Base de dados : LILACS
Pesquisa : D12.776.817 [Categoria DeCS]
Referências encontradas : 72 [refinar]
Mostrando: 1 .. 10   no formato [Detalhado]

página 1 de 8 ir para página                    

  1 / 72 LILACS  
              next record last record
seleciona
para imprimir
Fotocópia
Texto completo
Id: biblio-1047367
Autor: Qureshi, M. Amjad; Tariq Pervez, Muhammad; Ellahi Babar, Masroor; Hussain, Tanveer; Shoaib, Muhammad; Shah Mohammad, Syed.
Título: Genomic comparisons of Rhizobium species using in silico AFLP-PCR, endonuclease restriction, and AMPylating enzymes
Fonte: Electron. j. biotechnol;34:67-75, july. 2018. graf, tab.
Idioma: en.
Resumo: Background: The whole-genome sequences of nine Rhizobium species were evaluated using different in silico molecular techniques such as AFLP-PCR, restriction digest, and AMPylating enzymes. The entire genome sequences were aligned with progressiveMauve and visualized by reconstructing phylogenetic tree using NTSYS pc 2.11X. The "insilico.ehu.es" was used to carry out in silico AFLP-PCR and in silico restriction digest of the selected genomes. Post-translational modification (PTM) and AMPylating enzyme diversity between the proteome of Rhizobium species were determined by novPTMenzy. Results: Slight variations were observed in the phylogeny based on AFLP-PCR and PFGE and the tree based on whole genome. Results clearly demonstrated the presence of PTMs, i.e., AMPylation with the GS-ATasE (GlnE), Hydroxylation, Sulfation with their domain, and Deamidation with their specific domains (AMPylating enzymes) GS-ATasE (GlnE), Fic, and Doc (Phosphorylation); Asparagine_hydroxylase and Collagen_prolyl_lysyl_hydroxylase; Sulfotransferase; and CNF (Cytotoxic Necrotizing Factors), respectively. The results pertaining to PTMs are discussed with regard to functional diversities reported in these species. Conclusions: The phylogenetic tree based on AFLP-PCR was slightly different from restriction endonuclease- and PFGE-based trees. Different PTMs were observed in the Rhizobium species, and the most prevailing type of PTM was AMPylation with the domain GS-ATasE (GlnE). Another type of PTM was also observed, i.e., Hydroxylation and Sulfation, with the domains Asparagine_hydroxylase and Collagen_prolyl_lysyl_hydroxylase and Sulfotransferase, respectively. The deamidation type of PTM was present only in Rhizobium sp. NGR234. How to cite: Qureshi MA, Pervez MT, Babar ME, et al. Genomic comparisons of Rhizobium species using in silico AFLP-PCR, endonuclease restrictions and ampylating enzymes.
Descritores: Rhizobium/genética
-Filogenia
Rhizobium/enzimologia
Rhizobium/fisiologia
Simbiose
Simulação por Computador
Enzimas de Restrição do DNA
Reação em Cadeia da Polimerase/métodos
Análise de Sequência
Proteoma
Genômica
Análise do Polimorfismo de Comprimento de Fragmentos Amplificados
Fabaceae/microbiologia
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


  2 / 72 LILACS  
              first record previous record next record last record
seleciona
para imprimir
Fotocópia
Texto completo
Id: biblio-1045628
Autor: Feng, K; Qiu, H; Gao, Y; Fu, Y; Du, L; Qiu, T; Meng, H; Luo, Q.
Título: Comparative proteomic analysis of the nucleus accumbens during extinction and reinstatement of morphine dependence / Análisis proteómico comparativo del núcleo accumbens durante laextinción y recaída de la dependencia a la morfina
Fonte: West Indian med. j;62(3):210-215, Mar. 2013. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: BACKGROUND: The aim of this study was to detect differentially expressed proteins in the nucleus accumbens between the states of extinction and reinstatement of morphine addiction. Numerous studies on the neurobiological mechanisms concerning drug craving and relapse have been reported to date, but data on their relationship with the underlying key molecular mechanisms involved remain limited. METHODS: In this study, 40 male SpragueDawley rats were equally randomized into a saline group and a morphine group. Both groups received drug selfadministration training, after which extinction models were established naturally. The groups were further divided into two subgroups for extinction and reinstatement tests. Cerebral nucleus accumbens masses were measured for total protein extraction. Twodimensional electrophoresis was performed to determine differential protein spots. These differential proteins were then enzymolysed and identified using mass spectrography. RESULTS: The proteins were classified as fatty acidbinding protein, serine/threonine protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform, serine/threonine protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform, serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B² subunit gamma or heat shock protein 90 cochaperone CDC37. CONCLUSION: Significant changes in five proteins were detected between extinction and reinstatement. These proteins are correlated with phosphorylation and the tricarboxylic acid cycle.

ANTECEDENTES: El objetivo de este estudio fue detectar las proteínas diferencialmente expresadas en el núcleo accumbens entre los estados de extinción y recaída de la adicción a la morfina. Hasta la fecha se han reportado numerosos estudios en relación con los mecanismos neurobiológicos del deseo incontenible y recaída en el consumo de drogas, pero los datos sobre su relación con los mecanismos moleculares fundamentales subyacentes implicados, siguen siendo limitados. MÉTODO: En este estudio, 40 ratas machos SpragueDawley fueron por igual asignadas de manera aleatoria a un grupo salino y un grupo de morfina. Ambos grupos recibieron entrenamiento de autoadministración de drogas, después de lo cual se establecieron modelos de extinción de manera natural. A su vez, los grupos fueron luego subdivididos en dos subgrupos para realizar pruebas de extinción y recaída. Se procedió a medir las masas cerebrales del núcleo accumbens para la extracción total de proteína. Se realizó una electroforesis bidimensional para determinar manchas proteicas diferenciales. Estas proteínas diferenciales fueron entonces sometidas a enzimólisis e identificadas mediante espectrografía de masa. RESULTADOS: Las proteínas fueron clasificadas como proteína de unión a ácidos grasos, isoforma beta de la subunidad catalítica serinatreonina proteína fosfatasa 2A, isoforma alfa de la subunidad catalítica serinatreonina proteína fosfatasa 2A, subunidad gamma subunidad B" de la serinatreonina proteína fosfatasa 2A, o la proteína CDC37 cochaperona 90 de choque térmico. CONCLUSIÓN: Se detectaron cambios significativos en cinco proteínas entre la extinción y la recaída. Estas proteínas están correlacionadas con la fosforilación y el ciclo del ácido tricarboxílico.
Descritores: Proteínas de Choque Térmico HSP90/metabolismo
Proteínas de Ligação a Ácido Graxo/metabolismo
Extinção Psicológica/fisiologia
Proteína Fosfatase 2/metabolismo
Dependência de Morfina/metabolismo
Núcleo Accumbens/metabolismo
-Ratos
Reforço Psicológico
Ratos Sprague-Dawley
Proteoma
Limites: Animais
Masculino
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Estudo Comparativo
Responsável: BR1.1 - BIREME


  3 / 72 LILACS  
              first record previous record next record last record
seleciona
para imprimir
Fotocópia
Texto completo SciELO Chile
Texto completo
Id: biblio-950726
Autor: Rahmad, Norasfaliza; Al-Obaidi, Jameel R; Rashid, Noraswati Mohd Nor; Zean, Ng Boon; Yusoff, Mohd Hafis Yuswan Mohd; Shaharuddin, Nur Syahidah; Jamiland, Nor Azreen Mohd; Saleh, Norihan Mohd.
Título: Comparative proteomic analysis of different developmental stages of the edible mushroom Termitomyces heimii
Fonte: Biol. Res;47:1-8, 2014. ilus, graf, tab.
Idioma: en.
Projeto: Ministry of Science Technology and Innovation.
Resumo: BACKGROUND: Termitomyces heimii is a basidiomycete fungus that has a symbiotic relationship with termites, and it is an edible mushroom with a unique flavour and texture. T. heimii is also one of the most difficult mushrooms to cultivate throughout the world. Little is known about the growth and development of these mushrooms, and the available information is insufficient or poor. The purpose of this study was to provide a base of knowledge regarding the biological processes involved in the development of T. heimii. The proteomic method of 2 dimensional difference gel electrophoresis 2D-DIGE was used to determine and examine the protein profiles of each developmental stage (mycelium, primordium and fruiting body). Total proteins were extracted by TCA-acetone precipitation. RESULTS: A total of 271 protein spots were detected by electrophoresis covering pH 3 - 10 and 10 - 250 kDa. Selected protein spots were subjected to mass spectrometric analyses with matrix-assisted laser desorption/ionisation (MALDI TOF/TOF). Nineteen protein spots were identified based on peptide mass fingerprinting by matching peptide fragments to the NCBI non-redundant database using MASCOT software. The 19 protein spots were categorised into four major groups through KEGG pathway analysis, as follows: carbohydrate metabolism, energy metabolism, amino acid metabolism and response to environmental stress. CONCLUSIONS: The results from our study show that there is a clear correlation between the changes in protein expression that occur during different developmental stages. Enzymes related to cell wall synthesis were most highly expressed during fruiting body formation compared to the mycelium and primordial stages. Moreover, enzymes involved in cell wall component degradation were up-regulated in the earlier stages of mushroom development.
Descritores: Proteoma/isolamento & purificação
Termitomyces/crescimento & desenvolvimento
Termitomyces/química
-Precipitação Química
Espectrometria de Massas
Micélio/metabolismo
Bases de Dados de Proteínas
Carpóforos/metabolismo
Eletroforese em Gel Diferencial Bidimensional
Corantes Fluorescentes
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


  4 / 72 LILACS  
              first record previous record next record last record
seleciona
para imprimir
Fotocópia
Texto completo
Id: biblio-1052045
Autor: Zhao, Xiaobo; Li, Chunjuan; Yan, Caixia; Wang, Juan; Yuan, Cuiling; Zhang, Hao; Shan, Shihua.
Título: Transcriptome and proteome analyses of resistant preharvest peanut seed coat in response to Aspergillus flavus infection
Fonte: Electron. j. biotechnol;39:82-90, may. 2019. graf, ilus.
Idioma: en.
Projeto: Taishan Scholar Project of Shandong Province, China; . Agro-industry Technology Research System of Shandong Province, China; . Fine Breeding Project of Shandong Province, China; . Agricultural Scientific and Technological Innovation Project of Shandong Academy of Agricultural Sciences, China.
Resumo: BACKGROUND: The infection of peanut (Arachis hypogaea L.) seed coat by the pathogenic fungus Aspergillus flavus has highly negative economic and health impacts. However, the molecular mechanism underlying such defense response remains poorly understood. This study aims to address this issue by profiling the transcriptomic and proteomic changes that occur during the infection of the resistant peanut cultivar J11 by A. flavus. RESULTS: Transcriptomic study led to the detection of 13,539 genes, among which 663 exhibited differential expression. Further functional analysis found the differentially expressed genes to encode a wide range of pathogenesis- and/or defense-related proteins such as transcription factors, pathogenesis-related proteins, and chitinases. Changes in the expression patterns of these genes might contribute to peanut resistance to A. flavus. On the other hand, the proteomic profiling showed that 314 of the 1382 detected protein candidates were aberrantly expressed as a result of A. flavus invasion. However, the correlation between the transcriptomic and proteomic data was poor. We further demonstrated by in vitro fungistasis tests that hevamine-A, which was enriched at both transcript and protein levels, could directly inhibit the growth of A. flavus. Conclusions: The results demonstrate the power of complementary transcriptomic and proteomic analyses in the study of pathogen defense and resistance in plants and the chitinase could play an important role in the defense response of peanut to A. flavus. The current study also constitutes the first step toward building an integrated omics data platform for the development of Aspergillus-resistant peanut cultivars
Descritores: Arachis/genética
Proteoma/análise
Transcriptoma
-Arachis/microbiologia
Aspergillus flavus/fisiologia
Sementes/genética
Expressão Gênica
Quitinases
Aflatoxinas
Resistência à Doença/genética
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
RNA-Seq
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


  5 / 72 LILACS  
              first record previous record next record last record
seleciona
para imprimir
Fotocópia
Texto completo SciELO Brasil
Texto completo
Id: biblio-888838
Autor: Cotinguiba, F; López, S N; Budzinski, I G F; Labate, C A; Kato, M J; Furlan, M.
Título: Proteomic profile of Piper tuberculatum (Piperaceae) / Perfil proteômico e metabólico de Piper tuberculatum (Piperaceae)
Fonte: Braz. j. biol;78(1):117-124, Feb. 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: FAPESP; . FAPESP.
Resumo: Abstract Piper tuberculatum (Piperaceae) is a species that accumulates especially amides as secondary metabolites and several biological activities was previously reported. In this article, we report a proteomic study of P. tuberculatum. Bidimensional electrophoresis (2D SDS-PAGE) and mass spectrometry (ESI-Q-TOF) were used in this study. Over a hundred spots and various peptides were identified in this species and the putative functions of these peptides related to defense mechanism as biotic and abiotic stress were assigned. The information presented extend the range of molecular information of P. tuberculatum.

Resumo Piper tuberculatum (Piperaceae) é uma espécie que acumula especialmente amidas como metabólitos secundários e diversas atividades biológicas dessa espécie foram relatadas anteriormente. No presente artigo, relatamos um estudo proteômico dessa espécie. Eletroforese bidimensional (2D SDS-PAGE) e espectrometria de massas (ESI-Q-TOF) foram utilizadas nesse estudos. Mais de cem spots e vários peptídeos foram identificados nesta espécie e as funções putativas desses peptídeos relacionadas a mecanismo de defesa como estresse biótico e abiótico foram atribuídos. As informações apresentadas ampliam a gama de informações moleculares dessa espécie.
Descritores: Proteínas de Plantas/análise
Proteoma/análise
Piper/química
-Proteínas de Plantas/fisiologia
Proteínas de Plantas/química
Eletroforese em Gel Bidimensional
Proteoma/fisiologia
Proteoma/química
Espectrometria de Massas por Ionização por Electrospray
Piper/fisiologia
Piper/metabolismo
Proteômica
Responsável: BR1.1 - BIREME


  6 / 72 LILACS  
              first record previous record next record last record
seleciona
para imprimir
Fotocópia
Texto completo SciELO Saúde Pública
Texto completo
Id: lil-688044
Autor: Batista-Duharte, Alexander; Téllez, Bruno; Tamayo, Maybia; Portuondo, Deivys; Cabrera, Osmir; Sierra, Gustavo; Pérez, Oliver.
Título: Identificación In Silico del mimetismo molecular entre Epitopes T de Neisseria meningitidis B y el proteoma humano / In Silico identification of molecular mimicry between T-Cell Epitopes of Neisseria meningitidis B and the human proteome
Fonte: Rev. peru. med. exp. salud publica;30(3):441-445, jul.-sep. 2013. ilus, graf, tab.
Idioma: es.
Resumo: El objetivo del estudio fue determinar los epítopes T de cuatro de las proteínas antigénicas más frecuentes de la membrana externa de Neisseria meningitidis B e identificar los sitios más relevantes donde existe mimetismo molecular para estos epítopes en seres humanos. Para ello se realizó un estudio in silico (estudios que usan herramientas bioinformáticas) usando las bases de datos SWISS-PROT/TrEMBL SYFPEITHI y FASTA, las cuales se emplearon para la determinación de las secuencias proteicas, la predicción de los epítopes T CD4 y CD8, y la determinación del mimetismo molecular en humanos, respectivamente. Se encontró similitud molecular en varias proteínas humanas presentes en diferentes órganos y tejidos, entre ellos: hígado, piel y epitelios, cerebro, sistema linfático y testículos, destacando las encontradas en estos últimos, ya que ellas mostraron la frecuencia más alta de secuencias miméticas. Este hallazgo ayuda a comprender el éxito de N. meningitidis B para colonizar tejidos humanos, el fracaso de ciertas vacunas contra esta bacteria e incluso ayuda a explicar posibles reacciones autoimmunes asociadas a la infección o vacunación.

The objective of the study was to determine the T-cell epitopes of four of the most frequent antigenic proteins of the outer membrane of Neisseria meningitidis B, and to identify the most relevant sites for molecular mimicry with T-cell epitopes in humans. In order to do so, an in silico study -a type of study that uses bioinformatic tools- was carried out using SWISS-PROT/TrEMBL, SYFPEITHI and FASTA databases, which helped to determine the protein sequences, CD4 and CD8 T-cell epitope prediction, as well as the molecular mimicry with humans, respectively. Molecular similarity was found in several human proteins present in different organs and tissues such as: liver, skin and epithelial tissues, brain, lymphatic system and testicles. Of these, those found in testicles were more similar, showing the highest frequency of mimetic sequences. This finding shed light on the success of N. meningitidis B to colonize human tissues and the failure of certain vaccines against this bacterium, and it even helps to explain possible autoimmune reactions associated with the infection or vaccination.
Descritores: Antígenos de Bactérias/imunologia
Simulação por Computador
Epitopos de Linfócito T/imunologia
Mimetismo Molecular
Neisseria meningitidis Sorogrupo B/imunologia
Proteoma
Limites: Humanos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


  7 / 72 LILACS  
              first record previous record next record last record
seleciona
para imprimir
Fotocópia
Texto completo SciELO Brasil
Texto completo
Id: biblio-839334
Autor: Marques, Viviane Figueira; Motta, Cássia Couto da; Soares, Bianca da Silva; Melo, Dayanne Araújo de; Coelho, Shana de Mattos de Oliveira; Coelho, Irene da Silva; Barbosa, Helene Santos; Souza, Miliane Moreira Soares de.
Título: Biofilm production and beta-lactamic resistance in Brazilian Staphylococcus aureus isolates from bovine mastitis
Fonte: Braz. j. microbiol;48(1):118-124, Jan.-Mar. 2017. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: CNPq; . Foundation for Research Support in the State of Rio de Janeiro.
Resumo: Abstract Staphylococcus spp. play an important role in the etiology of bovine mastitis. Staphylococcus aureus is considered the most relevant species due to the production of virulence factors such as slime, which is required for biofilm formation. This study aimed to evaluate biofilm production and its possible relation to beta-lactamic resistance in 20 S. aureus isolates from bovine mastitic milk. The isolates were characterized by pheno-genotypic and MALDI TOF-MS assays and tested for genes such as icaA, icaD, bap, agr RNAIII, agr I, agr II, agr III, and agr IV, which are related to slime production and its regulation. Biofilm production in microplates was evaluated considering the intervals determined along the bacterial growth curve. In addition, to determine the most suitable time interval for biofilm analysis, scanning electron microscopy was performed. Furthermore, genes such as mecA and blaZ that are related to beta-lactamic resistance and oxacillin susceptibility were tested. All the studied isolates were biofilm producers and mostly presented icaA and icaD. The Agr type II genes were significantly prevalent. According to the SEM, gradual changes in the bacterial arrangement were observed during biofilm formation along the growth curve phases, and the peak was reached at the stationary phase. In this study, the penicillin resistance was related to the production of beta-lactamase, and the high minimal bactericidal concentration for cefoxitin was possibly associated with biofilm protection. Therefore, further studies are warranted to better understand biofilm formation, possibly contributing to our knowledge about bacterial resistance in vivo.
Descritores: Infecções Estafilocócicas/microbiologia
Staphylococcus aureus/efeitos dos fármacos
Staphylococcus aureus/fisiologia
Biofilmes
Resistência beta-Lactâmica
Mastite Bovina/microbiologia
Antibacterianos/farmacologia
-Staphylococcus aureus/ultraestrutura
Proteínas de Bactérias/genética
Bovinos
Testes de Sensibilidade Microbiana
Transativadores/genética
Proteoma
Fatores de Virulência/genética
Proteômica/métodos
Estudos de Associação Genética
Limites: Animais
Feminino
Responsável: BR1.1 - BIREME


  8 / 72 LILACS  
              first record previous record next record last record
seleciona
para imprimir
Fotocópia
Texto completo
Texto completo
Id: biblio-1049822
Autor: Oliveira, Duilio Rodrigues de.
Título: Caracterização funcional de sistemas de dois componentes em Xanthomonas citri / Functional characterization of two-component systems in Xanthomonas citri.
Fonte: São Paulo; s.n; 2019. 123 p. graf, tab.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Instituto de Química para obtenção do grau de Mestre.
Resumo: Xanthomonas citri subsp. citri, é uma bactéria pertencente à classe das Gamaproteobactérias, fitopatogênica, que exibe uma especificidade patógeno-hospedeiro extremamente alta. X. citri infecta plantas do gênero Citrus, causando o cancro cítrico, uma doença destrutiva encontrada em cultivos ao redor do mundo. Esta bactéria apresenta em seu genoma 34 genes que codificam proteínas relacionadas com o metabolismo do segundo mensageiro c-di-GMP. Em geral, níveis elevados de c-di-GMP favorecem a sessilidade e a produção de exopolissacarídeos, enquanto níveis mais baixos resultam em maior motilidade e aumento na dispersão do biofilme. Com o intuito inicial de buscar novos alvos de X. citri que dependessem dos níveis intracelulares desse segundo mensageiro, foram analisados os proteomas de linhagens mutantes em diguanilato ciclases específicas. Nas análises proteômicas por eletroforese bidimensional foram identificadas 15 proteínas diferencialmente expressas presentes em mais de um dos proteomas dos mutantes analisados. Entre estas, duas proteínas reguladoras de resposta e preditas de participar de sistemas de dois componentes, XAC0834 e XAC3443, foram encontradas sendo mais expressas em mutantes que apresentavam fenótipo de alto c-di-GMP; enquanto uma proteína hipotética provavelmente presente na membrana, XAC3657, estava mais expressa em linhagens com fenótipos relacionados a baixos níveis de c-di-GMP. Por meio de uma análise por qRT-PCR foi verificado que os níveis de mRNA para XAC0834 e XAC3443 não variam entre as linhagens e, portanto, a diferença nos níveis de expressão destas proteínas deve ocorrer póstranscricionalmente. Como os sistemas de dois componentes e proteínas de membrana são importantes para a adaptação das bactérias a diferentes condições ambientais, o objetivo do presente trabalho foi a caracterização funcional de XAC0834, XAC3433 e XAC3657, com maiorênfase em XAC0834 e na provável proteína sensora cognata, XAC0835, de forma a contribuir para a melhor compreensão dos processos de regulação da virulência de bactérias. Na análise da organização gênica dos genes que codificam estas proteínas, foi verificado que os genes XAC0834 e XAC0835 formam um operon, juntamente com a tioesterase XAC0833 e, portanto, o nível transcricional destes genes ocorre pelos mesmos reguladores, apoiando a hipótese de se tratarem de um sistema de dois componentes; assim como os genes XAC3442 e XAC3443. Utilizando uma linhagem mutante em XAC0834, mostramos que esta proteína impacta positivamente a motilidade sliding e a formação de biofilme, e tem efeito contrário no crescimento de X. citri em meio rico 2xTY e na motilidade twitching. Como estes fenótipos são modulados por c-di-GMP, é possível que a deleção deste gene altere significativamente os níveis de c-di-GMP nas células. Além disto, foi verificado que as proteínas XAC0835, XAC3443 e XAC3657 não afetam a motilidade sliding, mas, individualmente, XAC0835 é importante para a formação de biofilme; XAC3657 afeta negativamente o crescimento de X. citri em meio rico 2xTY; e XAC3443 afeta negativamente a motilidade twitching. Na análise do transcritoma da superexpressão de XAC0834, foi observado que havia aumento na expressão de genes relacionados ao sistema de secreção do tipo IV e na montagem do pilus do tipo IV, em comparação com a linhagem selvagem, o que pode estar relacionado aos fenótipos observados. Este trabalho forneceu subsídios importantes para a compreensão do papel fisiológico do sistema de dois componentes XAC0834/XAC0835, assim como do regulador de resposta XAC3443 e da proteína hipotética, XAC3657, em X. citri, o que pode contribuir para o entendimento da relação de c-di-GMP com os sistemas de dois componentes

Xanthomonas citri subsp. citri, is a phytopathogenic Gammaproteobacteria, with extremely high pathogen-host specificity. X. citri infects plants of the genus Citrus, causing citrus canker, a destructive disease found in crops around the world. The genome of X. citri pv. citri 306 (XAC 306) contains 34 genes encoding proteins related to the second messenger c-di-GMP metabolism. In general, high levels of c-di-GMP favor the sessility and exopolysaccharide production, whereas lower levels result in greater motility and increased biofilm dispersion. In order to initially search for new X. citri targets that depend on the intracellular levels of this second messenger, the proteomes of specific diguanylate cyclase mutant strains were analyzed by two-dimensional electrophoresis. Fifteen differentially expressed proteins present in more than one of the mutant proteomes compared to wild type were identified. Among these, two proteins predicted to participate as response regulators in two-component systems, XAC0834 and XAC3443, were found to be more expressed in mutants with high c-di-GMP phenotypes; whereas a hypothetical membrane protein, XAC3657, was more expressed in strains with low cdi-GMP-related phenotypes. Relative mRNA levels for XAC0834 and XAC3443, as determined by qRT-PCR, do not vary among the analyzed strains, suggesting post-transcriptional regulation. Because two-component systems and membrane proteins are important for the adaptation of bacteria to different environmental conditions, the aim of this work was the functional characterization of XAC0834, XAC3433 and XAC3657, with greater emphasis on XAC0834 and its probable cognate sensor protein, XAC0835, contributing to a better understanding of the processes of bacterial virulence regulation. Genes XAC0834 and XAC0835 form an operon, together with the XAC0833 coding for a thioesterase, suggesting that they are co-regulated, aswell as the XAC3442 and XAC3443 genes. Using a mutant strain in XAC0834, we show that this protein positively impacts sliding motility and biofilm formation and has the opposite effect on X. citri growth in rich medium and twitching motility. Because these phenotypes are modulated by c-di-GMP, deletion of this gene may alter cellular c-di-GMP levels. In addition, we found that XAC0835, XAC3443 and XAC3657 proteins do not affect sliding motility, but XAC0835 is important for biofilm formation; XAC3657 negatively affects X. citri growth in rich medium; and XAC3443 negatively affects twitching motility. The RNA-seq transcriptome of X. citri overexpressing XAC0834 was compared to the control strain, and there was an increase in the expression of genes for the type IV secretion system and the assembly of the type IV pilus, which may be related to the observed phenotypes. This work provided important insights for understanding the physiological role of the XAC0834/XAC0835 two-component system as well as the XAC3443 response regulator and the hypothetical protein XAC3657, in X. citri which may contribute to the understanding of the relationship of c- di-GMP with two-component systems
Descritores: Xanthomonas/metabolismo
Citrus/classificação
-Biofilmes
Proteoma/análise
Biologia Molecular
Responsável: BR40.1 - DBD - Divisão de Biblioteca e Documentacão do Conjunto das Químicas
BR40.1; T574.88, O48cf. 30100026383-Q


  9 / 72 LILACS  
              first record previous record next record last record
seleciona
para imprimir
Fotocópia
Texto completo
Texto completo
Id: biblio-966230
Autor: Rao, Junfeng; Lv, Weide; Yang, Jumei.
Título: Proteomic analysis of saffron (Crocus sativus L. ) grown under conditions of cadmium toxicity / Análise proteômica do açafrão (Crocus sativus L. ) cultivado sob condições de toxicidade por cádmio
Fonte: Biosci. j. (Online);33(3):713-720, may/jun. 2017. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: Cd is a highly detrimental global environmental pollutant. Plants have evolved complex defense mechanisms as an adaptation to against Cd toxicity. In this study, a pot experiment was performed to evaluate the protein profile of saffron in response to Cd stress. Fifteen proteins were found to be up-regulated in the leaves of plants under Cd stress and were primarily related to metabolism, signal transduction, stress and defense response and energy. Eleven proteins were found to be down-regulated following Cd treatment, including ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase (Rubisco), ferredoxin-NADP reductase, a 70 kDa heat shock-related protein and three protein synthesis-associated proteins. The results provide valuable insights regarding the molecular mechanism of saffron in response to Cd toxicity and the possible utilization of genetic resources in developing Cd tolerant/low-accumulation saffron.

O cádmio (Cd) é um poluente ambiental global altamente prejudicial. As plantas desenvolveram mecanismos de defesa complexos como uma adaptação contra a toxicidade por Cd. Neste estudo, realizou-se um experimento em vaso para avaliar o perfil proteico do açafrão em resposta ao estresse por Cd. Foi descoberto que quinze proteínas foram supra-reguladas (up-regulated) nas folhas de plantas sob estresse por Cd e foram principalmente relacionados ao metabolismo, transdução de sinal, estresse e resposta de defesa e energia. Foi descoberto ainda que onze proteínas foram infra-reguladas (down-regulated) após tratamento com Cd, incluindo ribulose bifosfato carboxilase oxigenase (RuBisCO), ferredoxina-NADP redutase, uma proteína relacionada com o choque térmico de 70 kDa e três proteínas associadas à síntese de proteínas. Os resultados fornecem informações valiosas sobre o mecanismo molecular do açafrão em resposta à toxicidade do Cd e a possível utilização de recursos genéticos no desenvolvimento de açafrão tolerante ao Cd e de baixa acumulação.
Descritores: Fotossíntese
Cádmio
Metais Pesados
Proteoma
Crocus
Responsável: BR396.1 - Biblioteca Central


  10 / 72 LILACS  
              first record previous record
seleciona
para imprimir
Fotocópia
Texto completo
Id: biblio-943109
Autor: Moreira, Douglas de Souza.
Título: Análise fosfoproteômica e genômica funcional de linhagens de Leishmaniaspp. sensíveis e resistentes ao antimônio trivalente.
Fonte: Belo Horizonte; s.n; 2017. 174 p.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Centro de Pesquisas René Rachou para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: A leishmaniose é um complexo de doenças com ampla diversidade epidemiológica e clínica causada por protozoários parasitas pertencentes ao gênero Leishmania. A fosforilação de proteínas é uma das modificações pós-traducionais mais estudadas, que está envolvida em diferentes eventos celulares em Leishmania. Na primeira parte desse estudo, nós realizamos uma análise fosfoproteômica comparativa de linhagens de L. braziliensis sensível e resistente ao antimônio trivalente (SbIII), utilizando eletroforese em gel diferencial bidimensional (2DDIGE) seguida por espectrometria de massas. Para investigar a abundância diferencial de fosfoproteínas associada com resposta ao estresse induzido à droga e mecanismos de resistência ao SbIII, nós comparamos amostras não tratadas e tratadas com SbIII de cada linhagem. Análises comparativas revelaram um total de 116 spots que apresentaram diferença estatisticamente significativa na abundância de fosfoproteínas, incluindo 11 e 34 spots especificamente correlacionados com estresse devido ao tratamento com a droga e resistência ao SbIII, respectivamente. Foram identificadas 48 proteínas diferentes distribuídas em sete categorias de processos biológicos. A categoria “enovelamento de proteínas/chaperonas e resposta ao estresse” está envolvida principalmente em resposta ao estresse com SbIII, enquanto que as categorias “antioxidante/detoxificação”, “processos metabólicos”, “processamento de RNA/DNA” e “biossíntese de proteínas” estão moduladas no caso de resistência à droga

Alinhamentos de sequências múltiplas foram realizados para validar a conservação de resíduos fosforilados em nove proteínas identificadas nesse estudo. Ensaios de Western blot foram conduzidos para validar a análise quantitativa do fosfoproteoma. Os resultados mostraram níveis de expressão diferencial de três fosfoproteínas nas linhagens analisadas. Na segunda parte desse estudo, análises de Western blot demonstraram que as proteínas nucleosídeo difosfato quinase b (NDKb) e fator de elongação 2 (EF2) estão mais e menos expressas, respectivamente, na linhagem de L. braziliensis resistente ao SbIII, corroborando nossos dados anteriores do fosfoproteoma. NDKb é responsável pela síntese de nucleosídeos trifosfatos e tem papel chave no metabolismo de purina em protozoários tripanossomatídeos. EF2 é um importante fator para síntese de proteínas

A superexpressão dos genes NDKb e EF2 nas espécies L. braziliensis e L. infantum foi realizada para investigar a contribuição destas proteínas no fenótipo de resistência ao SbIII. As linhagens de L. braziliensis superexpressoras de NDKb ou EF2 foram 1,6 a 2,1 vezes mais resistentes ao Sb III do que a linhagem sensível não transfectada. Em contraste, nenhuma diferença na susceptibilidade ao SbIII foi observada em L. infantum superexpressora de NDKb ou EF2. Ensaios de susceptibilidade mostraram que as linhagens de L. braziliensis superexpressoras de NDKb apresentaram elevada resistência à lamivudina, um agente antiviral, mas esta droga não alterou a atividade leishmanicida em associação com SbIII. O clone de L. braziliensis superexpressor de EF2 foi 1,2 vezes mais resistente aoinibidor da quinase de EF2 do que a linhagem sensível. Surpreendentemente, este inibidor aumentou o efeito leishmanicida do Sb III, sugerindo que esta associação pode ser uma estratégia valiosa para a quimioterapia das leishmanioses. Portanto, esse novo estudo nos permitiu determinar o perfil do fosfoproteoma de L. braziliensis, identificando alguns candidatos potenciais para redes bioquímicas ou de sinalização associadas com o fenótipo de resistência ao SbIII neste parasito. Além disso, nossos resultados representam o primeiro estudo de superexpressão dos genes NDKb e EF2 que demonstra um aumento de resistência ao SbIII em L. braziliensis, o que pode contribuir para o desenvolvimento de novas estratégias para o tratamento das leishmanioses
Descritores: Leishmania
Leishmaniose/tratamento farmacológico
Proteoma/análise
Limites: Humanos
Animais
Camundongos
Responsável: BR1719.1 - Biblioteca do CPqRR
BR1719.1; 616.936 4, M835a, 2017



página 1 de 8 ir para página                    
   


Refinar a pesquisa
  Base de dados : Formulário avançado   

    Pesquisar no campo  
1  
2
3
 
           



Search engine: iAH v2.6 powered by WWWISIS

BIREME/OPAS/OMS - Centro Latino-Americano e do Caribe de Informação em Ciências da Saúde