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Id: biblio-889085
Autor: Teng, Feixiang; Sun, Jinxia; Yu, Lili; Li, Qisong; Cui, Yubao.
Título: Homology modeling and epitope prediction of Der f 33
Fonte: Braz. j. med. biol. res = Rev. bras. pesqui. méd. biol;51(5):e6213, 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: National Natural Sciences Foundation; . Key Program of Wuxi health and Family Planning Commission; . 333 project of Jiangsu Province.
Resumo: Dermatophagoides farinae (Der f), one of the main species of house dust mites, produces more than 30 allergens. A recently identified allergen belonging to the alpha-tubulin protein family, Der f 33, has not been characterized in detail. In this study, we used bioinformatics tools to construct the secondary and tertiary structures and predict the B and T cell epitopes of Der f 33. First, protein attribution, protein patterns, and physicochemical properties were predicted. Then, a reasonable tertiary structure was constructed by homology modeling. In addition, six B cell epitopes (amino acid positions 34-45, 63-67, 103-108, 224-230, 308-316, and 365-377) and four T cell epitopes (positions 178-186, 241-249, 335-343, and 402-410) were predicted. These results established a theoretical basis for further studies and eventual epitope-based vaccine design against Der f 33.
Descritores: Tubulina (Proteína)/química
Alérgenos/química
Epitopos de Linfócito T/química
Epitopos de Linfócito B/química
Dermatophagoides farinae/química
Antígenos de Dermatophagoides/química
-Tubulina (Proteína)/genética
Tubulina (Proteína)/imunologia
Alérgenos/genética
Alérgenos/imunologia
Estrutura Molecular
Estrutura Terciária de Proteína
Mapeamento de Epitopos
Epitopos de Linfócito T/genética
Epitopos de Linfócito B/genética
Biologia Computacional
Análise de Sequência de Proteína
Dermatophagoides farinae/genética
Dermatophagoides farinae/imunologia
Antígenos de Dermatophagoides/genética
Antígenos de Dermatophagoides/imunologia
Limites: Animais
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: biblio-841780
Autor: Sodero, Ana Carolina Rennó; Abrahim-Vieira, Bárbara; Torres, Pedro Henrique Monteiro; Pascutti, Pedro Geraldo; Garcia, Célia RS; Ferreira, Vitor Francisco; Rocha, David Rodrigues da; Ferreira, Sabrina Baptista; Silva Jr, Floriano Paes.
Título: Insights into cytochrome bc1 complex binding mode of antimalarial 2-hydroxy-1, 4-naphthoquinones through molecular modelling
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;112(4):299-308, Apr. 2017. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: FAPESP.
Resumo: BACKGROUND Malaria persists as a major public health problem. Atovaquone is a drug that inhibits the respiratory chain of Plasmodium falciparum, but with serious limitations like known resistance, low bioavailability and high plasma protein binding. OBJECTIVES The aim of this work was to perform molecular modelling studies of 2-hydroxy-1,4-naphthoquinones analogues of atovaquone on the Qo site of P. falciparum cytochrome bc1 complex (Pfbc1) to suggest structural modifications that could improve their antimalarial activity. METHODS We have built the homology model of the cytochrome b (CYB) and Rieske iron-sulfur protein (ISP) subunits from Pfbc1 and performed the molecular docking of 41 2-hydroxy-1,4-naphthoquinones with known in vitro antimalarial activity and predicted to act on this target. FINDINGS Results suggest that large hydrophobic R2 substituents may be important for filling the deep hydrophobic Qo site pocket. Moreover, our analysis indicates that the H-donor 2-hydroxyl group may not be crucial for efficient binding and inhibition of Pfbc1 by these atovaquone analogues. The C1 carbonyl group (H-acceptor) is more frequently involved in the important hydrogen bonding interaction with His152 of the Rieske ISP subunit. MAIN CONCLUSIONS Additional interactions involving residues such as Ile258 and residues required for efficient catalysis (e.g., Glu261) could be explored in drug design to avoid development of drug resistance by the parasite.
Descritores: Plasmodium falciparum/efeitos dos fármacos
Complexo III da Cadeia de Transporte de Elétrons/química
Antimaláricos/farmacologia
Antimaláricos/química
-Naftoquinonas/química
Análise de Sequência de Proteína
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-633044
Autor: Duboscq, Cristina; Kordich, Lucía.
Título: Influencia de las variables preanalíticas en la determinación de proteína S / Influence of preanalytical variables in S protein determination
Fonte: Acta bioquím. clín. latinoam;42(1):89-93, ene.-mar. 2008. graf.
Idioma: es.
Resumo: La proteína S (PS) regula el sistema de coagulación mostrando actividad de cofactor de la Proteína C activada (PCa) con la cual forma un complejo equimolecular. En presencia de iones calcio este complejo inactiva por proteólisis los factores V y VIII activados por trombina. La proteína S plasmática circula 40% libre (fracción que presenta actividad de cofactor de la PCa) y 60% unida al C4-BP (proteína ligante de la fracción C4 del complemento). El objetivo fue comparar el dosaje de PS realizado por método coagulable e inmunoturbidimétrico e investigar cómo las variables preanalíticas afectan los niveles de PS determinados. Se obtuvieron los siguientes resultados: método coagulable: CV intra ensayo: (n=20): 4%, CV interensayo (n=20, 3 días): 3,4%. Método inmunoturbidimétrico: CV intraensayo (n=20): 3,7%.CV Inter. ensayo (n=20,3 días): 4,5%. Existe buena correlación (R2=0,94) entre ambos métodos, cuando la calibración por el método coagulable se realiza en la misma corrida analítica que las muestras. Cuando se realizó el estudio de Bland y Altman los dos métodos mostraron ser comparables en todos los niveles de PS estudiados. No se observaron diferencias significativas entre las muestras determinadas frescas y conservadas a -20 y -80 °C descongeladas solo una vez.

Protein S has an essential anticoagulant function acting as activated Protein C cofactor and forming an equimolecular complex with it. In the presence of calcium this complex regulates the coagulation process inactivating thrombin activated factors V and VIII by proteolysis. In plasma there are two different forms: a) free Protein S which acts as the cofactor of activated protein C (representing about 40% of total Protein S) and b) C4-BP(C4 binding protein) bound protein S which exhibits no activity as cofactor of activated Protein C (representing about 60% of total PS). The objetive was to compare the PS dosage determination by two methods: immunoturbidimetric and clotting, and to investigate how pre-analytical variables affect the results. The following results were obtained: Clotting method: CV intra assay: (n=20): 4%, CV interassay (n=20, 3 days): 3.4%; immunoturbidimetric method CV intra assay (n=20): 3.7%: CV inter assay (n=20.3 days): 4.5%. There is a good correlation (R2 = 0.94) between both methods; when the clotting method is calibrated in batch with the samples. There is significant difference between fresh and frozen ( -20 °C and -80 °C) samples when the latter have been desfrozen only once.
Descritores: Proteína S/análise
Análise de Sequência de Proteína/métodos
-Valores de Referência
Proteína C
Controle Analítico de Qualidade/métodos
Limites: Seres Humanos
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Responsável: AR1.2 - Instituto de Investigaciónes Epidemiológicas


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Id: lil-729793
Autor: Fu, Chunyun; Chen, Shaoke; Chen, Rongyu; Fan, Xin; Luo, Jingsi; Li, Chuan; Qian, Jiale.
Título: Mutation screening of the sodium iodide symporter gene in a cohort of 105 China patients with congenital hypothyroidism / Análise de mutações no gene simportador sódio/iodeto em coorte de 105 pacientes chineses com hipotireoidismo congênito
Fonte: Arq. bras. endocrinol. metab;58(8):828-832, 11/2014. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: National Natural Science Foundation of China; . Guangxi Natural Science Foundation Program.
Resumo: Objective Dyshormonogenetic congenital hypothyroidism (CH) was reported to be associated with a mutation in the sodium iodide symporter (NIS) gene. The present study was undertaken in the Guangxi Zhuang Autonomous Region of China, to determine the nature and frequency of NIS gene mutations among patients with CH due to dyshormonogenesis. Subjects and methods: Blood samples were collected from 105 dyshormonogenetic CH patients in Guangxi Zhuang Autonomous Region, China, and genomic DNA was extracted from peripheral blood leukocytes. All exons of the NIS gene together with their exon-intron boundaries were screened by next-generation sequencing. Results Two silent variations (T221T and T557T) and one missense variation (M435L), as well as two polymorphisms (rs200587561 and rs117626343) were found. Conclusions Our results indicate that the NIS mutation rate is very low in the Guangxi Zhuang Autonomous Region, China, and it is necessary to study mutations of other genes that have major effects on thyroid dyshormonogenesis and have not as yet been studied in this population. .

Objetivo O hipotireoidismo congênito disormonogenético (CH) foi relatado como associado a uma mutação no gene simportador sódio/iodeto (NIS). O presente estudo foi feito na região autônoma de Guangxi Zhuang na China para se determinar a natureza e a frequência das mutações no gene NIS entre pacientes com CH causado por disormonogênese. Sujeitos e métodos: Amostras de sangue foram coletadas de 105 pacientes com CH disormonogenéticos e o DNA genômico foi extraído de leucócitos do sangue periférico. Todos os éxons do gene NIS, junto com seus limites éxon-íntron, foram analisados por sequenciamento de nova geração. Resultados Foram encontradas duas variações silenciosas (T221T e T557T) e uma variação missense (M435L), assim como dois polimorfismos (rs200587561 e rs117626343). Conclusões Nossos resultados indicam que a taxa de mutação em NIS é muito baixa na região de Guangxi Zhuang. É necessário estudar mutações de outros genes que tenham efeitos maiores na disormonogênese da tiroide e que ainda não tenham sido estudados nesta população. .
Descritores: Hipotireoidismo Congênito/genética
Frequência do Gene/genética
Mutação
Simportadores/genética
-China
Estudos de Coortes
DNA
Éxons/genética
Triagem Neonatal
Reação em Cadeia da Polimerase
Polimorfismo Genético/genética
Análise de Sequência de Proteína/métodos
Simportadores/química
Limites: Seres Humanos
Recém-Nascido
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-728810
Autor: Arêas, Glauber P; Schuab, Rôde BB; Neves, Felipe PG; Barros, Rosana R.
Título: Antimicrobial susceptibility patterns, emm type distribution and genetic diversity of Streptococcus pyogenes recovered in Brazil
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;109(7):935-939, 11/2014. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Streptococcus pyogenes is responsible for a variety of infectious diseases and immunological complications. In this study, 91 isolates of S. pyogenes recovered from oropharynx secretions were submitted to antimicrobial susceptibility testing, emm typing and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) analysis. All isolates were susceptible to ceftriaxone, levofloxacin, penicillin G and vancomycin. Resistance to erythromycin and clindamycin was 15.4%, which is higher than previous reports from this area, while 20.9% of the isolates were not susceptible to tetracycline. The macrolide resistance phenotypes were cMLSB (10) and iMLSB (4). The ermB gene was predominant, followed by the ermA gene. Thirty-two emm types and subtypes were found, but five (emm1, emm4, emm12, emm22, emm81) were detected in 48% of the isolates. Three new emm subtypes were identified (emm1.74, emm58.14, emm76.7). There was a strong association between emm type and PFGE clustering. A variety of PFGE profiles as well as emm types were found among tetracycline and erythromycin-resistant isolates, demonstrating that antimicrobial resistant strains do not result from the expansion of one or a few clones. This study provides epidemiological data that contribute to the development of suitable strategies for the prevention and treatment of such infections in a poorly studied area.
Descritores: Variação Genética/genética
Resistência às Penicilinas/genética
Infecções Estreptocócicas/epidemiologia
Streptococcus pyogenes/efeitos dos fármacos
Streptococcus pyogenes/genética
Resistência a Vancomicina/genética
-Antibacterianos/farmacologia
Técnicas de Tipagem Bacteriana
Brasil/epidemiologia
Eritromicina/farmacologia
Genótipo
Macrolídeos/farmacologia
Orofaringe
Fenótipo
Análise de Sequência de Proteína/métodos
Infecções Estreptocócicas/prevenção & controle
Streptococcus pyogenes/classificação
Limites: Adolescente
Adulto
Criança
Pré-Escolar
Feminino
Seres Humanos
Masculino
Meia-Idade
Adulto Jovem
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Cuba
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Id: lil-717174
Autor: Falcón Almeida, Yadira; Quesada Leyva, Lidyce; Sosa Mendoza, Odalys; Fernández Torres, Sandra; Ruiz Hunt, Zaddys; García Chaviano, Ludmila.
Título: Estabilidad de un suero control para proteínas totales como controlador bioquímico en los laboratorios clínicos / Stability of a control serum for total proteins used as a biochemical controller in clinical laboratories
Fonte: Arch. méd. Camaguey;18(4):401-414, jul.-ago. 2014. graf.
Idioma: es.
Resumo: FUNDAMENTO: una de las vías fundamentales para garantizar la calidad en los laboratorios clínicos es mediante el uso del suero control o controlador. El alto costo de estos productos en el mercado nacional es una problemática hoy en día. OBJETIVO: evaluar la estabilidad de un suero bovino adulto para proteínas totales como controlador bioquímico en los laboratorios clínicos. MÉTODO: se realizó un estudio cuasiexperimental, mediante muestreo probabilístico durante tres años (enero de 2010-diciembre de 2012). Se evaluó la estabilidad a tiempo real del suero enriquecido con proteínas totales durante 12 meses a dos temperaturas (refrigeración y congelación). El estudio quedó diseñado para tres lotes por mes y tres determinaciones por lote, para un número total de muestra del estudio (N=63). RESULTADOS: se obtuvo un suero control líquido para proteínas totales. La concentración de proteínas totales, en el producto obtenido en condiciones de refrigeración y congelación se mantuvieron estables por un tiempo de 12 meses. El producto obtenido al compararse con el suero control de la firma OLYMPUS, mostró fluctuaciones similares con respecto a la concentración de proteínas totales. CONCLUSIONES: se logró un material de referencia como controlador estable por un período de 12 meses.

BACKGROUND: one of the main ways to guarantee the quality in clinical labs is by using a control serum or controller. A problem we face is the lack of these products in the domestic market due to their high cost. OBJECTIVE: to evaluate the stability of an adult bovine serum for total proteins as a biochemical controller in clinical labs. METHOD: a quasiexperiment was conducted during three years (January 2010- December 2012) through a probabilistic sampling. The stability in real time of the serum enriched with total proteins was evaluated during 12 months under two temperatures (refrigeration and freezing). The study was designed for three batches per month and three determinations per batch, for a total number of sample of the study (N=63). RESULTS: a liquid control serum for total proteins was obtained. The concentration of total proteins in the product obtained under refrigeration and freezing conditions kept stable for 12 months. The obtained product, when compared to the control serum from the company OLYMPUS, showed similar fluctuations regarding the concentration of total proteins. CONCLUSIONS: a reference material was obtained as a stable controller for a period of 12 months..
Descritores: Controle de Qualidade
Padrões de Referência
Análise de Sequência de Proteína
Soro/química
-Epidemiologia Experimental
Limites: Seres Humanos
Responsável: CU1.1 - Biblioteca Médica Nacional


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Brandäo, Lucinda Giampietro
Abrao, Emiliana Pereira
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Id: lil-703647
Autor: Maruyama, Sandra Regina; Castro-Jorge, Luiza Antunes; Ribeiro, Jose Marcos Chaves; Gardinassi, Luiz Gustavo; Garcia, Gustavo Rocha; Brandao, Lucinda Giampietro; Rodrigues, Aline Rezende; Okada, Marcos Ituo; Abrao, Emiliana Pereira; Ferreira, Beatriz Rossetti; Fonseca, Benedito Antonio Lopes da; Miranda-Santos, Isabel Kinney Ferreira de.
Título: Characterisation of divergent flavivirus NS3 and NS5 protein sequences detected in Rhipicephalus microplus ticks from Brazil
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;109(1):38-50, 02/2014. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: FAPESP; . FAPESP; . FAPESP; . FAPESP; . FAPESP; . FAPESP; . CNPq; . CNPq; . CNPq; . CNPq; . CNPq.
Resumo: Transcripts similar to those that encode the nonstructural (NS) proteins NS3 and NS5 from flaviviruses were found in a salivary gland (SG) complementary DNA (cDNA) library from the cattle tick Rhipicephalus microplus. Tick extracts were cultured with cells to enable the isolation of viruses capable of replicating in cultured invertebrate and vertebrate cells. Deep sequencing of the viral RNA isolated from culture supernatants provided the complete coding sequences for the NS3 and NS5 proteins and their molecular characterisation confirmed similarity with the NS3 and NS5 sequences from other flaviviruses. Despite this similarity, phylogenetic analyses revealed that this potentially novel virus may be a highly divergent member of the genus Flavivirus. Interestingly, we detected the divergent NS3 and NS5 sequences in ticks collected from several dairy farms widely distributed throughout three regions of Brazil. This is the first report of flavivirus-like transcripts in R. microplus ticks. This novel virus is a potential arbovirus because it replicated in arthropod and mammalian cells; furthermore, it was detected in a cDNA library from tick SGs and therefore may be present in tick saliva. It is important to determine whether and by what means this potential virus is transmissible and to monitor the virus as a potential emerging tick-borne zoonotic pathogen.
Descritores: Flavivirus/química
RNA Viral/isolamento & purificação
Rhipicephalus/virologia
Proteínas não Estruturais Virais/química
-Brasil
Sequência Conservada/genética
Flavivirus/classificação
Flavivirus/isolamento & purificação
Biblioteca Gênica
Interações Hidrofóbicas e Hidrofílicas
Filogenia
Reação em Cadeia da Polimerase
RNA Helicases/química
Alinhamento de Sequência/estatística & dados numéricos
Análise de Sequência de Proteína/métodos
Serina Endopeptidases/química
Extratos de Tecidos/análise
Transcriptoma/genética
Limites: Animais
Bovinos
Tipo de Publ: Research Support, N.I.H., Intramural
Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-691570
Autor: Inoue, Lilian Tiemi.
Título: Caracterização funcional da interação entre as proteínas CTSP-1 e CTCF / Functional characterization of the interaction between the proteins CTSP-1 and CTCF.
Fonte: São Paulo; s.n; 2011. 135 p. ilus, tab, graf.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Instituto de Química para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: Os antígenos cancer-testis (CT) são proteínas imunogênicas expressas em tecido gametogênico e em diferentes tipos de tumor, sendo considerados candidatos promissores para a imunoterapia do câncer. Entretanto, pouco se sabe sobre a função desses antígenos na tumorigênese. Em 2006, identificamos CTSP-1 como um novo antígeno CT, frequentemente expresso em vários tumores. Nesse trabalho, investigamos a função de CTSP-1 por meio da identificação de proteínas expressas em tumores de próstata e que são capazes de interagir fisicamente com esse antígeno. Demonstramos que CTSP-1 interage com a proteína CTCF em ensaios de duplo-híbrido em leveduras, pulldown e de co-localização e, em seguida, analisamos o impacto da superexpressão de CTSP-1 no controle da expressão de genes CT mediada por CTCF e na progressão do ciclo celular. Utilizando o CT NY-ESO-1 como modelo, demonstramos que a superexpressão de CTSP-1 não altera os níveis endógenos de NY-ESO-1 na linhagem celular tumoral H1299. Por outro lado, observamos que a superexpressão de CTSP-1 48h após as transfecções em H1299 induz um bloqueio do ciclo em G0/G1, reduzindo a capacidade clonogênica dessas células por um mecanismo dependente dos níveis de expressão de CTSP-1. Resultados semelhantes não foram observados em ensaios com clones superexpressando CTSP-1 estavelmente, o que sugere que eles tenham se originado de células que conseguiram escapar do bloqueio em G0/G1. Resultados preliminares sugerem que a redução da capacidade clonogênica das células H1299 que superexpressam CTSP-1 48h após as tansfecções não está associada à ocorrência de morte por apoptose.

Cancer-testis (CT) antigens are immunogenic proteins expressed in gametogenic tissues and in different histological types of tumors, being considered promising candidates for cancer immunotherapy. However, little is known about their role in tumorigenesis. In 2006, we identified CTSP-1 as a novel CT antigen, frequently expressed in different types of tumors. In this work, we investigated the functional role of CTSP-1 through the identification of proteins expressed in prostate tumors and that physically interact with this tumor antigen. We demonstrate that CTSP-1 interacts with the CTCF protein using the yeast two-hybrid system, pulldown and co-localization assays and have further analyzed the impact of CTSP-1 overexpression on the expression of CT genes mediated by CTCF and on the cell cycle progression. Using the CT antigen NY-ESO-1 as a model, we showed that the CTSP-1 overexpression does not alter the endogenous levels of NY-ESO-1 in the tumor cell line H1299. On the other hand, we observed that the overexpression of CTSP-1 in H1299 cells 48h after the transfections induces a cell cycle arrest in G0/G1 and reduces the clonogenic capacity of these cells by a mechanism dependent on the CTSP-1 expression levels. Similar results were not observed for cell clones stably overexpressing CTSP-1, suggesting that these clones have arisen from cells that managed to escape cell cycle arrest in G0/G1. Preliminary results suggest that the reduced clonogenic capacity of H1299 cells expressing CTSP-1 and analyzed 48h after the transfections is not associated with cell death by apoptosis.
Descritores: Ciclo Celular/genética
Biologia Molecular
Neoplasias da Próstata/imunologia
Mapeamento de Interação de Proteínas
-Antígenos de Neoplasias/química
Células Neoplásicas Circulantes
Análise de Sequência de Proteína
Responsável: BR40.1 - DBD - Divisão de Biblioteca e Documentacão do Conjunto das Químicas
BR40.1; T574.88, I58c. T24595-Q


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Id: lil-689770
Autor: Teixeira, E A; Euler, A C C; Faria, P M C; Turra, E M; Luz, R K; Prado, S A; Takata, R; Ribeiro, P A P; Fontes, D O; Ribeiro, L P; Saliba, E O S.
Título: Performance and nutrient utilization in South American juvenile catfish Pseudoplatystoma spp. weighting 89 - 170g, fed at different energy and protein levels / Desempenho e utilização de nutrientes em juvenis de surubim Pseudoplatystoma spp. alimentados com diferentes níveis de energia e proteína
Fonte: Arq. bras. med. vet. zootec;65(5):1500-1508, out. 2013. graf, tab.
Idioma: en.
Resumo: Most studies in nutrition for the South American catfish (surubim) were limited to the initial phase of development. However, it is clear that performance and nutrient utilization can change during the life stages of a fish. Therefore, this study aimed to evaluate the performance and nutrient utilization in juveniles of surubim fed diets varying in protein and energy levels. Two experiments were performed to test different levels of energy and protein in formulated diets. In the first experiment, surubim juveniles (89.2±4.8g) were fed five diets containing different levels of energy (18.0, 18.8, 19.6, 20.5, 21.3 MJ/kg). In the second experiment, juveniles (170.03±3.35g) were fed five diets containing different levels of protein (360, 400, 440, 480 and 520g/kg). The most favorable energy level for weight gain was 20.3 MJ/kg. The increasing energy levels provided a rise in fat and decrease in protein whole-body composition. The protein amount was between 360 to 400g/kg (383g/kg), which was adequate for performance and nutrient assimilation in surubim juveniles.

A maior parte dos estudos a respeito dos aspectos nutricionais do surubim está limitada às primeiras fases de desenvolvimento. Entretanto, é claro que o desempenho e a utilização dos nutrientes podem mudar durante os diferentes estágios de desenvolvimento destes animais. Assim sendo, este estudo teve como objetivo avaliar o desempenho e a utilização de nutrientes em juvenis de surubim alimentados com dietas contendo níveis variáveis de energia e proteína. Dois experimentos foram realizados para testar os diferentes níveis de proteína e energia. No primeiro experimento, juvenis de surubim (89,2±4,8g) foram alimentados com cinco dietas contendo níveis diferentes de energia (18.0, 18.8, 19.6, 20.5, 21.3MJ/kg). No segundo experimento, os juvenis (170,03±3,35g) foram alimentados com dietas contendo cinco níveis de proteína (360, 400, 440, 480 e 520g/kg). O melhor nível de energia para ganho de peso foi 20,3 MJ/kg. O aumento dos níveis de energia levou a um incremento nos níveis de lipídeo e diminuição da proteína corporal. Níveis de proteína entre 360 a 400g/kg foram os mais adequados para o desempenho e utilização dos nutrientes em juvenis grandes de surubim.
Descritores: Análise de Sequência de Proteína/veterinária
Fenômenos Fisiológicos da Nutrição Animal/fisiologia
-Peixes/anatomia & histologia
Peixes/classificação
Peixes/genética
Limites: Animais
Responsável: BR68.1 - Biblioteca Virginie Buff D'Ápice


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Id: lil-666021
Autor: International Braz J Urol; Ornellas, Paulo; Ornellas, Antonio Augusto; Chinello, Clizia; Gianazza, Erica; Mainini, Veronica; Cazzaniga, Marta; Pereira, Denise Abreu; Sandim, Vanessa; Cypriano, Ana Sheila; Koifman, Leandro; Silva, Paulo Cesar Barbosa da; Alves, Gilda; Magni, Fulvio.
Título: Downregulation of C3 and C4A/B complement factor fragments in plasma from patients with squamous cell carcinoma of the penis
Fonte: Int. braz. j. urol;38(6):739-749, Nov-Dec/2012. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: Italian Ministry of Universities and Research; . Italian Institute of Technology (IIT); . Programa de Oncobiologia; . FAPERJ.
Resumo: Purpose

To investigate the use of ClinProt technique to identify cancer markers in plasma of patients suffering from squamous cell carcinoma of the penis (SCCP). Materials and Methods

Plasma of 36 healthy subjects and 25 patients with penile carcinoma who underwent surgical treatment between June 2010 and June 2011 was collected and analyzed by the ClinProt/MALDI/ToF technique. Then the peptides were identified from the C8 MB eluted fraction of patients' and control subjects' plasma by LIFT MS/MS. Results

A cluster of 2 peptides (A=m/z 1897.22 ± 9 Da and B=m/z 2021.99 ± 9 Da) was able to discriminate patients from control subjects. Cross validation analysis using the whole casuistic showed 62.5% and 86.76% sensitivity and specificity, respectively. The cluster also showed very high sensitivity (100%) and specificity (97%) for SCCP patients that died due to the disease. Furthermore, patients with lymph node involvement presented sensitivity and specificity of 80% and 97%, respectively. These two peptides were identified by the proteomic approach based on a MALDI-TOF/TOF as fragments of C3 (m/z 1896.17) and C4a/b (m/z 2021.26) complement proteins. Conclusions

The results showed that as the disease progresses, the fragments C3 and C4 A/B are less expressed in comparison with healthy subjects. These results may be useful as prognostic tools. .

Descritores: Carcinoma de Células Escamosas/sangue
/análise
COMPLEMENT CABATTOIRS/análise
/análise
COMPLEMENT CABBREVIATIONS AS TOPICA/análise
/análise
COMPLEMENT CABBREVIATIONS AS TOPICB/análise
Neoplasias Penianas/sangue
-Carcinoma de Células Escamosas/imunologia
Carcinoma de Células Escamosas/patologia
Regulação para Baixo
Neoplasias Penianas/imunologia
Neoplasias Penianas/patologia
Reprodutibilidade dos Testes
Sensibilidade e Especificidade
Análise de Sequência de Proteína
Espectrometria de Massas por Ionização e Dessorção a Laser Assistida por Matriz
Biomarcadores Tumorais/sangue
Limites: Adulto
Idoso
Idoso de 80 Anos ou mais
Seres Humanos
Masculino
Meia-Idade
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME



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