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Id: biblio-894894
Autor: Eslabão, Marcus Redü; Kremer, Frederico Schmitt; Ramos, Rommel Thiago Juca; Silva, Artur Luiz da Costa da; Azevedo, Vasco Ariston de Carvalho; Pinto, Luciano da Silva; Silva, Éverton Fagonde da; Dellagostin, Odir Antônio.
Título: Genome of Leptospira borgpetersenii strain 4E, a highly virulent isolate obtained from Mus musculus in southern Brazil
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;113(2):137-141, Feb. 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: A previous study by our group reported the isolation and characterisation of Leptospira borgpetersenii serogroup Ballum strain 4E. This strain is of particular interest because it is highly virulent in the hamster model. In this study, we performed whole-genome shotgun genome sequencing of the strain using the SOLiD sequencing platform. By assembling and analysing the new genome, we were able to identify novel features that have been previously overlooked in genome annotations of other strains belonging to the same species.
Descritores: Leptospira/classificação
Leptospira/genética
Leptospira/patogenicidade
-Virulência
Limites: Animais
Cobaias
Camundongos
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: biblio-894891
Autor: Jorge, Sérgio; Kremer, Frederico Schmitt; Oliveira, Natasha Rodrigues de; Navarro, Gabrielle de Oliveira Sanches Valerio; Guimarães, Amanda Munari; Sanchez, Christian Domingues; Woloski, Rafael Danelon dos Santos; Ridieri, Karine Forster; Campos, Vinícius Farias; Pinto, Luciano da Silva; Dellagostin, Odir Antônio.
Título: Whole-genome sequencing of Leptospira interrogans from southern Brazil: genetic features of a highly virulent strain
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;113(2):80-86, Feb. 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: BACKGROUND Leptospirosis is the most widespread zoonotic disease. It is caused by infection with pathogenic Leptospira species, of which over 300 serovars have been described. The accurate identification of the causative Leptospira spp. is required to ascertain the pathogenic status of the local isolates. OBJECTIVES This study aimed to obtain the complete genome sequence of a virulent Leptospira interrogans strain isolated from southern Brazil and to describe its genetic features. METHODS The whole genome was sequenced by next-generation sequencing (Ion Torrent). The genome was assembled, scaffolded, annotated, and manually reviewed. Mutations were identified based on a variant calling analysis using the genome of L. interrogans strain Fiocruz L1-130 as a reference. FINDINGS The entire genome had an average GC content of 35%. The variant calling analysis identified 119 single nucleotide polymorphisms (SNPs), from which 30 led to a missense mutation. The structural analyses identified potential evidence of genomic inversions, translocations, and deletions in both the chromosomes. MAIN CONCLUSIONS The genome properties provide comprehensive information about the local isolates of Leptospira spp., and thereby, could facilitate the identification of new targets for the development of diagnostic kits and vaccines.
Descritores: Filogenia
Microbiologia da Água
Leptospira interrogans/isolamento & purificação
Leptospira interrogans/genética
-Virulência
Dados de Sequência Molecular
Genoma Bacteriano
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: biblio-966254
Autor: Beloti, Igor Forigo; Juliatti, Breno Cezar Marinho; Juliatti, Fernando Cezar.
Título: Evaluation of the gelatin technique for the preservation of phytopathogenic fungi / Avaliação da técnica da gelatina para preservação de fungos fitopatogênicos
Fonte: Biosci. j. (Online);33(4):923-932, july/aug. 2017. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: The preservation methods for fungi have great importance in ex situ collections, representing important biological heritage, useful for mycologists and plant pathologists in several scientific works. However, there is a lack of studies for a suiTable and efficient preservation method for the different groups of fungi. Although, the most appropriate is the one that maintain, even after long periods, the original characteristics of culture: viability, sporulation and pathogenicity, excluding mutations and undesirable contamination. The choice will depend of the laboratory infrastructure, microorganism, objectives, preferences and knowledge of the researcher. We conducted this study inside the Laboratory of Mycology and Plant Protection (LAMIP) in UFU (Universidade Federal de Uberlândia), localized in Uberlândia (MG), Brazil. The objective was to evaluate the gelatin preservation method (17 cultures), never used before for phytopathogenic fungi. Other classical methods were concomitantly evaluated, such as sterile soil (68 cultures), resistant structures (Sclerotinia sclerotiorum) in 4°C (10 strains) and mineral oil (31 cultures). We examined the time for maintaining the viability, sporulation and colonization in host tissues preserved in different dates. The gelatin method remained viability in 10 cultures; this method is suiTable for preservation of the genera and species: Colletotrichum spp., Septoria spp., Fusarium spp., F. moniliforme var. subglutinans, Macrophomina spp., Phomopsis spp. and Verticillium spp. The viability remained in 38 strains of sterile soil, three of mineral oil, and one strain of sclerotia reached a maximum preservation time in 4°C of four years.

Os métodos de preservação de fungos têm grande importância em coleções ex situ, representando importante patrimônio biológico, útil para micologistas e fitopatologista como suporte para vários trabalhos científicos. Não existe um método de preservação adequado e eficiente para os diferentes grupos de fungos, entretanto, o mais apropriado é o que mantém, mesmo após longos períodos, as características originais da cultura: viabilidade, esporulação e patogenicidade, excluindo mutações e contaminação indesejável. A escolha dependerá da infra-estrutura laboratorial, microorganismo, objetivos, preferências e conhecimentos do pesquisador. Este trabalho foi realizado no Laboratório de Micologia e Proteção Vegetal (LAMIP) da UFU (Universidade Federal de Uberlândia), localizado em Uberlândia (MG), Brasil. O objetivo foi avaliar o método de preservação da gelatina (17 culturas), nunca testado antes para fungos fitopatogêncios. Concomitantemente foram avaliados métodos clássicos, como solo estéril (68 culturas), escleródios (Sclerotinia sclerotiorum) em 4 ° C (10 isolados) e óleo mineral (31 culturas). Avaliou-se a manutenção na viabilidade, esporulação e patogenicidade dos isolados. O método da gelatina manteve a viabilidade em 10 culturas, sendo adequado para a preservação dos gêneros e espécies: Colletotrichum spp., Septoria spp., Fusarium spp., F. moniliforme var. subglutinans, Macrophomina spp., Phomopsis spp. e Verticillium spp. A viabilidade foi mantida em 38 isolados em solo estéril, três isolados em óleo mineral e um apenas um isolado de escleródio atingiu um tempo máximo de preservação de quatro anos.
Descritores: Preservação Biológica
Ascomicetos
Virulência
Fungos
Responsável: BR396.1 - Biblioteca Central


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Id: biblio-1002799
Autor: Beleza, Antonio Jackson F; Maciel, William C; Carreira, Arianne S; Bezerra, Windleyanne G. A; Carmo, Cecilia C; Havt, Alexandre; Gaio, Fernanda C; Teixeira, Régis S. C.
Título: Detection of Enterobacteriaceae, antimicrobial susceptibility, and virulence genes of Escherichia coli in canaries (Serinus canaria) in northeastern Brazil / Detecção de enterobactérias, sensibilidade antimicrobiana e genes de virulência de Escherichia coli em canários belgas (Serinus canaria) da região Nordeste do Brasil
Fonte: Pesqui. vet. bras = Braz. j. vet. res;39(3):201-208, Mar. 2019. tab.
Idioma: en.
Resumo: This study aimed to verify the presence of members from the Enterobacteriaceae family and determine antimicrobial susceptibility profiles of the isolates in canaries bred in northeastern Brazil; in addition, the presence of diarrheagenic Escherichia coli (DEC) and avian pathogenic Escherichia coli (APEC) was also verified in these birds. Samples were collected during an exhibition organized by the Brazilian Ornithological Federation in July 2015 in Fortaleza, Brazil. A total of 88 fecal samples were collected and submitted to pre-enrichment step using buffered peptone water, followed by enrichment with the following broths: brain-heart infusion, Rappaport-Vassiliadis, and Selenite-Cystine. Subsequently, aliquots were streaked on MacConkey, brilliant green and salmonella-shigella agar plates. Colonies were selected according to morphological characteristics and submitted to biochemical identification and antimicrobial susceptibility tests with disk-diffusion technique. E. coli strains were evaluated for the presence of eight DEC genes and five APEC genes through conventional polymerase chain reaction (PCR) screening. The most frequent species observed were Pantoea agglomerans (25%), Serratia liquefaciens (12.5%), and Enterobacter aerogenes (9.1%). A single rough strain of Salmonella enterica subsp. enterica was identified in one sample (1.1%). High resistance rates to amoxicillin (78.7%) and ampicillin (75.4%) were identified. Polymyxin B (9.8%), gentamycin (6.6%), and enrofloxacin (6.6%) were the most efficient antibiotics. The total number of multidrug-resistant strains (isolates resistant to more than three antimicrobial classes) was 23 (37.7%). Four E. coli strains were tested for the virulence genes, and two were positive for APEC virulence genes: one strain was positive for iutA and the other for hlyF. In conclusion, canaries in northeastern Brazil participating in exhibitions may present Salmonella spp., Escherichia coli and other enterobacteria in the intestinal microbiota with antimicrobial resistance. These results indicate that, although the E. coli strains recovered from canaries in this study have some virulence genes, they still do not fulfill all the requirements to be considered APEC.(AU)

O objetivo deste trabalho foi verificar a presença de enterobactérias e determinar o perfil de sensibilidade aos antimicrobianos dos isolados oriundos de canários belgas criados em cativeiro do Nordeste do Brasil, adicionalmente verificou-se a presença de Escherichia coli diarreiogênicas (DEC) e E. coli patogênica aviária (APEC) nesses animais. A colheita das amostras ocorreu durante uma exposição de canários belgas organizada pela Federação Ornitológica do Brasil (FOB), em julho de 2015, na cidade de Fortaleza, Ceará, Brasil. Um total de 88 amostras de fezes foram coletadas e submetidas a pré-enriquecimento utilizando água peptonada, caldo de enriquecimento Brain Heart Infusion, Rappaport-Vassiliadis e Selenito-Cistina. Fez-se triagem em placas de ágar MacConkey, Verde Brilhante e ágar Salmonella Shigella. As colônias foram selecionadas e submetidas à identificação bioquímica e susceptibilidade antimicrobiana. Estirpes de Escherichia coli foram avaliadas quanto a presença de 8 genes de virulência de DEC e cinco de APEC por reação em cadeia da polimerase convencional (PCR). As enterobactérias encontradas com maior frequência foram Pantoea agglomerans (25%), Serratia liquefaciens (12,5%) e Enterobacter aerogenes (9,1%). Uma única estirpe de Salmonella enterica subsp. enterica (rugosa) esteve presente em um dos isolados (1,1%). Altos percentuais de resistência foram encontrados para dois antibióticos: amoxicilina (78,7%) e ampicilina (75,4%). Polimixina B (9,8%), gentamicina (6,8%) e enrofloxacina (6,5%) foram os antibióticos com melhor eficiência. O total de estirpes multirresistentes (a mais de três classes de antimicrobianos) foi de 23 (37,7%). Das quatro estirpes de E. coli isoladas, duas foram positivas para os genes de APEC, sendo uma estipe para o gene iss e outra para os genes iutA e hlyF. Portanto, canários belgas criados em cativeiro no Brasil que participam de exposições podem apresentar Salmonella spp., Escherichia coli e outras enterobactérias em sua microbiota intestinal com resistência antimicrobiana. Estes resultados indicam que as estirpes de E. coli isoladas de canário belga no presente estudo apresentam alguns, mas não todos, genes de virulência para serem caracterizadas como E. coli patogênica para aves (APEC).(AU)
Descritores: Canários/microbiologia
Resistência Microbiana a Medicamentos
Salmonella enterica/isolamento & purificação
Pantoea/isolamento & purificação
Serratia liquefaciens/isolamento & purificação
Enterobacteriaceae/isolamento & purificação
Infecções por Enterobacteriaceae/veterinária
Escherichia coli/isolamento & purificação
-Virulência
Enterobacter aerogenes/isolamento & purificação
Limites: Animais
Responsável: BR68.1 - Biblioteca Virginie Buff D'Ápice


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Id: biblio-965903
Autor: Erper, Ismail; Yildirim, Elif.
Título: Characterization and pathogenicity of Rhizoctonia SPP. isolated from vegetable crops grown in greenhouses in Samsun province, Turkey / Caracterização e patogenicidade de Rhizoctonia SPP. isolada a partir de culturas vegetais crescidas em estufas na província de Samsun, Turquia
Fonte: Biosci. j. (Online);33(2):257-267, mar./apr. 2017. tab, ilus.
Idioma: en.
Resumo: A total of one hundred and five isolates of Rhizoctonia belonging to 7 anastomosis groups (AGs) were obtained from the diseased roots and rhizosphere soils of bean, cucumber, eggplant, pepper and tomato plants grown in greenhouses in Samsun province (Black Sea region, Turkey) during the period 2011­2012. The isolates of Rhizoctonia spp. were examined for their cultural characteristics, anastomosis groups and pathogenicity. Of these, 83.8% were multinucleate Rhizoctonia solani (AG-2, AG-4, AG-5 and AG-6) and 16.2% were binucleate Rhizoctonia (AG-A, AG-E and AG-F). Sixty five of the isolates belonged to AG-4 which was the most frequent group (61.9%) in all greenhouses surveyed. Numbers of the isolates belonging to AG-2 (7.6%), AG-5 (6.7%) and AG-6 (7.6%) were 8, 7 and 8, respectively. Seventeen isolates recovered from greenhouses surveyed were identified as binucleate Rhizoctonia AG-A (1.9%), AG-E (6.7%) and AG-F (7.6%). All isolates of Rhizoctonia spp. tested for growth rates grew at temperatures of 10, 15, 20, 25 and 30°C, whereas they were completely inhibited at 5°C. The results of pathogenicity tests showed that the differences in virulence among isolates of Rhizoctonia spp. were statistically significant (P < 0.001). The tests on bean seedlings showed that the highest disease severity was caused by AG-4 isolates. The disease severity index (DSI) of the R. solani AG-4 isolates ranged from 3.2 to 3.8. In addition, the isolates of three AGs belonging to binucleate Rhizoctonia spp. were generally found to be moderately virulent (DSI 2.0­2.4).

Um total de cento e cinco isolados de Rhizoctonia pertencentes a 7 grupos de anastomose (AGs) foram obtidos a partir de raízes doentes e solos rizosféricos de plantas de feijão, pepino, berinjela, pimenta e tomate cultivados em estufas na província de Samsun (região do Mar Negro, Turquia) durante o período 2011-2012. Os isolados de Rhizoctonia spp. foram examinados por suas características culturais, grupos de anastomose e patogenicidade. Destes, 83,8% eram Rhizoctonia solani multinucleadas (AG-2, AG-4, AG-5 and AG-6) e 16,2% era Rhizoctonia binucleadas (AGA, AG-E and AG-F). Sessenta e cinco dos isolados pertenciam ao AG-4, que foi o grupo mais freqüente (61,9%) em todas as estufas pesquisadas. O número de isolados pertencentes a AG-2 (7,6%), AG-5 (6,7%) e AG-6 (7,6%) foi de 8, 7 e 8, respectivamente. Dezessete isolados recuperados de estufas pesquisadas foram identificados como Rhizoctonia binucleada AG-A (1,9%), AG-E (6,7%) e AG-F (7,6%). Todos os isolados de Rhizoctonia spp. testados para taxas de crescimento cresceram a temperaturas de 10, 15, 20, 25 e 30ºC, enquanto que foram completamente inibidos a 5ºC. Os resultados dos testes de patogenicidade mostraram que as diferenças de virulência entre os isolados de Rhizoctonia spp. foram estatisticamente significativas (P <0,001). Os testes em mudas de feijão mostraram que a maior severidade da doença foi causada por isolados AG-4. O índice de gravidade da doença (do inglês, disease severity index - DSI) dos isolados de R. solani AG-4 variou de 3,2 a 3,8. Além disso, os isolados de três AGs pertencentes à Rhizoctonia spp. binucleadas foram geralmente encontrados como moderadamente virulentos (DSI 2,0-2,4).
Descritores: Rhizoctonia
Virulência
Fabaceae
Responsável: BR396.1 - Biblioteca Central


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Timm, Claudio Dias
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Id: biblio-1006986
Autor: Silveira, Débora Rodrigues; Milan, Camile; Rosa, Janaina Viana da; Timm, Cláudio Dias.
Título: Fatores de patogenicidade de Vibrio spp. de importância em doenças transmitidas por alimentos / Vibrio spp. pathogenicity factors of importance in foodborne diseases
Fonte: Arq. Inst. Biol;83:e1252013, 2016.
Idioma: pt.
Resumo: As bactérias do gênero Vibrio habitam ambiente tipicamente marinho e estuarino, sendo comumente isoladas de pescados. As principais espécies de Vibrio reportadas como agentes de infecções em humanos são V. vulnificus , V. parahaemolyticus , V. cholerae e V. mimicus . V. vulnificus é considerado o mais perigoso, podendo causar septicemia e levar à morte. V. parahaemolyticus é um patógeno importante nas regiões costeiras de clima temperado e tropical em todo o mundo e tem sido responsável por casos de gastroenterites associadas ao consumo de peixes, moluscos e crustáceos marinhos. V. cholerae causa surtos, epidemias e pandemias relacionados com ambientes estuarinos. V. mimicus pode causar episódios esporádicos de gastroenterite aguda e infecções de ouvido. A patogenicidade das bactérias está ligada à habilidade do micro-organismo em iniciar uma doença (incluindo entrada, colonização e multiplicação no corpo humano). Para que isso ocorra, os micro-organismos fazem uso de diversos fatores. O objetivo desta revisão foi sintetizar o conhecimento disponível na literatura sobre os fatores de patogenicidade de V. vulnificus , V. parahaemolyticus , V. cholerae e V. mimicus.(AU)

Bacteria of the genus Vibrio typically habitat marine and estuarine environment and are commonly isolated from fish. The main Vibrio species reported as agents of infections in humans are V. vulnificus , V. parahaemolyticus , V. cholerae and V. mimicus . V. vulnificus is considered the most dangerous, may cause sepsis and lead to death. V. parahaemolyticus is an important pathogen in coastal regions of temperate and tropical climates around the world and has been responsible for cases of gastroenteritis associated with consumption of fish, shellfish and marine crustaceans. V. cholerae causes outbreaks, epidemics and pandemics related to estuarine environments. V. mimicus can cause sporadic episodes of acute gastroenteritis and infections. The pathogenicity of the bacteria is linked to the ability of the micro-organism to initiate a disease (including entry, colonization and multiplication in the human body). For this to occur, the micro-organisms make use of several factors. The objective of this review is to summarize the knowledge available in the literature on the factors of pathogenicity of V. vulnificus , V. parahaemolyticus , V. cholerae and V. mimicus.(AU)
Descritores: Bactérias
Vibrio parahaemolyticus/patogenicidade
Virulência
Vibrio vulnificus/patogenicidade
Vibrio mimicus/patogenicidade
Peixes
Responsável: BR1942.1 - NID - Biblioteca - Núcleo de Informação e Documentação


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Id: biblio-895441
Autor: Zambrano, Cristina G; Fonseca, Anelise O. S; Valente, Júlia S. S; Braga, Caroline Q; Sallis, Elisa S. V; Azevedo, Maria Isabel; Weiblen, Carla; Santurio, Janio M; Botton, Sonia A; Pereira, Daniela Isabel B.
Título: Isolamento e caracterização de espécies de Pythium de ambientes aquáticos no Estado do Rio Grande do Sul e avaliação da patogenicidade em modelo experimental / Isolation and characterization of Pythium species from swampy areas in the Rio Grande do Sul, Brazil, and evaluation of pathogenicity in an experimental model
Fonte: Pesqui. vet. bras = Braz. j. vet. res;37(5):459-464, maio 2017. ilus, mapas, tab.
Idioma: pt.
Resumo: Foram coletadas 186 amostras de água de ambientes pantanosos em 13 municípios das regiões Sul, Central e Oeste do Rio Grande do Sul, Brasil, com o objetivo de isolar e caracterizar espécies de Pythium e avaliar a sua patogenicidade empregando coelhos como modelo experimental. Em 11,8% (n=22) das águas coletadas foram isoladas diferentes espécies de Pythium incluindo: P. insidiosum (n=1), P. catenulatum (n=3), P. pachycaule voucher (n=1), P. rhizo-oryzae (n=3), P. torulosum (n=4) e Pythium spp. (n=10). Zoósporos desses micro-organismos foram produzidos in vitro e inoculados por via subcutânea em coelhos, os quais foram avaliados durante 45 dias. Dentre os oomicetos testados, apenas P. insidiosum evidenciou patogenicidade, causando pitiose no modelo experimental, evidenciando que, em nossas condições, apenas esta espécie de Pythium é patógena para mamíferos.(AU)

One hundred and eighty-six water samples from swampy areas were collected in 13 municipalities of South, Central and West regions of Rio Grande do Sul, Brazil, in order to isolate and characterize Pythium species and assess their pathogenicity using rabbits as experimental model. Different Pythium species were isolated from 22 (11.8%) water samples, including P. insidiosum (n=1), P. catenulatum (n=3), P. pachycaule voucher (n=1), P. rhizo-oryzae (n=3), P. torulosum (n=4) e Pythium spp. (n=10). Zoospores of these microorganisms were produced in vitro and inoculated subcutaneously into rabbits, which were assessed over 45 days. Only P. insidiosum showed pathogenicity, causing pythiosis in the experimental model.(AU)
Descritores: Pythium/isolamento & purificação
Virulência
Modelos Animais
Pitiose
-Água Doce/microbiologia
Limites: Animais
Coelhos
Responsável: BR68.1 - Biblioteca Virginie Buff D'Ápice


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Id: biblio-999556
Autor: Nascimento, Cilícia Silverio.
Título: Streptococcus agalactiae - Distribuição sorotípica e relação com fatores de virulência e resistência antimicrobiana / Streptococcus agalactiae - Serotype distriburion and correlation with virulence factors and antibiotic resistance.
Fonte: São Paulo; s.n; 2019. 67 p. tab, graf.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Faculdade de Ciências Farmacêuticas para obtenção do grau de Mestre.
Resumo: Streptococcus agalactiae, ou Estreptococo do Grupo B, é um microrganismo que encontrado na microbiota intestinal, vaginal e/ou geniturinária de 10-30% de mulheres saudáveis. A principal infecção causada por S. agalactiae é a sepse neonatal. O bebê pode adquirir o microrganismo durante o parto ao passar pelo canal vaginal, ou até mesmo durante a gestação, caso haja ascensão de S. agalactiae para o útero. Existem diversos fatores associados à infecção do feto por S. agalactiae quando a mãe é colonizada, tais como fator CAMP, cápsula de polissacarídeos, hialuronidase, ß-citolisina/hemolisina e pili. Não existe consenso ou recomendação técnica sobre o tema no Brasil. Segundo o Caderno de Atenção Básica ao Pré-Natal, não existem estudos que levem à recomendação da antibioticoterapia intraparto. É necessário elucidar as características genotípicas de cepas de S. agalactiae isoladas no Brasil para alinhar as práticas clínicas às características fenotípicas do microrganismo. Desta forma, os objetivos deste projeto são: i) classificar cepas de S. agalactiae isoladas de gestantes e não gestantes quanto ao sorotipo capsular, por PCR Multiplex, ii) avaliar a presença e distribuição de fatores de virulência, por PCR e iii) avaliar o perfil de resistência antimicrobiana, pelo método de disco difusão e teste D. Os achados de virulência e resistência a antimicrobianos foram comparados com os sorotipos, gestação, localização geográfica e sítio de isolamento. Foram analisadas 292 cepas isoladas de gestantes e não gestantes em São Paulo, São José dos Campos e Rio de Janeiro. O sorotipo Ia foi o mais prevalente entre as cepas. Na cidade de São José dos Campos não houve diferença significativa entre a prevalência dos sorotipos Ia e V, sendo que o sorotipo V foi mais abundante do que nas cidades de São Paulo e Rio de Janeiro. O sorotipo II foi mais abundante em mulheres não gestantes do que gestantes. Não foram encontradas cepas resistentes à Penicilina e vancomicina; contudo a resistência a Cefepima, Eritromicina e Clindamicina ficou em torno de 22%. Foram encontradas diferenças entre os sorotipos quanto à resistência, genes de virulência e sítio de isolamento das cepas. Portanto essas diferenças podem se refletir no perfil epidemiológico da infecção por S. agalactiae quanto à localização geográfica também quanto à gestação. A incidência de sepse causada por S. agalactiae diminuiu muito nas últimas décadas, contudo o monitoramento constante é necessário para alinhar as práticas clínicas às características fenotípicas do microrganismo

Streptococcus agalactiae, or Group B Streptococcus, is a microorganism found in intestinal, vaginal and/or genitourinary microbiota from about 10-30% of all healthy women. The main infection caused by S. agalactiae is neonatal sepsis. The baby can contract the infection during labor when passing through the vaginal canal, or even during pregnancy, if S. agalactiae ascends from the vaginal canal to the uterus. There are several factors associated to the infection of the fetus by S. agalactiae when the mother is colonized, such as the CAMP factor, polysaccharide capsule, hyaluronidase, ß-cytolysin/hemolysin and pili. There is no consensus or technical recommendation regarding this theme in Brazil. According to the Brazilian guidelines to prenatal care, there is no research that justifies the implementation of intrapartum antibiotic therapy. There is a need to clarify genotype characteristics of S. agalactiae strains isolated in Brazil in order to align clinical practices to phenotypical characteristics of this microorganism. This way, the goals of this project are: i) to classify S. agalactiae strains isolated from pregnant and nonpregnant women according to their capsular serotype, using PCR Multiplex, ii) to evaluate the presence and distribution of virulence factors, using PCR and iii) to evaluate their antibiotic resistance profile, using disk-diffusion and D-zone tests. The findings regarding virulence and resistance were compared to serotypes, pregnancy, geographic localization and the site where the sample was isolated. A total of 292 strains from pregnant and nonpregnant women from the cities of São Paulo, São José dos Campos and Rio de Janeiro were analyzed. Serotype Ia was the most prevalent among the strains. In São José dos Campos there was no significate difference in the prevalence of serotypes Ia and V. Serotype V was the most abundant in São Paulo and Rio de Janeiro. Serotype II was most prevalent in nonpregnant women when compared to pregnant women. No resistance to Penicillin nor Vancomycin was found. However, resistance to Cefepime, Erythromycin or Clindamycin was found in around 22% of strains. There were differences among serotypes regarding resistance, virulence genes and site where the strain was isolated. Therefore these differences can reflect into the epidemiologic profile of S. agalactiae infection in regards to geographic localization and pregnancy. The incidence of sepsis caused by S. agalactiae has decrease in the last few decades, however constant monitoring is necessary in order to align clinical practice to the microorganisms phenotypical characteristics
Descritores: Streptococcus agalactiae/classificação
Virulência/imunologia
Gestantes
-Estudo Comparativo
Sepse/classificação
Testes de Sensibilidade a Antimicrobianos por Disco-Difusão/métodos
Reação em Cadeia da Polimerase Multiplex/métodos
Sorogrupo
Localizações Geográficas/etnologia
Responsável: BR40.1 - DBD - Divisão de Biblioteca e Documentacão do Conjunto das Químicas
BR40.1; T616.0756, N244s. 30100022595-F


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Andalo, Vanessa
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Id: biblio-996741
Autor: Andaló, Vanessa; Rossati, Kellin Patrícia; Carvalho, Fábio Janoni; Mieko, Jéssica; Faria, Lucas Silva de; Assis, Gleice Aparecida de; Barbosa, Leonardo Rodrigues.
Título: Entomopathogenic nematodes for the control of Gryllus sp. (Orthoptera: Gryllidae) under laboratory and field conditions / Nematoides entomopatogênicos no controle de Gryllus sp. (Orthoptera: Gryllidae) em condições de laboratório e campo
Fonte: Arq. Inst. Biol;85:e0442017, 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Entomopathogenic nematodes are effective in controlling soil insects and they are used in agricultural systems. The virulence of entomopathogenic nematodes on crickets (Gryllus L.) (Orthoptera: Gryllidae) was evaluated under different conditions in order to select populations for application in the field. Virulence tests with Heterorhabditis amazonensis RSC05, H. amazonensis MC01, Steinernema carpocapsae All (Weiser) and H. amazonensis GL were performed. Evaluations were then made of the concentrations of infective juveniles (100, 200, 400 and 600 infective juveniles per insect); feeding preference with or without choice; and field tests using traps to evaluate insect sampling. All isolates were found to cause mortality in Gryllus sp., and H. amazonensis MC01 and S. carpocapsae All were selected; an increase in concentration resulted in increased insect mortality. Regarding the feeding preference tests, after 16 h there was no feeding in any of the treatments. In treatments with a chance of choice, it was verified that the crickets fed, independently of the presence of the nematodes. In the field tests, 19 live crickets were found in the traps, and, after application of entomopathogenic nematodes in aqueous suspension, 2 live crickets were found. Results suggested that H. amazonensis MC01 was promising in the control of Gryllus sp. under the tested conditions.(AU)

Os nematoides entomopatogênicos (NEPs) são eficazes contra insetos de solo e têm sido usados em sistemas agrícolas. A ação de NEPs sobre grilos (Gryllus L.) (Orthoptera: Gryllidae) foi avaliada em condições de laboratório e campo, a fim de selecionar populações para aplicação em área de cultivo. Foram realizados testes de virulência com Heterorhabditis amazonensis RSC05, H. amazonensis MC01, Steinernema carpocapsae All (Weiser) e H. amazonensis GL, assim como verificadas a adequação da concentração de juvenis infectantes (100, 200, 400 e 600 juvenis infectantes por inseto) e a preferência alimentar sem chance de escolha e com chance de escolha, além do teste de campo utilizando armadilhas para amostragem dos insetos. Verificou-se que todos os isolados causaram mortalidade em Gryllus sp. selecionando-se H. amazonensis MC01 e S. carpocapsae All e que o aumento na concentração de juvenis infectantes resultou em mortalidade crescente dos insetos. Com relação aos testes de preferência alimentar, observou-se que, após 16 horas, não houve alimentação em nenhum dos tratamentos. Nos tratamentos com chance de escolha, constatou-se que houve alimentação dos grilos, independentemente da presença ou não de nematoides. Nos testes de campo, antes da aplicação de juvenis infectantes, foram encontrados 19 grilos vivos nas armadilhas, e após a aplicação dos NEPs em suspensão aquosa foram encontrados 2 grilos vivos. Dessa forma, concluiu-se que H. amazonensis MC01 foi promissor no controle de Gryllus sp. nas condições testadas.(AU)
Descritores: Virulência
Gryllidae
Controle Biológico de Vetores/métodos
Nematoides
-Jardinagem
Insetos
Responsável: BR1942.1 - NID - Biblioteca - Núcleo de Informação e Documentação


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Id: biblio-947935
Autor: Oliveira, Amanda Cabral Corrêa; Souza, Paulo Estevão de; Pozza, Edson Ampélio; Figueira, Antônia dos Reis; Avelar, Gabriel Dornelas; Gomes, Eliane Aparecida; Monteiro, Fernando Pereira.
Título: Caracterização morfológica, genética e patogenicidade de isolados de Rhizoctonia solani provenientes de algodoeiros no Brasil / Morphological, genetic characterization and pathogenicity of Rhizoctonia solani isolates from cotton in Brazil
Fonte: Biosci. j. (Online);30(5 Supplement 2):512-524, 2014.
Idioma: pt.
Resumo: A espécie Rhizoctonia solani é um patógeno importante na cultura do algodão associada a doenças conhecidas como tombamento e mela. A variabilidade entre os isolados são extremamente importantes, porque existem diferenças entre os grupos de anastomose, tomadas como aqueles isolados capazes de trocar informações genéticas entre si. A caracterização morfológica, quando confirmada pela a caracterização genética fornece informações concretas sobre a distribuição do isolados quando agem como um agente patogênico. O objetivo foi identificar e caracterizar os grupos de anastomose no Brasil e confirmá-los pela caracterização genética. Foram consideradas 51 isolados de Rhizoctonia solani com o objetivo de caracterizar os grupos de anastomose e determinar a patogenicidade. A caracterização morfológica foi realizada observando-se o número de núcleos, morfologia da colônia e identificação de grupos de anastomose (AG). Na caracterização genética foram sequenciados e analisados os fragmentos genômicos contendo as regiões 5.8 S, ITS1 e ITS2, comparando-se os isolados listados no GenBank. A patogenicidade foi avaliada utilizando a escala de infecção com graus que variam de 1 a 4. Considerando-se o AG foram identificados 36 de 51 isolados como AG-4 e dois isolados como AG-7, 13 isolados não tiveram classificação. Em análises moleculares foram confirmados os 36 isolados identificados pela caracterização morfológica e mais 10 isolados como AG-4. Todos os isolados AG-7 foram confirmados e encontrado mais um nas análises moleculares. Para a patogenicidade verificou-se que cinco isolados não diferem do controle. A virulência intermediária e alta virulência foram observadas em 16 e 24 isolados, respectivamente, com médias 2,52-3,3 e 3,4-3,9.

The Rhizoctonia solani is an important pathogen in cotton crop associated with damping-off disease. The variability among isolates are extremely important, because differences exist between anastomosis groups, taken as those isolates capable of exchanging genetic information with each other. Morphological characterization, when confirmed by genetic characterization provides concrete information about the isolates distribution when it acts like a pathogen. Our study was to identify and characterize the anastomosis groups in Brazil and confirm them by genetic characterization. We considered 51 Rhizoctonia solani isolates aiming to characterize the anastomose group and determine their pathogenicity. The morphological characterization was done observing the number of cores, colony morphology and identification of anastomosis groups (AG). In genetic characterization were sequenced and analyzed the genomic fragments containing the 5.8 S, ITS1 and ITS2 regions and compared them to Rhizoctonia isolates listed in the GenBank. The pathogenicity was evaluated for the disease severity, using the scale of infection with grades ranging from 1 to 4. Considering the AG we identified 36 of 51 isolates as AG-4 and two isolates as AG-7 and 13 isolates were listed as unrated. In molecular analyses were confirmed those 36 isolates and were identified more 10 isolates as AG-4. All the AG- 7 isolates were confirmed and we found one more considering the molecular analyses. For the pathogenicity was found that five strains did not differ from the control. Intermediate virulence and high virulence were observed in 16 and 24 isolates, respectively with averages from 2.52 to 3.3 and from 3.4 to 3.9.
Descritores: Rhizoctonia
Virulência
Gossypium
Bases de Dados de Ácidos Nucleicos
Biologia Molecular
Responsável: BR396.1 - Biblioteca Central



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