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Id: lil-691487
Autor: Silveira, Aline Rossi da.
Título: Estudo computacional da interação de compostos naftoquinônicos e a enzima DNA topoisomerase IB humana por modelagem comparativa, docking e dinâmica molecular / A computational study of the interaction of compounds naftoquinônicos and the enzyme DNA topoisomerase IB human by comparative modeling, docking and molecular dynamics.
Fonte: Rio de Janeiro; s.n; 2012. xxi,140 p. graf, ilus, tab.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Instituto Oswaldo Cruz para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: As DNA topoisomerases constituem um família de enzimas que desempenham um importante papel nos processos de replicação e atuam na regulação da topologia do DNA, inserindo uma quebra temporária em uma ou em ambas as fitas do DNA. A topoisomerases IB (TopoIB) produz quebras numa cadeia do DNA e permite o giro da cadeia quebrada sobre a cadeia intacta. A TopoIB conserva a energia do rompimento da ligação fosfodiéster, estocando-a na forma de ligação covalente que ocorre entre ela e os grupamentos fosfatos, no ponto de clivagem. Depois ela utiliza essa energia para restaurar a ligação fosfodiéster e selar a quebra. Algumas topoisomerases I podem relaxar super enovelamentos positivos e negativos no DNA. Estas enzimas são potenciais alvos para drogas citotóxicas. Alguns compostos já foram descritos como capazes de interferir na atividade de TopoI. Estes inibidores, chamados poisons, como a camptotecina e seus derivados, são efetivas drogas anticâncer. Outros, como os derivados de naftoquinonas são conhecidos como inibidores catalíticos, já foram descritos como atuantes sobre TopoI por mecanismos diferentes. Dentre estes compostos, o lapachol, uma naftoquinona natural, e alguns de seus derivados sintéticos como a (alfa)- e a (beta)-lapachona, já foram associados à inibição de topoisomerases. Desta forma, o objetivo principal deste trabalho foi o de estudar computacionalmente a interação entre alguns compostos derivados de naftoquinonas e a enzima DNA TopoIB humana, utilizando as técnicas de docking vii molecular e simulações de dinâmica molecular. Os compostos aqui estudados foram analisados quanto ao sítio mais provável de interação com a enzima, por docking molecular. Utilizando a mesma metodologia, foi possível descartar a atuação dos 75 compostos avaliados como poisons. Em geral, os compostos aqui estudados indicam que derivados de naftoquinonas são interessantes para o desenvolvimento de drogas anticancerígenas e antibióticas.
Descritores: Biologia Computacional
DNA Topoisomerases
Modelos Moleculares
Naftoquinonas
Neoplasias
Responsável: BR15.1 - Biblioteca de Ciências Biomédicas
BR15.1


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: lil-688597
Autor: Ferrari, Rafaela; Galiana, Antonio; Cremades, Rosa; Rodríguez, Juan Carlos; Magnani, Marciane; Tognim, M.C.B.; Oliveira, Tereza C.R.M.; Royo, Gloria.
Título: Plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR) and mutations in the topoisomerase genes of Salmonella enterica strains from Brazil
Fonte: Braz. j. microbiol;44(2):657-662, 2013. tab.
Idioma: en.
Resumo: The objective of this study was to identify mutations in the Quinolone Resistance Determining sources Regions (QRDR) of the gyrA, gyrB, parC, and parE genes and to determine if any of the qnr variants or the aac(6')-Ib-cr variant were present in strains of Salmonella spp. isolated in Brazil. A total of 126 Salmonella spp. strains from epidemic (n = 114) and poultry (n = 12) origin were evaluated. One hundred and twelve strains (88.8%) were resistant to nalidixic acid (NAL) and 29 (23.01%) showed a reduced susceptibility to ciprofloxacin (Cip). The mutations identified were substitutions limited to the QRDR of the gyrA gene in the codons for Serine 83, Aspartate 87 and Alanine 131. The sensitivity to NAL seems to be a good phenotypic indication of distinguishing mutated and nonmutated strains in the QRDR, however the double mutation in gyrA did not cause resistance to ciprofloxacin. The qnrA1 and qnrB19 genes were detected, respectively, in one epidemic strain of S. Enteritidis and one strain of S. Corvallis of poultry origin. Despite previous detection of qnr genes in Brazil, this is the first report of qnr gene detection in Salmonella, and also the first detection of qnrB19 gene in this country. The results alert for the continuous monitoring of quinolone resistance determinants in order to minimize the emergence and selection of Salmonella spp. strains showing reduced susceptibility or resistance to quinolones.
Descritores: Antibacterianos/farmacologia
DNA Topoisomerases/genética
Farmacorresistência Bacteriana
Mutação
Quinolonas/farmacologia
Salmonella enterica/efeitos dos fármacos
Salmonella enterica/genética
-Brasil
Testes de Sensibilidade Microbiana
Aves Domésticas
Salmonelose Animal/microbiologia
Infecções por Salmonella/microbiologia
Limites: Animais
Humanos
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: lil-665813
Autor: Minarini, Luciene A R; Darini, Ana Lucia C.
Título: Mutations in the quinolone resistance-determining regions of gyrA and parC in Enterobacteriaceae isolates from Brazil
Fonte: Braz. j. microbiol;43(4):1309-1314, Oct.-Dec. 2012. tab.
Idioma: en.
Projeto: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; . Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.
Resumo: Mutations in the quinolone resistance-determining regions (QRDR) in chromosomal gyrA and parC genes and fluoroquinolone susceptibility profiles were investigated in quinolone-resistant Enterobacteriaceae isolated from community and hospitalized patientsin the Brazilian Southeast region. A total of 112 nalidixic acid-resistant enterobacterial isolates collected from 2000 to 2005 were investigated for mutations in the topoisomerases genes gyrA and parC by amplifying and sequencing the QRDR regions. Susceptibility to fluoroquinolones was tested by the agar dilution method. Amongst the 112 enterobacterial isolates, 81 (72.3%) were resistant to ciprofloxacin and 5 (4.5%) showed reduced susceptibility. Twenty-six (23.2%) were susceptible to ciprofloxacin. Several alterations were detected in gyrA and parC genes. Escherichia coli isolates (47.7%) showed double mutations in the gyrA gene and a single one in the parC gene. Two unusual aminoacid substitutions are reported, an Asp87-Asn in a Citrobacter freundii isolate with reduced susceptibility to fluoroquinolones and a Glu84-Ala in one E. coli isolate.Only a parC gene mutation was found in fluoroquinolone-susceptible Enterobacter aerogenes. None of the isolates susceptible to ciprofloxacin presented mutations in topoisomerase genes. This comprehensive analysis of QRDRs in gyrA and parC genes, covering commonly isolated Enterobacteriaceae in Brazil is the largest reported up to now.
Descritores: /análise
ABBREVIATIONS AS TOPIC-QUINOLONAS/análise
/isolamento & purificação
ABBREVIATIONS AS TOPIC-QUINOLONAS/isolamento & purificação
Ácido Nalidíxico/isolamento & purificação
Sequência de Bases
DNA Girase/isolamento & purificação
DNA Topoisomerases/análise
DNA Topoisomerases/isolamento & purificação
Predisposição Genética para Doença
Mutação
-Métodos
Pacientes
Técnicas
Limites: Humanos
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Responsável: BR32.1 - Serviço de Biblioteca e Informação Biomédica



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