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Id: lil-747606
Autor: Navas Navas, María Cristina; Báez Triana, Paula Andrea.
Título: Infección por el virus de la hepatitis A: epidemiología y diversidad genética / Hepatitis A virus infection: Epidemiology and genetic diversity / Infecção pelo vírus da hepatite A: epidemiologia e diversidade genética
Fonte: Iatreia;28(2):157-169, abr.-jun. 2015. ilus, tab.
Idioma: es.
Resumo: La infección por el virus de la hepatitis A es un problema global de salud pública. El virus está ampliamente distribuido y es la principal causa de hepatitis aguda de transmisión entérica en Latinoamérica. La partícula viral es estable en el medio ambiente y conserva su infectividad por varias semanas, lo que facilita su transmisión por agua y alimentos contaminados. Mundialmente se han descrito distintos patrones epidemiológicos, que pueden cambiar en el tiempo al modificarse variables socioeconómicas en la población como las condiciones sanitarias básicas y la vacunación. Esto deja al descubierto nuevas poblaciones susceptibles a la infección. En Latinoamérica se ha descrito la circulación del genotipo I y los subgenotipos A y B, pero se requieren más investigaciones que aporten el conocimiento necesario para gestionar planes de prevención y control para la disminución mundial de la prevalencia de la infección. Para este artículo se hizo una revisión de la literatura en las bases de datos SciELO, PubMed y ScienceDirect bajo los términos de búsqueda ''Virus de la hepatitis A'', ''Epidemiología'', ''Seroprevalencia'' e ''Infección''. De los resultados obtenidos se incluyeron únicamente las publicaciones en inglés y español que describieran estudios epidemiológicos y moleculares de interés en Latinoamérica.

Hepatitis A virus infection is a global public health problem. The virus has a wide range of distribution and it is the main cause of acute hepatitis transmitted by the enteric route in Latin America. The viral particle is stable under environmental conditions and conserves its infectivity for several weeks, enabling its transmission by contaminated water and food. Worldwide, different epidemiological patterns have been identified, which may change over time by modification of social and economic variables in the population such as vaccination and the improvement of hygiene and primary health conditions. This leaves new populations susceptible to infection. In Latin America the circulation of genotype I and subgenotypes A and B has been described, but more research is needed to provide the knowledge needed to manage the prevention and control plans for the worldwide reduction of the prevalence of infection. For this paper, a literature review was performed on the SciELO, PubMed and ScienceDirect databases under the search terms "Hepatitis A", "Epidemiology," "Seroprevalence" and "Infection." From the results obtained, only papers published in English and Spanish to describe epidemiological and molecular studies of interest in Latin America were included.

A infecção pelo vírus da hepatite A é um problema global de saúde pública. O vírus está amplamente distribuído e é a principal causa de hepatite aguda de transmissão entérica na América Latina. A partícula viral é estável no médio ambiente e conserva sua infecciosidade por várias semanas, o que facilita sua transmissão por água e alimentos contaminados. Mundialmente se descreveram diferentes padrões epidemiológicos, que podem mudar no tempo ao modificar- se variáveis socioeconômicas na população como as condições sanitárias básicas e a vacinação. Isto deixa ao descoberto novas populações susceptíveis à infecção. Na América Latina se descreveu a circulação do genótipo I e os sub-genótipos A e B, mas são necessárias mais investigações que contribuam o conhecimento necessário para gerir planos de prevenção e controle para a diminuição mundial da prevalência da infecção. Para este artigo se fez uma revisão da literatura nas bases de dados SciELO, Pub- Med e ScienceDirect sob os termos de busca ''Vírus da hepatite A'', ''Epidemiologia'', ''Seroprevalência'' e ''Infecção''. Dos resultados obtidos se incluíram unicamente os estudos publicados em inglês e espanhol que descrevessem estudos epidemiológicos e moleculares de interesse na América Latina.
Descritores: Variação Genética
Saúde Pública
Epidemiologia
Vírus da Hepatite A
Hepatite A
-Vírus
Limites: Humanos
Tipo de Publ: Revisão
Responsável: CO332 - Facultad de Medicina


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Id: biblio-1154964
Autor: Restrepo-Escobar, Natalia; Yepes-Acevedo, Anny Johanna; Márquez, Edna Judith.
Título: Population genetics of three threatened catfish species in heterogeneous environments of the Cauca River, Colombia
Fonte: Neotrop. ichthyol;19(1):e200040, 2021. tab, graf, mapas.
Idioma: en.
Projeto: Universidad Nacional de Colombia; . Empresas Públicas de Medellín.
Resumo: Neotropical catfishes Ageneiosus pardalis, Pimelodus grosskopfii and Sorubim cuspicaudus are migratory fishes of commercial importance that exhibit decreasing populations due to overfishing and other anthropic interventions. This study used species-specific microsatellite loci to test the hypothesis that threatened fish populations show genetic vulnerability signs and are genetically structured in the middle and lower sections of the Cauca River. The studied species exhibit genetic diversity levels higher than the average values reported for Neotropical Siluriformes; however, they seem to have suffered recent bottlenecks and they present significant endogamy levels that are higher for the critically endangered catfish P. grosskopfii. Furthermore, both Ageneiosus pardalis and S. cuspicaudus are each formed by one genetic group, while Pimelodus grosskopfii comprises two coexisting genetic groups. The information obtained in this study is useful for the decision making in management plans that are appropriate for the sustainability of these three species populations within the proposal for the expansion of the hydroelectric development and other anthropic activities.(AU)

Los bagres Neotropicales Ageneiosus pardalis, Pimelodus grosskopfii y Sorubim cuspicaudus, son peces migratorios de importancia comercial cuyas poblaciones han disminuido debido a la sobrepesca y otras intervenciones antrópicas. En este trabajo, se utilizaron loci microsatélites especie-específicos para contrastar la hipótesis de que las poblaciones de peces amenazadas muestran señales de vulnerabilidad genética y están genéticamente estructuradas en los sectores medio y bajo del río Cauca. Las especies estudiadas exhiben niveles de diversidad genética superiores a los promedios reportados para Siluriformes Neotropicales; sin embargo, parecen haber sufrido cuellos de botella recientes y presentan niveles significativos de endogamia que son más altos para el bagre en peligro crítico, P. grosskopfii. Además, Ageneiosus pardalis y S. cuspicaudus están conformados cada uno por un solo grupo genético, mientras que Pimelodus grosskopfii comprende dos grupos genéticos que coexisten. La información obtenida en este estudio es útil para la toma de decisiones en planes de manejo que sean adecuados para la sostenibilidad de las poblaciones de estas tres especies de bagre dentro de las propuestas para la expansión de desarrollo hidroeléctrico y otras actividades antrópicas.(AU)
Descritores: Peixes-Gato
Meio Ambiente
Genética Populacional
-Variação Genética
Rios
Responsável: BR68.1 - Biblioteca Virginie Buff D'Ápice


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Id: biblio-1154970
Autor: Joya, Cristhian Danilo; Landínez-García, Ricardo Marcel; Márquez, Edna Judith.
Título: Development of microsatellite loci and population genetics of the catfish Pimelodus yuma (Siluriformes: Pimelodidae)
Fonte: Neotrop. ichthyol;19(1):e200114, 2021. tab, graf, mapas, ilus.
Idioma: en.
Projeto: Empresas Públicas de Medellín and Universidad Nacional de Colombia.
Resumo: Pimelodus yuma (formerly Pimelodus blochii) is a freshwater fish, endemic to the Colombian Magdalena-Cauca and Caribbean basins that experiences habitat disturbances resulting from anthropogenic activities. Due to the lack of information about the population genetics of this species, this study developed 14 species-specific microsatellite loci to assess the genetic diversity and population structure of samples from the lower section of the Cauca River. The studied species showed genetic diversity levels higher than the average values reported for Neotropical Siluriformes and significant inbreeding levels as was described for some congeners. Furthermore, P. yuma comprises two coexisting genetic groups that exhibit gene flow along the lower section of the Cauca River. This information constitutes a baseline for future monitoring of the genetic diversity and population structure in an anthropic influenced sector of the Magdalena-Cauca basin.(AU)

Pimelodus yuma (anteriormente Pimelodus blochii) es un pez dulceacuícola endémico de las cuencas colombianas Magdalena-Cauca y Caribe que experimenta alteraciones del hábitat como resultado de actividades antropogénicas. Debido a la falta de información sobre la genética poblacional de esta especie, este estudio desarrolló 14 loci microsatélites especie-específicos para evaluar la diversidad genética y la estructura poblacional de muestras de la sección baja del río Cauca. La especie estudiada mostró niveles de diversidad genética más altos que los valores promedio reportados para Siluriformes neotropicales y niveles de endogamia significativos como se describió para algunos congéneres. Además, P. yuma comprende dos grupos genéticos coexistentes que exhiben flujo de genes a lo largo de la sección baja del río Cauca. Esta información constituye una línea base para futuros monitoreos de la diversidad genética y la estructura poblacional en un sector de influencia antrópica de la cuenca Magdalena-Cauca.(AU)
Descritores: Variação Genética
Peixes-Gato/genética
Repetições de Microssatélites
Genética Populacional
-Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala
Água Doce
Limites: Animais
Responsável: BR68.1 - Biblioteca Virginie Buff D'Ápice


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: biblio-1154971
Autor: Rangel-Medrano, José David; Márquez, Edna Judith.
Título: Development of microsatellite loci and population genetics in the bumblebee catfish species Pseudopimelodus atricaudus and Pseudopimelodus magnus (Siluriformes: Pseudopimelodidae)
Fonte: Neotrop. ichthyol;19(1):e200053, 2021. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: Universidad Nacional de Colombia; . Empresas Públicas de Medellín.
Resumo: The Neotropical freshwater catfish Pseudopimelodus atricaudus and Pseudopimelodus magnus are two recently discovered species endemic to the Colombian Magdalena-Cauca River basin. In this study, a set of 13 microsatellite loci were developed by using next generation sequence technology to assess the genetic diversity and population structure in P. atricaudus and test for cross-species amplification in P. magnus. Both species exhibited high genetic diversity (P. atricaudus: Na: 9.000 - 9.769 alleles/locus, Ho: 0.760 - 0.804, HE: 0.804 - 0.840; P. magnus: Na: 12.8 - 5.4 alleles/locus, Ho: 0.638 - 0.683, HE: 0.747 - 0.755) compared to the mean levels of genetic diversity reported for Neotropical Siluriformes, and lack of genetic differentiation among sampling sites within the Cauca River (P. atricaudus: F'ST=0.013 - 0.017, P > 0.05, D'est= -0.004 - 0.023, P > 0.05; P. magnus: F'ST= 0.031, P= 0.055; D'est= 0.045, P= 0.058). This work is the first insight on the diversity and the population genetics of species of the family Pseudopimelodidae and provides a framework to further population genetic and conservation analyses needed in this poorly studied family at the microevolutionary level.(AU)

Los bagres neotropicales Pseudopimelodus atricaudus y Pseudopimelodus magnus son dos especies recientemente descubiertas, endémicas de la cuenca Magdalena-Cauca en Colombia. En este estudio, se desarrollaron 13 loci microsatélites usando tecnología de secuenciación de próxima generación para evaluar la diversidad genética y la estructura poblacional de P. atricaudus y evaluar su amplificación cruzada en P. magnus. Ambas especies exhibieron altos valores de diversidad genética (P. atricaudus: Na: 9.000 - 9.769 alelos/locus, HO: 0.760 - 0.804, HE: 0.804 - 0.840; P. magnus: Na: 12.8 - 5.4 alelos/locus, HO: 0.638 - 0.683, HE: 0.747 - 0.755) comparados con los valores promedios de diversidad genética reportados para Siluriformes neotropicales, y ausencia de estructura genética entre los sitios analizados (P. atricaudus: F'ST= 0.013 - 0.017, P > 0.05, D'est= -0.004 - 0.023, P > 0.05; P. magnus: F'ST= 0.031, P= 0.055; D'est= 0.045, P= 0.058). Este trabajo representa la primera aproximación a la diversidad y genética poblacional de especies de la familia Pseudopimelodidae y proporciona un marco de referencia para futuros estudios genético-poblacionales y de conservación, requeridos en esta familia de bagres poco estudiada en el nivel microevolutivo.(AU)
Descritores: Variação Genética
Peixes-Gato/genética
Repetições de Microssatélites
Genética Populacional
Limites: Animais
Responsável: BR68.1 - Biblioteca Virginie Buff D'Ápice


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Texto completo SciELO Saúde Pública
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Id: biblio-890200
Autor: Soares, Leonardo Ferreira; Lima, Eleonidas Moura; Silva, José Alexsandro da; Fernandes, Suenia Soares; Silva, Keyla Malba da Costa; Lins, Sarah Pereira; Damasceno, Bolivar Ponciano Goulart de Lima; Verde, Roseane Mara Cardoso Lima; Gonçalves, Marilda de Souza.
Título: Prevalência de hemoglobinas variantes em comunidades quilombolas no estado do Piauí, Brasil / Prevalence of hemoglobin variants in quilombola communities in the state of Piauí, Brazil
Fonte: Ciênc. Saúde Colet;22(11):3773-3780, Nov. 2017. tab.
Idioma: pt.
Resumo: Resumo As hemoglobinas variantes (Hb) decorrem de mutações nos genes da globina. As variantes estruturais mais frequentes são HbS, HbC, HbD e HbE. O gene da hemoglobina S tem frequência elevada na América, enquanto que no Brasil é maior no Sudeste e Nordeste. O presente artigo tem por objetivo investigar a presença de hemoglobinas variantes em 15 comunidades quilombolas do estado do Piauí. Foram analisadas 1.239 amostras, nas quais as hemoglobinas foram triadas pela cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC). Aplicou-se questionário referente a gênero, etnia e consanguinidade das populações. Das 1.239 amostras, 5,4% apresentaram o traço falciforme AS, as doenças falciformes SS e SC apareceram em 0,8% do total, nas hemoglobinas AC, AD e DD. Das 1.069 pessoas negras, 84 apresentaram alteração das hemoglobinas; destas, 34 eram do sexo masculino e 53 do feminino. Ocorreu a presença de 13 casamentos consanguíneos dentre as 84 alterações das hemoglobinas. O estudo das hemoglobinas variantes em 15 comunidades remanescentes de quilombos do Piauí contribui para sua educação em saúde frente aos aspectos da herança genética destas proteínas, relevante questão de saúde pública, proporcionando subsídios para a implantação do Programa Estadual da Doença Falciforme do Piauí.

Abstract Hemoglobin variants (Hb) result from mutations in globin genes, with amino acid substitution in the polypeptide chain. Among the most common structural variants are HbS, HbC, HbD and HbE. The S hemoglobin gene is a high frequency gene across America and Brazil, where it is more frequent in the Southeast and Northeast. The scope of this article is to investigate the presence of hemoglobin variants in 15 quilombos (fugitive slave communities) of Piaui. The sample was of 1,239 people and hemoglobin was screened by high-performance liquid chromatography (HPLC). A questionnaire was applied related to gender, ethnicity and consanguinity. Of the samples analyzed, 5.4% had AS sickle cell trait, while SS and SC sickle cell anemia showed a rate of 0.8%, with AC, AD and DD hemoglobin. Of the 1,069 Afro-descendants, 84 revealed hemoglobin abnormalities, 34 being male 53 being female. There were 13 consanguineous marriages among the 84 hemoglobin alterations. The study of hemoglobin variants in 15 former quilombo communities in the state of Piaui contributes to their education in health in the aspects of genetic inheritance of hemoglobin, a relevant public health issue, providing input for the implementation of the State Program of Sickle Cell Disease of Piaui.
Descritores: Traço Falciforme/epidemiologia
Hemoglobinas/genética
Grupos Étnicos/genética
Anemia Falciforme/epidemiologia
-Traço Falciforme/genética
Variação Genética
Brasil/epidemiologia
Prevalência
Inquéritos e Questionários
Cromatografia Líquida de Alta Pressão/métodos
Consanguinidade
Substituição de Aminoácidos/genética
Grupo com Ancestrais do Continente Africano/genética
Frequência do Gene
Anemia Falciforme/genética
Limites: Humanos
Masculino
Feminino
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: biblio-1147802
Autor: Marçal, Tiago de Souza; Bernardes, Carolina de Oliveira; Oliveira, Wagner Bastos dos Santos; Guilhen, José Henrique Soler; Ferreira, Marcia Flores da Silva; Ferreira, Adésio.
Título: Genetic diversity of Euterpe edulis martius based on fruit traits / Diversidade genética de Euterpe edulis martius com base em características de frutos
Fonte: Biosci. j. (Online);36(5):1549-1556, 01-09-2020. ilus.
Idioma: en.
Resumo: Juçara (Euterpe edulis Martius) is a palm species from the Atlantic Forest whose fruits are important as a source of food to several individuals from the fauna of the region. Despite its ecological importance, juçara is found in the list of endangered species, due to the fragmentation of the forests and the illegal extraction of the heart of palm. We aimed to evaluate the inter- and intra-populational genetic diversity of E. edulis based on fruit and seed traits in forest fragments of the Espírito Santo State in Brazil. The aim was to generate information to be used in E. edulis breeding programs, or in the delineation of more efficient management and reforestation strategies. The study was carried out in 20 forest fragments and 198 fruit plants were sampled. Positive genetic association was observed between the evaluated traits, with the longitudinal diameter of the fruit (LDF) and the seed mass (SM) greatly affecting fruit mass (FM). The existence of inter- and intra-populational genetic divergence was proved. The genetic divergence found in E. edulis suggests that there is genetic material that can be explored in breeding programs and this information may also contribute to management strategies that can increase the species genetic diversity

Juçara (Euterpe edulis Martius) é uma espécie de palmeira da Mata Atlântica, que é importante como fonte de alimento para vários indivíduos da fauna. Apesar de sua importância ecológica, juçara é encontrada na lista de espécies ameaçadas à extinção, devido à fragmentação florestal e à extração ilegal do palmito. Nós tivemos como objetivo avaliar a diversidade genética inter e intra populacional de E. edulis com base em caracteres de frutos e sementes, em fragmentos florestais do Estado do Espírito Santo no Brasil, com o objetivo de gerar informações a serem utilizadas nos programas de melhoramento de E. edulis ou na delimitação de estratégias de manejo e reflorestamento mais eficientes. O estudo foi realizado em 20 fragmentos florestais e 198 plantas frutíferas foram amostradas. Foi observada uma grande associação genética positiva entre os caracteres avaliados, com as características diâmetro longitudinal dos frutos (LDF) e massa de sementes (SM) apresentando efeitos maiores do que a massa característica da fruta (FM). A existência de divergência genética inter e intrapopulacional foi comprovada. A divergência genética encontrada neste trabalho para E. edulis sugere a presença de material genético que vale a pena ser explorado em programas de melhoramento e essa informação também pode contribuir com estratégias de manejo para aumentar a diversidade genética das espécies.
Descritores: Variação Genética
Euterpe
Responsável: BR396.1 - Biblioteca Central


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Id: biblio-1151817
Autor: Carletto-Körber, Fabiana P. M; Vera, Noelia S; Cornejo, Lila Susana; González-Ittig, Raúl E.
Título: Caries and genetic variability of streptococcus mutans / Caries y variabilidad genética de streptococcus mutans
Fonte: J. oral res. (Impresa);(2020,Perspectives in Oral Sciences):39-48, mar. 31, 2020. ilus, graf, tab.
Idioma: en.
Resumo: In the last two decades, the increase in population genetics studies has contributed to elucidating important questions about the evolution of the pathogenesis of bacteria of clinical interest. The objective of this study is to revise and update the knowledge of the last fifteen years regarding the genetic variability of Streptococcus mutans and their association with dental caries. Streptococcus mutans, one of the most widely distributed bacteria in the world, are heavily associated with this condition. This research shows the results of numerous studies carried out in various countries that, using molecular and biochemical methods, revealed associations between different serotypes and caries activity. In addition, it is reported that the population genetics structure of Streptococcus mutans in Argentina is highly recombinant, which reflects the largest waves of human immigration that occurred in the 19th and 20th centuries. On the other hand, demographic analysis suggests that these bacteria experienced a population expansion that coincided with the beginning of agricultural development.

En las últimas dos décadas el incremento de los estudios de genética de poblaciones ha contribuido a dilucidar cuestiones importantes sobre la evolución de la patogénesis de bacterias de interés clínico. El objetivo de este trabajo es realizar una actualización sobre los conocimientos de los últimos quince años referidos a la variabilidad genética de Streptococcus mutans y su relación con la caries dental. Streptococcus mutans, de amplia distribución mundial, es una de las bacterias más fuertemente asociada a dicha enfermedad. En este trabajo se muestran resultados de numerosos estudios realizados en diferentes países que utilizando métodos moleculares y bioquímicos revelaron asociaciones entre diferentes serotipos y la actividad de caries. Además, se reporta que la estructura genética poblacional de Streptococcus mutans de Argentina es de alto nivel recombinante, lo que reflejaría las grandes oleadas inmigratorias humanas ocurridas en los siglos 19thy 20th. Por otra parte, los análisis demográficos sugieren que esta bacteria experimentó una expansión poblacional coincidente con el comienzo del desarrollo de la agricultura
Descritores: Streptococcus mutans/genética
Variação Genética
Cárie Dentária/microbiologia
-Argentina/epidemiologia
Demografia
Emigração e Imigração
Sorogrupo
Genética Populacional
Limites: Humanos
Tipo de Publ: Revisão
Responsável: CL30.1 - Biblioteca


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Texto completo SciELO Chile
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Id: biblio-1038782
Autor: Garcia-Gonzales, Rolando; Pico-Mendoza, José; Quiroz, Karla; Carrasco, Basilio; Cáceres, Pablo; Chong-Perez, Borys; Pino, Hugo; Seiltgens, Marjorie; Greck, Eglis; Caligari, Peter D. S.
Título: Development and characterization of microsatellite markers in Gaultheria pumila Lf. (Ericaceae)
Fonte: Biol. Res;51:42, 2018. tab.
Idioma: en.
Projeto: Laboratorio Regional de Biotecnologías Aplicadas.
Resumo: BACKGROUND: Polymorphic microsatellite markers were developed for Gaultheria pumila (Ericaceae) to evaluate genetic diversity and population structure within its native range in Chile. This is a very important Ericaceae endemic to Chile with a large commercial potential. Its resistance to different abiotic conditions makes it a valuable target for genetic improvement. RESULTS: Ten polymorphic simple sequence repeat (SSR) loci were isolated from Gaultheria pumila using new-generation 454 FLX Titanium pyrosequencing technology. The mean number of alleles per locus ranged from 2 to 4. Observed and expected heterozygosity ranged from 0.00 to 1.0 and 0.00 to 0.64, respectively. CONCLUSIONS: From 10 SSR markers developed for G. pumila, 9 markers are promising candidates for analyzing genetic variation within or between natural populations of G. pumila and other species from the same genus.
Descritores: DNA de Plantas/genética
Repetições de Microssatélites/genética
Gaultheria/genética
-Polimorfismo Genético
Variação Genética
Alelos
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: biblio-1135392
Autor: Farias, Renata S; Silva, Bruno C. N. R; Nascimento, Wilka V. G; Silva, Gênison C; Luz, Ronald K; Prosdocimi, Francisco; Figueiredo, Rozzanno A. C. R; Carvalho, Daniel C; Coimbra, Maria R. M.
Título: Genetic diversity and aquaculture conservation for a threatened Neotropical catfish
Fonte: Neotrop. ichthyol;18(3):e200028, 2020. tab, graf, ilus, mapas.
Idioma: en.
Projeto: Grupo Boticário de Proteção à Natureza; . Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; . Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro; . Fundação de Amparo a Pesquisa de Minas Gerais; . Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; . Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; . Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; . Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico.
Resumo: Due to the ecological importance of Lophiosilurus alexandri, the present work evaluated its genetic representativeness by comparing wild stocks to broodstocks that were kept at three restocking hatcheries along the São Francisco River. A total of 97 samples were genotyped for newly developed microsatellite markers. Low levels of genetic diversity (average alleles number of 4.2 alleles) were detected in all cases, being more severe in captive groups. Significant pairwise FST and DEST values, Structure, and DAPC analyses showed that wild animals were structured in two groups, and a third group was formed by captive animals, evidencing the need to adopt genetic criteria to retain genetic diversity in the hatcheries. For this reason, three full-sib families were constructed to select the best relatedness estimator for L. alexandri and establish a cut-off value aimed to avoid full-sibling matings in the hatcheries. Two estimators, Wang (RW) and Lynch & Li (RLL), were accurate in reflecting the relatedness level for full-sibs in this species. According to them, less than 50% of the potential breeding matings in the three hatcheries are advisable. The innate low diversity of L. alexandri highlights the importance of minimizing inbreeding and retaining genetic diversity towards the species recovery.(AU)

Devido à importância ecológica de Lophiosilurus alexandri, o presente trabalho avaliou sua representatividade genética, comparando estoques selvagens com plantéis de reprodutores de três larviculturas ao longo do Rio São Francisco. Noventa e sete amostras foram genotipadas com marcadores microssatélites recém-desenvolvidos. Baixos níveis de diversidade genética (número médio de alelos de 4,2) foram detectados em todos os casos, sendo mais severo no cativeiro. Os valores de FST e DEST par a par, as análises do Structure e DAPC mostraram a estruturação dos animais selvagens em dois grupos, e um terceiro formado pelas larviculturas, evidenciando a necessidade de adoção de critérios genéticos para retenção da diversidade genética no cativeiro. Por essa razão, três famílias de irmãos completos foram construídas para selecionar o melhor estimador de parentesco para a espécie e estabelecer os valores mínimos de corte para evitar cruzamentos indesejados. Dois estimadores, Wang (RW) e Lynch & Li (RLL), foram eficientes em refletir as relações de parentesco para irmãos completos nessa espécie. Segundo eles, menos de 50% dos potenciais cruzamentos são recomendáveis nas três larviculturas. A baixa diversidade genética inerente ao L. alexandri destaca a importância de minimizar a consanguinidade e evitar perda de diversidade genética, visando a recuperação da espécie.(AU)
Descritores: Variação Genética
Peixes-Gato/genética
Aquicultura
-Cruzamento
Limites: Animais
Responsável: BR68.1 - Biblioteca Virginie Buff D'Ápice


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Id: biblio-968986
Autor: kirouani, Abderrezzak; Henkrar, Fatima; Udupa, Sripada M; Boukhalfoun, Leila; Bouzerzour, Hamenna.
Título: Genetic diversity in algerian durum wheat varieties (Triticum turgidum L var. durum) using microsatellite markers / Diversidade genética em variedades de trigo duro argelino (Triticum turgidum L var. durum) usando marcadores microssatélites
Fonte: Biosci. j. (Online);34(6):1575-1583, nov.-dec. 2018. tab, graf, ilus.
Idioma: en.
Resumo: Characterization of germplasm by DNA-markers provides powerful tool to precise germplasm identification. This study aimed to quantify the genetic diversity and to estimate the phylogenetic relationship among genotypes in many crop species. The results of the present study realized between Nov and Dec 2016 in biotechnologie unit (ICARDA, Morocco) which aimed to characterize a subset of 14 Algerian selected durum wheat cultivars (Triticum turgidum L. var. durum), using 13 SSR (Single Sequence Repeat) indicated the presence of a total of 39 alleles. The genetic diversity at the 13 microsatellites loci varied from 0,142 for Xgwm337 to 0.735 for Xgwm213 with a mean of 0.444. Polymorphic information content (PIC) values ranged from 0.13 to 0.70 and the genetic distance among the cultivars from 0.15 to 0.77. Clustering analysis showed that the studied varieties were grouped according to their population of origin, suggesting a provenance effect in their ordination. In fact the most similar varieties were those introduced from CIMMYT-ICARDA breeding program, which may have common parents in their pedigree. Selections from local landraces were more similar to each other and dissimilar to CIMMYT-ICARDA material, showing an agro-ecological adaptation.

A caracterização de germoplasma por marcadores de DNA fornece uma ferramenta poderosa para a identificação precisa de germoplasma, quantificar a diversidade genética e estimar a relação filogenética entre genótipos em muitas espécies de culturas. Os resultados do presente estudo foram realizados entre novembro e dezembro de 2016 na unidade de biotecnologia (ICARDA, Marrocos) que objetivou caracterizar um subconjunto de 14 cultivares de trigo duro argelinos selecionados (Triticum turgidum L. var. durum), utilizando 13 SSR (Single Sequence Repeat ) indicou a presença de um total de 39 alelos. A diversidade genética nos 13 locos de microssatélites variou de 0,142 para Xgwm337 a 0,735 para Xgwm213 com uma média de 0,444. Os valores do conteúdo de informação polimórfica (PIC) variaram de 0,13 a 0,70 e a distância genética entre as cultivares de 0,15 a 0,77. A análise de agrupamento mostrou que as variedades estudadas foram agrupadas de acordo com sua população de origem, sugerindo um efeito de proveniência em sua ordenação. De fato, as variedades mais similares foram aquelas introduzidas no programa de criação CIMMYT-ICARDA, que podem ter pais comuns em seu pedigree. Seleções de variedades locais foram mais similares entre si e diferentes do material CIMMYT-ICARDA, mostrando uma adaptação agroecológica.
Descritores: Variação Genética
Triticum
Repetições de Microssatélites
Responsável: BR396.1 - Biblioteca Central



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