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Diversidade genética do vírus da hepatite B no Brasil: genótipos, subgenótipos e recombinantes / Genetic diversity of the hepatitis B virus from Brazil: genotypes, subgenotypes and recombinants
Rio de Janeiro; s.n; 2008. ix,65 p. ilus, tab, graf, mapas.
Tese em Português | LILACS | ID: lil-511890
Biblioteca responsável: BR15.1
Localização: BR15.1
RESUMO
O vírus da hepatite B (HBV), membro da família Hepadnaviridae, possui genoma de DNA circular com cerca de 3200 pb e quatro regiões abertas de leitura. Apesar do pequeno tamanho do genoma viral, uma grande diversidade genética é observada. O HBV é classificado em oito genótipos, designados de A a H, e pelo menos 24 subgenótipos com distintas distribuições geográficas e propriedades virais. A recombinação inter e intra-genotípica tem sido reportada como um importante elemento na evolução do HBV. Nesse estudo, análises filogenéticas foram realizadas a fim de caracterizar possíveis recombinantes e os genótipos e subgenótipos do HBV em amostras de soro provenientes das cidades de Araçatuba (SP), Maceió (AL), Rio Grande (RS), Rio de Janeiro (RJ) e Vitória (ES). Um fragmento de 900pb da região pré-S/S do genoma viral foi amplificado e seqüenciado de 106 amostras positivas para marcadores sorológicos do HBV. Análises para a detecção de seqüências virais recombinantes foram realizadas com os programas SplitsTree4 e SimPlot, enquanto análises filogenéticas para a genotipagem viral foram realizadas utilizando os programas MEGA 4.0 e PAUP TM4.0. Estimativas de divergência genética (FST) entre as seqüências das diferentes cidades estudadas foram obtidas utilizando o programa ProSeq. Nesse estudo, verificamos a presença dos genótipos A, D e F na população estudada e reportamos pela primeira vez uma cepa brasileira recombinante entre os genótipos A e D e quatro cepas recombinantes entre os subgenótipos A1 e A2 do HBV. Esses dados foram confirmados com a construção de árvores filogenéticas utilizando as diferentes regiões não-recombinantes. A genotipagem das amostras mostrou a presença de 4,7 por cento de cepas recombinantes e a predominância do genótipo HBV/A em 75,5 por cento, seguido do HBV/D em 17,9 por cento e o HBV/F em 1,9 por cento da população. Dentro do HBV/A, o subgenótipo mais amostrado foi o A1 (86 por cento) e no HBV/D o D3 (63 por cento), enquanto no...brasileira.
Assuntos
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Coleções: Bases de dados internacionais Base de dados: LILACS Assunto principal: Variação Genética / Hepatite B País/Região como assunto: América do Sul / Brasil Idioma: Português Ano de publicação: 2008 Tipo de documento: Tese
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Coleções: Bases de dados internacionais Base de dados: LILACS Assunto principal: Variação Genética / Hepatite B País/Região como assunto: América do Sul / Brasil Idioma: Português Ano de publicação: 2008 Tipo de documento: Tese
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