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[PMID]:29293649
[Au] Autor:Dutt M; Zambon FT; Erpen L; Soriano L; Grosser J
[Ad] Endereço:Citrus Research and Education Center, University of Florida, Lake Alfred, Florida, United States of America.
[Ti] Título:Embryo-specific expression of a visual reporter gene as a selection system for citrus transformation.
[So] Source:PLoS One;13(1):e0190413, 2018.
[Is] ISSN:1932-6203
[Cp] País de publicação:United States
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:The embryo-specific Dc3 gene promoter driving the VvMybA1 anthocyanin regulatory gene was used to develop a visual selection system for the genetic transformation of citrus. Agrobacterium-mediated transformation of cell suspension cultures resulted in the production of purple transgenic somatic embryos that could be easily separated from the green non-transgenic embryos. The somatic embryos produced phenotypically normal plants devoid of any visual purple coloration. These results were also confirmed using protoplast transformation. There was minimal gene expression in unstressed one-year-old transgenic lines. Cold and drought stress did not have any effect on gene expression, while exogenous ABA and NaCl application resulted in a minor change in gene expression in several transgenic lines. When gas exchange was measured in intact leaves, the transgenic lines were similar to controls under the same environment. Our results provide conclusive evidence for the utilization of a plant-derived, embryo-specific visual reporter system for the genetic transformation of citrus. Such a system could aid in the development of an all-plant, consumer-friendly GM citrus tree.
[Mh] Termos MeSH primário: Citrus/genética
Genes Reporter
Seleção Genética
Transformação Genética
[Mh] Termos MeSH secundário: Citrus/embriologia
Plantas Geneticamente Modificadas
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE; RESEARCH SUPPORT, NON-U.S. GOV'T
[Em] Mês de entrada:1802
[Cu] Atualização por classe:180221
[Lr] Data última revisão:
180221
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:180103
[St] Status:MEDLINE
[do] DOI:10.1371/journal.pone.0190413


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[PMID]:28470618
[Au] Autor:Black C; Barker JJ; Hitchman RB; Kwong HS; Festenstein S; Acton TB
[Ad] Endereço:Evotec Ltd, 114 Innovation Drive, Milton Park, Abingdon, Oxfordshire, OX14 4RZ, UK.
[Ti] Título:High-Throughput Production of Proteins in E. coli for Structural Studies.
[So] Source:Methods Mol Biol;1586:359-371, 2017.
[Is] ISSN:1940-6029
[Cp] País de publicação:United States
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:We have developed a standardized and efficient workflow for high-throughput (HT) protein expression in E. coli and parallel purification which can be tailored to the downstream application of the target proteins. It includes a one-step purification for the purposes of functional assays and a two-step protocol for crystallographic studies, with the option of on-column tag removal.
[Mh] Termos MeSH primário: Clonagem Molecular/métodos
Escherichia coli/genética
Proteínas Recombinantes/genética
[Mh] Termos MeSH secundário: Animais
Eletroforese em Gel de Poliacrilamida/métodos
Ensaios de Triagem em Larga Escala/economia
Ensaios de Triagem em Larga Escala/métodos
Seres Humanos
Conformação Proteica
Proteômica/métodos
Proteínas Recombinantes/química
Proteínas Recombinantes/isolamento & purificação
Transformação Genética
Fluxo de Trabalho
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE
[Nm] Nome de substância:
0 (Recombinant Proteins)
[Em] Mês de entrada:1802
[Cu] Atualização por classe:180220
[Lr] Data última revisão:
180220
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:170505
[St] Status:MEDLINE
[do] DOI:10.1007/978-1-4939-6887-9_24


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[PMID]:28470615
[Au] Autor:Phan T; Huynh P; Truong T; Nguyen H
[Ad] Endereço:VNUHCM-University of Science, 227 Nguyen Van Cu, District 5, Hochiminh City, Vietnam.
[Ti] Título:A Generic Protocol for Intracellular Expression of Recombinant Proteins in Bacillus subtilis.
[So] Source:Methods Mol Biol;1586:325-334, 2017.
[Is] ISSN:1940-6029
[Cp] País de publicação:United States
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:Bacillus subtilis (B. subtilis) is a potential and attractive host for the production of recombinant proteins. Different expression systems for B. subtilis have been developed recently, and various target proteins have been recombinantly synthesized and purified using this host. In this chapter, we introduce a generic protocol to express a recombinant protein in B. subtilis. It includes protocols for (1) using our typical expression vector (plasmid pHT254) to introduce a target gene, (2) transformation of the target vector into B. subtilis, and (3) evaluation of the actual expression of a recombinant protein.
[Mh] Termos MeSH primário: Bacillus subtilis/genética
Proteínas de Bactérias/genética
Clonagem Molecular/métodos
Vetores Genéticos/genética
beta-Galactosidase/genética
[Mh] Termos MeSH secundário: Bacillus subtilis/crescimento & desenvolvimento
Expressão Gênica
Genes Bacterianos
Plasmídeos/genética
Regiões Promotoras Genéticas
Proteínas Recombinantes/genética
Transformação Genética
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE
[Nm] Nome de substância:
0 (Bacterial Proteins); 0 (Recombinant Proteins); EC 3.2.1.23 (beta-Galactosidase)
[Em] Mês de entrada:1802
[Cu] Atualização por classe:180220
[Lr] Data última revisão:
180220
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:170505
[St] Status:MEDLINE
[do] DOI:10.1007/978-1-4939-6887-9_21


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[PMID]:28470610
[Au] Autor:Dodson CA
[Ad] Endereço:Molecular Medicine, National Heart & Lung Institute, Imperial College London, SAF Building, Room 364, South Kensington Campus, London, SW7 2AZ, UK. c.dodson@imperial.ac.uk.
[Ti] Título:Production of Protein Kinases in E. coli.
[So] Source:Methods Mol Biol;1586:251-264, 2017.
[Is] ISSN:1940-6029
[Cp] País de publicação:United States
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:Recombinant protein expression is widely used to generate milligram quantities of protein kinases for crystallographic, enzymatic, or other biophysical assays in vitro. Expression in E. coli is fast, cheap, and reliable. Here I present a detailed protocol for the production of human Aurora-A kinase. I begin with transformation of a suitable plasmid into an expression strain of E. coli, followed by growth and harvesting of bacterial cell cultures. Finally, I describe the purification of Aurora-A to homogeneity using immobilized metal affinity and size exclusion chromatographies.
[Mh] Termos MeSH primário: Aurora Quinase A/genética
Clonagem Molecular/métodos
Escherichia coli/genética
[Mh] Termos MeSH secundário: Aurora Quinase A/isolamento & purificação
Cromatografia de Afinidade/métodos
Cromatografia em Gel/métodos
Seres Humanos
Plasmídeos/genética
Proteínas Recombinantes/genética
Proteínas Recombinantes/isolamento & purificação
Transformação Genética
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE
[Nm] Nome de substância:
0 (Recombinant Proteins); EC 2.7.11.1 (AURKA protein, human); EC 2.7.11.1 (Aurora Kinase A)
[Em] Mês de entrada:1802
[Cu] Atualização por classe:180220
[Lr] Data última revisão:
180220
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:170505
[St] Status:MEDLINE
[do] DOI:10.1007/978-1-4939-6887-9_16


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[PMID]:28470604
[Au] Autor:Saez NJ; Cristofori-Armstrong B; Anangi R; King GF
[Ad] Endereço:Institute for Molecular Bioscience, The University of Queensland, 306 Carmody Road, St. Lucia, QLD, 4067, Australia. n.saez@imb.uq.edu.au.
[Ti] Título:A Strategy for Production of Correctly Folded Disulfide-Rich Peptides in the Periplasm of E. coli.
[So] Source:Methods Mol Biol;1586:155-180, 2017.
[Is] ISSN:1940-6029
[Cp] País de publicação:United States
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:Recombinant expression of disulfide-reticulated peptides and proteins is often challenging. We describe a method that exploits the periplasmic disulfide-bond forming machinery of Escherichia coli and combines this with a cleavable, solubility-enhancing fusion tag to obtain higher yields of correctly folded target protein than is achievable via cytoplasmic expression. The protocols provided herein cover all aspects of this approach, from vector construction and transformation to purification of the cleaved target protein and subsequent quality control.
[Mh] Termos MeSH primário: Dissulfetos/química
Escherichia coli/genética
Peptídeos/química
Peptídeos/genética
Periplasma/genética
[Mh] Termos MeSH secundário: Cromatografia de Afinidade/métodos
Cromatografia Líquida de Alta Pressão/métodos
Dissulfetos/isolamento & purificação
Dissulfetos/metabolismo
Eletroforese em Gel de Poliacrilamida/métodos
Peptídeos/isolamento & purificação
Plasmídeos/genética
Dobramento de Proteína
Proteínas Recombinantes de Fusão/química
Proteínas Recombinantes de Fusão/genética
Solubilidade
Transformação Genética
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE
[Nm] Nome de substância:
0 (Disulfides); 0 (Peptides); 0 (Recombinant Fusion Proteins)
[Em] Mês de entrada:1802
[Cu] Atualização por classe:180220
[Lr] Data última revisão:
180220
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:170505
[St] Status:MEDLINE
[do] DOI:10.1007/978-1-4939-6887-9_10


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[PMID]:28470601
[Au] Autor:Kuipers G; Peschke M; Ismail NB; Hjelm A; Schlegel S; Vikström D; Luirink J; de Gier JW
[Ad] Endereço:Department of Biochemistry and Biophysics, Center for Biomembrane Research, Stockholm University, Svante Arrhenius väg 16C, SE-106 91, Stockholm, Sweden.
[Ti] Título:Optimizing E. coli-Based Membrane Protein Production Using Lemo21(DE3) or pReX and GFP-Fusions.
[So] Source:Methods Mol Biol;1586:109-126, 2017.
[Is] ISSN:1940-6029
[Cp] País de publicação:United States
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:Optimizing the conditions for the production of membrane proteins in E. coli is usually a laborious and time-consuming process. Combining the Lemo21(DE3) strain or the pReX T7-based expression vector with membrane proteins C-terminally fused to Green Fluorescent Protein (GFP) greatly facilitates the optimization of membrane protein production yields. Both Lemo21(DE3) and pReX allow precise regulation of expression intensities of genes encoding membrane proteins, which is critical to identify the optimal production condition for a membrane protein. The use of GFP-fusions allows direct monitoring and visualization of membrane proteins at any stage during the production optimization process.
[Mh] Termos MeSH primário: Escherichia coli/genética
Proteínas de Fluorescência Verde/genética
Proteínas de Membrana/genética
[Mh] Termos MeSH secundário: Animais
Técnicas de Cultura de Células
Clonagem Molecular/métodos
Expressão Gênica
Vetores Genéticos/genética
Seres Humanos
Proteínas Recombinantes de Fusão/genética
Transformação Genética
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE
[Nm] Nome de substância:
0 (Membrane Proteins); 0 (Recombinant Fusion Proteins); 147336-22-9 (Green Fluorescent Proteins)
[Em] Mês de entrada:1802
[Cu] Atualização por classe:180220
[Lr] Data última revisão:
180220
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:170505
[St] Status:MEDLINE
[do] DOI:10.1007/978-1-4939-6887-9_7


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[PMID]:28470600
[Au] Autor:Morra R; Young K; Casas-Mao D; Dixon N; Bird LE
[Ad] Endereço:Manchester Institute of Biotechnology, University of Manchester, Manchester, M1 7DN, UK.
[Ti] Título:Optimization of Membrane Protein Production Using Titratable Strains of E. coli.
[So] Source:Methods Mol Biol;1586:83-107, 2017.
[Is] ISSN:1940-6029
[Cp] País de publicação:United States
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:The heterologous expression of membrane proteins driven by T7 RNA polymerase in E. coli is often limited by a mismatch between the transcriptional and translational rates resulting in saturation of the Sec translocon and non-insertion of the membrane protein. In order to optimize the levels of folded, functional inserted protein, it is important to correct this mismatch. In this protocol, we describe the use of titratable strains of E. coli where two small-molecule inducers are used in a bi-variate analysis to optimize the expression levels by fine tuning the transcriptional and translational rates of an eGFP-tagged membrane protein.
[Mh] Termos MeSH primário: Clonagem Molecular/métodos
Escherichia coli/genética
Proteínas de Fluorescência Verde/genética
Proteínas de Membrana/genética
[Mh] Termos MeSH secundário: Animais
RNA Polimerases Dirigidas por DNA/genética
RNA Polimerases Dirigidas por DNA/metabolismo
Escherichia coli/crescimento & desenvolvimento
Escherichia coli/metabolismo
Expressão Gênica
Proteínas de Fluorescência Verde/metabolismo
Seres Humanos
Proteínas de Membrana/metabolismo
Biossíntese de Proteínas
Proteínas Recombinantes/genética
Proteínas Recombinantes/metabolismo
Transcrição Genética
Transformação Genética
Proteínas Virais/genética
Proteínas Virais/metabolismo
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE
[Nm] Nome de substância:
0 (Membrane Proteins); 0 (Recombinant Proteins); 0 (Viral Proteins); 0 (enhanced green fluorescent protein); 147336-22-9 (Green Fluorescent Proteins); EC 2.7.7.- (bacteriophage T7 RNA polymerase); EC 2.7.7.6 (DNA-Directed RNA Polymerases)
[Em] Mês de entrada:1802
[Cu] Atualização por classe:180220
[Lr] Data última revisão:
180220
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:170505
[St] Status:MEDLINE
[do] DOI:10.1007/978-1-4939-6887-9_6


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[PMID]:29262710
[Au] Autor:Liu Y; Liu G; Yang Y; Niu S; Yang F; Yang S; Tang J; Chen J
[Ad] Endereço:1 Department of Biotechnology, Faculty of Agricultural Science, Guang Dong Ocean University , Zhanjiang, Guangdong , P.R. China.
[Ti] Título:Establishment of an efficient plant regeneration culture protocol and achievement of successful genetic transformation in Jatropha curcas L.
[So] Source:Acta Biol Hung;68(4):428-442, 2017 Dec.
[Is] ISSN:0236-5383
[Cp] País de publicação:Hungary
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:An efficient and reproducible protocol is described for shoot-bud regeneration and Agrobacterium tumefaciens-mediated genetic transformation of J. curcas. Treating the explants with high concentrations (5-120 mg/L) of TDZ for short durations (5-80 min) before inoculation culture increased significantly the regeneration frequency and improved the quality of the regenerated buds. The highest shoot-buds induction rate (87.35%) was achieved when petiole explants were treated with 20 mg/L TDZ solution for 20 min and inoculated on hormone-free MS medium for 30 days. Regenerated shoots of 0.5 cm or a little longer were isolated and grafted to seedling stocks of the same species, and then the grafted plantlets were planted on half-strength MS medium containing 0.1 mg/L IBA and 2 mg/L sodium nitroprusside (SNP). This grafting strategy was found to be very effective, to obtain that healthy grafted plantlets ready for acclimatization within 20 days. By the above mentioned protocol and with general Agrobacterium - mediated genetic transformation methods only 65 days were needed to obtain intact transgenic plants.
[Mh] Termos MeSH primário: Técnicas de Cultura de Células/métodos
Técnicas de Transferência de Genes
Jatropha
Células Vegetais/metabolismo
Brotos de Planta
Transformação Genética
[Mh] Termos MeSH secundário: Agrobacterium tumefaciens/genética
Agrobacterium tumefaciens/metabolismo
Jatropha/genética
Jatropha/crescimento & desenvolvimento
Brotos de Planta/genética
Brotos de Planta/crescimento & desenvolvimento
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE
[Em] Mês de entrada:1802
[Cu] Atualização por classe:180216
[Lr] Data última revisão:
180216
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:171222
[St] Status:MEDLINE
[do] DOI:10.1556/018.68.2017.4.8


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[PMID]:28461174
[Au] Autor:Dalonso N; Savoldi M; França PHC; Reis TF; Goldman GH; Gern RMM
[Ad] Endereço:Programa de Pós Graduação em Saúde e Meio Ambiente, Universidade da Região de Joinville, UNIVILLE, Joinville, SC 89201-972, Brazil. Electronic address: nenidalo@yahoo.com.br.
[Ti] Título:Sequence-independent cloning methods for long DNA fragments applied to synthetic biology.
[So] Source:Anal Biochem;530:5-8, 2017 08 01.
[Is] ISSN:1096-0309
[Cp] País de publicação:United States
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:Simplified methods to assemble DNA fragments by independent cloning sequence have helped in the progress of synthetic biology, allowing some biotechnological processes to become economically viable by genetic improvement of microorganisms. We compared three methods of assembling six DNA fragments: PCR fusion-based, isothermal NEBuilder and circular polymerase extension cloning (CPEC). Double and triple fusion occurs directly with the PCR products using PCR fusion-based and NEBuilder methods. For multiple fragments the results showed higher efficiency by the CPEC method which allowed assembly of six fragments previously purified by agarose gel extraction, after a sequence of 20 annealing/extension cycles without any primer.
[Mh] Termos MeSH primário: Clonagem Molecular/métodos
DNA/química
DNA/genética
Reação em Cadeia da Polimerase/métodos
Biologia Sintética/métodos
[Mh] Termos MeSH secundário: Ligases/metabolismo
Transformação Genética
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE; RESEARCH SUPPORT, NON-U.S. GOV'T
[Nm] Nome de substância:
9007-49-2 (DNA); EC 6.- (Ligases)
[Em] Mês de entrada:1708
[Cu] Atualização por classe:180207
[Lr] Data última revisão:
180207
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:170503
[St] Status:MEDLINE


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[PMID]:27770369
[Au] Autor:Bilichak A; Kovalchuk I
[Ad] Endereço:Lethbridge Research Centre, Agriculture and Agri-Food Canada, Lethbridge, AB, Canada.
[Ti] Título:Increasing a Stable Transformation Efficiency of Arabidopsis by Manipulating the Endogenous Gene Expression Using Virus-Induced Gene Silencing.
[So] Source:Methods Mol Biol;1456:225-236, 2017.
[Is] ISSN:1940-6029
[Cp] País de publicação:United States
[La] Idioma:eng
[Ab] Resumo:Virus-induced gene silencing (VIGS) is a powerful epigenetic tool that allows in a relatively short period of time to down-regulate the expression of an endogenous gene in infected plants for either monitoring the resulting phenotype or enhancing/modifying a particular trait associated with the gene. Here, we describe the utilization of Tobacco rattle virus (TRV) as a vector for the VIGS technique in Arabidopsis plants. The unique ability of TRV to infect both somatic tissues and gametes allows deciphering the role of genes in these tissues simultaneously. As an example, we demonstrate the utilization of TRV to down-regulate the expression of AGO2 and NRPD1a genes in ovules of Arabidopsis plants in order to boost the stable transformation efficiency by floral dip.
[Mh] Termos MeSH primário: Arabidopsis/genética
Arabidopsis/virologia
Regulação da Expressão Gênica de Plantas
Inativação Gênica
Interações Hospedeiro-Patógeno/genética
Interferência de RNA
Transformação Genética
[Mh] Termos MeSH secundário: Vetores Genéticos/genética
Plasmídeos
[Pt] Tipo de publicação:JOURNAL ARTICLE
[Em] Mês de entrada:1801
[Cu] Atualização por classe:180112
[Lr] Data última revisão:
180112
[Sb] Subgrupo de revista:IM
[Da] Data de entrada para processamento:161023
[St] Status:MEDLINE



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