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Id: lil-765516
Autor: Hernández-Botero, Johan Sebastián; Pérez-Cárdenas, Jorge Enrique.
Título: Identificación de Candida glabrata y otras especies comunes del género Candida mediante el uso secuencial del medio de cultivo cromógeno y la prueba del tubo germinal / Identification of Candida glabrata and other common Candida species using chromogenic agar and germ tube test / Identificação de Candida glabrata e outras espécies comuns do gênero Candida mediante o uso sequencial do meio de cultivo cromogênico e a prova do tubo germinal
Fonte: Iatreia;28(4):355-367, oct.-dic. 2015. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: Introdución: se han usado agar cromógeno (AC) y la prueba del tubo germinal (PTG) para identificar C. albicans. Sin embargo, ninguna de estas dos pruebas por separado permite la identificación de C. glabrata. Objetivo: analizar la eficacia diagnóstica del uso secuencial del AC y la PTG para identificar las especies más comunes de Candida. Métodos: se identificaron 436 aislamientos usando el AC y luego la PTG; se utilizaron las pruebas bioquímicas como estándar de oro, y se determinaron la sensibilidad y especificidad del esquema secuencial con sus intervalos de confianza. Resultados: el uso en serie del AC y la PTG tuvo sensibilidad del 97,9 % (IC95 %: 96,0-99,9) para identificar C. albicans/dubliniensis y del 90,9 % (IC95 %: 84,0-97,8) para identificar C. tropicalis, con especificidad del 100 % para ambas especies. El mismo esquema permitió identificar C. glabrata con sensibilidad del 92,5 % (IC95 %: 86,2- 98,8) y especificidad del 96,6 % (IC95 %: 95,0-98,6), y el complejo C. parapsilosis con especificidad del 96,3 % (IC95 %: 94,5-98,1). Conclusiones: el esquema propuesto permite la identificación de C. albicans/dubliniensis, C. tropicalis y C. glabrata con sensibilidad y especificidad adecuadas, y podría ser útil en entornos clínicos de bajos recursos.

Introduction: Chromogenic agar and germ tube test have been used for decades to identify C. albicans. However, neither of these tests separately allows identification of C. glabrata. Objective: To test the efficacy of chromogenic agar and germ tube test used serially to identify the most common Candida species found in clinical practice, with emphasis on C. glabrata. Methods: 436 isolates were identified using the chromogenic medium followed by the germ tube test. Biochemical tests were used as gold standard. Sensitivity, specificity and confidence intervals (95 %) of the serial identification system were determined. Results: Sensitivity was 97.9 % (IC95 %: 96.0-99.9) to identify C. albicans/dubliniensis, and 90.9 % (IC95 %: 84.0-97.8) for C. tropicalis; specificity was 100 % for both species. Sensitivity was 92.5 % (IC95 %: 86.2-98.8) for identification of C. glabrata with 96.6 % (IC95 %: 95.0-98.6) specificity. Concerning identification of the C. parapsilosis complex, specificity was 96.3 % (IC95 %: 94.5-98.1). Conclusion: The proposed serial scheme has adequate sensitivity and specificity for identification of C. albicans/dubliniensis, C. tropicalis and C. glabrata. It could be useful in low-resources clinical settings.

Se usaram agar cromogênico (AC) e a prova do tubo germinal (PTG) para identificar C. albicans. No entanto, nenhuma destas duas provas por separado permite a identificação de C. glabrata. Objetivo: analisar a eficácia diagnóstica do uso sequencial do AC e a PTG para identificar as espécies mais comuns de Candida. Métodos: identificaram-se 436 isolamentos usando o AC e depois a PTG; utilizaram-se as provas bioquímicas como padrão de ouro, e se determinaram a sensibilidade e especificidade do esquema sequencial com seus intervalos de confiança. Resultados: o uso em série do AC e a PTG teve sensibilidade de 97,9 % (IC95 %: 96,0-99,9) para identificar C. albicans/dubliniensis e de 90,9 % (IC95 %: 84,0-97,8) para identificar C. tropicalis, com especificidade de 100 % para ambas espécies. O mesmo esquema permitiu identificar C. glabrata com sensibilidade de 92,5 % (IC95 %: 86,2- 98,8) e especificidade de 96,6 % (IC95 %: 95,0-98,6), e o complexo C. parapsilose com especificidade de 96,3 % (IC95 %: 94,5-98,1). Conclusões: o esquema proposto permite a identificação de C. albicans/dubliniensis, C. tropicalis e C. glabrata com sensibilidade e especificidade adequadas, e poderia ser útil em meios clínicos de baixos recursos.
Descritores: Candida
Candida glabrata
-Compostos Cromogênicos
Meios de Cultura
Limites: Humanos
Tipo de Publ: Artigo Clássico
Responsável: CO332 - Facultad de Medicina


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Id: lil-500684
Autor: Casarotti, Sabrina N; Paula, Aline T; Rossi, Daise A.
Título: Correlação entre métodos cromogênicos e o método convencional na enumeração de coliformes e Escherichia coli em carne bovina moída / Correlation between rapid and standard methods for counting coliforms and Escherichia coli in bovine raw minced meat
Fonte: Rev. Inst. Adolfo Lutz;66(3):278-286, set.-dez. 2007. graf.
Idioma: pt.
Resumo: Os métodos rápidos de análise microbiológica de alimentos apresentam vantagens sobre os ensaios convencionais no que se refere à simplificação do trabalho no laboratório e à redução de tempo na obtenção de resultados. O objetivo deste estudo foi de comparar os testes rápidos Petrifilm® EC e Compact dry® EC e CF com a técnica de análise convencional realizada em placas na enumeração de coliformes totais e coliformes termotolerantes em amostras de carne moída bovina e avaliar as metodologias alternativas para quantificação de Escherichia coli nas temperaturas de 35ºC e 45ºC. A análise de regressão linear dos dados mostrou alta correlação entre as contagens de coliformes totais e coliformes termotolerantes (R2>0,9). A correlação entre as contagens de Escherichia coli em Petrifilm®e Compact dry® foi também positiva e significativa (R2>0,9). Todavia, quando foi feita a comparação entre os resultados da enumeração de E. coli a temperaturas de 35ºC e 45ºC, houve decréscimo no coeficiente de correlação em ambos os sistemas (R2<0,9). Considerando-se que os métodos rápidos e a metodologia convencional para contagem de coliformes mostraram-se equivalentes, os resultados sugerem a aplicabilidade dos sistemas Petrifilm® e Compact dry® como técnicas alternativas ao método convencional de plaqueamento.
Descritores: Carne
Compostos Cromogênicos
Enterobacteriaceae
Escherichia coli
Responsável: BR91.2 - Centro de Documentação


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Id: lil-633024
Autor: Blanco, Alicia Noemí; Peirano, Andrea; Silvia, Grosso; Lazzari, María Angela.
Título: Efecto del inhibidor lúpico o anti-factor VIII sobre la actividad del factor VIII-sustrato cromogénico / Lupus anticoagulant or anti-factor VIII effect on factor VIII activity-chromogenic substrate
Fonte: Acta bioquím. clín. latinoam;41(3):399-405, jul.-sep. 2007. graf, tab.
Idioma: es.
Resumo: El objetivo del trabajo fue analizar el efecto de inmunoglobulinas (IgG) purificadas con actividad anti-factor VIII neutralizante o inhibidor lúpico, sobre el factor VIII medido por sustrato cromogénico (factor VIII SC), con el propósito de validar el método para detectar anti-factor VIII en presencia de inhibidor lúpico. Se aisló la fracción IgG (cromatografía de afinidad) a partir de plasmas normales (IgG-N), con anti-factor VIII (IgG-aFVIII) o con inhibidor lúpico (IgG-IL), preparándose un pool normal como aporte de factor VIII en los ensayos de inhibición. Se analizaron las mezclas del pool normal con IgG-N, IgG-aFVIII, IgG-IL o la combinación de IgG-aFVIII+IgG-IL, inmediatamente y luego de 2 h a 37 ºC, determinándose la actividad del factor VIII SC y el índice de inhibición inmediato (Ii) o post-incubación (Ip). La inhibición y la potenciación producida por IgG-aFVIII+IgG-IL (Ii:30%±0,7; Ip:55%±2,7), fueron similares a las observadas con IgG-aFVIII sola (Ii:30%±0,6; Ip:55%±2,7). La IgG-IL no afectó la actividad de factor VIII SC. Semejante a lo observado en plasma, la IgG-IL no interfirió en la inhibición del factor VIII SC mediada por IgG-aFVIII. Se confirmó así la especificidad del método amidolítico, que permite detectar inhibidores anti-factor VIII independientemente de la coexistencia con el inhibidor lúpico, solucionando el problema diagnóstico planteado en hemofilia A.

To analyse the effect of purified immunoglobulins (IgG) with anti-factor VIII or lupus anticoagulant activity on factor VIII measured by chromogenic substrate (factor VIIICS), in order to validate the chromogenic substrate method for detection of anti-factor VIII activity in the presence of lupus anticoagulant. IgG fractions were purified (affinity chromatography) from normal plasmas (IgG-N) and plasmas with anti-factor VIII (IgG-aFVIII) or lupus anticoagulant (IgG-LA). A normal plasma pool was prepared as source of factor VIII in the inhibition tests. Mixtures of this pool with IgG-N, IgG-aFVIII, IgG-LA or IgG-aFVIII+IgG-LA were tested immediately or after 2 h at 37 °C by factor VIIICS method; inhibition index (Ii) and post-incubation index (Ip) were calculated. The inhibitory and progressive inhibitory effects produced by IgG-aFVIII+IgG-LA (Ii:30%±0.7; Ip:55%±2.7) were similar to those observed with IgG-aFVIII (Ii:30%±0.6; Ip:55%±2.7). The IgG-LA did not inhibit the factor VIIIcs activity. As was observed in plasma samples, IgG-aFVIII and the mixture of IgG-aFVIII+IgG-LA inhibited factor VIIICS, whereas IgG-LA did not. These results confirm the specificity of the amidolytic method in detecting anti-factor VIII inhibitors independently of the presence of lupus anticoagulant, thus solving the diagnostic problem in haemophilia A.
Descritores: Fator VIII/antagonistas & inibidores
Fator VIII/metabolismo
-Imunoglobulinas/sangue
Compostos Cromogênicos
Limites: Humanos
Tipo de Publ: Estudo de Validação
Responsável: AR144.1 - CIBCHACO - Centro de Información Biomedica del Chaco


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Id: lil-775543
Autor: Someillan Iglesias, Dennis; Zhurbenko, Raisa; Rodríguez Martínez, Claudio.
Título: Efecto de una combinación nutritiva y selectiva con sustratos cromogénicos para diagnóstico de cocos grampositivos / Effect of a selective nutrient combination of chromogenic substrates for diagnosis of Grampositive cocci
Fonte: Rev. cuba. invest. bioméd;34(4):313-327, oct.-dic. 2015. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: INTRODUCCIÓN: la reemergencia de infecciones por bacterias grampositivas y el aumento de su patogenicidad, requiere de un diagnóstico microbiológico rápido y certero. En BioCen se desarrolló una composición cromogénica para el aislamiento, cultivo y diferenciación rápida y presuntiva de microorganismos grampositivos por medio de reacciones cromogénicas específicas, donde las bacterias gramnegativas se encuentran inhibidas de manera parcial o total. OBJETIVO: evaluar el efecto de la combinación de bases nutritivas, inhibidores selectivos y sustratos cromogénicos para aumentar la selectivad y capacidad diferencial para especies de los géneros Enterococcus, Streptococcus y Staphylococcus de importancia clínica. MÉTODOS: se evaluaron 21 cepas microbianas de la American Type Culture Collection y 24 aislamientos clínicos de Streptococcus, Enterococcus y Staphylococcus y otros microorganismos gramnegativos. Se evaluaron diferentes combinaciones de bases nutritivas, acetato de talio, ácido nalidíxico y sustratos cromogénicos para la promoción del crecimiento y diferenciación de las bacterias grampositivas. Se evaluó la funcionalidad microbiológica y se le determinaron los parámetros de calidad diagnóstica. RESULTADOS: la combinación de bases nutritivas permitió el desarrollo de los microorganismos grampositivos, en 24 h y su diferenciación por reacciones cromogénicas específicas. El crecimiento de los microorganismos gramnegativos fue inhibido por la acción del acetato de talio (0,014 g·L-1) y ácido nalidíxico (0,008 g·L-1), excepto Proteus mirabilis y Pseudomonas aeruginosa, cuyas características morfológicas no interfieren en la diferenciación de los microorganismos diana. La sensibilidad, especificidad y exactitud diagnósticas fueron del 100 %. CONCLUSIÓN: la combinación de las bases nutritivas, los inhibidores selectivos y los sustratos cromogénicos permitió el desarrollo y diferenciación de especies de los microorganismos evaluados. La inoculación en el medio cromogénico de microorganismos diana y no diana y la diferenciación de aquellas cepas donde se detectó color similar de las colonias por medio de pruebas complementarias rápidas, le confirió al medio elevadas sensibilidad, especificidad y exactitud diagnóstica.

INTRODUCTION: reemergence of Grampositive bacteria infections and the rise of their pathogenicity require a quick and accurate microbiological diagnosis. BioCen has developed a chromogenic composition for isolation, culturing and rapid and presumptive differentiation of gram-positive microorganisms through specific chromogenic reactions in which the inhibition of gramnegative bacteria is partial or total. OBJECTIVE: to evaluate the effect of a combination of nutrient bases, selective inhibitors and chromogenic substrates to increase the selectivity and differential capacity to detect Enterococcus, Streptococcus and Staphylococcus species of clinical importance. METHODS: twenty one microbial strains from the American Type Culture Collection and 24 clinical isolates of Enterococcus, Streptococcus and Staphylococcus and of other gramnegative microorganisms were evaluated. Various combinations of nutrient bases, thallium acetate, nalidixic acid and chromogenic substrates were also assessed for the promotion, growth and differentiation of grampositive bacteria. The microbiological functionality was evaluated whereas the diagnostic quality parameters were determined. RESULTS: the combination of nutrient bases allowed the development of grampositive microorganisms in 24 hours and their differentiation through specific chromogenic reactions. The growth of gramnegative microorganisms was inhibited by the thallium acetate (0.014 g·L-1) and nalidixic acid (0,008 g·L-1) except for Proteus mirabilis and Pseudomonas aeruginosa whose morphological characteristics do not interfere with differentiation of target microorganisms. Sensitivity, specificity and accuracy for diagnosis were 100 %. CONCLUSIONS: the combination of nutrient bases, selective inhibitors and chromogenic substrates allowed the development and differentiation of the evaluated microorganism species. The inoculation of target and non-target microorganisms in the chromogenic medium and the differentiation of those strains where a similar color of the colonies was detected by means of supplementary rapid tests provided the medium with high diagnostic sensitivity, specificity and accuracy.
Descritores: Compostos Cromogênicos
Cocos Anaeróbios Gram-Negativos/patogenicidade
Responsável: CU1.1 - Biblioteca Médica Nacional


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Texto completo SciELO Cuba
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Id: lil-781197
Autor: Viera Oramas, Diana Rosa; Rodríguez Martínez, Claudio; Zhurbenko, Raisa.
Título: Recuperación y diferenciación de aeromonas con CromoCen AE y CromoCen AGN / Recovery and differentiation of Aeromonas with CromoCen AE and CromoCen AGN
Fonte: Rev. cuba. invest. bioméd;35(1):36-47, ene.-mar. 2016. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: INTRODUCCIÓN: en la actualidad las especies del género Aeromonas han emergido como un problema de salud pública, son ellas los agentes etiológicos de las enfermedades diarreicas con el aumento de la atención médica por años. Los procedimientos convencionales para su diagnóstico son muy engorrosos, laboriosos y duraderos. Una nueva metodología que emplea medios de cultivo cromogénicos ha permitido la simplificación y aceleración de su diagnóstico, que ofrece resultados altamente específicos. OBJETIVO: estudiar el efecto de la combinación de diferentes agentes selectivos de los microorganismos grampositivos sobre el aumento de la capacidad de recuperación, cuantificación y diferenciación de las especies de Aeromonas. MÉTODOS: se estudió el efecto inhibidor de la combinación de agentes selectivos (desoxicolato de sodio (0,05-0,2 g·L-1), sales biliares (0,65 g·L-1), verde brillante (0,025-0,03 g·L-1), cristal violeta (0,001-0,01 g·L-1) y sulfito de sodio (0,8 g·L-1) sobre los microorganismos grampositivos, así como la capacidad de recuperación, cuantificación y diferenciación de las especies de Aeromonas. Como base se utilizó la formulación de CromoCen AGN, sin el desoxicolato de sodio. RESULTADOS: los valores de las productividades de los medios CromoCen AE y CromoCen AGN a partir del inóculo 1,5 × 102 UFC·mL-1 resultaron, para: A. hydrophila 116,8 % y 23,9 %, A. caviae 100,8 % y 3,95 %, A. bestiarium 93,6 % y 28,8 %, A. culicicola 85,1 % y 66,12 %, A. veronii 116,7 % y 59,2 %, A. popoffi 86,56 % y 13,2 %, A. trota 94,8 % y 11,25 % y para A. eucrinophila 103,9 % y 2,80 %. La nueva composición cromogénica logró la diferenciación de los microorganismos por sus características culturales: color, forma, superficie, bordes en las colonias y proteólisis del medio circundante. CONCLUSIONES: la combinación de diferentes agentes selectivos para la inhibición de los microorganismos grampositivos coadyuvo el aumento de la capacidad de recuperación, cuantificación y diferenciación de las especies de Aeromonas.

INTRODUCTION: Species of the genus Aeromonas are a current public health problem, for they are the etiological agents responsible for the growing incidence of diarrheal diseases requiring medical care. Conventional procedures for their diagnosis are very complicated, laborious and time-consuming. A new methodology based on the use of chromogenic culture media allows diagnostic simplification and acceleration, yielding highly specific results. OBJECTIVE: Study the effect of combining several selective agents for gram-positive microorganisms upon an increased capacity for recovery, quantification and differentiation of Aeromonas species. METHODS: Assessment was conducted of the inhibiting effect of combined selective agents (sodium deoxycholate (0.05-0.2 g·L-1), bile salts (0.65 g·L-1), brilliant green (0.025-0.03 g·L-1), crystal violet (0.001-0.01 g·L-1) and sodium sulfite (0.8 g·L-1)) on gram-positive microorganisms, as well as their capacity for recovery, quantification and differentiation of Aeromonas species. The base used was the CromoGen AGN formulation without sodium deoxycholate. RESULTS: Productivity values for the media CromoCen AE and CromoCen AGN based on inoculation of 1.5 × 102 CFU·mL-1 were 116.8 % and 23.9 % for A. hydrophila, 100.8 % and 3.95 % for A. caviae, 93.6 % and 28.8 % for A. bestiarium, 85.1 % and 66.12 % for A. culicicola, 116.7 % and 59.2 % for A. veronii, 86.56 % and 13.2 % for A. popoffi, 94.8 % and 11.25 % for A. trota, and 103.9 % and 2.8 0% for A. eucrinophila. The new chromogenic composition enabled differentiation of microorganisms based on their cultural characteristics: color, shape, surface, colony borders and environmental proteolysis. CONCLUSIONS: Combination of various selective agents for the inhibition of grampositive microorganisms led to an increased capacity for recovery, quantification and differentiation of Aeromonas species.
Descritores: Compostos Cromogênicos
Aeromonas/patogenicidade
Disenteria/etnologia
Sulfito de Sódio/métodos
Limites: Humanos
Responsável: CU1.1 - Biblioteca Médica Nacional


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Texto completo SciELO Cuba
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Id: lil-722953
Autor: Díaz Pérez, Marilyn; Zhurbenko, Raisa; Lobaina Rodríguez, Tamara; Quiñones Pérez, Dianelys; Rodríguez Martínez, Claudio.
Título: Determinación cuantitativa de enterococos en aguas utilizando un método cromogénico alternativo / Quantitative determination of enterococci in water using an alternative chromogenic method
Fonte: Rev. cuba. invest. bioméd;33(1):1-11, ene.-mar. 2014. tab.
Idioma: es.
Resumo: INTRODUCCIÓN: el control de la calidad de las aguas es vital para la protección de la salud humana y la biodiversidad en el ambiente acuático. Varios microorganismos son utilizados como indicadores de contaminación fecal para este propósito, dentro de ellos los enterococos son considerados buenos indicadores, porque sobreviven más tiempo ante condiciones adversas en la naturaleza. OBJETIVOS: evaluar la capacidad de un nuevo método cromogénico alternativo para la detección y enumeración de enterococos en aguas por la técnica de filtración por membrana, en comparación con el método estándar ISO 7899:2. MÉTODOS: se recolectaron muestras de aguas de tres orígenes diferentes para determinar su calidad. Las muestras se ensayaron en paralelo por las dos metodologías (alternativa y referencia), empleando la técnica de filtración por membrana. Para evaluar el desempeño de los métodos se determinaron varios parámetros: sensibilidad, especificidad, exactitud, porcentaje de falsos positivos, porcentaje de falsos negativos, índice kappa. Los tres primeros parámetros se calcularon para ambos métodos antes y después de la confirmación por pruebas bioquímicas. Los resultados se analizaron desde el punto de vista estadístico, teniendo en cuenta los principales criterios definidos en las normas ISO 16140 e ISO 177994. RESULTADOS: con el método alternativo los resultados se obtuvieron a las 24 h, estos mostraron valores de sensibilidad (99 %) y exactitud (98 %) más elevados que con el de referencia (97 % y 97 %, respectivamente), el cual demoró más de 48 h. La eficiencia y exactitud de ambos métodos fue similar y se obtuvo una concordancia entre ellos casi perfecta (kappa = 0,96) con el total de las muestras de aguas ensayadas. CONCLUSIONES: los resultados alcanzados indican que el método alternativo es eficiente para el recuento de enterococos provenientes de diferentes tipos de muestras de agua. Resulta además un método simple, más rápido y económicamente factible.

INTRODUCTION: water quality control is essential for the protection of human health and biodiversity in the aquatic environment. For this purpose, several microorganisms are used as indicators of fecal contamination. Among them are enterococci, which are considered to be good indicators, since they survive for a longer time in adverse natural conditions. OBJECTIVES: evaluate the suitability of a new alternative chromogenic method for the detection and enumeration of enterococci in water by membrane filtration technique, in comparison with the ISO 7899:2 standard method. METHODS: water samples were collected from three different sources to determine their quality. The samples were assayed in parallel with the two methodologies (alternative and reference) using the membrane filtration technique. The following parameters were determined to evaluate the performance of the methods: sensitivity, specificity, accuracy, percentage of false positives, percentage of false negatives, kappa index. The first three parameters were estimated for both methods before and after confirmation by biochemical testing. Results were analyzed statistically based on the main criteria defined by ISO standards 16140 and 177994. RESULTS: with the alternative method, results were obtained at 24 h, whereas the reference method required more than 48 h. Sensitivity and accuracy were higher with the alternative method (99 % and 98 %, respectively) than with the reference method (97% and 97%, respectively). Both methods had similar efficiency and accuracy, with almost perfect concordance between them (kappa = 0.96) in all the water samples tested. CONCLUSIONS: results show that the alternative method is efficient for the enumeration of enterococci from different types of water samples. It is also a simple, faster and economically feasible method.
Descritores: Qualidade da Água/normas
Técnicas Microbiológicas/métodos
Filtração por Membranas/métodos
Compostos Cromogênicos
Enterococcus/patogenicidade
Glucosidases/análise
Limites: Humanos
Responsável: CU1.1 - Biblioteca Médica Nacional


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: lil-670903
Autor: Brazilian Journal of Medical and Biological Research; Rosa, F.E.; Santos, R.M.; Rogatto, S.R.; Domingues, M.A.C..
Título: Chromogenic in situ hybridization compared with other approaches to evaluate HER2/neu status in breast carcinomas
Fonte: Braz. j. med. biol. res = Rev. bras. pesqui. méd. biol;46(3):207-216, 15/mar. 2013. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) has been evaluated in breast cancer patients to identify those most likely to benefit from herceptin-targeted therapy. HER2 amplification, detected in 20-30% of invasive breast tumors, is associated with reduced survival and metastasis. The most frequently used technique for evaluating HER2 protein status as a routine procedure is immunohistochemistry (IHC). HER2 copy number alterations have also been evaluated by fluorescence in situ hybridization (FISH) in moderate immunoexpression (IHC 2+) cases. An alternative procedure to evaluate gene amplification is chromogenic in situ hybridization (CISH), which has some advantages over FISH, including the correlation between HER2 status and morphological features. Other methodologies have also been used, such as silver-enhanced in situ hybridization (SISH) and quantitative real-time RT-PCR, to determine the number of HER2 gene copies and expression, respectively. Here we will present a short and comprehensive review of the current advances concerning HER2 evaluation in human breast cancer.
Descritores: Neoplasias da Mama/genética
/genética
GENES, ERBB-TEMEFOS/genética
Hibridização in Situ Fluorescente
-Neoplasias da Mama/metabolismo
Neoplasias da Mama/patologia
Compostos Cromogênicos
Amplificação de Genes
Imuno-Histoquímica
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
Sensibilidade e Especificidade
Biomarcadores Tumorais/genética
Limites: Feminino
Humanos
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Research Support, Non-U.S. Gov't
Revisão
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-657617
Autor: Errecalde, Laura; Cogut, Sandra; Erbín, Mariana; Jordá Vargas, Liliana; Cattani, Eugenia; Posse, Tamara; Tutzer, Silvia; Hermes, Ricardo; Kaufman, Sara.
Título: CHROMagar KPC. Comparación con el método propuesto por los Centros para el Control y Prevención de Enfermedades (CDC, EE.UU.) para el estudio de portación rectal y evaluación de falsos positivos / CHROMagar KPC. Comparison with the method proposed by the Centers for Disease Control and Prevention (CDC, USA) for rectal screening and evaluation of false positive results
Fonte: Rev. argent. microbiol;44(2):89-93, jun. 2012. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: Se cultivaron 81 hisopados rectales en el medio CHROMagar KPC y por el método del CDC. Fueron positivos para Klebsiella pneumoniae KPC en CHROMagar KPC, 9/81 y 6/81 con el método del CDC. El medio CHROMagar KPC tuvo dos falsos positivos: 1 K. pneumoniae y 1 Acinetobacter sp. Los falsos positivos del método CDC fueron: 25 Acinetobacter spp., 2 Escherichia coli y4K. pneumoniae. El empleo del medio CHROMagar KPC resultó ser un método con mayor recuperación de aislamientos productores de KPC y menos falsos positivos que el método del CDC. Para evaluar los falsos positivos en el medio CHROMagar KPC se cultivaron 1247 hisopados rectales. Se obtuvieron 1021 negativos, 171 K. pneumoniae KPC y 55 (4,4 %) falsos positivos. Debido al desarrollo de falsos positivos en el medio CHROMagar KPC, se debe confirmar por caracterización fenotípica la presencia de KPC en las bacterias aisladas.

Eighty one rectal swabs (RS) were cultured on CHROMagar KPC and the CDC method. Of the 81 samples, 9 were positive for KPC-producing Klebsiella pneumoniae on CHROMagar KPC, and 6 for the CDC method. CHROMagar KPC had two false positive (FP) results: 1 K. pneumoniae and 1 Acinetobacter sp. FP results on the CDC method were: 25 Acinetobacter spp., 2 Escherichia coli and 4 K. pneumoniae. CHROMagar KPC yielded a better recovery of KPC-producing bacteria and less FP results than CDC method. In order to evaluate FP results on CHROMagar KPC, 1247 RS were cultured and yielded 1021 negatives, 171 KPC-producing K. pneumoniae and 55 FP (4.4 %). Because of the FP results growing on CHROMagar KPC, KPC must be phenotypically confirmed in the bacteria isolated.
Descritores: Resistência beta-Lactâmica
Proteínas de Bactérias/análise
Técnicas Bacteriológicas/métodos
Meios de Cultura
Carbapenêmicos/farmacologia
Klebsiella pneumoniae/isolamento & purificação
Reto/microbiologia
beta-Lactamases/análise
-Ágar
Acinetobacter/enzimologia
Proteínas de Bactérias/genética
Centers for Disease Control and Prevention, U.S.
Compostos Cromogênicos
Escherichia coli/enzimologia
Reações Falso-Positivas
Klebsiella pneumoniae/efeitos dos fármacos
Klebsiella pneumoniae/enzimologia
Klebsiella pneumoniae/genética
Programas de Rastreamento
Fenótipo
Estados Unidos
Resistência beta-Lactâmica/genética
beta-Lactamases/genética
Limites: Humanos
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Estudo de Avaliação
Responsável: AR1.2 - Instituto de Investigaciónes Epidemiológicas


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Id: lil-634671
Autor: Montibello, Silvia E.; Guelfand, Liliana I.; Machaín, Mónica G.; Carrión, Natalia A.; Ferreira, María D.; Pidone, Juan C.; Ceregido, María E.; Kaufman, Sara C.; Soloaga, Rolando N..
Título: Optimización de metodologías de cribaje para la búsqueda de Streptococcus agalactiae en embarazadas / Optimization of screening methodologies for the detection of Streptococcus agalactiae in pregnant women
Fonte: Rev. argent. microbiol;43(1):4-8, ene.-mar. 2011.
Idioma: es.
Resumo: Streptococcus agalactiae es una causa importante de morbimortalidad en mujeres embarazadas y neonatos en todo el mundo. El objetivo del presente trabajo fue determinar la utilidad del medio cromogénico chromID Strepto B de bioMérieux para detectar S. agalactiae en embarazadas cuando la muestra es sembrada directamente en dicho medio o después del enriquecimiento en caldo de Todd Hewitt selectivo, opciones que se compararon con la metodología propuesta por el CDC . Se analizaron 1924 hisopados, 962 de introito vaginal y 962 rectales, correspondientes a 962 embarazadas entre la semana 35 y 37 de gestación, asistidas en distintos hospitales. Los hisopados se sembraron directamente en el medio chromID Strepto B (CR) y luego se colocaron en un caldo de Todd Hewitt selectivo, suplementado con 15 µg/ml de ácido nalidíxico y 10 µg/ml de colistina (CTH-sel). Luego de 24 h de incubación, se realizaron subcultivos en el medio CR y en agar con 5% de sangre de carnero (ASO). La prevalencia global de S. agalactiae fue de 17,4%. La sensibilidad, la especificidad y los valores predictivos positivo y negativo del subcultivo en CR del material desarrollado en el CTH -sel fueron 98,8%, 100%, 100% y 99,7% respectivamente, con una incubación de 48 h. Los valores correspondientes de la siembra directa fueron 57,8%, 100%, 100% y 90%. La sensibilidad del subcultivo en ASO del material desarrollado en el CTH -sel fue del 85%. Se destaca el excelente rendimiento del subcultivo en CR luego del enriquecimiento en caldo de Todd Hewitt selectivo en comparación con el método propuesto por el CDC.

Streptococcus agalactiae is a significant worldwide cause of morbidity and mortality in pregnant women and their newborn infants. The objective of this work was to determine the usefulness of bioMrieux chromogenic medium chromID Strepto B (CR) for detecting S. agalactiae in pregnant women from the selective Todd-Hewitt broth (sel-THB ) against the methods proposed by the CDC . A total of 1924 swabs were analyzed, 962 from vaginal introitus and 962 rectal, belonging to 962 women in weeks 35-37 of pregnancy. The swabs were directly seeded in CR. Both swabs were later placed in sel-THB with 15 µg/ml supplement of nalidixic acid and 10 µg/ml colistin. After 24 h of incubation, subcultures in CR medium and agar containing 5% sheep blood (SBA) were performed. The prevalence found was 17.4%. Sensitivity, specificity, positive and negative predictive values of sel-THB subcultures with CR supplement and 48 h incubation were: 98.8, 100, 100 and 99.7%, respectively. The corresponding values of direct harvest of the sample were 57.8, 100, 100, and 90%, respectively. Sensitivity of sel-THB in SBA was 85%. Sel-THB subculture performance in CR was outstanding in comparison with the method proposed by the CDC.
Descritores: Portador Sadio/diagnóstico
Programas de Rastreamento/métodos
Gravidez
Terceiro Trimestre da Gravidez
Complicações Infecciosas na Gravidez/diagnóstico
Kit de Reagentes para Diagnóstico
Reto/microbiologia
Infecções Estreptocócicas/diagnóstico
Streptococcus agalactiae/isolamento & purificação
Vagina/microbiologia
-Argentina/epidemiologia
Técnicas Bacteriológicas
Meios de Cultura
Portador Sadio/microbiologia
Compostos Cromogênicos/análise
Valor Preditivo dos Testes
Prevalência
Estudos Prospectivos
Complicações Infecciosas na Gravidez/microbiologia
Complicações Infecciosas na Gravidez/prevenção & controle
Sensibilidade e Especificidade
Infecções Estreptocócicas/microbiologia
Infecções Estreptocócicas/prevenção & controle
Streptococcus agalactiae/crescimento & desenvolvimento
Streptococcus agalactiae/patogenicidade
Temperatura
Limites: Feminino
Humanos
Tipo de Publ: Ensaio Clínico
Estudo Multicêntrico
Responsável: AR1.2 - Instituto de Investigaciónes Epidemiológicas


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Id: lil-634602
Autor: Pineda, G.; Scollo, K.; Santiso, G.; Lehmann, E.; Arechavala, A..
Título: Aislamiento de Candida dubliniensis en distintos materiales clínicos: Análisis de métodos fenotípicos de diferenciación con Candida albicans / Isolation of Candida dubliniensis in different clinical samples: Analysis of phenotypical methods to differenciate from Candida albicans
Fonte: Rev. argent. microbiol;40(4):211-217, oct.-dic. 2008. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: Con el objeto de estimar la frecuencia de aislamientos de Candida dubliniensis en materiales clínicos en el Hospital de Infecciosas F. J. Muñiz, se identificaron 388 levaduras entre setiembre de 2005 y agosto de 2007. Doscientos doce aislamientos presentaban color verde en CHROMagar® y producían tubos germinativos y clamidoconidias en agarleche. Para diferenciar cuales de ellos correspondían a Candida albicans o a C. dubliniensis, se utilizaron distintos métodos fenotípicos y se evaluó la utilidad de cada técnica a fin de proponer un algoritmo de identificación simple, económico y confiable. Se estudió el color en 2 medios con sustratos cromogénicos, la producción de clamidoconidias en medios de Staib, agar tomate-zanahoria y agar-tabaco; en este último medio también se evaluaron las características macromorfológicas de las colonias; se evaluó la presencia de actividad lipolítica (medio-opacidad), capacidad de desarrollo a 45 °C y asimilación de D-xilosa. El 6,1% (13/212 aislamientos) correspondió a C. dubliniensis (3,3% del total de levaduras). No se pudo diferenciar entre ambas especies por el color en los medios cromogénicos usados. Las pruebas que resultaron más sensibles y específicas fueron crecimiento a 45 °C, asimilación de D-xilosa, color y desarrollo en agar-tabaco. C. albicans produjo clamidoconidias en los 3 medios diferenciales, entre 11,6% y 15,1% de los casos. La presencia de lipasas se evidenció en el 95,6% de C. albicans pero 2 de las 13 cepas de C. dubliniensis también presentaron halo de opacidad. Consideramos que se deben usar, al menos, 3 métodos diferentes para discriminar entre estas levaduras ya que ninguna prueba es absolutamente sensible o específica.

In order to estimate the frequence of Candida dubliniensis in clinical samples in F. J. Muñiz Infectious Diseases Hospital, a total of 388 yeasts from September 2005 to August 2007. There were 212 isolates which presented a green color on CHROMagar® Candida medium and produced germ tubes and chlamidoconidiae in milk-agar; so as to distinguish whether they corresponded to Candida albicans or C. dubliniensis, different phenotypical methods were utilized. It was also evaluated the usefulness of each one in order to suggest a simple, economic and reliable identification algorithm. Each isolate was subcultured in two chromogenic media and then, the following determinations were done: chlamidospores production in Staib-agar, tomato-carrot-agar and tobacco-agar, colonies macromorphology was also studied in the last medium; opacity-test in Tween 80-CaCl2 agar (lipase activity), growing capacity at 45 °C, and D-xylose assimilation. Thirteen strains (6.1%) corresponded to C. dubliniensis. The difference in color between both species on chromogenic media was not so stressed as it is pointed out in some works. The more specific and sensitive tests were the ability to grow at 45 °C, D-xylose assimilation, color and macroscopic appearance in tobacco-agar. Between 11.6% and 15.1% of C. albicans strains produced chlamidoconidiae in the 3 differential media tested. The opacity halo (lipase) was evident in 95.6% of C. albicans isolates but 2 out of 13 C. dubliniensis also presented precipitation halo. We consider that at least 3 different phenotypical methods should be used to distinguish properly these two species since none of the tests is absolutely sensitive or specific.
Descritores: Candida/isolamento & purificação
Candidíase/microbiologia
-Candida albicans
Candida/classificação
Candida/crescimento & desenvolvimento
Candida/metabolismo
Compostos Cromogênicos/metabolismo
Meios de Cultura/farmacologia
Micologia/métodos
Fenótipo
Especificidade da Espécie
Xilose/metabolismo
Limites: Feminino
Humanos
Masculino
Responsável: AR1.2 - Instituto de Investigaciónes Epidemiológicas



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