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Id: biblio-1047771
Autor: Yan, Xia; Qian, Chaoju; Yin, Xiaoyue; Fan, Xingke; Zhao, Xueyong; Gu, Menghe; Wang, Tao; Ma, Xiao-Fei.
Título: A whole-transcriptome approach to evaluate reference genes for quantitative diurnal gene expression studies under natural field conditions in Tamarix ramosissima leaves
Fonte: Electron. j. biotechnol;35:48-56, sept. 2018. tab, graf.
Idioma: en.
Projeto: National Key Research and Development Program of China; . Natural Science Foundation of China; . Gansu Science and Technology Supporting Project.
Resumo: Background: Tamarix ramosissima is a desert forest tree species that is widely distributed in the drought-stricken areas to sustain the fragile ecosystem. Owing to its wide usage in the desert restoration of Asia, it can be used as an ecophysiological model plant. To obtain reliable and accurate results, a set of reference genes should be screened before gene expression. However, up to date, systematical evaluation of reference genes has not been conducted in T. ramosissima. Results: In this study, we used eigenvalues derived from principal component analysis to identify stable expressed genes from 72,035 unigenes from diurnal transcriptomes under natural field conditions. With combined criteria of read counts above 900 and CV of FPKM below 0.3, a total of 7385 unigenes could be qualified as candidate reference genes in T. ramosissima. By using three statistical algorithm packages, geNorm, NormFinder, and BestKeeper, the stabilities of these novel reference genes were further compared with a panel of traditional reference genes. The expression patterns of three aquaporins (AQPs) suggested that at least UBQ (high expression), EIF4A2 (low expression), and GAPDH (moderate expression) could be qualified as ideal reference genes in both RT-PCR and RNA-seq analysis of T. ramosissima. Conclusions: This work will not only facilitate future studies on gene expression and functional analysis of genetic resources of desert plants but also improve our understanding of the molecular regulation of water transport in this plant, which could provide a new clue to further investigate the drought adaptation mechanism of desert plant species under harsh environments.
Descritores: Tamaricaceae/genética
Transcriptoma
-Padrões de Referência
Adaptação Biológica
Expressão Gênica
Ecossistema
Folhas de Planta/genética
Deserto
Recuperação e Remediação Ambiental
Secas
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
RNA-Seq
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Id: biblio-1118416
Autor: Sánchez, Mireyma; Aponte, Carlos.
Título: Las arenas del desierto del Sahara y las afecciones inflamatorias crónicas de las vías respiratorias (asma y rinitis crónica) / Sahara desert sands and chronic inflammatory conditions respiratory tract (Asthma and chronic rhinitis)
Fonte: Rev. Inst. Nac. Hig;50(1-2):85-95, Diciembre 2019. graf, ilus.
Idioma: es.
Descritores: Asma/etiologia
Rinite/etiologia
Tempestade de Areia
Deserto
-Hipersensibilidade Respiratória/etiologia
Hipersensibilidade Respiratória/prevenção & controle
Infecções Respiratórias/etiologia
Infecções Respiratórias/prevenção & controle
Asma/prevenção & controle
Rinite/prevenção & controle
Doença Crônica
África do Norte
Limites: Humanos
Responsável: VE9.1 - Biblioteca


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Id: biblio-1116300
Autor: Contreras, Roberto; van den Brink, Liesbeth; Sepúlveda, Bernardo; Aguayo, Fernanda; Porcile, Vincenzo.
Título: Phylogenetic relationships of plant species from the flowering desert of the Atacama Region / Relaciones filogenéticas de especies de plantas que crecen en el desierto florido de la Región de Atacama
Fonte: Bol. latinoam. Caribe plantas med. aromát;19(3):300-313, mayo 2020. ilus, tab.
Idioma: en.
Projeto: Regional Innovation Fund for Regional Competitiveness; . Regional Government of Atacama; . National Forestry Corporation.
Resumo: Every 3 to 7 year angiosperms species of the flowering desert appear in the Atacama Region of Chile, as a result of the climatic phenomenon "El Niño". Our objective was to evaluate the universality of matK and rbcL barcode markers of these species, and validate their taxon through phylogenetic relationships. Argemone hunnemannii, Oenothera coquimbensis, Malesherbia humilis, Leucocoryne appendiculata, Loasa elongata, Nicotiana solanifolia, Stachys grandidentata, Aristolochia chilensis, Alstroemeria kingii and Adesmia eremophila, almost all classified as endemic to Chile, were collected in Pan de Azúcar and Llanos de Challe National Park (Atacama Region, Chile) at the end of October 2017. The phylogeny of these ten angiosperm species from the flowering desert was analyzed using rbcL and matK markers with the maximum likelihood and Bayesian inference methods. The results showed that 70% of the species can be distinguished with the matK or rbcL locus, however, 100% were distinguished using both loci. The phylogenetic results showed that the species formed clades with high reliability and high support with both the matK and rbcL genes, when comparing our results with sequences obtained from GenBank. The matK and rbcL genes are efficient markers for analyzing phylogenetic relationships and validating the taxonomy of flowering species.

Las especies de angiospermas del Desierto Florido de la Región de Atacama de Chile aparecen cada 3 a 7 años, influenciado por el fenómeno climático "El Niño". Nuestro objetivo fue evaluar la universalidad de los marcadores de código de barra matK y rbcL de estas especies, y validar su taxón por medio de relaciones filogenéticas. Las especies Argemone hunnemannii, Oenothera coquimbensis, Malesherbia humilis, Leucocoryne appendiculata, Loasa elongata, Nicotiana solanifolia, Stachys grandidentata, Aristolochia chilensis, Alstroemeria kingii y Adesmia eremophila son clasificadas la mayoría endémicas de Chile. Estas especies fueron colectadas en el Parque Nacional Pan de Azúcar y Llanos de Challe, Región de Atacama, Chile. La colecta se realizó a fines de octubre de 2017. Con los marcadores rbcL y matK se analizó la filogenia con los métodos máxima verosimilitud e inferencia bayesiana en diez especies de angiosperma del Desierto Florido. Los resultados mostraron que el 70% de las especies pueden ser distinguidas con un locus matK o rbcL, sin embargo, el 100% se distinguió usando ambos locus. Los resultados filogenéticos mostraron que las especies formaron clados con alta fiabilidad y alto soporte tanto con los genes matK y rbcL, al comparar con accesos de secuencias obtenidas de GenBank. Lo genes matK y rbcL son marcadores eficientes para analizar relaciones filogenéticas y validar el taxón de las especies de flor.
Descritores: Filogenia
Plantas/genética
Deserto
Código de Barras de DNA Taxonômico/métodos
-Ribulose-Bifosfato Carboxilase
Chile
Análise de Sequência de DNA
Responsável: CL1.1 - Biblioteca Central


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Texto completo SciELO Brasil
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Id: lil-464608
Autor: Cepeda-Pizarro, Jorge; Vega, Solange; Vásquez, Hernán; Elgueta, Mario; Pizarro-Araya, Jaime.
Título: Demographic study of two population outbreaks of Elasmoderus wagenknechti (Liebermann) (Orthoptera: Tristiridae) in the transitional desert of Chile
Fonte: Neotrop. entomol;36(4):495-502, July-Aug. 2007. ilus, graf, mapas, tab.
Idioma: en.
Resumo: Under certain environmental conditions, several species of grasshoppers inhabiting rangeland areas (e.g., inter-valleys) of the Chilean transitional desert can irrupt demographically. One of them is Elasmoderus wagenknechti (Liebermann), an endemic species. We studied two outbreaks occurred in 1996 and 1999. The objectives of the research were to (i) estimate some demographic parameters associated with the aforementioned events, and (ii) compare between them the population parameters. The parameters we studied were density (ind/m²), sexual proportion, female fertility (i.e., eggs/female), and the relationship eggs/female versus female size. Density (ind/m²) ranged from 0.2 to 0.4 in 1996 and from 0.5 to 0.6 in 1999. ANOVA-tests registered differences in density among study sites and between years. In some of the study sites, females were more abundant than males (e.g., Lomas del Sauce). Females fertility ranged from 27 to 39 eggs per female, with significant differences among sites in 1996 but not in 1999. For females of 30-50 mm body size, a linear relationship was detected between egg number/female and body size. It is concluded that the E. wagenknechti outbreaks are site-specific in the study area and that the demographic parameters examined show a high variability among sites and between events.

Sob certas condições ambientais, diversas espécies de gafanhotos que habitam áreas de campos, como as áreas entre vales do deserto transicional do Chile, podem experimentar surtos populacionais. Uma dessas espécies é Elasmoderus wagenknechti (Liebermann), espécie endêmica. Nós estudamos dois surtos que ocorreram em 1996 e 1999. Os objetivos da pesquisa foram (1) estimar alguns parâmetros demográficos associados aos eventos acima indicados, e (2) comparar os parâmetros entre os eventos. Os parâmetros estudados foram densidade (indivíduos/m²), razão sexual, fertilidade da fêmea (i.e., ovos/fêmea), e a relação entre a fertilidade e o tamanho corporal da fêmea. O intervalo da densidade do evento foi estimado entre 0,2 e 0,4 indivíduos/m² em 1996, e entre 0,5 e 0,6 indivíduos /m² em 1999. Foram encontradas diferenças (análise de variância) na densidade entre os locais para o mesmo evento, e entre os eventos. As fêmeas foram mais numerosas que os machos em alguns locais estudados (e.g., Lomas del Sauce). Foi estimado um intervalo médio de 27-39 ovos/fêmea, existindo diferenças entre os locais no evento de 1996, mas não no evento de 1999. Para fêmeas de longitude corporal de 30-35 mm. foi detectada uma relação linear entre número de ovos/fêmea e tamanho corporal. Em conclusão, a magnitude do evento na área de estudo é específica do local; além do que para os parâmetros demográficos examinados existe uma acentuada variabilidade entre locais e entre os eventos.
Descritores: Gafanhotos/anatomia & histologia
Gafanhotos/crescimento & desenvolvimento
Gafanhotos/parasitologia
Ortópteros/crescimento & desenvolvimento
-Deserto
Responsável: BR1561.1 - Biblioteca Virtual AMMG


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Id: lil-365863
Autor: Piontelli L., Eduardo; Toro, M. A; Giusiano, Gustavo; Vivar M., Valia.
Título: Distribución altitudinal de hongos queratinofilos, epifitos y endófitos en suelos desérticos del norte chileno (II Región, 23°L. S y 68°L. W) / Altitudinal distribution of keratinophilic, epiphytic and endophytic fungi from desertic soils in northern Chile (II Region, 23°L. S y 68°L. W)
Fonte: Bol. micol;17:33-49, dic. 2002. ilus.
Idioma: es.
Resumo: En una zona desértica del norte chileno entre los 2200 y 4500m de altura y en 2 períodos estacionales, se determinó la presencia y composición de las comunidades de microhongos queratinofílicos, epifítos y endófitos mediante el empleo de un anzuelo queratínico y vegetal. Las metodologías empleadas permitieron apreciar ciertos aspectos ecológicos de un grupo de hongos tolerantes al estrés y la persistencia en el tiempo de algunas de sus poblaciones en 3 gradientes altitudinales. En 79 muestras de suelo y 67 de vegetales se obtuvieron 1111 aislamientos, repartidos en 78 géneros y 172 especies y los integrantes de los 18 géneros más frecuentes en ambos sustratos y en todas las altitudes reunieron el 80 porciento del total de presencia fúngica. Los Zygomycetes fueron representados por 4 géneros, los Ascomycetes por 11, los Coelomycetes por 8 y los Hyphomycetes por 70. En este último grupo los principales taxa en orden decreciente fueron: Ulocladium, Penicillium, Aspergillus, Acremonium, Alternaria, Cladosporium, Fusarium, Paecilomyces, Trichoderma, Bipolaris, Rhizopus, Aphanocladium y Verticillium. Los integrantes del género Ulocladium Aspergillus, Penicillium y Alternaria obtuvieron las mayores frecuencias en el primer escalón altitudinal en las 3 metodologías, mientras en el escalón más alto fue Penicillium, Ulocladium, Cladosporium y Acremonium. Ocho especies mantuvieron una alta presencia en la mayoría de los sustratos y altitudes. Ulocladium atrum, U. chartarum, Alternaria alternata, Emericella nidulans, Cladosporium cladosporioides, U. botrytis, Aspergillus fumigatus y A. niger, junto a una proporción mayoritaria de especies esporádicas o de baja frecuencia ("ruderal"). La mayoría de los Onygenales y anamorfos relacionados, se aislaron principalmente en verano entre los 2200 y los 4000m. Los más frecuentes fueron: Auxarthron umbrinum, Chrysosporium tropicum, Malbranchea gypsea y Geomyces pannorum. La presencia más alta del grupo (17,4 porciento) en todos los escalones y la persistencia a través del tiempo correspondió a G. pannorum...
Descritores: Altitude
Deserto
Fungos
Solo
-Chile
Responsável: CL2.1 - Biblioteca de Medicina



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