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Id: lil-780805
Autor: Berber, Ismet; Avsar, Cumhur; Yegin, Zeynep; Tekerci, Melike; Civek, Seyhan.
Título: Molecular epidemiology of Pseudomonas aeruginosa clinical isolates
Fonte: Braz. j. infect. dis;20(2):224-225, Mar.-Apr. 2016. graf.
Idioma: en.
Descritores: Pseudomonas aeruginosa/genética
Fatores de Virulência/genética
Antibacterianos/farmacologia
-Pseudomonas aeruginosa/efeitos dos fármacos
Turquia
DNA Bacteriano/análise
Epidemiologia Molecular
Genes Bacterianos/genética
Limites: Humanos
Tipo de Publ: Carta
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-789481
Autor: Pereira, Jussyêgles Niedja da Paz; Rabelo, Marcelle Aquino; Lima, Jailton Lobo da Costa; Neto, Armando Monteiro Bezerra; Lopes, Ana Catarina de Souza; Maciel, Maria Amélia Vieira.
Título: Phenotypic and molecular characterization of resistance to macrolides, lincosamides and type B streptogramin of clinical isolates of Staphylococcus spp. of a university hospital in Recife, Pernambuco, Brazil
Fonte: Braz. j. infect. dis;20(3):276-281, May.-June 2016. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Abstract Introduction There is a mechanism of macrolide resistance in Staphylococcus spp. which also affects the lincosamides and type B streptogramins characterizing the so-called MLSB resistance, whose expression can be constitutive (cMLSB) or inducible (iMLSB) and is encoded mainly by ermA and ermC genes. The cMLSB resistance is easily detected by susceptibility testing used in the laboratory routine, but iMLSB resistance is not. Therapy with clindamycin in cases of infection with isolated iMLSB resistance may fail. Objective To characterize the phenotypic (occurrence of cMLSB and iMLSB phenotypes) and molecular (occurrence of ermA and ermC genes) profiles of MLSB resistance of clinical isolates of susceptible and methicillin-resistant Staphylococcus aureus and CNS (coagulase-negative Staphylococcus) from patients of a university hospital, in Pernambuco. Methods The antimicrobial susceptibility of 103 isolates was determined by the disk diffusion technique in Mueller–Hinton agar followed by oxacillin screening. The iMLSB phenotype was detected by D test. Isolates with cMLSB and iMLSB phenotypes were subjected to polymerase chain reaction (PCR) for the detection of ermA and ermC genes. Results The cMLSB and iMLSB phenotypes were respectively identified in 39 (37.9%) and five (4.9%) isolates. The iMLSB phenotype was found only in four (10.8%) methicillin-susceptible S. aureus and one (4.5%) methicillin-resistant S. aureus. In the 44 isolates subjected to PCR, four (9.1%) only ermA gene was detected, a lower frequency when compared to only ermC 17 (38.6%) gene and to one (2.3%) isolate presenting both genes. Conclusion In the Staphylococcus spp. analyzed, the ermC gene was found more often than the ermA, although the iMLSB phenotype had been less frequent than the cMLSB. It was important to perform the D test for its detection to guide therapeutic approaches.
Descritores: Staphylococcus/efeitos dos fármacos
Staphylococcus/genética
Macrolídeos/farmacologia
Estreptogramina B/farmacologia
Farmacorresistência Bacteriana Múltipla/genética
Lincosamidas/farmacologia
-Fenótipo
Brasil
Farmacorresistência Bacteriana Múltipla/efeitos dos fármacos
Testes de Sensibilidade a Antimicrobianos por Disco-Difusão
Genes Bacterianos/genética
Hospitais Universitários
Limites: Humanos
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Id: biblio-839231
Autor: Almeida, Rosana Macedo de; Barbosa, André Victor; Lisbôa, Rodrigo de Castro; Santos, André Felipe das Mercês; Hofer, Ernesto; Vallim, Deyse Christina; Hofer, Cristina Barroso.
Título: Virulence genes and genetic relationship of L. monocytogenes isolated from human and food sources in Brazil
Fonte: Braz. j. infect. dis;21(3):282-289, May-June 2017. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: ABSTRACT The herein presented assay provided a bacteriological and molecular characterization of 100 samples of L. monocytogenes isolated from human (43) and food (57) sources, from several regions of Brazil, and collected between 1975 and 2013. Antigenic characterization defined 49% of serotype 4b samples, followed by 28% of serotype 1/2b, 14% of serotype 1/2c, 8% of serotype 1/2a, and 1% of serotype 3b. Both type of samples from human and food origin express the same serotype distribution. Multiplex PCR analysis showed 13 strains of type 4b with the amplification profile 4b-VI (Variant I). Virulence genes hly, inlA, inlB, inlC, inlJ, actA, plcA, and prfA were detected in all samples, highlighting a deletion of 105pb on the actA gene in 23% of serotype 4b samples. Macrorestriction profile with ApaI at PFGE showed 55 pulsotypes, with the occurrence of the same pulsotype in hospitalized patients in São Paulo in 1992 and 1997, and two other highly related pulsotypes in patients hospitalized in Rio de Janeiro in 2008. Recognized pulsotypes in listeriosis cases have also been detected in food. Thus, the prevalence of a serotype and the persistence of certain pulsotypes herald future problems.
Descritores: Fatores de Virulência/genética
Microbiologia de Alimentos
Listeria monocytogenes/genética
-Brasil
Sorotipagem
Eletroforese em Gel de Campo Pulsado
Tipagem Molecular
Reação em Cadeia da Polimerase Multiplex
Genes Bacterianos/genética
Listeria monocytogenes/isolamento & purificação
Listeria monocytogenes/patogenicidade
Limites: Humanos
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Leal, Nilma Cintra
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Id: biblio-1039218
Autor: Rocha, Igor Vasconcelos; Xavier, Danilo Elias; Almeida, Karoline Rissele Henrique de; Oliveira, Sibele Ribeiro de; Leal, Nilma Cintra.
Título: Multidrug-resistant Acinetobacter baumannii clones persist on hospital inanimate surfaces
Fonte: Braz. j. infect. dis;22(5):438-441, Sept.-Oct. 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: FACEPE.
Resumo: ABSTRACT Acinetobacter baumannii is one of the most frequent Gram-negative opportunistic pathogens associated with hospital-acquired infection worldwide. We briefly describe A. baumannii isolates that were recovered from surrounding ICU bed surfaces, exhibiting multidrug resistance phenotype and belonging to some widely spread clonal complexes of clinical A. baumannii isolates.
Descritores: Leitos/microbiologia
Farmacorresistência Bacteriana Múltipla/genética
Acinetobacter baumannii/isolamento & purificação
Unidades de Terapia Intensiva
-Bactérias/isolamento & purificação
Bactérias/efeitos dos fármacos
Brasil
Testes de Sensibilidade Microbiana
Infecção Hospitalar/microbiologia
Acinetobacter baumannii/efeitos dos fármacos
Acinetobacter baumannii/genética
Centros de Atenção Terciária
Genes Bacterianos
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-783201
Autor: Teixeira, Junia Pacheco; Silva, Nivaldo da; Fonseca, Leorges Moraes da; Costa, Geraldo Marcio da.
Título: Uso de PCR Duplex para detecção dos genes femA e mecA e determinação da concentração inibitória mínima (CIM) em Staphylococcus aureus isolados de leite cru / Detection of femA and mecA genes in Staphylococcus aureus isolated from bovine raw milk using duplex PCR and determination of the minimum inhibitory concentration of the isolates
Fonte: Rev. Inst. Adolfo Lutz;73(3):272-279, jul.-set. 2014. ilus, tab, graf.
Idioma: pt.
Resumo: O objetivo deste trabalho foi de identificar Staphylococcus aureus e as linhagens resistentes à meticilina(MRSA) em amostras de leite cru bovino, por meio de métodos moleculares, e de determinar a concentração inibitória mínima (CIM) dos isolados. S. aureus pode apresentar linhagens resistentes à meticilina e a outros antimicrobianos utilizados na prática médico-veterinária. Foram analisadas 251 amostras de leite cru de tanques de expansão, procedentes de cinco mesorregiões produtoras de leite de Minas Gerais – Brasil. Por meio de PCR foi identificada a presença do gene femA em 278 isolados deS. aureus; e as linhagens MRSA foram determinadas pela presença do gene mecA. Os ensaios de PCR foram positivos para gene femA em 100 % dos isolados testados; e entre essas amostras 11 (3,95 %) apresentaram produto amplificado de 533 pb correspondente ao gene mecA. Para analisar a susceptibilidade dos isolados foi realizado o teste de CIM para nove substâncias antimicrobianas. Foram identificados 149 isolados deS. aureus que apresentaram CIM≤ 4 μg/mL para enrofloxacina, com 92,54 % de susceptibilidade, e 55 isolados testados para sulfametoxazol+trimetoprima, apresentaram CIM ≤ 2 μg/mL com 83,33 % de susceptibilidade. Estes antimicrobianos foram considerados os mais eficazes...
Descritores: Genes Bacterianos
Leite
Microbiologia de Alimentos
Staphylococcus aureus Resistente à Meticilina
Testes de Sensibilidade Microbiana
-Brasil
Limites: Humanos
Responsável: BR91.2 - Centro de Documentação


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Id: biblio-1087456
Autor: Laia, Marcelo Luiz de; Moreira, Leandro Marcio; Fernandes Gonçalves, Janaína; Tiraboschi Ferro, Maria Inês; Pinto Rodrigues, Any Caroliny; Santos, Jéssica Naiara dos; Barbosa Felestrino, Érica; Aparecido Ferro, Jesus.
Título: Gene expression analysis identifies hypothetical genes that may be critical during the infection process of Xanthomonas citri subsp. citri
Fonte: Electron. j. biotechnol;42:30-41, Nov. 2019. tab, graf, ilus.
Idioma: en.
Projeto: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; . Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; . Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES).
Resumo: Background: Gene expression analysis via microarray is widely used in phytobacteria to validate differential gene expression associated with virulence or to compare biological profiles of wild type and mutant strains. Here, we employed DNA microarrays to study the early stages of the infection process (24, 72 and 120 h post-inoculation) of Xanthomonas citri subsp. citri (Xac) infecting Citrus sinensis to interrogate the expression profiles of hypothetical genes. Results: Under infective conditions, 446 genes were up- and 306 downregulated. Outstanding among genes upregulated during infection were those involved in synthesizing the Type 3 Secretion System and effectors, xanthan gum and quorum-sensing induction, and flagellum synthesis and regulation. Additionally, 161 hypothetical genes were up- and 100 were downregulated, 49 of which are known to have a significant biological role. To understand hypothetical gene co-regulation or -expression, nine expression profiles including 158 genes were identified during the three infection phases. Of these, 47 hypothetical genes were identified as having expression profiles associated with at least one connected to a gene associated with adaptation and virulence. Conclusions: Expression patterns of six differentially expressed genes were validated by quantitative reverse transcription polymerase chain reaction, thus demonstrating the effectiveness of this tool in global gene expression analysis in Xac.
Descritores: Xanthomonas/genética
Xanthomonas/patogenicidade
Citrus sinensis/microbiologia
-Virulência
Xanthomonas/crescimento & desenvolvimento
Expressão Gênica
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos
Transcriptoma
Sistemas de Secreção Tipo III
Genes Bacterianos
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Id: biblio-951563
Autor: Almeida, R P; Stouthamer, R.
Título: Phylogeny of the Trichogramma endosymbiont Wolbachia, an alpha-proteobacteria (Rickettsiae) / Filogenia do endosimbionte Wolbachia em Trichogramma, an alpha-proteobacteria (Rickettsiae)
Fonte: Braz. j. biol;78(3):421-428, Aug. 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Abstract Wolbachia (Hertig) endosymbionts are extensively studied in a wide range of organisms and are known to be transmitted through the egg cytoplasm to the offsping. Wolbachia may cause several types of reproductive modifications in arthropods. In Trichogramma species, parthenogenesis-inducing Wolbachia bacteria allow females wasps to produce daughters from unfertilized eggs and these bacteria are present in at least 9% of all Trichogramma species. Phylogenetic studies have led to the subdivision of the Wolbachia clade in five supergroups (A, B, C, D and E) and Wolbachia from Trichogramma belong to supergroup B. Here, using the wsp gene, four groups of Wolbachia that infect Trichogramma species were distinguished and the addition of a new group "Ato" was suggested due to the addition of Wolbachia from Trichogramma atopovirilia (Oatman and Platner). Specific primers were designed and tested for the "Ato" group. Seventy-five percent of all evaluated Wolbachia strains from Trichogramma fell within "Sib" group.

Resumo Endosimbiontes do gênero Wolbachia (Hertig) são extensivamente estudados em uma ampla gama de organismos e são conhecidos por serem transmitidos via citoplasma do ovo hospedeiro para seu descendente. Wolbachia pode causar vários tipos de alterações reprodutivas nos artrópodes. Nas espécies de Trichogramma, a reprodução partenogenética induzida por Wolbachia, possibilita as fêmeas dos parasitoides a produção de fêmeas a partir de ovos não fertilizados e estas bactérias estão presentes em pelo menos 9% de todas as espécies de Trichogramma. Estudos filogenéticos têm levado a subdivisão do clado Wolbachia em cinco supergrupos (A, B, C, D and E). Wolbachia em Trichogramma pertence ao supergrupo B. Com o gene wsp foi possível se distinguir quatro grupos de Wolbachia que infectam Trichogramma e adicionar um novo grupo (Ato) devido a inclusão de Wolbachia detectada em Trichogramma atopovirilia (Oatman and Platner, 1983). Primers específicos foram construídos e testados para o grupo "Ato". Setenta e cinco por cento de todas as linhagens de Wolbachia que infectam Trichogramma se enquadraram dentro do grupo "Sib".
Descritores: Proteínas da Membrana Bacteriana Externa/metabolismo
Vespas/microbiologia
Primers do DNA/genética
Alphaproteobacteria/metabolismo
Wolbachia/genética
Genes Bacterianos/genética
-Filogenia
Reprodução
Especificidade da Espécie
Simbiose
Vespas/genética
Limites: Animais
Feminino
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-583937
Autor: Magalhães, Caroline A; Rossato, Sarita S; Barbosa, Ângela S; Santos, Thiago O dos; Elias, Waldir P; Sircili, Marcelo P; Piazza, Roxane MF.
Título: The ability of haemolysins expressed by atypical enteropathogenic Escherichia coli to bind to extracellular matrix components
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;106(2):146-152, Mar. 2011. ilus, graf, tab.
Idioma: en.
Projeto: Claudia Trigo Pedroso de Moraes; . FAPESP.
Resumo: Typical and atypical enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) are considered important bacterial causes of diarrhoea. Considering the repertoire of virulence genes, atypical EPEC (aEPEC) is a heterogeneous group, harbouring genes that are found in other diarrheagenic E. coli pathotypes, such as those encoding haemolysins. Haemolysins are cytolytic toxins that lyse host cells disrupting the function of the plasma membrane. In addition, these cytolysins mediate a connection to vascular tissue and/or blood components, such as plasma and cellular fibronectin. Therefore, we investigated the haemolytic activity of 72 aEPEC isolates and determined the correlation of this phenotype with the presence of genes encoding enterohaemolysins (Ehly) and cytolysin A (ClyA). In addition, the correlation between the expression of haemolysins and the ability of these secreted proteins to adhere to extracellular matrix (ECM) components was also assessed in this study. Our findings demonstrate that a subset of aEPEC presents haemolytic activity due to the expression of Ehlys and/or ClyA and that this activity is closely related to the ability of these isolates to bind to ECM components.
Descritores: Escherichia coli Enteropatogênica/fisiologia
Proteínas de Escherichia coli/fisiologia
Matriz Extracelular
-Escherichia coli Enteropatogênica
Escherichia coli Enteropatogênica
Proteínas de Escherichia coli
Genes Bacterianos
Proteínas Hemolisinas
Fenótipo
Reação em Cadeia da Polimerase
Sorotipagem
Fatores de Virulência
Limites: Animais
Humanos
Coelhos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
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Id: biblio-1001470
Autor: Barbosa, C A; Conceição, T A; Baliza, M D; Camilo, V M A; Juiz, P J L; Silva, I M M.
Título: Virulence genes in Escherichia coli isolates from commercialized saltwater mussels Mytella guyanensis (Lamarck, 1819) / Presença de genes de virulência em isolados de Escherichia coli provenientes de sururu Mytella guyanensis (Lamarck, 1819) comercializado
Fonte: Braz. j. biol;79(4):625-628, Nov. 2019. tab.
Idioma: en.
Resumo: Abstract The isolation of Escherichia coli from food is a major concern. Pathogenic strains of these bacteria cause diseases which range from diarrhea to hemolytic-uremic syndrome. Therefore the virulence genes in E. coli isolates from the mussel ( Mytella guyanensis) commercialized in Cachoeira, Bahia, Brazil were investigated. Samples were purchased from four vendors: two from supermarkets and two from fair outlets. They were conditioned into isothermal boxes with reusable ice and transported to the laboratory for analysis. E. coli strains were isolated in eosin methylene blue agar, preserved in brain-heart infusion medium with 15% glycerol and stored at -20 °C, after microbiological analysis. Virulence genes in the isolated strains were identified by specific primers, with Polymerase Chain Reaction. Twenty-four isolates were obtained, with a prevalence of elt gene, typical from enterotoxigenic infection, in 75% of the isolates. The stx and bfpA genes, prevalent in enterohemorragic and enteropathogenic E. coli, respectively, were not detected. The occurrence of elt virulence-related gene in the E. coli isolates of Mytella guyanensis reveals urgent improvement in food processing, including good handling practices, adequate storage and cooking before consumption, to ensure consumer's health.

Resumo O isolamento de Escherichia coli a partir de alimentos é uma grande preocupação, pois cepas patogênicas desta bactéria podem causar desde diarreia até síndrome hemolítico-urêmica. Diante do exposto, o objetivo do trabalho foi pesquisar genes de virulência em isolados de Escherichia coli provenientes do sururu Mytella guyanensis comercializado na cidade de Cachoeira, Bahia, Brasil. As amostras foram adquiridas de quatro comerciantes, sendo duas de mercados e duas em pontos de venda na feira livre da cidade de Cachoeira, acondicionadas em caixas isotérmicas com gelo reutilizável e transportadas até o laboratório para a análise. Após a análise microbiológica, as cepas de Escherichia coli foram isoladas em ágar Eosina Azul de Metileno e preservadas em caldo Brian Heart Infusion e glicerol a 15% e mantidas a - 20° C. A identificação dos genes de virulência nas cepas isoladas foi realizada utilizando primers específicos, por meio da Reação em Cadeia da Polimerase. Foram obtidos 24 isolados de Escherichia coli, destes a prevalência do gene elt , característico de Escherichia coli enterotoxigênica, foi de 75% dos isolados. Não houve a detecção dos genes stx e bfpA nos isolados, os quais são prevalentes nas cepas de Escherichia coli enterohemorrágica e Escherichia coli enteropatogênica, respectivamente. A presença do gene elt relacionado à virulência de Escherichia coli nos isolados de Mytella guyanensis revela a necessidade da melhoria no processamento, incluindo boas práticas de manipulação, armazenamento adequado e cocção previa ao consumo, visando a garantia da saúde do consumidor.
Descritores: Alimentos Marinhos/microbiologia
Fatores de Virulência
Escherichia coli/genética
Mytilidae/microbiologia
Microbiologia de Alimentos
Genes Bacterianos
-Brasil
Limites: Animais
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Id: biblio-828199
Autor: Barrantes, Kenia; Achí, Rosario.
Título: The importance of integrons for development and propagation of resistance in Shigella: the case of Latin America
Fonte: Braz. j. microbiol;47(4):800-806, Oct.-Dec. 2016.
Idioma: en.
Resumo: Abstract In Latin America, the disease burden of shigellosis is found to coexist with the rapid and rampant spread of resistance to commonly used antibiotics. The molecular basis of antibiotic resistance lies within genetic elements such as plasmids, transposons, integrons, genomic islands, etc., which are found in the bacterial genome. Integrons are known to acquire, exchange, and express genes within gene cassettes and it is hypothesized that they play a significant role in the transmission of multidrug resistance genes in several Gram-negative bacteria including Shigella. A few studies have described antibiotic resistance genes and integrons among multidrug resistant Shigella isolates found in Latin America. For example, in Brazil, Bolivia, Chile, Costa Rica and Peru, class 1 and class 2 integrons have been detected among multidrug resistant strains of Shigella; this phenomenon is more frequently observed in S. flexneri isolates that are resistant to trimethoprim, sulfamethoxazole, streptomycin, ampicillin, chloramphenicol, and tetracycline. The gene cassette sul2, which is frequently detected in Shigella strains resistant to the sulfonamides, suggests that the sulfonamide-resistant phenotype can be explained by the presence of the sul2 genes independent of the integron class detected. It is to be noted that sul3 was negative in all isolates analyzed in these studies.The high frequency of sulfonamide (as encoded by sul2) and trimethoprim resistance is likely to be a result of the recurrent use of trimethoprim sulfamethoxazole as a popular regimen for the treatment of shigellosis. The observed resistance profiles of Shigella strains confirm that ampicillin and trimethoprim-sulfamethoxazole are ineffective as therapeutic options. In-depth information regarding antibiotic resistance mechanism in this pathogen is needed in order to develop suitable intervention strategies. There is a pressing need for regional and local antimicrobial resistance profiling of Shigella to be included as a part of the public health strategy.
Descritores: Shigella/efeitos dos fármacos
Shigella/genética
Farmacorresistência Bacteriana
Integrons
Disenteria Bacilar/microbiologia
Disenteria Bacilar/epidemiologia
Antibacterianos/farmacologia
-Vigilância da População
Disenteria Bacilar/tratamento farmacológico
Loci Gênicos
Genes Bacterianos
América Latina/epidemiologia
Antibacterianos/uso terapêutico
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