[PMID]: | 27770636 |
[Au] Autor: | Mez J; Chung J; Jun G; Kriegel J; Bourlas AP; Sherva R; Logue MW; Barnes LL; Bennett DA; Buxbaum JD; Byrd GS; Crane PK; Ertekin-Taner N; Evans D; Fallin MD; Foroud T; Goate A; Graff-Radford NR; Hall KS; Kamboh MI; Kukull WA; Larson EB; Manly JJ; Haines JL; Mayeux R; Pericak-Vance MA; Schellenberg GD; Lunetta KL; Farrer LA; Alzheimer's Disease Genetics Consortium |
[Ad] Endereço: | Department of Neurology, Boston University School of Medicine, Boston, MA, USA; Alzheimer's Disease and CTE Center, Boston University School of Medicine, Boston, MA, USA. Electronic address: jessemez@bu.edu. |
[Ti] Título: | Two novel loci, COBL and SLC10A2, for Alzheimer's disease in African Americans. |
[So] Source: | Alzheimers Dement;13(2):119-129, 2017 Feb. |
[Is] ISSN: | 1552-5279 |
[Cp] País de publicação: | United States |
[La] Idioma: | eng |
[Ab] Resumo: | INTRODUCTION: African Americans' (AAs) late-onset Alzheimer's disease (LOAD) genetic risk profile is incompletely understood. Including clinical covariates in genetic analyses using informed conditioning might improve study power. METHODS: We conducted a genome-wide association study (GWAS) in AAs employing informed conditioning in 1825 LOAD cases and 3784 cognitively normal controls. We derived a posterior liability conditioned on age, sex, diabetes status, current smoking status, educational attainment, and affection status, with parameters informed by external prevalence information. We assessed association between the posterior liability and a genome-wide set of single-nucleotide polymorphisms (SNPs), controlling for APOE and ABCA7, identified previously in a LOAD GWAS of AAs. RESULTS: Two SNPs at novel loci, rs112404845 (P = 3.8 × 10 ), upstream of COBL, and rs16961023 (P = 4.6 × 10 ), downstream of SLC10A2, obtained genome-wide significant evidence of association with the posterior liability. DISCUSSION: An informed conditioning approach can detect LOAD genetic associations in AAs not identified by traditional GWAS. |
[Mh] Termos MeSH primário: |
Afroamericanos/genética Doença de Alzheimer/etnologia Doença de Alzheimer/genética Loci Gênicos Proteínas dos Microfilamentos/genética Transportadores de Ânions Orgânicos Dependentes de Sódio/genética Polimorfismo de Nucleotídeo Único Simportadores/genética
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[Mh] Termos MeSH secundário: |
Transportadores de Cassetes de Ligação de ATP/genética Idoso Idoso de 80 Anos ou mais Apolipoproteínas E/genética Complicações do Diabetes/etnologia Complicações do Diabetes/genética Escolaridade Feminino Predisposição Genética para Doença Estudo de Associação Genômica Ampla Seres Humanos Masculino Prevalência Fumar/etnologia Fumar/genética
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[Pt] Tipo de publicação: | JOURNAL ARTICLE |
[Nm] Nome de substância:
| 0 (ABCA7 protein, human); 0 (ATP-Binding Cassette Transporters); 0 (Apolipoproteins E); 0 (Cobl protein, human); 0 (Microfilament Proteins); 0 (Organic Anion Transporters, Sodium-Dependent); 0 (Symporters); 145420-23-1 (sodium-bile acid cotransporter) |
[Em] Mês de entrada: | 1712 |
[Cu] Atualização por classe: | 180307 |
[Lr] Data última revisão:
| 180307 |
[Sb] Subgrupo de revista: | IM |
[Da] Data de entrada para processamento: | 161023 |
[St] Status: | MEDLINE |
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