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Id: biblio-940947
Autor: Nei, Masatoshi.
Título: Molecular Evolutionary Genetics.
Fonte: New York; Columbia University Press; 1987. 512 p.
Idioma: en.
Descritores: Desoxirribonucleases/análise
Desoxirribonucleases/classificação
Desoxirribonucleases/genética
Limites: Masculino
Feminino
Seres Humanos
Responsável: BR1719.1 - Biblioteca do CPqRR
BR1719.1; 572.83, M397, 1987. 000308


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Texto completo SciELO Chile
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Id: biblio-840310
Autor: Zhang, Yu; Li, Zhen-Hua; Zheng, Wei; Tang, Zhen-Xing; Zhang, Zhi-Liang; Shi, Lu-E.
Título: Enzyme activity and thermostability of a non-specific nuclease from Yersinia enterocolitica subsp. palearctica by site-directed mutagenesis
Fonte: Electron. j. biotechnol;19(6):32-37, Nov. 2016. ilus.
Idioma: en.
Projeto: National Natural Science Funds of China; . Qianjiang Talent Program of Zhejiang Province.
Resumo: Background: To identify the critical amino acid residues that contribute to the high enzyme activity and good thermostability of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica (Y. NSN), 15 mutants of Y. NSN were obtained by site-directed mutagenesis in this study. And their enzyme activity and thermostability were assayed. Effect of several factors on the enzyme activity and thermostability of Y. NSN, was also investigated. Results: The results showed that the I203F and D264E mutants retained approximately 75% and 70% enzyme activity, respectively, compared to the wild-type enzyme. In addition to the I203F and D264E mutants, the mutant E202A had an obvious influence on the thermostability of Y. NSN. According to the analysis of enzyme activity and thermostability of Y. NSN, we found that Glu202, Ile203 and Asp264 might be the key residues for its high enzyme activity and good thermostability. Conclusions: Among all factors affecting enzyme activity and thermostability of Y. NSN, they failed to explain the experimental results well. One reason might be that the enzyme activity and thermostability of Y. NSN were affected not only by a single factor but also by the entire environment.
Descritores: Desoxirribonucleases/química
Desoxirribonucleases/genética
Yersinia enterocolitica/enzimologia
-Endonucleases/química
Endonucleases/genética
Ensaios Enzimáticos
Estabilidade Enzimática
Temperatura Alta
Mutagênese Sítio-Dirigida
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Id: lil-760611
Autor: Nei, Masatoshi.
Título: Molecular Evolutionary Genetics.
Fonte: New York; Columbia University Press; 1987. 512 p.
Idioma: en.
Descritores: Desoxirribonucleases/análise
Desoxirribonucleases/classificação
Desoxirribonucleases/genética
Limites: Seres Humanos
Masculino
Feminino
Responsável: BR1719.1 - Biblioteca do CPqRR


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: lil-751414
Autor: França, Monique Sedlmaier; Usón Junior, Pedro Luiz Serrano; Antunes, Yuri Philippe Pimentel Vieira; Prado, Bernard Lobato; Donnarumma, Carlos del Cistia; Mutão, Taciana Sousa; Rodrigues, Heloisa Veasey; Giglio, Auro del.
Título: Assessment of adherence to the guidelines for the management of nausea and vomiting induced by chemotherapy / Avaliação da aderência à diretriz de cuidados para náuseas e vômitos induzidos por quimioterapia
Fonte: Einstein (Säo Paulo);13(2):221-225, Apr-Jun/2015. tab.
Idioma: en.
Resumo: ABSTRACT Objective: To assess adherence of the prescribing physicians in a private cancer care center to the American Society of Clinical Oncology guideline for antiemetic prophylaxis, in the first cycle of antineoplastic chemotherapy. Methods: A total of 139 chemotherapy regimens, of 105 patients, were evaluated retrospectively from 2011 to 2013. Results: We observed 78% of non-adherence to the guideline rate. The main disagreements with the directive were the prescription of higher doses of dexamethasone and excessive use of 5-HT3 antagonist for low risk emetogenic chemotherapy regimens. On univariate analysis, hematological malignancies (p=0.005), the use of two or more chemotherapy (p=0.05) and high emetogenic risk regimes (p=0.012) were factors statistically associated with greater adherence to guidelines. Treatment based on paclitaxel was the only significant risk factor for non-adherence (p=0.02). By multivariate analysis, the chemotherapy of high emetogenic risk most correlated with adherence to guideline (p=0.05). Conclusion: We concluded that the adherence to guidelines is greater if the chemotherapy regime has high emetogenic risk. Educational efforts should focus more intensely on the management of chemotherapy regimens with low and moderate emetogenic potential. Perhaps the development of a computer generated reminder may improve the adherence to guidelines. .

RESUMO Objetivo: Avaliar a adesão dos médicos prescritores, de um centro privado especializado em oncologia, à diretriz de antiêmese profilática da American Society of Clinical Oncology, no primeiro ciclo de quimioterapia antineoplásica. Métodos: Foram avaliados retrospectivamente 139 esquemas de quimioterapia, de 105 pacientes, tratados no período de 2011 a 2013. Resultados: Foram observados 78% de taxa de não adesão à diretriz. As principais discordâncias com a diretriz foram prescrição de doses mais elevadas de dexametasona e uso excessivo de antagonista 5-HT3 para regimes de quimioterapia de risco emetogênico baixo. Pela análise univariada, malignidades hematológicas (p=0,005), uso de dois ou mais quimioterápicos (p=0,05) e regimes de alto risco emetogênico (p=0,012) foram fatores estatisticamente associados a maior adesão à diretriz. O tratamento baseado em paclitaxel foi o único fator estatisticamente significativo para a não adesão (p=0,02). Pela análise multivariada, a quimioterapia de alto risco emetogênico apresentou maior correlação com a adesão à diretriz (p=0,05). Conclusão: Houve maior aderência para a quimioterapia de alto risco emetogênico. Esforços educacionais devem se concentrar mais intensamente na gestão de regimes de quimioterapia com potencial emetogênico baixo e moderado. Talvez o desenvolvimento de lembretes gerados por sistemas informatizados possa melhorar a aderência à diretriz. .
Descritores: Dano ao DNA
Reparo de DNA por Recombinação
Ubiquitina-Proteína Ligases/química
-Motivos de Aminoácidos
Sequência de Aminoácidos
Proteína BRCA1/antagonistas & inibidores
Linhagem Celular
Quebra Cromossômica
Sequência Conservada
Reparo do DNA
Proteínas de Ligação a DNA/antagonistas & inibidores
Desoxirribonucleases/metabolismo
Histonas/metabolismo
Estrutura Terciária de Proteína
Ubiquitinação
Ubiquitina-Proteína Ligases/metabolismo
Limites: Animais
Seres Humanos
Camundongos
Tipo de Publ: Research Support, N.I.H., Extramural
Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: lil-719186
Autor: Evaristo, Thaiane Cristine; CruzAlves, Flávia Cilene Maciel da; Moroz, Andrei; Mion, Woner; Acorci-Valério, Michele Janegitz; Felisbino, Sérgio Luis; Rossi-Ferreira, Rosana; Ruiz Júnior, Raul Lopes; Deffune, Elenice.
Título: Light-emitting diode effects on combined decellularization of tracheae. A novel approach to obtain biological scaffolds
Fonte: Acta cir. bras;29(8):485-492, 08/2014. graf.
Idioma: en.
Projeto: Sao Paulo Research Foundation.
Resumo: PURPOSE: To obtain a decellularized tracheal scaffold associating traditional approaches with the novel light-emitting diode (LED) proposal. METHODS: This study was performed with New Zealand adult rabbits weighing 3.0 - 4.0 kg. Different protocols (22) were used combining physical (agitation and LED irradiation), chemical (SDS and Triton X-100 detergents), and enzymatic methods (DNase and RNase). RESULTS: Generally, the cells surrounding soft tissues were successfully removed, but none protocol removed cells from the tracheal cartilage. However, longer protocols were more effective. The cost-benefits relation of the enzymatic processes was not favorable. It was possible to find out that the cartilaginous tissue submitted to the irradiation with LED 630nm and 475 nm showed an increased number of gaps without cells, but several cells were observed to be still present. CONCLUSION: The light-emitting diode is a promising tool for decellularization of soft tissues. .
Descritores: Luz
Tecidos Suporte
Engenharia Tecidual/métodos
Traqueia/ultraestrutura
-Desoxirribonucleases/metabolismo
Detergentes/farmacologia
Matriz Extracelular/ultraestrutura
Ribonucleases/metabolismo
Traqueia/efeitos dos fármacos
Traqueia/enzimologia
Limites: Animais
Coelhos
Tipo de Publ: Estudos de Avaliação
Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-696127
Autor: Baena Del Valle, Javier Alonso; Ramos Moreno, Álvaro José; Gómez Alegría, Claudio Jaime; Gómez Camargo, Doris Esther.
Título: Comparación de métodos de extracción de ADN en tejidos parafinados y utilidad para amplificación por PCR / Comparison of DNA extraction methods from formalin-fixed paraffin sections for RCP amplification
Fonte: Rev. colomb. biotecnol;15(1):172-179, ene.-jun. 2013. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: Los tejidos fijados en formol e incluidos en parafina son una fuente de material para hallazgos moleculares en el ámbito clínico y científico, demostrándose que el ADN extraído de éstos, es adecuado para amplificación a través de la reacción en cadena de la polimerasa (RCP). En este estudio, se ensayaron tres métodos de extracción de ADN en tejidos incluidos en parafina, con el objetivo de comparar la eficiencia de estos para obtener ADN adecuado, además se analizó su utilidad en amplificación por RCP. Se emplearon tres muestras, correspondientes a una biopsia de pulmón, legrado endometrial y ganglio linfático, todas fijadas en formaldehido al 10% e incluidas en parafina. Utilizándose tres métodos diferentes de extracción de ADN (extracción por salting out, método modificado de Sambrook y kit comercial) El ADN obtenido se cuantificó por espectrofotometría, además se realizó electroforesis en gel de agarosa al 1%, para comprobar si el ADN era de buena calidad y se realizó RCP para el exón 3 del gen caveolina 1. Todos los métodos dieron como resultado una buen producto de ADN genómico, observándose mayor cantidad y pureza en los métodos de salting out y kit comercial, asimismo se obtuvo amplificación del producto esperado por estos dos métodos, no hubo buenos resultados con el ADN extraído por el método modificado "Preparation of Genomic DNA from Mouse Tails y Other Small samples, según Sambrook". El ADN obtenido a partir de tejidos FFIP puede ser amplificado por varios métodos, entre estos, la extracción por salting out es útil y con poca toxicidad, permite obtener ADN de buena calidad para amplificación por RCP.

Formalin-fixed and paraffin-embedded tissues are a source of important molecular findings in clinical and scientific, demonstrating that the DNA extracted from these is suitable for amplification by polymerase chain reaction (PCR). In this study, we tested three methods of DNA extraction, in order to compare the efficiency of these DNA for RCP amplification. Three samples were used, corresponding to a lung biopsy, endometrial curettage and lymph node, all fixed in 10% formaldehyde and embedded in paraffin. Three different methods were used for DNA extraction (extraction by salting out, modified Sambrook method and commercial kit) The DNA obtained was analyzed by spectrophotometry, and gel electrophoresis was performed in 1% agarose to check if the DNA was amplifiable. PCR was performed for exon 3 of caveolin-1 gene. All methods resulted in a good product of genomic DNA, obtaining more quality and purity in the salting out and commercial kit methods. Also, we obtained amplification of the product by these two methods, without favorable results with the DNA extracted by the modified "Preparation of Genomic DNA from Mouse Tails and Other Small samples, according to Sambrook et al." The DNA obtained from FFPE can be amplified by several methods, among them, salting out extraction is an easy, effective and low toxicity for obtaining good quality DNA for PCR amplification.
Descritores: Desoxirribonucleases
DNA
Formaldeído
Reação em Cadeia da Polimerase
-Parafina
Responsável: CO326 - Departamento de Biología


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Id: lil-692073
Autor: Carvalho, Suzana Papile Maciel.
Título: Estudo estimativo do sexo em crânios da região de Guarulhos-SP utilizando antropologia física e DNA / Estimative study of the sex in skulls from the region of Guarulhos-SP using physical antropology and DNA.
Fonte: São Paulo; s.n; 2012. 155 p. ilus, tab, graf. (BR).
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Faculdade de Odontologia para obtenção do grau de Doutor.
Símbolo: BR.
Resumo: A investigação do sexo é uma das análises mais importantes na identificação humana. Este trabalho teve como objetivo a determinação do sexo em crânios humanos utilizando três métodos de Antropologica Física, duas quantitativas (Forensic Data Anthropolgy Bank, FDB, 1986 e Oliveira, 1995) e uma qualitativa, (Walker, 2008), e a análise genética pela amelogenina. A amostra foi composta de 66 crânios (34 homens e 32 mulheres) do Centro de Estudo e Pesquisa em Ciências Forenses, Guarulhos, SP. As metodologias foram aplicadas por duas pesquisadoras, que desconheciam o sexo dos crânios. Para o estudo estatístico realizaram-se análise descritiva, média, desvio padrão, análise discriminante linear e logística e regressão logística. A metodologia quantivativa apresentou um acerto de 89,52%. O Método FBD teve uma acurácia de 92,31%, com a elaboração de uma fórmula utilizando as medidas Largura Bizigomática, Altura Nasal, as quais apresentaram o maior dimorfismo entre os sexos, e Altura Básio-bregma e Máximo Comprimento do Crânio. A metodologia de Oliveira et al. (1995) necessitou de ajuste para a população estudada (nova fórmula com acurácia de 76,47% em homens e 78,13% em mulheres). Para o DNA, foi possível determinar o sexo em 86,15% da amostra. Pode-se afirmar que as diferentes metodologias comportaram-se de modo semelhante e com alta acurácia para determinação do sexo. A antropologia física apresenta as vantagens de facilidade de aplicação, reprodutibilidade e baixo custo, porém, necessita de ajustes populacionais. O DNA é mais complexo, necessita de infraestrutura e insumos específicos e pode ter interferência da condição ambiental, fatores que dificultam as análises, entretanto, não precisa ser ajustado á população.

The investigation of the sex is one of the most important analyzes in the human identification. This study aimed to determine the sex in human skulls using three methodologies of Physical Anthropology, two quantitative (Forensic Data Anthropology Bank, FDB, 1986 e Oliveira, 1995) and one qualitative (Walker, 2008) and genetic analysis by amelogenin. The sample was composed by 66 skulls (34 men and 32 women) from the Center for Study and Research in Forensic Science, Guarulhos, SP. The methodologies were applied by two researchers who were unaware of the craniums sexes. For the statistical analysis, there were performed descriptive analysis, average, standard deviation, linear discriminant analysis and logistic and logistic regression. The quantitative methodology presented an accuracy of 89.52%. The FBD method had an accuracy of 92.31%, with the development of a mathematical model using the measures Bizygomatic breadth, Nasal heigh, which showed the biggest dimorphism between the sexes, and Basion-bregma height and Maximum Cranial Length. The Oliveiras et al. (1995) methodology required adjustment for the studied population (new formula with an accuracy of 76.47% in men and 78.13% in women). For the DNA, it was possible to determine the sex in 86.15% of the sample. The different methodologies behaved similarly and with high accuracy in sex determination. Physical anthropology has the advantages of being easy to use, reliability and low cost, but needs population adjustments. The DNA is more complex, requires specific reagents and structure and may have interference from environmental condition, however, does not need to be adjusted to the population.
Descritores: Antropologia Física/métodos
Desoxirribonucleases
Medicina Legal
Biologia Molecular
Limites: Seres Humanos
Masculino
Feminino
Responsável: BR97.1 - Serviço de Documentação Odontológica
BR97.1; T4.764


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Id: lil-556113
Autor: Baraldi, Andréia Moribe; Menezes, Léa Maria Bezerra de; Silva Júnior, José Pascaal da; Oliveira, Rogério Nogueira.
Título: Panorama nacional do uso da técnica de identificação genética nos serviços oficiais de identificação e a participação do cirurgião-dentista / National survey about the use of the technique of genetic identification in the official services of identification and the dentist's participation
Fonte: RPG rev. pos-grad;15(4):261-265, out.-dez. 2008. graf.
Idioma: pt.
Resumo: A análise do DNA pode ser considerada um dos principais progressos técnicos para investigação criminal desde a descoberta das impressões digitais. incorporada à rotina forense pelas polícias de países de primeiro mundo, esta análise começa a ser introduzida no contexto pericial em alguns estados do Brasil. O trabalho objetivou conhecer a realidade brasileira diante desta tecnologia. Foram aplicados questionários nos Institutos de Criminalística e Laboratórios de DNA Forense de 20 estados brasileiros. Por meio dos resultados obtidos no presente estudo, foi possível verificar a grande influência exercida pela técnica de DNA nos processos de identificação. Também foi possível verificar que a diversidade profissional das equipes e a descrição dos procedimentos empregados incorporaram conhecimentos específicos do odontologista, nos exemplos de equipes com a presença do cirurgião-dentista.
Descritores: Desoxirribonucleases
Antropologia Forense
Odontologia Legal
-Padrões de Prática Odontológica
Odontólogos
Conhecimento
Inquéritos e Questionários
Tipo de Publ: Estudos de Avaliação
Responsável: BR501.1 - Biblioteca de Ciências da Saúde / Sede Botânico


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Id: lil-540968
Autor: Ribeiro, Fabricia Pires Pimenta.
Título: Desenvolvimento e implementação de métodos laboratoriais aplicados ao diagnóstico fenotípico e genotípico do Corynebacterium diptheriae / Development and implementation of laboratory methods applied to phenotypic and genotypic diagnosis of Corynebacterium diphtheriae.
Fonte: Rio de Janeiro; s.n; 2008. 77 p. ilus.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Faculdade de Ciências Médicas para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: A emergência de cepas de Corynebacterium diphtheriae atoxinogênicas como agentes de endocardite e outras infecções sistêmicas aliada ao aumento do número de adultos susceptíveis à difteria enfatizam a necessidade de métodos alternativos para o diagnóstico laboratorial desta doença, especialmente para laboratórios de rotina clínica. Neste estudo avaliou-se a atividade de DNase de 91 amostras de C. diphtheriae (37 toxinogênicas e 54 atoxinogênicas) e de 564 cepas clínicas de bacilo Gram positivo não diftérico. A atividade de DNase foi detectada em todas as amostras de C. diphtheriae examinadas, previamente identificadas por métodos bioquímicos e pelo sistema API Coryne System. Diferentemente, os resultados do teste de DNase foram negativos em 93.9 porcento das cepas clínicas de bacilo Gram positivo não diftérico. Também foi documentado o valor de uma PCR espécie-específica que tem como alvo o gene dtxR como um método para diferenciação entre C. diphtheriae e colônias similares ao gênero Corynebacterium. Os resultados da PCR-dtxR foram positivos para todas as amostras de C. diphtheriae estudadas e foram concordantes com os obtidos através de metodologia bioquímica padrão. Diferentemente, os resultados da PCR-dtxR foram negativos para 100 porcento das 111 amostras de bacilos Gram positivos não diftéricos estudadas. A partir destes resultados, uma PCR multiplex utilizando três pares de oligonucleotídeos iniciadores foi desenvolvida para a detecção do C. diphtheriae e diferenciação em amostras toxinogênicas ou atoxinogênicas. Dois pares de oligonucleotídeos iniciadores têm como alvo as regiões do gene tox relativas aos domínios A e B da toxina diftérica e um terceiro par direcionado para o gene dtxR. Todas as amostras de C. diphtheriae foram identificadas pela reação de PCR multiplex em concordância com os testes bioquímicos padrão e os ensaios de citotoxicidade celular...

The emergence of non-toxigenic Corynebaterium diphtheriae strains as the causative agent of endocarditis and other systemic infections and the significant rise in the percentage of adults susceptible to diphtheria emphasize the need for new laboratory diagnostic procedures. In this study, we examine techniques as alternative procedures for differentiating C. diphtheriae from Corynebacterium-like colonies for the presumptive identification of this pathogen, especially in the diagnosis laboratory. This study evaluated the DNase activity of 91 C. diphtheriae (37 toxigenic and 54 non-toxigenic) and 564 non-diphtherial Gram-positive rod clinical strains. The DNase activity was detected in all C. diphtheriae strains examined, previously identified by both conventional biochemical methods and API Coryne System. Conversely, DNase test results were negative in 93.9 percent of the 564 non-diphtherial Gram-positive rod clinical strains. We also documented the value of a species-specific PCR assay that targets the dtxR gene as a procedure for differentiating C. diphtheriae from Corynebacterium-like colonies. The results of the PCR-dtxR were all positive for 91 C. diphtheriae strains and completely correlated with the standard biochemical methods and commercial identification system for all strains tested. In other hand, the PCR-dtxR results were negative in 100 percent of the 111 non-diphtherial Gram-positive rod strains. Considering these results, a multiplex PCR using three primers pairs was developed for detection of C. diphtheriae infection and differentiation between toxigenic and non-toxigenic strains. Two primer pairs targeted to domains A and B of tox gene and a third primer pair targeted to a region of dtxR gene. All C. diphtheriae strains were diagnosed by the multiplex PCR in agreement with standard biochemical tests and citotoxicity assay in Vero cells. Thus, these tecniques emerged as viable, cost-effective screening methods for C. diphtheriae laboratory...
Descritores: Técnicas de Tipagem Bacteriana
Técnicas de Laboratório Clínico
Corynebacterium diphtheriae/isolamento & purificação
Desoxirribonucleases
Difteria/diagnóstico
Reação em Cadeia da Polimerase/métodos
Técnicas de Laboratório Clínico/métodos
Toxina Diftérica/genética
-Endocardite/diagnóstico
Limites: Masculino
Feminino
Responsável: BR1365.1 - Biblioteca Biomédica A - CB/A
BR1365.1


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Texto completo SciELO Brasil
Texto completo
Id: lil-328937
Autor: Oliveira, P. F; Oliveira, D. A. A; Teixeira, C. S; Velloso, A. P. S; Coelho, E. G. A; Rodrigues, S. G; Alves, C.
Título: Teste de DNA para verificaçäo de parentesco em cäes: avaliaçäo do método näo automatizado com o auxílio do primer CMR S / DNA test for parentage verification in dogs: evaluation of the non-automatized method with assistance of the primer CMR S
Fonte: Arq. bras. med. vet. zootec;54(5):551-554, out. 2002. ilus.
Idioma: pt.
Resumo: To evaluate the precision of the DNA tests using the non-automatized technique for individual identification and parentage tests, 105 Rottweiler dogs were studied using the primer CMR S. The sample was composed of 39 animals belonging to 11 complete families and their progenies, and 66 non related individuals until the second generation, derived from kennels located in the states of Minas Gerais and Säo Paulo. The CMR S primer was used for the Polimerase Chain Reaction (PCR). The results showed the inefficiency of the technique, even when analyzed through the automated gel analysis system. Also showed the impossibility of its commercial use due to the fact of does not permit the storage of data for subsequent use
Descritores: Desoxirribonucleases
Cães
Responsável: BR68.1 - Biblioteca Virginie Buff D'Ápice



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