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Id: lil-623784
Autor: Manning, Jerry E; Peterson, David S.
Título: Identification of the 85 kDa surface antigen gene of Trypanosoma cruzi as a member of a multigene family
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;82(supl.1):229-237, Nov. 1987.
Idioma: en.
Conferência: Apresentado em: Meeting on Immunopathology and Pathogenesis of Chagas' Disease, Leishmaniasis and Leprosy, s.l, Nov. 7-8, 1987.
Descritores: Trypanosoma cruzi/genética
Antígenos de Superfície/análise
-Família Multigênica/genética
Limites: Seres Humanos
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: biblio-898909
Autor: Nongbri, Sandor Rudy L; Verma, Henu Kumar; Lakkakula, Bhaskar V. K. S; Patra, Pradeep Kumar.
Título: Presence of atypical beta globin (HBB) gene cluster haplotypes in sickle cell anemia patients of India
Fonte: Rev. bras. hematol. hemoter;39(2):180-182, Apr.-June 2017. tab.
Idioma: en.
Projeto: Chhattisgarh Council of Science & Technology.
Descritores: Haplótipos
Família Multigênica
Globinas beta
Índia
Anemia Falciforme
Limites: Seres Humanos
Tipo de Publ: Carta
Responsável: BR408.1 - Biblioteca da Faculdade de Medicina - BFM


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Id: biblio-889174
Autor: Melo, Ricardo Rodrigues de; Persinoti, Gabriela Felix; Paixão, Douglas Antonio Alvaredo; Squina, Fábio Márcio; Ruller, Roberto; Sato, Helia Harumi.
Título: Draft genome sequence of Streptomyces sp. strain F1, a potential source for glycoside hydrolases isolated from Brazilian soil
Fonte: Braz. j. microbiol;48(4):612-614, Oct.-Dec. 2017. tab.
Idioma: en.
Resumo: ABSTRACT Here, we show the draft genome sequence of Streptomyces sp. F1, a strain isolated from soil with great potential for secretion of hydrolytic enzymes used to deconstruct cellulosic biomass. The draft genome assembly of Streptomyces sp. strain F1 has 69 contigs with a total genome size of 8,142,296 bp and G + C 72.65%. Preliminary genome analysis identified 175 proteins as Carbohydrate-Active Enzymes, being 85 glycoside hydrolases organized in 33 distinct families. This draft genome information provides new insights on the key genes encoding hydrolytic enzymes involved in biomass deconstruction employed by soil bacteria.
Descritores: Proteínas de Bactérias/genética
Genoma Bacteriano
Glicosídeo Hidrolases/genética
Microbiologia do Solo
Streptomyces/enzimologia
Streptomyces/isolamento & purificação
-Proteínas de Bactérias/metabolismo
Composição de Bases
Brasil
Glicosídeo Hidrolases/metabolismo
Família Multigênica
Filogenia
Streptomyces/classificação
Streptomyces/genética
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-779776
Autor: Bourguignon, E; Viçosa, G. N.; Corsini, C. M. M.; Moreira, M. A. S.; Nero, L. A.; Conceição, L. G..
Título: Description of Methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius from canine pyoderma in Minas Gerais state, Brazil / Descrição de Staphylococcus pseudintermedius meticilina-resistentes de piodermite canina no estado de Minas Gerais, Brasil
Fonte: Arq. bras. med. vet. zootec;68(2):299-306, mar.-abr. 2016. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius (MRSP) is of worldwide concern in veterinary medicine. The identification of resistant strains is necessary for proper treatment and the prevention of its propagation among animals. This study aimed to identify S. pseudintermedius isolated from canine pyoderma and evaluate their resistance profiles. Lesions from 25 dogs with pyoderma were sampled. Bacterial isolates were subjected to phenotypic and genotypic analysis for identification of the causative agent. S. pseudintermedius isolates were subjected to SmaI macrorestriction analysis and PFGE for genetic grouping, and PCR to identify the presence of the mecA gene. Their resistance profiles against 12 antimicrobials were also assessed. According to the microbiological analysis, 70 of the 75 isolates obtained were S. pseudintermedius. The isolates presented PFGE patterns, with similarity varying between 84.6 and 100%, and were grouped into 19 clusters. Despite a high frequency of mecA-positive isolates (66 out 70), only 12 presented resistances to oxacillin. Multi-resistance was identified in 29 isolates. The high frequency of MRSP isolated in this study highlights the relevance of identifying resistant strains to lead proper clinical treatment.

Staphylococcus pseudintermedius meticilina-resistente (MRSP) é de preocupação mundial na medicina veterinária. A identificação de cepas resistentes é necessária a um tratamento adequado e à prevenção da sua propagação entre os animais. O objetivo do estudo foi identificar S. pseudintermedius isolados de piodermite canina e avaliar o perfil de resistência. Foram coletadas amostras de lesões de 25 cães com piodermite. Os isolados bacterianos foram submetidos a análises fenotípicas e genotípicas para identificação do agente causador. Isolados de S. pseudintermedius foram submetidos à análise de macrorrestrição por SmaI e PFGE para agrupamento genético e à PCR para identificar a presença do gene mecA. Seu perfil de resistência contra 12 antimicrobianos também foi avaliado. De acordo com a análise microbiológica, 70 dos 75 isolados obtidos foram identificados como S. pseudintermedius. Os isolados apresentaram padrões de PFGE com similaridade variando entre 84.6 e 100% e foram agrupados em 19 grupos genéticos. Apesar da frequência alta de isolados mecA positivos (66 em 70), apenas 12 apresentaram resistência à oxacilina. Multirresistência foi identificada em 29 isolados. A alta frequência de MRSP isolados neste estudo destaca a relevância de se identificarem cepas resistentes para se conduzir um tratamento clínico adequado.
Descritores: Resistência Microbiana a Medicamentos
Genótipo
Staphylococcus aureus Resistente à Meticilina
Oxacilina/uso terapêutico
Fenótipo
-Genes Bacterianos
Análise Microbiológica
Família Multigênica
Staphylococcus/patogenicidade
Limites: Animais
Cães
Responsável: BR68.1 - Biblioteca Virginie Buff D'Ápice


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Id: lil-771880
Autor: Veloso, R. C.; Winkelstroter, L. K.; Silva, M. T. P.; Pires, A. V.; Torres Filho, R. A.; Pinheiro, S. R. F.; Costa, L. S.; Amaral, J. M..
Título: Seleção e classificação multivariada de modelos não lineares para frangos de corte / Selection and classification of multivariate nonlinear models for broilers
Fonte: Arq. bras. med. vet. zootec;68(1):191-200, jan.-fev. 2016. tab.
Idioma: pt.
Resumo: Objetivou-se com este estudo utilizar a técnica de análise de agrupamento para classificar modelos de regressão não lineares usados para descrever a curva de crescimento de frangos de corte, levando em consideração os resultados de diferentes avaliadores de qualidade de ajuste. Para tanto, utilizaram-se dados de peso corporal e idade dos seguintes grupos genéticos de frangos de corte: Cobb500, Hubbard Flex e Ross308, de ambos os sexos, constituindo, assim, seis classes. Foram ajustados 10 modelos não lineares, cuja qualidade de ajuste foi medida pelo coeficiente de determinação ajustado, pelos critérios de informação de Akaike e bayesiano, pelo quadrado médio do erro e pelo índice assintótico. A análise de agrupamento indicou os modelos logístico, Michaelis-Menten, Michaelis-Menten modificado e von Bertalanffy como os mais adequados à descrição das curvas de crescimento das seis classes estudadas.

The aim of this study was to classify non-linear models used to describe the growth curve of broilers using the cluster analysis technique, taking into account the results of different measures of quality adjustment regression. For this purpose, we used data of body weight and age the following genetic groups of broilers: Cobb500, Hubbard Flex and Ross308, of both sexes, thus constituting six classes. Ten non-linear models were fitted, the quality of fit was measured by the adjusted coefficient of determination, Akaike information criteria and Bayesian, mean square error and index asymptotic. Cluster analysis indicated the Logistico, Michaelis Menten, Michaelis Menten Modificado and von Bertalanffy models as the most appropriate description of the growth curves for the six classes studied.
Descritores: Crescimento/genética
Galinhas/crescimento & desenvolvimento
Família Multigênica
Pesos e Medidas Corporais/veterinária
-Tamanho Corporal
Genótipo
Dinâmica não Linear
Limites: Animais
Responsável: BR68.1 - Biblioteca Virginie Buff D'Ápice


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Id: lil-746286
Autor: Durán, Anyelo; Álvarez-Mon, Melchor; Valero, Nereida.
Título: Papel de los receptores tipo toll (TLRs) y receptores para dominios de oligomerización para la unión a nucleótidos (NLRs) en las infecciones virales / Role of toll-like receptors (TLRs) and nucleotide-binding oligomerization domain receptors (NLRs) in viral infections
Fonte: Invest. clín;55(1):61-81, mar. 2014. ilus.
Idioma: es.
Resumo: Las células del sistema inmunitario (SI) son capaces de reconocer una gran variedad de microorganismos, a través de los receptores que se encuentran expresados y distribuidos a lo largo de su arquitectura celular. La interacción entre los patrones moleculares asociados a microorganismos o a daño (PMAM o PMAD) y los receptores reconocedores de patrones (RRP) presentes en las células del hospedero es un evento crítico que implica procesos intracelulares de señalización que finalizan en la expresión de mediadores tanto proinflamatorios como antivirales. Por consiguiente, de la integridad de estos receptores dependerá el buen funcionamiento de los distintos mecanismos de transducción de señal desde las membranas celulares al citoplasma y por ende, de la respuesta que el SI desencadene contra los patógenos entre ellos los agentes virales. De allí que, en esta revisión se discutirá el papel de los receptores tipo toll (TLRs) y receptores para dominios de oligomerización para la unión a nucleótidos (NLRs) en las infecciones virales, tomando como evidencia los estudios en humanos y ratones que a la fecha se conocen.

The immune system (IS) cells are capable of recognizing a wide variety of microorganisms, through receptors that are expressed and distributed throughout the cell architecture. The interaction between the pathogen-associated molecular patterns or damage-associated molecular patterns (PAMPs or DAMPs) and pattern recognition receptors (PRR), present in host cells, is a critical event that involves intracellular signaling processes that end up in the expression of both, proinflammatory and antiviral mediators. Accordingly, the proper functioning of the different mechanisms of signal transduction from the cell membrane to the cytoplasm will depend on the integrity of these receptors (PRR); and therefore, the IS response triggered against pathogens including viral agents. Hence, in this review we discuss the role of toll-like receptors (TLRs) and nucleotide-binding oligomerization domain receptors (NLRs) in viral infections, using as evidence the studies in humans and mice known to date.
Descritores: Proteínas Adaptadoras de Sinalização CARD/fisiologia
Interações Hospedeiro-Patógeno/imunologia
/fisiologia
NODTEMEFOS SIGNALING ADAPTOR PROTEIN/fisiologia
Receptores Toll-Like/fisiologia
Viroses/imunologia
-Proteínas de Transporte/fisiologia
Citocinas/biossíntese
Citocinas/genética
Evolução Molecular
Previsões
Imunidade Inata
Modelos Imunológicos
Família Multigênica
Proteína Adaptadora de Sinalização NOD1/fisiologia
Estrutura Terciária de Proteína
Transdução de Sinais
Receptores Toll-Like/química
Receptores Toll-Like/classificação
Limites: Animais
Seres Humanos
Camundongos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Revisão
Responsável: VE1.1 - Biblioteca Humberto Garcia Arocha


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Id: lil-742762
Autor: ACQUAFRESCA, Pablo A.; PALERMO, Mariano; ROGULA, Tomasz; DUZA, Guillermo E.; SERRA, Edgardo.
Título: Early surgical complications after gastric by-pass: a literature review / Complicações cirúrgicas precoces após bypass gástrico: revisão da literatura
Fonte: ABCD arq. bras. cir. dig;28(1):74-80, 2015. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: INTRODUCTION: Gastric bypass is today the most frequently performed bariatric procedure,but, despite of it, several complications can occur with varied morbimortality. Probably all bariatric surgeons know these complications, but, as bariatric surgery continues to spread, general surgeon must be familiarized to it and its management. Gastric bypass complications can be divided into two groups: early and late complications, taking into account the two weeks period after the surgery. This paper will focus the early ones. METHOD: Literature review was carried out using Medline/PubMed, Cochrane Library, SciELO, and additional information on institutional sites of interest crossing the headings: gastric bypass AND complications; follow-up studies AND complications; postoperative complications AND anastomosis, Roux-en-Y; obesity AND postoperative complications. Search language was English. RESULTS: There were selected 26 studies that matched the headings. Early complications included: anastomotic or staple line leaks, gastrointestinal bleeding, intestinal obstruction and incorrect Roux limb reconstruction. CONCLUSION: Knowledge on strategies on how to reduce the risk and incidence of complications must be acquired, and every surgeon must be familiar with these complications in order to achieve an earlier recognition and perform the best intervention. .

INTRODUÇÃO: O bypass gástrico é hoje o procedimento bariátrico mais realizado, mas, apesar disso, várias complicações podem ocorrer com variada morbimortalidade. Provavelmente todos os cirurgiões bariátricos conhecem essas complicações, mas como a cirurgia bariátrica continua a se espalhar, o cirurgião geral deve estar familiarizado com essas complicações e seu manuseio. As complicações do bypass gástrico podem ser divididas em dois grupos: as precoces e tardias, tendo em conta o período de duas semanas após a operação. Este artigo irá focar as precoces. MÉTODO: Foi realizada revisão da literatura utilizando as bases Medline/PubMed, Cochrane Library, SciELO, e informações adicionais sobre sites institucionais de interesse cruzando os descritores: bypass gástrico AND complicações; seguimento AND complicações; complicações pós-operatórias AND anastomose, Roux-en-Y; obesidade AND complicações pós-operatórias. A língua usada para a busca foi o inglês. RESULTADOS: Foram selecionados 26 artigos que combinavam com os descritores. As complicações imediatas foram: fístula na linha de grampeamento, sangramento gastrointestinal, obstrução intestinal e reconstrução incorreta da alça em Roux. CONCLUSÃO: O conhecimento sobre as estratégias de como reduzir o risco e incidência das complicações deve ser adquirido ao longo do tempo, e cada cirurgião deve estar familiarizado com essas complicações, a fim de reconhecê-las precocemente e realizar a melhor intervenção. .
Descritores: Linfócitos B/fisiologia
Poli(ADP-Ribose) Polimerases/fisiologia
-Formação de Anticorpos/efeitos dos fármacos
Formação de Anticorpos/genética
Apoptose/genética
Apoptose/imunologia
Linfócitos B/efeitos dos fármacos
Linfócitos B/metabolismo
Diferenciação Celular/efeitos dos fármacos
Diferenciação Celular/genética
Sobrevivência Celular/genética
Imunoglobulina A/imunologia
/farmacologia
INTERLEUKIN-ABBREVIATIONS AS TOPIC/farmacologia
Camundongos Knockout
Família Multigênica
MICE, INBRED CABDOMENABDOMINAL INJURIESBL
Proteínas de Neoplasias/genética
Proteínas de Neoplasias/metabolismo
Proteínas de Neoplasias/fisiologia
Poli(ADP-Ribose) Polimerases/química
Poli(ADP-Ribose) Polimerases/genética
Poli(ADP-Ribose) Polimerases/metabolismo
Homologia de Sequência
Limites: Animais
Feminino
Camundongos
Tipo de Publ: Research Support, N.I.H., Extramural
Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-723999
Autor: Sun, Mingyue; Wang, Yue; Chen, Zhongju; Zhu, Xuhui; Tian, Lei; Sun, Ziyong.
Título: The first report of the vanC1 gene in Enterococcus faecium isolated from a human clinical specimen
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;109(6):712-715, 09/09/2014. graf.
Idioma: en.
Projeto: China National Mega Project.
Resumo: The vanC1 gene, which is chromosomally located, confers resistance to vancomycin and serves as a species marker for Enterococcus gallinarum. Enterococcus faecium TJ4031 was isolated from a blood culture and harbours the vanC1gene. Polymerase chain reaction (PCR) assays were performed to detect vanXYc and vanTc genes. Only the vanXYc gene was found in the E. faecium TJ4031 isolate. The minimum inhibitory concentrations of vancomycin and teicoplanin were 2 µg/mL and 1 µg/mL, respectively. Real-time reverse transcription-PCR results revealed that the vanC1and vanXYc genes were not expressed. Pulsed-field gel electrophoresis and southern hybridisation results showed that the vanC1 gene was encoded in the chromosome. E. faecalis isolated from animals has been reported to harbour vanC1gene. However, this study is the first to report the presence of the vanC1gene in E. faecium of human origin. Additionally, our research showed the vanC1gene cannot serve as a species-specific gene of E. gallinarum and that it is able to be transferred between bacteria. Although the resistance marker is not expressed in the strain, our results showed that E. faecium could acquire the vanC1gene from different species.
Descritores: Proteínas de Bactérias/genética
Enterococcus faecium/genética
Genes Bacterianos/genética
Enterococos Resistentes à Vancomicina/genética
-Antibacterianos/farmacologia
Southern Blotting
Proteínas de Bactérias/sangue
Eletroforese em Gel de Campo Pulsado
Enterococcus faecalis/genética
Enterococcus faecium/efeitos dos fármacos
Enterococcus/efeitos dos fármacos
Enterococcus/genética
Hibridização In Situ/métodos
Testes de Sensibilidade Microbiana
Tipagem de Sequências Multilocus
Família Multigênica/fisiologia
Reação em Cadeia da Polimerase
Teicoplanina/farmacologia
Resistência a Vancomicina/genética
Vancomicina/farmacologia
Limites: Seres Humanos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-654244
Autor: Bertoletto, Paulo Roberto; Ikejiri, Adauto Tsutomu; Somaio Neto, Frederico; Chaves, José Carlos; Teruya, Roberto; Bertoletto, Eduardo Rodrigues; Taha, Murched Omar; Fagundes, Djalma José.
Título: Oxidative stress gene expression profile in inbred mouse after ischemia/reperfusion small bowel injury / Perfil da expressão gênica do estresse oxidativo em camundongos isogênicos após lesão de isquemia e reperfusão intestinal
Fonte: Acta cir. bras;27(11):773-782, Nov. 2012. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: PURPOSE: To determine the profile of gene expressions associated with oxidative stress and thereby contribute to establish parameters about the role of enzyme clusters related to the ischemia/reperfusion intestinal injury. METHODS: Twelve male inbred mice (C57BL/6) were randomly assigned: Control Group (CG) submitted to anesthesia, laparotomy and observed by 120min; Ischemia/reperfusion Group (IRG) submitted to anesthesia, laparotomy, 60min of small bowel ischemia and 60min of reperfusion. A pool of six samples was submitted to the qPCR-RT protocol (six clusters) for mouse oxidative stress and antioxidant defense pathways. RESULTS: On the 84 genes investigated, 64 (76.2%) had statistic significant expression and 20 (23.8%) showed no statistical difference to the control group. From these 64 significantly expressed genes, 60 (93.7%) were up-regulated and 04 (6.3%) were down-regulated. From the group with no statistical significantly expression, 12 genes were up-regulated and 8 genes were down-regulated. Surprisingly, 37 (44.04%) showed a higher than threefold up-regulation and then arbitrarily the values was considered as a very significant. Thus, 37 genes (44.04%) were expressed very significantly up-regulated. The remained 47 (55.9%) genes were up-regulated less than three folds (35 genes - 41.6%) or down-regulated less than three folds (12 genes - 14.3%). CONCLUSION: The intestinal ischemia and reperfusion promote a global hyper-expression profile of six different clusters genes related to antioxidant defense and oxidative stress.

OBJETIVO: Determinar o perfil de expressão dos genes associados com estresse oxidativo e contribuir para estabelecer parâmetros sobre o papel das familias de enzimas relacionadas com a lesão de isquemia / reperfusão intestinal. MÉTODOS: Doze camundongos machos isogênicos (C57BL/6) foram distribuídos aleatoriamente: Grupo Controle (CG) submetido à laparotomia anestesia, e observado por 120min; Grupo isquemia/reperfusão (IRG) submetido à anestesia, laparotomia, 60min de isquemia do intestino delgado e 60min de reperfusão. Um pool dos seis camundongos de cada grupo foi submetido ao protocolo de qPCR-RT (seis famílias) para o estresse oxidativo e defesa antioxidante. RESULTADOS: Dos 84 genes investigados, 64 (76,2%) tiveram expressão estatística significante e 20 (23,8%) não apresentaram diferença estatística com o grupo controle. Dos 64 genes expressos de forma significante, 60 (93,7%) foram hiper-expressos e 04 (6,3%) foram hipo-expressos. Do grupo sem expressão estatisticamente significante, 12 genes foram hiper e 8 genes foram hipo-expressos. Surpreendentemente, 37 (44,04%) apresentaram expressão três maior que o limiar de normalidade e arbitrariamente os valores foram considerados como altamente significantes. Assim, 37 genes (44,04%) foram hiper-expressos de modo muito significante. Nos demais, 47 (55,9%) dos genes foram hiper-expressos menos de três vezes (35 genes - 41,6%) ou hipo-expressos menos de três vezes(12 genes - 14,3%). CONCLUSÃO: A isquemia e reperfusão intestinal promoveu um perfil de hiper-expressão global das seis familias de genes relacionados com estresse oxidativo antioxidante e defesa antioxidante.
Descritores: Intestino Delgado/irrigação sanguínea
Intestino Delgado/cirurgia
Isquemia/genética
Estresse Oxidativo/genética
Traumatismo por Reperfusão/metabolismo
-Antioxidantes/metabolismo
Regulação para Baixo/genética
Perfilação da Expressão Gênica
Isquemia/metabolismo
MICE, INBRED CABDOMENABDOMINAL INJURIESBL
Família Multigênica/genética
Distribuição Aleatória
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
Traumatismo por Reperfusão/genética
Fatores de Tempo
Regulação para Cima/genética
Limites: Animais
Masculino
Camundongos
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-541118
Autor: Morgan, M.
Título: Models for the recent evolution of protocadherin gene clusters
Fonte: Biocell;32(1):9-26, Apr. 2008. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: The clustered protocadherins (Pcdhs) are single-pass transmembrane proteins that constitute a subfamily within the cadherin superfamily. In mammals, they are arranged in three consecutive clusters named alpha, beta, and gamma. These proteins are expressed in the nervous system and are targeted to mature synapses.Interestingly, different neurons express different subsets of isoforms; however, little is known about the functions and expression of the clustered Pcdhs. Previous phylogenetic analyses that compared rodent and human clusters postulated the recent occurrence of gene duplication events. Using standard phylogenetic methods, I confirmed the prior observations, and I show that duplications are likely to occur through unequal crossing-over events between two, and sometimes three, different Pcdh genes. The results are consistent with the fact that these genes undergo gene conversion. Recombination events between different clustered Pcdh genes appear to underlie concerted evolution through gene conversion and gene duplications through unequal crossing-over. In this work, I provided evidence that the unit of duplication of these genes in both the mouse and the human and within each cluster is the same. The unit of duplication includes the extracellular domain-coding sequence of an isoform and its promoter along with the cytoplasmic domain-coding region of the immediately upstream isoform in the cluster.
Descritores: Sequência de Aminoácidos
Caderinas/genética
Evolução Molecular
Modelos Biológicos
Modelos Genéticos
-Estrutura Terciária de Proteína/genética
Dados de Sequência Molecular
Família Multigênica
Filogenia
Ratos
Homologia de Sequência de Aminoácidos
Limites: Seres Humanos
Ratos
Animais
Responsável: AR40.1 - Biblioteca de la Facultad de Ciencias Médicas de la UNCuyo



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