Base de dados : LILACS
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Id: biblio-1008749
Autor: González L, Carmen D; Castillo D, Carla P; Angiolillo R, Giovanny; Fernández S, David J; Rojas A, Ascanio.
Título: Herramientas bioinformáticas para el análisis de secuencias en el Instituto Nacional de Higiene "Rafael Rangel" / Bioinformatic tools for sequence analysis at Instituto Nacional de Higiene "Rafael Rangel"
Fonte: Rev. Inst. Nac. Hig;47(1-2):76-79, 2016.
Idioma: es.
Descritores: Ácidos Nucleicos
Análise de Sequência/métodos
Biologia Computacional
Bases de Dados de Ácidos Nucleicos
-Biotecnologia
Saúde Pública
Biologia Molecular
Limites: Seres Humanos
Masculino
Feminino
Responsável: VE9.1 - Biblioteca


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Id: biblio-947935
Autor: Oliveira, Amanda Cabral Corrêa; Souza, Paulo Estevão de; Pozza, Edson Ampélio; Figueira, Antônia dos Reis; Avelar, Gabriel Dornelas; Gomes, Eliane Aparecida; Monteiro, Fernando Pereira.
Título: Caracterização morfológica, genética e patogenicidade de isolados de Rhizoctonia solani provenientes de algodoeiros no Brasil / Morphological, genetic characterization and pathogenicity of Rhizoctonia solani isolates from cotton in Brazil
Fonte: Biosci. j. (Online);30(5 Supplement 2):512-524, 2014.
Idioma: pt.
Resumo: A espécie Rhizoctonia solani é um patógeno importante na cultura do algodão associada a doenças conhecidas como tombamento e mela. A variabilidade entre os isolados são extremamente importantes, porque existem diferenças entre os grupos de anastomose, tomadas como aqueles isolados capazes de trocar informações genéticas entre si. A caracterização morfológica, quando confirmada pela a caracterização genética fornece informações concretas sobre a distribuição do isolados quando agem como um agente patogênico. O objetivo foi identificar e caracterizar os grupos de anastomose no Brasil e confirmá-los pela caracterização genética. Foram consideradas 51 isolados de Rhizoctonia solani com o objetivo de caracterizar os grupos de anastomose e determinar a patogenicidade. A caracterização morfológica foi realizada observando-se o número de núcleos, morfologia da colônia e identificação de grupos de anastomose (AG). Na caracterização genética foram sequenciados e analisados os fragmentos genômicos contendo as regiões 5.8 S, ITS1 e ITS2, comparando-se os isolados listados no GenBank. A patogenicidade foi avaliada utilizando a escala de infecção com graus que variam de 1 a 4. Considerando-se o AG foram identificados 36 de 51 isolados como AG-4 e dois isolados como AG-7, 13 isolados não tiveram classificação. Em análises moleculares foram confirmados os 36 isolados identificados pela caracterização morfológica e mais 10 isolados como AG-4. Todos os isolados AG-7 foram confirmados e encontrado mais um nas análises moleculares. Para a patogenicidade verificou-se que cinco isolados não diferem do controle. A virulência intermediária e alta virulência foram observadas em 16 e 24 isolados, respectivamente, com médias 2,52-3,3 e 3,4-3,9.

The Rhizoctonia solani is an important pathogen in cotton crop associated with damping-off disease. The variability among isolates are extremely important, because differences exist between anastomosis groups, taken as those isolates capable of exchanging genetic information with each other. Morphological characterization, when confirmed by genetic characterization provides concrete information about the isolates distribution when it acts like a pathogen. Our study was to identify and characterize the anastomosis groups in Brazil and confirm them by genetic characterization. We considered 51 Rhizoctonia solani isolates aiming to characterize the anastomose group and determine their pathogenicity. The morphological characterization was done observing the number of cores, colony morphology and identification of anastomosis groups (AG). In genetic characterization were sequenced and analyzed the genomic fragments containing the 5.8 S, ITS1 and ITS2 regions and compared them to Rhizoctonia isolates listed in the GenBank. The pathogenicity was evaluated for the disease severity, using the scale of infection with grades ranging from 1 to 4. Considering the AG we identified 36 of 51 isolates as AG-4 and two isolates as AG-7 and 13 isolates were listed as unrated. In molecular analyses were confirmed those 36 isolates and were identified more 10 isolates as AG-4. All the AG- 7 isolates were confirmed and we found one more considering the molecular analyses. For the pathogenicity was found that five strains did not differ from the control. Intermediate virulence and high virulence were observed in 16 and 24 isolates, respectively with averages from 2.52 to 3.3 and from 3.4 to 3.9.
Descritores: Rhizoctonia
Virulência
Gossypium
Bases de Dados de Ácidos Nucleicos
Biologia Molecular
Responsável: BR396.1 - Biblioteca Central


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Id: lil-789335
Autor: Pereira, Ana Carla; Souza, Vânia Brito de; Dias-Baptista, Ida Maria Foschiani.
Título: Extração de DNA de biópsias de pele fixadas em formalina tamponada e embebidas em parafina e amplificação por PCR / DNA extraction from formalin-fixed and paraffin-embedded skin biopsies and PCR amplification
Fonte: Hansen. int;33(2):25-30, 2008. ilus.
Idioma: pt.
Resumo: Biópsias de pele oriundas dos serviços de diagnóstico da hanseníase podem ser grande fonte de material para estudos retrospectivos em genética humana e do Mycobacterium leprae. No entanto, os procedimentos de fixação e inclusão em parafina podem dificultar a obtenção de DNA de qualidade para amplificação por PCR. Assim, estas amostras requerem protocolos especiais para a extração do material genético. O objetivo deste trabalho é apresentar um método alternativo para extração de DNA com base na combinação de calor e digestão enzimática. Para tanto, os cortes foram aquecidos a 120º C em solução tampão de pH 9,0, submetidos à digestão enzimática com proteinase K e o DNA foi extraído por meio de solução de fenol:clorofórmio:álcool isoamílico. A amplificação por PCR para as regiões dos genes humanos TNF e LTA foi bem sucedida para 85,4% dos espécimes. Considerando o DNA do M. leprae, obtivemos amplificação em 67,6%, 48,5%, 36,7% e 64,8% para os marcadores TA18, GTA9, TTC e RLEP, respectivamente. Concluímos que este é um método de baixo custo que proporcionou um rendimento satisfatório de DNA de boa qualidade para emprego em PCR a partir de biópsias parafinadas de pele.

Skin biopsies from leprosy diagnostic services can be great sources of material for retrospective studies concerning human and Mycobacterium leprae genetic. However, fixation and paraffin embedding procedures make difficult to obtain good quality DNA to PCR amplification. Thus, paraffin-embedded samples require special protocols to DNA extraction. The aim of this paper is to present an alternative method for DNA extraction based on the combination of heat and enzymatic digestion. The sections were heated at 120ºC at pH 9.0, submitted to enzymatic digestion with proteinase K and the DNA was extracted by using phenol:chlorophorm:isoamilic alcohol. PCR amplification for regions in TNF and LTA human genes was successful for 85.4 % of specimens. Regarding M. lepraeDNA, we obtained amplification in 67.6%, 48.5%, 36.7% and 64.8% for the TA18, GTA9, TTC and RLEP markers, respectively. We conclude that this is an inexpensive method which provided a satisfactory yield of a good quality DNA for PCR from paraffin- embedded skin biopsies.
Descritores: Bases de Dados de Ácidos Nucleicos
Hanseníase/patologia
Epidemiologia Molecular
Pele/patologia
-Biópsia
Hospitais de Dermatologia Sanitária de Patologia Tropical
Reação em Cadeia da Polimerase
Sistema Único de Saúde
Limites: Seres Humanos
Responsável: BR191.1 - Biblioteca e Centro de Documentação Luiza Keffer


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Id: lil-784085
Autor: Karaman, Paola Andrea Paz.
Título: Biobancos: casos de estudio y Lecciones para colombia / Biobanks: case studies and lessons for Colombia
Fonte: Rev. direito sanit;16(3):102-121, nov. 2015- fev.2016.
Idioma: es.
Resumo: En este artículo se describen a partir de dos casos, el biobanco de Islandia y el de Estonia, los elementos característicos de cada biobanco y las condiciones necesarias para su creación. Igualmente se analizan el interés político, médico y económico vinculado a los biobancos en el marco de los derechos individuales y el Estado. Posteriormente se analiza la iniciativa de Proyecto de Ley que pretendía crear el primer banco de ADN financiado por el Estado colombiano, sus carencias y repercusiones en la sociedad colombiana...

This paper describes the characteristic elements of two countries' biobank projects ‒ Iceland and Estonia‒ and the necessary conditions for their creation. Furthermore, it analyses the political, medical and economic interests linked to biobanks in the framework of individuals' rights and of the State. Finally it assesses the bill seeking to create the first National DNA biobank financed by the Colombian State, identifying its weaknesses and its possible reper.(AU)-cussions on the Colombian society...
Descritores: Biotecnologia
Confidencialidade
Bases de Dados de Ácidos Nucleicos
Genética Médica
Genoma
Privacidade
-Antropologia Forense
Marcadores Genéticos
Hereditariedade
Discriminação Social
Limites: Seres Humanos
Masculino
Feminino
Responsável: BR67.1 - CIR - Biblioteca - Centro de Informação e Referência


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Id: lil-750248
Autor: Bezerra, Márcia Mártyres.
Título: Modelagem conceitual do sistema de banco de dados ProteinWorldDB / Conceptual modeling of the database system ProteinWorldDB.
Fonte: Rio de Janeiro; s.n; 2012. xi,134 p. ilus, tab.
Idioma: pt.
Tese: Apresentada a Instituto Oswaldo Cruz para obtenção do grau de Doutor.
Resumo: Esta tese descreve o projeto conceitual do sistema de banco de dados ProteinWorldDB (PWDB). Um ponto importante da proposta do PWDB é permitir a construção de consultas e procedimentos no domínio da genômica comparativa sem a necessidade de comparação de sequências. Além disso, o PCG comparou milhões de sequências de proteína, incluindo o conjunto proteico total de centenas de genomas completos, utilizando programação dinâmica, e não um método heurístico, para os cálculos de similaridade. A estratégia do PCG, assim como a genômica, está fundamentada no conhecimento de que sequências biológicas por si só são pouco informativas; elas precisam ser analisadas a partir de um enfoque comparativo para a inferência de homologia. A comparação de sequências de diferentes organismos introduz uma perspectiva evolutiva ao processo, e o estudo comparativo de genomas completos pode ampliar a escala do conhecimento de um único processo biológico para o de sistemas biológicos complexos em células e organismos. Para responder eficientemente questões dessa natureza, o esquema conceitual apresentado associa bases de dados biológicos de referência aos índices de similaridade já pré-calculados e armazenados pelo PCGUtilizando um formato gráfico de fácil compreensão para representar conceitos e relacionamentos (diagrama ER), o esquema foi proposto para facilitar o planejamento de consultas e procedimentos por pesquisadores da área de genômica (sem conhecimento de linguagens de bancos de dados), assim como guiar o desenvolvimento e a implementação física do PWDB por profissionais da área de computação. Alguns exemplos são apresentados com o objetivo de demonstrar a utilização do esquema conceitual para a especificação de consultas e procedimentos, mesmo antes da existência de um esquema lógico...

This thesis describes the conceptual design of the database system ProteinWorldDB(PWDB). An important point of the PWDB proposal is to allow the construction of queriesand procedures in the field of comparative genomics without the need for sequencecomparison. Moreover, the PCG compared millions of protein sequences, including theentire set of proteins from hundreds of complete genomes using dynamic programming,rather than a heuristic method, for calculating similarityPCG's strategy, like that of genomic studies in general, is grounded in the knowledgethat biological sequences alone are uninformative. They need to be analyzed from acomparative approach to infer homology. The comparison of sequences from differentorganisms introduces an evolutionary perspective to the process and the comparativestudy of complete genomes can expand our knowledge from a single biological processall the way to complex biological systems in cells and organisms. To efficiently answerquestions of this nature, the conceptual schema links selected international referencebiological databases to similarity indexes already precomputed and stored by the PCG.By using an easily understandable graphic format to represent concepts andrelationships (ER diagram), the schema was proposed to help the design of queries andprocedures by genomic researchers (who may not have knowledge of databaselanguages) as well as to guide the development and physical implementation of thesystem by developers. Some examples are presented to demonstrate the use of theconceptual schema for specifying queries and procedures, even before the existence ofa logical schema. The schema can be easily extended. Additional modules can be inserted/removed toinclude other protein sequences comparisons projects that may benefit from theinformation provided by the schema´s central module. Likewise, new databases specificto different areas (-omics, for example) can be cross-referenced to the schema...
Descritores: Biologia Computacional
Bases de Dados de Ácidos Nucleicos
Homologia de Genes
Genômica/classificação
Limites: Seres Humanos
Responsável: BR15.1 - Biblioteca de Ciências Biomédicas


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: lil-716298
Autor: Araujo, Thessika Hialla Almeida; Barreto, Fernanda Khouri; Luiz Carlos Júnior, Alcântara; Miranda, Aline Cristina Andrade Mota.
Título: Inferences about the global scenario of human T-cell lymphotropic virus type 1 infection using data mining of viral sequences
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;109(4):448-451, 03/07/2014. tab, graf.
Idioma: en.
Resumo: Human T-cell lymphotropic virus type 1 (HTLV-1) is mainly associated with two diseases: tropical spastic paraparesis/HTLV-1-associated myelopathy (TSP/HAM) and adult T-cell leukaemia/lymphoma. This retrovirus infects five-10 million individuals throughout the world. Previously, we developed a database that annotates sequence data from GenBank and the present study aimed to describe the clinical, molecular and epidemiological scenarios of HTLV-1 infection through the stored sequences in this database. A total of 2,545 registered complete and partial sequences of HTLV-1 were collected and 1,967 (77.3%) of those sequences represented unique isolates. Among these isolates, 93% contained geographic origin information and only 39% were related to any clinical status. A total of 1,091 sequences contained information about the geographic origin and viral subtype and 93% of these sequences were identified as subtype “a”. Ethnicity data are very scarce. Regarding clinical status data, 29% of the sequences were generated from TSP/HAM and 67.8% from healthy carrier individuals. Although the data mining enabled some inferences about specific aspects of HTLV-1 infection to be made, due to the relative scarcity of data of available sequences, it was not possible to delineate a global scenario of HTLV-1 infection.
Descritores: Infecções por HTLV-I/epidemiologia
Infecções por HTLV-I/virologia
Vírus 1 Linfotrópico T Humano/genética
-Sequência de Bases
Mineração de Dados
Bases de Dados de Ácidos Nucleicos
Geografia Médica
Saúde Global
Epidemiologia Molecular
Interface Usuário-Computador
Limites: Adulto
Feminino
Seres Humanos
Masculino
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: lil-705824
Autor: Usein, Codru?a-Romani?a; Militaru, M?d?lina; Cristea, Violeta; Str?u?, Monica.
Título: Genetic diversity and antimicrobial resistance  in Streptococcus agalactiae strains recovered from female carriers in the Bucharest area
Fonte: Mem. Inst. Oswaldo Cruz;109(2):189-196, abr. 2014. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: MECTS.
Resumo: For the first time, we used multilocus sequence typing (MLST) to understand how Romanian group B streptococcus (GBS) strains fit into the global GBS population structure. Colonising isolates recovered from adult human females were tested for antibiotic resistance, were molecularly serotyped based on the capsular polysaccharide synthesis (cps) gene cluster and further characterised using a set of molecular markers (surface protein genes, pilus-encoded islands and mobile genetic elements inserted in the scpB-lmb intergenic region). Pulsed-field gel electrophoresis was used to complement the MLST clonal distribution pattern of selected strains. Among the 55 strains assigned to six cps types (Ia, Ib, II-V), 18 sequence types (STs) were identified by MLST. Five STs represented new entries to the MLST database. The prevalent STs were ST-1, ST-17, ST-19 and ST-28. Twenty molecular marker profiles were identified. The most common profiles (rib+GBSi1+PI-1, rib+GBSi1+PI-1, PI-2b and alp2/3+PI-1, PI-2a) were associated with the cps III/ST-17 and cps V/ST-1 strains. A cluster of fluoroquinolone-resistant strains was detected among the cps V/ST-19 members; these strains shared alp1 and IS1548 and carried PI-1, PI-2a or both. Our results support the usefulness of implementing an integrated genotyping system at the reference laboratory level to obtain the reliable data required to make comparisons between countries.
Descritores: Antibacterianos/farmacologia
Portador Sadio/microbiologia
DNA Bacteriano/genética
Resistência Microbiana a Medicamentos/genética
Variação Genética
Streptococcus agalactiae/genética
-Bases de Dados de Ácidos Nucleicos
Testes de Sensibilidade a Antimicrobianos por Disco-Difusão
DNA Intergênico/análise
Eletroforese em Gel de Campo Pulsado
Fímbrias Bacterianas/fisiologia
Genes Bacterianos
Sequências Repetitivas Dispersas/fisiologia
Tipagem de Sequências Multilocus
Proteínas de Membrana/genética
Romênia
Streptococcus agalactiae/efeitos dos fármacos
Esfregaço Vaginal
Virulência
Limites: Adulto
Feminino
Seres Humanos
Tipo de Publ: Research Support, Non-U.S. Gov't
Responsável: BR1.1 - BIREME


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Id: lil-696503
Autor: Pereira, Andresa Costa; Silva, Marco Antonio Dias da; Lima, Jackson Cordeiro; Paiva, Paulo Bandiera.
Título: A bioinformática na pesquisa odontológica brasileira / The bioinformatics in the Brazilian oral research / La bioinformática en la investigación odontológica brasileña
Fonte: J. health inform;5(4), out.-dez. 2013. graf.
Idioma: pt.
Resumo: Objetivo: Avaliar o papel da bioinformática na pesquisa odontológica brasileira. Métodos: Foram analisados os resumos das reuniões da Sociedade Brasileira de Pesquisa Odontológica (SBPqO), de 2005 a 2011. As palavras-chave bioinformática, genbank, seqüenciamento/seqüenciada(o), PCR em tempo real, microarranjo e projeto genoma foram pesquisadas em português e inglês. Os dados foram tabulados de acordo com a instituição pesquisadora (publica ou privada e sua localização no país) e com a categoria de apresentação (estudante de graduação ou profissional graduado). Resultado: Verificou-se que o número de resumos com as palavras-chave aumentou de 2005 para 2011; entretanto, a maioria foi realizada por instituições públicas, no sudeste do Brasil e por graduados. Conclusão: A quantidade de pesquisas odontológicas usando bioinformática está crescendo, porém, ainda será necessário que esta tecnologia alcance todas as regiões do país e todos os níveis de estudantes, integrando também os graduandos com as ferramentas de bioinformática.

Objective: To verify the role of bioinformatics in the Brazilian oral research. Methods: The abstracts of Brazilian Oral Research Society (SBPqO) meetings were investigated, from 2005 to 2011. The key-words:bioinformatics, genbank, sequencing/sequence, real time PCR, microarray and genome project were searched in English and Portuguese languages. The data were tabulated according to the research institution(private or public and country location) and to the category of the speaker (graduating student or professional). Results: It could be seen that the number of abstracts with the key-words increased from 2005 to 2011; however, the majority was performed in public institutions, in Brazilian southeast and by graduated speakers. Conclusion: The amount of Brazilian oral researches using bioinformatics is increasing; however, it is necessary that this technology reach all the regions of the country and also all the degrees of students, integrating the graduate learners to bioinformatics tools.

Objetivo: Evaluar el papel de la bioinformática en la investigación odontológica brasileña. Métodos: Analizaron los resúmenes de las reuniones de la Sociedad Brasileña para la Investigación Odontológica (SBPqO), de 2005 a 2011. Los descriptores: bioinformática, GenBank, secuencia / secuenciada (o), PCR en tiempo real, microarray y proyecto genoma fueron buscados en Inglés y Portugués. Los datos fueron tabulados de acuerdo con la institución de investigación (públicos o privados y su ubicación en el país) y la categoría de presentación (estudiante graduado o título profesional). Resultados: Se encontró que el número de resúmenes con palabras clave se incrementó de 2005 a 2011, sin embargo, la mayoría estaba en manos de las instituciones públicas, en el sureste de Brasil y graduados. Conclusión: La cantidad de investigación odontológica utilizando la bioinformática está creciendo, todavía necesitan esta tecnología llegue a todos las regiones del país y todos los niveles de estudiantes, graduados también la integración con las herramientas de la bioinformática.
Descritores: Biologia Computacional
Bases de Dados de Ácidos Nucleicos
Odontologia
Projeto Genoma Humano
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
Pesquisa
-Brasil
Responsável: BR1.2 - Biblioteca Central


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Id: lil-601529
Autor: Zárate Montoya, Ignacio Manuel; Palacios Moreno, Ana María; Henao Mejía, Juanita; Ayala Ramírez, Paola Andrea; Salazar Salazar, Marleny; Acosta Guio, Johanna; Gordillo González, Gisel; López Gutiérrez, Catalina; Cadena Castillo, Paola Andrea.
Título: Descripción de la muestra del banco de ADN de recién nacidos con malformaciones congénitas / Description of the DNA sample bank about congenital malformations
Fonte: Univ. med;50(3):302-310, jul.-dic. 2009. tab.
Idioma: es.
Resumo: Objetivos. Este artículo describe una muestra de recién nacidos con malformaciones congénitas a quienes se les tomó muestra de mucosa oral mediante la técnica de hisopado bucal. Se hizo lo anterior con el fin de generar un banco de ADN, de manera que exista la posibilidad de acceder al material genético para investigaciones moleculares de malformaciones congénitas. Métodos. Siguiendo la metodología del Estudio Colaborativo Latinoamericano de Malformaciones Congénitas (ECLAMC), se examinaron los recién nacidos de dos hospitales de Bogotá, el Hospital Universitario San Ignacio y la Fundación Clínica Emmanuel, durante el periodo comprendido entre el 1º de agosto de 2007 y el 31 de julio de 2008. Para la extracción del ADN, se tomaron muestras de mucosa oral mediante la técnica de hisopado bucal y el ADN se almacenó a -20°C en el Instituto de Genética Humana de la Pontificia Universidad Javeriana. Resultados. Se registraron 6.219 nacimientos, de los cuales, 213 niños nacieron con alguna malformación congénita; de éstos, a 125 se les tomó muestra de hisopado bucal. En la población general, la mayoría de nacimientos registrados fueron de sexo masculino (51,6%). Sin embargo, la muestra presentó una mayor tendencia hacia pacientes femeninos (53,6%Se registraron dos casos de mortinatos en la muestra (1,6%). La mortalidad de los pacientes con malformaciones se aumentó a 7 casos (5,6%) al momento del alta. No se encontró una diferencia importante en la edad materna al momento de la gestación, entre la población general y la muestra (promedio de 26,89 años y 27,06 años, respectivamente). La malformación que se observó con mayor frecuencia fueron las deformidades congénitas del pie (16,8%), seguida de la cardiopatía (6,4% del total de las malformaciones) y la polidactilia (5,6%)...

Objective: To describe a sample of newborns with congenital malformations that were part of a surveillance program. DNA samples were taken from this patient´s oral mucosa using buccal swabs with the purpose of creating a DNA bank for the future molecular investigation of congenital anomalies.Methods: Following the methodology of the Latin American Collaborative Study of CongenitalMalformations (ECLAMC), we evaluated all newborns from August 1, 2007 to July 31, 2008 that were born in two hospitals in Bogotá- Colombia: Hospital Universitario San Ignacio and Fundaci ón Clínica Emmanuel. For the extraction of DNA, samples were taken from the newborn´s oral mucosa using buccal swabs and they werestoraged at a -20°C temperature at the Human Genetic Institute of the Pontificia Universidad Javeriana.Results: From August 1, 2007 to July 31, 2008, 6219 births were registered; 213 of which had a congenital malformation. Samples of DNA were taken from 125 malformed newborns, using buccal swabs. 51% of the infants were males, and 48% were females, but in the sampled babies, females predominated (53,6%). Two cases of stillbirths were registered (1,6%). We found no difference when comparing the general population´s maternal age at the moment of birth with the sample´s maternal age at the moment of birth (average, 26, 89 and 27, 09 years, respectively).The most frequent anomalies observed were: Malformations of the feet (16,8%), cardiopathies (6.4%) and polydactyly (5,6%).Conclusions: Samples taken from oral mucosa using buccal swabs represent an easy and noninvasive method for the extraction of DNA and the creation of a DNA bank that will contribute for the future molecular research of congenital anomalies...
Descritores: Bases de Dados de Ácidos Nucleicos
Genética Médica
-Anormalidades Congênitas
Responsável: CO185.1 - Biblioteca Alfonso Borrero Cabal, S. J.


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Texto completo SciELO Chile
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Id: lil-591924
Autor: Amui, Saulo França; Puga, Renato David; Soares, Andreimar Martins; Giuliatti, Silvana.
Título: Plant-antivenom: database of anti-venom medicinal plants
Fonte: Electron. j. biotechnol;14(1):6-7, Jan. 2011. ilus, tab.
Idioma: en.
Resumo: Plant-antivenom is a computational Websystem about medicinal plants with anti-venom properties. The system consists of a database of these plants, including scientific publications on this subject and amino acid sequences of active principles from venomous animals. The system relates these data allowing their integration through different search applications. For the development of the system, the first surveys were conducted in scientific literature, allowing the creation of a publication database in a library for reading and user interaction. Then, classes of categories were created, allowing the use of tags and the organization of content. This database on medicinal plants has information such as family, species, isolated compounds, activity, inhibited animal venoms, among others. Provision is made for submission of new information by registered users, by the use of wiki tools. Content submitted is released in accordance to permission rules defined by the system. The database on biological venom protein amino acid sequences was structured from the essential information from National Center for Biotechnology Information (NCBI). Plant-antivenom's interface is simple, contributing to a fast and functional access to the system and the integration of different data registered on it. Plant-antivenom system is available on the Internet at http://gbi.fmrp.usp.br/plantantivenom.
Descritores: Antídotos/isolamento & purificação
Antídotos/síntese química
Antídotos/uso terapêutico
Antivenenos/administração & dosagem
Antivenenos/biossíntese
Antivenenos/uso terapêutico
Bases de Dados de Ácidos Nucleicos
Peçonhas/efeitos adversos
Peçonhas/toxicidade
-Internet
Extratos Vegetais
Limites: Animais
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central



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