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Id: lil-731304
Autor: Santos, Osmara Alves dos; Borges, Ana Luiza Vilela; Chofakian, Christiane Borges do Nascimento; Pirotta, Kátia Cibelle Machado.
Título: Determinants of emergency contraception non-use among women in unplanned or ambivalent pregnancies / Determinantes del no uso de la anticoncepción de emergencia entre mujeres con embarazo no planeado u ambivalente / Determinantes do não uso da anticoncepção de emergência entre mulheres com gravidez não planejada ou ambivalente
Fonte: Rev. Esc. Enferm. USP;48(spe):16-22, 08/2014. tab.
Idioma: en.
Projeto: CNPq.
Resumo: Objective To analyze the determinants of emergency contraception non-use among women in unplanned and ambivalent pregnancies. Method Cross-sectional study with a probabilistic sample of 366 pregnant women from 12 primary health care units in the city of São Paulo, Brazil. A multinomial logistic regression was performed, comparing three groups: women who used emergency contraception to prevent ongoing pregnancies (reference); women who made no use of emergency contraception, but used other contraceptive methods; and women who made no use of any contraceptive methods at all. Results Cohabitation with a partner was the common determinant of emergency contraception non-use. No pregnancy risk awareness, ambivalent pregnancies and no previous use of emergency contraception also contributed to emergency contraception non-use. Conclusion Apart from what is pointed out in the literature, knowledge of emergency contraception and the fertile period were not associated to its use. .

Objetivo Analizar los determinantes del no uso de la anticoncepción de emergencia entre las mujeres con embarazo no planeado o ambivalente. Método Estudio transversal en una muestra probabilística de 366 mujeres embarazadas de 12 Unidades Básicas de Salud de São Paulo. Mediante regresión logística multinomial, se comparó tres grupos de mujeres: aquellas que usaron la anticoncepción de emergencia para prevenir el embarazo en curso (referencia), aquellas que usaron algún método anticonceptivo, pero no la anticoncepción de emergência; y aquellas que no usaron ningún método. Resultados Los hallazgos mostraron que vivir com la pareja fue el determinante común del no uso de la anticoncepción de emergencia. No tener conciencia del riesgo de embarazo, estar en un embarazo ambivalente y nunca tener utilizado la anticoncepción de emergencia también fueron associados con su no uso para prevenir el embarazo en curso. Conclusión Contrariamente a lo que reporta la literatura, el conocimiento de la anticoncepción de emergencia y el período fértil no mostró asociación con el no uso. .

Objetivo Analisar os determinantes do não uso da anticoncepção de emergência entre mulheres com gravidez não planejada ou ambivalente. Método Estudo transversal com amostra probabilística de 366 gestantes de 12 Unidades Básicas de Saúde da cidade de São Paulo. Por meio de regressão logística multinomial, compararam-se três grupos de mulheres: as que usaram anticoncepção de emergência para prevenir a gravidez em curso (referência); as que usaram algum método contraceptivo, mas não anticoncepção de emergência; e as que não usaram nenhum método. Resultados Os achados mostraram que morar com o parceiro foi o determinante comum do não uso da anticoncepção de emergência. Não ter consciência do risco de engravidar, estar em uma gravidez ambivalente e nunca ter usado anticoncepção de emergência também foram associados ao seu não uso para prevenir a gravidez em curso. Conclusão Diferentemente do que relata a literatura, o conhecimento sobre anticoncepção de emergência e sobre o período fértil não mostrou qualquer associação ao não uso. .
Descritores: Proteínas de Ligação a DNA
Escherichia coli/genética
Mapeamento de Interação de Proteínas/métodos
Técnicas do Sistema de Duplo-Híbrido
-Bacteriófago lambda/genética
DNA Bacteriano/genética
RNA Polimerases Dirigidas por DNA/biossíntese
RNA Polimerases Dirigidas por DNA/genética
RNA Polimerases Dirigidas por DNA/fisiologia
Proteínas de Escherichia coli/biossíntese
Proteínas de Escherichia coli/genética
Proteínas de Escherichia coli/fisiologia
Escherichia coli/enzimologia
Genes Reporter/genética
Fosforilação
Plasmídeos/biossíntese
Plasmídeos/genética
Regiões Promotoras Genéticas/genética
RNA Bacteriano/genética
Proteínas Recombinantes de Fusão/biossíntese
Proteínas Recombinantes de Fusão/genética
Proteínas Recombinantes de Fusão/fisiologia
Proteínas Repressoras/biossíntese
Proteínas Repressoras/genética
Proteínas Repressoras/fisiologia
Transcrição Genética/genética
Transcrição Genética/fisiologia
Proteínas Virais/biossíntese
Proteínas Virais/genética
Proteínas Virais/fisiologia
Proteínas Virais Reguladoras e Acessórias
beta-Galactosidase/biossíntese
beta-Lactamases/biossíntese
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Machado, Rosangela Zacarias
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Id: biblio-1042463
Autor: Braga, Maria do Socorro Costa de Oliveira; Pereira, José Gomes; Fernandes, Simone de Jesus; Marques, Ingrid Carolinne Lopes; Jesus, Renata Passos de; Ferreira, Gleycianny Santos; Xavier, Daniele Rosa; Benevenute, Jyan Lucas; Machado, Rosangela Zacarias; André, Marcos Rogério.
Título: Molecular detection of Anaplasmataceae agents in Dasyprocta azarae in northeastern Brazil / Detecção molecular de agentes Anaplasmataceae em Dasyprocta azarae no nordeste do Brasil
Fonte: Rev. bras. parasitol. vet;27(1):98-104, Jan.-Mar. 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: FAPESP; . CNPq.
Resumo: Abstract Recently, the importance of wild-living rodents for maintenance of pathogens of the family Anaplasmataceae in the environment was investigated. These mammals play a role as reservoirs for these pathogens and act as hosts for the immature stages of tick vectors. The aim of the present study was to investigate the prevalence of Ehrlichia sp. and Anaplasma sp. in 24 specimens of Azara's agouti (Dasyprocta azarae) that had been trapped in the Itapiracó Environmental Reserve, in São Luís, Maranhão, northeastern Brazil, using molecular methods. Four animals (16.7%) were positive for Ehrlichia spp. in nested PCR assays based on the 16S rRNA gene. In a phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene, using the maximum likelihood method and the GTRGAMMA+I evolutionary model, Ehrlichia sp. genotypes detected in Azara's agoutis were found to be closely related to E. canis and to genotypes relating to E. canis that had previously been detected in free-living animals in Brazil. The present work showed the first molecular detection of Ehrlichia sp. in Azara's agoutis in Brazil.

Resumo Recentemente, a importância de roedores selvagens na manutenção de agentes Anaplasmataceae no ambiente tem sido investigada, haja visto o papel que tais mamíferos podem desempenhar como reservatórios para os patógenos e como hospedeiros para estágios imaturos dos carrapatos vetores. O presente estudo objetivou investigar a ocorrência de Ehrlichia sp. e Anaplasma sp. em 24 cotias (Dasyprocta azarae) capturadas na Reserva Ambiental de Itapiracó, em São Luís, Maranhão, nordeste do Brazil, utilizando métodos moleculares. Quatro animais (16,7%) mostraram-se positivos nos ensaios de nested PCR para Ehrlichia spp. baseados no gene 16S rRNA gene. Na análise filogenética baseda no gene 16S rRNA e utilizando o método de Máxima Verossimilhança e modelo evolutivo GTRGAMMA+I, os genótipos de Ehrlichia sp. detectados em cotias mostraram-se filogeneticamente relacionados às sequências de E. canis e outros genótipos relacionados a E. canis detectados previamente em animais selvagens no Brasil. O presente trabalho mostrou a primeira detecção molecular de Ehrlichia sp. em cotias no Brasil.
Descritores: Ehrlichia/isolamento & purificação
Dasyproctidae/microbiologia
Anaplasma/isolamento & purificação
-Brasil
RNA Bacteriano/análise
Técnicas de Diagnóstico Molecular
Limites: Animais
Masculino
Feminino
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Labruna, Marcelo Bahia
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Id: biblio-1057978
Autor: Jacinavicius, Fernando de Castro; Bassini-Silva, Ricardo; Muñoz-Leal, Sebastián; Welbourn, Cal; Ochoa, Ronald; Labruna, Marcelo Bahia; Barros-Battesti, Darci Moraes.
Título: Molecular detection of Rickettsia genus in chigger mites (Trombidiformes: Trombiculidae) collected on small mammals in southeastern brazilian / Detecção molecular do gênero Rickettsia em ácaros trombiculídeos (Trombidiformes: Trombiculidae) coletados em pequenos mamíferos do sudeste brasileiro
Fonte: Rev. bras. parasitol. vet;28(4):563-568, Oct.-Dec. 2019. tab.
Idioma: en.
Projeto: CNPq; . CNPq; . FAPESP; . CAPES.
Resumo: Abstract Chiggers are ectoparasites of vertebrates and may cause trombiculiasis or transmit pathogens to their hosts. Specimens collected from rodents and marsupials were morphologically identified as Herpetacarus hertigi, Eutrombicula tinami, Kymocta sp., Quadraseta brasiliensis, Quadraseta falconensis, Quadraseta flochi, Quadraseta mackenziei, Quadraseta pazca, Quadraseta trapezoides, Quadraseta sp., Serratacarus sp., and Trombewingia bakeri. These mites were submitted individually to molecular analyses for the detection of bacteria of the genus Coxiella, Hepatozoon and Rickettsia. Samples were positive to Rickettsia only. Obtained sequences for the gltA (350 pb) and ompA (488 pb) genes were identical to "Candidatus Rickettsia colombianensi", a species previously detected in ticks. In addition, molecular identification of mites based on 18S rDNA sequences are provided for H. hertigi, Kymocta sp., Q. brasiliensis, Q. pazca, Q. trapezoides, Quadraseta sp., and T. bakeri for the first time. This is the first report of the detection of a Rickettsia sp. in chigger mites collected on rodents in Brazil.

Resumo Os trombiculídeos são ectoparasitas de vertebrados e podem causar trombiculíase ou transmitir patógenos ao hospedeiro. Exemplares coletados em roedores e marsupiais foram identificados morfologicamente como Herpetacarus hertigi, Eutrombicula tinami, Kymocta sp., Quadraseta brasiliensis, Quadraseta falconensis, Quadraseta flochi, Quadraseta mackenziei, Quadraseta pazca, Quadraseta trapezoides, Quadraseta sp., Serratacarus sp. e Trombewingia bakeri. Estes ácaros foram submetidos individualmente à análise molecular para detecção de bactérias dos gêneros Coxiella, Hepatozoon e Rickettsia. Amostras foram positivas somente para Rickettsia. Sequências obtidas para os genes gltA (350 pb) e ompA (488 pb) foram idênticas à "Candidatus Rickettsia colombianensi", uma espécie anteriormente detectada em carrapatos. Além disso, foram fornecidas sequências de DNA 18S para identificação molecular de H. hertigi, Kymocta sp., Q. brasiliensis, Q. pazca, Q. trapezoides, Quadraseta sp. e T. bakeri. Este é o primeiro registro da detecção de Rickettsia em ácaros trombiculídeos coletados em roedores do Brasil.
Descritores: Rickettsia/genética
Roedores/parasitologia
Trombiculidae/microbiologia
Marsupiais/parasitologia
Infestações por Ácaros/veterinária
-Rickettsia/isolamento & purificação
RNA Bacteriano/genética
RNA Ribossômico 18S/genética
Reação em Cadeia da Polimerase
Limites: Animais
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Id: biblio-984009
Autor: Munir, I; Bano, A; Faisal, M.
Título: Impact of phosphate solubilizing bacteria on wheat (Triticum aestivum ) in the presence of pesticides / Impacto das bactérias solubilizantes de fosfato no trigo (Triticum aestivum ) na presença de pesticidas
Fonte: Braz. j. biol;79(1):29-37, Jan.-Mar 2019. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Abstract Three phosphate solubilizing bacteria were isolated and identified by 16S rRNA sequencing as Pseudomonas putida, Pseudomonas sp and Pseudomonas fulva . The strains were subjected to plant biochemical testing and all the PGPR attributes were checked in the presence of pesticides (chlorpyrifos and pyriproxyfen). The phosphate solubilizing index of strain Ros2 was highest in NBRIP medium i.e 2.23 mm. All the strains showed acidic pH (ranges from 2.5-5) on both medium i.e PVK and NBRIP. Strain Ros2 was highly positive for ammonia production as well as siderophore production while strain Rad2 was positive for HCN production. The results obtained by the strains Rad1, Rad2 and Ros2 for auxin production were 33.1, 30.67 and 15.38 µg ml-1, respectively. Strain Rad1 showed 16% increase in percentage germination in comparison to control in the presence of pesticide stress. Most promising results for chlorophyll content estimation were obtained in the presence of carotenoids upto 6 mgg-1 without stress by both strains Rad1 and Rad2. Study suggests that especially strain Ros2 can enhance plant growth parameters in the pesticide stress.

Resumo Três bactérias solubilizantes de fosfato foram isoladas e identificadas por seqüenciamento de rRNA 16S como Pseudomonas putida, Pseudomonas sp e Pseudomonas fulva. As estirpes foram submetidas a testes bioquímicos de plantas e todos os atributos PGPR foram verificados na presença de pesticidas (clorpirifos e piriproxifeno). O índice de solubilização de fosfato da estirpe Ros2 foi mais elevado no meio NBRIP, isto é, 2,23 mm. Todas as estirpes apresentaram um pH ácido (varia de 2,5-5) em ambos os meios, isto é PVK e NBRIP. A estirpe Ros2 foi altamente positiva para a produção de amoníaco, bem como a produção de sideróforos enquanto a estirpe Rad2 foi positiva para a produção de HCN. Os resultados obtidos pelas estirpes Rad1, Rad2 e Ros2 para a produção de auxina foram 33,1, 30,67 e 15,38 μg ml-1 , respectivamente. A deformação Rad1 mostrou aumento de 16% na germinação percentual em comparação com o controlo na presença de stress de pesticida. Os resultados mais promissores para a estimativa do teor de clorofila foram obtidos na presença de carotenóides até 6 mgg-1 sem estresse por ambas as cepas Rad1 e Rad2. Estudo sugere que especialmente a estirpe Ros2 pode melhorar parâmetros de crescimento de plantas no estresse de pesticidas.
Descritores: Fosfatos/metabolismo
Pseudomonas/fisiologia
Piridinas/administração & dosagem
Triticum/crescimento & desenvolvimento
Clorpirifos/administração & dosagem
Inseticidas/administração & dosagem
-Paquistão
Pseudomonas/efeitos dos fármacos
Triticum/metabolismo
Triticum/microbiologia
RNA Bacteriano/análise
RNA Ribossômico 16S/análise
Pseudomonas putida/efeitos dos fármacos
Pseudomonas putida/fisiologia
Análise de Sequência de RNA
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Id: lil-362559
Autor: Ramos, C. R. R; Abreu, P. A. E; Nascimento, A. L. T. O; Ho, P. L.
Título: A high-copy T7 Escherichia coli expression vector for the production of recombinant proteins with a minimal N-terminal His-tagged fusion peptide
Fonte: Braz. j. med. biol. res = Rev. bras. pesqui. méd. biol;37(8):1103-1109, Aug. 2004. ilus, tab.
Idioma: en.
Projeto: FAPESP; . CNPq; . Fundação Butantan.
Resumo: We report here the construction of a vector derived from pET3-His and pRSET plasmids for the expression and purification of recombinant proteins in Escherichia coli based on T7 phage RNA polymerase. The resulting pAE plasmid combined the advantages of both vectors: small size (pRSET), expression of a short 6XHis tag at N-terminus (pET3-His) and a high copy number of plasmid (pRSET). The small size of the vector (2.8 kb) and the high copy number/cell (200-250 copies) facilitate the subcloning and sequencing procedures when compared to the pET system (pET3-His, 4.6 kb and 40-50 copies) and also result in high level expression of recombinant proteins (20 mg purified protein/liter of culture). In addition, the vector pAE enables the expression of a fusion protein with a minimal amino-terminal hexa-histidine affinity tag (a tag of 9 amino acids using XhoI restriction enzyme for the 5'cloning site) as in the case of pET3-His plasmid and in contrast to proteins expressed by pRSET plasmids (a tag of 36 amino acids using BamHI restriction enzyme for the 5'cloning site). Thus, although proteins expressed by pRSET plasmids also have a hexa-histidine tag, the fusion peptide is much longer and may represent a problem for some recombinant proteins.
Descritores: Proteínas Recombinantes de Fusão
Escherichia coli
Vetores Genéticos
-RNA Bacteriano
Reação em Cadeia da Polimerase
Clonagem Molecular
Eletroforese em Gel de Poliacrilamida
Limites: Humanos
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Id: biblio-954614
Autor: Carvalho-Ramos, Isabel I; Duarte, Rubens T D; Brandt, Katia G; Martinez, Marina B; Taddei, Carla R.
Título: Breastfeeding increases microbial community resilience / Aleitamento materno aumenta a resiliência da comunidade microbiana
Fonte: J. pediatr. (Rio J.);94(3):258-267, May-June 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: FAPESP (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo).
Resumo: Abstract Objective Since the present group had already described the composition of the intestinal microbiota of Brazilian infants under low social economic level, the aim of the present study was to analyze the microbial community structure changes in this group of infants during their early life due to external factors. Methods Fecal samples were collected from 11 infants monthly during the first year of life. The infants were followed regarding clinical and diet information and characterized according to breastfeeding practices. DNA was extracted from fecal samples of each child and subjected to Polymerase Chain Reaction - Denaturing Gradient Gel Electrophoresis. Results The results revealed a pattern of similarity between the time points for those who were on exclusive breastfeeding or predominant breastfeeding. Although there were changes in intensity and fluctuation of some bands, the Denaturing Gradient Gel Electrophoresis patterns in the one-year microbial analysis were stable for breastfeeding children. There was uninterrupted ecological succession despite the influence of external factors, such as complementary feeding and antibiotic administration, suggesting microbiota resilience. This was not observed for those children who had mixed feeding and introduction of solid food before the 5th month of life. Conclusion These results suggested an intestinal microbiota pattern resilient to external forces, due to the probiotic and prebiotic effects of exclusive breastfeeding, reinforcing the importance of exclusive breastfeeding until the 6th month of life.

Resumo Objetivo Como nosso grupo já havia descrito a composição da microbiota intestinal de neonatos brasileiros em baixo nível socioeconômico, o objetivo deste estudo foi analisar alterações estruturais da comunidade microbiana desse grupo de neonatos no início de sua vida devido a fatores externos. Métodos Amostras fecais foram coletadas mensalmente de 11 neonatos durante o primeiro ano de vida. Os neonatos foram acompanhados com relação a informações clínicas e nutricionais e caracterizados de acordo com práticas de amamentação. O DNA foi extraído das amostras fecais de cada criança e submetido a análise através da técnica de Reação em Cadeia da Polimerase - Eletroforese em Gel de Gradiente Desnaturante. Resultados Os resultados revelaram um padrão de similaridade entre seus próprios pontos temporais em indivíduos em aleitamento materno exclusivo ou predominante. Apesar de variações na intensidade e flutuação de algumas bandas, o padrão Eletroforese em Gel de Gradiente Desnaturante na análise microbiana de um ano foi estável em crianças em aleitamento materno. Houve sucessão ecológica ininterrupta apesar da influência de fatores externos, como alimentação complementar e administração de antibióticos, sugeriu resiliência da microbiota. Isso não foi observado nas crianças com alimentação heterogênea e introdução de alimentos sólidos antes do quinto mês de vida. Conclusão Nossos resultados sugerem um padrão de microbiota intestinal resiliente a forças externas, devido a efeitos probióticos e prebióticos do aleitamento materno exclusivo, reforçam a importância do aleitamento materno exclusivo até o sexto mês de vida.
Descritores: Bactérias/imunologia
Aleitamento Materno
Fezes/microbiologia
Intestinos/microbiologia
Antibacterianos/administração & dosagem
-Bactérias/efeitos dos fármacos
Bactérias/genética
RNA Bacteriano/análise
RNA Ribossômico 16S/análise
Reação em Cadeia da Polimerase
Eletroforese em Gel de Ágar
Limites: Humanos
Masculino
Feminino
Recém-Nascido
Lactente
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Id: biblio-894856
Autor: Arraes, Maria Luisa Bezerra de Macedo; Holanda, Maísa Viana de; Lima, Luana Nepomuceno Gondim Costa; Sabadia, José Antônio Beltrão; Duarte, Cynthia Romariz; Almeida, Rosa Livia Freitas; Kendall, Carl; Kerr, Ligia Regina Sansigolo; Frota, Cristiane Cunha.
Título: Natural environmental water sources in endemic regions of northeastern Brazil are potential reservoirs of viable Mycobacterium leprae
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;112(12):805-811, Dec. 2017. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: CNPq; . Water and Public Health.
Resumo: BACKGROUND The detection of live Mycobacterium leprae in soil and animals other than humans suggests that the environment plays a role in the transmission of leprosy. OBJECTIVE The objective of this study was to investigate the presence of viable M. leprae in natural water sources used by the local population in five municipalities in the state of Ceará, northeastern Brazil. METHODS Samples were collected from 30 different sources. Viable bacilli were identified by reverse transcriptase polymerase chain reaction (PCR) of the M. leprae gyrA gene and sequencing of the PCR products. Physicochemical properties of each water source were also assessed. FINDINGS M. leprae gyrA mRNA was found in 23 (76.7%) of the water sources. No association was found between depth of the water and sample positivity, nor was there any association between the type of water used by the population and sample positivity. An association between viable M. leprae and temperature and pH was found. Georeferencing showed a relation between the residences of leprosy cases and water source containing the bacterium. MAIN CONCLUSIONS The finding of viable M. leprae in natural water sources associated with human contact suggests that the environment plays an important role in maintaining endemic leprosy in the study region.
Descritores: DNA Bacteriano/genética
RNA Bacteriano/genética
RNA Ribossômico 16S/genética
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
Mycobacterium leprae/isolamento & purificação
Mycobacterium leprae/genética
-Microbiologia da Água
Brasil
Reservatórios de Doenças
Genótipo
Limites: Humanos
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Id: lil-794226
Autor: Midena, Raquel Zanin.
Título: Suscetibilidade antimicrobiana e protocolo de purificação de RNA para análise de expressão gênica de isolados clínicos de Fusobacterium nucleatum / Antimicrobial susceptibility and RNA purification protocol for gene expression analysis of clinical isolates of Fusobacterium nucleatum.
Fonte: Bauru; s.n; 2015. 95 p. ilus, tab, graf.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Faculdade de Odontologia de Bauru para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: Fusobacterium nucleatum é uma espécie bacteriana Gram-negativa, anaeróbia estrita e uma das espécies frequentemente encontradas nas infecções primárias do sistema de canais radiculares. Esta espécie tem grande importância na formação de biofilmes por ser uma ponte de união entre espécies que não são capazes de interagir. Os micro-organismos constituintes de biofilmes trocam material genético, aumentando a tolerancia dos mesmos e é quase impossível um isolado clínico ter os genes totalmente iguais à cepa padrão de coleções de cultura como da ATCC (American Type Culture Colection). O presente estudo investigou a espécie bacteriana anaeróbia Fusobacterium nucleatum isolada de canais radiculares, comparando-a com sua cepa de referência. Foi feito a comparação da suscetibilidade microbiana in vitro por meio de cultura microbiológica pelo método do E-test, com as cepas em crescimento planctônico e em biofilme. Também foi definido um protocolo de Purificação de RNA para esta espécie em ambas as condições de crescimento. As cepas clínicas de F. nucelatum foram isoladas por meio da cultura microbiológica de 23 pacientes que apresentavam dentes com infecção primária e periodontite apical visível em radiografia. Foi feito isolamento e identificação da espécie por série bioquímica com testes comerciais (Sistema Api, Bio-Meriéux, França) e PCR convencional, sendo no total 4 isolados clínicos investigados. Foi verificada a suscetibilidade antimicrobiana dos seguintes antibióticos: Amoxicilina, Amoxicilina + ácido clavulânico, Ampicilina, Azitromicina, Clindamicina, Eritromicina e Metronidazol. O protocolo para purificação de RNA foi feito com microesferas de zircônia, dispositivo bead beater, kit comercial RNeasy (Qiagen) e transcrição para DNA complementar (cDNA). A qualidade da purificação foi testada quanto a sua capacidade de amplificação pela reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) utilizando primer para o gene 16s RNA específico para F. nucelatum...

Fusobacterium nucleatum is a Gram-negative bacterial species, strict anaerobic and one of the species often found in primary infection of the root canal system. This species has great importance in biofilm formation to be a union bridge between species which are not able to act alone. The constituent microorganisms of the biofilm exchange each tother genetic material, increasing the strength of them. It is almost impossible for a clinical isolate have genes totally equal to a standard strain, such as strains of culture collections like ATCC (American Type Culture Collection). The present study investigated anaerobic bacterial species Fusobacterium nucleatum isolated from root canals, comparing them to the ATCC strain. The microbial in vitro susceptibility of biofilm and planktonic growth of the strains was compared by means of microbiological culture and the E-test method, with the antibiotics Amoxicillin, Amoxicillin + clavulanic acid, Ampicillin, Azithromycin, Clindamycin, Eritromycin and Metronidazole.. Also, a RNA Purification protocol for the strains under the same growth conditions was defined. Clinical isolates were obtained by microbiological samples of patients with teeth with pulp necrosis and apical periodontitis visible on radiographs. The species isolation and identification were performed using commercial biochemical tests (Sistema Api, Bio-Meriéux, France) and conventional PCR, obtaining four clinical isolates. The protocol for RNA purification was done with zirconia beads, bead beater device and commercial kit RNeasy (Qiagen) and transcribed into complementary DNA (cDNA). The quality of purification was tested for its ability of amplification by real time polymerase chain reaction (qPCR) using primer for the gene 16s RNA specific for F. nucleatum. All tested trains were 100% susceptible to amoxicillin + clavulanic acid, ampicillin, azithromycin, clindamycin and metronidazole. Both types of bacterial growth showed resistance to...
Descritores: Fusobacterium nucleatum/genética
Fusobacterium nucleatum/isolamento & purificação
Expressão Gênica
RNA Bacteriano/isolamento & purificação
-Antibacterianos/farmacologia
Biofilmes/crescimento & desenvolvimento
Cavidade Pulpar/microbiologia
Fusobacterium nucleatum
Testes de Sensibilidade Microbiana
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
Fatores de Tempo
Limites: Humanos
Responsável: BR28.1 - Serviço de Biblioteca e Documentação Professor Doutor Antônio Gabriel Atta


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Id: lil-762924
Autor: Beltrame, C. O.; Côrtes, M. F.; Bandeira, P. T.; Figueiredo, A. M. S..
Título: Optimization of the RNeasy Mini Kit to obtain high-quality total RNA from sessile cells of Staphylococcus aureus
Fonte: Braz. j. med. biol. res = Rev. bras. pesqui. méd. biol;48(12):1071-1076, Dec. 2015. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Biofilm formed by Staphylococcus aureus is considered an important virulence trait in the pathogenesis of infections associated with implantable medical devices. Gene expression analyses are important strategies for determining the mechanisms involved in production and regulation of biofilm. Obtaining intact RNA preparations is the first and most critical step for these studies. In this article, we describe an optimized protocol for obtaining total RNA from sessile cells of S. aureus using the RNeasy Mini Kit. This method essentially consists of a few steps, as follows: 1) addition of acetone-ethanol to sessile cells, 2) lysis with lysostaphin at 37°C/10 min, 3) vigorous mixing, 4) three cycles of freezing and thawing, and 5) purification of the lysate in the RNeasy column. This simple pre-kit procedure yields high-quality total RNA from planktonic and sessile cells of S. aureus.
Descritores: Técnicas Bacteriológicas/normas
Biofilmes/crescimento & desenvolvimento
RNA Bacteriano/isolamento & purificação
Staphylococcus aureus/genética
-Técnicas Bacteriológicas/métodos
Eletroforese em Gel de Ágar
Proteínas Hemolisinas/metabolismo
Staphylococcus aureus Resistente à Meticilina/genética
Staphylococcus aureus Resistente à Meticilina/isolamento & purificação
Controle de Qualidade
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
Transcrição Reversa
Staphylococcus aureus/fisiologia
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-734583
Autor: Landone Vescovo, Ignacio A; Golemba, Marcelo D; Di Lello, Federico A; Culasso, Andrés C.A; Levinb, Gustavo; Ruberto, Lucas; Mac Cormack, Walter P; López, José L.
Título: Rich bacterial assemblages from Maritime Antarctica (Potter Cove, South Shetlands) reveal several kinds of endemic and undescribed phylotypes / Una rica colección de bacterias marinas antárticas (Caleta Potter, islas Shetlands del Sur) revela diversos filotipos endémicos y previamente no descritos
Fonte: Rev. argent. microbiol;46(3):218-230, oct. 2014. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: .

Bacterial richness in maritime Antarctica has been poorly described to date. Phylogenetic affiliation of seawater free-living microbial assemblages was studied from three locations near the Argentinean Jubany Station during two Antarctic summers. Sixty 16S RNA cloned sequences were phylogenetically affiliated to Alphaproteobacteria (30/60 clones), Gammaproteobacteria(19/60 clones), Betaproteobacteria and Cytophaga-Flavobacteriia- Bacteroides (CFB), which were (2/60) and (3/60) respectively. Furthermore, six out of 60 clones could not be classified. Both, Alphaproteobacteria and Gammaproteobacteria, showed several endemic and previously undescribed sequences. Moreover, the absence of Cyanobacteria sequences in our samples is remarkable. In conclusion, we are reporting a rich sequence assemblage composed of widely divergent isolates among themselves and distant from the most closely related sequences currently deposited in data banks.
Descritores: Bactérias/isolamento & purificação
Água do Mar/microbiologia
-Regiões Antárticas
Sequência de Bases
Bactérias/classificação
Bactérias/genética
DNA Bacteriano/genética
DNA Ribossômico/genética
Evolução Molecular
Microbiota
Dados de Sequência Molecular
Filogenia
Ribotipagem
RNA Bacteriano/genética
/genética
RNA, RIBOSOMAL, ABNORMALITIES, MULTIPLES/genética
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: AR1.2 - Instituto de Investigaciónes Epidemiológicas



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