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Id: biblio-1087522
Autor: Du, Chunhua; Wu, Yanqiu; Ju, Yurong; Zhao, Junli; Yang, Peiyan; Mao, Qinwen; Xia, Haibin.
Título: The luciferase reporter system of the MMP12 endogenous promoter for investigating transcriptional regulation of the human MMP12 gene
Fonte: Electron. j. biotechnol;43:55-61, Jan. 2020. tab, ilus, graf.
Idioma: en.
Projeto: Fundamental Research Funds for Innovation Founds of Graduate Programs, Shaanxi Normal University; . National Natural Science Foundation of China; . Key Research and Development Plan of Shaanxi Province; . Fundamental Research Funds for the Central Universities; . National Students' Platform for Innovation and Entrepreneurship Training Program.
Resumo: Background: Matrix metalloproteinase 12 (MMP12), a member of MMPs, can take lots of roles including extracellular matrix component degradation, viral infection, inflammation, tissue remodeling and tumorigenesis. To explore the transcriptional regulation of MMP12 gene, a sensitive luciferase reporter HEK293 cell line for endogenous MMP12 promoter was generated by CRISPR/Cas9 technology. Results: The HEK293-MMP12-T2A-luciferase-KI cell line was successfully established by CRISPR/Cas9 technology. The sequencing results indicated that one allele of the genome was proven to have a site-directed insertion of luciferase gene and another allele of the genome was confirmed to have additional 48 bp insertion in this cell line. The cell line was further demonstrated to be a sensitive reporter of the endogenous MMP12 promoter by applying transcription factors STAT3, AP-1 and SP-1 to the cell line. The reporter cell line was then screened with bioactive small molecule library, and a small molecule Tanshinone I was found to significantly inhibit the transcriptional activity of MMP12 gene in HEK293-MMP12-T2A-luciferase-KI cell line by luciferase activity assay, which was further confirmed to inhibit the expression of MMP12 mRNA in wild-type HEK293 cells. Conclusions: This novel luciferase knock-in reporter system will be helpful for investigating the transcriptional regulation of MMP12 gene and screening the drugs targeting MMP12 gene.
Descritores: Metaloproteinase 12 da Matriz/genética
Sistemas CRISPR-Cas
Luciferases/genética
-Transcrição Genética
Comunicação Celular
Linhagem Celular
Regiões Promotoras Genéticas/genética
Técnicas de Cultura de Células
Matriz Extracelular
Técnicas de Introdução de Genes
Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas
Limites: Humanos
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: biblio-1041952
Autor: Bergel, Salvador Darío.
Título: El impacto ético de las nuevas tecnologías de edición genética / The ethical impact of new genetic editing technologies / O impacto ético das novas tecnologias de edição genética
Fonte: Rev. bioét. (Impr.);25(3):454-461, out.-dez. 2017.
Idioma: es.
Resumo: Resumen El descubrimiento de la técnica CRISPR/CAS 9 de edición genética abre importantes horizontes para la investigación científica. Los problemas éticos, jurídicos y sociales que pueden importar su aplicación a humanos son inmensos, lo que justifica un amplio debate social. El trabajo indaga sobre los temas más significativos que podría incluir tal debate.

Abstract The discovery of the CRISPR/CAS 9 genetic engineering technique opens up important new horizons for scientific research. The ethical, legal and social problems that can be applied to humans are immense, and justify a broad social debate. The present study looks at the most significant issues that might be included in such a debate.

Resumo O descobrimento da técnica CRISPR/CAS 9 de edição genética abre importantes horizontes para a pesquisa científica. Os problemas éticos, jurídicos e sociais que podem surgir com a aplicação em humanos são enormes, o que justifica um debate social amplo. O trabalho indaga sobre os temas mais significativos que poderiam ser incluídos em tal debate.
Descritores: Bioética
Terapia Genética
Tomada de Decisões
Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas
Edição de Genes
Princípios Morais
Responsável: BR67.1 - CIR - Biblioteca - Centro de Informação e Referência


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: biblio-1001467
Autor: Huescas, C G Y; Pereira, R I; Prichula, J; Azevedo, P A; Frazzon, J; Frazzon, A P G.
Título: Frequency of Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPRs) in non-clinical Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium strains / Frequência das repetições palindrômicas curtas agrupadas e regularmente interespaçadas (CRISPRs) em cepas não-clínicas de Enterococcus faecalis e Enterococcus faecium
Fonte: Braz. j. biol;79(3):460-465, July-Sept. 2019. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: CNPq.
Resumo: Abstract The fidelity of the genomes is defended by mechanism known as Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR) systems. Three Type II CRISPR systems (CRISPR1- cas, CRISPR2 and CRISPR3-cas) have been identified in enterococci isolates from clinical and environmental samples. The aim of this study was to observe the distribution of CRISPR1-cas, CRISPR2 and CRISPR3-cas in non-clinical strains of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium isolates from food and fecal samples, including wild marine animals. The presence of CRISPRs was evaluated by PCR in 120 enterococci strains, 67 E. faecalis and 53 E. faecium. It is the first report of the presence of the CRISPRs system in E. faecalis and E. faecium strains isolated from wild marine animal fecal samples. The results showed that in non-clinical strains, the CRISPRs were more frequently detected in E. faecalis than in E. faecium. And the frequencies of CRISPR1-cas and CRISPR2 were higher (60%) in E. faecalis strains isolated from animal feces, compared to food samples. Both strains showed low frequencies of CRISPR3-cas (8.95% and 1.88%). In conclusion, the differences in the habitats of enterococcal species may be related with the results observe in distribution of CRISPRs systems.

Resumo A fidelidade dos genomas ​​é defendida por mecanismos conhecidos como sistemas de repetições palindrômicas curtas agrupadas e regularmente interespaçadas (CRISPRs). Três tipos de sistemas CRISPR II (CRISPR1-cas, CRISPR2 e CRISPR3-cas) têm sido identificados em cepas de enterococos isolados de amostras clínicas e ambientais. O objetivo deste estudo foi observar a distribuição dos CRISPR1-cas, CRISPR2 e CRISPR3-cas em cepas não-clínicas de Enterococcus faecalis e Enterococcus faecium isoladas de amostras alimentícias e fecais, incluindo animais marinhos selvagens. A presenca dos CRISPRs foi determinada por PCR em 120 cepas de enterococos, sendo 67 E. faecalis e 53 E. faecium. É o primeiro relato da presença do sistema CRISPRs nas estirpes E. faecalis e E. faecium isoladas de amostras fecais de animais marinhos selvagens. Os resultados mostraram que em cepas não-clínicas, os CRISPRs foram mais frequentemente detectados em E. faecalis do que em E. faecium. E as frequências de CRISPR1-cas e CRISPR2 foram maiores (60%) em cepas de E. faecalis isoladas de fezes de animais, quando comparadas à amostras de alimentos. Ambas as cepas apresentaram baixas freqüências de CRISPR3-cas (8,95% e 1,88%). Em conclusão, as diferenças nos habitats das espécies de enterococos podem estar relacionadas com os resultados observados na distribuição dos sistemas CRISPRs.
Descritores: Enterococcus faecium/genética
Enterococcus faecalis/genética
Fezes/microbiologia
Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas
Microbiologia de Alimentos
-Tartarugas/microbiologia
Verduras/microbiologia
Galinhas/microbiologia
Laticínios/microbiologia
Leite/microbiologia
Spheniscidae/microbiologia
Otárias/microbiologia
Carne/microbiologia
Limites: Animais
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Venezuela
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Id: lil-783088
Autor: Patiño, Margareth A; Abadía, Edgar; Gómez, Solalba; Maes, Mailis; Muñoz, Mariana; Gómez, Daniela; Guzmán, Patricia; Méndez, María Victoria; Ramirez, Carmen; España, Mercedes; de Waard, Jacobus; Takiff, Howard.
Título: Mycobacterium tuberculosis population structure and molecular epidemiological analysis in Sucre municipality, Miranda state, Venezuela / Estructura poblacional y análisis epidemiológico molecular de Mycobacterium tuberculosis en el municipio Sucre, estado Miranda, Venezuela
Fonte: Invest. clín;55(4):332-351, dic. 2014. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: Sucre municipality is a large, densely populated marginal area in the eastern part of Caracas, Venezuela that consistently has more cases of tuberculosis than other municipalities in the country. To identify the neighborhoods in the municipality with the highest prevalence of tuberculosis, and determine whether the Mycobacterium tuberculosis strain distribution in this municipality is different from that previously found in the western part of Caracas and the rest of Venezuela, we collected data on all tuberculosis cases in the municipality diagnosed in 2005-6. We performed two separate molecular epidemiological studies, spoligotyping 44 strains in a first study, and spoligotyping 131 strains, followed by MIRU-VNTR 15 on 21 clustered isolates in the second. With spoligotyping, the most common patterns were Shared International Type SIT17 (21%); SIT42 (15%); SIT93 (11%); SIT20 (7%); SIT53 (6%), a distribution similar to other parts of Venezuela, except that SIT42 and SIT20 were more common. MIRU-VNTR 15 showed that six of seven SIT17 strains examined belonged to a large cluster previously found circulating in Venezuela, but all of the SIT42 strains were related to a cluster centered in the neighborhoods of Unión and Maca, with a MIRU-VNTR pattern not previously seen in Venezuela. It appears that a large percentage of the tuberculosis in the Sucre municipality is caused by the active transmission of two strain families centered within distinct neighborhoods, one reflecting communication with the rest of the country, and the other suggesting the insular, isolated nature of some sectors.

El municipio Sucre es un área densamente poblada del este de Caracas, Venezuela, con más casos de tuberculosis que otros municipios del país. Para establecer las áreas en el municipio Sucre con la mas alta prevalencia de tuberculosis y determinar sí la distribución de cepas de Mycobacterium tuberculosis es diferente de las encontradas previamente en el Oeste de Caracas y el resto de Venezuela, se recolectaron los datos de todos los casos diagnosticados de tuberculosis en el municipio en el 2005-6. Además, se aplicaron dos estudios de epidemiología molecular, el primero con 44 aislados en 2006 y el segundo con 131 aislados del 2006 al 2011, todos caracterizados por spoligotyping. Fue aplicada la técnica MIRU VNTR15 sobre 21 aislados agrupados. Con spoligotyping, los patrones encontrados fueron SIT17 (21%); SIT42 (15%); SIT93 (11%); SIT20 (7%); SIT53 (6%), presentando una distribución similar en otras partes de Venezuela, con la diferencia de que el SIT42 y el SIT20 fueron comunes en el municipio. MIRU VNTR15 mostró que seis de las siete cepas SIT17 pertenecían a un gran grupo encontrado previamente en Venezuela, mientras las cepas SIT42, estaban relacionados a un grupo concentrado en los Barrios Unión y Maca, con un patrón MIRU VNTR no visto previamente en Venezuela. Los resultados indicarían que un gran porcentaje de tuberculosis en el municipio Sucre es causada por transmisión activa de dos familias, una reflejando comunicación con el resto del país, y otra sugiriendo que es un aislado propio de algunos Barrios del municipio.
Descritores: Mycobacterium tuberculosis/classificação
Tuberculose/microbiologia
-Técnicas de Tipagem Bacteriana
Análise por Conglomerados
Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas/genética
Mycobacterium tuberculosis/genética
Mycobacterium tuberculosis/isolamento & purificação
Projetos Piloto
Reação em Cadeia da Polimerase/métodos
Características de Residência
Estudos Retrospectivos
Homologia de Sequência do Ácido Nucleico
Especificidade da Espécie
Tuberculose/epidemiologia
População Urbana
Venezuela/epidemiologia
Limites: Humanos
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: VE1.1 - Biblioteca Humberto Garcia Arocha



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