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Id: lil-589923
Autor: Oliveira, Katia C; Carvalho, Mariana L. P; Maracaja-Coutinho, Vinicius; Kitajima, João P; Verjovski-Almeida, Sergio.
Título: Non-coding RNAs in schistosomes: an unexplored world
Fonte: An. acad. bras. ciênc;83(2):673-694, June 2011. ilus, tab.
Idioma: en.
Projeto: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; . Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; . SEtTReND; . CAPES.
Resumo: Non-coding RNAs (ncRNAs) were recently given much higher attention due to technical advances in sequencing which expanded the characterization of transcriptomes in different organisms. ncRNAs have different lengths (22 nt to >1, 000 nt) and mechanisms of action that essentially comprise a sophisticated gene expression regulation network. Recent publication of schistosome genomes and transcriptomes has increased the description and characterization of a large number of parasite genes. Here we review the number of predicted genes and the coverage of genomic bases in face of the public ESTs dataset available, including a critical appraisal of the evidence and characterization of ncRNAs in schistosomes. We show expression data for ncRNAs in Schistosoma mansoni. We analyze three different microarray experiment datasets: (1) adult worms' large-scale expression measurements; (2) differentially expressed S. mansoni genes regulated by a human cytokine (TNF-α) in a parasite culture; and (3) a stage-specific expression of ncRNAs. All these data point to ncRNAs involved in different biological processes and physiological responses that suggest functionality of these new players in the parasite's biology. Exploring this world is a challenge for the scientists under a new molecular perspective of host-parasite interactions and parasite development.

RNAs não codificadores (ncRNAs) têm sido recentemente objeto de atenção muito maior devido aos avanços técnicos no sequenciamento que expandiram a caracterização dos transcritomas em diferentes organismos. ncRNAs possuem diferentes comprimentos (22 nt a >1.000 nt) e mecanismos de ação que essencialmente compreendem uma sofisticada rede de regulação de expressão gênica. A publicação recente dos genomas e transcritomas dos esquistossomos aumentou a descrição e caracterização de um grande número de genes do parasita. Aqui nós revisamos o número de genes preditos e a cobertura das bases do genoma em face dos ESTs públicos disponíveis, incluindo uma avaliação crítica da evidência e caracterização de ncRNAs em esquistossomos. Nós mostramos dados de expressão de ncRNAs em Schistosoma mansoni. Nós analisamos três conjuntos diferentes de dados de experimentos com microarranjos: (1) medidas de expressão em larga escala de vermes adultos; (2) genes diferencialmente expressos de S. mansoni regulados por uma citocina humana (TNF-α) no parasita em cultura; e (3) expressão estágio-especifica de ncRNAs. Todos estes dados apontam para ncRNAs envolvidos em diferentes processos biológicos e respostas fisiológicas que sugerem funcionalidade destes novos personagens na biologia do parasita. Explorar este mundo é um desafio para os cientistas sob uma nova perspectiva molecular da interação parasita-hospedeiro e do desenvolvimento do parasita.
Descritores: Genoma Helmíntico/genética
RNA de Helmintos/genética
RNA não Traduzido/genética
Schistosoma japonicum/genética
Schistosoma mansoni/genética
-Etiquetas de Sequências Expressas
Limites: Animais
Humanos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
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Responsável: BR1.1 - BIREME


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Vicente, Ana Carolina P
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Id: lil-333819
Autor: Iñiguez, Alena M; Reinhard, Karl J; Araújo, Adauto; Ferreira, Luiz Fernando; Vicente, Ana Carolina P.
Título: Enterobius vermicularis: ancient DNA from north and south American human coprolites
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;98(supl.1):67-69, Jan. 15, 2003. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: A molecular paleoparasitological diagnostic approach was developed for Enterobius vermicularis. Ancient DNA was extracted from 27 coprolites from archaeological sites in Chile and USA. Enzymatic amplification of human mtDNA sequences confirmed the human origin. We designed primers specific to the E. vermicularis 5S ribosomal RNA spacer region and they allowed reproducible polymerase chain reaction identification of ancient material. We suggested that the paleoparasitological microscopic identification could accompany molecular diagnosis, which also opens the possibility of sequence analysis to understand parasite-host evolution
Descritores: DNA de Helmintos
DNA Mitocondrial
Enterobius
Fósseis
RNA Ribossômico 5S
-Sequência de Bases
Chile
Dados de Sequência Molecular
Reação em Cadeia da Polimerase
RNA de Helmintos
Estados Unidos
Limites: Humanos
Animais
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Abath, Frederico G. C
Montenegro, Sílvia M. L
Werkhäuser, Roberto P
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Id: lil-325013
Autor: Abath, Frederico G. C; Xavier, Edeneide M; Montenegro, Sílvia M. L; Werkhauser, Roberto P.
Título: Partial molecular characterization of Sm8, a tegumental antigen of Schistosoma mansoni
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;97(suppl.1):91-93, Oct. 2002. ilus.
Idioma: en.
Conferência: Apresentado em: International Symposium on Schistosomiasis, 8, Recife, Dec. 2-5, 2001.
Resumo: Sm8 is a major tegumental antigen of Schistosoma mansoni. The partial cDNA was isolated and analyzed. Sequence analysis revealed transmembrane compatible hydrophobic domains and a putative leucine zipper pattern. The mRNA and the protein are predominantly expressed in adult worms
Descritores: Antígenos de Helmintos
Proteínas de Helminto
Schistosoma mansoni
-Sequência de Aminoácidos
Antígenos de Helmintos
Sequência de Bases
Western Blotting
DNA Complementar
Dados de Sequência Molecular
RNA de Helmintos
Limites: Animais
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Rodrigues, Vanderlei
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Id: lil-194208
Autor: Coelho-Castelo, Arlete Martins; Rodrigues, Vanderlei.
Título: Cloning and characterization of a Schistosoma mansoni cDNA clone with a specific antigenic expression during development in a vertebrate host
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;92(5):643-6, Sept.-Oct. 1997. ilus.
Idioma: en.
Resumo: Approximately 2.0 x 10 cDNA clones of an Schistosoma mansoni gt11 cDNA library were screened in duplicate with serum from infected mice corresponding to distinct phases of infection. A cDNA clone (7/1) was isolated and recognized only by seven week serum. The clone was subcloned in pGEX-2T and Western-blot studies showed a specific antigenic expression confirming that only serum from the chronic phase is capable of recognizing this antigen. Dot-hybridization with RNA from different developmental phases of the parasite showed that the corresponding 7/1 RNA is expressed in all phases of parasite development in vertebrate hosts.
Descritores: Clonagem Molecular
Schistosoma mansoni/genética
-DNA Complementar/genética
RNA de Helmintos/genética
Limites: Animais
Responsável: BR15.1 - Biblioteca de Ciências Biomédicas



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