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Id: biblio-1223212
Autor: Wu, Haiying; Li, Sijie; Ji, Minghua; Chen, Qiao; Shi, Jiping; Blamey, Jenny M; Sun, Junsong.
Título: Improvement of polyhydroxybutyrate production by deletion of csrA in Escherichia coli
Fonte: Electron. j. biotechnol;46:8-13, jul. 2020. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: National Natural Science Foundation of China.
Resumo: BACKGROUND: Poly-3-hydroxybutyrate (PHB) can be efficiently produced in recombinant Escherichia coli by the overexpression of an operon (NphaCAB) encoding PHB synthetase. Strain improvement is considered to be one of critical factors to lower the production cost of PHB in recombinant system. In this study, one of key regulators that affect the cell growth and PHB content was confirmed and analyzed. RESULT: S17-3, a mutant E. coli strain derived from S17-1, was found to be able to achieve high cell density when expressing NphaCAB with the plasmid pBhya-CAB. Whole genome sequencing of S17-3 revealed genetic alternations on the upstream regions of csrA, encoding a global regulator cross-talking between stress response, catabolite repression and other metabolic activities. Deletion of csrA or expression of mutant csrA resulted in improved cell density and PHB content. CONCLUSION: The impact of gene deletion of csrA was determined, dysfunction of the regulators improved the cell density of recombinant E. coli and PHB production, however, the detail mechanism needs to be further clarified.
Descritores: Escherichia coli/metabolismo
Hidroxibutiratos/metabolismo
-Proteínas Repressoras/genética
Biopolímeros/genética
Proteínas Recombinantes
Proteínas de Ligação a RNA/genética
Deleção de Genes
Proteínas de Escherichia coli/genética
Escherichia coli/genética
Engenharia Metabólica
Ligases/metabolismo
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Texto completo SciELO Chile
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Id: biblio-950791
Autor: Shen, Wenlong; Wang, Dong; Ye, Bingyu; Shi, Minglei; Zhang, Yan; Zhao, Zhihu.
Título: A possible role of Drosophila CTCF in mitotic bookmarking and maintaining chromatin domains during the cell cycle
Fonte: Biol. Res;48:1-8, 2015. graf.
Idioma: en.
Projeto: National Basic Research Program of China; . National Natural Science Foundation of China; . National Key Technology R& D Program of China.
Resumo: BACKGROUND: The CCCTC-binding factor (CTCF) is a highly conserved insulator protein that plays various roles in many cellular processes. CTCF is one of the main architecture proteins in higher eukaryotes, and in combination with other architecture proteins and regulators, also shapes the three-dimensional organization of a genome. Experiments show CTCF partially remains associated with chromatin during mitosis. However, the role of CTCF in the maintenance and propagation of genome architectures throughout the cell cycle remains elusive. RESULTS: We performed a comprehensive bioinformatics analysis on public datasets of Drosophila CTCF (dCTCF). We characterized dCTCF-binding sites according to their occupancy status during the cell cycle, and identified three classes: interphase-mitosis-common (IM), interphase-only (IO) and mitosis-only (MO) sites. Integrated function analysis showed dCTCF-binding sites of different classes might be involved in different biological processes, and IM sites were more conserved and more intensely bound. dCTCF-binding sites of the same class preferentially localized closer to each other, and were highly enriched at chromatin syntenic and topologically associating domains boundaries. CONCLUSIONS: Our results revealed different functions of dCTCF during the cell cycle and suggested that dCTCF might contribute to the establishment of the three-dimensional architecture of the Drosophila genome by maintaining local chromatin compartments throughout the whole cell cycle.
Descritores: Proteínas Repressoras/fisiologia
Cromatina/fisiologia
Proteínas de Drosophila/fisiologia
Drosophila melanogaster/química
Genoma de Inseto/genética
Mitose/fisiologia
-Sítios de Ligação
Sequência de Bases
Ciclo Celular/fisiologia
Sequência Conservada
Biologia Computacional
Sintenia
Montagem e Desmontagem da Cromatina/fisiologia
Anotação de Sequência Molecular
Conjuntos de Dados como Assunto
Fator de Ligação a CCCTC
Interfase/fisiologia
Limites: Animais
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Ward, Laura S
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Id: biblio-887654
Autor: Batista, Fernando A; Marcello, Marjory A; Martins, Mariana B; Peres, Karina C; Cardoso, Ulieme O; Silva, Aline C D N; Bufalo, Natassia E; Soares, Fernando A; Silva, Márcio J da; Assumpção, Lígia V; Ward, Laura S.
Título: Diagnostic utility of DREAM gene mRNA levels in thyroid tumours
Fonte: Arch. endocrinol. metab. (Online);62(2):205-211, Mar.-Apr. 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: Foundation for Research of the State of São Paulo (Fapesp).
Resumo: ABSTRACT Objective The transcriptional repressor DREAM is involved in thyroid-specific gene expression, thyroid enlargement and nodular development, but its clinical utility is still uncertain. In this study we aimed to investigate whether DREAM mRNA levels differ in different thyroid tumors and how this possible difference would allow the use of DREAM gene expression as molecular marker for diagnostic and/or prognosis purpose. Materials and methods We quantified DREAM gene mRNA levels and investigated its mutational status, relating its expression and genetic changes to diagnostic and prognostic features of 200 thyroid tumors, being 101 malignant [99 papillary thyroid carcinomas (PTC) and 2 anaplastic thyroid carcinomas] and 99 benign thyroid lesions [49 goiter and 50 follicular adenomas (FA)]. Results Levels of mRNA of DREAM gene were higher in benign (0.7909 ± 0.6274 AU) than in malignant (0.3373 ± 0.6274 AU) thyroid lesions (p < 0.0001). DREAM gene expression was able to identify malignancy with 66.7% sensitivity, 85.4% specificity, 84.2% positive predictive value (PPV), 68.7% negative predictive value (NPV), and 75.3% accuracy. DREAM mRNA levels were also useful distinguishing the follicular lesions FA and FVPTC with 70.2% sensitivity, 73.5% specificity, 78.5% PPV, 64.1% NPV, and 71.6% accuracy. However, DREAM gene expression was neither associated with clinical features of tumor aggressiveness, nor with recurrence or survival. Six different genetic changes in non-coding regions of DREAM gene were also found, not related to DREAM gene expression or tumor features. Conclusion We suggest that DREAM gene expression may help diagnose thyroid nodules, identifying malignancy and characterizing follicular-patterned thyroid lesions; however, it is not useful as a prognostic marker.
Descritores: Proteínas Repressoras/genética
RNA Mensageiro/genética
Neoplasias da Glândula Tireoide/diagnóstico
Biomarcadores Tumorais/genética
Proteínas Interatuantes com Canais de Kv/genética
Elementos Reguladores de Transcrição/genética
-Prognóstico
Proteínas Repressoras/metabolismo
RNA Mensageiro/metabolismo
Neoplasias da Glândula Tireoide/genética
Neoplasias da Glândula Tireoide/metabolismo
Biomarcadores Tumorais/metabolismo
Sensibilidade e Especificidade
Proteínas Interatuantes com Canais de Kv/metabolismo
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
Estadiamento de Neoplasias
Limites: Humanos
Masculino
Feminino
Pessoa de Meia-Idade
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-731304
Autor: Santos, Osmara Alves dos; Borges, Ana Luiza Vilela; Chofakian, Christiane Borges do Nascimento; Pirotta, Kátia Cibelle Machado.
Título: Determinants of emergency contraception non-use among women in unplanned or ambivalent pregnancies / Determinantes del no uso de la anticoncepción de emergencia entre mujeres con embarazo no planeado u ambivalente / Determinantes do não uso da anticoncepção de emergência entre mulheres com gravidez não planejada ou ambivalente
Fonte: Rev. Esc. Enferm. USP;48(spe):16-22, 08/2014. tab.
Idioma: en.
Projeto: CNPq.
Resumo: Objective To analyze the determinants of emergency contraception non-use among women in unplanned and ambivalent pregnancies. Method Cross-sectional study with a probabilistic sample of 366 pregnant women from 12 primary health care units in the city of São Paulo, Brazil. A multinomial logistic regression was performed, comparing three groups: women who used emergency contraception to prevent ongoing pregnancies (reference); women who made no use of emergency contraception, but used other contraceptive methods; and women who made no use of any contraceptive methods at all. Results Cohabitation with a partner was the common determinant of emergency contraception non-use. No pregnancy risk awareness, ambivalent pregnancies and no previous use of emergency contraception also contributed to emergency contraception non-use. Conclusion Apart from what is pointed out in the literature, knowledge of emergency contraception and the fertile period were not associated to its use. .

Objetivo Analizar los determinantes del no uso de la anticoncepción de emergencia entre las mujeres con embarazo no planeado o ambivalente. Método Estudio transversal en una muestra probabilística de 366 mujeres embarazadas de 12 Unidades Básicas de Salud de São Paulo. Mediante regresión logística multinomial, se comparó tres grupos de mujeres: aquellas que usaron la anticoncepción de emergencia para prevenir el embarazo en curso (referencia), aquellas que usaron algún método anticonceptivo, pero no la anticoncepción de emergência; y aquellas que no usaron ningún método. Resultados Los hallazgos mostraron que vivir com la pareja fue el determinante común del no uso de la anticoncepción de emergencia. No tener conciencia del riesgo de embarazo, estar en un embarazo ambivalente y nunca tener utilizado la anticoncepción de emergencia también fueron associados con su no uso para prevenir el embarazo en curso. Conclusión Contrariamente a lo que reporta la literatura, el conocimiento de la anticoncepción de emergencia y el período fértil no mostró asociación con el no uso. .

Objetivo Analisar os determinantes do não uso da anticoncepção de emergência entre mulheres com gravidez não planejada ou ambivalente. Método Estudo transversal com amostra probabilística de 366 gestantes de 12 Unidades Básicas de Saúde da cidade de São Paulo. Por meio de regressão logística multinomial, compararam-se três grupos de mulheres: as que usaram anticoncepção de emergência para prevenir a gravidez em curso (referência); as que usaram algum método contraceptivo, mas não anticoncepção de emergência; e as que não usaram nenhum método. Resultados Os achados mostraram que morar com o parceiro foi o determinante comum do não uso da anticoncepção de emergência. Não ter consciência do risco de engravidar, estar em uma gravidez ambivalente e nunca ter usado anticoncepção de emergência também foram associados ao seu não uso para prevenir a gravidez em curso. Conclusão Diferentemente do que relata a literatura, o conhecimento sobre anticoncepção de emergência e sobre o período fértil não mostrou qualquer associação ao não uso. .
Descritores: Proteínas de Ligação a DNA
Escherichia coli/genética
Mapeamento de Interação de Proteínas/métodos
Técnicas do Sistema de Duplo-Híbrido
-Bacteriófago lambda/genética
DNA Bacteriano/genética
RNA Polimerases Dirigidas por DNA/biossíntese
RNA Polimerases Dirigidas por DNA/genética
RNA Polimerases Dirigidas por DNA/fisiologia
Proteínas de Escherichia coli/biossíntese
Proteínas de Escherichia coli/genética
Proteínas de Escherichia coli/fisiologia
Escherichia coli/enzimologia
Genes Reporter/genética
Fosforilação
Plasmídeos/biossíntese
Plasmídeos/genética
Regiões Promotoras Genéticas/genética
RNA Bacteriano/genética
Proteínas Recombinantes de Fusão/biossíntese
Proteínas Recombinantes de Fusão/genética
Proteínas Recombinantes de Fusão/fisiologia
Proteínas Repressoras/biossíntese
Proteínas Repressoras/genética
Proteínas Repressoras/fisiologia
Transcrição Genética/genética
Transcrição Genética/fisiologia
Proteínas Virais/biossíntese
Proteínas Virais/genética
Proteínas Virais/fisiologia
Proteínas Virais Reguladoras e Acessórias
beta-Galactosidase/biossíntese
beta-Lactamases/biossíntese
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: biblio-1117754
Autor: Figueiredo, Amanda Faria de.
Título: Estudo do perfil citogenético e de expressão dos genes do complexo Polycomb na leucemia mielóide aguda da infância / [Study of the cytogenetic profile and expression of the Polycomb complex genes in acute childhood myeloid leukemia].
Fonte: Rio de Janeiro; s.n; 2014. 135 p p.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Instituto Nacional de Câncer José Alencar Gomes da Silva para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: A LMA é uma neoplasia hematológica caracterizada pela proliferação anormal de precursores mielóides na medula óssea decorrente de uma parada no processo de diferenciação destas células. A etiologia da leucemia ainda é desconhecida, mas alguns fatores, incluindo a presença de translocações cromossômicas podem contribuir para o aparecimento desta neoplasia.Três subgrupos de alterações genéticas vêm sendo definidos nos últimos anos como os de maior freqüência em LMA primária da criança. O grupo que envolve rearranjos do gene CBF (core binding factor): t(8;21)(q22;q22) e inv(16)(p13;q22); as leucemias associadas a alterações no gene MLL (anormalidades da região 11q23); e as leucemias associadas ao rearranjo PML-RAR: t(15;17)(q22;q12). Apesar de todo o conhecimento já acumulado sobre as bases moleculares dos processos leucemogênicos da LMA, alterações em reguladores epigenéticos vem ganhando destaque na patologia da leucemia. Neste contexto, os genes pertencentes ao complexo Gênico Polycomb (PcG) estão associados ao silenciamento epigenético durante o desenvolvimento embrionário e durante a carcinogênese de diversos tumores, incluindo a leucemia mielóide aguda (LMA). Portanto, o objetivo deste estudo foi realizar uma análise citogenética e de expressão dos genes do complexo PcG em crianças diagnosticadas com LMA para contribuir para o entendimento da biologia desta neoplasia tão heterogênea. As amostras de medula óssea de 84 pacientes foram tratadas de acordo com os protocolos padrões e, as técnicas de citogenética, envolvendo técnicas moleculares foram realizadas, sendo possível evidenciar uma alta taxa de anormalidades cromossômicas de 89%. Além disso, uma alta taxa da t(15;17)(q22;q12) pode ser observada, assim como, várias alterações não-recorrentes puderam ser identificadas, já que várias técnicas de citogenética molecular de alta resolução foram utilizadas. Dos 84 pacientes, 52 pacientes foram avaliados quanto ao perfil de expressão de alguns dos genes PcG, utilizando a metodologia de PCR em tempo real (RT-qPCR). Com isso, foi possível observar altos níveis relativos de mRNA dos genes PcG nos pacientes quando comparados com os doadores saudáveis. Quando foram comparados os níveis de expressão destes genes de acordo com os subtipos morfológicos, o subtipo LMA-M3 apresentou os níveis mais aumentados, principalmente nos pacientes menores de 8 anos de idade. Com relação aos dados clínicos, apesar da grande variação, a LMA apresentou altos níveis de mRNA dos genes PcG em pacientes com mais de 50.000 leucócitos e a LMA-M3 apresentou níveis aumentados de mRNA destes genes nos pacientes com baixa contagem de plaquetas. Com isso, podemos concluir que apesar da variação nos níveis de mRNA dos genes PcG estudados na LMA, foi possível observar uma correlação destes níveis com os dados clínicos dos pacientes, como os subtipos morfológicos, com a idade, contagem leucocitária e plaquetas na LMA-M3. (AU)

AML is a hematologic malignancy characterized by the abnormal proliferation of myeloid precursors in the bone marrow due to an arrest of differentiation process of these cells. The etiology of leukemia is unknown, but some factors, including the presence of chromosomal translocations may contribute to the emergence of this neoplasia. Three subgroups of genetic alterations have been defined in recent years as the most frequent in primary childhood AML. The group involving core binding factor gene rearrangements: t(8;21)(q22; q22), and inv(16)(p13;q22); leukemias associated with alterations in the MLL gene (11q23 abnormalities in the region ); leukemias associated with PML-RARa rearrangement: t(15;17)(q22;q12). Despite all the knowledge already accumulated regarding the molecular basis of AML leukemogenic processes, changes in epigenetic regulators have been gaining attention in the pathology of leukemia. In this context, the Polycomb Complex genes (PcG) are associated with epigenetic silencing during embryonic development and during carcinogenesis of several tumors, including acute myeloid leukemia (AML). Therefore, the aim of this study was to evaluate a cytogenetic and PcG genes expression profiles in children diagnosed with AML to contribute to the understanding of the biology of this heterogeneous tumor. The bone marrow samples of 84 patients were treated according to standard protocols, and the cytogenetic analysis involving molecular techniques were performed, and were able to demonstrate a high rate of chromosomal abnormalities in 89% of cases. In addition, a high rate of t(15;17)(q22;q12) may be observed, as well as several non -recurring changes could be identified, since several high resolution molecular cytogenetic techniques were used. From the 84 patients' samples, 52 were evaluated for the expression of some of the PcG genes profile, using the real-time PCR methodology. Thus, it was possible to observe mRNA high relative levels of PcG genes in patients compared with healthy donors. When the expression levels of these genes according to the morphological subtypes were compared, AML-M3 subtype showed the most increased levels, mainly in children under the age of 8. Regarding clinical data, despite the wide variation AML showed high mRNA levels of PcG genes in patients with more than 50,000 leukocytes and AML - M3 showed increased mRNA levels of these genes in patients with low platelet counts. Thus, we conclude that despite the variation in mRNA levels of PcG genes studied in AML, we observed a correlation of these levels with clinical patient data, such as morphological subtypes, with age, white blood count and platelets in AML - M3. (AU)
Descritores: Leucemia Mieloide Aguda/genética
-Proteínas Repressoras
Criança
Adolescente
Análise Citogenética
Limites: Humanos
Criança
Adolescente
Responsável: BR440.1 - Biblioteca Geraldo Matos de Sá . Hospital do Câncer I


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Id: biblio-889189
Autor: Silva, Clara Maria Guimarães; Silva, Déborah Nascimento dos Santos; Costa, Scarlathe Bezerra da; Almeida, Juliana Soares de Sá; Boente, Renata Ferreira; Teixeira, Felipe Lopes; Domingues, Regina Maria Cavalcanti Pilotto; Lobo, Leandro Araujo.
Título: Inactivation of MarR gene homologs increases susceptibility to antimicrobials in Bacteroides fragilis
Fonte: Braz. j. microbiol;49(1):200-206, Jan.-Mar. 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: ABSTRACT Bacteroides fragilis is the strict anaerobic bacteria most commonly found in human infections, and has a high mortality rate. Among other virulence factors, the remarkable ability to acquire resistance to a variety of antimicrobial agents and to tolerate nanomolar concentrations of oxygen explains in part their success in causing infection and colonizing the mucosa. Much attention has been given to genes related to multiple drug resistance derived from plasmids, integrons or transposon, but such genes are also detected in chromosomal systems, like the mar (multiple antibiotic resistance) locus, that confer resistance to a range of drugs. Regulators like MarR, that control expression of the locus mar, also regulate resistance to organic solvents, disinfectants and oxygen reactive species are important players in these events. Strains derived from the parental strain 638R, with mutations in the genes hereby known as marRI (BF638R_3159) and marRII (BF638R_3706) were constructed by gene disruption using a suicide plasmid. Phenotypic response of the mutant strains to hydrogen peroxide, cell survival assay against exposure to oxygen, biofilm formation, resistance to bile salts and resistance to antibiotics was evaluated. The results showed that the mutant strains exhibit statistically significant differences in their response to oxygen stress, but no changes were observed in survival when exposed to bile salts. Biofilm formation was not affected by either gene disruption. Both mutant strains however, became more sensitive to multiple antimicrobial drugs tested. This indicates that as observed in other bacterial species, MarR are an important resistance mechanism in B. fragilis.
Descritores: Antibacterianos/farmacologia
Proteínas de Bactérias/genética
Bacteroides fragilis/efeitos dos fármacos
Bacteroides fragilis/genética
Infecções por Bacteroides/microbiologia
Proteínas Repressoras/genética
-Proteínas de Bactérias/metabolismo
Bacteroides fragilis/isolamento & purificação
Bacteroides fragilis/metabolismo
Regulação Bacteriana da Expressão Gênica/efeitos dos fármacos
Inativação Gênica
Testes de Sensibilidade Microbiana
Proteínas Repressoras/metabolismo
Limites: Humanos
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: biblio-847078
Autor: Bonatto, José Matheus Camargo.
Título: Caracterização da proteína quinase C Beta I nuclear em células tronco embrionárias / Characterization of protein kinase C beta I in embryonic stem cell nucleus.
Fonte: São Paulo; s.n; 2014. 181 p. tab, graf, ilus.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Instituto de Química para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: As proteína quinases C (PKC) pertencem à família das serina/treonina quinases, que vem sendo apontadas como importantes enzimas para os processos de proliferação e diferenciação das células tronco embrionárias (CTE), todavia, a função exata de cada isoforma dessa família ainda não está clara. Dados anteriores do nosso laboratório indicam que dentre as PKCs expressas em CTE, formas cataliticamente ativas da PKCßI são altamente expressas no núcleo das CTE murinas. Estas ao se diferenciarem expressam essa quinase no seu citoplasma ou deixam de expressar a mesma, e que a maioria dos alvos da PKCßI em CTE indiferenciada estão envolvidos em processos de regulação da transcrição de proteínas envolvidas em processos de proliferação/ diferenciação. Dando continuidade aos resultados anteriores do laboratório, no presente trabalho, com técnicas de proteômica e fosfoproteômica identificamos outros alvos nucleares da PKCßI em CTE indiferenciadas. Vimos que de fato inibindo-se a PKCßI diminuiu-se a fostorilação de fatores envolvidos com a indiferenciação das CTE. Dentre os alvos da PKCßI encontramos a proteína adaptadora, TIF1 que recruta proteínas remodeladoras de cromatina. Essa proteína é essencial para a manutenção do estado indiferenciado das CTE. In vitro a PKCßI foi capaz de fosforilar a TIF1ß e inibindo-se a PKCßI por RNAi vimos uma diminuição na expressão da TIF1ß e no fator de indiferenciação Nanog cuja expressão já foi demonstrada ser regulada pela TIF1ß. Além disso vimos que inibindo-se a PKCßI com o peptídeo inibidor da PKCßI aumentou a expressão de proteínas reguladas pelo c-Myc. E que o RNAi para a PKCßI aumentou a expressão de proteínas que regulam a expressão do c-Myc. Não vimos nenhum efeito na fosforilação ou expressão do c-Myc após a inibição da PKCßI o que sugere que a PKCßI ative proteínas repressoras do c-Myc. Nossos estudos sugerem que a PKCßI regula a manutenção do estado indiferenciado das CTE regulando a expressão e atividade da Tif1ß um possível alvo direto da PKCßI. Levando a modificações da cromatina e regulação da expressão de genes que mantém as CTE indiferenciadas. Outro ponto de regulação da PKCßI parece ser a nibição da atividade de c-Myc o que seria importante para a manutenção do estado indiferenciado visto que o c-Myc é um amplificador das vias de sinalização que mantém as células proliferando. Desta forma a PKCßI parece ter um papel central na regulação da expressão gênica de CTE à nível de modificações epigenéticas e a nível transcricional mantendo as CTE indiferenciadas

The Protein kinase C (PKC) family of serine/treonine kinases, are being described as important enzymes for proliferation and diferentiation of embryonic stem cells (ESC), however, the exact function of the different isoenzymes of this family still is unclear. Previous data from our laboratory indicates that amongst the PKCs expressed in ESC, catalytically active forms of PKCßI are highly expressed in nucleus of murine ESC. When these cells differentiate this kinase can be found in the cytoplasm or not expressed at all, and that the majority of PKCßI targets in undifferentiated ESC are involved in the regulation of proteins involved in transcription of proteins involved in proliferation/ diferentiation. Continuing our previous work herewith using proteomics and phosphoproteomics techniques we identified other nuclear PKCßI targets in undifferentiated ESC. We indeed saw that inhibiting PKCßI decreased the phosphorylation of factors involved with maintainance of the undifferentiated state of ESC. Amongst the targets of PKCßI we found the adaptor protein, TIF1ßI, that recruits cromatin remodeling proteins. This protein is essential for the maintenance of the undifferentiated state of ESC. In vitro PKCßI phosphorylated TIF1ß and inhibiting PKCßI with RNAi decreased the expression of TIF1ß and of the undifferentiation factor Nanog whose expression has been shown to be regulated by TIF1ß. We also saw that inhibiting PKCßI with a peptide inhibitor increased the expression of proteins regulated by c-Myc, and that RNAi for PKCßI increased the expression of proteins that regulate the expression of c-Myc. We did not see any effect on the phosphorylation or expression of c-Myc after inhibition of PKCßI suggesting that PKCßI activates c-Myc repressor proteins. Our studies sugest that PKCßI regulates the maintenance of the undiferentiated state of ESC regulating the expression and activity of Tif1ß a possibly a direct target of PKCßI, leading to chromatin modifications and regulation of genes that maintain ESC undiferentiated. Another form of regulation of PKCßI seems to be by inhibiting the activity of c-Myc which is importante to maintain ESC undifferentiated since c-Myc is na an amplifyer of signaling patheways that maintain ESC proliferating. Together PKCßI has a central role in the regulation of the gene expression of ESC at the level of epigenetic modifications and transcriptional regulation
Descritores: Células-Tronco Embrionárias/citologia
Proteína Quinase C/metabolismo
-Diferenciação Celular
Cromatina/genética
Espectrometria de Massas/métodos
Fosforilação
Proteína Quinase C beta/análise
Proteômica/instrumentação
Proteínas Repressoras/genética
Substratos para Tratamento Biológico/classificação
Tipo de Publ: Técnicas In Vitro
Responsável: BR40.1 - DBD - Divisão de Biblioteca e Documentacão do Conjunto das Químicas
BR40.1; T 574.192, B699c. 30100025419-Q


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Id: biblio-828178
Autor: Lopes-Ramos, C M; Pereira, T C; Dogini, D B; Gilioli, R; Lopes-Cendes, I.
Título: Lithium carbonate and coenzyme Q10 reduce cell death in a cell model of Machado-Joseph disease
Fonte: Braz. j. med. biol. res = Rev. bras. pesqui. méd. biol;49(12):e5805, 2016. graf.
Idioma: en.
Resumo: Machado-Joseph disease (MJD) or spinocerebellar ataxia type 3 (SCA3) is an autosomal dominant neurodegenerative disorder caused by expansion of the polyglutamine domain of the ataxin-3 (ATX3) protein. MJD/SCA3 is the most frequent autosomal dominant ataxia in many countries. The mechanism underlying MJD/SCA3 is thought to be mainly related to protein misfolding and aggregation leading to neuronal dysfunction followed by cell death. Currently, there are no effective treatments for patients with MJD/SCA3. Here, we report on the potential use of lithium carbonate and coenzyme Q10 to reduce cell death caused by the expanded ATX3 in cell culture. Cell viability and apoptosis were evaluated by MTT assay and by flow cytometry after staining with annexin V-FITC/propidium iodide. Treatment with lithium carbonate and coenzyme Q10 led to a significant increase in viability of cells expressing expanded ATX3 (Q84). In addition, we found that the increase in cell viability resulted from a significant reduction in the proportion of apoptotic cells. Furthermore, there was a significant change in the expanded ATX3 monomer/aggregate ratio after lithium carbonate and coenzyme Q10 treatment, with an increase in the monomer fraction and decrease in aggregates. The safety and tolerance of both drugs are well established; thus, our results indicate that lithium carbonate and coenzyme Q10 are good candidates for further in vivo therapeutic trials.
Descritores: Ataxina-3/efeitos dos fármacos
Morte Celular/efeitos dos fármacos
Carbonato de Lítio/farmacologia
Doença de Machado-Joseph
Proteínas Repressoras/efeitos dos fármacos
Ubiquinona/análogos & derivados
-Diferenciação Celular/efeitos dos fármacos
Proliferação de Células/efeitos dos fármacos
Doença de Machado-Joseph/tratamento farmacológico
Ubiquinona/farmacologia
Limites: Humanos
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-746612
Autor: Barbosa, Jeam Haroldo Oliveira; Santos, Antonio Carlos; Salmon, Carlos Ernesto Garrido.
Título: Susceptibility weighted imaging: differentiating between calcification and hemosiderin / Imagem ponderada em suscetibilidade magnética: diferenciando calcificação de hemossiderina
Fonte: Radiol. bras;48(2):93-100, Mar-Apr/2015. graf.
Idioma: en.
Resumo: Objective: To present a detailed explanation on the processing of magnetic susceptibility weighted imaging (SWI), demonstrating the effects of echo time and sensitive mask on the differentiation between calcification and hemosiderin. Materials and Methods: Computed tomography and magnetic resonance (magnitude and phase) images of six patients (age range 41– 54 years; four men) were retrospectively selected. The SWI images processing was performed using the Matlab’s own routine. Results: Four out of the six patients showed calcifications at computed tomography images and their SWI images demonstrated hyperintense signal at the calcification regions. The other patients did not show any calcifications at computed tomography, and SWI revealed the presence of hemosiderin deposits with hypointense signal. Conclusion: The selection of echo time and of the mask may change all the information on SWI images, and compromise the diagnostic reliability. Amongst the possible masks, the authors highlight that the sigmoid mask allows for contrasting calcifications and hemosiderin on a single SWI image. .

Objetivo: Expor em detalhes o processamento da imagem ponderada em suscetibilidade magnética (susceptibility weighted imaging – SWI), destacando o efeito da escolha do tempo de eco e da máscara sensível à diferenciação de calcificação e hemossiderina simultaneamente. Materiais e Métodos: Imagens de tomografia computadorizada e por ressonância magnética (magnitude e fase) foram selecionadas, retrospectivamente, de seis pacientes (idades entre 41 e 54 anos; quatro homens). O processamento das imagens SWI foi realizado em rotina própria no programa Matlab. Resultados: Dos seis pacientes estudados, quatro apresentaram calcificações nas imagens de tomografia computadorizada. Nestes, as imagens SWI mostraram sinal hiperintenso para as regiões de calcificações. Os outros dois pacientes não apresentaram calcificações nas imagens de tomografia computadorizada e apresentaram depósito de hemossiderina com sinal hipointenso na imagem SWI. Conclusão: A escolha do tempo de eco e da máscara pode alterar toda a informação da imagem SWI e comprometer a confiabilidade diagnóstica. Dentre as possíveis máscaras, destacamos que a máscara sigmoide permite contrastar calcificação e hemossiderina em uma única imagem SWI. .
Descritores: Processamento Alternativo/genética
Proteínas de Transporte/genética
Proteínas de Transporte/metabolismo
Proteínas Nucleares/genética
Proteínas Nucleares/metabolismo
Proteína de Ligação a Regiões Ricas em Polipirimidinas/genética
Tropomiosina/genética
-Sequência de Bases
Sítios de Ligação
Primers do DNA
Éxons
Vetores Genéticos
Ligantes
Fases de Leitura Aberta
Reação em Cadeia da Polimerase
Proteína de Ligação a Regiões Ricas em Polipirimidinas/metabolismo
Proteínas Recombinantes/metabolismo
Proteínas Repressoras/metabolismo
Transfecção
Limites: Animais
Camundongos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Saúde Pública
Minayo, Maria Cecília de Souza
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Id: lil-744848
Autor: Taquette, Stella Regina; Minayo, Maria Cecília de Souza; Rodrigues, Adriana de Oliveira.
Título: The perceptions of medical researchers on qualitative methodologies / Percepción de los investigadores médicos en metodologías cualitativas / Percepção de pesquisadores médicos sobre metodologias qualitativas
Fonte: Cad. saúde pública = Rep. public health;31(4):722-732, 04/2015.
Idioma: en.
Resumo: We aimed to verify doctor's perception of the qualitative research method, via a qualitative study of interviews with questions on the academic profile of doctors and on the methodology. We interviewed 42 professionals, of which 18 had experience with the qualitative method and 24 with the quantitative method. The results showed that knowledge on the qualitative method was virtually nil among "quantitative researchers", who did not value qualitative research, although some of those realized that it would be important to be more accepting in clinical practice. Others only considered the method as subsidiary to quantitative. The majority considered qualitative methods as lacking academic structure, taking too long to conduct empirical studies, and being difficult to publish. All of them criticized the misuse of the method, and the "quantitatives" pointed out the problem of being unable to reproduce. We concluded that widening the use of the qualitative method by doctors requires investment from the beginning of the academic career and participation in qualitative research projects.

El objetivo es verificar la percepción de médicos sobre el método de investigación cualitativa. Se trata de un estudio cualitativo por medio de entrevistas con preguntas sobre el perfil de los médicos y sobre el método. Entrevistamos a 42 profesionales, 18 con experiencia en el método cualitativo y 24 con el cuantitativo. Los resultados mostraron que el conocimiento sobre lo cualitativo es casi nulo entre los "cuantitativistas", que no valoran la investigación cualitativa, aunque algunos se dan cuenta de que sería importante tener un enfoque más amplio en la práctica clínica. Otros la ven como subsidiaria a lo cuantitativo. Sus dificultades para utilizar ese abordaje son: falta de formación, cantidad de tiempo que exigen y problemas de publicación. Todos han criticado el mal uso del método. Los "cuantitativistas" han destacado como fragilidad, la no reproductibilidad. Llegamos a la conclusión de que para ampliar el uso de los abordajes cualitativos entre los médicos es importante invertir en su formación desde el inicio del curso y la participación en proyectos de investigación cualitativa.

Objetivamos verificar a percepção de médicos sobre o método qualitativo de pesquisa. Estudo qualitativo por meio de entrevistas com questões sobre o perfil acadêmico do médico e perguntas abertas a respeito do método. Entrevistamos 42 profissionais, sendo 18 com experiência no método qualitativo e 24 com o quantitativo. Os resultados evidenciaram que o conhecimento sobre o qualitativo é quase nulo entre os pesquisadores "quantitativistas", os quais não valorizam a pesquisa qualitativa, embora alguns percebam que seria importante ter uma postura mais compreensiva na prática clínica. Outros só a veem como subsidiária ao quantitativo. As principais dificuldades da maioria são: falta de formação, tempo longo despendido nos estudos empíricos e dificuldade de publicação. Todos os entrevistados criticaram o mau uso do método, e os "quantitativistas" ressaltaram, como problema, sua não reprodutibilidade. Concluímos que ampliar o uso do método qualitativo por médicos exige investimento na formação desde o início da graduação e participação em projetos de pesquisa qualitativa.
Descritores: Anilidas/farmacologia
Benzodiazepinonas/farmacologia
/farmacologia
HETEROCYCLIC COMPOUNDS WITH ABBREVIATIONS AS TOPIC OR MORE RINGS/farmacologia
Inibidores de Proteínas Quinases/farmacologia
Proteínas Serina-Treonina Quinases/antagonistas & inibidores
Pirimidinas/farmacologia
Proteínas Repressoras/antagonistas & inibidores
-Células Cultivadas
Movimento Celular/efeitos dos fármacos
Proliferação de Células/efeitos dos fármacos
Avaliação Pré-Clínica de Medicamentos
Ativação Enzimática/efeitos dos fármacos
HEKABORTION, INCOMPLETEABATTOIRS CELLS
Neoplasias/patologia
Proteínas Quinases/genética
Proteínas Serina-Treonina Quinases/genética
Proteínas Serina-Treonina Quinases/metabolismo
Proteínas Serina-Treonina Quinases/fisiologia
Proteínas Repressoras/agonistas
Proteínas Repressoras/genética
Especificidade por Substrato
Proteínas Supressoras de Tumor/fisiologia
Limites: Animais
Humanos
Camundongos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME



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