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Id: lil-546961
Autor: Ohashi, Selma Toyoko; Yared, Jorge Alberto Gazel; Farias Neto, João Tomé de.
Título: Variabilidade entre procedências de paricá Schizolobium parahyba var amazonicum (Huber ex Ducke) Barneby plantadas no município de Colares - Pará / Variability among Schizolobium parahyba var. amazonicum (Huber ex Ducke) Barneby provenances planted in the municipality of Colares - PA
Fonte: Acta amaz;40(1):81-88, mar. 2010. tab.
Idioma: pt.
Resumo: O estudo envolveu quatro procedências de paricá (Schizolobium parahyba var. amazonicum) plantadas no município de Colares-PA, seguindo um delineamento experimental em blocos ao acaso com cinco repetições. As características estudadas foram: sobrevivência, altura da planta, diâmetro a 1,30m do solo (DAP), altura e diâmetro da copa, percentagem de plantas atacadas e tipo de casca. A avaliação foi efetuada aos três anos de idade. Foram encontradas diferenças entre procedências para a sobrevivência e crescimento em altura da planta e DAP, não tendo sido encontradas diferenças para as características de altura da copa, diâmetro da copa, percentagem de plantas atacadas e tipo de casca. A procedência de maior sobrevivência foi Belterra que diferiu das demais ao nível de 5 por cento de significância. Para o crescimento em Altura da planta e DAP, as procedências Belterra, Ji-Paraná e Alta Floresta foram estatisticamente iguais entre si, diferindo de Brasiléia que apresentou o menor desenvolvimento. As procedência Belterra, Alta Floresta e Ji-Paraná podem ser recomendadas para o uso em programas de reflorestamento e sistemas agroflorestais para esta região. O coeficiente de correlação de Spearman indicou alta associação entre as variáveis de produção e a latitude, indicando que as procedências de latitudes mais baixas tendem a ter um maior desenvolvimento, entretanto, devido este estudo ter envolvido somente uma pequena amostra dentro da ampla área de distribuição da espécie, é aconselhável ampliar o trabalho de prospecção e coleta para melhor explorar a variabilidade no programa de melhoramento genético com a espécie.

The study involved four three-year-old provenances of Schizolobium parahyba var. amazonicum planted in the municipality of Colares-Pará, following an experimental design of randomized blocks with five replications. The studied characteristics were: survival, plant height, diameter at 1.30 m from the ground (DAP), height and diameter of the tree crown, percentage of attacked plants and type of bark. Differences among origins for the survival and growth in height of plant and DAP had been found, however, no differences were found for crown height characteristics, crown diameter, percentage plants of attacked plants and bark type. The provenance with the highest survival was Belterra. For plant growth in height and DAP, the provenances Belterra, Ji-Paraná and Alta Floresta were statistically similar, differing from Brasiléia that presented the lowest development. The provenances Belterra, Alta Floresta and Ji-Paraná can be recommended for reforestation programs and agroforestry systems for this region. The Spearman correlation coefficient indicated a strong association among the production variables and the latitude, indicating that the provenances from lower latitudes tend to have a higher development. However, due to this study had involved only a small sample inside of the ample area of distribution of the species, it is advisable to extend the prospection and collecting activities for better explore the variability in the program of genetic improvement of the species.
Descritores: Variação Genética
Conservação dos Recursos Naturais
Melhoramento Genético
Responsável: BR6.1 - BCS - Biblioteca de Ciências da Saúde


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Id: lil-790793
Autor: Guio, Heinner; Levano, Kelly S; Sánchez, Cesar; Tarazona, David.
Título: Rol de la farmacogenómica en el régimen de tratamiento de tuberculosis / The role of pharmacogenomics in the tuberculosis treatment regime
Fonte: Rev. peru. med. exp. salud publica;32(4):794-800, oct.-dic. 2015. tab.
Idioma: es.
Conferência: Apresentado em: Simposio: Ciencias Básicas y su Contribución a la Salud, Lima, 09 dic. 2015.
Resumo: La tuberculosis es un problema de salud Pública a nivel mundial con un tercio de la población infectada por el bacilo Mycobacterium tuberculosis. El tratamiento de primera línea incluye a las drogas isoniazida (INH) y rifampicina (RIF) metabolizadas en el hígado. La metabolización de drogas está directamente relacionada con la variación genética de NAT2 y CYP2E1 (asociados a metabolismo de INH) y AADAC (asociados a metabolismo de RIF), y los efectos pueden producir que un individuo sea metabolizador rápido, intermedio o lento. Los polimorfismos en genes de personas con tratamiento estándar de tuberculosis pueden ocasionar efectos en el metabolismo de drogas con consecuencias de hepatoxicidad e, incluso, posible drogorresistencia. Algunos países han empezado ensayos clínicos enfocados en la personalización del tratamiento a tuberculosis para reducir las consecuencias en pacientes en tratamiento. En países como el Perú, donde se registran altos índices de tuberculosis y, por consiguiente, más población en tratamiento, la farmacogenómica de individuos se convierte en una herramienta crucial para un óptimo tratamiento. La presente revisión destaca la importancia de tener estudios en farmacogenómica e identificar los polimorfismos asociados al metabolismo de las drogas antituberculosas en nuestra población peruana...

Tuberculosis is a health problem worldwide with one-third of the population infected with the Mycobacterium tuberculosis bacilli. The first-line of treatment for tuberculosis includes the drugs Isoniazid (INH) and Rifampicin (RIF) metabolized in the liver. Drug metabolism is directly related to the genetic variation of NAT2 and CYP2E1 (associated with INH metabolism) and AADAC (associated with RIF metabolism), and the effects produced in an individual may be a fast, intermediate or slow metobolizer. Polymorphisms in genes of people in standard tuberculosis treatment can cause effects on drug metabolism with consequences of hepatotoxicity and even drug resistance. Countries have began clinical trials focusedon personalization of tuberculosis treatment to reduce the consequences for patients in treatment. In countries like Peru, where high rates of tuberculosis are recorded and therefore more people in treatment, the pharmacogenomic of individuals becomes a crucial tool for an optimum tuberculosis treatment. This review highlights the importance of having pharmacogenomic studies and having the identification of polymorphisms associated to the metabolism of the anti-tuberculosis drugs in our Peruvian population...
Descritores: Farmacogenética
Mycobacterium tuberculosis
Tuberculose/terapia
Variação Genética
Limites: Humanos
Tipo de Publ: Conferência Clínica
Responsável: PE14.1 - Biblioteca de la Sede Central


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Id: lil-549857
Autor: Yábar V., Carlos; Salvatierra F., Javier; Quijano G., Eberth.
Título: Variabilidad del gen de la envoltura del VIH-1 en tres grupos humanos con diferentes conductas sexuales de riesgo para adquirir ITS-VIH / Envelope genetic variability of HIV-1 infecting human groups with differents risk sexual behaviour to adquire HIV-STD
Fonte: Rev. peru. med. exp. salud publica;24(3):202-210, jul.-sept. 2007. tab, graf.
Idioma: es.
Resumo: Objetivo: Determinar la variabilidad genética del gen de la envoltura porción C2-V3-C3 (env) del VIH-1 infectando grupos humanos con diferente conducta sexual de riesgo para adquirir ITS-VIH. Materiales y métodos: Se seleccionaron 50 sujetos infectados con VIH-1 de los cuales 19 fueron hombres trabajadores sexuales (HTS), 8 mujeres trabajadoras sexuales (MTS) y 23 sujetos heterosexuales (SH). Se realizó la extracción de ADN genómico y la amplificación del gen env por PCR. Se identificó el subtipo genético por ensayo de movilidad de heterodúplex (HMA) y se confirmaron los resultados por análisis filogenético. Asimismo, se realizó el análisis de recombinación intragenética, diversidad y distancia genética en las tres poblaciones. Resultados: Se amplificó el gen env en 49 muestras (98 per cent) y se logró secuenciar el fragmento en 40 de ellas. Se observó que el 97,5 per cent de las muestras de VIH fueron subtipo B mientras que una muestra no pudo ser clasificada filogenéticamente. Asimismo, se encontraron pequeños tramos de recombinación en el gen env de VIH en MTS (33 per cent), HTS (43 per cent) y SH (45 per cent). El mayor índice de diversidad de nucleótidos (Pi) de env se encontró entre las muestras de VIH provenientes de SH y HTS (0,12 y 0,13 respectivamente). Conclusiones: Se encontró una mayor variabilidad genética del gen env de VIH-1 en las poblaciones de HTS y SH, sin embargo, el subtipo genético y la frecuencia de recombinación de este fragmento genético fue similar en los tres grupos estudiados.

Objectives: To determine the genetic variability of C2-V3-C3 envelope genetic portion (env) of HIV-1 from human groups showing different sexual behavior to acquire STD/HIV. Material and methods: Fifty HIV-infected subjects were selected, which nineteen of them were male sex workers (MSW), eight female sex workers (FSW), and twenty three heterosexual subjects (HS). DNA genomic was extracted and the gen env was amplified by PCR. Genetic subtype as identified by heteroduplex mobility assay (HMA) and confirmed by phylogeny. Likewise, intragenic recombination, diversity and genetic distance were analyzed for the three populations. Results: Forty nine (98 per cent) samples were successfully amplified by PCR but only forty were sequenced. HMA and phylogeny analysis revealed that 97.5 per cent of HIV-1 samples were subtype B, but only one sample remain unclassifiable. Likewise, short recombinant regions in gene env were found from FSW (33 per cent), MSW (43 per cent) and HS (45 per cent). Finally, HIV species infecting MSW and HS showed the highest diversity nucleotide between them (Pi) (0,12 and 0,13 respectively). Conclusion: This study revealed that env gene was highly variable in MSW and HS populations, however genetic subtype and recombination frequency were similar for the three groups.
Descritores: HIV-1
Comportamento Sexual
Grupos de Risco
Variação Genética
-Estudos Retrospectivos
Limites: Humanos
Masculino
Adulto
Feminino
Pessoa de Meia-Idade
Tipo de Publ: Estudo Comparativo
Responsável: PE14.1 - Biblioteca de la Sede Central


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Id: lil-498605
Autor: Leiva G., Nélida; Cáceres Rey, Omar Alberto.
Título: Variabilidad genética de Aedes Aegypti en algunas áreas del Perú usando single stranded comformational polymorphism (SSCP) / Genetic variability of Aedes aegypti in some Peruvian areas using Single Stranded Conformational Polymosphism (SSCP)
Fonte: Rev. peru. med. exp. salud publica;21(3):157-166, jul.-sept. 2004. ilus.
Idioma: es.
Resumo: Aedes aegypti es el vector responsable de la transmisión del virus del dengue, su distribución geográfica se haampliado rápidamente debido principalmente a la intervención de los seres humanos. Objetivo: Analizar la variabilidad genética de este mosquito mediante la comparación del Segundo Espaciador Transcrito Interno (ITS 2) perteneciente al ADN ribosomal (rADN). Materiales y Métodos: Se analizaron muestras de ocho localidades (Jaén, Tingo María, Iquitos, Lambayeque, el distrito de El Rimac, Sullana y Zarumilla) y uno de la provincia de Huaquillas (Ecuador). El análisis de la variabilidad se determinó usando la técnica conocida como SSCP (Single Stranded Conformation Polymorphism). Resultados: El estudio muestra que existe variabilidad genética entre las poblaciones analizadas, principalmente entre las muestras localizadas en la costa del Perú (Zarumilla, El Rímac, Sullana) y Huaquillas y las muestras del nororiente (Tingo María, Iquitos, Jaén y Lambayeque) Conclusión: Se determinaron dos variantes genéticas entre las poblaciones de Aedes aegypti: Costeña y Nororiental, que probablemente provienen de dos ancestros diferentes y cuyo ancestro común sufrió de aislamiento por distancia. Se observó que no existe relación entre las distancias genéticas y las distancias geográficas indicando que la migración de estas poblaciones es el resultado de la intervención de los seres humanos que diseminan al vector y no por la migración activa del mosquito. Se plantea el papel de la Cordillera de los Andes en la migración y separación de las poblaciones de Aedes.

Aedes aegypti is the responsible vector for transmission of dengue fever virus, and its geographical distribution has been widely broadened, mainly because of human intervention. Objectives: To analyze the mosquito genetic variability comparing the Second Internal Trascribed Spacer (ITS-2) from the ribosomal DNA (rDNA). Materials and Methods: Samples from seven Peruvian sites (Jaen, Tingo Maria, Iquitos, Lambayeque, Rimac district in Lima, Sullana, and Zarumilla) and one site from Ecuador (Huaquillas Province) were assessed. Variability analysis was determined using the SSCP (Single-Stranded Conformational Polymorphism) technique. Results: The study shows that there are genetic variability between the analyzed populations, mainly between the samples from the Peruvian northern and central coast (Zarumilla, Sullana, and Rímac) as well as in the Ecuador sample (Huaquillas) and the samples from the northeastern region in Peru (Tingo Maria, Iquitos, Jaen, and Lambayeque). Conclusions: Two genetic variants were determined for Aedes aegypti populations: Coastal and northeastern, which probably come from different lineages, and whose common ancestor became isolated because of the distance. It was observed that there is no relationship between genetic distances and geographical distances, indicating that the migration of the mosquito populations is a consequence of human intervention disseminating the vector and not because of active mosquito migration. We propose that there is a role for the Andes Mountains with respect to Aedes populations migration and separation.
Descritores: Variação Genética
Aedes/genética
Polimorfismo Conformacional de Fita Simples
Responsável: PE14.1 - Biblioteca de la Sede Central


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Id: lil-773066
Autor: Luchs, Adriana.
Título: Potencial zoonótico dos rotavírus: diversidade genética e transmissãointerespecífica / Zoonotic potential of rotavirus: genetic diversity and interspecies transmission.
Fonte: São Paulo; s.n; 2014. 641 p. tab, graf, mapas.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a São Paulo (Estado) Secretaria da Saúde. Coordenadoria de Controle de Doenças. Programa de Pós-Graduação em Ciências para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: Rotavirus do grupo A (RVA) foi detectado em 19,1% (1181/6196) dos casos, com menor frequência (19,5%) entre as crianças ≤5 anos quando comparado à crianças em idade escolar (6-18 anos) (40,6%). Os genótipos de RVA mostrou distribuição diferente a cada ano: G2P[4] em 2007-2010, G9P[8] em 2011 e G12P[8] em 2012. O pico deincidência das infecções causadas por RVA deslocou de junho-agosto para setembro. A vacinação em massa pode reduzir o número de indivíduos susceptíveis, retardando o tempo de atividade do RVA e alterando seu padrão sazonal em todo o país. A tendência do RVA em infectar crianças mais velhas após a implantação da vacina temsido observada em todo o mundo, provavelmente devido à imunidade coletiva. A emergência de G2P[4] segue uma tendência mundial ditada pelas flutuações oscilatórias dos genótipos de RVA e, provavelmente, não está relacionada à vacinação.Aparentemente, G12 está emergindo na população brasileira, assim como o observado em todo o mundo. Em 2009, cepas incomuns de RVA G8P[6] (IAL- RN376 e IALRN377) foram detectadas em crianças indígenas. A sequência G8 da cepa IAL-RN376 compartilha um clado com cepas bovinas e humanas, exibindo maior identidade de nucleotídeos com as cepas humanas africanas DRC86 (98,9% nt; 99,6% aa) e DRC88 (98,7% nt; 99,3% aa), seguido pela cepa bovina africana NGRBg8 (95,7% nt; 97% aa). As sequências P[6] das cepas IAL-RN376 e IAL-RN377 exibiram maior identidade genômica com a cepa humana R330 (99,4-99,6% nt; 98,4-99,2% aa) detectada na Irlanda e uma relação genética próxima com a cepa RVA de morcego africano KE4852/07 (94,6-94,7% nt; 94,2-95% aa). Estes dados sugerem que um rearranjo entre cepas de RVA de origem bovina e de quirópteros poderia ter ocorrido em hospedeiro(s) animai(s) antes de sua transmissão para os seres humanos. A cepa incomum de RVA G3P[3] (IAL-R2638) foi...

Group A Rotavirus (RVA) was detected in 19.1% (1181/6196); incidence peaked in September. RVA was detected less frequently (19.5%) among children ≤5 years than in older children (6-18 years) (40.6%). RVA Genotype distribution showed a different profile for each year: G2P[4] from 2007 to 2010, G9P[8] in 2011, and G12P[8] in 2012. The peak of RVA infections moved from June-August to September. Widespread vaccination may reduce the number of susceptible individuals, delaying the timing of RVA activity and altering its seasonal pattern across the country. A tendency of RVArelated cases to affect older children after vaccine implementation has been observed worldwide, probably due to herd immunity. G2P[4] emergence most likely follows a global trend dictated by the oscillatory fluctuations of RVA genotypes seemingly unrelated to vaccination. G12 apparently is emerging in Brazilian population as observed worldwide. In 2009, unusual strains of RVA G8P[6] (IAL-RN376 and IALRN377) genotype were detected in Brazilian indians children. IAL-RN376 G8 sequence shares a clade with bovine and human strains, displaying highest nucleotide identity to African human strains DRC86 (98.9% nt; 99.6% aa) and DRC88 (98.7% nt; 99.3% aa), and following by African bovine NGRBg8 strain (95.7% nt; 97% aa). IAL-RN376 and IAL-RN377 P[6] sequences showed highest identity to human R330 strain (99.4-99.6% nt; 98.4-99.2% aa) from Ireland, and closely genetic relationship to African fruit bat RVAstrain KE4852/07 (94.6-94.7% nt; 94.2-95% aa). These data su ggests that a reassortment between bovine and bat RVA strains could have occurred in animalhost(s) preceding the transmission to human. The unusual RVA G3P[3] (IAL-R2638) strain was detected from a 1-year-old child patient in 2011. The VP7 gene of the IALR2638 strain displayed the highest nucleotide...
Descritores: Gastroenterite
Rotavirus
Variação Genética
Monitoramento Epidemiológico
Zoonoses
Responsável: BR91.2 - Centro de Documentação


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Id: lil-773060
Autor: Francisco, Gabriela Rodrigues.
Título: Diversidade genética de Klebsiella pneumoniae produtora de KPC isolada de diversos hospitais do Estado de São Paulo / Genetic diversity of KPC - producing Klebsiella pneumoniae isolated from several hospitals in São Paulo State, Brazil.
Fonte: São Paulo; s.n; 2014. 110 p. ilus, tab, graf.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a São Paulo (Estado) Secretaria da Saúde. Coordenadoria de Controle de Doenças. Programa de Pós-Graduação em Ciências para obtenção do grau de Mestre.
Resumo: KPC (Klebsiella pneumoniae carbapenemase) é uma enzima que confere resistência a todos os beta-lactâmicos incluindo os carbapenêmicos. Surtos de K. pneumoniae produtora de KPC foram primeiramente descritos em Nova York (2004) e se disseminaram, relatos indicam que estas bactérias produtoras de KPC são prevalentes no mundo. Em 2005, foi isolada pela primeira vez no Brasil uma cepa de Klebsiella pneumoniae produtora de KPC, e a partir de 2009 se disseminou para vários hospitais no Estado de São Paulo, assim como para outros Estados. O objetivo deste estudo foi analisar a diversidade genética de cepas de K. pneumoniae produtoras de KPC isoladas de vários hospitais do Estado de São Paulo através das técnicas de MLST e PFGE. Um total de 100 cepas de K. pneumoniae, provenientes de vários hospitais do Estado de São Paulo, encaminhadas ao Instituto Adolfo Lutz e previamente confirmadas em nosso laboratório como K. pneumoniae produtora de KPC foram selecionadas e submetidas às técnicas de PFGE e MLST. Foram detectados 13 perfis de PFGE, sendo o perfil A o mais dominante, encontrado em 61% dos isolados. O MLST apresentou 8 sequence type diferentes sendo o ST437 o mais predominante encontrado em 73% dos isolados, seguido pelo ST11 (11%), ST340 (7%), ST258 (3%), ST442 (2%) e ST101 (1%), também foram descritos 2 novos STs, o ST1044 e ST1046. Os dados de PFGE e MLST mostraram como as cepas se disseminaram tanto entre hospitais como entre cidades, aumentando a disseminação dos mecanismos de resistência presentes nesses isolados, como produção de ESBL, carbapenemase e metilases 16S rRNA. Os ST437, ST11, ST340 e ST258, pertencem ao mesmo complexo clonal denominado CC258 disseminado mundialmente e associado com a produção de KPC e CTX-M. Foi observada a predominância de um tipo de clone pertencendo ao ST437 e ao...

KPC (Klebsiella pneumoniae Carbapenemase) is an enzyme that confers resistance to all beta-lactams, including carbapenems. Klebsiella pneumoniae-producing KPC causing nosocomial outbreaks were first reported in New York (2004) and nowadays this KPC-producing microorganism is disseminated worldwide. KPC-producing K. pneumoniae isolated in 2005 was first described in Brazil and from 2009 has spread through several hospitals in Sao Paulo State, as well as other states. The aim of this study was to evaluate the genetic diversity of KPC-producing K. pneumoniae isolates from several hospitals in Sao Paulo State performing MLST and PFGE to detect clonal spread within and among hospitals. A total of 100 isolates of K. pneumoniae from several hospitals in Sao Paulo State sent to Adolfo Lutz Institute and previously confirmed in our laboratory as KPC producers were selected and subjected to Pulsed Field Gel Eletrophoresis (PFGE) and Multi-Locus Sequence Typing (MLST). Eleven PFGE profiles were detected and the profile A was the prevalent, found in 61% of the strains. MLST showed 8 different sequence types (ST) and the ST437 was predominant in 73% of the isolates, followed by ST11 (11%), ST340 (7%), ST258 (3%), ST442 (2%) E ST101 (1%) and two new STs were described, ST1044 and ST1046. PFGE and MLST data showed how strains are disseminated among hospitals and among cities increasing the dissemination of resistance mechanisms such as ESBL-producing, carbapenemases and 16S rRNA methylases. ST437, ST11, ST340 and ST258 belong to the same clonal complex denominated CC258 that are globally disseminated and associated with the production of KPC and CTX-M. The prevalence of the clone belonging to ST437 and to the PFGE A profile was observed in 59% of the isolates. This may suggest a correlation between PFGE and MLST results, althought it was observed different PFGE profiles in the same ST and different ST in the same PFGE profile...
Descritores: Epidemiologia Molecular
Hospitais
Klebsiella pneumoniae
Variação Genética
beta-Lactamases
-Brasil
Responsável: BR91.2 - Centro de Documentação


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Id: lil-756284
Autor: Nora, Sandra Terezinha Rodrigues.
Título: Diversidade genética de Pseudomonas aeruginosa isoladas do trato respiratório de pacientes com fibrose cística / Genetic diversity of Pseudomonas aeruginosa isolated from the respiractory tract of cystic fibrosis patients.
Fonte: São Paulo; s.n; 2014. [95] p. tab, ilus.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Programa de Pós-Graduação em Ciências da Secretaria de Estado da Saúde de São Paulo para obtenção do grau de Mestre.
Resumo: Fibrose cística é uma doença genética grave, de herança autossômica recessiva e caracterizada por uma alteração nas secreções das glândulas exócrinas de todo o organismo, resultando principalmente em doença pulmonar obstrutiva crônica progressiva. Pacientes portadores de fibrose cística são frequentemente acometidos por infecções pulmonares causadas por microrganismos específicos. Pseudomonas aeruginosa é o microrganismo mais prevalente, e coloniza cerca de 70% dos pacientes adolescentes e adultos. Os danos ao pulmão aumentam quando P. aeruginosa adquire o fenótipo mucóide. Resistência bacteriana também tem aumentado, sendo relatada a emergência da resistência aos carbapenêmicos. Alguns centros de fibrose cística relatam disseminação de P. aeruginosa entre os pacientes e outros centros relatam grande variabilidade entre os isolados e não identificam transmissão entre os pacientes, o que pode indicar a aquisição ambiental ao invés de uma fonte comum. Este estudo buscou avaliar a sensibilidade aos antimicrobianos frente a P. aeruginosa isoladas do trato respiratório de pacientes com fibrose cística atendidos no Ambulatório do Instituto da Criança do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (HC-FMUSP) e analisar a variabilidade genética entre os diversos isolados bacterianos de vários pacientes. Um total de 580 isolados de Pseudomonas aeruginosa foram obtidos de 98 pacientes em três períodos de coleta diferentes, destes, 129 isolados de 11 pacientes foram selecionados e analisados. Os isolados foram submetidos ao teste de disco-difusão frente a 14 antimicrobianos. Os isolados que apresentaram resistência ao imipenem foram submetidos à pesquisa fenotípica de metalo-beta-lactamase e pesquisa genotípica para carbapenemases blaSPM, blaIMP, blaVIM e blaNDM, blaKPC e blaGES. O isolado 420-2 com perfil fenotípico suspeito de produção de ESBL foi submetido à pesquisa genotípica dos genes blaCTX-M, blaGES e blaTEM. Os isolados...

Cystic fibrosis (CF) is a serious genetic disease, an autosomal recessive disorder, characterized by an alteration in the secretion of the exocrine gland of all organism, resulting mainly in obstructive cronic progressive lung disease. CF patients are frequently attacked by lung infections caused by specific microorganisms. Pseudomonas aeruginosa is the most prevalent microorganism, and colonizes approximately 70% of adolecents and adults CF patients. The damage to the lung increases when P. aeruginosa acquires mucoid phenotype. Antimicrobial resistance has also been increased and the emergence of resistance to carbapenems has been related. Some CF centers reported the dissemination of P. aeruginosa among CF patients and other centers demonstrated the large variability among the isolates not detecting transmission among the CF patients, which can indicates an environmental acquisition instead of a common source. The aims of this study were to evaluate the susceptibility to antimicrobial agents of P. aeruginosa isolates recovered from respiractory tract of CF outpatients attending the outpatient clinic of Instituto da Criança (University of São Paulo Medical School) and to analyse the genetic variability among P. aruginosa isolates recovered from diverse CF patients. A total of 580 P. aruginosa isolates were recovered from 98 CF patients during three different periods of collection, 129 of these isolates obtained from 11 CF patients were selected and analysed. P. aeruginosa isolates were submitted to the disk-diffusion method testing 14 antimicrobial agents. P. aeruginosa isolates wich presented resistance to imipenem were submitted to the phenotypical test to detect the production of metalo-beta-lactamases, PCR for carbapenemase were carried-out by using specific primers to detect the blaSPM, blaIMP, blaVIM, blaNDM, blaKPC, blaGES genes. The Isolate 420-2 with phenotypic profile suspected of ESBL-producing was submitted to PCR using specific primers...
Descritores: Eletroforese em Gel de Campo Pulsado
Fibrose Cística
Infecções por Pseudomonas
Pseudomonas aeruginosa
Resistência Microbiana a Medicamentos
Variação Genética
-Pacientes Ambulatoriais
Testes de Sensibilidade Microbiana
Limites: Humanos
Masculino
Feminino
Responsável: BR91.2 - Centro de Documentação


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Id: lil-555561
Autor: Prudente, Ana Lúcia da Costa; Maschio, Gleomar Fabiano; Santos-Costa, Maria Cristina dos; Feitosa, Darlan Tavares.
Título: Serpentes da Bacia petrolífera de Urucu, município de Coari, Amazonas, Brasil / Snakes of the Urucu Petrol Basin, Municipality of Coari, Amazonas, Brasil
Fonte: Acta amaz;40(2):381-386, 2010. mapas, tab.
Idioma: pt.
Projeto: CNPq.
Resumo: Um inventário estruturado de serpentes foi realizado na Base Operacional Geólogo Pedro de Moura (BOGPM), localizada na Bacia Petrolífera de Urucu, Município de Coari, Amazonas, nos anos de 2003, 2004 e 2007. Nas quatro expedições realizadas (51 dias de coleta) foram registradas 47 espécies de serpentes, pertencentes a sete famílias e 33 gêneros. Foram utilizados quatro métodos complementares de amostragem de serpentes: armadilha de interceptação e queda, encontros ocasionais, procura limitada por tempo a pé e procura limitada por tempo de carro. Das 47 espécies coletadas, Liophis reginae (n= 14), Philodryas viridissima (n= 9), Philodryas boulengeri (n= 7) e Oxybelis fulgidus (n= 7) foram as mais abundantes em toda região. O maior número de espécies e espécimes foi registrado pela procura limitada por tempo de carro (52,8 por cento). Estudos anteriores indicam que as localidades ao sul do Rio Amazonas (como região Leste do Pará, Usina Hidrelétrica de Tucuruí, Estado do Pará, e de Samuel, Estado de Rondônia) apresentam maior riqueza quando comparadas às regiões ao norte do Amazonas (como Município de Manaus, Reserva do INPA-WWF e Usina Hidrelétrica de Balbina, Estado do Amazonas). Desta forma, é possível inferir que o levantamento das serpentes da região de Urucu ainda não esteja completo, sendo necessário um maior esforço de coleta para que novos registros sejam adicionados para a área.

A structured snake inventory was carried out at the Base Operacional Geólogo Pedro de Moura (BOGPM), located at the Urucu Petrol Basin, Municipality of Coari, Amazonas, during 2003, 2004 and 2007. Throughout four sampling expeditions (51 collection days), seven species of snakes, belonging to seven families and 33 genera, were recorded. Four complementary sampling methods were used: pitfall traps with drift fence, occasional encounters, time-limited search on foot and time-limited search by car. Of the 47 collected species Liophis reginae (n= 14), Philodryas viridissima (n= 9), Philodryas boulengeri (n= 7) and Oxybelis fulgidus (n= 7) were the most abundant in the region. The highest number of species and specimens was obtained by the time-limited search by car (n=52.8 percent). Previous studies indicate that localities south of the Amazonas river (such as the eastern region of Pará and Tucuruí, state of Para, and Samuel Hydroelectric Plants, state of Rondônia) present a greater richness when compared to those north of the Amazonas river (such as the mucipality of Manaus, INPA-WWF Reserve and Balbina Hydroelectric Plant, state of Amazonas).Thus, it is possible to infer that the snake inventory in Urucu region is not yet complete, requiring more sampling efforts so that new records can be obtained for the area.
Descritores: Variação Genética
Ecossistema Amazônico
Equipamentos e Provisões
Responsável: BR6.1 - BCS - Biblioteca de Ciências da Saúde


  9 / 1101 LILACS  
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Id: lil-557589
Autor: Brito, Virgínia Rossanade Sousa; Sousa, Francisco Stélio de; Gadelha, Francisco Henrique; Souto, Rafaella Queiroga; Rego, Ana Raquel de Figueiredo; França, Inacia Sátiro Xavier de.
Título: Malformações congênitas e fatores de risco materno em Campina Grande — Paraíba / Malformaciones congénitas y factores de riesgo materno en Campina Grande - Paraíba / Congenital malformations and maternal risk factors in Campina Grande — Paraíba
Fonte: Rev. RENE;11(2):27-36, abr.-jun. 2010. tab, graf.
Idioma: pt.
Resumo: Objetivou-se verificar a prevalência de crianças nascidas com malformações congênitas nas maternidades de Campina Grande —PB e os fatores de risco associados. Coletaram-se dados em três maternidades por meio das Declarações de Nascido Vivo — DNVs emitidas no período 2003-2005. A associação entre os tipos de malformações e as variáveis foi testada pelo Qui-Quadrado e as Odds Ratio, foram calculados para cada variável separadamente usando o programa SPSS 15.0. A significância utilizada foi de p< 0,05. Detectaram-se 190 malformações que foram distribuídas nas categorias morfodisplasias, com 90 casos (47,4%), histodisplasias,49 (25,8%), quimiodisplasias, 1 (0,5%), malformações múltiplas, 34 (17,9%) e malformações não especificadas 16 (8,4%) casos. Identificaram-se hidrocefalia, anencefalia, Síndrome de Down, polidactilia, lábio leporino e pés tortos. Conclui-se que não houve associação estatística significativa das variáveis sociais relativas às mães com malformação congênita. O significativo número de DNVs ilegíveis, ou sem especificação da malformação, sinaliza a necessidade de maior rigor no preenchimento.

This study aimed to determine the prevalence of children born with congenital malformations in maternities of Campina Grande - PB and the associated risk factors. Data were collected in three maternities through the certificates of live birth (CLB) issuedduring the period of 2003 and 2005. The association between the types of malformations and the variables was tested by Chi-square and Odds Ratio, by using the program SPSS 15.0. It was used significance p<0,05. 190 malformations were detected whichwere distributed in the following categories: morphological dysplasia with 90 cases (47.4%), histological dysplasia 49 (25.8%), chemical dysplasia 1(0.5%), multiple malformations 34 (17.9%) and not specified malformations 16 (8.4%) cases. Other cases were also identified: hydrocephaly, anencephaly, Down syndrome, polydactyly, cleft lip and crooked feet. The conclusion was thatthere was no statistically significant association between social variables related to the mothers and congenital malformation. The significant number of illegible BC, or without specification of malformation, shows the need for more accuracy in form filling.

En el siguiente artículo se realiza un estudio para verificar el predominio de niños nacidos con malformaciones congénitas en las maternidades de Campina Grande–PB y los factores de riesgo asociados. Los datos recolectados se refieren a tres centrosmaternos a través de las Declaraciones de Nacido Vivo — DNV emitidos en el período del 2003 al 2005. La asociaciónentre los tipos de malformaciones y las variables fue avalorada por el Chi-cuadrado y las Odds Ratio, fueron calculadas para cada variable por separado usando el programa SPSS 15.0. La consideración usada fue de p < 0,05. Se detectaron 190 malformacionesque fueron distribuidas en las categorías: morfo- displasias, con 90 casos (47,4%); hito-displasias, 49 (25,8%), quimio-displasias, 1 (0,5%), malformaciones múltiples, 34 (17,9%) y malformaciones sin especificación 16 (8,4%). Se identificó hidrocefalia, anencefalia, Síndrome de Down, polidactilia, labio leporino y pie zambo. Se concluye que no hubo asociaciónestadística significativa de las variables sociales relativas a las madres con malformación congénita. El alto número de DNV ininteligibles, o sin especificación de la malformación, muestra que es necesario un mayor rigor al llenar los impresos.
Descritores: Anormalidades Congênitas
Mortalidade Infantil
Prevalência
Variação Genética
Monitoramento Epidemiológico
Limites: Humanos
Recém-Nascido
Responsável: BR6.1 - BCS - Biblioteca de Ciências da Saúde


  10 / 1101 LILACS  
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Texto completo SciELO Brasil
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Id: biblio-989290
Autor: Vasques, Gabriela A; Andrade, Nathalia L M; Jorge, Alexander A L.
Título: Genetic causes of isolated short stature
Fonte: Arch. endocrinol. metab. (Online);63(1):70-78, Jan.-Feb. 2019. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: São Paulo Research Foundation (FAPESP); . National Council for Scientific and Technological Development (CNPq); . Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES).
Resumo: ABSTRACT Short stature is a common feature, and frequently remains without a specific diagnosis after conventional clinical and laboratorial evaluation. Longitudinal growth is mainly determined by genetic factors, and hundreds of common variants have been associated to height variability among healthy individuals. Although isolated short stature may be caused by the combination of variants, with a deleterious impact on the growth of individuals with polygenic inheritance, recent studies have pointed out some monogenic defects as the cause of the growth disorder observed in nonsyndromic children. The majority of these defects are in genes related to the growth plate cartilage and in the growth hormone (GH) - insulin-like growth factor 1 (IGF-1) axis. Affected patients usually present the mildest spectrum of some forms of skeletal dysplasia, or subtle abnormalities of laboratory tests, suggesting hormonal resistance or insensibility. The lack of specific characteristics, however, does not allow formulation of a definitive diagnosis without the use of broad genetic studies. Thus, molecular genetic studies including panels of genes or exome analysis will become essential in investigating and identifying the causes of isolated short stature in children, with a crucial impact on treatment and follow-up.
Descritores: Variação Genética/genética
Estatura/genética
Fator de Crescimento Insulin-Like I/genética
Hormônio do Crescimento Humano/genética
Transtornos do Crescimento/genética
Limites: Humanos
Tipo de Publ: Revisão
Responsável: BR1.1 - BIREME



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