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[PMID]:24937569
[Au] Autor:Hassanin A
[Ad] Endereço:a Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UFR927 , Paris , France and.
[Ti] Título:The complete mitochondrial genome of the African palm civet, Nandinia binotata, the only representative of the family Nandiniidae (Mammalia, Carnivora).
[So] Source:Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal;27(2):904-5, 2016.
[Is] ISSN:2470-1408
[Cp] País de publicação:England
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:Here I report the complete mitochondrial genome of the African palm civet, (Nandinia binotata) as sequenced from overlapping PCR products. The genome is 17,103 bp in length and contains the 37 genes found in a typical mammalian genome: 13 protein-coding genes, 22 transfer RNA genes and 2 ribosomal RNA genes. The control region of N. binotata includes both RS2 and RS3 tandem repeats. The overall base composition on the L-strand is A: 33.6%, C: 27.3%, G: 13.0%, and T: 26.1%.
[Mh] Termos MeSH primário: DNA Mitocondrial/genética
Genoma Mitocondrial/genética
Mitocôndrias/genética
Nandiniidae/genética
Análise de Sequência de DNA/veterinária
[Mh] Termos MeSH secundário: África
Animais
Composição de Bases/genética
Sequência de Bases
Tamanho do Genoma
Dados de Sequência Molecular
Reação em Cadeia da Polimerase/veterinária
RNA Ribossômico/genética
RNA de Transferência/genética
Sequências de Repetição em Tandem/genética
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE; RESEARCH SUPPORT, NON-U.S. GOV'T
[Nm] Nome de substância:
0 (DNA, Mitochondrial); 0 (RNA, Ribosomal); 9014-25-9 (RNA, Transfer)
[Em] Mês de entrada:1609
[Cu] Atualização por classe:151216
[Lr] Data última revisão:
151216
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:140618
[St] Status:MEDLINE
[do] DOI:10.3109/19401736.2014.926478


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[PMID]:24978855
[Au] Autor:Singh R; Low ET; Ooi LC; Ong-Abdullah M; Nookiah R; Ting NC; Marjuni M; Chan PL; Ithnin M; Manaf MA; Nagappan J; Chan KL; Rosli R; Halim MA; Azizi N; Budiman MA; Lakey N; Bacher B; Van Brunt A; Wang C; Hogan M; He D; MacDonald JD; Smith SW; Ordway JM; Martienssen RA; Sambanthamurthi R
[Ad] Endereço:Malaysian Palm Oil Board, Advanced Biotechnology and Breeding Centre, 6, Persiaran Institusi, Bandar Baru Bangi, 43000 Kajang, Selangor, Malaysia.
[Ti] Título:The oil palm VIRESCENS gene controls fruit colour and encodes a R2R3-MYB.
[So] Source:Nat Commun;5:4106, 2014 Jun 30.
[Is] ISSN:2041-1723
[Cp] País de publicação:England
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:Oil palm, a plantation crop of major economic importance in Southeast Asia, is the predominant source of edible oil worldwide. We report the identification of the virescens (VIR) gene, which controls fruit exocarp colour and is an indicator of ripeness. VIR is a R2R3-MYB transcription factor with homology to Lilium LhMYB12 and similarity to Arabidopsis production of anthocyanin pigment1 (PAP1). We identify five independent mutant alleles of VIR in over 400 accessions from sub-Saharan Africa that account for the dominant-negative virescens phenotype. Each mutation results in premature termination of the carboxy-terminal domain of VIR, resembling McClintock's C1-I allele in maize. The abundance of alleles likely reflects cultural practices, by which fruits were venerated for magical and medicinal properties. The identification of VIR will allow selection of the trait at the seed or early-nursery stage, 3-6 years before fruits are produced, greatly advancing introgression into elite breeding material.
[Mh] Termos MeSH primário: Frutas/crescimento & desenvolvimento
Regulação da Expressão Gênica de Plantas
Nandiniidae/metabolismo
Proteínas de Plantas/metabolismo
[Mh] Termos MeSH secundário: Sequência de Aminoácidos
Animais
Frutas/genética
Frutas/metabolismo
Regulação da Expressão Gênica no Desenvolvimento
Dados de Sequência Molecular
Nandiniidae/classificação
Nandiniidae/genética
Proteínas Associadas a Pancreatite
Filogenia
Proteínas de Plantas/genética
Plantas/classificação
Plantas/genética
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE; RESEARCH SUPPORT, NON-U.S. GOV'T
[Nm] Nome de substância:
0 (Pancreatitis-Associated Proteins); 0 (Plant Proteins); 0 (REG3A protein, human)
[Em] Mês de entrada:1510
[Cu] Atualização por classe:171116
[Lr] Data última revisão:
171116
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:140701
[St] Status:MEDLINE
[do] DOI:10.1038/ncomms5106


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[PMID]:21282929
[Au] Autor:Ueki T; Akaishi T; Okumura H; Morioka T; Abe K
[Ad] Endereço:Laboratory of Pharmacology, Faculty of Pharmacy and Research Institute of Pharmaceutical Sciences, Musashino University, Tokyo 202-8585, Japan.
[Ti] Título:Biphasic tracheal relaxation induced by higenamine and nantenine from Nandina domestica Thunberg.
[So] Source:J Pharmacol Sci;115(2):254-7, 2011.
[Is] ISSN:1347-8648
[Cp] País de publicação:Japan
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:We compared the effects of the extract from fruits of Nandina domestica Thunberg (NDE) and its constituents, higenamine and nantenine, on contractile responses in isolated guinea-pig trachea. NDE (1 mg/ml) caused biphasic relaxation of the trachea precontracted with high-K(+) stimulation: the fast component was blocked by propranolol and mimicked by higenamine; and the slow was resistant to propranolol and mimicked by nantenine. Ca(2+)-induced contraction under high-K(+) stimulation was antagonized by nantenine or NDE + propranolol. These results suggest that NDE relaxes the trachea quickly through ß-adrenoceptor stimulation by higenamine and slowly through Ca(2+) antagonism by nantenine.
[Mh] Termos MeSH primário: Agonistas Adrenérgicos beta/farmacologia
Alcaloides/farmacologia
Aporfinas/farmacologia
Nandiniidae
Tetra-Hidroisoquinolinas/farmacologia
Traqueia/efeitos dos fármacos
[Mh] Termos MeSH secundário: Antagonistas Adrenérgicos beta/farmacologia
Animais
Cálcio/metabolismo
Frutas
Cobaias
Masculino
Relaxamento Muscular/efeitos dos fármacos
Músculo Liso/efeitos dos fármacos
Potássio/metabolismo
Propranolol/farmacologia
Traqueia/fisiologia
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE
[Nm] Nome de substância:
0 (Adrenergic beta-Agonists); 0 (Adrenergic beta-Antagonists); 0 (Alkaloids); 0 (Aporphines); 0 (Tetrahydroisoquinolines); 9Y8NXQ24VQ (Propranolol); RWP5GA015D (Potassium); SY7Q814VUP (Calcium); TBV5O16GAP (higenamine); XE0AU8C122 (nantenine)
[Em] Mês de entrada:1109
[Cu] Atualização por classe:161125
[Lr] Data última revisão:
161125
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:110202
[St] Status:MEDLINE


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[PMID]:19027884
[Au] Autor:Hamilton PB; Adams ER; Njiokou F; Gibson WC; Cuny G; Herder S
[Ad] Endereço:School of Biosciences, University of Exeter, Exeter, UK. p.b.hamilton@exeter.ac.uk
[Ti] Título:Phylogenetic analysis reveals the presence of the Trypanosoma cruzi clade in African terrestrial mammals.
[So] Source:Infect Genet Evol;9(1):81-6, 2009 Jan.
[Is] ISSN:1567-1348
[Cp] País de publicação:Netherlands
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:Despite the impact of some trypanosome species on human and livestock health, the full diversity of trypanosomes in Africa is poorly understood. A recent study examined the prevalence of trypanosomes among a wide variety of wild vertebrates in Cameroon using species-specific PCR tests, but six trypanosome isolates remained unidentified. Here they have been re-examined using fluorescent fragment length barcoding (FFLB) and phylogenetic analysis of glycosomal glyceraldehyde phosphate dehydrogenase gGAPDH and 18S ribosomal RNA (rDNA) genes. Isolates from a monkey (Cercopithecus nictitans) and a palm civet (Nandinia binotata) belonged to the Trypanosoma cruzi clade, known previously only from New World and Australian terrestrial mammals, and bats from Africa, Europe and South America. Of the four other isolates, three from antelope were identified as Trypanosoma theileri, and one from a crocodile as T. grayi. This is the first report of trypanosomes of the T. cruzi clade in African terrestrial mammals and expands the clade's known global distribution in terrestrial mammals. Previously it has been hypothesized that African and New World trypanosomes diverged after continental separation, dating the divergence to around 100 million years ago. The new evidence instead suggests that intercontinental transfer occurred well after this, possibly via bats or rodents, allowing these trypanosomes to establish and evolve in African terrestrial mammals, and questioning the validity of calibrating trypanosome molecular trees using continental separation.
[Mh] Termos MeSH primário: Genes de Protozoários
Mamíferos/parasitologia
Filogenia
Trypanosoma cruzi/genética
Trypanosoma/classificação
Trypanosoma/genética
Tripanossomíase Africana/veterinária
[Mh] Termos MeSH secundário: Jacarés e Crocodilos/parasitologia
Animais
Antílopes/parasitologia
Camarões
Cercopithecus/parasitologia
DNA Ribossômico/genética
Evolução Molecular
Variação Genética
Gliceraldeído-3-Fosfato Desidrogenases/genética
Seres Humanos
Dados de Sequência Molecular
Nandiniidae/parasitologia
RNA Ribossômico 18S/genética
Alinhamento de Sequência
Trypanosoma cruzi/classificação
Tripanossomíase Africana/parasitologia
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE; RESEARCH SUPPORT, NON-U.S. GOV'T
[Nm] Nome de substância:
0 (DNA, Ribosomal); 0 (RNA, Ribosomal, 18S); EC 1.2.1.- (Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenases)
[Em] Mês de entrada:0904
[Cu] Atualização por classe:081222
[Lr] Data última revisão:
081222
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:081126
[St] Status:MEDLINE
[do] DOI:10.1016/j.meegid.2008.10.011


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PubMed Central Texto completo
[PMID]:17620608
[Au] Autor:Zhu Z; Chakraborti S; He Y; Roberts A; Sheahan T; Xiao X; Hensley LE; Prabakaran P; Rockx B; Sidorov IA; Corti D; Vogel L; Feng Y; Kim JO; Wang LF; Baric R; Lanzavecchia A; Curtis KM; Nabel GJ; Subbarao K; Jiang S; Dimitrov DS
[Ad] Endereço:Protein Interactions Group, Center for Cancer Research Nanobiology Program, SAIC-Frederick, Inc., National Cancer Institute-Frederick, National Institutes of Health, Frederick, MD 21702, USA.
[Ti] Título:Potent cross-reactive neutralization of SARS coronavirus isolates by human monoclonal antibodies.
[So] Source:Proc Natl Acad Sci U S A;104(29):12123-8, 2007 Jul 17.
[Is] ISSN:0027-8424
[Cp] País de publicação:United States
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:The severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) caused a worldwide epidemic in late 2002/early 2003 and a second outbreak in the winter of 2003/2004 by an independent animal-to-human transmission. The GD03 strain, which was isolated from an index patient of the second outbreak, was reported to resist neutralization by the human monoclonal antibodies (hmAbs) 80R and S3.1, which can potently neutralize isolates from the first outbreak. Here we report that two hmAbs, m396 and S230.15, potently neutralized GD03 and representative isolates from the first SARS outbreak (Urbani, Tor2) and from palm civets (SZ3, SZ16). These antibodies also protected mice challenged with the Urbani or recombinant viruses bearing the GD03 and SZ16 spike (S) glycoproteins. Both antibodies competed with the SARS-CoV receptor, ACE2, for binding to the receptor-binding domain (RBD), suggesting a mechanism of neutralization that involves interference with the SARS-CoV-ACE2 interaction. Two putative hot-spot residues in the RBD (Ile-489 and Tyr-491) were identified within the SARS-CoV spike that likely contribute to most of the m396-binding energy. Residues Ile-489 and Tyr-491 are highly conserved within the SARS-CoV spike, indicating a possible mechanism of the m396 cross-reactivity. Sequence analysis and mutagenesis data show that m396 might neutralize all zoonotic and epidemic SARS-CoV isolates with known sequences, except strains derived from bats. These antibodies exhibit cross-reactivity against isolates from the two SARS outbreaks and palm civets and could have potential applications for diagnosis, prophylaxis, and treatment of SARS-CoV infections.
[Mh] Termos MeSH primário: Anticorpos Monoclonais/imunologia
Vírus da SARS/imunologia
Vírus da SARS/isolamento & purificação
[Mh] Termos MeSH secundário: Animais
Ligação Competitiva
Fusão Celular
Reações Cruzadas
Modelos Animais de Doenças
Surtos de Doenças
Seres Humanos
Modelos Biológicos
Modelos Moleculares
Mutagênese
Nandiniidae/virologia
Testes de Neutralização
Estrutura Terciária de Proteína
Receptores de Superfície Celular/química
Vírus da SARS/fisiologia
Síndrome Respiratória Aguda Grave/epidemiologia
Síndrome Respiratória Aguda Grave/imunologia
Síndrome Respiratória Aguda Grave/virologia
Proteínas Virais/metabolismo
Internalização do Vírus
Replicação Viral
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE; RESEARCH SUPPORT, N.I.H., EXTRAMURAL; RESEARCH SUPPORT, N.I.H., INTRAMURAL
[Nm] Nome de substância:
0 (Antibodies, Monoclonal); 0 (Receptors, Cell Surface); 0 (Viral Proteins)
[Em] Mês de entrada:0708
[Cu] Atualização por classe:161203
[Lr] Data última revisão:
161203
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:070711
[St] Status:MEDLINE


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PubMed Central Texto completo
[PMID]:16796401
[Au] Autor:ter Meulen J; van den Brink EN; Poon LL; Marissen WE; Leung CS; Cox F; Cheung CY; Bakker AQ; Bogaards JA; van Deventer E; Preiser W; Doerr HW; Chow VT; de Kruif J; Peiris JS; Goudsmit J
[Ad] Endereço:Crucell Holland B.V., Leiden, Netherlands. j.termeulen@crucell.com
[Ti] Título:Human monoclonal antibody combination against SARS coronavirus: synergy and coverage of escape mutants.
[So] Source:PLoS Med;3(7):e237, 2006 Jul.
[Is] ISSN:1549-1676
[Cp] País de publicação:United States
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:BACKGROUND: Experimental animal data show that protection against severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) infection with human monoclonal antibodies (mAbs) is feasible. For an effective immune prophylaxis in humans, broad coverage of different strains of SARS-CoV and control of potential neutralization escape variants will be required. Combinations of virus-neutralizing, noncompeting mAbs may have these properties. METHODS AND FINDINGS: Human mAb CR3014 has been shown to completely prevent lung pathology and abolish pharyngeal shedding of SARS-CoV in infected ferrets. We generated in vitro SARS-CoV variants escaping neutralization by CR3014, which all had a single P462L mutation in the glycoprotein spike (S) of the escape virus. In vitro experiments confirmed that binding of CR3014 to a recombinant S fragment (amino acid residues 318-510) harboring this mutation was abolished. We therefore screened an antibody-phage library derived from blood of a convalescent SARS patient for antibodies complementary to CR3014. A novel mAb, CR3022, was identified that neutralized CR3014 escape viruses, did not compete with CR3014 for binding to recombinant S1 fragments, and bound to S1 fragments derived from the civet cat SARS-CoV-like strain SZ3. No escape variants could be generated with CR3022. The mixture of both mAbs showed neutralization of SARS-CoV in a synergistic fashion by recognizing different epitopes on the receptor-binding domain. Dose reduction indices of 4.5 and 20.5 were observed for CR3014 and CR3022, respectively, at 100% neutralization. Because enhancement of SARS-CoV infection by subneutralizing antibody concentrations is of concern, we show here that anti-SARS-CoV antibodies do not convert the abortive infection of primary human macrophages by SARS-CoV into a productive one. CONCLUSIONS: The combination of two noncompeting human mAbs CR3014 and CR3022 potentially controls immune escape and extends the breadth of protection. At the same time, synergy between CR3014 and CR3022 may allow for a lower total antibody dose to be administered for passive immune prophylaxis of SARS-CoV infection.
[Mh] Termos MeSH primário: Anticorpos Monoclonais/uso terapêutico
Antígenos Virais/imunologia
Imunização Passiva
Glicoproteínas de Membrana/imunologia
Vírus da SARS/imunologia
Síndrome Respiratória Aguda Grave/prevenção & controle
Proteínas do Envelope Viral/imunologia
[Mh] Termos MeSH secundário: Substituição de Aminoácidos
Animais
Anticorpos Monoclonais/administração & dosagem
Anticorpos Monoclonais/genética
Anticorpos Monoclonais/imunologia
Afinidade de Anticorpos
Especificidade de Anticorpos
Reações Antígeno-Anticorpo
Variação Antigênica
Sequência de Bases
Sítios de Ligação
Células Cultivadas/virologia
Cercopithecus aethiops
Surtos de Doenças
Relação Dose-Resposta Imunológica
Sinergismo Farmacológico
Epitopos/imunologia
Seres Humanos
Soros Imunes
Cadeias Pesadas de Imunoglobulinas/genética
Cadeias Pesadas de Imunoglobulinas/imunologia
Cadeias Leves de Imunoglobulina/genética
Cadeias Leves de Imunoglobulina/imunologia
Região Variável de Imunoglobulina/química
Região Variável de Imunoglobulina/imunologia
Macrófagos/virologia
Glicoproteínas de Membrana/genética
Glicoproteínas de Membrana/fisiologia
Dados de Sequência Molecular
Mutação de Sentido Incorreto
Nandiniidae/virologia
Testes de Neutralização
Mutação Puntual
Estrutura Terciária de Proteína
Proteínas Recombinantes de Fusão/imunologia
Vírus da SARS/genética
Síndrome Respiratória Aguda Grave/tratamento farmacológico
Síndrome Respiratória Aguda Grave/epidemiologia
Síndrome Respiratória Aguda Grave/terapia
Síndrome Respiratória Aguda Grave/virologia
Glicoproteína da Espícula de Coronavírus
Ressonância de Plasmônio de Superfície
Células Vero
Proteínas do Envelope Viral/genética
Proteínas do Envelope Viral/fisiologia
Replicação Viral
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE; RESEARCH SUPPORT, N.I.H., EXTRAMURAL; RESEARCH SUPPORT, NON-U.S. GOV'T
[Nm] Nome de substância:
0 (Antibodies, Monoclonal); 0 (Antigens, Viral); 0 (Epitopes); 0 (Immune Sera); 0 (Immunoglobulin Heavy Chains); 0 (Immunoglobulin Light Chains); 0 (Immunoglobulin Variable Region); 0 (Membrane Glycoproteins); 0 (Recombinant Fusion Proteins); 0 (S protein, severe acute respiratory syndrome coronavirus); 0 (Spike Glycoprotein, Coronavirus); 0 (Viral Envelope Proteins)
[Em] Mês de entrada:0702
[Cu] Atualização por classe:170520
[Lr] Data última revisão:
170520
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:060627
[St] Status:MEDLINE



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