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Id: biblio-889085
Autor: Teng, Feixiang; Sun, Jinxia; Yu, Lili; Li, Qisong; Cui, Yubao.
Título: Homology modeling and epitope prediction of Der f 33
Fonte: Braz. j. med. biol. res = Rev. bras. pesqui. méd. biol;51(5):e6213, 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: National Natural Sciences Foundation; . Key Program of Wuxi health and Family Planning Commission; . 333 project of Jiangsu Province.
Resumo: Dermatophagoides farinae (Der f), one of the main species of house dust mites, produces more than 30 allergens. A recently identified allergen belonging to the alpha-tubulin protein family, Der f 33, has not been characterized in detail. In this study, we used bioinformatics tools to construct the secondary and tertiary structures and predict the B and T cell epitopes of Der f 33. First, protein attribution, protein patterns, and physicochemical properties were predicted. Then, a reasonable tertiary structure was constructed by homology modeling. In addition, six B cell epitopes (amino acid positions 34-45, 63-67, 103-108, 224-230, 308-316, and 365-377) and four T cell epitopes (positions 178-186, 241-249, 335-343, and 402-410) were predicted. These results established a theoretical basis for further studies and eventual epitope-based vaccine design against Der f 33.
Descritores: Tubulina (Proteína)/química
Alérgenos/química
Epitopos de Linfócito T/química
Epitopos de Linfócito B/química
Dermatophagoides farinae/química
Antígenos de Dermatophagoides/química
-Tubulina (Proteína)/genética
Tubulina (Proteína)/imunologia
Alérgenos/genética
Alérgenos/imunologia
Estrutura Molecular
Estrutura Terciária de Proteína
Mapeamento de Epitopos
Epitopos de Linfócito T/genética
Epitopos de Linfócito B/genética
Biologia Computacional
Análise de Sequência de Proteína
Dermatophagoides farinae/genética
Dermatophagoides farinae/imunologia
Antígenos de Dermatophagoides/genética
Antígenos de Dermatophagoides/imunologia
Limites: Animais
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-597258
Autor: Camacho, Ariane Guglielmi Ariza; Teixeira, Laís Helena; Bargieri, Daniel Youssef; Boscardin, Silvia Beatriz; Soares, Irene da Silva; Nussenzweig, Ruth Sonntag; Nussenzweig, Victor; Rodrigues, Mauricio Martins.
Título: TLR5-dependent immunogenicity of a recombinant fusion protein containing an immunodominant epitope of malarial circumsporozoite protein and the FliC flagellin of Salmonella Typhimurium
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;106(supl.1):167-171, Aug. 2011. ilus, graf.
Idioma: en.
Projeto: FAPESP; . CNPq. INCTV; . CAPES; . FAPESP.
Resumo: Recently, we described the improved immunogenicity of new malaria vaccine candidates based on the expression of fusion proteins containing immunodominant epitopes of merozoites and Salmonella enterica serovar Typhimurium flagellin (FliC) protein as an innate immune agonist. Here, we tested whether a similar strategy, based on an immunodominant B-cell epitope from malaria sporozoites, could also generate immunogenic fusion polypeptides. A recombinant His6-tagged FliC protein containing the C-terminal repeat regions of the VK210 variant of Plasmodium vivax circumsporozoite (CS) protein was constructed. This recombinant protein was successfully expressed in Escherichia coli as soluble protein and was purified by affinity to Ni-agarose beads followed by ion exchange chromatography. A monoclonal antibody specific for the CS protein of P. vivax sporozoites (VK210) was able to recognise the purified protein. C57BL/6 mice subcutaneously immunised with the recombinant fusion protein in the absence of any conventional adjuvant developed protein-specific systemic antibody responses. However, in mice genetically deficient in expression of TLR5, this immune response was extremely low. These results extend our previous observations concerning the immunogenicity of these recombinant fusion proteins and provide evidence that the main mechanism responsible for this immune activation involves interactions with TLR5, which has not previously been demonstrated for any recombinant FliC fusion protein.
Descritores: Flagelina/imunologia
Epitopos Imunodominantes/imunologia
Vacinas Antimaláricas/imunologia
Malária Vivax
Plasmodium falciparum/imunologia
Proteínas Recombinantes de Fusão/imunologia
Salmonella typhimurium/imunologia
-Anticorpos Antiprotozoários/imunologia
Epitopos de Linfócito B/imunologia
Epitopos de Linfócito B
Proteínas de Escherichia coli/imunologia
Flagelina
Epitopos Imunodominantes
Vacinas Antimaláricas
Malária Vivax/imunologia
MICE, INBRED CABDOMENABDOMINAL INJURIESBL
Proteínas de Protozoários/imunologia
Proteínas de Protozoários
Proteínas Recombinantes de Fusão
Salmonella typhimurium
/imunologia
TOLL-LIKE RECEPTOR ABDOMEN/imunologia
Limites: Animais
Camundongos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-527771
Autor: Silva, Andréa Nazaré Monteiro Rangel da.
Título: Identificação de epítopos de célula B na glicoproteína-E do envelope do vírus dengue sorotipo 3 / Identification of B-cell epitopes in the envelope glycoprotein of dengue virus type 3.
Fonte: Recife; s.n; 2007. 111 p. ilus.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães para obtenção do grau de Mestre.
Resumo: As infecções pelo vírus dengue têm se tornado um problema crescente de Saúde Pública em regiões tropicais e subtropicais do mundo. O vírus pertence à família Flaviviridae com quatro sorotipos antigenicamente distintos (DENV-1 a DENV-4). Uma possível estratégia para evitar a patogenia associada com uma vacina para o dengue (que deve ser tetravalente), seria a construção de uma vacina quimérica composta de epítopos críticos selecionados dos quatro sorotipos. A maioria dos epítopos envolvidos na neutralização do vírus está presente na glicoproteína E do envelope, que é a maior proteína de superfície da partícula viral. O objetivo deste trabalho foi identificar epítopos de célula B na glicoproteína E do vírus dengue sorotipo 3. Para o mapeamento de epítopos imunodominantes, noventa e cinco peptídeos (15-mers cada, sobreposição de 10) foram sintetizados (Synpep, California-USA), a partir da sequência de 490 aminoácidos da glicoproteína E do envelope do DENV-3, de cepa circulante no Brasil. Estes peptídeos foram testados por ELISA contra um pool de soros de pacientes positivos e negativos para dengue, coletados durante a fase de convalescença da infecção por DENV-3. Os resultados mostraram que os soros de humanos reagiram com onze, dos noventa e cinco peptídeos testados, distribuídos em 5 regiões com aminoácidos na posições 51-65 (peptídeo 11), 71-90 (peptídeos 15 e 16), 131-170 (peptídeos 27, 28, 29, 30, 31 e 32), 196-210 (peptídeo 40) e 246-260 (peptídeo 50). A análise da curva ROC mostrou que, dentre os peptídeos identificados, nove seriam capazes de diferenciar entre pacientes com DENV-3 de pacientes não-dengue e três capazes de diferenciar a infecção por DENV-3 daquelas por outros sorotipos virais (DENV-1 e DENV-2). Os epítopos imunodominantes aqui descritos, junto com outros epítopos bem documentados, são potencialmente relevantes para o desenho de uma vacina para o vírus dengue e para o desenvolvimento de kits de diagnóstico específicos.
Descritores: Dengue
Vírus da Dengue
Epitopos de Linfócito B
Peptídeos/síntese química
-Sequência de Aminoácidos
Ensaio de Imunoadsorção Enzimática
Mapeamento de Epitopos
Epitopos Imunodominantes/análise
Produtos do Gene env
Limites: Humanos
Responsável: BR305.1 - Biblioteca do CPqAM
CPqAM; (043.3)"2007", S586a


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Id: lil-520879
Autor: Scharfstein, Julio; Gomes, Juliana de Assis Silva; Correa-Oliveira, Rodrigo.
Título: Back to the future in Chagas disease: from animal models to patient cohort studies, progress in immunopathogenesis research
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;104(supl.1):187-198, July 2009.
Idioma: en.
Resumo: Despite the wealth of information generated by trans-disciplinary research in Chagas disease, knowledge about its multifaceted pathogenesis is still fragmented. Here we review the body of experimental studies in animal models supporting the concept that persistent infection by Trypanosoma cruzi is crucial for the development of chronic myocarditis. Complementing this review, we will make an effort to reconcile seemingly contradictory results concerning the immune profiles of chronic patients from Argentina and Brazil. Finally, we will review the results of molecular studies suggesting that parasite-induced inflammation and tissue damage is, at least in part, mediated by the activities of trans-sialidase, mucin-linked lipid anchors (TLR2 ligand) and cruzipain (a kinin-releasing cysteine protease). One hundred years after the discovery of Chagas disease, it is reassuring that basic and clinical research tends to converge, raising new perspectives for the treatment of chronic Chagas disease.
Descritores: Doença de Chagas/imunologia
Trypanosoma cruzi/imunologia
-/imunologia
CDABDOMINAL NEOPLASMS-POSITIVE T-LYMPHOCYTES/imunologia
Doença Crônica
Cardiomiopatia Chagásica/imunologia
Cardiomiopatia Chagásica/parasitologia
Doença de Chagas/parasitologia
Modelos Animais de Doenças
Epitopos de Linfócito B/imunologia
Receptores de Quimiocinas/imunologia
Trypanosoma cruzi/genética
Trypanosoma cruzi/patogenicidade
Limites: Animais
Humanos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Revisão
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-464431
Autor: Mokfienski, Jessica Joy.
Título: Mapeamento imunológico de epítopos lineares de células B do vírus vaccínia, homólogos ao vírus varíola / Immunological mapping of linear of cells B of the vaccinia virus, homologous epitopes to the virus smallpox.
Fonte: Rio de Janeiro; s.n; 1 jun. 2007. xiv,71 p. ilus, tab, graf.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Instituto Oswaldo Cruz para obtenção do grau de Mestre.
Resumo: A Varíola, uma doença endêmica por mais de 3000 anos e com alta taxa de mortalidade no mundo inteiro, foi erradicada em 1977 através de uma intensa campanha de vacinação usando o vírus vaccínia (VVAC), antigenicamente relacionado ao vírus varíola (VVAR). Ambos pertencem à família Poxviridae, gênero Orthopoxvirus e seus genomas compartilham de grande homologia. Importantes respostas de anticorpos estão dirigidas às proteínas de superfície das duas principais formas infecciosas de poxvirus, o vírus intracelular maduro (VMI) e o vírus extracelular envelopado (VEE). Neste trabalho foram mapeados 27 epítopos lineares de células B do VVAC, homólogos ao VVAR, das principais proteínas responsáveis pela imunidade protetora humoral conferida pela vacina a Varíola. As proteínas B5R, H3L, L1R e A33R de VVAC foram selecionadas...Spot-synthesis. Sete epítopos lineares foram... soros de indivíduos infectados por VCTG. Dez epítopos lineares foram identificados na proteína H3L de VMIs, sendo 8 reatores cruzados e 2 reatores específicos aos soros de indivíduos infectados. Sete epítopos lineares foram identificados na proteína L1R de VMIs, sendo 6 reatores cruzados e um reator específico ao soro de indivíduos infectados. No entanto, dos 4 epítopos lineares identificados na proteína A33R de VEEs, todos foram reatores tanto com o soro de indivíduos normais quanto ao soro de indivíduos infectados com VCTG. As análises de modelagem molecular empreendidas neste estudo identificaram que 3 dos 4 epítopos específicos ao VVAC estão dispostos na superfície das moléculas e fazem parte de regiões não estruturadas (coil) e um em região estruturada (alfa hélice). Sessenta e três por cento da predição teórica, por métodos computacionais, de regiões que correspondem a possíveis esítopos foram confirmados pelas análises experimentais empregando bibliotecas peptídicas. Além disso, neste estudo definimos estruturalmente todos os 27 epítopos lineares. Embora tenhamos identificado vários epítopos...
Descritores: Alergia e Imunologia
Epitopos de Linfócito B
Orthopoxvirus
Varíola
-Brasil/epidemiologia
Limites: Humanos
Animais
Responsável: BR15.1 - Biblioteca de Ciências Biomédicas
BR15.1


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Araújo, Flábio R
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Id: lil-340122
Autor: Oliveira, Jaqueline B; Madruga, Claudio R; Schenk, Maria A. M; Kessler, Raul H; Miguita, Midori; Araújo, Flábio R.
Título: Antigenic characterization of Brazilian isolates of Anaplasma marginale
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;98(3):395-400, Apr. 2003. ilus, tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Antigenic characterization of Anaplasma marginale isolates, by identifying conserved and variable epitopes of major surface proteins (MSP), is an important tool for vaccine development against this rickettsia. The B cell epitopes of A. marginale isolates from three microregions of the State of Pernambuco and one from the State of Mato Grosso do Sul, Brazil, were characterized by indirect fluorescent antibody technique (IFAT) and Western blot (WB) with 15 monoclonal antibodies (MAbs). The epitope recognized by MAb ANA22B1 (MSP-1a) was conserved by IFAT and WB (73-81 kDa). MSP-2 epitopes recognized by MAbs ANAO58A2 and ANAO70A2 were conserved by IFAT, while ANAO50A2 and ANA66A2 epitopes were polymorphic; in the WB, the MAbs ANAO50A2 and ANAO70A2 identified bands of 45 kDa only in the Pernambuco-Mata isolate. None of the isolates reacted with MAb ANAR75C2 (MSP-3). The MSP-4 epitope recognized by MAb ANAR76A1 was conserved by IFAT, as well as the MSP-5 epitope recognized by MAb ANAF16C1 by IFAT and WB (16 kDa). The MAbs ANAR17A6, ANAR83B3, ANAR94C1, ANAO24D5 and ANAR19A6 identified conserved epitopes by IFAT. MSP-1, MSP-2 and MSP-4, which previously showed partial protection in experimental trials, are also potential immunogens to be employed in Brazil, due to the B cell epitope conservation
Descritores: Anaplasma
Variação Antigênica
Antígenos de Bactérias
Epitopos de Linfócito B
-Anaplasmose
Anticorpos Monoclonais
Variação Antigênica
Antígenos de Bactérias
Antígenos de Superfície
Western Blotting
Doenças dos Bovinos
Eletroforese em Gel de Poliacrilamida
Epitopos de Linfócito B
Técnica Indireta de Fluorescência para Anticorpo
Limites: Animais
Bovinos
Responsável: BR1.1 - BIREME



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