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Id: biblio-1011427
Autor: Shen, Gangxu; Yang, Chih-Hui; Shen, Chi-Yen; Huang, Keng-Shiang.
Título: Origination and selection of ABCDE and AGL6 subfamily MADS-box genes in gymnosperms and angiosperms
Fonte: Biol. Res;52:25, 2019. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: BACKGROUND: The morphological diversity of flower organs is closely related to functional divergence within the MADS-box gene family. Bryophytes and seedless vascular plants have MADS-box genes but do not have ABCDE or AGAMOUS-LIKE6 (AGL6) genes. ABCDE and AGL6 genes belong to the subgroup of MADS-box genes. Previous works suggest that the B gene was the first ABCDE and AGL6 genes to emerge in plant but there are no mentions about the probable origin time of ACDE and AGL6 genes. Here, we collected ABCDE and AGL6 gene 381 protein sequences and 361 coding sequences from gymnosperms and angiosperms and reconstructed a complete Bayesian phylogeny of these genes. In this study, we want to clarify the probable origin time of ABCDE and AGL6 genes is a great help for understanding the role of the formation of the flower, which can decipher the forming order of MADS-box genes in the future. RESULTS: These genes appeared to have been under purifying selection and their evolutionary rates are not significantly different from each other. Using the Bayesian evolutionary analysis by sampling trees (BEAST) tool, we estimated that: the mutation rate of the ABCDE and AGL6 genes was 2.617 × 10-3 substitutions/site/million years, and that B genes originated 339 million years ago (MYA), CD genes originated 322 MYA, and A genes shared the most recent common ancestor with E/AGL6 296 MYA, respectively. CONCLUSIONS: The phylogeny of ABCDE and AGL6 genes subfamilies differed. The APETALA1 (AP1 or A gene) subfamily clustered into one group. The APETALA3/PISTILLATA (AP3/PI or B genes) subfamily clustered into two groups: the AP3 and PI clades. The AGAMOUS/SHATTERPROOF/SEEDSTICK (AG/SHP/STK or CD genes) subfamily clustered into a single group. The SEPALLATA (SEP or E gene) subfamily in angiosperms clustered into two groups: the SEP1/2/4 and SEP3 clades. The AGL6 subfamily clustered into a single group. Moreover, ABCDE and AGL6 genes appeared in the following order: AP3/PI â†' AG/SHP/STK â†' AGL6/SEP/AP1. In this study, we collected candidate sequences from gymnosperms and angiosperms. This study highlights important events in the evolutionary history of the ABCDE and AGL6 gene families and clarifies their evolutionary path.
Descritores: Filogenia
Magnoliopsida/genética
Proteínas de Domínio MADS/genética
Proteínas de Arabidopsis/genética
Cycadopsida/genética
Proteínas Circadianas Period/genética
-Genes de Plantas
Genoma de Planta
Regulação da Expressão Gênica de Plantas
Evolução Molecular
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Id: biblio-1087162
Autor: Jiménez-Guillen, Doribet; Pérez-Pascual, Daniel; Souza-Perera, Ramón; Zúñiga Aguilar, José Juan.
Título: Cloning and molecular characterization of a putative habanero pepper SERK1 cDNA expressed during somatic and zygotic embryogenesis
Fonte: Electron. j. biotechnol;41:48-55, sept. 2019. tab, ilus, graf.
Idioma: en.
Projeto: Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología-FORDECyT; . Comisión Intersecretarial de Bioseguridad de los Organismos Genéticamente Modificado.
Resumo: Background: Plant gene homologs that control cell differentiation can be used as biotechnological tools to study the in vitro cell proliferation competence of tissue culture-recalcitrant species such as peppers. It has been demonstrated that SERK1 homologs enhance embryogenic competence when overexpressed in transformed tissues; therefore, cloning of a pepper SERK1 homolog was performed to further evaluate its biotechnological potential. Results: A Capsicum chinense SERK full-length cDNA (CchSERK1) was cloned and characterized at the molecular level. Its deduced amino acid sequence exhibits high identity with sequences annotated as SERK1 and predicted-SERK2 homologs in the genomes of the Capsicum annuum CM-334 and Zunla-1 varieties, respectively, and with SERK1 homologs from members of the Solanaceae family. Transcription of CchSERK1 in plant tissues, measured by quantitative RT-PCR, was higher in stems, flowers, and roots but lower in leaves and floral primordia. During seed development, CchSERK1 was transcribed in all zygotic stages, with higher expression at 14 days post anthesis. During somatic embryogenesis, CchSERK1 was transcribed at all differentiation stages, with a high increment in the heart stage and lower levels at the torpedo/cotyledonal stages. Conclusion: DNA sequence alignments and gene expression patterns suggest that CchSERK1 is the C. chinense SERK1 homolog. Significant levels of CchSERK1 transcripts were found in tissues with cell differentiation activities such as vascular axes and during the development of zygotic and somatic embryos. These results suggest that CchSERK1 might have regulatory functions in cell differentiation and could be used as a biotechnological tool to study the recalcitrance of peppers to proliferate in vitro.
Descritores: Capsicum/genética
Clonagem Molecular
-Técnicas In Vitro
Biotecnologia
Expressão Gênica
Diferenciação Celular
Genes de Plantas
DNA Complementar/genética
Solanaceae/genética
Proteínas de Arabidopsis
Proliferação de Células
Desenvolvimento Embrionário
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Texto completo SciELO Brasil
Carvalho, Emília Campos de
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Id: lil-752510
Autor: Teixeira, Carla Regina de Souza; Pereira, Marta Cristiane Alves; Kusumota, Luciana; Gaioso, Vanessa Pirani; Mello, Carolina Lima de; Carvalho, Emília Campos de.
Título: Avaliação dos estudantes de enfermagem sobre a aprendizagem com a simulação clínica / Evaluación de los estudiantes de enfermería sobre el aprendizaje con la simulación clínica / Evaluation of nursing students about learning with clinical simulation
Fonte: Rev. bras. enferm;68(2):311-319, Mar-Apr/2015. tab.
Idioma: pt.
Projeto: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico.
Resumo: RESUMO Objetivo: descrever as contribuições da simulação clínica para aprendizagem de atributos cognitivos e procedimentais, por meio do debriefing, na perspectiva dos estudantes de enfermagem. Método: estudo descritivo exploratório. Participaram 20 estudantes de Graduação em Enfermagem de uma universidade do interior paulista. Na coleta de dados, realizada na etapa do debriefing, foi registrada a percepção do aluno sobre a simulação, aspectos positivos e o que poderia ser feito de forma diferente. Os relatos foram agrupados em categorias temáticas centrais, segundo referencial de análise de conteúdo de Bardin (2011), analisadas por meio de estatística descritiva. Resultados: identificada valorização da aprendizagem ativa, crítica e reflexiva (47,5%) em decorrência da aproximação à realidade assistencial (20,3%), manifestação dos sentimentos vivenciados durante a simulação (16,9%) e composição do cenário (15,3%). Conclusão: a simulação clínica seguida do debriefing favorece a compreensão da relação entre ação e resultados alcançados na aprendizagem. .

RESUMEN Objetivo: describir las contribuciones de simulación clínica para aprender atributos cognitivos y de procedimiento, a través de debriefing, desde la perspectiva de los estudiantes de enfermería. Método: estudio exploratorio descriptivo. 20 estudiantes participaron en el Pregrado en Enfermería de una universidad de São Paulo. Durante la recolección de datos, que se aplicó durante el debriefing, fue grabado en la percepción de los estudiantes de la simulación, los aspectos positivos y lo que podría hacerse de otra manera. Los informes de los estudiantes se agrupan de acuerdo a los temas centrales, según el referencial de análisis de contenido de Bardin (2011) y analizados mediante estadística descriptiva. Resultados: identificado la mejora de aprendizaje activo, crítico y reflexivo (47,5%) debido a la aproximación a la realidad en la atención de enfermería (20,3%), un resultado de la composición del escenario (16,9%), lo que favorece el desarrollo de sentimientos experimentados durante la simulación (15,3%). Conclusión: la simulación clínica seguida de debriefing favorece la comprensión de la relación entre la acción y los resultados obtenidos en el aprendizaje. .

ABSTRACT Objective: to describe the contributions of clinical simulation for learning cognitive and procedural attributes through debriefi ng, from the perspective of nursing students. Method: descriptive exploratory study. Twenty nursing undergraduate students from a university in the interior of the state of São Paulo participated in this study. Data collection was performed at the debriefi ng stage. Student’s perceptions about the simulation, positive aspects and what they could have done differently were registered. The students’ statements were grouped according to the central themes and the framework of Bardin’s content analysis (2011) and were analyzed using descriptive statistics. Results: enhancement of active, critical and refl ective learning (47.5%) was identifi ed due to the closeness to reality in nursing care (20.3%), manifestation of feelings experienced during the simulation (15.3%) and composition of the scenario (15.3%). Conclusion: the clinical simulation followed by debriefi ng promotes the understanding of the link between action and achievements in learning. .
Descritores: Proteínas de Arabidopsis/metabolismo
Arabidopsis/crescimento & desenvolvimento
Arabidopsis/imunologia
Imunidade Inata/imunologia
Fragmentos de Peptídeos/imunologia
Imunidade Vegetal/imunologia
Receptores de Reconhecimento de Padrão/imunologia
-Sequência de Aminoácidos
Arabidopsis/genética
Western Blotting
Regulação da Expressão Gênica de Plantas
Dados de Sequência Molecular
Raízes de Plantas/crescimento & desenvolvimento
Raízes de Plantas/imunologia
Raízes de Plantas/metabolismo
RNA Mensageiro/genética
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
Receptores de Reconhecimento de Padrão/metabolismo
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
Homologia de Sequência de Aminoácidos
Transdução de Sinais
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Saúde Pública
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Id: lil-744857
Autor: Teixeira, Jane Blanco; Souza Junior, Paulo Roberto Borges de; Higa, Joelma; Theme Filha, Mariza Miranda.
Título: Mortality from Alzheimer's disease in Brazil, 2000-2009 / Enfermedad de Alzheimer: estudio de la mortalidad en Brasil, 2000-2009 / Doença de Alzheimer: estudo da mortalidade no Brasil, 2000-2009
Fonte: Cad. saúde pública = Rep. public health;31(4):850-860, 04/2015. tab.
Idioma: en.
Resumo: Alzheimer's disease is the most prevalent type of dementia in the elderly worldwide. To evaluate the mortality trend from Alzheimer's disease in Brazil, a descriptive study was conducted with the Mortality Information System of the Brazilian Ministry of Health (2000-2009). Age and sex-standardized mortality rates were calculated in Brazil's state capitals, showing the percentage variation by exponential regression adjustment. The state capitals as a whole showed an annual growth in mortality rates in the 60 to 79 year age bracket of 8.4% in women and 7.7% in men. In the 80 and older age group, the increase was 15.5% in women and 14% in men. Meanwhile, the all-cause mortality rate declined in both elderly men and women. The increase in mortality from Alzheimer's disease occurred in the context of chronic diseases as a proxy for increasing prevalence of the disease in the population. The authors suggest healthcare strategies for individuals with chronic non-communicable diseases.

La enfermedad de Alzheimer es la demencia más frecuente entre adultos mayores en el mundo. Para evaluar la evolución de la mortalidad por la enfermedad de Alzheimer en Brasil, se ha desarrollado un estudio con datos del Sistema de Información sobre Mortalidad del Ministerio de Salud, durante el período 2000-2009. Se calcularon las tasas de mortalidad estandarizadas por edad y sexo en las capitales brasileñas y se registró la variación porcentual mediante ajuste de la regresión exponencial. El conjunto de las capitales presentó un aumento anual de las tasas de mortalidad en el grupo de edad de 60 a 79 años, de un 8,4% en mujeres y un 7,7% en hombres. En el grupo de 80 o más años, el aumento fue de un 15,5% en mujeres y un 14% en hombres. No obstante, hubo una disminución en la tasa de mortalidad por todas las causas entre los adultos mayores de ambos sexos. Se destaca un aumento de la mortalidad por enfermedad de Alzheimer en el contexto de las enfermedades crónicas como un proxy para la prevalencia de la enfermedad en la población, y se indican estrategias de asistencia en el cuidado de pacientes con enfermedades de larga duración.

A doença de Alzheimer é o tipo de demência que mais prevalece entre os idosos no mundo. Para avaliar a evolução da mortalidade por doença de Alzheimer no Brasil foi desenvolvido um estudo descritivo com os dados do Sistema de Informações sobre Mortalidade do Ministério da Saúde, no período de 2000 a 2009. Calcularam-se as taxas de mortalidade padronizadas por idade e sexo nas capitais brasileiras e se observou a variação percentual por meio de ajuste por regressão exponencial. Para o conjunto das capitais houve um crescimento anual nas taxas de mortalidade na faixa etária de 60 a 79 anos de 8,4% entre as mulheres e 7,7% entre os homens. No grupo etário de 80 anos e mais, o aumento foi de 15,5% entre as mulheres e 14% entre os homens. Contrariamente, verificou-se declínio da taxa de mortalidade por todas as causas entre os idosos em ambos os sexos. Destaca-se o aumento da mortalidade por doença de Alzheimer no contexto das doenças crônicas como um indicador aproximado da prevalência da doença na população, e são apontadas estratégias de assistência ao cuidado dos portadores de doenças de longa duração.
Descritores: Arabidopsis/fisiologia
Interações Hospedeiro-Patógeno/fisiologia
Peronospora/imunologia
Doenças das Plantas/microbiologia
Reguladores de Crescimento de Planta/fisiologia
Imunidade Vegetal/fisiologia
Ácido Salicílico/metabolismo
-Proteínas de Arabidopsis/fisiologia
Interações Hospedeiro-Patógeno/imunologia
Complexo Mediador/fisiologia
Doenças das Plantas/imunologia
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Saúde Pública
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Id: lil-733139
Autor: Rodrigues, Ana Paula dos Santos; Silveira, Erika Aparecida da.
Título: Correlação e associação de renda e escolaridade com condições de saúde e nutrição em obesos graves / Correlation and association of income and educational level with health and nutritional conditions among the morbidly obese
Fonte: Ciênc. saúde coletiva;20(1):165-174, 01/2015. tab.
Idioma: pt.
Resumo: O objetivo deste artigo é investigar relações entre renda e escolaridade com condições de saúde e nutrição em obesos graves. Estudo transversal ambulatorial com 79 pacientes de primeira consulta, com Índice de Massa Corporal (IMC) ≥ 35 kg/m2 e idade ≥ 20 anos. Coletaram-se dados: sociodemográficos, antropométricos, estilo de vida, exames bioquímicos e consumo alimentar. O IMC médio foi 48,3 ± 6,9 kg/m2. Observou-se correlação negativa significante de escolaridade com variáveis peso (r = -0,234) e IMC (r = -0,364) e de renda familiar per capita com consumo diário de vegetal A (r = -0,263). Após análise multivariada maior renda familiar per capita se associou à ausência de cardiopatia (RP: 0,51, IC95%: 0,32-0,81), maior consumo diário de vegetal A (RP: 1,79, IC95%: 1,16-2,75) e doces (RP: 3,12, IC95%: 1,21-8,04). Em obesos graves a maior renda familiar per capita se associou à ausência de cardiopatia e maior consumo de vegetais folhosos e doces. Já a escolaridade não se manteve associada às condições de saúde e nutrição.

This article seeks to investigate the relationship between income and educational level and health and nutritional conditions among the morbidly obese. A cross-sectional study was conducted with 79 patients at first appointment, with Body Mass Index (BMI) ≥ 35 kg/m2 and age ≥ 20 years. The following data was collected: demographic, socioeconomic, anthropometric, lifestyle, biochemical and food intake data. Average BMI was 48.3 ± 6.9 kg/m2. There was a significant negative correlation between education level and the variables of weight (r = -0.234) and BMI (r = -0.364) and per capita family income with daily consumption of leafy vegetables (r = -0.263). After multivariate analysis, higher per capita family income was associated with the absence of heart disease (PR: 0.51, CI95%: 0.32-0.81), higher daily consumption of leafy vegetables (PR: 1.79, CI95%: 1.16-2.75) and candy (PR: 3.12, CI95%: 1.21-8.04). In the morbidly obese, per capita household income was associated with absence of heart disease and higher consumption of leafy vegetables and candy. On the other hand, education level was not associated with health and nutrition conditions.
Descritores: Arabidopsis/enzimologia
Arabidopsis/genética
Regulação da Expressão Gênica de Plantas
Ácidos Indolacéticos/metabolismo
Fosfolipases A/metabolismo
-/farmacologia
ABDOMEN,ABDOMINAL NEOPLASMS,ABELSON MURINE LEUKEMIA VIRUS,CONGENITAL ABNORMALITIES-EICOSATETRAYNOIC ACID/farmacologia
Proteínas de Arabidopsis/genética
Proteínas de Arabidopsis/metabolismo
Proteínas de Ligação a DNA/genética
Proteínas de Ligação a DNA/metabolismo
Inibidores Enzimáticos/farmacologia
Glucuronidase/metabolismo
Luciferases/metabolismo
Proteínas Nucleares/genética
Proteínas Nucleares/metabolismo
Fosfolipases A/antagonistas & inibidores
Processamento de Proteína Pós-Traducional/efeitos dos fármacos
RNA Mensageiro/genética
RNA Mensageiro/metabolismo
Plântula/efeitos dos fármacos
Plântula/metabolismo
Fatores de Tempo
/farmacologia
TEMEFOS,ABBREVIATIONS AS TOPIC-DICHLOROPHENOXYACETIC ACID/farmacologia
Tipo de Publ: Research Support, N.I.H., Extramural
Research Support, Non-U.S. Gov't
Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Chile
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Id: lil-640508
Autor: Loeza-Ángeles, Heber; López-Meza, Joel E; Ochoa-Zarzosa, Alejandra.
Título: Antimicrobial effects of plant defence peptides expressed by bovine endothelial cells on intracellular pathogens
Fonte: Electron. j. biotechnol;14(5):1-1, Sept. 2011. ilus, tab.
Idioma: en.
Projeto: Coordinación de la Investigación Científica; . CONACyT; . FOMIX.
Resumo: Background: The actions of plant antimicrobial peptides (PAP) against intracellular pathogens are poorly known. It has been reported that wheat puroindolines show antibacterial activity against Staphylococcus epidermidis endocyted by macrophages. In this work, we evaluated the intracellular antimicrobial activity of PAP gamma-thionin and thionin Thi2.1 produced by bovine endothelial cells against intracellular Staphylococcus aureus and Candida albicans. We used three host-pathogen models: 1) bovine mammary epithelial cells (BMEC)-S. aureus, 2) bovine endothelial cells (BEC)-S. aureus and 3) BEC-C. albicans, and evaluated the effect of conditioned media from BEC producers of PAP (gamma-thionin and thionin Thi2.1). Results: In the first model, conditioned medium (CM) containing Thi2.1 completely inhibited S. aureus intracellular after 24 hrs treatment. In the second model, CM from BEC containing gamma-thionin has a better effect killing intracellular S. aureus for 12-24 hrs incubations than CM from endothelial cells producers of Thi2.1; this was related with an increase of nitric oxide production (~2 times) in BEC infected and treated for 12 hrs with CM containing gamma-thionin, which negatively correlates with bacterial viability. In the third model, CM containing Thi2.1 showed a more potent intracellular fungicidal activity (~85 percent of inhibition) at 24 hrs treatment than CM containing gamma-thionin (~35 percent of inhibition). Conclusions: This work shows new effects of PAP to control intracellular bacterial or fungal infections.
Descritores: Candida albicans
Peptídeos Catiônicos Antimicrobianos/farmacologia
Proteínas de Arabidopsis/farmacologia
Staphylococcus aureus
-Capsicum
Células Endoteliais
Óxido Nítrico
Limites: Bovinos
Animais
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Id: lil-449128
Autor: Mudado, M. de A; Ortega, J. M.
Título: A picture of gene sampling/expression in model organisms using ESTs and KOG proteins
Fonte: Genet. mol. res. (Online);5(1):242-253, Mar. 31, 2006. tab, graf, ilus.
Idioma: en.
Resumo: The expressed sequence tag (EST) is an instrument of gene discovery. When available in large numbers, ESTs may be used to estimate gene expression. We analyzed gene expression by EST sampling, using the KOG database, which includes 24,154 proteins from Arabidopsis thaliana (Ath), 17,101 from Caenorhabditis elegans (Cel), 10,517 from Drosophila melanogaster (Dme), and 26,324 from Homo sapiens (Hsa), and 178,538 ESTs for Ath, 215,200 for Cel, 261,404 for Dme, and 1,941,556 for Hsa. BLAST similarity searches were performed to assign KOG annotation to all ESTs. We determined the amount of gene sampling or expression dedicated to each KOG functional category by each model organism. We found that the 25% most-expressed genes are frequently shared among these organisms. The KOG protein classification allowed the EST sampling calculation throughout the glycolysis pathway. We calculated the KOG cluster coverage and inferred that 50 to 80 K ESTs would efficiently cover 80-85% of the KOG database clusters in a transcriptome project. Since KOG is a database biased towards housekeeping genes, this is probably the number of ESTs needed to include the more commonly expressed genes in these organisms. We also examined a still unaddressed question: what is the minimum number of ESTs that should be produced in a transcriptome project?
Descritores: Etiquetas de Sequências Expressas
Expressão Gênica/genética
Proteínas de Arabidopsis/genética
Proteínas de Caenorhabditis elegans/genética
Proteínas de Drosophila/genética
-Análise por Conglomerados
Bases de Dados Genéticas
Bases de Dados de Proteínas
Modelos Genéticos
Proteínas de Arabidopsis/química
Proteínas de Caenorhabditis elegans/química
Proteínas de Drosophila/química
Análise de Sequência de Proteína
Transcrição Genética
Limites: Humanos
Animais
Responsável: BR1.1 - BIREME



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