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Lemos, Marcílio Figueiredo
Moreira, Regina Celia
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Id: biblio-1021405
Autor: Santos, Ana Paula de Torres; Levi, José Eduardo; Lemos, Marcilio Figueiredo; Calux, Samira Julien; Oba, Isabel Takano; Moreira, Regina Célia.
Título: An in-house real-time polymerase chain reaction: standardisation and comparison with the Cobas amplicor HBV monitor and Cobas Amplipred/Cobas Taqman HBV tests for the quantification of hepatitis B virus DNA
Fonte: Mem Inst Oswaldo Cruz;111(2):134-40, 2016.
Idioma: en.
Resumo: This study aimed to standardise an in-house real-time polymerase chain reaction (rtPCR) to allow quantification of hepatitis B virus (HBV) DNA in serum or plasma samples, and to compare this method with two commercial assays, the Cobas Amplicor HBV monitor and the Cobas AmpliPrep/Cobas TaqMan HBV test. Samples from 397 patients from the state of São Paulo were analysed by all three methods. Fifty-two samples were from patients who were human immunodeficiency virus and hepatitis C virus positive, but HBV negative. Genotypes were characterised, and the viral load was measure in each sample. The in-house rtPCR showed an excellent success rate compared with commercial tests; inter-assay and intra-assay coefficients correlated with commercial tests (r = 0.96 and r = 0.913, p < 0.001) and the in-house test showed no genotype-dependent differences in detection and quantification rates. The in-house assay tested in this study could be used for screening and quantifying HBV DNA in order to monitor patients during therapy.
Descritores: Idoso
Seres Humanos
DNA
Criança
Vírus da Hepatite B
Reação em Cadeia da Polimerase
Adolescente
Soropositividade para HIV
Adulto
Estudos de Avaliação
Técnicas de Diagnóstico Molecular
Técnicas de Genotipagem
Genótipo
Hepatite B
Meia-Idade
Responsável: BR91.2 - Centro de Documentação


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Texto completo SciELO Brasil
Lemos, Marcílio Figueiredo
Moreira, Regina Celia
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Id: lil-772614
Autor: Santos, Ana Paula de Torres; Levi, José Eduardo; Lemos, Marcilio Figueiredo; Calux, Samira Julien; Oba, Isabel Takano; Moreira, Regina Célia.
Título: An in-house real-time polymerase chain reaction: standardisation and comparison with the Cobas Amplicor HBV monitor and Cobas AmpliPrep/Cobas TaqMan HBV tests for the quantification of hepatitis B virus DNA
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;111(2):134-140, Feb. 2016. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: FAPESP.
Resumo: This study aimed to standardise an in-house real-time polymerase chain reaction (rtPCR) to allow quantification of hepatitis B virus (HBV) DNA in serum or plasma samples, and to compare this method with two commercial assays, the Cobas Amplicor HBV monitor and the Cobas AmpliPrep/Cobas TaqMan HBV test. Samples from 397 patients from the state of São Paulo were analysed by all three methods. Fifty-two samples were from patients who were human immunodeficiency virus and hepatitis C virus positive, but HBV negative. Genotypes were characterised, and the viral load was measure in each sample. The in-house rtPCR showed an excellent success rate compared with commercial tests; inter-assay and intra-assay coefficients correlated with commercial tests (r = 0.96 and r = 0.913, p < 0.001) and the in-house test showed no genotype-dependent differences in detection and quantification rates. The in-house assay tested in this study could be used for screening and quantifying HBV DNA in order to monitor patients during therapy.
Descritores: DNA Viral/isolamento & purificação
Técnicas de Genotipagem/normas
Vírus da Hepatite B/isolamento & purificação
Hepatite B Crônica/diagnóstico
Técnicas de Diagnóstico Molecular
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real/normas
-Primers do DNA/normas
Estudos de Avaliação como Assunto
Genótipo
Soropositividade para HIV/sangue
Soropositividade para HIV/diagnóstico
Vírus da Hepatite B/genética
Hepatite B Crônica/sangue
Hepatite C/sangue
Hepatite C/diagnóstico
Invenções/normas
Técnicas de Diagnóstico Molecular/instrumentação
Técnicas de Diagnóstico Molecular/métodos
Sensibilidade e Especificidade
Carga Viral
Limites: Seres Humanos
Masculino
Feminino
Lactente
Pré-Escolar
Criança
Adolescente
Adulto
Meia-Idade
Idoso
Idoso de 80 Anos ou mais
Adulto Jovem
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Estudo Comparativo
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-771210
Autor: Silva, Elisvania Rodrigues da; Macêdo, Francisca Lopes dos Santos; Soares, Lázaro Rogério Carvalho; Rosal, Veronésia Maria de Sena; Carvalho, Nathacha Adriela Lima; Rocha, Maria Gabrielle de Lima.
Título: Diagnóstico molecular do papilomavírus humano por captura híbrida e reação em cadeia da polimerase / Molecular diagnosis of human papillomavirus in hybrid capture and polymerase chain reaction
Fonte: Femina;43(4):181-184, jul.-ago. 2015.
Idioma: pt.
Resumo: A infecção pelo papilomavírus humano (HPV) é extremamente comum e está associada a várias condições clínicas, que variam de infecções assintomáticas a doenças benignas e malignas da mucosa genital, como as verrugas genitais, a neoplasia intraepitelial cervical e o câncer do colo do útero. O objetivo deste estudo foi apresentar as técnicas de biologia molecular por captura híbrida (CH) e reação em cadeia da polimerase (PCR), utilizadas no diagnóstico do HPV e suas aplicações. Métodos mais precisos, quando aplicados em situações especiais, principalmente no caso de divergência entre outros métodos diagnósticos, podem ser aplicados às políticas de saúde pública, visando diminuir a mortalidade causada pelo câncer do colo do útero em consequência do HPV.(AU)

HPV infection is extremely common and is associated with various clinical conditions, ranging from asymptomatic infections to benign and malignant diseases of the genital mucosa, such as genital warts, cervical intraepithelial neoplasia and cervical cancer. The aim of this study was to present the techniques of molecular biology by hybrid capture and PCR, used in the diagnosis of HPV and its applications. More accurate methods when applied in special situations, especially in the case of divergence between other diagnostic methods can be applied to public health policies in order to reduce mortality caused by cervical cancer because of HPV.(AU)
Descritores: DNA/análise
Neoplasias do Colo do Útero/diagnóstico
Reação em Cadeia da Polimerase/métodos
Infecções por Papillomavirus/diagnóstico
Técnicas de Diagnóstico Molecular/métodos
Hibridização de Ácido Nucleico/métodos
-Papillomaviridae/patogenicidade
Bases de Dados Bibliográficas
Limites: Feminino
Tipo de Publ: Revisão
Responsável: BR1365.1 - Biblioteca Biomédica A - CB/A


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Id: biblio-1003885
Autor: Mejía Ochoa, Mónica; Acevedo Toro, Paola Andrea.
Título: Calreticulina: aspectos moleculares y técnicas para su detección / Calreticulin: molecular aspects and techniques for its detection
Fonte: Rev. cuba. hematol. inmunol. hemoter;35(1):e911, ene.-mar. 2019. tab, graf.
Idioma: es.
Resumo: Las neoplasias mieloproliferativas crónicas (NMPC) son enfermedades clonales caracterizadas por un aumento en el número de células maduras circulantes; estas incluyen: policitemia vera (PV), trombocitemia esencial (TE), mielofibrosis primaria (MFP), entre otras. Una de las principales características moleculares de estas tres entidades es la ausencia del gen de fusión BCR/ABL. La primera mutación relacionada directamente con estas neoplasias fue detectada en el gen JAK2; a partir de su descubrimiento, otras mutaciones en los genes del receptor de trombopoyetina (MPL) y calreticulina (CALR) han sido fuertemente relacionadas con la presentación de la enfermedad. La calreticulina es una proteína del retículo endoplásmico con diversas funciones a nivel celular como la homeostasis del calcio y la actividad de chaperona. Hasta la fecha se ha identificado un gran número de mutaciones en el gen CALR. La mayoría de ellas son inserciones y deleciones que generan cambios a nivel proteico con implicaciones importantes en el curso clínico y pronóstico de las neoplasias. Debido a su alta frecuencia y fuerte asociación con las NMPC, las mutaciones de CALR se incluyen como criterio mayor para el diagnóstico de estas entidades. Por este motivo, se han desarrollado varias técnicas encaminadas a la detección rápida, eficiente, sensible y especifica de esta mutación como: la secuenciación, el análisis de fragmentos y el análisis de fusión de alta resolución. El conocimiento e implementación de estas técnicas en los laboratorios clínicos constituye un avance importante para el diagnóstico y la evolución de los pacientes(AU)

Chronic myeloproliferative neoplasms (NMPC) are clonal diseases characterized by an increase in the number of mature circulating cells; these diseases include: polycythemia vera (PV), essential thrombocythemia (ET), primary myelofibrosis (MFP) among others. One of the main molecular characteristics of these three entities is the absence of the BCR/ABL fusion gene. The first mutation related to this group of neoplasms was detected in the JAK2 gene; since its discovery, other mutations in thrombopoietin receptor (MPL) and calreticulin (CALR) genes have been strongly related with the presentation of the disease. Calreticulin is an endoplásmic reticulum protein with different functions in the cell such as calcium homeostasis and the chaperone activity. To date, a large number of mutations have been identified in CALR gene most of them are insertions and deletions that generate changes in the protein that generate important implications in the clinical course and prognosis of neoplasms. Due to its high frequency and strong association with NMPC, CALR mutations are included as a major criteria for the diagnosis of these entities. For this reason, several techniques have been developed aimed at the rapid, efficient, sensitive and specific detection of this mutation as: sequencing, fragment analysis and high resolution fusion analysis. The knowledge and implementation of these techniques in clinical laboratories is an important advance for the diagnosis and in the evolution of patients(AU)
Descritores: Calreticulina/síntese química
-Técnicas de Diagnóstico Molecular
Mutação
Limites: Seres Humanos
Masculino
Feminino
Responsável: CU1.1 - Biblioteca Médica Nacional


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Id: biblio-895457
Autor: Mayer, Fabiana Q; Reis, Emily M. dos; Bezerra, André Vinícius A; Rodrigues, Rogério O; Michel, Thais; Cerva, Cristine; Bertagnolli, Angélica C.
Título: Nasal swab real-time PCR is not suitable for in vivo diagnosis of bovine tuberculosis / A PCR em tempo real de swab nasal não é adequada para o diagnóstico in vivo de tuberculose bovina
Fonte: Pesqui. vet. bras = Braz. j. vet. res;37(6):549-554, jun. 2017. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: CNPq.
Resumo: Bovine tuberculosis (bTB) is a zoonosis causing economic losses and public health risks in many countries. The disease diagnosis in live animals is performed by intradermal tuberculin test, which is based on delayed hypersensitivity reactions. As tuberculosis has complex immune response, this test has limitations in sensitivity and specificity. This study sought to test an alternative approach for in vivo diagnosis of bovine tuberculosis, based on real-time polymerase chain reaction (PCR). DNA samples, extracted from nasal swabs of live cows, were used for SYBR® Green real-time PCR, which is able to differentiate between Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium avium complexes. Statistical analysis was performed to compare the results of tuberculin test, the in vivo gold standard bTB diagnosis method, with real-time PCR, thereby determining the specificity and sensitivity of molecular method. Cervical comparative test (CCT) was performed in 238 animals, of which 193 had suitable DNA from nasal swabs for molecular analysis, as indicated by amplification of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) gene, and were included in the study. In total, 25 (10.5%) of the animals were CCT reactive, of which none was positive in the molecular test. Of the 168 CCT negative animals, four were positive for M. tuberculosis complex at real time PCR from nasal swabs. The comparison of these results generated values of sensitivity and specificity of 0% and 97.6%, respectively; moreover, low coefficients of agreement and correlation (-0.029 and -0.049, respectively) between the results obtained with both tests were also observed. This study showed that real-time PCR from nasal swabs is not suitable for in vivo diagnosis of bovine tuberculosis; thus tuberculin skin test is still the best option for this purpose.(AU)

A tuberculose bovina (bTB) é uma zoonose que causa perdas econômicas e riscos à saúde pública em muitos países. O diagnóstico da doença em animais vivos é realizado pelo teste intradérmico da tuberculina, que é baseado em reações de hipersensibilidade tardia. Como a tuberculose tem resposta imunológica complexa, este teste tem limitações em termos de sensibilidade e especificidade. Este estudo procurou desenvolver uma abordagem alternativa para o diagnóstico in vivo da tuberculose bovina, com base na reação em cadeia da polimerase (PCR) em tempo real. As amostras de DNA, extraídas de suabes nasais de vacas vivas, foram usadas para PCR em tempo real com SYBR® Green, capaz de diferenciar os complexos Mycobacterium tuberculosis e Mycobacterium avium. A análise estatística foi realizada para comparar os resultados de teste de tuberculina, padrão ouro para o diagnóstico in vivo da bTB, com PCR em tempo real, determinando-se assim a especificidade e sensibilidade do método molecular. O teste cervical comparativo (TCC) foi realizado em 238 animais, dos quais 193 tiveram DNA dos suabes nasais adequados para análise molecular, como indicado pela amplificação do gene gliceraldeído-3-fosfato-desidrogenase (GAPDH), e foram incluídos no estudo. No total, 25 (10,5%) animais foram reativos no TCC, dos quais nenhum foi positivo no teste molecular. Dos 168 animais negativos no TCC, quatro foram positivos para o complexo M. tuberculosis na PCR em tempo real a partir dos suabes nasais. A comparação destes resultados gerou valores de sensibilidade e especificidade de 0% e 97,6%, respectivamente; além disso, baixos coeficientes de concordância e correlação (-0,029 e -0,049, respectivamente) entre os resultados obtidos com ambos os testes também foram observados. Este estudo mostrou que a PCR em tempo real a partir de suabes nasais não é adequada para o diagnóstico in vivo da tuberculose bovina; portanto, o teste da tuberculina ainda é a melhor opção para este fim.(AU)
Descritores: Tuberculose Bovina/diagnóstico
Teste Tuberculínico/veterinária
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real/veterinária
-Complexo Mycobacterium avium/isolamento & purificação
Técnicas de Diagnóstico Molecular/veterinária
Mycobacterium bovis/isolamento & purificação
Mycobacterium tuberculosis/isolamento & purificação
Limites: Animais
Bovinos
Responsável: BR68.1 - Biblioteca Virginie Buff D'Ápice


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Alves, Clebert Jose
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Id: biblio-996678
Autor: Ramos, Joelson Marcolino; Heinemann, Marcos Bryan; Ferreira Neto, José Soares; Souza Filho, Antonio Francisco de; Cárdenas, Nicolás Céspedes; Dantas, Antônio Flávio Medeiros; Alves, Clebert José; Azevedo, Sérgio Santos de.
Título: Isolation and identification of Mycobacterium bovis in bovines with positive reaction to the tuberculin test in the state of Paraíba, northeast Brazil / Isolamento e identificação de Mycobacterium bovis em bovinos positivos no teste de tuberculinização no estado da Paraíba, nordeste do Brasil
Fonte: Arq. Inst. Biol;85:e0842016, 2018. ilus, tab.
Idioma: en.
Projeto: CNPq.
Resumo: In areas where human tuberculosis and bovine tuberculosis coexist, differentiation between M. bovis and M. tuberculosis is important for monitoring the spread of M. bovis among cattle and from cattle to humans. The objective of this study was to isolate and identify M. bovis in bovines with positive diagnosis identified on tuberculin test in the State of Paraíba, Northeastern Brazil. Thirty-two bovines that tested positive in the comparative tuberculin test were used, from which samples of any organ with lesions suggestive of tuberculosis were collected, as well as lymph nodes, when no gross lesions were observed. Samples were submitted to histopathological exam, mycobacterial culture, Ziehl-Neelsen staining and molecular diagnosis. Twenty-one (65.6%) animals presented lesions suggestive of tuberculosis. As to body region 77.7% of lesions were found in the thoracic cavity, 12.4% in the head and 9.9% in the abdominal cavity. Among 55 samples submitted to mycobacterial culture, mycobacteria were isolated in 31 (56.4%), being 13 (41.9%) identified as M. bovis and 18 (58.1%) as Mycobacterium spp. Conclusion is that isolation and identification of M. bovis and Mycobacterium spp. in cattle suggests that humans are exposed to the risk of infection. This reinforces the need for intensification and optimization of prevention and control measures foreseen in the Brazilian National Program for the Control and Eradication of Bovine Brucellosis and Tuberculosis. Mycobacteria isolation and identification surveys are, therefore, encouraged in other Northeastern states.(AU)

Em áreas onde a tuberculose humana e a tuberculose bovina coexistem, a diferenciação entre M. bovis e M. tuberculosis é importante para monitorar a disseminação de M. bovis entre bovinos e destes para os seres humanos. Objetivou-se neste estudo isolar e identificar M. bovis em bovinos com diagnóstico positivo pelo teste de tuberculinização no estado da Paraíba, nordeste do Brasil. Foram submetidos 32 bovinos positivos ao teste de tuberculinização comparativa, dos quais foram colhidas amostras de qualquer órgão com lesões sugestivas de tuberculose, e, nos casos em que não foram observadas lesões sugestivas, foram colhidas amostras de linfonodos. As amostras foram submetidas a exame histopatológico, cultivo micobacteriológico, coloração de Ziehl-Neelsen e diagnóstico molecular. Apresentaram lesões sugestivas de tuberculose 21 animais (65,6%). Com relação à distribuição das lesões de acordo com a região corporal, 77,7% localizavam-se na cavidade torácica, 12,4% na cabeça e 9,9% na cavidade abdominal. De 55 amostras submetidas ao cultivo de micobactérias, em 31 (56,4%) foram isoladas micobactérias, sendo que em 13 (41,9%) foi identificado M. bovis, e nas 18 restantes (58,1%) foi identificado Mycobacterium spp. Conclui-se que o isolamento e a identificação de M. bovis e Mycobacterium spp. em bovinos indicam que os seres humanos estão expostos ao risco de infecção. Isso reforça a necessidade de intensificação e otimização de medidas de prevenção e controle previstas no Programa Nacional de Controle e Erradicação da Brucelose e Tuberculose Bovina. Sugere-se a realização de estudos de isolamento e identificação de micobactérias em outros estados do Nordeste.(AU)
Descritores: Tuberculose/transmissão
Tuberculose Bovina/transmissão
-Testes Imunológicos/métodos
Brucelose Bovina
Técnicas de Diagnóstico Molecular/métodos
Mycobacterium
Limites: Bovinos
Responsável: BR1942.1 - NID - Biblioteca - Núcleo de Informação e Documentação


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Id: biblio-987561
Autor: Real Cotto, Jhony Joe; Ochoa Andrade, Aurora; Maridueña Silva, Helen; Pacheco Vila, Lourdes Carolina; Vizueta Méndez, Ricardo; Sánchez Haz, Néstor Neil.
Título: Caracterización epidemiológica del zika en mujeres atendidas en el distrito 09D01 de Guayaquil / Epidemiological characterization of zika in women attended in the district 09D01 of Guayaquil
Fonte: INSPILIP;1(2):1-16, jun.-dic. 2017.
Idioma: es.
Resumo: Introducción. El virus del Zika es un flavivirus que es transmitido por mosquitos principalmente del género Aedes. Aproximadamente el 80 % de las personas infectadas no presenta síntomas. Objetivo. Caracterizar epidemiológicamente la enfermedad del Zika, en mujeres atendidas en el distrito 09D01 durante enero a junio del 2017. Metodología. Fue de diseño no experimental, descriptivo, analítica de corte transversal en mujeres atendidas en la consulta externa. Resultados. Se obtuvo el grupo mayormente afectado de 30 - 39 años con 30,41 %, 20 - 29 años con 29,90 %, entre otros; pero en las embarazadas, fue el grupo etario de 20 ­ 29 años con 47,42 %, seguido del 30 ­ 39 años de edad con 40,21 %, entre otros. En el caso de las no embarazadas se observó en edades de 0 a 9 años, 10 a 19 años y en más de 50 años. En cuanto a las embarazadas, mayormente fueron en el segundo trimestre con 48,44 %. Los resultados de laboratorio dio positivo el 98,97 % de los casos con PCR y nexo epidemiológico 1,03 %; siendo el Hospital Materno Infantil y Centro de Salud N.° 3 de mayor detección. Conclusiones. El comportamiento de la enfermedad del Zika influye en las mujeres atendidas en el distrito 09D01, presentándose a cualquier edad y especialmente en las mujeres embarazadas en el segundo trimestre de gestación; con características sintomáticas variables. Por lo tanto, es significativo anotar que se debe continuar observando el debutar clínico en el futuro próximo, pero sigue siendo importante y de confianza el diagnóstico molecular para su confirmación.

Introduction. The Zika virus is a flavivirus that is transmitted by mosquitoes mainly of the genus Aedes. Approximately 80 % of infected people have no symptoms. Objective. Epidemiological characterization of Zika's disease in women treated in the district 09D01 during January to June of 2017. Methodology. It was of non-experimental, descriptive, cross-sectional analytic design in women attended at the outpatient clinic. Results. It was obtained the group most affected of 30 - 39 years with 30,41 %, 20 - 29 years with 29,90 %, among others; but in the pregnant women, it was the 20- to 29-year-old age group with 47,42 % followed by 30-39 years of age with 40,21 %, among others. In the case of non-pregnant women, it was observed in the ages of 0 to 9 years, 10 to 19 years and in more than 50 years. As for the pregnant women, they were mostly in the second quarter with 48,44 %. Laboratory results were positive in 98,97 % of the cases with PCR and epidemiological link 1,03 %; being the hospital Maternal Infantile and Health Center N.° 3 of greater detection. Conclusions. The behavior of Zika'sdisease influences the women treated in the district 09D01, presenting at any age and especially in pregnant women in the second trimester of gestation; with variable symptomatic characteristics. Therefore, it is significant to note that clinical debut should continue to be observed in the near future, but the molecular diagnosis for confirmation remains important and reliable.
Descritores: Vírus
Flavivirus
Zika virus
-Estudos Transversais
Técnicas de Diagnóstico Molecular
Metodologia
Limites: Seres Humanos
Feminino
Tipo de Publ: Artigo Clássico
Responsável: EC7.1 - Biblioteca


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Id: biblio-911324
Autor: Isasmendi, A; Pinheiro, J L; Campos, B; Pérez, G; Hernández, C.
Título: Microorganismos involucrados en las infecciones respiratorias de pacientes con fibrosis quísitca / Microorganisms involved in respiratory infections in cystic fibrosis patients
Fonte: Med. infant;21(2):85-89, Junio 2014. ilus.
Idioma: es.
Resumo: La fibrosis quística es la enfermedad autosómica recesiva letal más frecuente en la infancia. Se caracteriza por presentar una evolución crónica, progresiva y compromiso multisistémico. El objetivo de este trabajo fue conocer la frecuencia de los microorganismos implicados en las infecciones respiratorias de pacientes fibroquísticos atendidos en el Hospital de Pediatría Prof. Dr. Juan P. Garrahan durante el año 2012 y su resistencia a los antimicrobianos. Para la identificación bacteriana se utilizaron pruebas bioquímicas convencionales, sistemas automatizados y semiautomatizados. En la identificación de miembros del complejo Burkholderia cepacia se utilizaron además métodos moleculares. De esta manera se pudo lograr la clasificación genética de las especies incluidas dentro de ese complejo presentes en los pacientes fibroquísticos de nuestro medio. Este trabajo nos permitió conocer la situación microbiológica actual de las infecciones respiratorias en los pacientes fibroquísticos. Tanto el estudio minucioso de los cultivos convencionales como la caracterización molecular de las especies de B. cepacia deben seguirse en los pacientes colonizados por microorganismos multirresistentes y son imprescindibles en el control postratamiento después del aislamiento de estos patógenos (AU)

Cystic fibrosis is the most common lethal autosomal recessive disease in childhood. It is characterized by a chronic, progressive evolution and multisystemic involvement. The aim of this study was to assess the incidence of the microorganisms involved in respiratory infections of patients with cystic fibrosis seen at the Pediatric Hospital Prof. Dr. Juan P. Garrahan in 2012 and their resistance to antimicrobial agents. To identify the microorganisms conventional biochemical tests with automatized and semiautomatized systems were used. For the identification of members of the Burkholderia cepacia complex molecular studies were additionally used. Species of this complex found in cystic fibrosis patients in our setting were genetically classified allowing for the definition of the current microbiological situation of respiratory infections in cystic fibrosis patients. Careful study of conventional cultures as well as molecular typing of the B. cepacia species should be routinely performed in patients colonized by multiresistant microorganisms and is fundamental in the post-treatment monitoring after the isolation of these pathogens (AU)
Descritores: Infecções Respiratórias/diagnóstico
Infecções Respiratórias/etiologia
Infecções Respiratórias/tratamento farmacológico
Resistência Microbiana a Medicamentos
Burkholderia cepacia/isolamento & purificação
Burkholderia cepacia/efeitos dos fármacos
Fibrose Cística/complicações
Fibrose Cística/microbiologia
Fibrose Cística/tratamento farmacológico
-Técnicas de Diagnóstico Molecular
Limites: Seres Humanos
Lactente
Pré-Escolar
Criança
Adolescente
Responsável: AR305.1 - SID - Servicio de Información y Documentación


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Id: biblio-974007
Autor: Ruiz, Lina; Maya, María Angélica; Rueda, Zulma Vanessa; López, Lucelly; Vélez, Lázaro Agustín.
Título: Current characteristics of tuberculosis and human immunodeficiency virus co-infection in a cohort of hospitalized patients in Medellín, Colombia / Características actuales de la coinfección con tuberculosis y el virus de la inmunodeficiencia humana en pacientes hospitalizados en Medellín, Colombia
Fonte: Biomédica (Bogotá);38(supl.2):59-67, ago. 2018. tab.
Idioma: en.
Resumo: Introduction: Tuberculosis (TB) is an important cause of morbidity and mortality in HIV patients. It is unknown if the advent of molecular diagnostic methods and a greater availability of antiretroviral therapy (ART) in our country have changed some characteristics of the TB/HIV co-infection. Objective: To describe the epidemiology, clinical features, diagnosis, resistance patterns, tuberculosis drug effects and mortality in co-infected patients. Materials and methods: Retrospective study based on the review of medical records of hospitalized co-infected adults in a university hospital in Medellín, Colombia. Results: A total of 178 patients was included in the study. TB and HIV diagnosis was simultaneous in 49.4%. In the moment of TB diagnosis, the median CD4 count was 61 cells/µL (27-145). Pulmonary tuberculosis (PTB) occurred in 28% of patients, extrapulmonary (EPTB) in 23%, and mixed TB in 48.9%. The main EPTB affectations were lymphatic (55.4%), gastrointestinal (35.9%), and of the central nervous system (18.7%). Ziehl-Neelsen stain was positive in 137 patients (77%), mycobacterium culture in 121 (68%), and TB-PCR, in 85 of those patients in whom the test was done. Rifampicin resistance was detected in six cases (4.9%). Transaminases (ALT) increased in half of the patients during TB treatment, but only 10% met liver-toxicity criteria. In-hospital mortality was 11.3%. The single risk factor associated with mortality was CD4 count <50/µL (RR=3.9; 95% CI: 1.36-11.37; p=0.01). Conclusions: When it occurs as an opportunistic infection, TB usually leads to the diagnosis of advanced HIV disease. If used appropriately, TB diagnosis in these patients can be done by conventional methods. It is always necessary to monitor liver function during TB treatment and to rule out drug resistance.

Introducción. La tuberculosis es una causa importante de morbilidad y mortalidad en pacientes positivos para el HIV. Los métodos de diagnóstico molecular y una mayor disponibilidad del tratamiento antirretroviral en el país pueden haber cambiado las características de la infección concomitante. Objetivo. Describir la epidemiología, las características clínicas, el diagnóstico, los patrones de resistencia, los efectos secundarios de los medicamentos antituberculosos y la mortalidad, en pacientes con las dos infecciones. Materiales y métodos. Se hizo un estudio retrospectivo basado en la revisión de historias clínicas de adultos hospitalizados en un hospital universitario de Medellín, Colombia. Resultados. Se incluyeron 178 pacientes en el estudio. El diagnóstico de tuberculosis e infección por el HIV fue simultáneo en 49,9 %. En el momento del diagnóstico, la mediana de CD4 fue de 61 células/ µL (rango de 27 a 145). La tuberculosis pulmonar ocurrió en 28 % de los pacientes, la extrapulmonar en 23% y la mixta en 48,9%. En la tuberculosis extrapulmonar, el compromiso fue principalmente linfático (55,4 %), gastrointestinal (35,9%) y del sistema nervioso central (18,7 %). La tinción de Ziehl-Neelsen fue positiva en 137 pacientes (77 %), en tanto que el cultivo para micobacterias lo fue en 121 (68 %). La reacción en cadena de la polimerasa para detectar la tuberculosis fue positiva en 85 de los pacientes a quienes se les hizo la prueba. Se detectó resistencia a la rifampicina en seis casos (4,9 %). Al iniciar el tratamiento antituberculoso, las transaminasas se elevaron en la mitad de los pacientes, pero solo 10 % cumplieron los criterios de hepatotoxicidad. La mortalidad hospitalaria fue de 11,3 %. El único factor de riesgo asociado con la mortalidad fue un conteo de CD4 menor de 50/µL (RR=3,9; IC95% 1,36-11,37; p=0,01). Conclusiones. Cuando la tuberculosis se presenta de manera oportunista, comúnmente lleva al diagnóstico de enfermedad avanzada por el HIV. Su diagnóstico en estos pacientes puede hacerse con los métodos convencionales. Es necesario vigilar la función hepática durante el tratamiento y excluir la resistencia a los medicamentos.
Descritores: Tuberculose
HIV
-Resistência a Medicamentos
Síndrome de Imunodeficiência Adquirida
Técnicas de Diagnóstico Molecular
Efeitos Colaterais e Reações Adversas Relacionados a Medicamentos
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Id: biblio-972114
Autor: Mota, Dan Jessé Gonçalves da.
Título: Infecção natural por larvas de metastrongilídeos em moluscos terrestres de diferentes regiões do estado de São Paulo.
Fonte: São Paulo; s.n; 2018. 130 p. tab, graf, map.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Secretaria da Saúde do Estado de São Paulo. Coordenadoria de Controle de Doenças. Programa de Pós-Graduação em Ciências para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: Objetivo: Caracterizar a série histórica do número de municípios infestados por Aedes aegypti e por Aedes albopictus no estado de São Paulo (ESP), de 1986 a 2015. Analisar sua sazonalidade, temperaturas médias, indicadores de infestação de cada espécie, e verificar sua interdependência espacial na Região Metropolitana do Vale do Paraíba Paulista (RMVP). Material e Métodos: Os dados das ações de vigilância entomológica foram obtidos com o índice de Breteau (IB), do banco de dados da Superintendência de Controle de Endemias (Sucen). Foram calculadas as médias aritméticas por mês e ano, e analisadas pelo teste de Wilcoxon. Os mapas de temperatura foram obtidos junto ao Instituto Nacional de Meteorologia (INMET). Para análise geoespacial das espécies na RMVP foi empregado o indicador global de Moran (I) e o estimador de densidade Kernel (k). Resultados: O estado de São Paulo apresentou-se quase que totalmente infestado pelas duas espécies, com registro de coexistência em 93,64% dos municípios. A trajetória geográfica dessas espécies...
Descritores: Moluscos
Metastrongyloidea
Microscopia
Técnicas de Diagnóstico Molecular
Limites: Seres Humanos
Responsável: BR91.2 - Centro de Documentação
BR91.2; W4, M917i



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