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[PMID]:26176126
[Au] Autor:Küppers GC; Claps MC
[Ad] Endereço:Instituto de Limnología Dr. Raúl A. Ringuelet CONICET-CCT La Plata, Boulevard 120 y 62, (1900) La Plata, Buenos Aires, Argentina. gkuppers@fcnym.unlp.edu.ar
[Ti] Título:Hypotrichous ciliates (Protozoa: Ciliophora) from a temporary pond in Argentina, with redescription of Apoamphisiella hymenophora (Stokes, 1886) Berger, 1999.
[So] Source:Zootaxa;3626:55-76, 2013.
[Is] ISSN:1175-5326
[Cp] País de publicação:New Zealand
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:Hypotrichous ciliates collected in the plankton and soil samples from a temporary pond in Buenos Aires province, Argentina, were characterized after live observations and protargol impregnation. Apoamphisiella hymenophora (Stokes) Berger is redescribed and the neotype material deposited. Apoamphisiella hymenophora differs from its congeners in having 2 macronuclear nodules, 1 contractile vacuole with anterior and posterior collecting canals, the absence of cortical granules, 2 cirri behind the rightmost frontal cirrus, 1 postoral cirrus, 6 dorsal rows of dikinetids along with scattered dikinetids on the right body margin, and 3-9 caudal cirri arranged in groups at the ends of dorsal rows 1, 2, and 4. Rigidohymena candens, R. quadrinucleata, Histriculus histrio, Gastrostyla steinii, and Pseudouroleptus caudatus are new for the Argentine microfauna. Since especially the soil ciliates have been almost unexplored in South America, the results from the present investigation describe and contribute to the knowledge of the diversity of these microorganisms within this geographical region.
[Mh] Termos MeSH primário: Tanques/parasitologia
Sporadotrichina/classificação
Sporadotrichina/citologia
[Mh] Termos MeSH secundário: Argentina
Especificidade da Espécie
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE; RESEARCH SUPPORT, NON-U.S. GOV'T
[Em] Mês de entrada:1508
[Cu] Atualização por classe:150715
[Lr] Data última revisão:
150715
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:150716
[St] Status:MEDLINE


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[PMID]:22327026
[Au] Autor:Postberg J; Tsytlonok M; Sparvoli D; Rhodes D; Lipps HJ
[Ad] Endereço:Centre for Biomedical Education and Research, Institute of Cell Biology, Witten, Germany.
[Ti] Título:A telomerase-associated RecQ protein-like helicase resolves telomeric G-quadruplex structures during replication.
[So] Source:Gene;497(2):147-54, 2012 Apr 15.
[Is] ISSN:1879-0038
[Cp] País de publicação:Netherlands
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:It is well established that G-quadruplex DNA structures form at ciliate telomeres and their formation throughout the cell-cycle by telomere-end-binding proteins (TEBPs) has been analyzed. During replication telomeric G-quadruplex structure has to be resolved to allow telomere replication by telomerase. It was shown that both phosphorylation of TEBPß and binding of telomerase are prerequisites for this process, but probably not sufficient to unfold G-quadruplex structure in timely manner to allow replication to proceed. Here we describe a RecQ-like helicase required for unfolding of G-quadruplex structures in vivo. This helicase is highly reminiscent of human RecQ protein-like 4 helicase as well as other RecQ-like helicase found in various eukaryotes and E. coli. In situ analyses combined with specific silencing of either the telomerase or the helicase by RNAi and co-immunoprecipitation experiments demonstrate that this helicase is associated with telomerase during replication and becomes recruited to telomeres by this enzyme. In vitro assays showed that a nuclear extract prepared from cells in S-phase containing both the telomerase as well as the helicase resolves telomeric G-quadruplex structure. This finding can be incorporated into a mechanistic model about the replication of telomeric G-quadruplex structures during the cell cycle.
[Mh] Termos MeSH primário: DNA Helicases/genética
DNA Helicases/metabolismo
Replicação do DNA/fisiologia
Quadruplex G
RecQ Helicases/metabolismo
Telomerase/metabolismo
Telômero/metabolismo
[Mh] Termos MeSH secundário: Sequência de Aminoácidos
Replicação do DNA/genética
Genoma
Imunoprecipitação/métodos
Macronúcleo/genética
Dados de Sequência Molecular
RecQ Helicases/genética
Fase S/genética
Sporadotrichina/genética
Sporadotrichina/metabolismo
Telomerase/genética
Telômero/genética
Proteínas de Ligação a Telômeros/genética
Proteínas de Ligação a Telômeros/metabolismo
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE
[Nm] Nome de substância:
0 (Telomere-Binding Proteins); EC 2.7.7.49 (Telomerase); EC 3.6.4.- (DNA Helicases); EC 3.6.4.12 (RecQ Helicases)
[Em] Mês de entrada:1207
[Cu] Atualização por classe:170922
[Lr] Data última revisão:
170922
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:120214
[St] Status:MEDLINE
[do] DOI:10.1016/j.gene.2012.01.068


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[PMID]:8493097
[Au] Autor:Stoll S; Zirlik T; Maercker C; Lipps HJ
[Ad] Endereço:Medizinisch-Naturwissenschaftliches Forschungszentrum, Universität Tübingen, Germany.
[Ti] Título:The organization of internal telomeric repeats in the polytene chromosomes of the hypotrichous ciliate Stylonychia lemnae.
[So] Source:Nucleic Acids Res;21(8):1783-8, 1993 Apr 25.
[Is] ISSN:0305-1048
[Cp] País de publicação:England
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:There exist about 1000-1500 internal telomeric sequences per haploid genome in the polytene chromosomes of the hypotrichous ciliate Stylonychia lemnae. All these telomeric repeats are contained in a very conserved element. This element consists of two 2 kb direct repeats flanking a 2.6 kb sequence. Immediately adjacent to one of the repeats a 18mer C4A4C4A4C2 telomeric sequence is localized. Sequences homologous to macronuclear DNA follow 180 bp downstream of the C4A4-bloc. These macronuclear homologous sequences are flanked by the second direct repeat. The possible origin and function of these telomere containing elements is discussed.
[Mh] Termos MeSH primário: Cromossomos/ultraestrutura
Sequências Repetitivas de Ácido Nucleico
Sporadotrichina/genética
Telômero
[Mh] Termos MeSH secundário: Animais
Sequência de Bases
DNA de Protozoário
Dados de Sequência Molecular
Mapeamento por Restrição
Homologia de Sequência do Ácido Nucleico
Sporadotrichina/ultraestrutura
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE; RESEARCH SUPPORT, NON-U.S. GOV'T
[Nm] Nome de substância:
0 (DNA, Protozoan)
[Em] Mês de entrada:9306
[Cu] Atualização por classe:170219
[Lr] Data última revisão:
170219
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:930425
[St] Status:MEDLINE


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[PMID]:1398099
[Au] Autor:Gaunitz C; Witte H; Gaunitz F
[Ad] Endereço:Abteilung Zellbiologie, Eberhard-Karls-Universität, Tübingen, Germany.
[Ti] Título:Primary structure of a gene-sized DNA encoding calmodulin from the hypotrichous ciliate Stylonychia lemnae.
[So] Source:Gene;119(2):191-8, 1992 Oct 01.
[Is] ISSN:0378-1119
[Cp] País de publicação:Netherlands
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:We have isolated and characterized a gene-sized DNA encoding calmodulin (Clm) from macronuclear (MA) DNA of the hypotrichous ciliate, Stylonychia lemnae. The gene has 3500 copies per macronucleus. The length of the gene was deduced by agarose-gel electrophoresis of MA DNA and Southern blot analysis using a Clm cDNA probe from chicken. We then isolated the gene from a MA library. The overall length of the gene is 821 bp with a 450-bp intronless coding region. The deduced amino acid (aa) sequence of ciliate Clm has 149 aa and an M(r) of 16,819. Both ends of the cloned gene have the hypotrichous telomeric C4A4 repeat. The coding region is flanked by a 158-bp 5'-leader sequence and a 3'-trailer sequence of 213 bp. S1 analysis was used to locate the transcription start point (tsp) 49 bp upstream from the start codon. No common eukaryotic transcription signals were found upstream from the tsp. A second gene-sized DNA, detected by its cross-hybridization with the Clm DNA, predicts the existence of a second Ca(2+)-binding protein with only one Ca(2+)-binding site. It's function and biological significance is yet unknown.
[Mh] Termos MeSH primário: Calmodulina/genética
Genes de Protozoários
Sporadotrichina/genética
[Mh] Termos MeSH secundário: Sequência de Aminoácidos
Animais
Sequência de Bases
Northern Blotting
Galinhas
Clonagem Molecular
DNA de Protozoário
Elementos Facilitadores Genéticos
Dados de Sequência Molecular
Homologia de Sequência de Aminoácidos
Transcrição Genética
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE; RESEARCH SUPPORT, NON-U.S. GOV'T
[Gs] Símbolo de gene:Clm
[Nm] Nome de substância:
0 (Calmodulin); 0 (DNA, Protozoan)
[Em] Mês de entrada:9211
[Cu] Atualização por classe:081121
[Lr] Data última revisão:
081121
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:921001
[St] Status:MEDLINE


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[PMID]:1945829
[Au] Autor:Fang GW; Cech TR
[Ad] Endereço:Department of Chemistry and Biochemistry, Howard Hughes Medical Institute, University of Colorado, Boulder 80309.
[Ti] Título:Molecular cloning of telomere-binding protein genes from Stylonychia mytilis.
[So] Source:Nucleic Acids Res;19(20):5515-8, 1991 Oct 25.
[Is] ISSN:0305-1048
[Cp] País de publicação:England
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:A telomere-binding protein heterodimer of 56 kDa (alpha) and 41 kDa (beta) subunits binds specifically to Oxytricha nova telomeres. Genes encoding both subunits have been cloned previously. Here we report molecular cloning and sequence analysis of the homologous genes in Stylonychia mytilis. The derived amino acid sequences were 79% identical for the alpha subunits and 77% identical for the beta subunits. Three repeats of a Leu/Ile heptad were found in each subunit, which might be involved in heterodimer formation. A 360 amino acid region of the Stylonychia mytilis alpha subunit was found to share weak sequence similarity with human vimentin, suggesting the possibility of a relationship between telomeres and intermediate filaments.
[Mh] Termos MeSH primário: DNA de Protozoário/metabolismo
Proteínas de Ligação a DNA/genética
Sporadotrichina/genética
Telômero/metabolismo
[Mh] Termos MeSH secundário: Sequência de Aminoácidos
Animais
Sequência de Bases
Southern Blotting
Clonagem Molecular
Proteínas de Ligação a DNA/metabolismo
Dados de Sequência Molecular
Mapeamento por Restrição
Alinhamento de Sequência
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE; RESEARCH SUPPORT, NON-U.S. GOV'T; RESEARCH SUPPORT, U.S. GOV'T, P.H.S.
[Nm] Nome de substância:
0 (DNA, Protozoan); 0 (DNA-Binding Proteins)
[Em] Mês de entrada:9112
[Cu] Atualização por classe:170219
[Lr] Data última revisão:
170219
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:911025
[St] Status:MEDLINE


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[PMID]:1840642
[Au] Autor:Bierbaum P; Dönhoff T; Klein A
[Ad] Endereço:Department of Biology, Philipps University, Marburg, Germany.
[Ti] Título:Macronuclear and micronuclear configurations of a gene encoding the protein synthesis elongation factor EF 1 alpha in Stylonychia lemnae.
[So] Source:Mol Microbiol;5(6):1567-75, 1991 Jun.
[Is] ISSN:0950-382X
[Cp] País de publicação:England
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:The micronuclear and macronuclear configurations of a gene encoding the protein synthesis elongation factor EF 1 alpha in the hypotrich ciliate Stylonychia lemnae were compared. The two sequences are generally colinear. The coding sequence of the micronuclear gene is, however, interrupted by a 64 bp insert flanked by a 2 bp direct repeat in a gene region which is moderately conserved among EF 1 alpha genes of different organisms. The insertion site is distinct from known intron positions in eukaryotic EF 1 alpha genes. The insert sequence shows inverted repeats at its ends and thus exhibits typical features of an internal eliminated sequence (IES). Comparison with other such sequences in the related organism Oyxtricha nova shows that the IES falls into a new group of such elements. The macronuclear gene exhibits a strikingly limited codon usage, which cannot be simply explained by the overall base composition of the DNA but probably also relates to the very high copy number of the macronuclear gene and the putative high amount of the gene product.
[Mh] Termos MeSH primário: Códon/genética
Família Multigênica/genética
Fatores de Alongamento de Peptídeos/genética
Ribonucleoproteínas/genética
Sporadotrichina/genética
[Mh] Termos MeSH secundário: Sequência de Aminoácidos
Animais
Composição de Bases
Sequência de Bases
Núcleo Celular/metabolismo
Íntrons/genética
Dados de Sequência Molecular
Conformação de Ácido Nucleico
Oxytricha/genética
Fator 1 de Elongação de Peptídeos
Reação em Cadeia da Polimerase
Sequências Repetitivas de Ácido Nucleico/genética
Mapeamento por Restrição
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE; RESEARCH SUPPORT, NON-U.S. GOV'T
[Gs] Símbolo de gene:EF 1&agr;
[Nm] Nome de substância:
0 (Codon); 0 (Peptide Elongation Factor 1); 0 (Peptide Elongation Factors); 0 (Ribonucleoproteins)
[Em] Mês de entrada:9203
[Cu] Atualização por classe:061115
[Lr] Data última revisão:
061115
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:910601
[St] Status:MEDLINE


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[PMID]:2132956
[Au] Autor:Wefes I; Lipps HJ
[Ad] Endereço:Medizinisch-Naturwissenschaftliches-Forschungszentrum, Universität Tuebingen, FRG.
[Ti] Título:The two macronuclear histone H4 genes of the hypotrichous ciliate Stylonychia lemnae.
[So] Source:DNA Seq;1(1):25-32, 1990.
[Is] ISSN:1042-5179
[Cp] País de publicação:England
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:Macronuclear DNA of hypotrichous ciliates is organized in short gene-sized molecules, each containing all regulatory sequences for autonomous replication and expression. In these organisms the histone genes are not clustered but dispersed on different molecules of various sizes. Two histone H4 genes containing fragments, one of 1.7 kb and one of 2.8 kb, were found in the macronucleus of Stylonychia lemnae. Restriction and sequence data reveal that the two genes-sized pieces are derived from different micronuclear precursors. Both histone H4 genes code for the same protein of 103 aminoacids but differ greatly in their 5'-and 3'-regions.
[Mh] Termos MeSH primário: Histonas/genética
Sporadotrichina/genética
[Mh] Termos MeSH secundário: Sequência de Aminoácidos
Animais
Sequência de Bases
Núcleo Celular
Clonagem Molecular
DNA de Protozoário
Dados de Sequência Molecular
Hibridização de Ácido Nucleico
Mapeamento por Restrição
Homologia de Sequência do Ácido Nucleico
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE; RESEARCH SUPPORT, NON-U.S. GOV'T
[Nm] Nome de substância:
0 (DNA, Protozoan); 0 (Histones)
[Em] Mês de entrada:9202
[Cu] Atualização por classe:061115
[Lr] Data última revisão:
061115
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:900101
[St] Status:MEDLINE



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