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Id: biblio-1279478
Autor: Cruz, Vanessa P; Adachi, Aisni M.C. L; Oliveira, Pablo H; Ribeiro, Giovana S; Paim, Fabilene G; Souza, Bruno C; Rodrigues, Alexandre S. F; Vianna, Marcelo; Delpiani, Sergio M; Díaz de Astarloa, Juan Martín; Rotundo, Matheus M; Mendonça, Fernando F; Oliveira, Claudio; Lessa, Rosangela P; Foresti, Fausto.
Título: Genetic diversity in two threatened species of guitarfish (Elasmobranchii: Rhinobatidae) from the Brazilian and Argentinian coasts: an alert for conservation
Fonte: Neotrop. ichthyol;19(2):e210012, 2021. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: The guitarfishes Pseudobatos horkelii and Pseudobatos percellens meet the criteria for threatened status as Critically Endangered (CR) and Endangered (EN), respectively. Both species occur in the Southern Atlantic Ocean. Considering the lack of data on the genetic structure of these species, the present study evaluated the genetic variability and population structure of the P. horkelii and P. percellens in the southern region of Brazil and the northern coast of Argentina, based on sequences of mitochondrial DNA, Control Region (D-loop). Samples of P. horkelii (n = 135) were analyzed in six localities situated in Northern Argentina, along the Brazilian states' coast. The mean of nucleotide diversity was 0.0053, the ΦST was 0.4277 and demographic analysis of P. horkelii suggests the existence of stability of the populations, with D = 0.9929, FS = 2.0155, SSD = 0.0817, R = 0.2153. In P. percellens (n = 101) were analyzed from six Brazilian localities along the coast of Santa Catarina, Paraná, and São Paulo. The mean nucleotide diversity was 0.0014 and ΦST value of 0.2921, the demographic analysis indicates a high migration rate of P. percellens among the localities evaluated, with D = 0.5222, FS = 0.3528, SSD = 0.01785, R = 0.3890.(AU)

As raias violas Pseudobatos horkelii e Pseudobatos percellens, são listados como "Criticamente em Perigo" (CR) e "Em Perigo" (EN), respectivamente. Ambas as espécies ocorrem no Sul do Oceano Atlântico. Considerando a falta de dados sobre a estrutura genética dessas espécies, o presente estudo avaliou a variabilidade genética e a estrutura populacional de P. horkelii e P. percellens na região sudeste do Brasil e litoral norte da Argentina, com base em sequências de DNA mitocondrial, região de controle (D-loop). Amostras de 135 indivíduos de P. horkelii analisados em seis localidades, situadas no norte da Argentina e ao longo da costa dos estados brasileiros. A média da diversidade nucleotídica foi de 0.0053, o índice ΦST foi de 0.4277 e a análise demográfica de P. horkelii, indicou a existência de estabilidade das populações, com D = 0.9929, Fus = 2.0155, SSD = 0.0817, R = 0.2153. Em 101 exemplares de P. percellens, foram analisados em seis localidades brasileiras ao longo do litoral de Santa Catarina, Paraná e São Paulo. A diversidade nucleotídica média foi de 0.0014 e o valor ΦST de 0.2921, a análise demográfica indicou uma alta taxa de migração de P. percellens entre as localidades analisadas, com D = 0.5222, FS = 0.3528, SSD = 0.01785, R = 0.3890.(AU)
Descritores: Variação Genética
Rajidae
Estruturas Genéticas
-DNA Mitocondrial
Limites: Animais
Responsável: BR68.1 - Biblioteca Virginie Buff D'Ápice


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Id: biblio-1255022
Autor: Fraga, Angélica Godoy de; Lazzari, Virgínia Meneghini.
Título: Técnicas de substituição de DNA mitocondrial para reduzir a transmissão da Síndrome de Leigh / Mitochondrial DNA replacement techniques to reduce Leigh syndrome transmission
Fonte: Clin. biomed. res;41(1):65-74, 2021. ilus.
Idioma: pt.
Resumo: A Síndrome de Leigh (SL) é uma doença neuro-metabólica congênita, que faz parte do grupo das encefalopatias fatais, com progressão e morte dentro de 2 anos, em média. A SL é causada por mutações no DNA que causam alterações na geração de ATP celular pelas mitocôndrias. As mitocôndrias contêm seu próprio DNA (mtDNA) e, ao contrário do DNA nuclear, o mtDNA é herdado somente da mãe. Mulheres portadores de mutações causadoras da SL podem vivenciar experiências muito tristes ao tentarem realizar o sonho da maternidade. As técnicas de substituição de mtDNA mutado com mtDNA saudável de doadora, oferecem a essas mulheres a possibilidade de terem uma criança geneticamente relacionada sem a SL. O desenvolvimento e a aplicação clínica de terapias de substituição de mtDNA já são uma realidade, tendo o primeiro bebê gerado a partir da técnica nascido em 2016. Mas será que essas técnicas são seguras? Neste trabalho, revisamos a SL e algumas técnicas de substituição de mtDNA já aplicadas em humanos, que envolvem a transferência de pronúcleos de zigotos ou de fuso acromático de oócitos. Concluímos que, apesar dos resultados promissores, ainda é cedo para assegurar a aplicabilidade clínica de técnicas de substituição de mtDNA em seres humanos. (AU)

Leigh syndrome (SL) is a congenital neurometabolic disease included in the group of fatal encephalopathies, with progression and death within 2 years on average. SL is caused by mutations in the DNA that cause changes in the generation of cellular ATP by mitochondria. Mitochondria contain their own DNA (mtDNA) and, unlike nuclear DNA, mtDNA is inherited only from the mother. Women with SL mutations may experience mournful situations when attempting to fulfill the dream of motherhood. Techniques for replacing mutant mtDNA with healthy donor mtDNA provide these women with the possibility of having a genetically related child without SL. The development and clinical application of mtDNA replacement therapies is a reality, and the first baby generated using the technique was born in 2016. However, are these techniques safe? In this article, we review SL and some mtDNA replacement techniques that have been used in humans, which involve zygote pronuclear transfer or oocyte spindle transfer. We conclude that, despite the promising results, it is too early to ensure that mtDNA replacement techniques are clinically applicable to humans. (AU)
Descritores: DNA Mitocondrial/genética
Doença de Leigh
-Doenças Mitocondriais/terapia
Tipo de Publ: Revisão
Responsável: BR18.1 - Biblioteca FAMED/HCPA


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Id: biblio-838974
Autor: Valenzuela, Carlos Y.
Título: Selective intra-dinucleotide interactions and periodicities of bases separated by K sites: a new vision and tool for phylogeny analyses
Fonte: Biol. Res;50:3, 2017. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Direct tests of the random or non-random distribution of nucleotides on genomes have been devised to test the hypothesis of neutral, nearly-neutral or selective evolution. These tests are based on the direct base distribution and are independent of the functional (coding or non-coding) or structural (repeated or unique sequences) properties of the DNA. The first approach described the longitudinal distribution of bases in tandem repeats under the Bose-Einstein statistics. A huge deviation from randomness was found. A second approach was the study of the base distribution within dinucleotides whose bases were separated by 0, 1, 2... K nucleotides. Again an enormous difference from the random distribution was found with significances out of tables and programs. These test values were periodical and included the 16 dinucleotides. For example a high ¨positive¨ (more observed than expected dinucleotides) value, found in dinucleotides whose bases were separated by (3K + 2) sites, was preceded by two smaller ¨negative¨ (less observed than expected dinucleotides) values, whose bases were separated by (3K) or (3K + 1) sites. We examined mtDNAs, prokaryote genomes and some eukaryote chromosomes and found that the significant non-random interactions and periodicities were present up to 1000 or more sites of base separation and in human chromosome 21 until separations of more than 10 millions sites. Each nucleotide has its own significant value of its distance to neutrality; this yields 16 hierarchical significances. A three dimensional table with the number of sites of separation between the bases and the 16 significances (the third dimension is the dinucleotide, individual or taxon involved) gives directly an evolutionary state of the analyzed genome that can be used to obtain phylogenies. An example is provided.
Descritores: Filogenia
Sequência de Bases/genética
Genoma
Análise de Sequência de DNA/métodos
Nucleotídeos/genética
-Periodicidade
Células Procarióticas/química
Valores de Referência
Algoritmos
DNA Mitocondrial/genética
Distribuição de Qui-Quadrado
Colágeno/genética
HIV-1/genética
Evolução Molecular
Sequências de Repetição em Tandem
Estruturas Cromossômicas
Deriva Genética
Drosophila melanogaster/genética
Epistasia Genética/genética
Nucleotídeos/química
Limites: Humanos
Animais
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Id: biblio-950714
Autor: Valenzuela, Carlos Y.
Título: The structure of selective dinucleotide interactions and periodicities in D melanogaster mtDNA
Fonte: Biol. Res;47:1-12, 2014. tab.
Idioma: en.
Resumo: BACKGROUND: We found a strong selective 3-sites periodicity of deviations from randomness of the dinucleotide (DN) distribution, where both bases of DN were separated by 1, 2, K sites in prokaryotes and mtDNA. Three main aspects are studied. I) the specific 3 K-sites periodic structure of the 16 DN. II) to discard the possibility that the periodicity was produced by the highly nonrandom interactive association of contiguous bases, by studying the interaction of non-contiguous bases, the first one chosen each I sites and the second chosen J sites downstream. III) the difference between this selective periodicity of association (distance to randomness) of the four bases with the described fixed periodicities of base sequences. RESULTS: I) The 16 pairs presented a consistent periodicity in the strength of association of both bases of the pairs; the most deviated pairs are those where G and C are involved and the least deviated ones are those where A and T are involved. II) we found significant non-random interactions when the first nucleotide is chosen every I sites and the second J sites downstream until I=J=76. III) we showed conclusive differences between these internucleotide association periodicities and sequence periodicities. CONCLUSIONS: This relational selective periodicity is different from sequence periodicities and indicates that any base strongly interacts with the bases of the residual genome; this interaction and periodicity is highly structured and systematic for every pair of bases. This interaction should be destroyed in few generations by recurrent mutation; it is only compatible with the Synthetic Theory of Evolution and agrees with the Wright's adaptive landscape conception and evolution by shifting balanced adaptive peaks.
Descritores: DNA Mitocondrial/química
Drosophila melanogaster/genética
Epistasia Genética
Evolução Biológica
Nucleotídeos/química
-Fenótipo
Sequência de Bases/genética
Processos Estocásticos
Genoma
Nucleotídeos/genética
Limites: Animais
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Id: biblio-1178022
Autor: Ceretti Junior, Walter.
Título: Análise das relações taxonômicas e sistemáticas entre espécies de triatomíneos (Hemiptera: Reduviidae) de colônias mantidas pelo Serviço Especial de Saúde de Araraquara, inferida de seqüências de genes mitocondriais / Analysis of taxonomic and systematic relationships among species of Triatominae (hemiptera: reduviidae) from colonies maintened by Special Health Service of Araquara - SESA.
Fonte: São Paulo; s.n; 2008. 129 p.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Faculdade de Saúde Pública para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: Os insetos da subfamília Triatominae Jeannel, 1919 de Reduviidae (Hemiptera: Heteroptera: Reduviidae), também conhecidos como barbeiros, constituem um grupo amplamente distribuído pela região Neotropical que comporta hoje, 142 espécies ocorrentes e uma fóssil, distribuídas em 18 gêneros, são insetos hematófagos estritos em todas as fases da vida e reconhecidos vetores da Doença de Chagas. Essa enfermidade é considerada um dos mais importantes problemas de saúde na América Latina, com cerca de 12 a 14 milhões de indivíduos chagásicos, 60 milhões vivendo em risco e cerca de 20.000 caso/ano em 18 países da América do Sul e Central. Neste estudo foram analisadas seqüências de nucleotídeos dos genes 16S e CitB mitocondrial em populações de triatomíneos, dos gêneros Panstrongylus Berg, 1879, Rhodnius Stål, 1859 e Triatoma Laporte, 1832, mantidos em colônias no insetário Serviço Especial de Saúde de Araraquara (SESA) - SP, comparando-as com seqüências dos mesmos genes disponíveis no GenBank. Os fragmentos obtidos variaram de 311 a 317 pb (16S) e 393 pb (CitB). Observou-se baixa variação intra-específica entre as distâncias genéticas do gene 16S, enquanto o gene CitB mostrou-se mais polimórfico, podendo ser utilizado para estudos de populações geográficas. As seqüências geradas foram alinhadas com seqüências dos mesmos genes para outros triatomíneos e também de Arilus cristatus Linaeus, 1763 (Hemiptera: Reduviidae: Harpactorinae) (16S e CitB) e Oncerotrachelus sp. Stål, 1868 (Hemiptera: Reduviidae: Saicinae) (16S). As relações entre as espécies foram avaliadas pelos métodos de Distância (Neighbor Joining), Máxima Parcimônia e Máxima Verossimilhança. As análises de fragmentos para os dois genes demonstraram a parafilia de Rhodniini e Triatomini, confirmando resultados anteriores. Evidenciou-se a possível origem dos "Triatomas" Neotropicais a partir de derivações de Triatomas Neárticos, verificada pela estreita relação genética de Panstrongylus e Triatoma vitticeps (Stål, 1859) com o ramo Norte-Centro Americano de Triatoma; por meio das relações com T. protracta (Uhler, 1894), Dipetalogaster maxima (Uhler, 1894) e T. dimidiata Latreille, 1811. É dada a conhecer a primeira seqüência de bases nitrogenadas de fragmentos do gene 16S para Triatoma sherlocki Papa, Jurberg, Carcavallo, Cerqueira e Barata, 2002. Os resultados mostraram a utilidade de 16S e CitB como marcadores moleculares de espécies e de populações de triatomíneos e sua importância em questões de sistemática e taxonomia, no entanto, exigem um alto grau de segurança e controle de contaminação. Há necessidade de novos estudos envolvendo outros marcadores e o uso de caracteres sistemáticos clássicos de morfologia, ecologia e comportamento, indispensáveis para decisões sistemáticas adequadas uma vez, que teriam impacto não apenas sistemático mas, para as estratégias de controle. As colônias de triatomíneos do SESA revelaram-se importante fonte de material para estudos sistemáticos de triatomíneos, pois compreendem amostras significativas de várias populações triatomínicas da América, principalmente de espécies consideradas vetores principais do mal de Chagas como Triatoma infestans (Klug, 1834), Panstrongylus megistus (Burmeister, 1835), Rhodnius prolixus Stål, 1859 e Triatoma brasiliensis Neiva, 1911. Algumas questões sistemáticas relativas a origem e relacionamento filogenético dos triatomíneos continuam em aberto; novos reagrupamentos serão necessários para que a Subfamília continue válida; Análises mais completas, com a inclusão de representantes das tribos Alberproseniini, Bolboderini e Cavernicolini, são ainda necessárias.

The insects of the Triatominae subfamily Jeannel, 1919 of Reduviidae (Hemiptera: Heteroptera), also known as triatomine bugs, constitute a widely distributed group in the Neotropical region and including 142 current species and a fossil one, distributed in 18 genera. They are strict hematophagic insects in all phases of their life cicle and recognized vectors of the Chagas disease. This disease is considered one of the most serious Health problem in Latin America, with about 12 the 14 million of chagasic individuals, 60 million people living at risk and about 20,000 cases/year in 18 Central and South American countries. In this study mitocondrial 16S and CytB nucleotide sequences were analyzed in populations of triatomine bugs of the genera Panstrongylus Berg, 1879, Rhodnius Stål, 1859 and Triatoma Laporte, 1832 from colonies maintained in the Insectary of Special Health Service of Araraquara - SESA (acronym in Portuguese), Araraquara- SP, comparing them with sequences of the same available genes deposited in the GenBank. The obtained fragments varied from 311 to 317 bp (16S gene) and 393 pb (CytB). Low intra-specific variation among the genetic distance of the 16S gene, while the CytB gene revealed a higher polymorphism, being able to be used in geographic population studies. The generated sequences were aligned with sequences of the same genes for other triatomine bugs and also with Arilus cristatus Linaeus, 1763 (16S and CytB) and Oncerotrachelus sp Stål, 1868 (16S). The relationships among the species had been evaluated by the methods of Distance (Neighbor Joining), Maximum Parsimony and Maximum Likelihood. The analyses of fragments for the two genes had demonstrated the paraphily of Rhodniini and Triatomini, confirming previous results. It was hypothesized the possible origin of the Neotropical "Triatomas" from derivations of Nearctic triatomes, verified for the narrow genetic relation of Panstrongylus and Triatoma vitticeps (Stål, 1859) with the North-Center American branch of Triatoma by the relationships with T. protracta (Uhler, 1894), D. maxima (Uhler, 1894) and T. dimidiata Latreille, 1811. It is known the first sequence of nitrogen bases of fragments of the 16S gene for Triatoma sherlocki Papa, Jurberg, Carcavallo, Cerqueira e Barata, 2002. The results had shown the utility of 16S and CytB as markers of species and of triatomine populations and their importance in systematic and taxonomy questions. However, demands one high degree of security and control of contamination. There is a necessity of new studies involving other molecular markers and the use of classic systematic characters of morphology, ecology and behavior, indispensable for systematic decisions adjusted a time, that would have not only systematic impact but, for the control strategies. The colonies of triatomine of the SESA had shown important source of material for systematic studies of this kind of insect, since they include significant samples of triatomine populations of America, mainly of species considered the main vectors of the Chagas disease such as Triatoma infestans (Klug, 1834), Panstrongylus megistus (Burmeister, 1835), Rhodnius prolixus Stål, 1859 and Triatoma brasiliensis Neiva, 1911. Some systematic questions related to the origin and phylogenetic relationship of the triatomine bugs have kept opened; new regroupings will be necessary so that the Subfamily continues valid; more complete analyses, with the inclusion of representative members of the Alberproseniini, Bolboderini and Cavernicolini tribes, are still necessary.
Descritores: DNA Mitocondrial
Triatominae/classificação
Doença de Chagas
Vetores de Doenças
Insetos Vetores
Responsável: BR67.1 - CIR - Biblioteca - Centro de Informação e Referência


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Id: biblio-1011409
Autor: Kong, Xiangjun; Liu, Dongmei; Zheng, Jie; Khan, Aziz; Li, Bin; Diao, Yong; Zhou, Ruiyang.
Título: RNA editing analysis of ATP synthase genes in the cotton cytoplasmic male sterile line H276A
Fonte: Biol. Res;52:6, 2019. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: National Natural Science Foundation of China.
Resumo: BACKGROUND: Pollen development is an energy-consuming process that particularly occurs during meiosis. Low levels of adenosine triphosphate (ATP) may cause cell death, resulting in CMS (cytoplasmic male sterility). DNA sequence differences in ATP synthase genes have been revealed between the N- and S-cytoplasms in the cotton CMS system. However, very few data are available at the RNA level. In this study, we compared five ATP synthase genes in the H276A, H276B and fertile F1 (H276A/H268) lines using RNA editing, RNA blotting and quantitative real time-PCR (qRT-PCR) to explore their contribution to CMS. A molecular marker for identifying male sterile cytoplasm (MSC) was also developed. RESULTS: RNA blotting revealed the absence of any novel orf for the ATP synthase gene sequence in the three lines. Forty-one RNA editing sites were identified in the coding sequences. RNA editing showed that proteins had 32.43% higher hydrophobicity and that 39.02% of RNA editing sites had proline converted to leucine. Two new stop codons were detected in atp6 and atp9 by RNA editing. Real-time qRT-PCR data showed that the atp1, atp6, atp8, and atp9 genes had substantially lower expression levels in H276A compared with those in H276B. By contrast, the expression levels of all five genes were increased in F1 (H276A/H268). Moreover, a molecular marker based on a 6-bp deletion upstream of atp8 in H276A was developed to identify male sterile cytoplasm (MSC) in cotton. CONCLUSIONS: Our data substantially contributes to the understanding of the function of ATP synthase genes in cotton CMS. Therefore, we suggest that ATP synthase genes might be an indirect cause of cotton CMS. Further research is needed to investigate the relationship among ATP synthase genes in cotton CMS.
Descritores: Membrana Celular/genética
Edição de RNA
Adenosina Trifosfatases/genética
Gossypium/enzimologia
Infertilidade das Plantas/genética
-DNA Mitocondrial/genética
Reação em Cadeia da Polimerase
Regulação da Expressão Gênica de Plantas/genética
Gossypium/genética
Citoplasma/metabolismo
RNA Mitocondrial/genética
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Id: biblio-1146847
Autor: Quintero Ferrer, José Miguel; Pardo Govea, Tatiana Carolina; Borjas Fuentes, Lisbeth Beatriz.
Título: Frecuencia de heteroplasmia en las regiones hipervariables HVI y HVII del ADN Mitocondrial en una muestra de la población de Maracaibo, Venezuela / Frequency of heteroplasmy in HVI and HVII mitocondrial genome regions in a population sample of Maracaibo,Venezuela
Fonte: Rev. cienc. forenses Honduras (En línea);5(2):14-24, 2019. tab, graf.
Idioma: es.
Resumo: Justificación:El estudio de los polimorfismos de las regiones hipervariables I y II (HVI y HVII) del ADN mitocondrial (ADNmt) se ha convertido en una herramienta invaluable para la ciencia forense, ya que enalgunas ocasionesun determinadoindividuopuedepresentar más de un tipo de ADNmitocondrial,este fenómeno es conocido como Heteroplasmia. Lacoexistencia de dos o más poblaciones de ADNmt puedeocurrir enuna sola mitocondria, célula oindividuo, lo que puede aumentar la complejidad en la interpretación de los resultados de las experticias forenses. Objetivos:Analizar la frecuencia de la heteroplasmia en las regiones HVI y HVII del genoma mitocondrialen una muestra de la población de Maracaibo. Metodología:Seseleccionaron al azar 50 muestras de ADN de la población de Maracaibo, las regiones hipervariables se amplificaron mediantereacción en cadena de la polimerasa, posteriormente se secuenciaron mediante método de Sanger y los fragmentos se separaron por electroforesis capilar, se reportaron las diferencias con respecto a la secuencia de referencia de Cambridge. Resultados: El 26% de las muestras presentaron heteroplasmia en la región HVI, el 52%en la región HVII.Conclusiones:El hecho deaparecer laheteroplas-miaen una determinadasecuencianoinválida el uso del análisis del ADN mitocondrial con fines forenses, dependiendo de la complejidad del caso a peritar,la heteroplasmia puede ser de gran ayuda...(AU)
Descritores: DNA Mitocondrial
Técnica de Amplificação ao Acaso de DNA Polimórfico
-Genética Forense/métodos
Limites: Humanos
Masculino
Feminino
Responsável: HN1.1 - Biblioteca Médica Nacional


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Id: lil-794981
Autor: Jiang, Hua; Chen, Jia; Li, Ying; Lin, Peng-Fang; He, Jian-Guo; Yang, Bei-Bei.
Título: Prevalence of mitochondrial DNA mutations in sporadic patients with nonsyndromic sensorineural hearing loss / Prevalência de mutações no DNA mitocondrial em pacientes esporádicos com deficiência auditiva sensorioneural não sindrômica
Fonte: Braz. j. otorhinolaryngol. (Impr.);82(4):391-396, July-Aug. 2016. tab.
Idioma: en.
Projeto: Department of Public Health; . Science Technology Department.
Resumo: ABSTRACT INTRODUCTION: Several mitochondrial DNA mutations have been reported to be associated with nonsyndromic hearing loss in several families. However, little is known about the prevalence of these mutations in sporadic patients with nonsyndromic sensorineural hearing loss. OBJECTIVE: The purpose of our study was to investigate the incidence of these mitochondrial DNA mutations in such population. METHODS: A total of 178 sporadic patients with nonsyndromic sensorineural hearing loss were enrolled in this study. Genomic DNA was extracted from the peripheral blood sample. We employed the SNaPshot(r) sequencing method to detect five mitochondrial DNA mutations, including A1555G and A827G in 12S rRNA gene and A7445G, 7472insC, and T7511C in tRNASerUCN gene. Meanwhile, we used polymerase chain reaction and sequenced the products to screen GJB2 gene mutations in patients carrying mitochondrial DNA mutations. RESULTS: We failed to detect the presence of A1555G mutation in 12S rRNA gene, and of A7445G, 7472insC, T7511C mutations in tRNASerUCN gene in our population. However, we found that 6 patients (3.37%) were carriers of a homozygous A827G mutation and one of them also carried homozygous GJB2 235delC mutation. CONCLUSION: Our findings in the present study indicate that even in sporadic patients with nonsyndromic sensorineural hearing loss, mitochondrial DNA mutations might also contribute to the clinical phenotype.

Resumo Introdução: Diversas mutações do DNA mitocondrial tem sido descritas, em diferentes famílias, associadas à deficiência auditiva não sindrômica. No entanto, pouco se sabe sobrea prevalência dessas mutações em pacientes esporádicos com deficiência auditiva sensorioneural não sindrômica. Objetivo: A finalidade do nosso estudo foi investigar a incidência dessas mutações no DNA mitocondrial nessa população. Método: No total, 178 pacientes esporádicos com deficiência auditiva sensorioneural não sindrômica foram recrutados para participação no estudo. O DNA genômico foi extraído de amostra, de sangue periférico. Utilizamos o método de sequenciamento SNaPshot(r) para detecção de cinco mutações do DNA mitocondrial: A1555G e A827G no gene 12S rRNA e A7445G, 7472insCe T7511C no gene tRNASerUCN. Paralelamente, utilizamos a reação de polimerase em cadeia e sequenciamos os produtos para triagem das mutações no gene GJB2 nos pacientes portadores de mutações no DNA mitocondrial. Resultados: Em nossa população, não conseguimos detectar a presença da mutação A1555G no gene 12S rRNA e nem as mutações A7445G, 7472insC e T7511C no gene tRNASerUCN. Entretanto, constatamos que seis pacientes (3,37%) eram portadores da mutação homozigota A827G; e um deles também portava a mutação homozigota GJB2 235delC. Conclusão: Nossos achados no presente estudo indicam que, mesmo em pacientes esporádicos com deficiência auditiva sensorioneural não sindrômica, as mutações do DNA mitocondrial também podem contribuir para o fenótipo clínico.
Descritores: DNA Mitocondrial/genética
RNA Ribossômico/genética
Perda Auditiva Neurossensorial/genética
Mutação/genética
-Índice de Gravidade de Doença
Dados de Sequência Molecular
Sequência de Bases
Reação em Cadeia da Polimerase
Prevalência
Limites: Humanos
Masculino
Feminino
Lactente
Pré-Escolar
Criança
Adolescente
Adulto
Adulto Jovem
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: lil-795074
Autor: Csordas, Bárbara Guimarães; Garcia, Marcos Valério; Cunha, Rodrigo Casquero; Giachetto, Poliana Fernanda; Blecha, Isabella Maiumi Zaidan; Andreotti, Renato.
Título: New insights from molecular characterization of the tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus in Brazil / Novos pontos de vista sobre a caracterização molecular em carrapatos Rhipicephalus (Boophilus) microplus, no Brasil
Fonte: Rev. bras. parasitol. vet;25(3):317-326, July-Sept. 2016. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Abstract The Rhipicephalus (Boophilus) microplus complex currently consists of five taxa, namely R. australis, R. annulatus, R. (B.) microplus clade A sensu, R. microplus clade B sensu, and R. (B.) microplus clade C sensu. Mitochondrial DNA-based methods help taxonomists when they are facing the morpho-taxonomic problem of distinguishing members of the R. (B.) microplus complex. The purpose of this study was to perform molecular characterization of ticks in all five regions of Brazil and infer their phylogenetic relationships. Molecular analysis characterized 10 haplotypes of the COX-1 gene. Molecular network analysis revealed that haplotype H-2 was the most dispersed of the studied populations (n = 11). Haplotype H-3 (n = 2) had the greatest genetic differentiation when compared to other Brazilian populations. A Bayesian phylogenetic tree of the COX-1 gene obtained strong support. In addition, it was observed that the population of R. (B.) microplus haplotype H-3 exhibited diverging branches among the other Brazilian populations in the study. The study concludes that the different regions of Brazil have R. (B.) microplus tick populations with distinct haplotypes.

Resumo Carrapatos do complexo R. (B.) microplus se distribuem em cinco taxa: R. australis, R. annulatus, R. (B.) microplus clado A sensu R. microplus clado B sensue e R. (B.) microplus clado C sensu. Métodos baseados no DNA mitocondrial podem auxiliar taxonomistas quando há dificuldades em estabelecer diferenças morfológicas para distinguir membros do complexo R. (B.) microplus. O objetivo deste estudo foi a caracterização molecular e a inferência de relações filogenéticas em carrapatos de todas as cinco regiões geográficas do Brasil. Para o gene COX-1, a análise molecular caracterizou 10 haplótipos. Na análise molecular em rede foi observado que o haplótipo H-2 é o mais disperso entre as populações (n=11). O haplótipo H-3 (n=2) foi o que obteve maior diferenciação genética ao ser comparado com outras populações brasileiras. A árvore filogenética Bayesiana de gene COX-1 gerou suporte robusto e foi observado que a população de R. (B.) microplus haplótipo H-3 apresentou ramificação com divergência entre as outras populações brasileiras apresentadas neste estudo. Conclui-se que as populações brasileiras possuem diversidade haplotípica com divergência entre as diversas populações de R. (B.) microplus no Brasil.
Descritores: Filogenia
Rhipicephalus/classificação
Rhipicephalus/genética
-Brasil
DNA Mitocondrial
Teorema de Bayes
Limites: Animais
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: biblio-1042538
Autor: Matos, Andressa Maria Rorato Nascimento de; Lavorente, Fernanda Louise Pereira; Lorenzetti, Elis; Meira Filho, Mário Roberto Castro; Nóbrega, Daniela Farias da; Chryssafidis, Andreas Lazaros; Oliveira, Admilton Gonçalves de; Domit, Camila; Bracarense, Ana Paula Frederico Rodrigues Loureiro.
Título: Molecular identification and histological aspects of Renicola sloanei (Digenea: Renicolidae) in Puffinus puffinus (Procellariiformes): a first record / Identificação molecular e aspectos histológicos de Renicola sloanei (Digenea: Renicolidae) em Puffinus puffinus (Procellariiformes): primeiros registros
Fonte: Rev. bras. parasitol. vet;28(3):367-375, July-Sept. 2019. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Abstract Renicolids are parasites that inhabit the renal tubules and ureters of molluscivorous and piscivorous birds. Puffinus puffinus is a migratory seabird that was identified as the definitive host of Renicola spp. Studies focusing on the renicolid species and the resulting renal lesions are valuable for their association with causes of stranding in seabirds. The aim of this study was to identify the renicolid trematodes and evaluate the histological findings in two P. puffinus stranded on the coast of Paraná state, Brazil. The parasites were evaluated by histologic, ultrastructural and molecular assays, while tissue changes were analyzed by histologic methods. The morphological and morphometrical characteristics of the parasites, along with polymerase chain reaction and sequencing assays (ribosomal and mitochondrial regions), identified the species as Renicola sloanei. The results also suggest that this helminth can be the adult form of Cercaria pythionike. The dilation of collecting ducts was the main histological finding in the kidneys. In conclusion, R. sloanei was identified, and for the first time, P. puffinus was described as a host of this digenean inducing mild renal changes.

Resumo Renicolídeos são parasitos que habitam túbulos renais e ureteres de aves que se alimentam de moluscos e peixes. Puffinus puffinus, ave marinha migratória, foi registrada como hospedeiro definitivo de Renicola spp. Estudos relacionados com as espécies de renicolídeos e as lesões renais resultantes são importantes para o entendimento das causas de óbito de aves marinhas. O objetivo deste estudo foi identificar os trematódeos renicolídeos e avaliar os achados histológicos em dois P. puffinus encalhados no litoral do Estado do Paraná, Brasil. Os parasitos foram avaliados por ensaios histológicos, ultraestruturais e moleculares, enquanto as alterações teciduais foram analisadas por métodos histológicos. As características morfológicas e morfométricas dos parasitos, juntamente com a reação em cadeia da polimerase e sequenciamento (regiões ribossomal e mitocondrial), identificaram a espécie como Renicola sloanei. Os resultados também sugerem que este helminto pode ser a forma adulta de Cercaria pythionike. A dilatação dos ductos coletores foi o principal achado histológico renal. Em conclusão, R. sloanei foi identificado, e pela primeira vez P. puffinus foi descrito como hospedeiro deste digenético induzindo alterações renais discretas.
Descritores: Trematódeos/isolamento & purificação
Doenças das Aves/parasitologia
Aves/parasitologia
Rim/parasitologia
-Filogenia
Trematódeos/classificação
Trematódeos/genética
Trematódeos/ultraestrutura
DNA Mitocondrial/genética
DNA Ribossômico/genética
Análise de Sequência de DNA
DNA de Helmintos/genética
Limites: Animais
Responsável: BR1.1 - BIREME



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