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Id: lil-672471
Autor: Heslop, OD; Smikle, MF; Vickers, IE; Christian, NA; Harvey, KM; Figueroa, JP; Brown, SE; Christie, CDC; Bain, B; Barton, EN.
Título: High genetic diversity in human immunodeficiency virus: type 1 in Jamaica / Elevada diversidad genética del virus de la inmunodeficiencia humana: tipo 1 en Jamaica
Fonte: West Indian med. j;58(3):195-200, June 2009. ilus.
Idioma: en.
Resumo: The subtypes of the human immunodeficiency virus - type 1 (HIV-1) strains from 54 HIV-1 - infected persons including 44 strains which were typed previously by heteroduplex mobility assay (HMA) were determined by DNA sequencing and phylogenetic analysis. Of 54 HIV- infected persons, 92.5% were infected with HIV-1 subtype B and 7.5% with other HIV-1 subtypes including subtypes D (3.7%), A (1.9%) and J (1.9%). In the phylogenetic analysis, the subtype A virus found in the sample clustered with subtype A reference strains and a circulating recombinant form (CRF) reference strain which originates in Central Africa and is circulating in Cuba indicating a close relationship between these viruses. There was 86% concordance between HMA and DNA sequencing in assigning subtype B viruses. For the non-B subtype viruses, there was less concordance between the two methods (67%). The results confirm the predominance of HIV-1 subtype B strains and the high genetic diversity of HIV-1 strains in circulation in Jamaica. The efficacies and some limitations of the HMA as a method of HIV-1 subtyping also were noted. It is important that the HIV/AIDS epidemic in Jamaica be monitored meticulously for possible expansions in non-B subtypes and the emergence of inter-subtype recombinant forms. We recommend that the more expensive DNA sequencing and phylogenetic analysis, including HIV-1 genotyping for antiretroviral drug resistance testing, be used as an adjunct to the more cost-effective HMA to track the HIV/AIDS epidemic in Jamaica.

Los subtipos de cepas de virus de la inmunodeficiencia humana-tipo-1 de 54 personas infectadas con el VIH-1, que incluyeron 44 cepas previamente clasificadas según su tipo mediante ensayo de movilidad de heterodúplex (HMA), fueron determinados mediante secuenciación de ADN y análisis filogenético. De 54 personas infectados con VIH, 92.5% estaban infectadas con VIH-1 subtipo B y 7.5% con otros subtipos de VIH-1 incluidos los subtipos D (3.7%), A (1.9%), J (1.9%). En el análisis filogenético, el virus de subtipo A hallado en la muestra, se agrupa con las cepas de referencias del subtipo A y una cepa de referencia de forma recombinante circulante (CRF), que tienesu origen en África Central y está circulando en Cuba, lo que indica una estrecha relación entre estos virus. Hubo un 86% de concordancia entre el HMA y la secuenciación del DNA en la asignación de virus de subtipo B. Para los virus de subtipo no B, hubo menos concordancia entre los dos métodos (67%). Los resultados confirman el predominio de las cepas del subtipo B del VIH-1, y la alta diversidad genética de las cepas del VIH-1 en circulación en Jamaica. También se señalaron las eficacias y algunas limitaciones del HMA como método de clasificación del VIH-1 en subtipos. Es importante monitorear meticulosamente la epidemia de VIH/SIDA en Jamaica, a fin de detectar posibles expansiones de subtipos no B y la aparición de formas recombinantes inter-subtipos. Recomendamos que por ser ambos métodos más costosos, tanto la secuenciación de ADN como el análisis filogenético - incluyendo el genotipado del VIH-1 para probar la resistencia antiretroviral del medicamento - sean usados como complementos del HMA, el cual es más costo-efectivo, para seguir de cerca el rastro de la epidemia VIH/SIDA en Jamaica.
Descritores: DNA Viral/química
Variação Genética
Infecções por HIV/virologia
HIV-1
-Análise Heteroduplex
HIV-1
Jamaica
Filogenia
Reprodutibilidade dos Testes
Análise de Sequência de DNA
Produtos do Gene env do Vírus da Imunodeficiência Humana/genética
Produtos do Gene gag do Vírus da Imunodeficiência Humana/genética
Limites: Humanos
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Cuba
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Id: lil-615550
Autor: Díaz Herrera, Dervel Felipe; Cruz Sui, Otto; Montano Tamayo, Lucy; Silva Cabrera, Eladio.
Título: Evaluación de la inmovilización de un péptido de gp36 de VIH-2 en membranas de nitrocelulosa / Evaluation of the immobilization of one HIV-2 gp36 peptide in nitrocellulose membrane
Fonte: Rev. cuba. med. trop;63(2):135-140, mayo.-ago. 2011.
Idioma: es.
Resumo: Introducción: la inmovilización de antígenos a soportes sólidos se utiliza para el desarrollo de diversos inmunoensayos. Una de las primeras tecnologías desarrolladas fue la adsorción de proteínas por aplicación directa sobre la nitrocelulosa. Objetivo: normalizar la inmovilización de un péptido sintético de la proteína de transmembrana gp36 del VIH-2, a un soporte de nitrocelulosa para fines diagnósticos y evaluar los parámetros de desempeño en un grupo de muestras de sueros con reactividad de interés conocida. Métodos: el péptido se inmovilizó de forma libre, conjugado a la albúmina de suero bovina (BSA) y a la hemocianina de lapa marina (KLH) como proteínas portadoras. Se analizaron los parámetros de inmovilización y se determinó la variante óptima. Con la variante escogida se evaluó la sensibilidad y especificidad diagnóstica frente a paneles de referencia del Laboratorio de Investigaciones del SIDA. La especificidad analítica se evaluó con muestras reactivas a VIH-1 y HTLV-I. Resultados: el análisis de las variantes de péptido inmovilizadas a las membranas de nitrocelulosa, demostró que el péptido gp36-BSA, fue el que logró la mayor diferenciación entre muestras positivas y negativas. Se obtuvo 100 por ciento de sensibilidad y 95,2 por ciento de especificidad diagnóstica, así como 100 por ciento de especificidad analítica. Conclusiones: el péptido gp36-BSA inmovilizado en membranas de nitrocelulosa es eficaz en el diagnóstico serológico del VIH-2, lo cual permitirá considerarlo para su empleo con fines diagnósticos en sistemas que utilicen como fase sólida la nitrocelulosa.

Introduction: antigen immobilization in solid supports is used for the development of several immunoassays. One of the first technologies developed was the protein adsorption by direct application to nitrocellulose. Objective: to standardize the immobilization of a synthetic peptide of the HIV-2 transmembrane protein gp36 to nitrocellulose support for diagnostic purposes and to evaluate the performance parameters in a group of serum samples with recognized interesting reactivity. Methods: the peptide was freely immobilized, conjugated to bovine serum albumin (BSA) and to keyhole limpet hemocyanin (KLH) as carrier proteins. Immobilization parameters were analyzed and then, the optimal immobilization alternative was determined. Using the chosen variant, the diagnostic sensitivity and specificity against reference panels of the AIDS Research Laboratory were evaluated. Analytical specificity was evaluated with reactive samples to HIV-1 and HTLV-I. Results: the analysis of the immobilized peptide variants to nitrocellulose membranes showed that the gp36 peptide-BSA was the one that succeeded in setting the greatest differentiation between positive and negative samples. There were observed 100 percent sensitivity, 95.2 percent diagnostic specificity and 100 percent analytical specificity. Conclusions: the gp36-BSA peptide immobilized on nitrocellulose membranes showed efficacy for the serological diagnosis of HIV-2, which will allow considering this peptide for diagnostic uses in systems with nitrocellulose based solid phase.
Descritores: Produtos do Gene env do Vírus da Imunodeficiência Humana/análise
-Colódio
Membranas Artificiais
Responsável: CU1.1 - Biblioteca Médica Nacional



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