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Texto completo SciELO Brasil
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Id: lil-421722
Autor: Magalhães, Juliana Teixeira de; Floresta, Fernanda; Moraes, Célia Alencar de.
Título: Partial characterization of ribosomal operons of Lactobacillus delbrueckii UFV H2b20
Fonte: Braz. j. microbiol;36(2):177-183, Apr.-June 2005. ilus.
Idioma: en.
Resumo: Operons ribossomais têm sido instrumentos importantes na caracterizacão de comunidades microbianas e no estudo de relacionamentos entre microrganismos, principalmente em bactérias do ácido láctico. Operons ribossomais da linhagem probiótica, Lactobacillus delbrueckii UFV H2b20, foram parcialmente caracterizados. Um banco genômico da linhagem foi construído e os clones, contendo parte do operon ribossomal, foram subclonados pelo método de "shot gun", para em seguida serem seqüenciados com primer "forward". As seqüências indicaram a presenca da extremidade 3' do rDNA 16S seguida da região espacadora curta 1 (16S-23S) e a presenca da extremidade 3' do rDNA 23S seguido da região espacadora 2 (23S-5S), que por sua vez precedia o rDNA 5S. Adjacente ao gene rDNA 5S deste operon rrn uma região codificadora de 6 tRNAs foi detectada.
Descritores: DNA Ribossômico
Biblioteca Genômica
Técnicas In Vitro
Ácido Láctico
Lactobacillus
RNA Ribossômico
Óperon de RNAr
-Métodos
Amostragem
Tipo de Publ: Revisão
Responsável: BR32.1 - Serviço de Biblioteca e Informação Biomédica


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Araripe, J. R
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Id: lil-417584
Autor: Silva, R; Araripe, J. R; Rondinelli, E; Urményi, T. P.
Título: Gene expression in Chromobacterium violaceum
Fonte: Genet. mol. res. (Online);3(1):64-75, Mar. 2004.
Idioma: en.
Resumo: The repertoire of 4,431 open reading frames (ORFs), eight rRNA operons and 98 tRNA genes of Chromobacterium violaceum must be expressed in a regulated manner for successful adaptation to a wide variety of environmental conditions. To accomplish this feat, the organism relies on protein machineries involved in transcription, RNA processing and translation. Analysis of the C. violaceum genome showed that transcription initiation, elongation and termination are performed by the five well-known RNA polymerase subunits, five categories of sigma 70 factors, one sigma 54 factor, as well as six auxiliary elongation and termination factors. RNA processing is performed by a variety of endonucleases and exonucleases, such as ribonuclease H, ribonuclease E, ribonuclease P, and ribonuclease III, in addition to poly(A) polymerase and specific methyltransferases and pseudouridine synthases. ORFs for all ribosomal proteins, except S22, were found. Only 19 aminoacyl-tRNA synthetases were found, in addition to three aminoacyl-tRNA synthetase-related proteins. Asparaginyl-tRNA (Asn) is probably obtained by enzymatic modification of a mischarged aminoacyl-tRNA. The translation factors IF-1, IF-2, IF-3, EF-Ts, EF-Tu, EF-G, RF-1, RF-2 and RF-3 are all present in the C. violaceum genome, although the absence of selB suggests that C. violaceum does not synthesize selenoproteins. The components of trans-translation, tmRNA and associated proteins, are present in the C. violaceum genome. Finally, a large number of ORFs related to regulation of gene expression were also found, which was expected, considering the apparent adaptability of this bacterium
Descritores: Adaptação Fisiológica/genética
Chromobacterium/genética
Regulação Bacteriana da Expressão Gênica/genética
-Chromobacterium/fisiologia
Fases de Leitura Aberta/genética
Genoma Bacteriano
RNA de Transferência/genética
Óperon de RNAr
Regulação Bacteriana da Expressão Gênica/fisiologia
Transcrição Genética
Tipo de Publ: Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-212527
Autor: Ortiz Rivera, María; Leibowitz, Michael J.
Título: Partial sequence of the rRNA operon of Pneumocystis carinii isolates from Puerto Rico
Fonte: P. R. health sci. j;16(3):251-4, sept. 1997. ilus.
Idioma: en.
Resumo: Several reports indicate geographic variation of isolates of Pneumocystis carinii hominis. We have sequenced the internal transcribed spacer (ITS) region and large subunit Group I intron of rRNA genes from P. carinii DNA obtained from two patients from Puerto Rico. Both can be subclassified as Type II, according to the sequence of the ITS region. A system capable of identifying individual isolates will be an essential tool for epidemiological studies of the organism. The amplification of DNA from fixed tissues may facilitate the processing of a large number of samples.
Descritores: Pneumocystis carinii/genética
Óperon de RNAr/genética
-Sequência de Bases
Dados de Sequência Molecular
Porto Rico
Limites: Seres Humanos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME



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