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Texto completo SciELO Cuba
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Id: biblio-894670
Autor: Cutiño Jiménez, Ania Margarita; Barrera Roca, Lianne; de la Puente López, Vivian; Peña Cutiño, Heidy Annia.
Título: Marcadores moleculares de tipo inserción en bacterias de las familias Moraxellaceae y Helicobacteraceae (phylum Proteobacteria) / Molecular markers of insertion type in bacterias of the Moraxellaceae and Helicobacteraceae (phylum Proteobacteria) families
Fonte: Medisan;22(1), ene. 2018. tab, ilus.
Idioma: es.
Resumo: Se efectuó un estudio con el empleo de la metodología de Gupta, en el Departamento de Biología y Geografía de la Universidad de Oriente en Santiago de Cuba, para determinar marcadores moleculares de tipo inserción en secuencias de las proteínas ADN polimerasa I y ADN polimerasa III (subunidad alfa), obtenidas de bases de datos internacionales y posteriormente alineadas con el programa ClustalX2. Las familias Moraxellaceae y Helicobacteraceae han sido ampliamente estudiadas, porque comprenden agentes patógenos causantes de numerosas enfermedades en humanos, pero pocas investigaciones han estado dirigidas a la identificación de las características moleculares que puedan distinguir a sus miembros de otros grupos de bacterias; de manera que los presentes resultados constituyen un aporte al conocimiento de la genética y la bioquímica de estas familias y proveen herramientas moleculares para la clasificación taxonómica y el diagnóstico de especies patógenas

A study with the use of Gupta methodology was carried out in the Biology and Geography Department of Oriente University in Santiago de Cuba, to determine molecular markers of insertion type in sequences of the DNA polimerase I proteins and DNA polimerase III (alpha subunity), obtained from international databases and later on aligned with the ClustalX2 program. The Moraxellaceae and Helicobacteraceae families have been broadly studied, because they comprise pathogen agents that cause numerous diseases in humans, but few investigations have been directed to the identification of the molecular characteristics that can distinguish their members from other groups of bacterias; so these results constitute a contribution to the knowledge of genetics and biochemistry of these families and provide molecular tools for the taxonomic classification and the diagnosis of pathogen species
Descritores: Helicobacter/citologia
Moraxellaceae/citologia
DNA Polimerase I
DNA Polimerase III
-Biomarcadores
Marcadores Genéticos
Estudos Epidemiológicos
Limites: Seres Humanos
Tipo de Publ: Artigo Clássico
Responsável: CU418.1 - Centro Provincial de Información de Ciencias Médicas de Santiago de Cuba


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Id: lil-745088
Autor: Anon.
Título: Optimización de la Reacción en Cadena de la Polimerasa para la Detección del gen B1 de T. gondii / Optimization of Polymerase Chain Reaction for the detection of the B1 gene of T. gondii
Fonte: NOVA publ. cient;12(22):137-142, jul.-dic. 2014. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: Optimizar las condiciones de amplificación del gen B1 (35 copias en el genoma) para la detección de ADN de T.gondii en casos probables de toxoplasmosis cerebral. Materiales y métodos: Se realizó extracción de ADN a partir de exudado peritoneal de ratones inoculados con la cepa RH de T. gondii obteniendo 17 ml con una concentración inicial de 1x107 parásitos/ml. Se optimizaron las condiciones de PCR del gen B1. Resultados: Se obtuvo amplificación de un fragmento de 132 pb a partir de ADN obtenido de diluciones seriadas desde 1x106 a 1x10-1 parásitos por ml, estableciéndose un límite de detección de 1 taquizoíto de T. gondii...

This study aimed at optimizing the amplification conditions of the B1 gene (35 copies in the ge­nome) of T. gondii in cases of possible brain toxoplasmosis. Materials and methods: DNA was extracted from the peritoneal exudate of mice inoculated with the RH strain of T. gondii. Total exudate volume was 17 mL with a concentration of 1x107 parasites/mL. PCR conditions for the B1 gene were further optimized.Results: Serial dilutions from 1x106 to 1x10-1 parasites/mL were needed for amplifying a fragment of 132 bp . This set the detection limit for 1 T. gondii tachyzoite...
Descritores: Toxoplasmose Cerebral
-Infecções Bacterianas
Toxoplasma
DNA Polimerase I
Limites: Seres Humanos
Responsável: CO332 - Facultad de Medicina


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Id: lil-678812
Autor: Solórzano, Eduvigis; Díaz, Nancy; Smerling, Andrea; Montiel, Rafael; Malgosa, Assumpció.
Título: Rastreo genético del streptococcus mutans / Streptococcus mutans genetic tracking
Fonte: Acta odontol. venez;49(2), 2011. ilus.
Idioma: es.
Resumo: Las técnicas moleculares para recuperar DNA antiguo brindan la posibilidad de comparar la evolución molecular a través del tiempo, ya que constituye una herramienta para aclarar el diagnóstico de posibles enfermedades infecciosas del pasado. Aislar y secuenciar un fragmento de DNA de Streptococcus mutans fosilizado, considerado el principal agente infeccioso implicado en la formación de la placa bacteriana y el desarrollo de la caries dental, utilizando la reacción en cadena de polimerasa (PCR). La muestra estuvo conformada por caries y tártaro dental proveniente de dientes de diferentes colecciones de México, Barcelona e Islas Baleares. La metodología fue adaptada a las condiciones de conservación de este tipo de muestra para obtener DNA y los primers fueron específicos para la amplificación de un fragmento de 124 pb del gen de la Dextranasa del S. mutans. De las 24 muestras analizadas, 9 resultaron positivas para la amplificación y en 6 se lograron las secuencias correspondientes. Para la alineación de las secuencias obtenidas, se empleó la base de datos BLAST encontrándose una homología del 95% con el genoma del S. mutans UA159. Este estudio demuestra la primera evidencia de obtención de la secuencia de un fragmento de DNA de Streptococcus mutans recuperados a partir de caries y cálculo dental de restos humanos antiguos, presentando un 95% de homología con el DNA de S. mutans de la subespecie UA159 moderno

The molecular techniques for ancient DNA recovering, offers the possibility to compare the molecular evolution through time as these are tools which make clear possible infectious diseases from the ancient times Objective: To isolate and sequence fossilized Streptococcus mutans DNA fragments, considered the infectious agent involved with dental caries and plaque formation and development, by using the polymerase chain reaction (PCR). Dental caries and tartar samples of teeth collections from Mexico, Barcelona and Balearic Islands. The methodology was adapted to the conservation conditions of this type of DNA samples, and primers were specific to amplify a fragment of 124 bp of S. mutans dextranase gene. Results: 24 samples were analyzed, 9 were positive for amplification and 6 were obtained with its corresponding sequences. To alignment the sequences obtained, we used the BLAST database, giving us the 95% homology with the S. mutans UA159 genome. This study shows us the first evidence of Streptococcus mutans DNA sequence fragment recovered from dental caries and tartar from ancient human remains, presenting a 95% homology with S. mutans UA159 modern subspecies DNA
Descritores: Rastreamento de Células
Reação em Cadeia
DNA
DNA Polimerase I
Streptococcus mutans/isolamento & purificação
-Odontologia
Limites: Seres Humanos
Masculino
Feminino
Tipo de Publ: Estudos de Avaliação
Responsável: VE1.1 - Biblioteca Humberto Garcia Arocha


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Id: lil-507167
Autor: Conde, Marcos; Revollo, Susana; Espada, Angélica.
Título: Implementación de la Técnica Reacción en Cadena de la Polimerasa en el Diagnóstico de Salmonella y Shigella directamente de muestras fecales / Implementation of the Technical Polymerase Chain Reaction in the Diagnosis of `Salmonella` and Shigella directly of fecal samples
Fonte: Biofarbo;14(14):67-75, dic. 2006. ilus.
Idioma: es.
Resumo: Las diarreas causadas por bacterias son las que potencilamente suponene un mayor riesgo vital para el paciente, siendo los patógenos más importantes Shiggella y Salmonella que se ubican entre las causas principales de muerte en niños menores de cinco años, e spor esto que resulta de vital importancia realizar un diagnóstico rápido y preciso, junto a un tratamiento efectivo.
Descritores: DNA Polimerase I/análise
Intoxicação Alimentar por Salmonella/diagnóstico
Salmonella/patogenicidade
Responsável: BO2.1 - Centro de Información y Documentación


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Id: lil-482046
Autor: Lopes, D. O; Regis-da-Silva, C. G; Machado-Silva, A; Macedo, A. M; Franco, G. R; Hoffmann, J. S; Cazaux, C; Pena, S. D; Teixeira, S. M; Machado, C. R.
Título: Analysis of DNA polymerase activity in vitro using non-radioactive primer extension assay in an automated DNA sequencer
Fonte: Genet. mol. res. (Online);6(2):250-255, 2007. ilus, graf.
Idioma: en.
Resumo: Although different DNA polymerases have distinct functions and substrate affinities, their general mechanism of action is similar. Thus, they can all be studied using the same technical principle, the primer extension assay employing radioactive tags. Even though fluorescence has been used routinely for many years for DNA sequencing, it has not been used in the in vitro primer extension assay. The use of fluorescence labels has obvious advantages over radioactivity, including safety, speed and ease of manipulation. In the present study, we demonstrated the potential of non-radioactive in vitro primer extension for DNA polymerase studies. By using an M13 tag in the substrate, we can use the same fluorescent M13 primer to study different substrate sequences. This technique allows quantification of the DNA polymerase activity of the Klenow fragment using different templates and under different conditions with similar sensitivity to the radioactive assay.
Descritores: DNA Polimerase I/metabolismo
Escherichia coli/enzimologia
Fluoresceína/metabolismo
Primers do DNA/metabolismo
Análise de Sequência de DNA
-Automação
Concentração de Íons de Hidrogênio
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Bernardino, A. M. R
Romeiro, G. A
Moussatche, N
Id: lil-209359
Autor: Pereira, H. S; Bernardino, A. M. R; Nogueira, C; Gomes, C. R; Romeiro, G. A; Chaves, A; Ferreira, V. F; Caetano, M. V; Frugulhetti, I. C. P. P; Moussatché, N; Souza, M. C. B.
Título: Inibiçäo seletiva das atividades das enzimas transcriptase reversa do vírus HIV-1 e DNA polimerases humanas por derivados dipirazolo-piridina / Selective inhibition of reverse transcriptase enzyme activity of HIV-1 virus and human polymerases DNA by dipirazolo-pyridines derivatives
Fonte: DST j. bras. doenças sex. transm;8(4):14-8, dez. 1996. ilus.
Idioma: pt.
Resumo: Novos ribonucleosídeos derivados dos sistemas dipirazolo-piridina foram preparados e avaliados quanto à atividade polimerásica das enzimas transcriptase reversa (RT) do vírus HIV-1 e das DNA polimerases humanas alfa e epsilon. Os derivados 1b e 1d inibiram a atividade da transcriptase reversa em concentraçöes de micromolares. Entretanto, as mesmas substâncias näo foram capazes de inibir a atividade polimerase das enzimas DNA-polimerase humana alfa e epsilon.
Descritores: DNA Polimerase II/antagonistas & inibidores
DNA Polimerase I/antagonistas & inibidores
HIV-1/enzimologia
Pirazóis/farmacologia
Piridinas/farmacologia
Inibidores da Transcriptase Reversa
Ribonucleosídeos/farmacologia
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-96018
Autor: Manresa, M. G; Riverón, A. M; Higginson, D; Remigio, J. L.
Título: Amplificación del gen de la ADN polimerasa I por multiplicación del Lambda polA mediante ciclo lítico en la E. coli WK6: obtención y purificación de la enzima / Amplification of the gene for DNA polimerasa I by the multiplication of Lambda polA in E. coli WK6: obtention and purification of the enzyme
Fonte: Biotecnol. apl;7(1):80-6, 1990. tab.
Idioma: es.
Resumo: El fago Lambda polA (Qam 73, Sam 7) fue aislado y purificado de un lisógeno de la E. coli 594, y posteriormente se multiplicó en una cepa SupE, SupF. Se obtuvo una cantidad considerable de DNA polimerasa I multiplicándolo por vía ciclo lítico, tras la infección a alto MOI (Multiplicity of Infection) de una cepa libre de supresores amber (E. coli WK6). En este trabajo se muestran los resultados de la estandarización de las condiciones para obtener un nivel adecuado de expresión del gen polA, el esquema de purificación utilizado y se discuten las modificaciones realizadas para la obtención de la DNA polimerasa I a gran escala. La DNA pol I purificada incorporó P32-dATP por Nick translation en fragmentos de DNA entre 800-50 000 bp con un alto marcaje específico
Descritores: Bacteriófago lambda
DNA Polimerase I/isolamento & purificação
Escherichia coli
Responsável: CU1 - INFOMED - Centro Nacional de Información de Ciencias Médicas



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