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Id: lil-723106
Autor: Diba, K.; Mirhendi, H.; Kordbacheh, P.; Rezaie, S..
Título: Development of RFLP-PCR method for the identification of medically important Aspergillus species using single restriction enzyme MwoI
Fonte: Braz. j. microbiol;45(2):503-507, Apr.-June 2014. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: In this study we attempted to modify the PCR-RFLP method using restriction enzyme MwoI for the identification of medically important Aspergillus species. Our subjects included nine standard Aspergillus species and 205 Aspergillus isolates of approved hospital acquired infections and hospital indoor sources. First of all, Aspergillus isolates were identified in the level of species by using morphologic method. A twenty four hours culture was performed for each isolates to harvest Aspergillus mycelia and then genomic DNA was extracted using Phenol-Chloroform method. PCR-RFLP using single restriction enzyme MwoI was performed in ITS regions of rDNA gene. The electrophoresis data were analyzed and compared with those of morphologic identifications. Total of 205 Aspergillus isolates included 153 (75%) environmental and 52 (25%) clinical isolates. A. flavus was the most frequently isolate in our study (55%), followed by A. niger 65(31.7%), A. fumigatus 18(8.7%), A. nidulans and A. parasiticus 2(1% each). MwoI enabled us to discriminate eight medically important Aspergillus species including A. fumigatus, A. niger, A. flavus as the most common isolated species. PCR-RFLP method using the restriction enzyme MwoI is a rapid and reliable test for identification of at least the most medically important Aspergillus species.
Descritores: Aspergilose/microbiologia
Aspergillus/classificação
Aspergillus/genética
Desoxirribonucleases de Sítio Específico do Tipo II
Tipagem Molecular/métodos
Polimorfismo de Fragmento de Restrição
Reação em Cadeia da Polimerase/métodos
-DNA Fúngico/genética
DNA Espaçador Ribossômico/genética
Fatores de Tempo
Tipo de Publ: Estudo de Avaliação
Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Venezuela
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Id: lil-687426
Autor: Rojas-Atencio, Alicia; Yamarte, Leonard; Urdaneta, Karelis; Soto-Álvarez, Marisol; Álvarez Nava, Francisco; Cañizalez, Jenny; Quintero, Maribel; Atencio, Raquel; González, Richard.
Título: Utilidad del bandeo cromosómico con la enzima ALU I para la identificación de zonas metiladas en cáncer de mama / Utility of chromosome banding with ALU I enzyme for identifying methylated areas in breast cancer
Fonte: Invest. clín;53(4):331-341, dic. 2012. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: El cáncer es un conjunto de trastornos que comparten la característica común de un crecimiento celular descontrolado, teniendo la facultad de comenzar en las células, generando dos procesos sucesivos: el aumento de la proliferación celular (tumor o neoplasia) y la capacidad invasiva de estas células, proliferando y colonizando otros tejidos (metástasis). La metilación del DNA es un proceso epigenético que recurrentemente ha sido involucrado como un factor importante en la patogenia de esta enfermedad el cual participa en la regulación de la expresión génica directamente al impedir la unión de factores de trascripción, e indirectamente propiciando la estructura “cerrada” de la cromatina. El objetivo de este trabajo fue determinar regiones hipermetiladas en muestras de extendidos cromosómicos mediante la utilización de la endonucleasa de restricción Alu I y relacionar estas regiones con sitios de localización de genes supresores de tumores relacionados con el cáncer de mama. Se analizaron 60 muestras de sangre periférica de mujeres con diagnóstico de cáncer de mama a las cuales se les realizó cultivo celular; los extendidos cromosómicos fueron teñidos con Giemsa previamente digeridos con la enzima Alu I. Se observaron cromosomas con regiones centroméricas y no centroméricas teñidas en el 37% de los casos, comprobándose que en el 95,46% de los casos existen genes asociados descritos, como metilados en cáncer de mama. Ejemplo de ellos son los localizados en los cromosomas 1q, 2q, 6q, y regiones centroméricas no teñidas usualmente como en los cromosomas 3, 4, 8, 13, 14, 15, y 17. Se sugiere la importancia de esta técnica ya que permite la visualización total del genoma, pudiendo localizar genes metilados relacionados con cáncer de mama y, de esta manera dirigir la terapia de forma específica, logrando una mejor respuesta terapéutica.

Cancer is a group of disorders characterized by uncontrolled cell growth which is produced by two successive events: increased cell proliferation (tumor or neoplasia) and the invasive capacity of these cells (metastasis). DNA methylation is an epigenetic process which has been involved as an important pathogenic factor of cancer. DNA methylation participates in the regulation of gene expression, directly, by preventing the union of transcription factors, and indirectly, by promoting the “closed” structure of the chromatine. The objectives of this study were to identify hypermethyled chromosomal regions through the use of restriction Alu I endonuclease, and to relate cytogenetically these regions with tumor suppressive gene loci. Sixty peripheral blood samples of females with breast cancer were analyzed. Cell cultures were performed and cytogenetic spreads, previously digested with Alu I enzyme, were stained with Giemsa. Chromosomal centromeric and not centromeric regions were stained in 37% of cases. About 96% of stained hypermethyled chromosomal regions (1q, 2q, 6q) were linked with methylated genes associated with breast cancer. In addition, centromeric regions in chromosomes 3, 4, 8, 13, 14, 15 and 17, usually unstained, were found positive to digestion with Alu I enzime and Giemsa staining. We suggest the importance of this technique for the global visualization of the genome which can find methylated genes related to breast cancer, and thus lead to a specific therapy, and therefore a better therapeutic response.
Descritores: Neoplasias da Mama/genética
Bandeamento Cromossômico/métodos
Desoxirribonucleases de Sítio Específico do Tipo II
Metilação de DNA
Limites: Adulto
Idoso
Idoso de 80 Anos ou mais
Feminino
Humanos
Pessoa de Meia-Idade
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: VE1.1 - Biblioteca Humberto Garcia Arocha


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: lil-647746
Autor: Giacomazzi, J.; Aguiar, E.; Palmero, E.I.; Schmidt, A.V.; Skonieski, G.; Filho, D.D.; Bock, H.; Saraiva-Pereira, M.L.; Ewald, I.P.; Schuler-Faccini, L.; Camey, S.A.; Caleffi, M.; Giugliani, R.; Ashton-Prolla, P..
Título: Prevalence of ERα-397 PvuII C/T, ERα-351 XbaI A/G and PGR PROGINS polymorphisms in Brazilian breast cancer-unaffected women
Fonte: Braz. j. med. biol. res = Rev. bras. pesqui. méd. biol;45(10):891-897, Oct. 2012. tab.
Idioma: en.
Resumo: Polymorphisms of hormone receptor genes have been linked to modifications in reproductive factors and to an increased risk of breast cancer (BC). In the present study, we have determined the allelic and genotypic frequencies of the ERα-397 PvuII C/T, ERα-351 XbaI A/G and PGR PROGINS polymorphisms and investigated their relationship with mammographic density, body mass index (BMI) and other risk factors for BC. A consecutive and unselected sample of 750 Brazilian BC-unaffected women enrolled in a mammography screening program was recruited. The distribution of PGR PROGINS genotypic frequencies was 72.5, 25.5 and 2.0% for A1A1, A1A2 and A2A2, respectively, which was equivalent to that encountered in other studies with healthy women. The distribution of ERα genotypes was: ERα-397 PvuII C/T: 32.3% TT, 47.5% TC, and 20.2% CC; ERα-351 XbaI A/G: 46.3% AA, 41.7% AG and 12.0% GG. ERα haplotypes were 53.5% PX, 14.3% Px, 0.3% pX, and 32.0% px. These were significantly different from most previously published reports worldwide (P < 0.05). Overall, the PGR PROGINS genotypes A2A2 and A1A2 were associated with fatty and moderately fatty breast tissue. The same genotypes were also associated with a high BMI in postmenopausal women. In addition, the ERα-351 XbaI GG genotype was associated with menarche ≥12 years (P = 0.02). ERα and PGR polymorphisms have a phenotypic effect and may play an important role in BC risk determination. Finally, if confirmed in BC patients, these associations could have important implications for mammographic screening and strategies and may be helpful to identify women at higher risk for the disease.
Descritores: Neoplasias da Mama/genética
Desoxirribonucleases de Sítio Específico do Tipo II/genética
Receptor alfa de Estrogênio/genética
Predisposição Genética para Doença
Polimorfismo Genético/genética
Receptores de Progesterona/genética
-Índice de Massa Corporal
Brasil
Neoplasias da Mama/diagnóstico
Frequência do Gene
Genótipo
Glândulas Mamárias Humanas/anormalidades
Prevalência
Fatores de Risco
Limites: Adulto
Idoso
Feminino
Humanos
Pessoa de Meia-Idade
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-634528
Autor: Leotta, G. A.; Chinen, I.; Vigo, G. B.; Gugliada, J.; Rivas, M..
Título: Evaluación de dos técnicas de subtipificación molecular para el estudio de Pasteurella multocida / Evaluation of two techniques of molecular subtyping to study Pasteurella multocida
Fonte: Rev. argent. microbiol;38(4):190-196, oct.-dic. 2006. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: Se determinó la tipibilidad, la reproducibilidad y el poder discriminatorio de ERIC-PCR y ApaI-PFGE para establecer la relación genética de cepas de Pasteurella multocida. Se estudiaron 49 cepas de diferente origen, subespecie, biotipo, grupo capsular, serotipo somático y perfil de resistencia antimicrobiana. Por ERIC-PCR se establecieron 31 patrones, los que presentaron entre 10 y 14 bandas en un rango comprendido entre 0,2 y 1,2 kb. Por ApaI-PFGE se detectaron 37 patrones de restricción, los cuales presentaron entre 7 y 15 bandas bien definidas de 34 a 450 kb. La tipibilidad de ERIC-PCR fue del 100% (T=1) y la de ApaI-PFGE del 94% (T=0,94). La reproducibilidad de ambas técnicas fue del 100% (R=1); sin embargo, el poder discriminatorio de ERIC-PCR fue 93% (D=0,93) y el de ApaI-PFGE 98% (D=0,98). Mediante ambas técnicas fue posible agrupar las cepas con relación epidemiológica y diferenciar claramente las cepas no relacionadas. Se demostró el valor de ERIC-PCR y ApaI-PFGE para complementar estudios epidemiológicos, principalmente si las cepas en estudio son analizadas por ambas técnicas.

Typeability, reproducibility, and discriminatory power of ERIC-PCR and ApaI-PFGE to establish the genetic relation of P. multocida strains were determined. Forty-nine strains of different source, biotype, capsular group, somatic serotype, and resistance to antimicrobials were studied. By ERIC-PCR, 31 patterns were defined with 10 to 14 bands in a rank of 0.2 and 1.2 kb. By ApaI-PFGE, 37 restriction patterns were established with 7 to 15 bands of 34 to 450 kb. Typeability was 100% (T=1) for ERIC-PCR, and 94% (T=0.94) for ApaI-PFGE. Reproducibility of both techniques was 100% (R=1). Discriminatory power was 93% (D=0.93) for ERIC-PCR, and 98% (D=0.98) for ApaI-PFGE. By using both techniques, epidemiologically related strains were grouped, and unrelated strains were clearly differentiated. The value of ERIC-PCR and ApaI-PFGE as complements to epidemiologic studies was demonstrated, especially when both techniques were used to analyze the strains.
Descritores: Eletroforese em Gel de Campo Pulsado/métodos
Polimorfismo de Fragmento de Restrição
Pasteurella multocida/classificação
Reação em Cadeia da Polimerase/métodos
-América
Regiões Antárticas
Austrália
Doenças das Aves/microbiologia
Aves/microbiologia
Doenças dos Bovinos/microbiologia
Galinhas/microbiologia
Desoxirribonucleases de Sítio Específico do Tipo II
DNA Bacteriano/genética
Farmacorresistência Bacteriana
Infecções por Pasteurella/microbiologia
Infecções por Pasteurella/veterinária
Pasteurella multocida/genética
Pasteurella multocida/isolamento & purificação
Doenças das Aves Domésticas/microbiologia
Reprodutibilidade dos Testes
Doenças dos Suínos/microbiologia
Suínos/microbiologia
Perus/microbiologia
Limites: Animais
Bovinos
Humanos
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Estudo de Avaliação
Responsável: AR1.2 - Instituto de Investigaciónes Epidemiológicas


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Id: lil-632388
Autor: Patino-García, Brenda; Arroyo, Carlos; Rangel-Villalobos, Hector; Soto-Vega, Elena; Velarde-Félix, Jose Salvador; Gabilondo, Fernando; Sandoval-Ramírez, Lucila; Figuera, Luis Eduardo.
Título: Association between polymorphisms of the androgen and vitamin D receptor genes with prostate cancer risk in a Mexican population / Asociación entre polimorfismo de andrógenos y receptores de vitamina D con riesgo de cáncer prostático en una población mexicana
Fonte: Rev. invest. clín;59(1):25-31, ene.-feb. 2007. tab.
Idioma: en.
Resumo: Introduction. Prostate cancer (PCa) is a worldwide health issue, because of its high incidence and mortality. Its etiology is complex and includes certain risk factors such as age, hormonal status, ethnic origin and family history of PCa. Genetic predisposition is proposed as a major risk factor and there are several controversial reports on the association of PCa and gene polymorphism such as the receptors of the androgen receptor (AR) and the vitamin D (VDR). Objective. To evaluate the CAG triplets repetitions in the first exon of the AR and polymorphisms in the restriction site Taql in the VDR in Mexicans with PCa. Material and methods. A total of 68 Mexicans with histopathological diagnosis of PCa and 48 healthy Mexican with normal prostate specific antigen and rectal exam where included. 10ml of peripheral blood were extracted to isolate DNA and the polymorphisms were evaluated with specific primers for the AR and VDR. Results. The allelic and genetic distributions of the AR and VDR polymorphisms were consistent with the Hardy-Weinberg equilibrium, and there were no statistical differences between the PCa patients and controls (p > 0.05). However, there was a statistical difference between the number of CAG repeats in younger patients with PCa compared to controls (p = 0.045) but when the young patient group was compared versus the elder group there was not stadistically difference (p = 0.085), but the results showed a tendency towards less repetitions of CAG in elder patients. Concerning the VDR, when we analyzed the patients with PCa and a bad pathological prognosis they had a less frequent genotype of TT (p = 0.03). Conclusions. Our results suggest an association between the VDR and AR gene polymorphisms, and the hystopathological score and age at diagnosis in Mexican patients with PCa, respectively. However, it is important to confirm these results in a larger scale study.

Introducción. El cáncer de próstata (PCa) es un problema de salud mundial, tanto por su elevada incidencia como mortalidad. Su etiología es compleja e incluye factores de riesgo reconocidos como la edad, estado hormonal, origen étnico y antecedentes familiares de PCa. El fondo genético es un factor de riesgo y existen reportes controversiales de la asociación de PCa y polimorfismos en los genes como son los receptores de vitamina D (VDR) y el de andrógenos (AR). Objetivo. Evaluar las repeticiones de tripletes de CAG en el primer exon del AR y polimorfismos en el sitio de restricción Taql en el VDR en mexicanos con PCa. Material y métodos. Se incluyeron 68 mexicanos con diagnóstico histopatológico de PCa y 48 mexicanos con niveles normales de antígeno prostático y tacto rectal normal. Se les extrajo 10 mL de sangre periférica para aislar DNA y mediante olígos específicos se evaluaron los polimorfismos mencionados. Resultados. La distribución alélica y genotípica de los polimorfismos en el AR y VDR fueron consistentes con el equilibrio de Hardy-Weinberg, y no mostraron diferencias significativas entre los casos y controles (p > 0.05). Sin embargo, el número de repeticiones de CAG en el AR fueron estadísticamente diferentes en pacientes jóvenes con PCa comparados con los controles (p = 0.045), cuando se comparó el grupo de pacientes de jóvenes contra aquellos mayores de 60 años no se encontró diferencia estadísticamente significativa (p - 0.085); sin embargo, se observó una tendencia de un número menor de repetidos CAG en pacientes mayores con PCa. Por otra parte, al comparar VDR en los pacientes con PCa de mal pronóstico por el patrón histológico tenían menor frecuencia de genotipos TT (p - 0.03). Conclusiones. Nuestros resultados sugieren una asociación entre los polimorfismos de los genes del VDR y AR, y el patrón histológico y la edad al diagnóstico en pacientes mexicanos con PCa, respectivamente. Sin embargo, es necesario confirmar estos resultados en un estudio con mayor número de pacientes.
Descritores: Adenocarcinoma/genética
Éxons/genética
Polimorfismo de Fragmento de Restrição
Neoplasias da Próstata/genética
Receptores Androgênicos/genética
Receptores de Calcitriol/genética
Repetições de Trinucleotídeos
-Fatores Etários
Idade de Início
Adenocarcinoma/epidemiologia
Calcitriol/fisiologia
Desoxirribonucleases de Sítio Específico do Tipo II
Grupos Étnicos/genética
Predisposição Genética para Doença
Genótipo
México/epidemiologia
Neoplasias da Próstata/epidemiologia
Fatores de Risco
Limites: Idoso
Idoso de 80 Anos ou mais
Humanos
Masculino
Pessoa de Meia-Idade
Responsável: MX1.1 - CENIDSP - Centro de Información para Decisiones en Salud Pública


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Id: lil-545771
Autor: Machry, Lívia; Ribeiro, Rachel Leite; Vital-Brazil, Juliana Magalhães; Balassiano, Ilana Teruszkin; Oliveira, Ivi Cristina Menezes de; Avelar, Kátia Eliane Santos; Pereira, Martha Maria.
Título: Caracterização de cepas de referência de Leptospira sp utilizando a técnica de pulsed field gel electrophoresis / Characterization of Leptospira sp reference strains using the pulsed field gel electrophoresis technique
Fonte: Rev. Soc. Bras. Med. Trop;43(2):166-169, Mar.-Apr. 2010. ilus.
Idioma: pt.
Resumo: INTRODUÇÃO: A leptospirose é uma zoonose endêmica, mundialmente distribuída, causada por bactérias do gênero Leptospira. Este gênero compreende espécies patogênicas e saprofíticas, com mais de 200 sorovares distintos, dificultando sua caracterização. A técnica de pulsed field gel electrophoresis tem sido empregada como uma ferramenta para auxiliar nesta caracterização. Os objetivos deste trabalho foram padronizar a técnica de PFGE, determinar os perfis moleculares das cepas de referência utilizadas pelo Laboratório de Referência Nacional para Leptospirose/Centro Colaborador da Organização Mundial de Saúde para Leptospirose e criar um banco de dados com estes perfis. MÉTODOS: Foram analisadas, por PFGE, dezenove cepas utilizando a enzima de restrição NotI. RESULTADOS: Cada cepa apresentou um perfil único que pode ser considerado como uma identidade genômica específica, com exceção dos sorovares Icterohaemorrhagiae e Copenhageni, cujos perfis foram indistinguíveis. CONCLUSÕES: Dessa forma, foi possível a criação de um banco de perfis moleculares que está sendo utilizado no Laboratório para a comparação e identificação de cepas isoladas de quadros clínicos.

INTRODUCTION: Leptospirosis is an endemic zoonosis of worldwide distribution, caused by bacteria of the genus Leptospira. This genus includes pathogenic and saprophytic species, with more than 200 different serovars, thus making it difficult to characterize. The technique of pulsed field gel electrophoresis has been used as a tool to aid in this characterization. The aims of this study were to standardize the PFGE technique, determine the molecular profiles of reference strains used at the National Reference Laboratory for Leptospirosis/World Health Organization Collaborating Center for Leptospirosis and create a database with these profiles. METHODS: Nineteen strains were analyzed by means of PFGE, using the restriction enzyme NotI. RESULTS: Each strain presented a unique profile that could be considered to be a specific genomic identity, with the exception of the serovars Icterohaemorrhagiae and Copenhageni, whose profiles were indistinguishable. CONCLUSIONS: It was possible to create a database of molecular profiles, which are being used in the Laboratory for comparing and identifying strains isolated from clinical cases.
Descritores: Eletroforese em Gel de Campo Pulsado
Leptospira/classificação
Sorotipagem/métodos
-Testes de Aglutinação
DNA Bacteriano/análise
Desoxirribonucleases de Sítio Específico do Tipo II/análise
Leptospira/enzimologia
Leptospira/genética
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-494331
Autor: G, Manoj; Tiwari, Santosh K; Sharma, Vishwas; Habeeb, Mohammed Aejaz; Khan, Aleem A; Cm, Habibullah.
Título: Association of Helicobacter pylori restriction endonuclease-replacing gene, hrgA with overt gastrointestinal diseases / Associação entre o hrgA (Helicobacter pylori restriction endonuclease-replacing gene) com as principais doença gastrointestinais
Fonte: Arq. gastroenterol;45(3):225-229, jul.-set. 2008. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: BACKGROUND and AIM: Helicobacter pylori has been proven to be responsible for causing various gastrointestinal disorders including gastric adenocarcinoma. Several genes of pathogen (the genes of the cag-PAI, vacA, iceA, and babA) either in combination or independently have been reported to significantly increase the risk of ulceration/gastric carcinoma, with the cagA gene having the strongest predictive value. Pursuit to identify new genes which could serve as a marker of overt disease progression, lead to the discovery of hrgA gene. METHODS: Fifty-six indigenous strains of H. pylori from subjects with various gastric disorder were screened to assess the status of hrgA gene along with the cagA gene using simple polymerase chain reaction using specific oligonucleotide primers. Post-amplification, amplicons were subjected for sequencing to identify any strain specific variations in sequences from the H. pylori isolated from different disease manifestations. Histopathological analysis was done to ascertain any significant change in the histological scores of subjects infected with cagA+/hrgA+ and cagA-/hrg+ strains. RESULTS: All the 56 (100 percent) subjects amplified with the oligonucleotide primers specific to hrgA gene, whereas 81.71 percent subjects showed the presence of cagA gene. Sequencing of the amplimers showed 99 percent homology. Histology of the cagA+/hrgA+ and cagA-/hrg+ subjects did not show any significant difference. CONCLUSION: hrgA gene of Helicobacter pylori is not a ideal surrogate marker for identifying individuals with higher risk of developing overt gastro-duodenal diseases such as neoplasia of the stomach.

RACIONAL e OBJETIVOS: O Helicobacter pylori tem sido incriminado como causador de vários distúrbios digestivos, incluindo o adenocarcinoma gástrico. Diversos genes patogênicos (os genes do cag-PAI, vacA, iceA e babA), em combinação ou independentes, têm sido reportados como fatores de aumento de risco para ulceração/carcinoma gástrico, tendo o gene cagA forte valor preditivo. A procura da identificação de novos genes que possam vir a ser marcadores da progressão da doença levaram à descoberta do gene hrgA. MÉTODOS: Cinqüenta e seis amostras de H. pylori provenientes de pacientes com diversas afecções gástricas foram examinadas para caracterizar a presença do hrgA juntamente ao cagA, usando iniciadores específicos da reação de cadeia da polimerase. Após amplificação, os produtos amplificados pela PCR foram seqüenciados para a identificação de variações específicas nas seqüências do H. pylori isolado de diferentes doenças gastroduodenais. A análise histopatológica foi feita para assegurar qualquer mudança significativa nos escores dos indivíduos infectados com cagA+hrgA+ e cagA-/hrgA+. RESULTADOS: Todas as 56 amostras (100 por cento) foram amplificadas com iniciadores específicos para o hrgA, enquanto que 81,71 por cento mostraram a presença do cagA. O seqüenciamento do produto amplificado pela PCR mostrou 99 por cento de homologia. A histologia entre os grupos cagA+/hrgA+ e cagA-/hrgA+ não mostrou nenhuma diferença significante. CONCLUSÃO: O gene hrgA do H. pylori não é o marcador ideal para identificar indivíduos com alto risco de desenvolvimento de doenças gastrointestinais como a neoplasia de estômago.
Descritores: Antígenos de Bactérias/genética
Proteínas de Bactérias/genética
Desoxirribonucleases de Sítio Específico do Tipo II/genética
Gastroenteropatias/microbiologia
Infecções por Helicobacter/microbiologia
Helicobacter pylori/genética
-Biomarcadores/análise
DNA Bacteriano/análise
Dispepsia/microbiologia
Infecções por Helicobacter/genética
Reação em Cadeia da Polimerase
Valor Preditivo dos Testes
Adulto Jovem
Limites: Adulto
Idoso
Feminino
Humanos
Masculino
Pessoa de Meia-Idade
Adulto Jovem
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-456757
Autor: Maffei, E. M. D; Pompolo, S. G.
Título: Evaluation of hot saline solution and restriction endonuclease techniques in cytogenetic studies of Cycloneda sanguinea L. (Coccinellidae)
Fonte: Genet. mol. res. (Online);6(1):122-126, 2007. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: The goal of the present study was to determine if simple methods, especially hot saline solution (HSS) and MspI and HaeIII restriction endonucleases, which do not require special equipments, may be helpful in studies of genetic variability in the lady beetle, Cycloneda sanguinea. The HSS method extracted the heterochromatin region, suggesting that it is composed mostly of DNA rich in A-T base pairs. However, the X and y chromosomes were resistant to HSS banding. These bands facilitated the identification of each chromosome. In this study, we used the restriction endonucleases with different G-C base target sequences: MspI C/GGC and HaeIII GG/CC. The use of restriction enzyme MspI did not show an effect on the autosomal chromosomes. On the other hand, the sex pair showed a pale staining, to help in the recognition of these chromosomes. HaeIII produced characteristic bands which were identified all along the chromosomes, facilitating the identification of each chromosome. Based on these results, we can consider the heterochromatin being heterogeneous. The findings obtained here, using different chromosomal banding techniques, may be useful in the identification of intraspecific chomosome variability, specifically in Coccinellidae (Coleoptera) chromosomes, even without special equipment.
Descritores: Besouros/genética
Bandeamento Cromossômico/métodos
Desoxirribonuclease HpaII/genética
Desoxirribonucleases de Sítio Específico do Tipo II/genética
Cloreto de Sódio
-Besouros/enzimologia
Cariotipagem
Especificidade da Espécie
Limites: Animais
Masculino
Tipo de Publ: Estudo de Avaliação
Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: lil-455989
Autor: Sepetiba, R. J. C; Andrade, J; Hirata, R. D. C; Hirata, M. H; Sepetiba, C. R. G; Nakamura, Y; Matsumoto, L. O; Cavalli, S. A; Bertolami, M. C.
Título: Lipoprotein lipase PvuII polymorphism is associated with variations in serum lipid levels in non-diabetic pregnant women
Fonte: Braz. j. med. biol. res = Rev. bras. pesqui. méd. biol;40(7):919-926, July 2007. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: The aim of the present study was to determine if there is an association between the single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the lipoprotein lipase (LPL) and apolipoprotein E (apo E) genes and the serum lipid profile in pregnancy and puerperium. Non-diabetic women of European descent in the third semester of pregnancy (N = 120) were selected. Those with diseases or other condition that could modify their lipid profile were excluded from the study (N = 32). Serum lipids were measured by routine laboratory procedures and genomic DNA was extracted by a salting out method. LPL (PvuII and HindIII) and apo E (HhaI) SNPs were detected by the polymerase chain reaction and restriction fragment length polymorphism. Categorical and continuous variables were compared by the chi-square test and Student t-test or ANOVA, respectively. Women carrying the LPL P1P1 genotype had higher serum LDL cholesterol (N = 21; 155 ± 45 mg/dL) than women carrying the P1P2/P2P2 genotypes (N = 67; 133 ± 45 mg/dL; P = 0.032). During the puerperium period, serum levels of triglycerides and VLDL cholesterol were significantly reduced in women carrying the P1P1 (73 percent, P = 0.006) and P1P2 (51 percent, P = 0.002) genotypes but not in women carrying the P2P2 genotype (23 percent, P > 0.05). On the other hand, serum concentrations of lipids did not differ between the LPL HindIII and apo E genotypes during pregnancy and after delivery. We conclude that LPL PvuII SNP is associated with variations in serum lipids during pregnancy and the puerperal period in non-diabetic women.
Descritores: Apolipoproteínas E/genética
Desoxirribonucleases de Sítio Específico do Tipo II/genética
Lipídeos/sangue
Lipase Lipoproteica/genética
Período Pós-Parto/sangue
Gravidez/sangue
-Análise de Variância
DNA
Grupo com Ancestrais do Continente Europeu
Frequência do Gene
Genótipo
Lipídeos/genética
Reação em Cadeia da Polimerase
Polimorfismo de Fragmento de Restrição
Polimorfismo de Nucleotídeo Único/genética
Valores de Referência
Limites: Adolescente
Adulto
Feminino
Humanos
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-432180
Autor: Shimmoto, Marily Maria Azevedo; Vicari, Perla; Fernandes, Andréa Cristina; Guimarães, Gustavo Stuani; Figueiredto, Maria Stella.
Título: XmnI polymorphism is associated with fetal hemoglobin levels in hypoplastic syndromes
Fonte: Säo Paulo med. j;124(2):110-111, Mar. -Apr. 2006. tab.
Idioma: en.
Resumo: CONTEXTO E OBJETIVO: O aumento adquirido da hemoglobina fetal (HbF) já foi implicado como fator prognóstico em distúrbios diseritropoiéticos. Nossos objetivos foram de examinar elevações adquiridas na HbF em pacientes com anemia aplástica (AA) e hemoglobinúria paroxística noturna (PNH), e de avaliar se há associação entre a presença de polimorfismos XmnI e de região de controle de locus gênico 5' (LCR-HS2) e os níveis de HbF. TIPO DE ESTUDO E LOCAL: Estudo longitudinal no Serviço de Hematologia e Transfusão de Sangue da Universidade Federal de São Paulo – Escola Paulista de Medicina.MÉTODOS: Estudamos um grupo de 37 pacientes com AA e/ou PNH. Reação de polimerase em cadeia (PCR) e digestão enzimática foram usadas para analisar polimorfismos XmnI; e PCR para clonagem e sequenciamento automático dos polimorfismos HS2. RESULTADOS: O nível médio de HbF foi de 2,32%, mas não houve diferença significativa entre o nível de HbF dos pacientes AA e PNH (p = 0.46). Os níveis de HbF menores que 1,0% mostraram correlação estatisticamente significativa com ausência do polimorfismo XmnI (+) (p = 0.007). CONCLUSÕES: Ausência de polimorfismo XmnI está associado com diminuição de HbF. Mais estudos são necessários para confirmar estas observações e fazer comparações sobre tratamento, prognóstico e sobrevida.
Descritores: Anemia Aplástica/genética
Desoxirribonucleases de Sítio Específico do Tipo II/genética
Hemoglobina Fetal/análise
Hemoglobinúria Paroxística/genética
Polimorfismo Genético/genética
-Anemia Aplástica/sangue
Estudos Transversais
Hemoglobinúria Paroxística/sangue
Região de Controle de Locus Gênico
Reação em Cadeia da Polimerase
Limites: Humanos
Masculino
Feminino
Adolescente
Adulto
Pessoa de Meia-Idade
Idoso de 80 Anos ou mais
Responsável: BR1.1 - BIREME



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