa, Paulo Sérgio Sucasas da; Teixeira, José Marcus Sócrates; Giugliano, Loreny Gimenes; Leite, José Paulo Gagliardi; Cardoso, Divina das Dôres de Paula.
Título: Astrovirus infection in children living in the Central West region of Brazil
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;102(2):209-213, Mar. 2007. tab.
Idioma: en.
Projeto: CNPq.
Resumo: This study presents data regarding the circulation of astrovirus in Goiânia-GO and Brasília-DF. These viruses were detected in fecal samples from hospitalized children up to five years old with and without acute gastroenteritis. A total of 1244 fecal samples were collected in two periods, 1994 to 1996 (Brasília) and 1998 to 2002 (Goiânia and Brasília), and were analyzed for viral RNA using the reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). Positivity rates of 4.3 and 0.5 percent for astrovirus were observed in children with acute gastroenteritis and those without gastroenteritis, respectively. Among children with gastroenteritis no statistically significant difference was seen with regards to viral positivity rates in relation to gender and age. However, a higher incidence rate was observed for children from Brasília aged 36 months or more. Overall, astroviruses occurred predominantly from September to March in the two cities, suggesting a seasonal pattern for these viruses which coincides with the highest relative air humidity period. The results of this study highlight the importance of astrovirus as an etiologic agent of acute gastroenteritis in children of the Central West region of Brazil.
Descritores: Infecções por Astroviridae/epidemiologia
Gastroenterite/virologia
Mamastrovirus/isolamento & purificação
-Infecções por Astroviridae/diagnóstico
Brasil/epidemiologia
Diarreia/virologia
Fezes/virologia
Gastroenterite/diagnóstico
Gastroenterite/epidemiologia
Incidência
Mamastrovirus/genética
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
Estações do Ano
Limites: Seres Humanos
Masculino
Feminino
Recém-Nascido
Lactente
Pré-Escolar
Criança
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME



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