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Id: biblio-1142782
Autor: Pinheiro, George do Lago; Cruz, Andrea Fonseca; Domingues, Diego Munduruca; Genta, Pedro Rodrigues; Drager, Luciano F; Strollo, Patrick J; Lorenzi-Filho, Geraldo.
Título: Validation of an overnight wireless high-resolution oximeter plus cloud-based algorithm for the diagnosis of obstructive sleep apnea
Fonte: Clinics;75:e2414, 2020. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: OBJECTIVES: Obstructive sleep apnea (OSA) is a common but largely underdiagnosed condition. This study aimed to test the hypothesis that the oxygen desaturation index (ODI) obtained using a wireless high-resolution oximeter with a built-in accelerometer linked to a smartphone with automated cloud analysis, Overnight Digital Monitoring (ODM), is a reliable method for the diagnosis of OSA. METHODS: Consecutive patients referred to the sleep laboratory with suspected OSA underwent in-laboratory polysomnography (PSG) and simultaneous ODM. The PSG apnea-hypopnea index (AHI) was analyzed using the criteria recommended and accepted by the American Academy of Sleep Medicine (AASM) for the definition of hypopnea: arousal or ≥3% O2 desaturation (PSG-AHI3%) and ≥4% O2 desaturation (PSG-AHI4%), respectively. The results of PSG and ODM were compared by drawing parallels between the PSG-AHI3% and PSG-AHI4% with ODM-ODI3% and ODM-ODI4%, respectively. Bland-Altman plots, intraclass correlation, receiver operating characteristics (ROC) and area under the curve (AUC) analyses were conducted for statistical evaluation. ClinicalTrial.gov: NCT03526133. RESULTS: This study included 304 participants (men: 55%; age: 55±14 years; body mass index: 30.9±5.7 kg/m2; PSG-AHI3%: 35.3±30.1/h, ODM-ODI3%: 30.3±25.9/h). The variability in the AASM scoring bias (PSG-AHI3% vs PSG-AHI4%) was significantly higher than that for PSG-AHI3% vs ODM-ODI3% (3%) and PSG-AHI4% vs ODM-ODI4% (4%) (9.7, 5.0, and 2.9/h, respectively; p<0.001). The limits of agreement (2±SD, derived from the Bland-Altman plot) of AASM scoring variability were also within the same range for (PSG vs ODM) 3% and 4% variability: 18.9, 21.6, and 16.5/h, respectively. The intraclass correlation/AUC for AASM scoring variability and PSG vs ODM 3% or 4% variability were also within the same range (0.944/0.977 and 0.953/0.955 or 0.971/0.964, respectively). CONCLUSION: Our results showed that ODM is a simple and accurate method for the diagnosis of OSA.
Descritores: Apneia Obstrutiva do Sono/diagnóstico
Computação em Nuvem
-Oxigênio
Algoritmos
Polissonografia
Limites: Humanos
Masculino
Adulto
Pessoa de Meia-Idade
Idoso
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: biblio-977967
Autor: Zampieri, Fernando Godinho; Soares, Márcio.
Título: Resposta para: Epimed Monitor ICU Database®: um registro nacional baseado na nuvem, para pacientes adultos internados em unidades de terapia intensiva do Brasil / Reply to: The Epimed Monitor ICU Database®: a cloud-based national registry for adult intensive care unit patients in Brazil
Fonte: Rev. bras. ter. intensiva;30(3):398-398, jul.-set. 2018.
Idioma: pt.
Descritores: Computação em Nuvem
Unidades de Terapia Intensiva
-Brasil
Sistema de Registros
Limites: Humanos
Adulto
Tipo de Publ: Comentário
Carta
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: biblio-959325
Autor: Haniffa, Rashan; Silva, Ambepitjwaduge Pubudu de; Beane, Abigail; Sigera, Ponsuge Chathurani; Athapattu, Priyantha Lakmini; Rathnayake, Shriyananda; Jayasinghe, Kosala Saroj Amarasiri; Keizer, Nicolette F. de; Dondorp, Arjen M.
Título: Para: Epimed Monitor ICU Database®: um registro nacional baseado na nuvem, para pacientes adultos internados em unidades de terapia intensiva do Brasil / To: The Epimed Monitor ICU Database®: a cloud-based national registry for adult intensive care unit patients in Brazil
Fonte: Rev. bras. ter. intensiva;30(2):251-252, abr.-jun. 2018.
Idioma: pt.
Descritores: Computação em Nuvem
Unidades de Terapia Intensiva
-Brasil
Sistema de Registros
Limites: Humanos
Adulto
Tipo de Publ: Comentário
Carta
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Chile
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Id: biblio-893110
Autor: Inzunza, Oscar; Neyem, Andrés; Sanz, María Eliana; Valdivia, Iván; Villarroel, Mauricio; Farfán, Emilio; Matte, Andrés; López-Juri, Patricio.
Título: Anatomicis network: una plataforma de software educativa basada en la nube para mejorar la enseñanza de la anatomía en la educación médica / Anatomicis network: a cloud-based educational software platformto enhance anatomy teaching in medical education
Fonte: Int. j. morphol;35(3):1168-1177, Sept. 2017. ilus.
Idioma: es.
Projeto: FONDEF; . FONDEF.
Resumo: En este artículo, se describe una propuesta novedosa de plataforma de software educativa para mejorar la enseñanza de la anatomía en la educación médica. Con el fin de determinar la utilidad y el impacto de esta plataforma, se desarrollo una experiencia inter institucional entre los años 2016 y 2017, el cual involucró a las Universidades de Antofagasta, Playa Ancha, Austral y Católica de Chile. Los departamentos de anatomía que participaron en esta experiencia utilizaron la plataforma de software educativa para acceder a imágenes anatómicas 2D y 3D, videos y evaluaciones teórico prácticas multimodales en línea, pudiendo realizar con sus estudiantes pruebas de usabilidad. Este proyecto pretende aportar a la enseñanza de la anatomía en los diferentes departamentos de anatomía a lo largo del país.

In this article, we describe a novel proposal of an educational software platform to enhance the anatomy teaching in medical education. In order to determine the usefulness and impact of this platform, between 2016 and 2017, an inter-institutional experience was developed, which included the Universities of Antofagasta, Playa Ancha, Austral and Católica de Chile. The participation of anatomy departments in this experience, used the educational software platform to access 2D and 3D anatomical images and online multimodal practical-theoretical evaluations, being able to perform usability tests with their students. This project aims to improve teaching in the different anatomy departments throughout the country.
Descritores: Instrução por Computador/métodos
Educação Médica/métodos
Computação em Nuvem
Anatomia/educação
-Software
Inquéritos e Questionários
Avaliação Educacional
Limites: Humanos
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Id: biblio-995988
Autor: Cardozo, Lucas Esteves.
Título: Mapeamento de hotspots de transmissão de malária utilizando geolocalização de pacientes / Mapping hotspots of malaria transmission using patients geolocation data.
Fonte: São Paulo; s.n; 2018. 64 p. graf, ilus.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Faculdade de Ciências Farmacêuticas para obtenção do grau de Mestre.
Resumo: A identificação de focos de transmissão pode ser de grande utilidade no controle da malária. Por esse motivo, hospitais em regiões endêmicas buscam saber os locais que foram visitados anteriormente por pacientes. No entanto, tais informações, obtidas através de questionários fornecidos aos pacientes, são geralmente vagas e muitas vezes imprecisas. Isto torna o processo manual, lento e de pouca valia em estudos epidemiológicos de larga escala. Baseando-se no fato de que uma parcela significativa da população possui celulares com GPS, o objetivo deste projeto é melhorar a acurácia, organização e dinâmica do processo de coleta de dados de geolocalização de pacientes infectados. Um sistema (https://sipos.fcf.usp.br) foi desenvolvido para que pacientes que chegam aos hospitais possam, sob consentimento voluntário, fornecer os dados de GPS dos seus celulares. Os dados dos usuários, que são tratados de forma anônima, são automaticamente processados e armazenados de forma segura. Através do sistema SiPoS Explorer, epidemiologistas e especialistas em saúde pública podem explorar e analisar os dados de geolocalização, permitindo, desta forma, que regiões vulneráveis sejam priorizadas durante campanhas de controle

The identification of regions with high rates of infection can be of great use in the control of malaria. For this reason, hospitals in endemic regions seek to know the places previously visited by patients. However, such information, obtained through questionnaires provided to patients, is usually vague, inaccurate and not integrated into databases. This makes the process manual, slow and of little value in large-scale epidemiological studies. Based on the fact that a significant portion of the population has smartphones equipped with GPS, this project aims to improve the accuracy and organization of the process of collecting geolocation data from infected patients. The Sickness Positioning System (https://sipos.fcf.usp.br) was developed so that patients who arrive at hospitals can, with voluntary consent, provide the GPS data collected by their smartphones. User data, which is handled anonymously, is automatically processed and securely stored. Through the SiPoS Explorer system (https://sipos.fcf.usp.br/explorer), epidemiologists and public health experts can explore and analyze geolocation data, thereby allowing vulnerable regions to be prioritized during control campaigns
Descritores: Pacientes
Mapeamento Geográfico
Culicidae/classificação
-Mídias Sociais
Computação em Nuvem/estatística & dados numéricos
Malária/etnologia
Responsável: BR40.1 - DBD - Divisão de Biblioteca e Documentacão do Conjunto das Químicas
BR40.1; T614.532 c268m, c268m. 30100022517-F


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Id: biblio-847160
Autor: Navarro, Fábio Cassarotti Parronchi.
Título: A retrotransposição de mRNAs como fator de variabilidade genética no genoma humano e de outros primatas / The retrotransposition of mRNAs as a factor of genetic variability in the human and other primates genomes.
Fonte: São Paulo; s.n; 2014. 215 p. tab, graf, ilus.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Universidade de São Paulo. Instituto de Química para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: Duplicação genica é uma das principais forças levando a evolução dos genomas eucarioto. O impacto de duplicações gênicas/genômicas vem sendo investigado a muito tempo em humanos e outros primatas. Um segundo mecanismo de duplicação gênica, a retrotransposição baseada em RNA maduros, vem sendo menos estudada devido ao seu potencial menor de gerar cópias funcionais. No entanto, recentemente, publicações descreveram retrocópias funcionais em humanos, roedores e mosca de fruta. Nesta tese, para investigar sobre retrocópias causando variabilidade genética no genoma de primatas, nós desenvolvemos a implementamos os métodos para detectar estas inserções. Utilizando nove genomas e transcriptomas publicamente disponíveis (sete primatas e dois roedores) nós confirmamos um número similar, porém, com origem independente, de retrocópias em primatas e roedores. Nós também encontramos um enriquecimento de retrocópias no genoma de Platyrrhini, possivelmente explicado pela expansão de L1PA7 e L1P3 nestes genomas. Posteriormente, nós analisamos a ortologia de retrocópias no genoma de primatas e encontramos 127 eventos específicos à linhagem humana. Nós também exploramos dados do projeto 1000 Genomes para detectar retrocópias polimórficas (retroCNVs germinativos) e encontramos 17 eventos, presentes no genoma referência humano, mas ausentes em mais de um indivíduo. Similarmente, nós investigamos novas retroduplicações de mRNAs no genoma humano, detectando 21 eventos ausentes do genoma referência. Finalmente, investigamos a existência de retroCNVs somáticos e descrevemos sete possíveis retrocópias somáticas. Apesar de sua possível insignificância, nós encontramos que algumas retrocópias compartilhadas entre todos os primatas, espécie específicas, e polimórficas podem ser expressas per se ou como transcritos quiméricos com genes hospedeiros. Sobretudo, nós encontramos que retrocópias são um fator importante da variabilidade genética inter-espécie, intra-espécie e intra-indivíduo e podem estar influenciando a evolução de mamíferos ao criar reservatórios de duplicações potencialmente funcionais

Gene duplication is a major driving force of evolution in eukaryotic genome. The impact of gene/genomic duplication has long been investigated in human and other primates. A second mechanism of gene duplication, retrotransposition, which is based on mature RNA, has been traditionally less studied due to their lower potential to generate functional copies. Recently, however, publications described functional retrocopies in humans, murines and drosophila. Here, to gain insights of the genetic variability arising from retrocopies on primate genomes, we developed and implemented the methods to detect these insertions. Using nine publicly available reference genomes and transcriptomes (seven primates and two rodents) we described a similar number independently arisen retrocopies in primates and rodents. We also found an enrichment of retrocopies in Platyrhinni genomes, putatively explained by the expansion of L1PA7 and L1P3 in these genomes. Next, we evaluated the orthology of retrocopies in primate genomes and found 127 events specific to human lineage. We also explored 1000 Genomes Project data to detect polymorphic events (germinative retroCNVs) on human populations and found 17 events, present on the reference genome, absent in more than one individual. Conversely, we also investigated new insertions of mRNA retroduplications in the human genome, detecting 21 events absent to the human reference genome. Finally, we evaluated the existence of somatic retroCNVs and described seven putative somatic retrocopies. Despite their putative insignificance, we found that some of these shared, specie-specific and polymorphic events may be expressed per se and as chimeric transcripts within host genes. Taken together, we found that retrocopies are a great factor of genetic variation interspecie, intraspecie e intraindividual and may be affecting mammal evolution by creating reservoirs of potentially functional duplications
Descritores: Primatas/genética
-Computação em Nuvem/estatística & dados numéricos
Biologia Computacional/métodos
Edição de Genes
Terapia Genética/normas
Genoma
Variação Estrutural do Genoma
Polimorfismo Genético/genética
Transcriptoma/genética
Limites: Humanos
Animais
Masculino
Feminino
Gravidez
Recém-Nascido
Lactente
Pré-Escolar
Criança
Adolescente
Adulto
Pessoa de Meia-Idade
Idoso
Idoso de 80 Anos ou mais
Gatos
Bovinos
Embrião de Galinha
Cães
Cobaias
Cricetinae
Camundongos
Coelhos
Ratos
Responsável: BR40.1 - DBD - Divisão de Biblioteca e Documentacão do Conjunto das Químicas
BR40.1; T 574.88, N322r. 30100025420-Q


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Id: biblio-1113
Autor: Silva, Fabricio Alves Barbosa da.
Título: Big Data e Nuvens Computacionais: Aplicações em Saúde Pública e Genômica / Big data and cloud computing: Applications in Public Health and Genomics / Big Data y Cloud Computing: Aplicaciones en Salud Pública y Genómica
Fonte: J. health inform;8(2):73-79, abr.-jun. 2016. graf.
Idioma: pt.
Resumo: Big Data é um termo utilizado para descrever conjuntos de dados cuja captura, armazenamento, distribuição e análise requerem métodos e tecnologias avançadas devido a qualquer combinação de seu tamanho (volume), a frequência de atualização (velocidade) e diversidade (heterogeneidade). Este artigo apresenta uma revisão bibliográfica sobre aplicações de Big Data em saúde pública e em genômica. São descritos diversos exemplos, e alguns desafios tecnológicos relacionados com a análise destes dados são identificados. Também é discutida a utilização de nuvens computacionais no processamento de Big Data. No nosso ponto de vista, a nuvem computacional é uma plataforma adequada para o processamento de grandes volumes de dados, e pode ser usada também em diversas aplicações relacionadas à saúde pública e genômica. Diversos trabalhos disponíveis na literatura e citados neste artigo corroboram esta visão.

Big Data is a term used to describe data sets whose capture, storage, distribution and analysis require advanced methods and technologies due to any combination of its size (volume), the update frequency (speed) and diversity (heterogeneity). This paper presents a literature review of Big Data applications in public health and genomics. Several examples are described, and some technological challenges related to the analysis of these data are identified. The use of computational clouds for Big Data processing is also discussed in this paper. In our view, the cloud is an appropriate platform for the processing of large volumes of data, and it can be used in several applications related to public health and genomics. Several studies available in the literature and cited in this paper corroborate this view.

Big Data es un término usado para describir conjuntos de datos cuya captura, almacenamiento, distribución y análisis requieren métodos y tecnologías avanzadas, debido a una combinación de su tamaño (volumen), la frecuencia de actualización (velocidad) y la diversidad (heterogeneidad). Este artículo presenta una revisión de la literatura de aplicaciones Big Data en la salud pública y la genómica. Se describen varios ejemplos, y algunos de los desafíos tecnológicos relacionados con el análisis de estos datos se identifica. También discute es el uso de nubes computacionales en el procesamiento de grandes volúmenes de datos. En nuestra opinión, la plataforma de computación en la nube es adecuado para el procesamiento de grandes volúmenes de datos, y también puede ser utilizado en diversas aplicaciones relacionadas con la salud pública y la genómica. Varios estudios disponibles en la literatura y citados en este artículo corroboran esta opinión.
Descritores: Computação em Nuvem
Base de Dados
Genômica
Saúde Pública
Tipo de Publ: Revisão
Responsável: BR1888.9 - SBIS - Sociedade Brasileira de Informática em Saúde



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