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Texto completo SciELO Chile
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Id: biblio-1089072
Autor: Zhao, Jun; Geng, Lijiao; Chen, Yong; Wu, Chunfang.
Título: SNHG1 promotes MPP+-induced cytotoxicity by regulating PTEN/AKT/mTOR signaling pathway in SH-SY5Y cells via sponging miR-153-3p
Fonte: Biol. Res;53:01, 2020. graf.
Idioma: en.
Resumo: BACKGROUND: Long non-coding RNA small molecule RNA host gene 1 (SNHG1) was previously identified to be relevant with Parkinson's disease (PD) pathogenesis. This work aims to further elucidate the regulatory networks of SNHG1 involved in PD. Methods: 1-methyl-4-phenyl-1,2,3,6-tetrahydropyridine-hydrochloride (MPTP)-induced mice and 1-methyl-4-phenylpyridinium (MPP+)-treated SH-SY5Y cells were respectively constructed as the in vivo and in vitro PD models. Expression levels of SNHG1 and miR-153-3p were detected by qRT-PCR. Protein expression levels of phosphate and tension homology deleted on chromosome ten (PTEN) were measured by western blotting assay. Cell viability and apoptosis were determined by MTT and flow cytometry assays. The interactions among SNHG1, miR-153-3p and PTEN were identified by luciferase reporter assay, RNA immunoprecipitation, and/or RNA pull-down analysis. RESULTS: Increased SNHG1 expression was found in midbrain of MPTP-induced PD mice and MPP+-treated SH-SY5Y cells. Overexpression of SNHG1 lowered viability and enhanced apoptosis in MPP+-treated SH-SY5Y cells. Moreover, SNHG1 acted as a molecular sponge to inhibit the expression of miR-153-3p. Furthermore, miR-153-3p-mediated suppression of MPP+-induced cytotoxicity was abated following SNHG1 up-regulation. Additionally, PTEN was identified as a direct target of miR-153-3p, and SNHG1 could serve as a competing endogenous RNA (ceRNA) of miR-153-3p to improve the expression of PTEN. Besides, enforced expression of PTEN displayed the similar functions as SNHG1 overexpression in regulating the viability and apoptosis of MPP+-treated SH-SY5Y cells. Finally, SNHG1 was found to activate PTEN/AKT/mTOR signaling pathway in SH-SY5Y cells by targeting miR-153-3p. CONCLUSION: SNHG1 aggravates MPP+-induced cellular toxicity in SH-SY5Y cells by regulating PTEN/AKT/mTOR signaling via sponging miR-153-3p, indicating the potential of SNHG1 as a promising therapeutic target for PD.
Descritores: Doença de Parkinson/metabolismo
1-Metil-4-fenilpiridínio/toxicidade
PTEN Fosfo-Hidrolase/metabolismo
Proteínas Proto-Oncogênicas c-akt/metabolismo
Serina-Treonina Quinases TOR/metabolismo
RNA Longo não Codificante/metabolismo
-Doença de Parkinson/genética
Transfecção
Transdução de Sinais
Células Cultivadas
Regulação da Expressão Gênica
Western Blotting
Apoptose
MicroRNAs
Modelos Animais de Doenças
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
RNA Longo não Codificante/genética
Camundongos Endogâmicos C57BL
Limites: Animais
Masculino
Camundongos
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Id: lil-553374
Autor: Maschietto, Mariana.
Título: Caracterização da expressão dos genes da via de sinalização WNT e do processo de transição epitélio-mesênquima durante a embriogênese de rim e suas implicações em tumores de Wilms / Gene expression characterization of WNT signaling pathway and epithelial-mesenchymal transition during kidney embryogenesis and their implications in Wilms tumors.
Fonte: São Paulo; s.n; 2009. 153 p. ilus, tab.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Fundação Antônio Prudente para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: O desenvolvimento do rim envolve interações complexas entre as células epiteliais e mesenquimais. Uma interrupção em qualquer passo crucial da progressão morfogenética pode levar a má formação renal e doenças, incluindo câncer. O tumor de Wilms (TW) ou nefroblastoma é originado pela interrupção da diferenciação das células do blastema metanéfrico resultando em um tumor composto por três componentes histológicos, blastema, epitélio e estroma... Nesse estudo, para identificar as alterações moleculares do início da diferenciação do rim e que são recapituladas no TW, a expressão de genes pertencentes às vias de transdução de sinal foi avaliada em células do blastema metanéfrico de quatro estágios temporais da diferenciação em camundongos (de 15,5 dias pós-coito até o rim completamente diferenciado), e em células do blastema de TWs e de rins diferenciados em humanos... O RNA total das células capturadas a laser foi amplificado e hibridado. Foram selecionados 18 genes, cuja expressão no início da diferenciação do rim foi recapitulada no TW, dos quais 11 foram menos expressos no tumor e apresentaram expressão crescente durante a nefrogênese e 7 foram mais expressos no tumor e apresentaram expressão decrescente durante a nefrogênese ... As alterações da expressão desses genes devem ser eventos precoces da interrupção da diferenciação que leva a transformação maligna. Adicionalmente, combinações de trios de genes foram avaliadas como marcadores preditivos de recaída em TW. O melhor trio composto por IGF2, TESK1 e PAX2, foi capaz de discriminar corretamente 85,71% das amostras quanto a recaída e não recaída. Esse estudo contribuiu para a identificação de novos genes associados com o aparecimento do TW, e como são alterações moleculares precoces, provavelmente são desencadeadoras do aparecimento do TW. Dessa forma, são candidatos apropriados para serem testados como alvos terapêuticos e marcadores moleculares para auxiliar a prática diária do TW.

Kidney development involves complex interactions between epithelial and mesenchymal cells. A disruption at any crucial step of the morphogenetic progression may lead to kidney malformations and diseases, including cancer. Wilms tumor (WT) or nephroblastoma originates from the metanephric blastema cells, which were unable to complete the differentiation process, resulting in a tumor composed by three histological components, blastema, epithelia and stroma. Blastemal component presents molecular characteristics which are highly similar to the earliest stages of kidney development, suggesting that it retains the key molecular events responsible for WT onset. Deregulation of signal transduction pathways has showed to be an important factor for interruption of renal differentiation, and probably for the WT onset. In this study, aiming to identify the early molecular alterations potentially involved in WT arising, the expression pattern of genes belonging to the transduction signaling pathways was evaluated in cells of the metanephric blastema in four temporal differentiation stages from 15,5 days post-coitum to the fully differentiated kidney in mice, and in blastemal cells of WT and human differentiated kidneys. To evaluate nephrogenesis in mice and WT in humans, we developed a model that allows the hybridization of target molecules of both species in the same cDNA microarray platform. Three hundred and twenty-six stretches of orthologous genes from humans and mice that share high similarity at nucleotide level were immobilized on a glass platform. Wnt signaling pathway, phosphatidylinositol (PI3K) and genes related to epithelial-mesenchymal transition and epithelial-mesenchymal (EMT/MET), associated to the embryonic development, were among the evaluated pathways. Blastemal cells were laser captured from 24 WT samples at four stages of nephrogenesis. Total RNA from these samples was amplified and hybridized in the platform. Eighteen genes were selected, whose expression in the initial of kidney differentiation were also observed in WT, where 11 were down-regulated in WT and reported an increasing expression during nephrogenesis and 7 were up-regulated in WT and presented a decreasing expression during nephrogenesis. Non-supervised hierarchical clustering based on the expression of 18 genes grouped differentiated kidneys from both species, human and murine, and discriminated both from WT samples, which were grouped with the earliest kidney stages, validating the model proposed by this study. The 18 genes were assessed in independent groups of samples at mRNA and protein levels. Twelve out of 18 genes were selected for validation by quantitative RT-PCR in the initial sample set and the expression of 9 (75%) genes was confirmed. From the 9 genes, 5 (55.6%) were validated in an independent group of samples. At protein level, 8 genes were evaluated by immunohistochemistry in WT, during nephrogenesis and in differentiated kidneys in humans. Quantitative evaluation of protein expression was consistent with the results of mRNA expression for 5 (62.5%) genes. This study identified WNT5B, PI3KCA, FZD2, GRK7, TESK1 and TIMP3, which had not been previously associated to WT. Gene expression alterations may be the early events of the interruption of cell differentiation that leads to malignant transformation. Additionally, combinations of trios of genes were tested as predictors of WT relapse revealing IGF2, TESK1 and PAX2 as the best trio because it was able to correctly discriminate 85.71% of the samples. This study contributes to the identification of new genes associated to the WT onset and to the early molecular alterations, which are likely to trigger the WT arising. In this way, these genes are candidates to be tested for therapeutic targets and also for molecular markers to assist the daily WT practice.
Descritores: Antígenos de Diferenciação
Expressão Gênica
Regulação da Expressão Gênica
Regulação da Expressão Gênica no Desenvolvimento
Rim
Transdução de Sinais
-Tumor de Wilms
Responsável: BR30.1 - Biblioteca
BR30.1


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Id: biblio-1003276
Autor: Ramírez-Benítez, José E; Arjona Sabido, Raúl A; Caamal Velázquez, José H; Rodríguez Ávila, Norma L; Solís Pereira, Sara E; Lizama Uc, Gabriel.
Título: Inhibición del crecimiento y modificación genética de Phytophthora capsici usando quitosano de bajo grado de polimerización / Growth inhibition and genetic modification of Phytophthora capsici using chitosan with low degree of polymerization
Fonte: Rev. argent. microbiol;51(1):12-17, mar. 2019. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: Phytophtora capsici es un patógeno que incide sobre cultivos de la familia de las solanáceas causando pérdidas económicas en cultivos de pimientos, tomates, berenjenas y cur-cubitáceas. En este trabajo evaluamos el efecto del quitosano de bajo grado de polimerización (QBP) sobre el crecimiento de P. capsici y sobre la regulación génica de este fitopatógeno a nivel transcripcional. A una concentración de 0,4mg/l de QBP se obtuvo un 88% de inhibición en el crecimiento; concentraciones superiores a 1,6 mg/l inhibieron el crecimiento en un 100%. Mediante ensayos de cambio en la movilidad electroforética de ácidos nucleicos se comprobó que el quitosano interactúa con el ADN y el ARN del hongo frente a concentraciones entre 2 y 4 mg/l de ADN y entre 0,5 y 3 mg/l de ARN. Además, se efectuó un análisis de despliegue diferencial de los productos de amplificación por RT-PCR de los ARN mensajeros de P. capsici obtenidos en presencia o ausencia de QBP; este mostró cambios en el perfil de expresión inducidos por el tratamiento con quitosano. El análisis bioinformático de las secuencias de los transcritos expresados diferencialmente sugiere que el QBP afectó la regulación génica de elementos involucrados en la síntesis de quitina y de proteínas de unión a hidratos de carbono.

Phytophthora blight of peppers, caused by oomycete Phytophthora capsici, currently causes economic losses in crops such as peppers, tomatoes, eggplant and cucurbits. In this work, we evaluated the effect of chitosan with low degree of polymerization (LDP) on growth and gene expression of P. capsici cultures. LDP chitosan inhibited 88% of P. capsici mycelial growth at concentrations up to 0,4 mg/l, whereas at concentrations higher than 1,6 mg/l it completely inhibit growth. Gel mobility shift assays demonstrated that chitosan interacts with DNA and RNA of the fungus at concentrations ranging from 2 to 4 mg/l for DNA and 0,5 to 3 mg/l for RNA. The differential display analysis of RT-PCR-amplification products of P. capsici messenger RNA revealed changes in gene expression profiles after the chitosan treatment. Bioinformatic analysis of sequences from selected differentially-expressed bands showed the gene regulation of elements involved in chitin synthesis and carbohydrate-binding proteins.
Descritores: Phytophthora/genética
Expressão Gênica/efeitos dos fármacos
Regulação da Expressão Gênica/efeitos dos fármacos
Quitosana/administração & dosagem
-Phytophthora/efeitos dos fármacos
Ensaio de Desvio de Mobilidade Eletroforética/métodos
Quitosana/uso terapêutico
Polimerização
Tipo de Publ: Estudo de Avaliação
Estudo de Validação
Responsável: AR635.1 - FCVyS - Servicio de Información y Documentación


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Id: biblio-1120975
Autor: Gastelbondo-Pastrana, Bertha; Madera Anaya, Meisser Vidal; Suárez-Causado, Amileth.
Título: Gene expression of collagen type I alpha 2 and its relationship with dental fluorosis
Fonte: J. oral res. (Impresa);7(6):232-235, ago. 1, 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Objective: to compare the gene expression levels of collagen type I alpha 2 (COL1A2) in children with and without dental fluorosis. methods: cross-sectional study involving 92 children between 5 and 12 years of age. socio-demographic characteristics, the presence of dental fluorosis by means of the Thylstrup-Fejerskov index, and gene expression analysis of COL1A2 in peripheral blood samples by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) assays, were described. for the descriptive analysis, measures of central tendency, dispersion and proportions were used. differences between the groups (p<0.05) were established by the student t-test. results: mean age was 8.6 (SD=1.9) years, 51.1 percent were female; 54 children were diagnosed with fluorosis and 38 without fluorosis; prevalence of dental fluorosis was 58.7 percent (95 percent CI: 48.4 percent -68.9 percent). gene expression of COL1A2 was statistically significantly lower (p<0.05) in the participants with dental fluorosis. conclusion: there are differences in the expression levels of the COL1A2 gene among the population under study. therefore, COL1A2 may be potentially involved in the development of dental fluorosis.
Descritores: Colágeno Tipo I/fisiologia
Fluorose Dentária/etiologia
-Expressão Gênica
Regulação da Expressão Gênica/fisiologia
Estudos Transversais
Colômbia/epidemiologia
Limites: Humanos
Masculino
Feminino
Pré-Escolar
Criança
Responsável: CL30.1 - Biblioteca


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Texto completo SciELO Brasil
Merighi, Miriam Aparecida Barbosa
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Id: lil-731286
Autor: Silva, Marcelo Henrique da; Jesus, Maria Cristina Pinto de; Merighi, Miriam Aparecida Barbosa; Oliveira, Deíse Moura de.
Título: Limits and possibilities experienced by nurses in the treatment of women with chronic venous ulcers / Límites y posibilidades vividas por enfermeras en el tratamiento de mujeres con úlcera venosa crónica / Limites e possibilidades vivenciados por enfermeiras no tratamento de mulheres 
com úlcera venosa crônica
Fonte: Rev. Esc. Enferm. USP;48(spe):53-58, 08/2014.
Idioma: en.
Resumo: Objective To understand the experiences and expectations of nurses in the treatment of women with chronic venous ulcers. Method Phenomenological research was based on Alfred Schütz, whose statements were obtained in January, 2012, through semi-structured interviews with seven nurses. Results The nurse reveals the difficulties presented by the woman in performing self-care, the perceived limitations in the treatment anchored in motivation, and the values and beliefs of women. It showed professional frustration because venous leg ulcer recurrence, lack of inputs, interdisciplinary work and training of nursing staff. There was an expected adherence to the treatment of women, and it emphasized the need for ongoing care, supported self-care and standard practices in treatment. Conclusion That treatment of chronic venous leg ulcers constitutes a challenge that requires collective investment, involving women, professionals, managers and health institutions. .

Objetivo Comprender las experiencias y expectativas de enfermeras en el tratamiento de mujeres con úlcera venosa crónica. Método Investigación fenomenológica fundamentada en Alfred Schutz, que buscó Se realizó entrevista semiestructurada con siete enfermeras, en enero del 2012. Resultados La enfermera revela dificultades presentadas por la mujer para realizar el autocuidado, percibe limitaciones en el tratamiento relacionadas con la desmotivación, los valores y las creencias de las mujeres. Refiere frustración profesional debido a la recidiva de la lesión, a la falta de insumos, al deficiente trabajo interdisciplinar y a la limitada capacitación del equipo de enfermeras. Espera la adhesión de la mujer al tratamiento y resalta la necesidad del cuidado continuo, del autocuidado apoyado y de estandarizar conductas de tratamiento. Conclusión El tratamiento de la úlcera venosa crónica es un desafío que requiere contribución colectiva, involucrando a las mujeres, a los profesionales, a los gestores y a las instituciones de salud. .

Objetivo Compreender as experiências e expectativas de enfermeiras no tratamento de mulheres com úlcera venosa crônica na Atenção Primária à Saúde. Método Pesquisa fundamentada na fenomenologia social de Alfred Schütz, com depoimentos obtidos em janeiro de 2012, por meio de entrevista semiestruturada com sete enfermeiras. Resultados As enfermeiras revelam dificuldades apresentadas pelas mulheres com úlcera venosa crônica para realizar o autocuidado, percebem limitações na terapêutica ancoradas na desmotivação e nos valores e crenças das mulheres. Referem frustração profissional em razão da recidiva da lesão, falta de insumos e tecnologia, de trabalho interdisciplinar e da capacitação da equipe de enfermagem. Esperam a adesão das mulheres ao tratamento e ressaltam a necessidade do cuidado contínuo, do autocuidado apoiado e da padronização de condutas no tratamento. Conclusão O tratamento da úlcera venosa crônica constitui-se em um desafio que requer investimento coletivo, envolvendo a mulher, os profissionais, os gestores e as instituições de saúde. .
Descritores: Proteínas de Caenorhabditis elegans/isolamento & purificação
Caenorhabditis elegans/metabolismo
Membrana Celular/metabolismo
Canais Iônicos/isolamento & purificação
Canais Iônicos/metabolismo
Proteínas do Tecido Nervoso/isolamento & purificação
Proteínas do Tecido Nervoso/metabolismo
Sistema Nervoso/metabolismo
Neurônios Aferentes/metabolismo
Sensação/genética
-Sequência de Aminoácidos/genética
Sequência de Bases/genética
Comportamento Animal/efeitos dos fármacos
Comportamento Animal/fisiologia
Proteínas de Caenorhabditis elegans/genética
Proteínas de Caenorhabditis elegans/metabolismo
Caenorhabditis elegans/citologia
Capsaicina/farmacologia
Compartimento Celular/genética
Membrana Celular/efeitos dos fármacos
Membrana Celular/ultraestrutura
Regulação da Expressão Gênica/fisiologia
Canais Iônicos/genética
Canais Iônicos/ultraestrutura
Dados de Sequência Molecular
Mutação/genética
Proteínas do Tecido Nervoso/genética
Proteínas do Tecido Nervoso/ultraestrutura
Sistema Nervoso/citologia
Sistema Nervoso/efeitos dos fármacos
Neurônios Aferentes/citologia
Neurônios Aferentes/efeitos dos fármacos
Dor/genética
Dor/metabolismo
Dor/fisiopatologia
Filogenia
Receptores de Droga/efeitos dos fármacos
Receptores de Droga/metabolismo
Receptores de Droga/ultraestrutura
Sensação/efeitos dos fármacos
Transdução de Sinais/genética
Canais de Cátion TRPV
Canais de Receptores Transientes de Potencial
Limites: Animais
Tipo de Publ: Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.
Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: biblio-1119738
Autor: Mognol, Giuliana Patrícia.
Título: Regulação da expressão gênica pelo NFAT1: o proto-oncogene c-myc e o papel da proteína IRF-2BP2 / [Regulation of gene expression by NFAT1: the proto-oncogene c-myc and the role of the IRF-2BP2 protein].
Fonte: Rio de Janeiro; s.n; 2012. xviii, 110 p.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Instituto Nacional de Câncer José Alencar Gomes da Silva para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: Durante a transcrição gênica em eucariotos, a produção de níveis significativos de mRNA é conferida pela presença de diversos sítios de ligação para fatores de transcrição específicos, localizados dentro e fora do promotor basal. Dentre os fatores de transcrição que se ligam a estes sítios estão as proteínas da família NFAT (nuclear factor of activated T cells), composta pelos NFAT1-5, sendo o NFAT1 o alvo desse estudo. O NFAT pode regular seus genes alvo direta ou indiretamente e, neste processo, a ativação ou a repressão da transcrição pode ser alterada pela interação com diferentes parceiros proteicos. Esses dois pontos da regulação transcricional mediados pelo NFAT foram avaliados em duas etapas distintas. Na primeira, avaliamos se a regulação do proto-oncogene c-Myc pelo NFAT1 ocorria de forma direta. Tanto NFAT quanto c-Myc estão envolvidos na regulação de genes de ciclo celular, apoptose e angiogênese. Já tinha sido mostrado que as vias de sinalização que ativam NFAT induzem a expressão de c-Myc e que o NFAT1 se liga a um elemento localizado no promotor mínimo de c-Myc, apesar da importância desse elemento não ter sido avaliada no contexto do promotor completo de c-Myc. Nós mostramos que a regulação desse promotor pelo NFAT1 é mais complexa do que se acreditava. Além desse sítio proximal, o NFAT1 se liga a sítios distais com diferentes afinidades. Nossos resultados sugerem que alguns elementos NFAT são negativos e dominantes, enquanto outros são positivos e recessivos. Além disso, demonstramos que a cooperação com p300 aumenta a transativação do promotor de c-Myc mediada pelo NFAT1. Por último, mostramos que os novos sítios identificados também são responsivos ao NFAT2, outro membro da família, que pode tanto ter funções opostas quanto redundantes com o NFAT1. Assim, sugerimos que a contribuição do NFAT para a regulação da expressão de c-Myc é direta e depende do balanço entre a ligação do NFAT aos sítios positivos e negativos e da cooperação com cofatores transcricionais. Na segunda parte do trabalho, focamos nas implicações da interação recém-identificada entre NFAT1 e a proteína IRF-2BP2. A IRF-2BP2 foi pescada num ensaio de duplo híbrido com a região TAD-C do NFAT1, região esta que é menos conservada entre as proteínas NFAT. Mostramos que a IRF- 2BP2 reprime a expressão de genes de citocina induzida pelo NFAT1 e que ela age somente sobre a função do NFAT1 dentro da família NFAT. Nossos dados também sugerem que a IRF-2BP2 não se ligue ao DNA e, portanto, funcione como um correpressor transcricional. Ainda mostramos que a superexpressão de IRF-2BP2 leva ao atraso da progressão das fases G0/G1 para a fase S do ciclo celular e à alteração da expressão de genes de ciclo celular, como de c-Myc, que também é regulado por NFAT1. Esses dados sugerem que a IRF-2BP2 possa ter um papel bem mais amplo na regulação do NFAT1, não se restringindo apenas à modulação de genes de citocinas. Se isso se confirmar, a interação entre NFAT1 e IRF-2BP2 poderá contribuir para explicar as diferenças fenotípicas exercidas pelos diferentes membros da família NFAT.

During gene transcription in eukaryotes, the production of significant mRNA levels is conferred by the presence of several binding sites for specific transcription factors, located inside and outside of the basal promoter. Among the transcription factors that bind to these sites are proteins of the NFAT family (nuclear factor of activated T cells), comprising the NFAT1-5, being the NFAT1 the target of this study. The NFAT can regulate their target genes directly or indirectly and in this process, the activation or repression of transcription can be altered by interaction with different partner proteins. These two points of NFAT-mediated transcriptional regulation were assessed here in two stages. In the first one, we evaluated whether the regulation of the proto-oncogene c-Myc by NFAT1 occurred directly. Both c-Myc as NFAT regulate genes involved in cell cycle, apoptosis and angiogenesis. It has already been shown that the signaling pathways that activate NFAT induce the c-Myc expression and that NFAT1 binds to an element located at the minimal c-Myc promoter, although the importance of this element has not been assessed in the full c-Myc promoter context. We demonstrated that the regulation of this promoter by NFAT1 is more complex than previously conceived. In addition to this proximal site, NFAT1 binds to distal sites with different affinities. Our results suggest that some NFAT elements are negative and dominant, while others are positive and recessive. Furthermore, we demonstrated that cooperation with p300 enhances NFAT1-mediated transactivation of the c-Myc promoter. Finally, we show that the newly identified sites are also responsive to NFAT2, another member of NFAT family, which can both have opposite as well as redundant functions with NFAT1. We suggest that NFAT1 the contribution of NFAT to the regulation of c-Myc expression is direct and may depend on a balance between the binding to positive and negative NFAT-responsive elements, and cooperation with transcriptional cofactors. In the second part of this work, we focused on the implications of the recently identified interaction between NFAT1 and the protein IRF-2BP2. The IRF-2BP2 was identified in a two-hybrid assay with the TAD-C region of the NFAT1, a region which is less conserved among the NFAT proteins. We showed that IRF-2BP2 represses the expression of cytokine genes induced by NFAT1 and regulates specifically the function of NFAT1 among the NFAT family members. Our data also suggest that the IRF- 2BP2 does not bind to DNA and therefore functions as a transcriptional correpressor. Therefore, the overexpression of IRF-2BP2 leads to a delayed transition from G0/G1 to S phase of cell cycle and also alters the expression of many cell cycle genes, such as c-Myc, which is also regulated by NFAT1. These data suggest that the IRF-2BP2 may have a much greater role regulating NFAT1, not being restricted to the modulation of cytokine genes. If this is confirmed, the interaction between NFAT1 and IRF-2BP2 may help to explain the phenotypic differences exerted by different NFAT family members.
Descritores: Regulação da Expressão Gênica
Fatores de Transcrição NFATC
Responsável: BR440.1 - Biblioteca Geraldo Matos de Sá . Hospital do Câncer I
BR440.1


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Id: biblio-1119878
Autor: Silva, Cristiane Sécca da.
Título: Avaliação da participação da proteína IRF2BP2 na ativação e diferenciação de linfócitos T CD4 / [Evaluation of the participation of the IRF2BP2 protein in the activation and differentiation of CD4 T lymphocytes].
Fonte: Rio de Janeiro; s.n; 2013. xix, 146 p.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Instituto Nacional de Câncer José Alencar Gomes da Silva para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: Após a ativação, os linfócitos T CD4 proliferam e se diferenciam em diferentes perfis de células efetoras ou regulatória. O perfil Th1 promove a resposta contra patógenos intracelulares e câncer; o perfil Th2 está envolvido na imunidade contra helmintos e respostas alérgicas e o perfil Th17 é um importante mediador de respostas inflamatórias e autoimunes, contribuindo em alguns casos com respostas inflamatórias crônicas associadas à carcinogênese. Além dos perfis efetores, as células T CD4 podem se diferenciar em um perfil regulatório conhecido como células T regulatórias induzidas (iTreg) que controla a resposta dos perfis efetores. A ativação e diferenciação destas células depende de diversos eventos, dentre eles, a ativação dos fatores de transcrição da família NFAT (Nuclear Factor of Activated T cells). A proteína IRF2BP2 (Interferon Regulatory Factor 2 Binding Protein 2), foi recentemente descrita em nosso laboratório como um co- repressor de NFAT1 e possivelmente apresenta um papel na ativação, diferenciação e atividade efetora de linfócitos através do controle da atividade transcricional desta proteína. Para testar nossa hipótese, inicialmente avaliamos a regulação da expressão de irf2bp2 em linfócitos T CD4 murinos após a ativação. Observamos que os níveis expressos de mRNA para IRF2BP2 foram diminuídos após a ativação in vitro com anti-CD3 e anti-CD28. Para investigar possíveis papéis funcionais para IRF2BP2 em linfócitos, superexpressamos esta proteína em células T CD4 por transdução retroviral. Primeiramente, observamos que as células transduzidas com IRF2BP2 apresentavam uma menor capacidade proliferativa em resposta a ativação. A produção da citocina IL-2 nestas células foi comparável ao controle, entretanto a expressão da proteína CD25, que compõe o receptor para IL-2, foi significativamente reduzida após a superexpressão de IRF2BP2. Avaliamos também a expressão de outras proteínas marcadoras de ativação como CD69 que também teve sua expressão reduzida em linfócitos superexpressando IRF2BP2 e CD62L cuja expressão não foi alterada. A diferenciação de linfócitos T CD4 em ausência de condições polarizantes resultou em células polarizadas para Th1 independentemente da superexpressão de IRF2BP2. Além disso, não observamos diferenças significativas na expressão de mRNA para irf2bp2 entre as culturas efetoras Th1, Th2 e Th17, ou regulatória iTreg diferenciadas in vitro. Com relação à produção de citocinas, observamos uma discreta redução na produção de IL-4 em células Th2 transduzidas com IRF2BP2, enquanto os níveis de IFN-γ e IL-17 em culturas Th1 e Th17, respectivamente, não foram alterados. Finalmente, foi observado uma redução da expressão de CD25 em células iTreg transduzidas com IRF2BP2. Em conjunto, nossos resultados sugerem um papel para IRF2BP2 durante a ativação de linfócitos T CD4, principalmente no controle da proliferação celular durante a expansão clonal, possivelmente através da modulação da expressão de CD25.

After the activation, CD4 T lymphocytes proliferate and differentiate into different effector or regulatory profiles. Th1 profile promotes the response against intracellular pathogens and cancer; Th2 profile is involved in immunity against helminths and allergic responses and Th17 profile is an important mediator of inflammatory and autoimmune responses, contributing, in some cases to the chronic inflammation associated to carcinogenesis. Besides the effector profiles, CD4 T cells can also differentiate towards a regulatory profile known as induced regulatory T cells (iTreg), which controls the effector profiles responses. CD4 T cells activation and differentiation depends on many factors, among them, is the activation of the NFAT (Nuclear Factor of Activated T cells) family of transcriptional factors. In our laboratory, IRF2BP2 (Interferon Regulatory Factor 2 Binding Protein 2) has recently been described as a NFAT1 co-repressor and it possibly plays a role on lymphocytes activation, differentiation and effector functions through the control of NFAT1 transcriptional activity. To test our hypothesis, we first evaluated irf2bp2 gene expression on murine CD4 T lymphocytes after activation. We observed a diminished mRNA expression for irf2bp2 after activation in vitro with anti-CD3 and anti-CD28. In order to investigate the possible roles of IRF2BP2 on lymphocyte function, we super-expressed this protein in CD4 T cells by retroviral transduction. First we observed that IRF2BP2 transducted cells showed an imparied proliferation response trigged by activation. In these cells IL-2 cytokine production was comparable to the control group, however, the expression of CD25 protein, which composes IL-2 receptor, was significantly reduced after IRF2BP2 expression. We also evaluated the expression of other activation marker proteins such as CD69, that was also reduced on IRF2BP2 super-expresing cells, and CD62L whose expression did not alter. CD4 T cells differentiation at default polarizing conditions resulted in cells polarized to Th1 regardless of IRF2BP2 super-expression. Moreover, no significative differences were observed in mRNA expression for irf2bp2 between Th1, Th2 and Th17 effector or iTreg regulatory cell cultures differentiated in vitro. Regarding of cytokine production we observed a slightly reduction on IL-4 production at Th2 IRF2BP2 transduced cells, while the levels of IFN-γ and IL-17 produced by Th1 and Th17 respectively, remained the same. Finally, it was observed a reduction of CD25 expression on iTregs transducted with IRF2BP2. Taken together, our data suggests a role for IRF2BP2 on CD4 T cells activation, especially in the control of cellular proliferation during clonal expansion, possibly through modulation of CD25 expression.
Descritores: Linfócitos T CD4-Positivos
-Regulação da Expressão Gênica
Responsável: BR440.1 - Biblioteca Geraldo Matos de Sá . Hospital do Câncer I
BR440.1


  8 / 219 LILACS  
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Id: lil-409968
Autor: Mayer, Mario Gustavo; Floeter-Winter, Lucile Maria.
Título: Pre-mRNA trans-splicing: from kinetoplastids to mammals, an easy language for life diversity
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;100(5):501-513, Aug. 2005. ilus.
Idioma: en.
Resumo: Since the discovery that genes are split into intron and exons, the studies of the mechanisms involved in splicing pointed to presence of consensus signals in an attempt to generalize the process for all living cells. However, as discussed in the present review, splicing is a theme full of variations. The trans-splicing of pre-mRNAs, the joining of exons from distinct transcripts, is one of these variations with broad distribution in the phylogenetic tree. The biological meaning of this phenomenon is discussed encompassing reactions resembling a possible noise to mechanisms of gene expression regulation. All of them however, can contribute to the generation of life diversity.
Descritores: Variação Genética
Kinetoplastida/genética
Mamíferos/genética
Nematoides/genética
Precursores de RNA/genética
Trans-Splicing/genética
-Regulação da Expressão Gênica
Filogenia
Limites: Animais
Responsável: BR1.1 - BIREME


  9 / 219 LILACS  
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Id: biblio-1015230
Autor: Lupinacci, Fernanda C S; Ferreira, Elisa N; Roffe, Martin; Bellato, Hermano M; Carraro, Dirce Maria; Hajj, Glaucia N M.
Título: Effects of tumor biobank storage on polysome stability
Fonte: Appl. cancer res;39:1-5, 2019. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: Background: Human biological material has become an important resource for biomedical research. Tumor Biobanks are facilities that collect, store and distribute samples of tumor and normal tissue for further use in basic and translational cancer research. mRNA-translation has been demonstrated to modulate protein levels and is considered a fundamental post-transcriptional mechanism of gene expression regulation. Thus, determining translation efficiencies of individual mRNAs in human tumors may add another layer of information that contributes to the understanding of tumorigenic pathways. To analyze the RNAs actively engaged in translation, RNAs associated with ribosomes (polysomes) are isolated, identified and compared to total RNA. However, the application of this technique in human tumors depends on the stability of the polysomal structure under Biobank storage conditions that usually consists of ultra-low temperature. Since the effect of freezing on the stability of the polysomal structure in stored tumor samples is not known, it is essential to evaluate this factor in the frozen samples, validating the use of biobank samples in studies of translational efficiency. Methods: Xenograft tumors were divided in two parts, half was subject to immediate processing, and half was frozen for posterior analysis. Both parts were subject to polysomal separation, RNA extraction and identification through RNAseq. Results: It was possible to successfully extract and identify total and polysomal RNA from both fresh and frozen tumoral tissue. The quantification of the polysome profile indicated no difference in the translational efficiency estimated in fresh versus frozen tissue. Gene expression data from the fresh versus frozen tissues were compared and the correlation between the polysome associated fresh x frozen (R = 0,89) and total fresh x frozen (0,90) mRNAs was calculated. No difference was identified between the two conditions. Conclusions: We demonstrated that tissue freezing does not affect the polysomal structure, consequently validating the viability of the use of biobank stored tissue for polysome associated RNA analysis (AU)
Descritores: Polirribossomos
RNA
Expressão Gênica
Regulação da Expressão Gênica
Neoplasias
Limites: Humanos
Responsável: BR30.1 - Biblioteca


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Id: lil-557221
Autor: Silva, Sandra R. Boiça; Tempone, Antônio J; Silva, Tatiana P; Costa, Maria Renata Sales Nogueira; Pereira, Geraldo M. B; Lara, Flávio A; Pessolani, Maria Cristina V; Esquenazi, Danuza.
Título: Mycobacterium leprae downregulates the expression of PHEX in Schwann cells and osteoblasts
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;105(5):627-632, Aug. 2010. ilus, graf.
Idioma: en.
Projeto: CNPq.
Resumo: Neuropathy and bone deformities, lifelong sequelae of leprosy that persist after treatment, result in significant impairment to patients and compromise their social rehabilitation. Phosphate-regulating gene with homologies to endopeptidase on the X chromosome (PHEX) is a Zn-metalloendopeptidase, which is abundantly expressed in osteoblasts and many other cell types, such as Schwann cells, and has been implicated in phosphate metabolism and X-linked rickets. Here, we demonstrate that Mycobacterium leprae stimulation downregulates PHEX transcription and protein expression in a human schwannoma cell line (ST88-14) and human osteoblast lineage. Modulation of PHEX expression was observed to a lesser extent in cells stimulated with other species of mycobacteria, but was not observed in cultures treated with latex beads or with the facultative intracellular bacterium Salmonella typhimurium. Direct downregulation of PHEX by M. leprae could be involved in the bone resorption observed in leprosy patients. This is the first report to describe PHEX modulation by an infectious agent.
Descritores: Hanseníase
Mycobacterium leprae
Osteoblastos/enzimologia
Células de Schwann/enzimologia
-Regulação para Baixo
Citometria de Fluxo
Regulação da Expressão Gênica
Imuno-Histoquímica
Hanseníase
Hanseníase/patologia
Endopeptidase Neutra Reguladora de Fosfato PHEX
Endopeptidase Neutra Reguladora de Fosfato PHEX
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
Transcrição Genética
Limites: Humanos
Responsável: BR1.1 - BIREME



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