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Id: biblio-974305
Autor: Leite, Jakson; Passos, Samuel Ribeiro; Simões-Araújo, Jean Luiz; Rumjanek, Norma Gouvêa; Xavier, Gustavo Ribeiro; Zilli, Jerri Édson.
Título: Genomic identification and characterization of the elite strains Bradyrhizobium yuanmingense BR 3267 and Bradyrhizobium pachyrhizi BR 3262 recommended for cowpea inoculation in Brazil
Fonte: Braz. j. microbiol;49(4):703-713, Oct.-Dec. 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: ABSTRACT The leguminous inoculation with nodule-inducing bacteria that perform biological nitrogen fixation is a good example of an "eco-friendly agricultural practice". Bradyrhizobium strains BR 3267 and BR 3262 are recommended for cowpea (Vigna unguiculata) inoculation in Brazil and showed remarkable responses; nevertheless neither strain was characterized at species level, which is our goal in the present work using a polyphasic approach. The strains presented the typical phenotype of Bradyrhizobium with a slow growth and a white colony on yeast extract-mannitol medium. Strain BR 3267 was more versatile in its use of carbon sources compared to BR 3262. The fatty acid composition of BR 3267 was similar to the type strain of Bradyrhizobium yuanmingense; while BR 3262 was similar to Bradyrhizobium elkanii and Bradyrhizobium pachyrhizi. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA and three housekeeping genes placed both strains within the genus Bradyrhizobium: strain BR 3267 was closest to B. yuanmingense and BR 3262 to B. pachyrhizi. Genome average nucleotide identity and DNA-DNA reassociation confirmed the genomic identification of B. yuanmingense BR 3267 and B. pachyrhizi BR 3262. The nodC and nifH gene analyses showed that strains BR 3267 and BR 3262 hold divergent symbiotic genes. In summary, the results indicate that cowpea can establish effective symbiosis with divergent bradyrhizobia isolated from Brazilian soils.
Descritores: Bradyrhizobium/isolamento & purificação
Bradyrhizobium/genética
Inoculantes Agrícolas/isolamento & purificação
Inoculantes Agrícolas/genética
Vigna/microbiologia
-Filogenia
Simbiose
Brasil
DNA Bacteriano/genética
RNA Ribossômico 16S/genética
Genoma Bacteriano
Evolução Molecular
Bradyrhizobium/classificação
Bradyrhizobium/fisiologia
Genômica
Nódulos Radiculares de Plantas/microbiologia
Inoculantes Agrícolas/classificação
Inoculantes Agrícolas/fisiologia
Vigna/fisiologia
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Id: lil-788969
Autor: Cunty, Amandine; Cesbron, Sophie; Briand, Martial; Carrère, Sébastien; Poliakoff, Françoise; Jacques, Marie-Agnès; Manceau, Charles.
Título: Draft genome sequences of five Pseudomonas syringae pv. actinidifoliorum strains isolated in France
Fonte: Braz. j. microbiol;47(3):529-530, July-Sept. 2016. tab.
Idioma: en.
Resumo: ABSTRACT Pseudomonas syringae pv. actinidifoliorum causes necrotic spots on the leaves of Actinidia deliciosa and Actinidia chinensis. P. syringae pv. actinidifoliorum has been detected in New Zealand, Australia, France and Spain. Four lineages were previously identified within the P. syringae pv. actinidifoliorum species group. Here, we report the draft genome sequences of five strains of P. syringae pv. actinidifoliorum representative of lineages 1, 2 and 4, isolated in France. The whole genomes of strains isolated in New Zealand, representative of P. syringae pv. actinidifoliorum lineages 1 and 3, were previously sequenced. The availability of supplementary P. syringae pv. actinidifoliorum genome sequences will be useful for developing molecular tools for pathogen detection and for performing comparative genomic analyses to study the relationship between P. syringae pv. actinidifoliorum and other kiwifruit pathogens, such as P. syringae pv. actinidiae.
Descritores: Genoma Viral
Análise de Sequência de DNA
Pseudomonas syringae/classificação
Pseudomonas syringae/genética
-Doenças das Plantas/microbiologia
Genômica/métodos
Pseudomonas syringae/isolamento & purificação
Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala
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Id: lil-788968
Autor: Chand, Karam; Biswas, Sanchay Kumar; Sharma, Gaurav; Saxena, Arpit; Tewari, Neha; Mahajan, Sonalika; Pandey, Awadh Bihari.
Título: Full genome sequencing of the bluetongue virus-1 isolate MKD20/08/Ind from goat in India
Fonte: Braz. j. microbiol;47(3):527-528, July-Sept. 2016.
Idioma: en.
Resumo: ABSTRACT This communication reports full genome sequencing of the bluetongue virus-1 (BTV-1) isolate MKD20/08/Ind from goat in northern India. The total BTV-1 genome size was found to be 19,190 bp. A comparison study between the Indian isolate and other global isolates revealed that it belongs to the 'Eastern' BTV topotype. The full genome sequence of BTV-1 will provide vital information on its geographical origin and it will also be proved useful for comparing the Indian isolate with global isolates from other host species.
Descritores: Cabras/virologia
Genoma Viral
Análise de Sequência de DNA
Vírus Bluetongue/genética
-Filogenia
Vírus Bluetongue/isolamento & purificação
Vírus Bluetongue/classificação
Genômica
Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala
Sorogrupo
Índia
Limites: Animais
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Id: biblio-839362
Autor: Park, Gun-Seok; Hong, Sung-Jun; Park, Seulki; Jin, Hyewon; Lee, Sang-Jae; Shin, Jae-Ho; Lee, Han-Seung.
Título: Draft genome sequence of alcohol-tolerant bacteria Pediococcus acidilactici strain K3
Fonte: Braz. j. microbiol;48(1):1-2, Jan.-Mar. 2017.
Idioma: en.
Projeto: Ministry of Education, Science and Technology.
Resumo: Abstract Pediococcus acidilactici strain K3 is an alcohol-tolerant lactic acid bacterium isolated from nuruk, which is a traditional Korean fermentation starter for makgeolli brewing. Draft genome of this strain was approximately 1,991,399 bp (G+C content, 42.1%) with 1525 protein-coding sequences (CDS), of which 44% were assigned to recognized functional genes. This draft genome sequence data of the strain K3 will provide insights into the genetic basis of its alcohol-tolerance.
Descritores: Adaptação Biológica/efeitos dos fármacos
Adaptação Biológica/genética
Genoma Bacteriano
Etanol/farmacologia
Pediococcus acidilactici/efeitos dos fármacos
Pediococcus acidilactici/genética
-Ácido Láctico/biossíntese
Biologia Computacional/métodos
Genômica/métodos
Etanol/metabolismo
Fermentação
Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala
Anotação de Sequência Molecular
Pediococcus acidilactici/isolamento & purificação
Pediococcus acidilactici/metabolismo
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Id: biblio-839346
Autor: Hong, Sung-Jun; Park, Chang Eon; Park, Gun-Seok; Kim, Min-Chul; Jung, Byung Kwon; Shin, Jae-Ho.
Título: Draft genome sequence of sulfur-reducing archaeon Thermococcus thioreducens DSM 14981T
Fonte: Braz. j. microbiol;48(1):3-4, Jan.-Mar. 2017.
Idioma: en.
Projeto: Ministry of Education.
Resumo: Abstract Thermococcus thioreducens DSM 14981T, a sulfur-reducing archaeon, was isolated from the rainbow hydrothermal vent site on the Mid-Atlantic Ridge. Herein, we report the draft genome sequence of T. thioreducens DSM 14981T; we obtained 41 contigs with a genome size of 2,052,483 bp and G + C content of 53.5%. This genome sequence will not only help understand how the archaeon adapts to the deep-sea hydrothermal environment but also aid the development of enzymes that are highly stable under extreme conditions for industrial applications.
Descritores: Enxofre/metabolismo
Thermococcus/genética
Thermococcus/metabolismo
Genoma Arqueal
Genômica
Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala
-Análise de Sequência de DNA
Biologia Computacional/métodos
Genômica/métodos
Anotação de Sequência Molecular
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Id: biblio-839345
Autor: Moon, Ji-Hoi; Kim, Minjung; Lee, Jae-Hyung.
Título: Genome sequence of Prevotella intermedia SUNY aB G8-9K-3, a biofilm forming strain with drug-resistance
Fonte: Braz. j. microbiol;48(1):5-6, Jan.-Mar. 2017.
Idioma: en.
Projeto: Ministry of Health & Welfare, Republic of Korea; . Kyung Hee University.
Resumo: Abstract Prevotella intermedia has long been known to be as the principal etiologic agent of periodontal diseases and associated with various systemic diseases. Previous studies showed that the intra-species difference exists in capacity of biofilm formation, antibiotic resistance, and serological reaction among P. intermedia strains. Here we report the genome sequence of P. intermedia SUNY aB G8-9K-3 (designated ATCC49046) that displays a relatively high antimicrobial resistant and biofilm-forming capacity. Genome sequencing information provides important clues in understanding the genetic bases of phenotypic differences among P. intermedia strains.
Descritores: Genoma Bacteriano
Prevotella intermedia/efeitos dos fármacos
Prevotella intermedia/fisiologia
Biofilmes
Farmacorresistência Bacteriana
Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala
Antibacterianos/farmacologia
-Análise de Sequência de DNA
Biologia Computacional/métodos
Polimorfismo de Nucleotídeo Único
Genômica/métodos
Anotação de Sequência Molecular
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Id: biblio-839337
Autor: Ntushelo, Khayalethu; Mafofo, Joseph.
Título: Draft genome of a South African strain of Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliense
Fonte: Braz. j. microbiol;48(1):11-12, Jan.-Mar. 2017.
Idioma: en.
Resumo: Abstract The draft genome of Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliense (Pcb) which causes blackleg of potato was submitted to the NCBI and released with reference number NZ_LGRF00000000.1. The estimated genome size based on the draft genome assembly is 4,820,279 bp from 33 contigs ranging in length from 444 to 1,660,019 nucleotides. The genome annotation showed 4250 putative genes, 4114 CDS and 43 pseudo-genes. Three complete rRNA gene species were detected: nine 5S, one 16S and one 23S. Other partial rRNA gene fragments were also identified, nine 16S rRNA and three 23S rRNA. A total of 69 tRNA genes and one ncRNA gene were also annotated in this genome.
Descritores: Genoma Bacteriano
Pectobacterium carotovorum/genética
Genômica
-Análise de Sequência de DNA
Biologia Computacional/métodos
Genômica/métodos
Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala
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Id: biblio-839336
Autor: Petkauskaite, Raimonda; Blom, Jochen; Goesmann, Alexander; Kuisiene, Nomeda.
Título: Draft genome sequence of pectic polysaccharide-degrading moderate thermophilic bacterium Geobacillus thermodenitrificans DSM 101594
Fonte: Braz. j. microbiol;48(1):7-8, Jan.-Mar. 2017. tab.
Idioma: en.
Projeto: “TermozymOS’ project of the National Research Programme “Healthy and Safe Food” by the Lithuanian Science Council.
Resumo: Abstract Geobacillus thermodenitrificans DSM 101594 was isolated as a producer of extracellular thermostable pectic polysaccharide degrading enzymes. The completely sequenced genome was 3.6 Mb in length with GC content of 48.86%. A number of genes encoding enzymatic active against the high molecular weight polysaccharides of potential biotechnological importance were identified in the genome.
Descritores: Genoma Bacteriano
Genômica
Geobacillus/genética
Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala
-Pectinas/metabolismo
Biologia Computacional/métodos
Genômica/métodos
Geobacillus/metabolismo
Anotação de Sequência Molecular
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Id: biblio-839335
Autor: Delamuta, Jakeline Renata Marçon; Ribeiro, Renan Augusto; Gomes, Douglas Fabiano; Souza, Renata Carolini; Chueire, Ligia Maria Oliveira; Hungria, Mariangela.
Título: Genome sequence of Bradyrhizobium embrapense strain CNPSo 2833T, isolated from a root nodule of Desmodium heterocarpon
Fonte: Braz. j. microbiol;48(1):9-10, Jan.-Mar. 2017.
Idioma: en.
Projeto: Embrapa; . CNPq.
Resumo: Abstract Bradyrhizobium embrapense CNPSo 2833T is a nitrogen-fixing symbiont of the legume pasture Desmodium. Its draft genome contains 8,267,832 bp and 7876 CDSs. The symbiotic island includes nodulation and nitrogen fixation genes resembling the operon organization of B. japonicum. Several CDSs related to secretion proteins and stress tolerance were also identified.
Descritores: Genoma Bacteriano
Bradyrhizobium/genética
Genômica
Nódulos Radiculares de Plantas/microbiologia
Fabaceae/microbiologia
-Simbiose
Análise de Sequência de DNA
Biologia Computacional/métodos
Bradyrhizobium/isolamento & purificação
Bradyrhizobium/metabolismo
Genômica/métodos
Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala
Anotação de Sequência Molecular
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Id: biblio-886022
Autor: Varsi Rospigliosi, Enrique.
Título: Clasificación del sujeto de derecho frente al avance de la genómica y la procreática / Subjects of rights classification facing genomic and proteomic development / Classificação do sujeito de direito contra o avanço da genômica e da procriativa
Fonte: Acta bioeth;23(2):213-225, jul. 2017. tab, ilus.
Idioma: es.
Resumo: Resumen: El Derecho cataloga la vida humana de acuerdo al estado con el cual se presenta en sociedad con la finalidad de darle una adecuada seguridad. La teoría del sujeto de derecho se sustenta en la conceptualización jurídica de la vida humana. Como teoría, fue creada para reconocer una real y efectiva regulación jurídica a las relaciones que lleve a cabo el hombre en la sociedad, tomando en cuenta que la vida humana tiene numerosas formas de presentarse en sociedad. La vida es una, pero -sea biológica o social- adopta diversos estadios que merecen una regulación acorde con su estatus. Es esta esencia y forma como la vida se presenta en sociedad lo que permite categorizarla jurídicamente y de esto se encarga la teoría del sujeto de derecho. De esta forma se regula la vida humana en su verdadera esencia y dimensión; sin embargo, la biotecnología procreática y genómica vienen alterando su clásica taxonomía, variándolo, al presentar nuevos actores en un mundo de relación.

Abstract: Law categorizes human life according to its situation in society with the goal to provide adequate safety. The theory of the subject of rights is based on the juridical conceptualization of human life. As theory, it was created to recognize a real and effective legal regulation to human relations in society, taking into account that human life has many ways to appear in society. Life is one, but -be biological or social- it adopts diverse stages which deserves regulation according to their status. This essence and way in which life is presented allows its juridical categorization by the subject of rights theory. In this way, human life is regulated in its true essence and dimension; nevertheless, genomic and proteomic biotechnology have being altering their classic taxonomy, changing it when presenting new actors in a world of relations.

Resumo: O Direto cataloga a vida humana de acordo com o estado com a qual se apresenta na sociedade com a finalidade de dá-la um nível adequado de segurança. A teoria do sujeito de direito é baseada no conceito jurídico de vida humana. Como teoria, foi criada para reconhecer uma real e efetiva regulação jurídica das relações realizadas pelo homem na sociedade, tendo em conta que a vida humana tem inúmeras maneiras de se apresentar na sociedade. A vida é uma, embora -seja biológica ou social- adota diferentes fases que merecem uma regulação em conformidade com o seu estatuto. É essa essência e forma como a vida surge na sociedade é o que permite categorizá-la juridicamente e disso se encarga a teoria do sujeito do direito. Assim, regula a vida humana na sua verdadeira essência e dimensão; no entanto, a biotecnología procriativa e genômica vem alterando sua taxonomia clássica, variando-a, introduzindo novos atores em um mundo de relações.
Descritores: Genômica/legislação & jurisprudência
Genômica/ética
Direitos Humanos
-Proteômica/legislação & jurisprudência
Proteômica/ética
Limites: Seres Humanos
Responsável: CL58.1 - Biblioteca



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